单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals variable trajectories of CSPCs in the progression of osteoarthritis
2022-Nov, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2022.e11148
PMID:36339749
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示了骨关节炎进展中软骨源性干细胞/祖细胞（CSPCs）的变异轨迹 | 首次在单细胞水平上分析了骨关节炎进展中CSPCs的细胞功能和命运变化，并探索了CSPCs在骨关节炎进展中的动态变化 | 研究依赖于从Gene Expression Omnibus数据库下载的数据，可能存在数据质量和代表性的限制 | 理解骨关节炎病理过程中CSPCs的变化模式，以开发针对骨关节炎的干细胞疗法 | 骨关节炎患者的软骨源性干细胞/祖细胞（CSPCs） | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | Seurat包 | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 1442 | 2024-08-08 |
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of triple-negative breast cancer patients after surgery
2022-Nov, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1016/j.ijsu.2022.106936
PMID:36341760
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研究论文 | 本文通过分析多种程序性细胞死亡模式，构建了一个细胞死亡指数（CDI）模型，用于预测三阴性乳腺癌患者术后预后和药物敏感性 | 本文创新性地利用12种程序性细胞死亡模式构建了一个细胞死亡指数（CDI）模型，该模型能够准确预测三阴性乳腺癌患者的临床预后和药物敏感性 | NA | 研究目的是构建一个能够预测三阴性乳腺癌患者术后预后和药物敏感性的模型 | 研究对象是三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法 | 无监督聚类模型 | 转录组数据、基因组数据和临床信息 | 数据来自TCGA-BRCA、METABRIC等多个队列 |
| 1443 | 2024-08-08 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
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研究论文 | 研究严重COVID-19患者中鼻咽部真菌定植及其与IL-17反应的关系 | 首次详细分析了严重COVID-19患者中鼻咽部真菌定植与IL-17反应的关联，并探讨了免疫反应在疾病进展中的作用 | 研究样本量未具体说明，且未涵盖所有可能的真菌种类 | 探讨严重COVID-19患者中真菌定植与免疫反应的关系 | 严重COVID-19患者的鼻咽部和气管样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本量未在摘要中提及 |
| 1444 | 2024-08-08 |
Aberrant Expression of Thymosin Beta-4 Correlates With Advanced Disease and BRAF V600E Mutation in Thyroid Cancer
2022-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554221138370
PMID:36321670
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研究论文 | 本研究探讨了胸腺素β-4（TMSB4X）在良性和恶性甲状腺肿瘤中的免疫染色模式 | 发现TMSB4X在多种甲状腺癌中异常高表达，并与疾病进展特征相关，可能是BRAF V600E突变的新型下游效应因子 | NA | 研究TMSB4X在甲状腺肿瘤中的表达及其与疾病进展的关系 | 胸腺素β-4在甲状腺良恶性肿瘤中的表达 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 141名分化型甲状腺癌患者 |
| 1445 | 2024-08-08 |
Intra-tumor heterogeneity and prognostic risk signature for hepatocellular carcinoma based on single-cell analysis
2022-10, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221110659
PMID:36330895
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肝细胞癌的肿瘤内异质性，并建立了一个新的九基因预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序数据建立了肝细胞癌的九基因预后模型，揭示了肝细胞癌微环境中不同细胞亚群的特征 | NA | 研究肝细胞癌的肿瘤内异质性并建立预后风险模型 | 肝细胞癌及其癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 64,634个单细胞样本，包括13个肝细胞癌样本和8个癌旁样本 |
| 1446 | 2024-08-08 |
Exploration the global single-cell ecological landscape of adenomyosis-related cell clusters by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1020757
PMID:36324511
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症（AM）的全球单细胞图谱，并探索了相关细胞簇的生物学功能及其在AM中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了AM相关细胞簇的免疫生态特征，并分析了细胞簇中的染色体拷贝数变异（CNV） | NA | 探索子宫内膜异位症（AM）相关细胞簇的单细胞生态景观 | 子宫内膜异位症（AM）患者的细胞簇及其免疫生态特征 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42260个细胞，10个细胞簇 |
| 1447 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Cell Profiling in IMQ Induced Psoriasis-Like Model
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S379349
PMID:36330167
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了咪喹莫特诱导的银屑病样模型中的免疫细胞特征 | 首次系统地研究了咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型中皮肤免疫细胞的异质性，并识别了10个主要细胞群及其标记基因 | NA | 揭示银屑病小鼠模型中的免疫环境特征，并提供对银屑病小鼠免疫反应的系统性见解 | 咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14,439个细胞 |
