单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1581 - 1600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1581 | 2024-08-08 |
Research progress of single-cell transcriptome sequencing in autoimmune diseases and autoinflammatory disease: A review
2022-12, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2022.102919
PMID:36242821
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在自身免疫性疾病和自身炎症性疾病中的研究进展 | 单细胞转录组测序技术能够提供无偏倚的结果，通过独立分析组织中的细胞，为识别细胞亚群提供更多mRNA信息，为研究免疫耐受破坏和促炎途径的细胞基础提供了新方法 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在自身免疫性疾病和自身炎症性疾病中的应用，揭示疾病发生发展的机制 | 41种自身免疫性疾病，包括9种系统性自身免疫性疾病和自身炎症性疾病以及32种器官特异性自身免疫性疾病 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 涉及多种组织和细胞类型 |
| 1582 | 2024-08-08 |
The characteristics of cerebrospinal fluid anaplastic large cells in a patient with primary leptomeningeal anaplastic large cell lymphoma
2022-Dec-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2022.09.029
PMID:36243040
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研究论文 | 本文报道了一例原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤患者的病例，并通过单细胞RNA测序分析了脑脊液中间变性大细胞的转录组特征。 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析脑脊液中间变性大细胞的转录组特征。 | NA | 研究原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤的诊断和机制。 | 一例26岁中国男性原发性软脑膜间变性大细胞淋巴瘤患者。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一例患者 |
| 1583 | 2024-08-08 |
Transcriptional noise adjusted for expression levels reveals genes with high transcriptional noise that are highly expressed, functionally related, and co-regulated in yeast
2022-Dec, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01255-x
PMID:36245041
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研究论文 | 本文研究了酵母中基因表达变异与单细胞和非单细胞基因表达研究之间的关系，发现调整表达水平后的转录噪声可以识别出高表达、功能相关且共同调控的基因 | 本文采用线性/自然对数多项式和局部拟合方法调整表达水平后的转录噪声，并分析多个非单细胞RNA-seq数据集，识别出与高CV基因不同的具有高中值转录噪声的基因 | NA | 理解单细胞和非单细胞基因表达研究中变异性的关系及其在生物系统中的作用和机制 | 酵母中的基因表达变异 | 分子生物学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个非单细胞RNA-seq数据集 |
| 1584 | 2024-08-08 |
Small cell carcinoma of the ovary hypercalcemic type (SCCOHT): A review and novel case with dual germline SMARCA4 and BRCA2 mutations
2022-Dec, Gynecologic oncology reports
IF:1.2Q3
DOI:10.1016/j.gore.2022.101077
PMID:36249907
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综述 | 本文综述了卵巢高钙型小细胞癌（SCCOHT）的罕见性和侵袭性，并描述了一例同时携带SMARCA4和BRCA2胚系突变的病例 | 描述了一例罕见的双重胚系突变病例，并分享了原始肿瘤的空间转录组学数据 | NA | 综述SCCOHT的特征并介绍一例新型病例 | 卵巢高钙型小细胞癌及其病例 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 单个病例 |
| 1585 | 2024-08-08 |
Anatomical Evidence for Parasympathetic Innervation of the Renal Vasculature and Pelvis
2022-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021111518
PMID:36253054
|
研究论文 | 本文通过解剖学研究方法，包括转基因小鼠模型和免疫染色技术，以及单细胞RNA测序，探讨了肾脏血管和肾盂的副交感神经支配 | 首次提供了肾脏血管和肾盂副交感神经支配的解剖学证据 | NA | 验证肾脏血管和肾盂的副交感神经支配 | 肾脏血管和肾盂的副交感神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 1586 | 2024-08-08 |
Differential plasticity and fate of brain-resident and recruited macrophages during the onset and resolution of neuroinflammation
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.09.005
PMID:36228615
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研究论文 | 本研究探讨了神经炎症发生和消退过程中，大脑常驻和招募的巨噬细胞的命运和可塑性 | 揭示了大脑常驻巨噬细胞和招募巨噬细胞在感染和疾病消退过程中的不同反应和动态变化 | NA | 研究神经炎症过程中大脑常驻和招募巨噬细胞的命运和可塑性 | 大脑常驻的微胶质细胞、边界相关巨噬细胞（BAMs）和招募的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | NA |
| 1587 | 2024-08-08 |
Molecular pathology of Usher 1B patient-derived retinal organoids at single cell resolution
2022-11-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.09.006
PMID:36240775
