单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1541 - 1560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2024-08-08 |
An asparagine metabolism-based classification reveals the metabolic and immune heterogeneity of hepatocellular carcinoma
2022-10-25, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01380-z
PMID:36284275
|
研究论文 | 本研究基于天冬酰胺代谢水平对肝细胞癌（HCC）患者进行分类，并探讨其代谢和免疫异质性 | 首次详细探讨了天冬酰胺代谢在HCC中的状态及其相关机制，并发现GOT2作为潜在的预后标志物和治疗靶点 | NA | 探讨肝细胞癌中天冬酰胺代谢的状态及其相关机制，并寻找潜在的预后标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌患者及其天冬酰胺代谢水平 | 数字病理学 | 肝癌 | 共识聚类、最小绝对收缩与选择算子回归、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、基因集富集分析、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序 | UMAP | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 来自三个队列的HCC样本 |
| 1542 | 2024-08-08 |
Combining denoising of RNA-seq data and flux balance analysis for cluster analysis of single cells
2022-Oct-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04967-6
PMID:36284276
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研究论文 | 本文研究了去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并将其应用于代谢网络分析和单细胞聚类分析 | 首次探讨了去噪策略在整合单细胞RNA测序数据到代谢网络分析中的应用，并展示了去噪对恢复重要代谢特性的效果 | NA | 研究去噪策略在单细胞RNA测序数据预处理中的作用，并探讨其对代谢表型聚类分析的影响 | 单细胞RNA测序数据的去噪处理及其在代谢网络分析中的应用 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个公共单细胞RNA测序数据集 |
| 1543 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic inventory of murine smooth muscle cells
2022-10-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.015
PMID:36283392
|
研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序结合原位基因和蛋白表达分析，研究了小鼠心脏、主动脉、肺和结肠中平滑肌细胞的分子基础 | 首次揭示了血管、内脏和气道平滑肌细胞之间的高水平差异，以及弹性动脉和肌性动脉平滑肌细胞之间的细微差异 | NA | 探索平滑肌细胞在不同器官系统中的分子差异 | 小鼠的平滑肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及心脏、主动脉、肺和结肠四个器官 |
| 1544 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights origin and pathological process of human endometrioid endometrial carcinoma
2022-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33982-7
PMID:36273006
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞，揭示了子宫内膜癌的起源和病理过程 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了子宫内膜样子宫内膜癌起源于子宫内膜上皮细胞而非基质细胞，并识别了LCN2+/SAA1/2+细胞作为子宫内膜癌变的一个特征性亚群 | NA | 阐明子宫内膜样子宫内膜癌发展过程中细胞群体的演变 | 正常子宫内膜、非典型子宫内膜增生和子宫内膜样子宫内膜癌的细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1545 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing deconvolutes cellular responses to exercise in human skeletal muscle
2022-10-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04088-z
PMID:36273106
|
研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了人类骨骼肌在剧烈运动前后细胞组成和细胞类型特异性过程的变化 | 首次通过单细胞测序揭示了运动对骨骼肌细胞类型特异性适应机制的影响 | NA | 探究运动对人类骨骼肌细胞类型特异性适应机制的影响 | 人类骨骼肌细胞在运动前后的变化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 15个细胞集群，来自6种不同的细胞群体 |
| 1546 | 2024-08-08 |
Gossypetin ameliorates 5xFAD spatial learning and memory through enhanced phagocytosis against Aβ
2022-10-21, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-022-01096-3
PMID:36271414
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研究论文 | 研究探讨了gossypetin通过增强小胶质细胞对Aβ的吞噬作用，改善5xFAD小鼠的空间学习和记忆能力 | gossypetin能够增强小胶质细胞对Aβ的吞噬活性，减少其胶质化，并增加MHC II+小胶质细胞群体 | NA | 探索gossypetin作为治疗阿尔茨海默病（AD）的新型潜在治疗候选药物 | 5xFAD AD模型小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 实验涉及5xFAD AD模型小鼠，进行了13周的gossypetin治疗 |
| 1547 | 2024-08-08 |
scRNA-sequencing reveals subtype-specific transcriptomic perturbations in DRG neurons of PirtEGFPf mice in neuropathic pain condition
2022-10-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76063
