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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1401 | 2024-08-08 |
Laying the foundation for single-cell studies in bats
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.10.010
PMID:36351371
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术研究了Eonycteris spelaea蝙蝠肺组织中的免疫细胞谱,揭示了Pteropine orthoreovirus (PRV3M)感染后的体内免疫反应 | 首次在蝙蝠中应用单细胞转录组学技术,为未来比较免疫学研究提供了范例 | NA | 探索蝙蝠作为病毒宿主的免疫反应机制 | Eonycteris spelaea蝙蝠肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
1402 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of the in vivo response to viral infection in the cave nectar bat Eonycteris spelaea
2022-11-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.10.008
PMID:36351376
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了洞果蝠在体内感染双链RNA病毒后的免疫反应 | 首次详细描述了洞果蝠在病毒感染后肺部免疫细胞的动态变化及其分子机制 | NA | 探究洞果蝠在病毒感染后的免疫反应机制 | 洞果蝠的肺部免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
1403 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling and chromatin accessibility reveal an exhausted regulatory CD4+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2022-11-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111606
PMID:36351407
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研究论文 | 本研究通过ATAC-seq和单细胞转录组测序技术,分析了系统性红斑狼疮(SLE)患者和健康对照者的外周CD4 T细胞的异质性,揭示了Treg细胞的转录功能障碍及其与疾病严重性的关联。 | 本研究首次揭示了SLE患者中具有功能性衰竭特征的CCR7CD74 Treg亚群,为理解SLE的发病机制提供了新的视角。 | NA | 探索系统性红斑狼疮(SLE)中CD4 T细胞的调控组异质性及其与疾病发生的关系。 | 系统性红斑狼疮(SLE)患者和健康对照者的外周CD4 T细胞。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 72名SLE患者和30名健康对照者的外周CD4 T细胞 |
1404 | 2024-08-08 |
Progesterone Promotes In Vitro Maturation of Domestic Dog Oocytes Leading to Successful Live Births
2022-Nov-03, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12111778
PMID:36362933
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研究论文 | 本研究探讨了孕酮在体外成熟犬卵母细胞中的作用,并通过优化体外成熟系统成功获得了活体犬。 | 首次通过添加孕酮优化犬卵母细胞的体外成熟系统,成功获得活体犬,并建立了一种新的低成本犬只生产方法。 | NA | 研究孕酮在犬卵母细胞体外成熟中的作用,并优化体外成熟系统以提高效率和降低成本。 | 犬卵母细胞的体外成熟及其质量评估。 | 生物医学研究 | NA | 体外受精和单细胞RNA测序 | NA | 卵母细胞 | 使用了不同孕酮浓度的微滴培养的犬卵母细胞 |
1405 | 2024-08-08 |
Gonadal Sex Differentiation and Ovarian Organogenesis along the Cortical-Medullary Axis in Mammals
2022-Nov-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113373
PMID:36362161
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综述 | 本文综述了哺乳动物沿着皮质-髓质轴的性腺性别分化和卵巢器官发生的机制 | 揭示了支持细胞系的双波增殖及其在性腺性别分化早期阶段和围产期阶段的形成过程中的细胞和分子事件 | NA | 探讨性腺性别分化沿着皮质-髓质轴的机制,并比较不同哺乳动物卵巢皮质和髓质区域的特征 | 哺乳动物的性腺性别分化和卵巢器官发生 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
1406 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics with light barcodes in intact tissues
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01577-8
PMID:36347989
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1407 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq relates GWAS variants to disease risk
2022-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01570-1
PMID:36347991
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1408 | 2024-08-08 |
Cross-protection against African swine fever virus upon intranasal vaccination is associated with an adaptive-innate immune crosstalk
2022-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010931
PMID:36350837
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研究论文 | 本研究探讨了通过鼻内疫苗接种非洲猪瘟病毒(ASFV)后诱导的免疫反应及其对病毒的交叉保护作用 | 首次详细描述了鼻内接种BA71ΔCD2突变病毒后,从适应性免疫到先天免疫的正反馈机制,以及这种机制如何促进对ASFV的交叉保护 | NA | 研究非洲猪瘟病毒的免疫保护机制,为开发有效疫苗提供理论基础 | 非洲猪瘟病毒及接种疫苗后的猪免疫细胞反应 | NA | 非洲猪瘟 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 接种疫苗的猪的血液和淋巴结细胞 |
1409 | 2024-08-08 |
A spatiotemporally resolved single-cell atlas of the Plasmodium liver stage
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05406-5
PMID:36352220
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和单分子转录成像技术,研究了鼠疟原虫在肝脏阶段与宿主肝细胞的时空表达程序 | 首次揭示了肝细胞分区对寄生虫分子水平发育的影响,并识别了不同区域中寄生虫基因表达的差异 | NA | 旨在深入理解疟原虫肝脏阶段的感染机制 | 鼠疟原虫Plasmodium berghei ANKA及其宿主肝细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,单分子转录成像 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未明确提及 |
1410 | 2024-08-08 |
The neurons that restore walking after paralysis
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05385-7
PMID:36352232