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研究论文 | 本研究分析了从Usher 1B患者诱导的多能干细胞生成的3D视网膜类器官，以单细胞分辨率揭示了MYO7A突变相关的视网膜色素变性的分子病理机制。 | 首次使用患者来源的视网膜类器官模型，揭示了Usher 1B相关视网膜色素变性的分子机制，特别是MYO7A在杆状光感受器和Müller胶质细胞中的表达及其对细胞死亡的防御机制。 | 研究仅限于单一患者来源的类器官，可能需要更多样本以验证结果的普遍性。 | 揭示Usher 1B相关视网膜色素变性的分子病理机制，为开发治疗策略提供基础。 | 从Usher 1B患者诱导的多能干细胞生成的3D视网膜类器官。 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者来源的视网膜类器官 |
| 1588 | 2024-08-08 |
CCR2 is expressed by tendon resident macrophage and T cells, while CCR2 deficiency impairs tendon healing via blunted involvement of tendon-resident and circulating monocytes/macrophages
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201162R
PMID:36250393
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研究论文 | 本研究探讨了趋化因子受体2（CCR2）在肌腱愈合中的作用，特别是在肌腱驻留巨噬细胞和T细胞中的表达及其缺乏对肌腱愈合的影响 | 首次揭示了CCR2在成年稳态和愈合过程中在肌腱中的存在，并通过单细胞RNA测序确定了这些细胞为肌腱驻留巨噬细胞和T细胞 | NA | 阐明肌腱驻留与循环来源巨噬细胞的功能差异 | CCR2报告和敲除小鼠的肌腱愈合表型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | CCR2报告和敲除小鼠 |
| 1589 | 2024-08-08 |
Integrative transcriptome analysis reveals TEKT2 and PIAS2 involvement in diabetic nephropathy
2022-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200740RR
PMID:36251411
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研究论文 | 本文通过整合大量和单细胞转录组数据集，揭示了与糖尿病肾病（DN）发展相关的TEKT2和PIAS2基因的作用机制 | 首次通过整合大量和单细胞转录组数据，发现并验证了TEKT2和PIAS2基因在糖尿病肾病中的作用 | NA | 揭示糖尿病肾病的新机制，特别是在足细胞中的作用 | 糖尿病肾病患者和糖尿病小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 4个肾小球和4个肾小管数据集 |
| 1590 | 2024-08-08 |
SCOTv2: Single-Cell Multiomic Alignment with Disproportionate Cell-Type Representation
2022-Nov, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0270
PMID:36251763
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研究论文 | 本文介绍了SCOTv2方法，用于处理单细胞多组学数据中细胞类型不均衡的问题，通过使用不平衡的Gromov-Wasserstein最优传输进行单细胞对齐 | SCOTv2方法通过使用不平衡的Gromov-Wasserstein最优传输，有效处理了单细胞实验中细胞类型不均衡和样本大小差异的问题 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据对齐方法，以解决现有算法在非共测序单细胞实验中表现不佳的问题 | 单细胞多组学数据的对齐 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 最优传输 | 单细胞数据 | 五个非共测序数据集（模拟和真实世界） |
| 1591 | 2024-08-08 |
GM-CSF-activated human dendritic cells promote type 1 T follicular helper cell polarization in a CD40-dependent manner
2022-11-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.260298
PMID:36254574
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和蛋白质验证，发现GM-CSF激活的人类树突状细胞能够促进幼稚CD4+ T细胞向Tfh1细胞分化 | 首次揭示了GM-CSF激活的树突状细胞通过CD40依赖性方式促进Tfh1细胞分化的细胞和分子机制 | NA | 探究人类Tfh1细胞分化的细胞和分子要求 | 人类血液中的CD1c+树突状细胞和幼稚CD4+ T细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及COVID-19轻症患者和潜伏性结核感染患者的血液样本 |
| 1592 | 2024-08-08 |
Deterministic programming of human pluripotent stem cells into microglia facilitates studying their role in health and disease
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2123476119
PMID:36251998
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类多能干细胞（hPSCs）生成微胶质细胞（MGLs）的前向编程协议，并探讨了其在健康和疾病中的作用 | 通过短暂过表达PU.1和C/EBPβ，实现了从hPSCs到成熟微胶质细胞的同质群体生成，时间为16天 | NA | 研究微胶质细胞在健康和疾病中的作用 | 人类多能干细胞（hPSCs）生成的微胶质细胞（MGLs） | 细胞生物学 | 神经退行性疾病 | 前向编程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 1593 | 2024-08-08 |
Disruption of proteostasis causes IRE1 mediated reprogramming of alveolar epithelial cells
2022-10-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2123187119
PMID:36252035
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研究论文 | 研究探讨了肺泡上皮细胞蛋白质量控制失调在慢性肺病中的作用，特别是通过IRE1介导的细胞重编程 | 首次发现肺泡上皮细胞在经历显著的内质网应激后，会失去其典型特征并发展出一种新的细胞状态，这种状态可以通过抑制IRE1α信号来减轻 | NA | 研究蛋白稳态失调如何导致肺泡上皮细胞重编程，并探讨其对肺纤维化的影响 | 肺泡上皮细胞（AEC2）和其蛋白质量控制 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用两个临床SP-C突变模型 |
| 1594 | 2024-08-08 |
Online single-cell data integration through projecting heterogeneous datasets into a common cell-embedding space
2022-10-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33758-z
