单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2024-08-08 |
Targeting of Scavenger Receptors Stabilin-1 and Stabilin-2 Ameliorates Atherosclerosis by a Plasma Proteome Switch Mediating Monocyte/Macrophage Suppression
2022-12-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了通过靶向清道夫受体Stabilin-1和Stabilin-2来减轻动脉粥样硬化的机制，主要通过改变血浆蛋白质组来抑制单核细胞/巨噬细胞的活性 | 首次全面研究了靶向Stabilin-1和Stabilin-2对动脉粥样硬化的影响，并发现了一种新的治疗动脉粥样硬化的方法 | NA | 研究靶向Stabilin-1和Stabilin-2对动脉粥样硬化的影响 | Stabilin-1和Stabilin-2在动脉粥样硬化中的作用 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 血浆蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质，RNA | ApoE-KO小鼠，Stab1-KO小鼠，Stab2-KO小鼠，Ldlr-KO小鼠 |
| 1402 | 2024-08-08 |
Biologic insights from single-cell studies of psoriasis and psoriatic arthritis
2022-12, Expert opinion on biological therapy
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/14712598.2022.2142465
PMID:36317702
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研究论文 | 本文讨论了单细胞技术在银屑病和银屑病关节炎研究中的应用，特别是单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性和相互作用 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了多种细胞类型在银屑病发病机制中的辅助作用，并展示了机器学习模型在早期诊断中的潜力 | 文章提到了单细胞研究的局限性和未来挑战，但未具体说明 | 探讨单细胞技术在银屑病和银屑病关节炎病理机制中的应用 | 研究对象包括T细胞、髓样细胞、角质形成细胞、先天淋巴细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA | 22项单细胞研究 |
| 1403 | 2024-08-08 |
SREBP2/Rab11s/GLUT1/6 network regulates proliferation and migration of glioblastoma
2022-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2022.154176
PMID:36327817
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研究论文 | 研究探讨了SREBP2/Rab11s/GLUT1/6网络在胶质母细胞瘤增殖和迁移中的调控作用 | 首次揭示了SREBP2/Rab11/GLUT网络在胶质母细胞瘤细胞生长中的作用，并识别了潜在的治疗靶点 | NA | 研究SREBP2/Rab11s/GLUT1/6网络在胶质母细胞瘤进展中的调控作用 | 胶质母细胞瘤组织和T98G细胞系 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 蛋白质印迹（western blotting）, 反转录定量PCR | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤组织和T98G细胞系 |
| 1404 | 2024-08-08 |
An artificial LAMA2-GelMA hydrogel microenvironment for the development of pancreatic endocrine progenitors
2022-12, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 研究开发了一种基于LAMA2-GelMA的混合水凝胶，作为内分泌谱系形成和成熟的仿生载体，用于改善人胚胎干细胞衍生的β细胞的分化效率和功能。 | 本研究首次开发了LAMA2-GelMA混合水凝胶，通过调节转录因子的表达和整合素-AKT信号传导，显著提高了胰腺内分泌祖细胞的功能和成熟度。 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体试验来验证其临床应用的可行性。 | 旨在开发一种基于蛋白质组学和组织工程的胰腺特异性微环境，用于糖尿病的治疗。 | 研究对象包括胰腺内分泌祖细胞、人胚胎干细胞衍生的β细胞以及LAMA2-GelMA混合水凝胶。 | 组织工程 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 蛋白质 | 使用小鼠模型进行体内实验，具体样本数量未详细说明。 |
| 1405 | 2024-08-08 |
An improved Fuzzy based GWO algorithm for predicting the potential host receptor of COVID-19 infection
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106050
PMID:36334362
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研究论文 | 本文通过改进的模糊聚类技术结合灰狼优化算法（GWO），预测COVID-19感染的潜在宿主受体 | 提出了一种结合进化算法变异和交叉操作的改进GWO算法，增强了灰狼种群的遗传多样性，并通过消除弱个体提高了算法的探索和开发能力 | NA | 旨在识别与ACE2和TMPRSS2转录和生物学上相似的新型病毒受体或膜蛋白，以帮助理解COVID-19感染在人类中的趋向性、传播和发病机制 | COVID-19病毒的潜在宿主受体 | 生物信息学 | COVID-19 | 灰狼优化算法（GWO） | 模糊聚类 | 蛋白质表达谱 | 58种新型病毒受体和816种膜蛋白 |
| 1406 | 2024-08-08 |
scBPGRN: Integrating single-cell multi-omics data to construct gene regulatory networks based on BP neural network
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106249
PMID:36335815
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研究论文 | 提出了一种基于BP神经网络的算法scBPGRN，用于整合单细胞RNA测序数据和DNA甲基化数据构建基因调控网络 | 使用双权极端相关系数衡量因子间的相关性，并利用神经网络计算广义权重来构建基因调控网络 | NA | 通过整合单细胞多组学数据构建包含更多组学信息的基因调控网络，以深入理解癌症的发病机制 | 肝细胞癌（HCC）数据 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化 | BP神经网络 | 基因调控网络 | 涉及两个亚群的单细胞数据 |
