单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1461 2024-08-08
The Tumor Microenvironment Reprograms Immune Cells
2022-12, Cellular reprogramming IF:1.2Q4
综述 本文综述了肿瘤微环境如何通过创建免疫抑制环境和代谢竞争来重新编程免疫细胞和其他基质细胞,以限制其抗肿瘤能力 利用单细胞测序技术分析了肿瘤微环境中免疫细胞和其他基质细胞的肿瘤特异性特征 NA 探讨肿瘤细胞如何重新编程肿瘤微环境及外周血中的免疫细胞,以提高当前免疫治疗效率并提出新的抗癌思路 肿瘤微环境中的免疫细胞和其他基质细胞 NA NA 单细胞测序技术 NA NA NA
1462 2024-08-08
Single-cell transcriptional and functional analysis of dopaminergic neurons in organoid-like cultures derived from human fetal midbrain
2022-12-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了从人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中多巴胺能神经元的转录组和功能成熟过程 本文首次揭示了3D类器官培养条件比单层培养条件更能有效地生成和维持成熟的多巴胺能神经元 NA 研究旨在开发从多能干细胞生成中脑多巴胺神经元的精细分化协议,以应用于疾病模型、诊断、药物筛选和基于细胞的治疗方法 人类胎儿中脑衍生的类器官培养物中的多巴胺能神经元 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 6-11周龄的人类胎儿中脑组织
1463 2024-08-08
Prostaglandin E2 synchronizes lunar-regulated beach spawning in grass puffers
2022-11-21, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了草河豚在月相周期下海滩产卵的同步机制 首次揭示了前列腺素E2(PGE)在月相周期下同步草河豚海滩产卵行为中的作用 NA 理解草河豚在月相周期下海滩产卵的机制 草河豚的垂体和下丘脑 NA NA RNA测序(RNA-seq) NA RNA 2个月内每周收集的雄性草河豚的垂体和下丘脑样本
1464 2024-08-08
Single-cell transcriptome profiling reveals heterogeneous neutrophils with prognostic values in sepsis
2022-Nov-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术对近300,000个人类外周血细胞进行转录组分析,揭示了具有预后价值的异质性中性粒细胞 首次通过单细胞RNA测序技术详细划分了中性粒细胞的四种亚型,并发现其中一种亚型Neu1与脓毒性休克显著相关,其基因表达模块Neu1_C具有高预测性 NA 研究中性粒细胞在脓毒症中的异质性及其作为预后生物标志物的潜力 人类外周血细胞中的中性粒细胞 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 近300,000个人类外周血细胞
1465 2024-08-08
Adult human kidney organoids originate from CD24+ cells and represent an advanced model for adult polycystic kidney disease
2022-11, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文报道了成人肾脏类器官来源于CD24+细胞,并展示了其在成人多囊肾病模型中的高级应用 首次揭示了成人肾脏类器官(tubuloids)来源于特定的CD24上皮亚群,并展示了其在模拟常染色体显性多囊肾病(ADPKD)中的应用 NA 研究成人肾脏类器官的细胞起源及其在成人多囊肾病模型中的应用 成人肾脏类器官(tubuloids)及其在成人多囊肾病中的应用 数字病理学 多囊肾病 单细胞RNA测序 NA 细胞 涉及CRISPR-Cas9基因编辑的PKD1和PKD2敲除类器官以及人类ADPKD和对照组织
1466 2024-08-08
Characterization of the tumour microenvironment phenotypes in malignant tissues and pleural effusion from advanced osteoblastic osteosarcoma patients
2022-11, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了晚期成骨性骨肉瘤患者恶性组织和胸腔积液中的肿瘤微环境表型 首次提供了晚期成骨性骨肉瘤患者胸腔积液和原发肿瘤的细胞图谱 NA 探究成骨性骨肉瘤患者胸腔积液中的细胞环境,并寻找潜在的治疗靶点 成骨性骨肉瘤患者的胸腔积液和肿瘤组织 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 27,260个细胞来自7个胸腔积液样本,91,186个细胞来自8个骨肉瘤组织样本
1467 2024-08-08
Identification of MRAP protein family as broad-spectrum GPCR modulators
2022-11, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用,并重新定义了其在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络。 本研究首次全面阐明了MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的复杂GPCR网络,并重新定义了MRAP蛋白家族作为广谱GPCR调节因子的作用。 NA 研究MRAP蛋白家族在两个主要内分泌器官中的GPCR调节作用。 MRAP1和MRAP2蛋白及其在GPCR调节中的作用。 NA NA 单细胞转录组分析 NA RNA-seq 涉及人鼠组织的多组RNA-seq数据和单细胞数据