PMID:36253379
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCALEX的深度学习方法，该方法通过将细胞投影到一个批次不变的通用细胞嵌入空间中，实现了单细胞数据的在线集成 | SCALEX方法能够在不重新训练模型的情况下，以真正在线的方式集成单细胞数据，并且在处理具有部分重叠的数据集时，能够准确对齐相似的细胞群并保留真实的生物学差异 | NA | 开发一种新的计算工具，用于集成多样化的单细胞实验数据，并能够与基础数据集进行信息交叉引用 | 单细胞RNA测序、scRNA-seq、单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）等多种模态的单细胞数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习方法 | 单细胞数据 | 涉及人类、小鼠和COVID-19患者的单细胞图谱，数据来源多样且随新数据不断增长 |
| 1595 | 2024-08-08 |
Loss of CASZ1 tumor suppressor linked to oncogenic subversion of neuroblastoma core regulatory circuitry
2022-10-15, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-05314-6
PMID:36243768
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研究论文 | 本文研究了神经母细胞瘤中核心调控电路（CRC）的癌基因颠覆与肿瘤抑制因子CASZ1丢失之间的关系 | 首次揭示了CASZ1肿瘤抑制因子与神经母细胞瘤核心调控电路之间的负反馈调节机制 | NA | 探讨CASZ1肿瘤抑制因子在神经母细胞瘤中的作用及其与核心调控电路的关系 | 神经母细胞瘤中的CASZ1肿瘤抑制因子和核心调控电路 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq | NA | RNA序列 | NA |
| 1596 | 2024-08-08 |
Alignment of single-cell trajectory trees with CAPITAL
2022-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33681-3
PMID:36241645
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAPITAL的方法，用于通过树对齐比较单细胞轨迹，能够自动比较分支轨迹 | CAPITAL方法能够实现复杂伪时间轨迹的全局对齐，特别是在处理分支轨迹方面相较于现有工具的创新 | NA | 开发一种新的方法来对齐不同单细胞RNA-seq数据集中的复杂伪时间轨迹 | 单细胞RNA-seq数据集中的伪时间轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 树对齐 | 数据集 | 合成数据集和真实骨髓细胞数据集 |
| 1597 | 2024-08-08 |
CellCallEXT: Analysis of Ligand-Receptor and Transcription Factor Activities in Cell-Cell Communication of Tumor Immune Microenvironment
2022-Oct-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194957
PMID:36230879
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研究论文 | 本文介绍了CellCallEXT工具，该工具通过整合配体-受体（L-R）和转录因子（TF）活动信息，分析肿瘤免疫微环境中的细胞间通信 | CellCallEXT扩展了CellCall的功能，能够处理两种条件的比较，并整合了Reactome数据库和L-R-TF信号传导及基因调控数据集 | CellCall受限于组织中基因表达的特异性，且无法直接处理两种条件的比较 | 开发和验证一种新的工具，用于分析基于单细胞RNA测序数据的疾病中细胞间通信 | 肿瘤和免疫细胞微环境中的细胞间通信及相关的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及来自腺苷脱氨酶2缺乏症患者的scRNA-seq数据 |
| 1598 | 2024-08-08 |
Early Mechanisms of Chemoresistance in Retinoblastoma
2022-Oct-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194966
PMID:36230889
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研究论文 | 本文研究了视网膜母细胞瘤对卡铂化疗产生早期耐药的分子机制 | 利用单细胞下一代RNA测序和单细胞条形码技术，发现了卡铂诱导的快速转录组重编程与PI3K-AKT通路目标的上调有关 | NA | 探讨视网膜母细胞瘤对卡铂化疗早期耐药的分子机制 | 低代次的人类视网膜母细胞瘤细胞 | NA | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞下一代RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1599 | 2024-08-08 |
Single-Cell Identification of Melanoma Biomarkers in Circulating Tumor Cells
2022-Oct-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14194921
PMID:36230844
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研究论文 | 本文探讨了循环肿瘤细胞（CTCs）作为黑色素瘤生物标志物的潜力，并介绍了一种可行的单细胞CTC分离和分析方法 | 提出了一种临床可行的单细胞CTC分离和分析方法，克服了以往的限制 | NA | 研究黑色素瘤CTCs作为生物标志物的潜力 | 黑色素瘤患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自黑色素瘤患者的循环肿瘤细胞 |
| 1600 | 2024-08-08 |
Global Transcriptional and Epigenetic Reconfiguration during Chemical Reprogramming of Human Retinal Pigment Epithelial Cells into Photoreceptor-like Cells
2022-10-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11193146
PMID:36231108
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研究论文 | 本文通过使用小分子化合物直接将人胎儿视网膜色素上皮细胞重编程为化学诱导的类光感受器细胞，并进行了转录组和表观遗传学的多组学分析 | 首次展示了通过小分子化合物有效诱导视网膜色素上皮细胞转化为类光感受器细胞，并揭示了这一过程中的转录和表观遗传变化 | 当前的重编程效率仍然较低，且分子机制尚未完全阐明 | 探讨视网膜色素上皮细胞向类光感受器细胞重编程的分子机制，为视网膜退行性疾病的治疗提供新的细胞来源 | 人胎儿视网膜色素上皮细胞及其重编程后的类光感受器细胞 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | RNA测序、甲基化测序 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 涉及大量和单细胞样本 |