| 1407 | 2024-08-08 |
Identification of underexplored mesenchymal and vascular-related cell populations in human skeletal muscle
2022-12-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00364.2022
PMID:36342160
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人体骨骼肌中的未充分探索的间质细胞群体，特别是血管相关细胞类型。 | 首次在人体骨骼肌中发现并描述了表达pericyte和pan-endothelial基因的endothelial-like pericytes (ELPCs)，并探讨了其在细胞转化中的潜在作用。 | 研究仅限于年轻个体的骨骼肌样本，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性。 | 揭示人体骨骼肌中未充分探索的间质细胞群体的特征和功能。 | 人体骨骼肌中的间质细胞群体，特别是血管相关细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 约2,000个细胞 |
| 1408 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals immunopathological cell composition of skin lesions in subacute cutaneous lupus erythematosus
2022-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2022.109172
PMID:36343898
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了亚急性皮肤红斑狼疮（SCLE）皮肤病变中的细胞组成，并与健康对照组进行了比较 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SCLE中扩展的成纤维细胞和角质形成细胞亚型，以及异常激活的淋巴细胞和炎症性M1巨噬细胞 | NA | 探究亚急性皮肤红斑狼疮（SCLE）的免疫发病机制 | SCLE皮肤病变中的细胞组成 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | SCLE皮肤病变和健康对照组皮肤组织的scRNA-seq数据 |
| 1409 | 2024-08-08 |
BISC: accurate inference of transcriptional bursting kinetics from single-cell transcriptomic data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac464
PMID:36326081
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BISC的贝叶斯方法，用于从单细胞转录组数据中准确推断转录爆发动力学参数 | BISC基于beta-gamma-Poisson模型，通过建模均值-方差依赖性，实现了从噪声数据中准确估计爆发参数，相比现有方法在低表达基因上表现出更高的准确性和可靠性 | NA | 探索单细胞转录组数据中的转录爆发动力学 | 单细胞转录组数据中的转录爆发参数 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 贝叶斯方法 | 单细胞转录组数据 | 包括小鼠胚胎细胞和成纤维细胞数据集、人类免疫细胞数据集和人类胰腺细胞数据集 |
| 1410 | 2024-08-08 |
IReNA: Integrated regulatory network analysis of single-cell transcriptomes and chromatin accessibility profiles
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105359
PMID:36325073
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研究论文 | 本文开发了集成调控网络分析（IReNA）方法，通过整合单细胞转录组和染色质可及性数据进行网络推断和模块化分析 | IReNA方法能够更精确地识别已知调控因子，并优于现有方法 | NA | 开发一种新的方法来整合单细胞转录组和染色质可及性数据，以进行更精确的调控网络分析 | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 使用公开数据集 |
| 1411 | 2024-08-08 |
Cellular plasticity and immune microenvironment of malignant pleural effusion are associated with EGFR-TKI resistance in non-small-cell lung carcinoma
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105358
PMID:36339256
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研究论文 | 本研究评估了非小细胞肺癌（NSCLC）相关恶性胸腔积液（MPE）在理解肿瘤异质性和识别EGFR酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗反应因素方面的诊断潜力 | 研究通过单细胞RNA测序分析，发现EGFR TKI耐药组中肺上皮前体样细胞和过渡效应T细胞、浆细胞样树突状细胞的富集 | NA | 探讨恶性胸腔积液中的细胞可塑性和免疫抑制微环境与EGFR突变非小细胞肺癌患者TKI反应的关系 | 非小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 9名非小细胞肺癌患者（5名耐药，4名敏感）的31,743个细胞 |
| 1412 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq transcriptomic landscape of human and mouse islets and pathological alterations of diabetes
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105366
PMID:36339258
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了人鼠胰岛细胞的转录组图谱，并探讨了2型糖尿病的病理变化 | 首次详细描绘了胰岛细胞的完整细胞景观，并发现了2型糖尿病中β细胞的显著异质性和表达变化 | NA | 深入理解糖尿病的病理机制 | 人鼠胰岛细胞及2型糖尿病的病理变化 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和2型糖尿病小鼠的胰岛细胞 |
| 1413 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals different signatures of mesenchymal stromal cell pluripotent-like and multipotent populations