| 1448 | 2024-08-08 |
EPSTI1 as an immune biomarker predicts the prognosis of patients with stage III colon cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.987394
PMID:36330510
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境中的免疫分子EPSTI1作为III期结肠癌的预后标志物的潜力 | 首次揭示了EPSTI1与III期结肠癌复发自由生存期的显著相关性，并验证了其作为保护因子的作用 | 研究样本量相对较小，需要更大规模的研究来验证结果 | 探索与III期结肠癌预后相关的新的免疫浸润相关分子 | III期结肠癌患者及其肿瘤微环境中的免疫分子 | 数字病理学 | 结肠癌 | TMEscore算法, 分子复合物检测算法, 免疫组化, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 547名III期结肠癌患者 |
| 1449 | 2024-08-08 |
Toward a granular molecular-anatomic map of the blood vasculature - single-cell RNA sequencing makes the leap
2022, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v127.9051
PMID:36337278
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）在生理学和医学领域的新时代中的应用，特别是在血管生物学研究中的潜在影响 | scRNAseq技术使得我们能够精确了解体内不同细胞类型和亚型的基因表达水平及其在发育、组织修复或疾病中的特定细胞状态 | NA | 探讨scRNAseq技术在血管生物学研究中的应用及其对生命科学各领域的影响 | 血管细胞的基因表达差异及其在器官特异性功能中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1450 | 2024-08-08 |
Fatty acid metabolism predicts prognosis and NK cell immunosurveillance of acute myeloid leukemia patients
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1018154
PMID:36338749
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸代谢（FAM）与急性髓系白血病（AML）患者预后及自然杀伤细胞免疫监视之间的关系 | 首次揭示了FAM在AML患者中的预后价值及其对TME免疫监视的影响，并开发了一种基于FAM相关基因的预后模型 | NA | 研究FAM与AML患者预后及免疫监视之间的关系 | 急性髓系白血病患者及其脂肪酸代谢 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据 |
| 1451 | 2024-08-08 |
Combining bulk RNA-sequencing and single-cell RNA-sequencing data to reveal the immune microenvironment and metabolic pattern of osteosarcoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.976990
PMID:36338972
|
研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了骨肉瘤的免疫微环境和代谢模式 | 首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合四种代谢模型，分析了骨肉瘤的肿瘤间异质性和肿瘤内异质性 | NA | 探索骨肉瘤的肿瘤微环境异质性和代谢调控模式 | 骨肉瘤的肿瘤微环境和代谢模式 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 28608个免疫细胞样本，其中7617个为恶性细胞 |
| 1452 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing technologies in bladder cancer research: Applications and challenges
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1027909
PMID:36338973
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用及其面临的挑战 | 单细胞测序技术提供了高吞吐量的测序工具，揭示了膀胱肿瘤的发生、进展和侵袭机制，并有助于发现新的治疗靶点和预后模型 | 缺乏针对膀胱癌的有效靶向治疗或免疫治疗的特定生物标志物 | 探讨单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用，以增进对膀胱肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境复杂生态系统的理解 | 膀胱癌及其治疗抵抗机制和尿液脱落肿瘤细胞的检测 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
| 1453 | 2024-08-08 |
Characterization of the SARS-CoV-2 co-receptor NRP1 expression profiles in healthy people and cancer patients: Implication for susceptibility to COVID-19 disease and potential therapeutic strategy
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.995736
PMID:36338984
|
研究论文 | 研究分析了NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况，并探讨了其作为SARS-CoV-2感染易感性和治疗策略的潜在生物标志物的作用 | 首次全面分析NRP1在不同人群中的表达情况及其与SARS-CoV-2感染和肿瘤发生的关系 | NA | 预测健康人群和癌症患者对SARS-CoV-2的易感性和感染后的预后 | NRP1在健康人群、COVID-19患者和癌症患者中的表达情况 | 数字病理学 | COVID-19疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及健康人群、COVID-19患者和癌症患者的样本 |
| 1454 | 2024-08-08 |
Pathological implications of metabolic reprogramming and its therapeutic potential in medulloblastoma
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1007641
PMID:36340043