PMID:36264609
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在神经病理性疼痛条件下，PirtEGFPf小鼠背根神经节（DRG）神经元的亚型特异性转录组扰动 | 首次揭示了神经病理性疼痛条件下DRG神经元的亚型特异性转录组变化，并发现了性别差异在转录组水平上的表现 | 研究仅限于特定的小鼠模型和特定的神经损伤模型，可能限制了结果的普遍性 | 探究神经病理性疼痛条件下DRG神经元的转录组变化，以期发现新的治疗靶点和优化神经病理性疼痛治疗 | PirtEGFPf小鼠的背根神经节（DRG）神经元 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及多个DRG神经元亚型和性别的小鼠样本 |
| 1548 | 2024-08-08 |
Blood monocyte-derived CD169+ macrophages contribute to antitumor immunity against glioblastoma
2022-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34001-5
PMID:36266311
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研究论文 | 本文研究了血液单核细胞来源的CD169+巨噬细胞在对抗胶质母细胞瘤（GBM）中的抗肿瘤免疫作用 | 本文首次鉴定了一种促进抗肿瘤微环境的CD169巨噬细胞亚群，并揭示了其通过产生促炎性趋化因子吸引T细胞和NK细胞的机制 | NA | 研究肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在胶质母细胞瘤免疫治疗中的作用 | CD169+巨噬细胞及其在胶质母细胞瘤中的作用 | NA | 脑瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 人类和小鼠的胶质瘤样本 |
| 1549 | 2024-08-08 |
High-resolution single-cell analysis paves the cellular path for brain regeneration in salamanders
2022-Oct-19, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00144-5
PMID:36258096
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研究论文 | 本研究利用高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了蝾螈端脑细胞的分化路径，为理解脊椎动物大脑的进化、发育和再生提供了新见解 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描述了蝾螈大脑再生的细胞分化路径 | NA | 探索蝾螈大脑再生的分子和细胞机制，以及脊椎动物大脑结构的进化 | 蝾螈端脑细胞的分化路径 | 数字病理学 | NA | 高分辨率单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1550 | 2024-08-08 |
Insights into skeletal stem cells
2022-Oct-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00235-8
PMID:36261411
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综述 | 本文回顾了骨骼干细胞（SSCs）的鉴定和功能研究，讨论了鉴定真正SSCs的原则和方法，并强调了绘制SSCs谱系图谱的开创性发现。 | 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术，识别了多种类型的SSCs，并绘制了谱系承诺轨迹，部分揭示了其在生理和病理条件下的特性。 | 文章主要集中在争议和SSC研究中的挑战，未详细说明具体的局限性。 | 回顾和讨论骨骼干细胞的鉴定、功能及其在骨骼系统中的作用。 | 骨骼干细胞及其在长骨、颅面组织和骨膜中的作用。 | NA | NA | 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 1551 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptome profiling of normal human liver
2022-10-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01676-w
PMID:36261431
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研究论文 | 本文通过空间转录组学技术对正常人肝脏组织切片进行了详细研究，提供了肝脏分区在转录水平上的详细信息 | 本文首次提供了来自两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot，并对肝细胞进行了四个亚组的分类 | NA | 研究人类肝脏的空间细胞解剖结构，以解决肝脏疾病的细胞起源问题 | 正常人肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个正常人肝脏捐赠者的6581个高质量spot |
| 1552 | 2024-08-08 |
scRNA-seq generates a molecular map of emerging cell subtypes after sciatic nerve injury in rats
2022-10-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03970-0
PMID:36261573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，生成了大鼠坐骨神经损伤后新兴细胞亚型的分子图谱 | 首次提供了高分辨率的转录组图谱，揭示了神经损伤后细胞异质性的详细分子特征 | NA | 开发针对外周神经损伤、病毒感染或代谢紊乱引起的神经痛的新疗法 | 大鼠坐骨神经损伤后的细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 神经痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过110,000个单个细胞 |
| 1553 | 2024-08-08 |
Reprogramming of myeloid cells and their progenitors in patients with non-medullary thyroid carcinoma
2022-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33907-4
PMID:36257966
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能分析，探讨了非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞在治疗前后的转录和功能变化 | 首次展示了非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞在肿瘤浸润前的转录和功能变化，并揭示了治疗对其的影响 | NA | 研究非髓性甲状腺癌患者骨髓细胞及其前体细胞的转录和功能变化及其对治疗的反应 | 非髓性甲状腺癌患者的骨髓细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1554 | 2024-08-08 |
