单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 4052 篇文献,本页显示第 1441 - 1460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1441 2024-08-08
Estrogen regulates divergent transcriptional and epigenetic cell states in breast cancer
2022-11-11, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究系统地追踪了乳腺癌细胞系和类器官模型中雌激素反应在单细胞水平上的时间变化,并开发了一种计算工具(TITAN)来量化单细胞数据集中的信号梯度 本研究首次揭示了雌激素反应在单细胞水平上的异质性,并发现了由ER和FOXM1驱动的两种最显著的转录网络 NA 探讨雌激素在乳腺癌中的转录和表观遗传调控机制 乳腺癌细胞系和类器官模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞数据 多个细胞系和类器官模型
1442 2024-08-08
Whole-brain comparison of rodent and human brains using spatial transcriptomics
2022-11-07, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文通过空间转录组学数据,比较了啮齿类和人类大脑的相似性 采用了一种新的监督机器学习方法来提高跨物种对应关系的分辨率 NA 改进啮齿类模型与人类大脑研究结果之间的翻译方法 啮齿类和人类大脑的神经解剖学组织 神经科学 NA 空间转录组学 监督机器学习 转录组数据 使用了公开可获得的脑部转录组数据集
1443 2024-08-08
Rooting through single-cell sequencing in phloem pole cells
2022-11-07, Communications biology IF:5.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1444 2024-08-08
GLI1+ cells are a source of repair-supportive mesenchymal cells (RSMCs) during airway epithelial regeneration
2022-Nov-05, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了修复支持性间充质细胞(RSMCs)在气道上皮再生中的作用,特别是GLI1+细胞在其中的角色 首次报道了GLI1+细胞在气道上皮再生中作为RSMCs的来源,并通过遗传学方法证明了Fgf10在这些细胞中的关键作用 研究主要集中在实验室条件下,可能需要进一步的临床验证 探究GLI1+细胞在气道上皮再生中的作用及其机制 GLI1+细胞和修复支持性间充质细胞(RSMCs) 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 来自非损伤或损伤肺的GLI1+细胞
1445 2024-08-08
Astrocytic dysfunction induced by ABCA1 deficiency causes optic neuropathy
2022-Nov-04, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文研究了ABCA1缺乏导致视网膜星形胶质细胞功能障碍及其在老年小鼠中引起类似青光眼的视神经病变的作用 首次揭示了ABCA1在视网膜星形胶质细胞中的高表达及其缺乏导致视神经病变的新机制 NA 探讨ABCA1缺乏在视网膜星形胶质细胞中引起的功能障碍及其对视神经病变的影响 ABCA1缺乏的视网膜星形胶质细胞及老年小鼠模型 NA 视神经病变 单细胞RNA测序 NA RNA 老年Glia-KO小鼠
1446 2024-08-08
Whole-embryonic identification of maternal microchimeric cell types in mouse using single-cell RNA sequencing
2022-11-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,成功识别了小鼠胚胎中的母源微嵌合细胞类型 首次成功估计了单个小鼠胚胎中母源微嵌合细胞的细胞类型谱 NA 探究母源微嵌合细胞在不同胚胎中的细胞类型谱及其对胚胎发育的影响 小鼠胚胎中的母源微嵌合细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 26个小鼠胚胎
1447 2024-08-08
Single cell profiling of CD45+ spinal cord cells reveals microglial and B cell heterogeneity and crosstalk following spinal cord injury
2022-Nov-04, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序技术分析了脊髓损伤后脊髓中CD45+细胞的异质性和相互作用 揭示了脊髓损伤后微胶质细胞和B细胞的新型相互作用,为脊髓损伤修复提供了新的潜在治疗靶点 NA 探讨脊髓损伤后免疫细胞的响应及其在损伤修复中的作用 脊髓损伤后的CD45+细胞,包括微胶质细胞和B细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞测序 NA 基因表达数据 来自未受伤和受伤的Swiss-webster小鼠的脊髓CD45+细胞,分别在损伤后3天、7天和60天采集
1448 2024-08-08
JAK2V617F mutation drives vascular resident macrophages toward a pathogenic phenotype and promotes dissecting aortic aneurysm