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤（MB）中代谢重编程的机制及其在治疗中的潜在应用 | 强调了MB细胞如何通过重编程代谢和能量生产网络来支持快速生长、生存、侵袭、转移和治疗抵抗 | NA | 探讨靶向能量代谢的现有药物在抑制MB进展和提高当前MB治疗效果方面的潜在临床益处 | 髓母细胞瘤及其代谢重编程机制 | NA | 儿童脑肿瘤 | 基因组学、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1455 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome of Nepeta tenuifolia leaves reveal differentiation trajectories in glandular trichomes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.988594
PMID:36340347
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞，揭示了其分化轨迹 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细描绘了Nepeta tenuifolia叶片腺毛细胞的分化和发展轨迹 | NA | 探索植物细胞发育和分化，特别是腺毛的启动和发展 | Nepeta tenuifolia叶片的腺毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 33,254个原生质体 |
| 1456 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics of the lacrimal gland features macrophage activity and epithelium metabolism as key alterations during chronic inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011125
PMID:36341342
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研究论文 | 本研究分析了NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中泪腺的慢性炎症，利用bulk RNAseq和Visium空间基因表达技术，通过Seurat进行无监督聚类，分析了泪腺切片中细胞的空间分布和基因表达变化。 | 首次使用Visium技术验证了bulk RNAseq定义的特定通路在泪腺切片中的激活情况，并发现了一个在Sjögren's综合征中未曾描述过的“TYROBP因果网络”。 | NA | 探讨泪腺慢性炎症过程中的关键改变及其对干眼症的治疗潜力。 | 泪腺的慢性炎症及其在Sjögren's综合征中的表现。 | 数字病理学 | 干眼症 | bulk RNAseq, Visium空间基因表达 | NA | 基因表达数据 | NOD.B10Sn-H2b/J小鼠模型中的泪腺组织 |
| 1457 | 2024-08-08 |
Molecular profiling of core immune-escape genes highlights LCK as an immune-related prognostic biomarker in melanoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1024931
PMID:36341345
|
研究论文 | 本研究通过整合多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集，识别与黑色素瘤免疫治疗相关的潜在预后生物标志物，特别是LCK基因。 | 首次揭示LCK作为免疫相关预后生物标志物在黑色素瘤中的作用，并通过多种分析方法验证其表达与免疫细胞浸润水平及临床预后的关联。 | 研究主要基于现有数据库和测序数据，未涉及大规模临床试验验证。 | 识别与黑色素瘤免疫治疗相关的预后生物标志物。 | 黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫逃逸相关基因。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | 回归分析 | 转录组数据 | 涉及多个黑色素瘤单细胞和转录组测序数据集 |
| 1458 | 2024-08-08 |
The shared biomarkers and pathways of systemic lupus erythematosus and metabolic syndrome analyzed by bioinformatics combining machine learning algorithm and single-cell sequencing analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1015882
PMID:36341378
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合机器学习算法和单细胞测序分析，探讨了系统性红斑狼疮（SLE）和代谢综合征（MetS）之间的共享生物标志物和通路 | 本研究首次通过机器学习技术和单细胞RNA测序验证了SLE和MetS之间的共享关键基因，并构建了有效的诊断模型 | NA | 探讨系统性红斑狼疮和代谢综合征之间的潜在关联及其发病机制 | 系统性红斑狼疮和代谢综合征的共享基因及其在免疫和代谢过程中的作用 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | XG-Boost | 基因表达数据 | NA |
| 1459 | 2024-08-08 |
Protocol to dissociate, process, and analyze the human lung tissue using single-cell RNA-seq
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101776
PMID:36313536
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类肺部生物样本中获取高质量单细胞转录组数据的方法 | 采用机械和酶解法处理组织，通过荧光激活细胞分选（FACS）富集活细胞，并使用基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术 | NA | 开发一种高效获取人类肺组织单细胞转录组数据的方法 | 人类肺部生物样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及来自核心针活检、细针抽吸、手术切除和胸腔积液的人类肺部生物样本 |
| 1460 | 2024-08-08 |
Insights gained from single-cell analysis of immune cells in tofacitinib treatment of Vogt-Koyanagi-Harada disease
2022-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162335
PMID:36301664
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，首次进行了多模态、高维度的分析，生成了一份关于VKH患者在接受TOFA治疗期间免疫细胞亚群组成、基因特征、富集通路和细胞间相互作用的全面人类免疫图谱 | 首次进行了多模态、高维度的分析，生成了一份全面的人类免疫图谱，并识别出与炎症和JAK相关的两种单核细胞亚群，这些亚群在VKH发病机制和TOFA治疗机制中起重要作用 | NA | 探讨TOFA治疗Vogt-Koyanagi-Harada病（VKH）的具体发病机制和靶向治疗策略 | VKH患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |