单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1481 - 1500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of the lacrimal gland features macrophage activity and epithelium metabolism as key alterations during chronic inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011125
PMID:36341342
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研究论文 | 本研究分析了NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中泪腺的慢性炎症，利用bulk RNAseq和Visium空间基因表达技术，通过Seurat进行无监督聚类，分析了泪腺切片中细胞的空间分布和基因表达变化。 | 首次使用Visium技术验证了bulk RNAseq定义的特定通路在泪腺切片中的激活情况，并发现了一个在Sjögren's综合征中未曾描述过的“TYROBP因果网络”。 | NA | 探讨泪腺慢性炎症过程中的关键改变及其对干眼症的治疗潜力。 | 泪腺的慢性炎症及其在Sjögren's综合征中的表现。 | 数字病理学 | 干眼症 | bulk RNAseq, Visium空间基因表达 | NA | 基因表达数据 | NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中的泪腺组织 |
| 1482 | 2024-08-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights LCK as an immune-related prognostic biomarker in melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1024931
PMID:36341345
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研究论文 | 本研究通过整合多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集，识别与黑色素瘤免疫治疗相关的潜在预后生物标志物，特别是LCK基因。 | 首次揭示LCK作为免疫相关预后生物标志物在黑色素瘤中的作用，并通过多种分析方法验证其表达与免疫细胞浸润水平及临床预后的关联。 | 研究主要基于现有数据库和测序数据，未涉及大规模临床试验验证。 | 识别与黑色素瘤免疫治疗相关的预后生物标志物。 | 黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫逃逸相关基因。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | 回归分析 | 转录组数据 | 涉及多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集 |
| 1483 | 2024-08-08 |
The shared biomarkers and pathways of systemic lupus erythematosus and metabolic syndrome analyzed by bioinformatics combining machine learning algorithm and single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1015882
PMID:36341378
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合机器学习算法和单细胞测序分析，探讨了系统性红斑狼疮（SLE）和代谢综合征（MetS）之间的共享生物标志物和通路 | 本研究首次通过机器学习技术和单细胞RNA测序验证了SLE和MetS之间的共享关键基因，并构建了有效的诊断模型 | NA | 探讨系统性红斑狼疮和代谢综合征之间的潜在关联及其发病机制 | 系统性红斑狼疮和代谢综合征的共享基因及其在免疫和代谢过程中的作用 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | XG-Boost | 基因表达数据 | NA |
| 1484 | 2024-08-08 |
Protocol to dissociate, process, and analyze the human lung tissue using single-cell RNA-seq
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101776
PMID:36313536
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类肺部生物样本中获取高质量单细胞转录组数据的方法 | 采用机械和酶解法处理组织，通过荧光激活细胞分选（FACS）富集活细胞，并使用基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术 | NA | 开发一种高效获取人类肺组织单细胞转录组数据的方法 | 人类肺部生物样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及来自核心针活检、细针抽吸、手术切除和胸腔积液的人类肺部生物样本 |
| 1485 | 2024-08-08 |
Insights gained from single-cell analysis of immune cells in tofacitinib treatment of Vogt-Koyanagi-Harada disease
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162335
PMID:36301664
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，首次进行了多模态、高维度的分析，生成了一份关于VKH患者在接受TOFA治疗期间免疫细胞亚群组成、基因特征、富集通路和细胞间相互作用的全面人类免疫图谱 | 首次进行了多模态、高维度的分析，生成了一份全面的人类免疫图谱，并识别出与炎症和JAK相关的两种单核细胞亚群，这些亚群在VKH发病机制和TOFA治疗机制中起重要作用 | NA | 探讨TOFA治疗Vogt-Koyanagi-Harada病（VKH）的具体发病机制和靶向治疗策略 | VKH患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1486 | 2024-08-08 |
The Tumor Microenvironment Reprograms Immune Cells
2022-12, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2022.0047
PMID:36301256
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境如何通过创建免疫抑制环境和代谢竞争来重新编程免疫细胞和其他基质细胞，以限制其抗肿瘤能力 | 利用单细胞测序技术分析了肿瘤微环境中免疫细胞和其他基质细胞的肿瘤特异性特征 | NA | 探讨肿瘤细胞如何重新编程肿瘤微环境及外周血中的免疫细胞，以提高当前免疫治疗效率并提出新的抗癌思路 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和其他基质细胞 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 1487 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional and functional analysis of dopaminergic neurons in organoid-like cultures derived from human fetal midbrain
2022-12-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200504