2022-Nov-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105395
PMID:36339265
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了人骨髓间充质基质细胞中多能样和多能群体的不同基因表达特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细比较了多能样Muse-MSCs和多能MSCs在基因表达上的差异，并进一步通过无监督聚类分析了这些细胞亚群的基因表达模式 | NA | 探究维持干细胞特性的必要属性 | 人骨髓间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多能样Muse-MSCs和多能MSCs的多个样本 |
| 1414 | 2024-08-08 |
Estrogen regulates divergent transcriptional and epigenetic cell states in breast cancer
2022-11-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac908
PMID:36318267
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研究论文 | 本研究系统地追踪了乳腺癌细胞系和类器官模型中雌激素反应在单细胞水平上的时间变化，并开发了一种计算工具（TITAN）来量化单细胞数据集中的信号梯度 | 本研究首次揭示了雌激素反应在单细胞水平上的异质性，并发现了由ER和FOXM1驱动的两种最显著的转录网络 | NA | 探讨雌激素在乳腺癌中的转录和表观遗传调控机制 | 乳腺癌细胞系和类器官模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多个细胞系和类器官模型 |
| 1415 | 2024-08-08 |
Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models
2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04589-4
PMID:36346530
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review | 本文综述了人滋养层细胞和干细胞（hTSCs）的转录组学数据，评估了这些细胞模型的实用性和适用性，并探讨了它们在早期滋养层发育中的再现能力。 | 整合并评估了基于细胞的hTSC模型与体内样本的转录组数据，以及单细胞RNA测序数据集，以识别这些模型的效用和适用性。 | NA | 评估人滋养层细胞和干细胞模型的转录组学数据，并探讨其在早期滋养层发育中的应用。 | 人滋养层细胞和干细胞（hTSCs）及其在生殖、肿瘤和移植领域的潜在应用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1416 | 2024-08-08 |
Whole-brain comparison of rodent and human brains using spatial transcriptomics
2022-11-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79418
PMID:36342372
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学数据，比较了啮齿类和人类大脑的相似性 | 采用了一种新的监督机器学习方法来提高跨物种对应关系的分辨率 | NA | 改进啮齿类模型与人类大脑研究结果之间的翻译方法 | 啮齿类和人类大脑的神经解剖学组织 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | 监督机器学习 | 转录组数据 | 使用了公开可获得的脑部转录组数据集 |
| 1417 | 2024-08-08 |
Rooting through single-cell sequencing in phloem pole cells
2022-11-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04180-4
PMID:36344596
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1418 | 2024-08-08 |
GLI1+ cells are a source of repair-supportive mesenchymal cells (RSMCs) during airway epithelial regeneration
2022-Nov-05, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04599-2
PMID:36333491
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研究论文 | 本研究探讨了修复支持性间充质细胞（RSMCs）在气道上皮再生中的作用，特别是GLI1+细胞在其中的角色 | 首次报道了GLI1+细胞在气道上皮再生中作为RSMCs的来源，并通过遗传学方法证明了Fgf10在这些细胞中的关键作用 | 研究主要集中在实验室条件下，可能需要进一步的临床验证 | 探究GLI1+细胞在气道上皮再生中的作用及其机制 | GLI1+细胞和修复支持性间充质细胞（RSMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自非损伤或损伤肺的GLI1+细胞 |
| 1419 | 2024-08-08 |
Astrocytic dysfunction induced by ABCA1 deficiency causes optic neuropathy
2022-Nov-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq1081
PMID:36332025
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研究论文 | 本文研究了ABCA1缺乏导致视网膜星形胶质细胞功能障碍及其在老年小鼠中引起类似青光眼的视神经病变的作用 | 首次揭示了ABCA1在视网膜星形胶质细胞中的高表达及其缺乏导致视神经病变的新机制 | NA | 探讨ABCA1缺乏在视网膜星形胶质细胞中引起的功能障碍及其对视神经病变的影响 | ABCA1缺乏的视网膜星形胶质细胞及老年小鼠模型 | NA | 视神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年Glia-KO小鼠 |
| 1420 | 2024-08-08 |
Whole-embryonic identification of maternal microchimeric cell types in mouse using single-cell RNA sequencing
2022-11-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-20781-9
PMID:36333354
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，成功识别了小鼠胚胎中的母源微嵌合细胞类型 | 首次成功估计了单个小鼠胚胎中母源微嵌合细胞的细胞类型谱 | NA | 探究母源微嵌合细胞在不同胚胎中的细胞类型谱及其对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎中的母源微嵌合细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 26个小鼠胚胎 |