2022-11-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了JAK2V617F突变在主动脉疾病发展中的作用,发现该突变促使血管驻留巨噬细胞向病理性表型转变,并促进主动脉夹层动脉瘤的形成。 通过单细胞RNA测序、遗传修饰小鼠模型和药物治疗等方法,揭示了JAK2V617F突变在早期促进有害的主动脉壁重塑和晚期通过招募循环单核细胞促进主动脉夹层动脉瘤的机制。 NA 研究JAK2V617F突变在主动脉疾病发展中的作用及其机制。 JAK2V617F突变、血管驻留巨噬细胞、主动脉疾病。 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因数据 包括患有骨髓增生性肿瘤的患者和遗传修饰小鼠模型。
1449 2024-08-08
Trade-off between conservation of biological variation and batch effect removal in deep generative modeling for single-cell transcriptomics
2022-Nov-03, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文探讨了在单细胞转录组学中使用深度生成模型时,生物变异保留与批次效应去除之间的权衡问题 引入Pareto多任务学习(Pareto MTL)和互信息神经估计(MINE)来优化生物变异保留与批次效应去除之间的权衡 NA 提供生物变异保留与批次效应去除之间权衡的全局视图 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 深度生成模型 高维数据 NA
1450 2024-08-08
Defects of microtubule cytoskeletal organization in NOA human testes
2022-Nov-03, Reproductive biology and endocrinology : RB&E IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过组织病理学、免疫荧光和单细胞RNA测序分析了非阻塞性无精子症(NOA)患者睾丸中微管细胞骨架的缺陷 首次探讨了微管细胞骨架在人类非阻塞性无精子症发病机制中的作用 样本量较小,且仅限于特定类型的NOA患者 研究微管细胞骨架在人类非阻塞性无精子症中的作用及其对精子发生的影响 NOA患者和正常男性的睾丸组织 NA 男性不育症 免疫荧光(IF)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 组织样本、基因表达数据 正常男性6例,NOA患者(SCO型3例,减数分裂阻滞型3例)
1451 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals rebalancing of immunological response in patients with periodontitis after non-surgical periodontal therapy
2022-11-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了牙周炎患者在接受非手术牙周治疗前后外周血单个核细胞(PBMCs)的转录组变化 首次揭示了牙周炎患者在接受非手术牙周治疗后免疫反应的重新平衡,并识别了牙周炎特有的系统性炎症指标 NA 探究牙周炎患者的系统性免疫反应及其治疗效果 牙周炎患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 数字病理学 牙周病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 健康对照组及配对的牙周炎患者治疗前后的PBMCs样本
1452 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing identifies the properties of myelodysplastic syndrome stem cells
2022-11-03, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1453 2024-08-08
Uncovering the emergence of HSCs in the human fetal bone marrow by single-cell RNA-seq analysis
2022-11-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿骨髓和脾脏中造血干细胞/祖细胞及其微环境的转录组图谱,揭示了造血干细胞在骨髓中出现的时间点及其功能。 首次通过单细胞RNA测序技术精确确定了人类胎儿骨髓中功能性造血干细胞出现的时间点,并探讨了造血干细胞迁移和维持的可能机制。 NA 揭示人类胎儿骨髓中造血干细胞的出现时间及其功能,并探讨其迁移和维持机制。 人类胎儿骨髓和脾脏中的造血干细胞/祖细胞及其微环境。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 从10到14周的胎儿骨髓和脾脏样本
1454 2024-08-08
A single-cell transcriptome atlas of glial diversity in the human hippocampus across the postnatal lifespan
2022-11-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序技术,生成了人类海马体在出生后生命周期中的单细胞转录组图谱,并分析了星形胶质细胞、少突胶质细胞系和微胶质细胞的亚群及其与特定生理功能、年龄相关变化和疾病相关性的关系。 首次揭示了人类海马体中胶质细胞的分子多样性及其在生命周期中的时间动态变化,并利用胶质亚群分类作为参考图谱,揭示了从人多能干细胞分化而来的胶质细胞的多样性。 NA 扩展对人类胶质细胞多样性、出生后生命周期中群体动态变化以及阿尔茨海默病中失调机制的理解。 人类海马体中的胶质细胞及其在生命周期中的动态变化。 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序 NA 转录组数据 NA