PMID:36305490
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了从人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中多巴胺能神经元的转录组和功能成熟过程 | 本文首次揭示了3D类器官培养条件比单层培养条件更能有效地生成和维持成熟的多巴胺能神经元 | NA | 研究旨在开发从多能干细胞生成中脑多巴胺神经元的精细分化协议，以应用于疾病模型、诊断、药物筛选和基于细胞的治疗方法 | 人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中的多巴胺能神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6-11周龄的人类胎儿中脑组织 |
| 1488 | 2024-08-08 |
Prostaglandin E2 synchronizes lunar-regulated beach spawning in grass puffers
2022-11-21, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.09.062
PMID:36306789
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研究论文 | 本研究探讨了草河豚在月相周期下海滩产卵的同步机制 | 首次揭示了前列腺素E2（PGE）在月相周期下同步草河豚海滩产卵行为中的作用 | NA | 理解草河豚在月相周期下海滩产卵的机制 | 草河豚的垂体和下丘脑 | NA | NA | RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 2个月内每周收集的雄性草河豚的垂体和下丘脑样本 |
| 1489 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals heterogeneous neutrophils with prognostic values in sepsis
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105301
PMID:36304125
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对近300,000个人类外周血细胞进行转录组分析，揭示了具有预后价值的异质性中性粒细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细划分了中性粒细胞的四种亚型，并发现其中一种亚型Neu1与脓毒性休克显著相关，其基因表达模块Neu1_C具有高预测性 | NA | 研究中性粒细胞在脓毒症中的异质性及其作为预后生物标志物的潜力 | 人类外周血细胞中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 近300,000个人类外周血细胞 |
| 1490 | 2024-08-08 |
Adult human kidney organoids originate from CD24+ cells and represent an advanced model for adult polycystic kidney disease
2022-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01202-z
PMID:36303074
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研究论文 | 本文报道了成人肾脏类器官来源于CD24+细胞，并展示了其在成人多囊肾病模型中的高级应用 | 首次揭示了成人肾脏类器官（tubuloids）来源于特定的CD24上皮亚群，并展示了其在模拟常染色体显性多囊肾病（ADPKD）中的应用 | NA | 研究成人肾脏类器官的细胞起源及其在成人多囊肾病模型中的应用 | 成人肾脏类器官（tubuloids）及其在成人多囊肾病中的应用 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及CRISPR-Cas9基因编辑的PKD1和PKD2敲除类器官以及人类ADPKD和对照组织 |
| 1491 | 2024-08-08 |
Characterization of the tumour microenvironment phenotypes in malignant tissues and pleural effusion from advanced osteoblastic osteosarcoma patients
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1072
PMID:36305631
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期成骨性骨肉瘤患者恶性组织和胸腔积液中的肿瘤微环境表型 | 首次提供了晚期成骨性骨肉瘤患者胸腔积液和原发肿瘤的细胞图谱 | NA | 探究成骨性骨肉瘤患者胸腔积液中的细胞环境，并寻找潜在的治疗靶点 | 成骨性骨肉瘤患者的胸腔积液和肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 27,260个细胞来自7个胸腔积液样本，91,186个细胞来自8个骨肉瘤组织样本 |
| 1492 | 2024-08-08 |
Identification of MRAP protein family as broad-spectrum GPCR modulators
2022-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1091
PMID:36314066
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用，并重新定义了其在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络。 | 本研究首次全面阐明了MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络，并重新定义了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用。 | NA | 研究MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的GPCR调节作用。 | MRAP1和MRAP2蛋白及其在GPCR调节中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA-seq | 涉及人鼠组织的多组RNA-seq数据和单细胞数据 |
| 1493 | 2024-08-08 |
Identification of a rare Gli1+ progenitor cell population contributing to liver regeneration during chronic injury
2022-Nov-01, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00474-3
PMID:36316325
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研究论文 | 本文识别了一种罕见的Gli1+前体细胞群，该细胞群在慢性肝损伤期间有助于肝再生 | 发现了一种新的双表型细胞群EpCAMGli1，该细胞群具有上皮和间充质双重身份，并能促进肝细胞再生 | NA | 研究慢性肝损伤后肝细胞再生的新来源 | Gli1+前体细胞群及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1494 | 2024-08-08 |
SIRPα antibody combined with oncolytic virus OH2 protects against tumours by activating innate immunity and reprogramming the tumour immune microenvironment
2022-10-31, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-022-02574-z