1468 2024-08-08
Identification of a rare Gli1+ progenitor cell population contributing to liver regeneration during chronic injury
2022-Nov-01, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文识别了一种罕见的Gli1+前体细胞群,该细胞群在慢性肝损伤期间有助于肝再生 发现了一种新的双表型细胞群EpCAMGli1,该细胞群具有上皮和间充质双重身份,并能促进肝细胞再生 NA 研究慢性肝损伤后肝细胞再生的新来源 Gli1+前体细胞群及其在肝再生中的作用 NA 肝病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
1469 2024-08-08
SIRPα antibody combined with oncolytic virus OH2 protects against tumours by activating innate immunity and reprogramming the tumour immune microenvironment
2022-10-31, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 本文首次尝试将溶瘤单纯疱疹病毒2型(OH2)与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗,并探讨了这种组合对肿瘤免疫微环境的重新编程作用 首次将溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体联合用于抗肿瘤治疗,为溶瘤病毒疗法提供了新策略 NA 探讨溶瘤病毒与免疫检查点阻断剂联合治疗的可行性及机制 溶瘤病毒OH2与抗SIRPα抗体的联合治疗对肿瘤免疫微环境的影响 免疫学 肿瘤 RNA测序和单细胞RNA测序 NA 细胞和动物模型数据 使用了RAW264.7细胞和小鼠肿瘤模型
1470 2024-08-08
CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,构建了主要器官中CD34+细胞的图谱,并探讨了其在生理和病理条件下的作用 首次展示了CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性,并揭示了其在血管生成和器官纤维化中的双重作用 NA 探究CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和作用 CD34+细胞在主要器官中的分布及其在血管生成和器官纤维化中的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 使用了遗传谱系追踪的小鼠模型
1471 2024-08-08
Revised International Staging System (R-ISS) stage-dependent analysis uncovers oncogenes and potential immunotherapeutic targets in multiple myeloma (MM)
2022-10-31, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过构建单细胞转录组图谱,比较了修订国际分期系统(R-ISS)不同阶段多发性骨髓瘤(MM)患者中的差异表达模式 发现了新的细胞毒性浆细胞(PC)群体,以及与不良预后和EB病毒感染相关的恶性PC群体,并验证了RRM2在MM细胞增殖中的作用 NA 探索多发性骨髓瘤(MM)中修订国际分期系统(R-ISS)阶段依赖的分析,以发现致癌基因和潜在的免疫治疗靶点 多发性骨髓瘤(MM)患者的单细胞转录组 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞转录组 NA 转录组数据 收集了多发性骨髓瘤(MM)患者的样本
1472 2024-08-08
Characterization of EGFR-reprogrammable temozolomide-resistant cells in a model of glioblastoma
2022-Oct-31, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本文通过建立一个获得性TMZ耐药异种移植模型,研究了MGMT-null实验性胶质母细胞瘤中TMZ耐药细胞的特性 本文首次揭示了表皮生长因子受体(EGFR)缺陷和下游信号减弱可能导致三重阳性CSCs亚群的静止表型和化学耐药性,并提出EGF+TMZ联合治疗可能是克服细胞静止和TMZ耐药的有效策略 NA 研究TMZ耐药胶质母细胞瘤细胞的特性,并探索克服TMZ耐药的新策略 TMZ耐药的胶质母细胞瘤细胞 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 使用MGMT-超甲基化U87细胞建立的异种移植模型
1473 2024-08-08
Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在癌症免疫治疗中的整合见解和临床应用 单细胞测序提供了多维度的细胞特征分析,揭示了肿瘤微环境的复杂性、肿瘤异质性、细胞组成和细胞间相互作用等 单细胞技术的临床转化尚未深入,特别是在免疫治疗的应用中 探讨单细胞测序技术在癌症免疫治疗中的进展和新兴策略 单细胞测序技术及其在癌症免疫治疗中的应用 数字病理学 癌症 单细胞测序 NA 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组等多组学数据 NA
1474 2024-08-08
Sex differences exist in adult heart group 2 innate lymphoid cells
2022-10-31, BMC immunology IF:2.9Q3
研究论文 本文研究了成年心脏中第2组先天淋巴细胞(ILC2s)的性别差异 首次揭示了心脏ILC2s中存在的性别差异,并探讨了可能的机制 研究仅限于小鼠模型,且未探讨人类中的相关性 探讨心脏ILC2s在不同性别小鼠中的数量和功能差异 小鼠心脏中的第2组先天淋巴细胞(ILC2s) 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括3周和8周龄的野生型(WT)和Rag2-/-小鼠