1455 2024-08-08
Single-cell transcriptomics identifies Keap1-Nrf2 regulated collective invasion in a Drosophila tumor model
2022-11-02, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了果蝇卵巢中极性基因敲降后的细胞侵袭行为,并揭示了Keap1-Nrf2信号通路在此过程中的作用 发现了Keap1-Nrf2信号通路与细胞可塑性在肿瘤早期发生中的新联系 NA 探究极性丧失后细胞可塑性的调控机制及介质 果蝇卵巢中的极性基因敲降细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 多个可辨别的表型细胞
1456 2024-08-08
Stromal androgen signaling acts as tumor niches to drive prostatic basal epithelial progenitor-initiated oncogenesis
2022-11-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过体内实验和鼠模型研究,发现基质细胞中雄激素受体(AR)的缺失会减少前列腺上皮细胞的肿瘤发生 首次揭示了基质细胞中AR信号在前列腺肿瘤发生中的作用机制 NA 探讨基质细胞中AR信号在前列腺肿瘤发生中的作用 基质细胞和前列腺上皮细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 使用鼠模型进行研究
1457 2024-08-08
MicroRNA-874 targets phosphomevalonate kinase and inhibits cancer cell growth via the mevalonate pathway
2022-11-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究探讨了微小RNA-874(miR-874)通过靶向磷甲羟戊酸激酶(PMVK)和固醇调节元件结合蛋白2(SREBF2)抑制癌症细胞生长及其与甲羟戊酸途径的关系 首次阐明了miR-874通过靶向PMVK和SREBF2抑制甲羟戊酸途径,从而导致细胞凋亡和p53途径激活的新机制 研究主要基于细胞和数据库分析,未来需在动物模型中验证这些发现 探究miR-874在癌症细胞生长抑制中的作用及其与甲羟戊酸途径的关系 miR-874、PMVK、SREBF2以及p53途径 数字病理学 癌症 下一代测序分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及多种癌症类型的细胞样本和TCGA数据库中的基因表达数据
1458 2024-08-08
Mycn regulates intestinal development through ribosomal biogenesis in a zebrafish model of Feingold syndrome 1
2022-11, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文通过构建斑马鱼Feingold综合征1型模型,研究了Mycn通过调控核糖体生物合成影响肠道发育的机制 首次在斑马鱼模型中揭示了Mycn功能缺失导致肠道发育障碍的分子机制,并提出了赖氨酸补充作为潜在治疗策略的可能性 NA 探究Mycn在斑马鱼模型中调控肠道发育的分子机制及寻找潜在的治疗策略 斑马鱼Feingold综合征1型模型中的肠道发育 分子生物学 遗传性疾病 单细胞RNA测序,批量RNA测序,代谢组学分析,Northern blot,核糖体分析 斑马鱼模型 RNA序列,代谢数据 NA
1459 2024-08-08
Blockade of the BLT1-LTB4 axis does not affect mast cell migration towards advanced atherosclerotic lesions in LDLr-/- mice
2022-11-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 研究BLT1-LTB4轴阻断对LDLr-/-小鼠中晚期动脉粥样硬化斑块内肥大细胞迁移的影响 展示了人类斑块内白细胞可能是局部产生LTB的来源 未能证明BLT1拮抗作用对晚期动脉粥样硬化中肥大细胞积累或斑块大小的影响 探讨BLT1拮抗作用是否能抑制晚期动脉粥样硬化中的肥大细胞积累 LDLr-/-小鼠中的晚期动脉粥样硬化斑块 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
1460 2024-08-08
Identification and characterization of innate lymphoid cells generated from pluripotent stem cells
2022-11-01, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文报道了从多能干细胞(PSC)衍生的造血祖细胞(iHPCs)中生成先天淋巴细胞(ILCs)的首次实验证据 首次报道了PSC衍生的iHPCs移植后生成ILCs的现象,并通过单细胞转录组学揭示了PSC衍生ILCs的发育轨迹 NA 探究从多能干细胞衍生的造血祖细胞中生成先天淋巴细胞的过程 先天淋巴细胞(ILCs)及其在多能干细胞衍生的造血祖细胞中的生成 细胞生物学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
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