PMID:36310169
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研究论文 | 本文首次尝试将溶瘤单纯疱疹病毒2型（OH2）与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗，并探讨了这种组合对肿瘤免疫微环境的重新编程作用 | 首次将溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗，为溶瘤病毒疗法提供了新策略 | NA | 探讨溶瘤病毒与免疫检查点阻断剂联合治疗的可行性及机制 | 溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体的联合治疗对肿瘤免疫微环境的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和动物模型数据 | 使用了RAW264.7细胞和小鼠肿瘤模型 |
| 1495 | 2024-08-08 |
Revised International Staging System (R-ISS) stage-dependent analysis uncovers oncogenes and potential immunotherapeutic targets in multiple myeloma (MM)
2022-10-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75340
PMID:36315425
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞转录组图谱，比较了修订国际分期系统（R-ISS）不同阶段多发性骨髓瘤（MM）患者中的差异表达模式 | 发现了新的细胞毒性浆细胞（PC）群体，以及与不良预后和EB病毒感染相关的恶性PC群体，并验证了RRM2在MM细胞增殖中的作用 | NA | 探索多发性骨髓瘤（MM）中修订国际分期系统（R-ISS）阶段依赖的分析，以发现致癌基因和潜在的免疫治疗靶点 | 多发性骨髓瘤（MM）患者的单细胞转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 收集了多发性骨髓瘤（MM）患者的样本 |
| 1496 | 2024-08-08 |
Characterization of EGFR-reprogrammable temozolomide-resistant cells in a model of glioblastoma
2022-Oct-31, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-01230-y
PMID:36316307
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研究论文 | 本文通过建立一个获得性TMZ耐药异种移植模型，研究了MGMT-null实验性胶质母细胞瘤中TMZ耐药细胞的特性 | 本文首次揭示了表皮生长因子受体(EGFR)缺陷和下游信号减弱可能导致三重阳性CSCs亚群的静止表型和化学耐药性，并提出EGF+TMZ联合治疗可能是克服细胞静止和TMZ耐药的有效策略 | NA | 研究TMZ耐药胶质母细胞瘤细胞的特性，并探索克服TMZ耐药的新策略 | TMZ耐药的胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 使用MGMT-超甲基化U87细胞建立的异种移植模型 |
| 1497 | 2024-08-08 |
Sex differences exist in adult heart group 2 innate lymphoid cells
2022-10-31, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00525-0
PMID:36316644
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研究论文 | 本文研究了成年心脏中第2组先天淋巴细胞（ILC2s）的性别差异 | 首次揭示了心脏ILC2s中存在的性别差异，并探讨了可能的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类中的相关性 | 探讨心脏ILC2s在不同性别小鼠中的数量和功能差异 | 小鼠心脏中的第2组先天淋巴细胞（ILC2s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括3周和8周龄的野生型（WT）和Rag2-/-小鼠 |
| 1498 | 2024-08-08 |
Scoring model based on the signature of non-m6A-related neoantigen-coding lncRNAs assists in immune microenvironment analysis and TCR-neoantigen pair selection in gliomas
2022-10-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03713-z
PMID:36309750
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研究论文 | 本文研究了非m6A相关新抗原编码长非编码RNA（lncRNA）在胶质瘤中的作用，并建立了一个新抗原激活评分（NAS）模型来预测患者的生存结果和TCR-新抗原配对选择。 | 本文首次建立了基于非m6A相关新抗原编码lncRNA特征的NAS模型，并验证了其在预测胶质瘤患者生存结果和TCR-新抗原配对选择中的有效性。 | 本文的局限性在于仅分析了13种非m6A相关新抗原编码lncRNA，且模型验证的数据集有限。 | 研究非m6A相关新抗原编码lncRNA在胶质瘤进展中的作用，并探索其在CAR-T细胞疗法中的潜在应用。 | 非m6A相关新抗原编码lncRNA、胶质瘤患者的生存结果、TCR-新抗原配对选择。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 机器学习 | NAS模型 | RNA测序数据、单细胞测序数据 | 13种非m6A相关新抗原编码lncRNA，两个RNA-seq数据集和两个单细胞测序数据集 |
| 1499 | 2024-08-08 |
Reactive Oxygen Species and Oxidative Stress in the Pathogenesis of MAFLD
2022-Oct-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2022.00067
PMID:36304513
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研究论文 | 本文探讨了代谢相关脂肪性肝病（MAFLD）的发病机制，特别是活性氧（ROS）和氧化应激的作用 | 研究了Nrf2激活、甲状腺激素受体β（THRβ）激动剂和核过氧化物酶体增殖激活受体（PPAR）家族在减少MAFLD中氧化应激和炎症的作用，并采用了多组学策略进行假设自由的分子变化分析 | MAFLD进展的临床和分子成分之间的真正相互作用仍部分未被理解 | 研究MAFLD的发病机制及其与氧化应激的关系 | 代谢相关脂肪性肝病（MAFLD）及其发病机制 | NA | 代谢相关脂肪性肝病 | 多组学分析 | NA | 转录组 | 未具体说明 |
| 1500 | 2024-08-08 |
Osteocytes regulate senescence of bone and bone marrow
2022-10-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81480
PMID:36305580
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研究论文 | 研究探讨了成骨细胞在调节骨骼和骨髓衰老中的作用 | 首次证明了成骨细胞通过调节衰老相关分泌表型（SASP）在骨和骨髓细胞谱系规范中发挥关键作用 | NA | 探究成骨细胞在骨和骨髓细胞谱系规范及组织稳态中的调节作用 | 成骨细胞及其在骨骼和骨髓衰老中的作用 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用条件性删除成骨细胞的鼠模型进行研究 |