Dissecting the genetic and microenvironmental factors of gastric tumorigenesis in mice
2022-10-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111482
PMID:36261019
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研究论文 | 本研究通过基因编辑的小鼠胃类器官生成了一系列原发性胃癌模型，揭示了从异型增生到分化良好和分化不良胃癌的遗传驱动因素，并探讨了微环境在胃癌转移中的关键作用。 | 本研究首次通过基因编辑的小鼠胃类器官模型，详细解析了胃癌发生过程中的遗传和微环境因素，特别是揭示了特定细胞间相互作用在胃癌远端转移中的作用。 | 研究主要在小鼠模型中进行，其结果在人类胃癌中的适用性需要进一步验证。 | 探讨胃癌发生和进展的遗传和微环境机制。 | 小鼠胃癌模型及其遗传和微环境因素。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 一系列基因编辑的小鼠胃类器官 |
| 1555 | 2024-08-08 |
Self-organizing in vitro mouse neural tube organoids mimic embryonic development
2022-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201052
PMID:36268933
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研究论文 | 本文报道了一种由单个小鼠胚胎干细胞衍生的自组织3D神经管类器官模型，该模型展示了与体内相似的组织结构、细胞类型组成和前后模式 | 首次实现了在哺乳动物模型中实时观察迁移的神经嵴细胞的吞噬作用 | NA | 研究早期神经发育过程中的关键形态发生和细胞类型衍生事件 | 小鼠胚胎干细胞衍生的3D神经管类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | 3D神经管类器官模型 | 细胞 | 单个小鼠胚胎干细胞 |
| 1556 | 2024-08-08 |
Mapping the adult human esophagus in vivo and in vitro
2022-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200614
PMID:36278875
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研究论文 | 本文创建了成人食管细胞类型的图谱，并建立了用于研究稳态和损伤的体外食管组织生物库，同时使用成人食管图谱对体外模型进行了基准测试。 | 首次创建了成人食管的单细胞RNA测序参考图谱，并展示了体外培养模型可以用于模拟完整的食管上皮层。 | NA | 研究人类食管的发育、稳态和疾病。 | 成人食管的细胞类型和体外模型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 55条患者来源的体外培养线 |
| 1557 | 2024-08-08 |
Biopsy-based single-cell transcriptomics reveals MAIT cells as potential targets for controlling fibrosis-related liver inflammation due to chronic hepatitis-B infection
2022-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1073
PMID:36263680
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1558 | 2024-08-08 |
Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols
2022-Oct, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e11023
PMID:36281413
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研究论文 | 本文比较了两种常用的单细胞Hi-C协议，并分析了它们在效率、偏差、规模和成本上的差异 | 使用长读长测序技术分析Hi-C检测的分子产物，揭示了全基因组扩增步骤导致的伪影增多、覆盖偏差增大和噪声增加 | 仅比较了两种常用的单细胞Hi-C协议，未涵盖所有可用协议 | 评估不同单细胞Hi-C协议的优劣，为研究染色质结构提供指导 | 单细胞Hi-C协议的效率、偏差、规模和成本 | 基因组学 | NA | 长读长测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1559 | 2024-08-08 |
Exploring biomarkers and transcriptional factors in type 2 diabetes by comprehensive bioinformatics analysis on RNA-Seq and scRNA-Seq data
2022-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4303
PMID:36267740
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析RNA-Seq和scRNA-Seq数据，探索了2型糖尿病的生物标志物和转录因子 | 本研究通过结合转录组和单细胞测序数据，为2型糖尿病的分子机制和诊断提供了新的见解 | NA | 探索2型糖尿病的生物标志物和转录因子 | 2型糖尿病患者和健康人群的RNA-Seq和scRNA-Seq数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-Seq, scRNA-Seq | LASSO算法, ROC分析 | 基因表达数据 | GSE41762数据集包括健康和2型糖尿病患者的RNA-seq数据，E-MTAB-5061数据集包括1,515个2型糖尿病细胞和1,817个健康细胞 |
| 1560 | 2024-08-08 |
Th1 cytokine endotype discriminates and predicts severe complications in COVID-19
2022-06-01, European cytokine network
IF:2.2Q4
DOI:10.1684/ecn.2022.0477
PMID:36266985
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研究论文 | 本研究通过多重免疫表型分析和单细胞RNA测序，探讨了Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并根据血清细胞因子和全身炎症标志物将COVID-19病例分为四个严重程度递增的集群 | 本研究首次将COVID-19病例根据特定的炎症标志物进行集群分类，并探讨了这些集群与临床结果的关系 | NA | 研究Th1和Th2细胞因子/趋化因子与COVID-19患者细胞介导免疫的关系，并预测严重并发症 | COVID-19患者的Th1和Th2细胞因子/趋化因子及其与细胞介导免疫的关系 | NA | COVID-19 | 多重免疫表型分析，单细胞RNA测序 | NA | 血清细胞因子，全身炎症标志物 | 多个COVID-19患者的外周血单个核细胞 |