1475 2024-08-08
Scoring model based on the signature of non-m6A-related neoantigen-coding lncRNAs assists in immune microenvironment analysis and TCR-neoantigen pair selection in gliomas
2022-10-29, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本文研究了非m6A相关新抗原编码长非编码RNA(lncRNA)在胶质瘤中的作用,并建立了一个新抗原激活评分(NAS)模型来预测患者的生存结果和TCR-新抗原配对选择。 本文首次建立了基于非m6A相关新抗原编码lncRNA特征的NAS模型,并验证了其在预测胶质瘤患者生存结果和TCR-新抗原配对选择中的有效性。 本文的局限性在于仅分析了13种非m6A相关新抗原编码lncRNA,且模型验证的数据集有限。 研究非m6A相关新抗原编码lncRNA在胶质瘤进展中的作用,并探索其在CAR-T细胞疗法中的潜在应用。 非m6A相关新抗原编码lncRNA、胶质瘤患者的生存结果、TCR-新抗原配对选择。 数字病理学 脑瘤 机器学习 NAS模型 RNA测序数据、单细胞测序数据 13种非m6A相关新抗原编码lncRNA,两个RNA-seq数据集和两个单细胞测序数据集
1476 2024-08-08
Reactive Oxygen Species and Oxidative Stress in the Pathogenesis of MAFLD
2022-Oct-28, Journal of clinical and translational hepatology IF:3.1Q2
研究论文 本文探讨了代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)的发病机制,特别是活性氧(ROS)和氧化应激的作用 研究了Nrf2激活、甲状腺激素受体β(THRβ)激动剂和核过氧化物酶体增殖激活受体(PPAR)家族在减少MAFLD中氧化应激和炎症的作用,并采用了多组学策略进行假设自由的分子变化分析 MAFLD进展的临床和分子成分之间的真正相互作用仍部分未被理解 研究MAFLD的发病机制及其与氧化应激的关系 代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)及其发病机制 NA 代谢相关脂肪性肝病 多组学分析 NA 转录组 未具体说明
1477 2024-08-08
Osteocytes regulate senescence of bone and bone marrow
2022-10-28, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究探讨了成骨细胞在调节骨骼和骨髓衰老中的作用 首次证明了成骨细胞通过调节衰老相关分泌表型(SASP)在骨和骨髓细胞谱系规范中发挥关键作用 NA 探究成骨细胞在骨和骨髓细胞谱系规范及组织稳态中的调节作用 成骨细胞及其在骨骼和骨髓衰老中的作用 NA 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA RNA 使用条件性删除成骨细胞的鼠模型进行研究
1478 2024-08-08
Multi-level cellular and functional annotation of single-cell transcriptomes using scPipeline
2022-10-28, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文介绍了一个名为scPipeline的单细胞数据分析工具箱,该工具箱基于现有方法,提供模块化工作流程,用于多层次细胞注释和用户友好的分析报告 scPipeline引入了基于共依赖指数(CDI)的差异表达、使用标记特异性的聚类分辨率优化、基于Miko评分的标记细胞类型注释以及使用无标度共享最近邻网络(SSN)的基因程序发现等新功能 NA 开发一个灵活的计算框架,用于深入的单细胞RNA测序分析 单细胞转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 无标度共享最近邻网络(SSN) 转录组数据 使用多种单细胞RNA测序数据集进行验证
1479 2024-08-08
Live slow-frozen human tumor tissues viable for 2D, 3D, ex vivo cultures and single-cell RNAseq
2022-10-28, Communications biology IF:5.2Q1
research paper 本文展示了从多种实体人癌症中直接慢速冷冻的剩余组织,可以在后续用于不同类型的方法,包括建立2D、3D和体外培养以及单细胞RNA测序 本文首次展示了慢速冷冻的人类肿瘤组织可以用于多种生物学方法,包括2D、3D培养和单细胞RNA测序 NA 验证慢速冷冻的人类肿瘤组织在不同生物学方法中的应用 多种实体人癌症的剩余组织 digital pathology NA single-cell RNA sequencing NA tissue 多种实体人癌症的剩余组织
1480 2024-08-08
Subcellular spatial transcriptomics identifies three mechanistically different classes of localizing RNAs
2022-10-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过亚细胞空间转录组学技术,识别了柱状卵泡上皮细胞(FE)顶端和基底域定位的RNA,并分析了介导其定位的机制 首次在单一组织中全面分析RNA定位的机制,并发现了至少三种不同的RNA定位机制 NA 研究RNA在细胞内的定位机制及其对细胞功能极化的贡献 RNA在柱状卵泡上皮细胞中的定位及其机制 NA NA 亚细胞空间转录组学 NA 转录组数据 柱状卵泡上皮细胞
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