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研究论文 | 本文展示了通过在神经康复期间对腰椎脊髓进行时空经皮电刺激(EES),在九名慢性脊髓损伤患者中恢复行走能力 | 本文首次识别出在脊髓损伤后通过EES恢复行走所必需的特定神经元亚群,并展示了这些神经元在恢复行走中的关键作用 | NA | 旨在识别脊髓损伤后恢复行走所必需的神经元亚群 | 慢性脊髓损伤患者及小鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 分子数据 | 九名慢性脊髓损伤患者及小鼠模型 |
1411 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Distinct Cardiac-Derived Stromal Cell Subpopulations
2022-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9110374
PMID:36354773
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了新生儿和儿童来源的心脏基质细胞亚群,以优化基于心脏基质细胞的治疗并改善患者预后 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究新生儿和儿童心脏基质细胞的亚群差异,并识别出与纤维化和免疫反应相关的基因上调 | 研究仅限于新生儿和儿童的心脏基质细胞样本,未来研究需扩展到更多年龄段和样本类型 | 旨在通过单细胞水平的研究,识别和表征心脏基质细胞亚型,以优化基于心脏基质细胞的治疗 | 新生儿和儿童的心脏基质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个新生儿心脏基质细胞样本和5个儿童心脏基质细胞样本 |
1412 | 2024-08-08 |
A Case Series Exploration of Multi-Regional Expression Heterogeneity in Triple-Negative Breast Cancer Patients
2022-Nov-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113322
PMID:36362107
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研究论文 | 本研究探索了三阴性乳腺癌患者中的多区域表达异质性,通过评估基因表达和影像学来源的多区域差异 | 开发了一种新的分析框架来解析和表征不同类型的变异性,并进行了贝叶斯变化点分析来评估和分类区域变异性 | 研究样本量有限,仅涉及10名三阴性乳腺癌患者 | 探索三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性及其对治疗抵抗的影响 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 贝叶斯变化点分析 | 基因表达数据和影像数据 | 10名三阴性乳腺癌患者,每个肿瘤2-4个区域 |
1413 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis constructed the macrophage related gene-related signature in lung adenocarcinoma and verified by an independent cohort
2022-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110520
PMID:36372305
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组分析构建了与巨噬细胞相关的基因特征,并在肺腺癌中进行了验证 | 首次基于巨噬细胞在肺腺癌中的不同免疫模式,构建了一个四基因的预后特征 | NA | 探索巨噬细胞与肺腺癌患者预后的关系,并构建预后特征 | 肺腺癌患者的巨噬细胞相关基因和免疫模式 | 数字病理学 | 肺腺癌 | sc-RNAseq, ssGSEA, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 两个sc-RNAseq数据集,TCGA-LUAD队列,五个GEO-LUAD数据集和包含112个肺腺癌样本的独立队列 |
1414 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights the functional role of human endogenous retroviruses in gallbladder cancer
2022-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104319
PMID:36374772
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人内源性逆转录病毒在胆囊癌中的功能作用 | 发现HERVs在胆囊癌中以细胞类型特异性的方式转录,并与不同的生物学效应相关,HERVH可能作为胆囊癌的早期诊断标志物 | NA | 探索HERVs在胆囊癌中的转录景观及其潜在功能影响 | 胆囊癌组织及其配对邻近组织中的HERVs | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名胆囊癌患者的肿瘤组织及其配对邻近组织 |
1415 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Identified ASTN2 as a Migration Biomarker in Adult Glioblastoma
2022-Oct-30, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12111472
PMID:36358398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,在成人胶质母细胞瘤中鉴定了ASTN2作为迁移生物标志物 | 首次报道了ASTN2在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用,并验证了其在临床预后中的不良影响 | NA | 探索成人胶质母细胞瘤中ASTN2的表达及其对细胞迁移能力的影响 | 成人胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
1416 | 2024-08-08 |
A Resilience Related Glial-Neurovascular Network Is Transcriptionally Activated after Chronic Social Defeat in Male Mice
2022-10-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213405
PMID:36359800
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研究论文 | 本研究通过数据驱动的行为分层和单细胞转录组学分析,探讨了慢性社交挫败应激后小鼠海马体的分子机制 | 揭示了慢性应激后海马体在神经免疫反应、血管生成、髓鞘形成和神经发生中的作用,并证明了雷帕霉素作为药物干预可以显著增加应激恢复力 | NA | 理解慢性应激反应的分子过程并探索针对性的干预措施 | 小鼠海马体在慢性社交挫败应激后的分子响应 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
1417 | 2024-08-08 |
Multiplexed Digital Spatial Protein Profiling Reveals Distinct Phenotypes of Mononuclear Phagocytes in Livers with Advanced Fibrosis
2022-10-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213387
PMID:36359782
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研究论文 | 本研究利用多重数字空间蛋白质分析技术,揭示了晚期肝纤维化中肝内单核吞噬细胞的独特蛋白质特征 | 首次使用空间定义的基于蛋白质的多重分析技术,展示了早期和晚期肝纤维化中门静脉单核吞噬细胞表型的关键差异 | NA | 旨在通过多重数字空间蛋白质分析技术,推导出预测晚期肝纤维化的独特蛋白质特征 | 肝内单核吞噬细胞在晚期肝纤维化中的表型 | 数字病理学 | 肝病 | 多重数字空间蛋白质分析(Nanostring GeoMX) | NA | 蛋白质数据 | 64个门静脉感兴趣区域(ROIs) |
1418 | 2024-08-08 |
Prognosis and Immunological Characteristics of PGK1 in Lung Adenocarcinoma: A Systematic Analysis
2022-Oct-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215228
PMID:36358653
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研究论文 | 本文通过系统分析探讨了磷酸甘油酸激酶1(PGK1)在肺腺癌(LUAD)中的预后和免疫学特性 | 首次确定了PGK1在肺腺癌中改变肿瘤微环境(TME)的作用,并揭示了PGK1与多种免疫细胞和免疫检查点的关联 | 需要更多的实验和临床转化研究来验证PGK1在肺腺癌中的作用 | 研究PGK1在肺腺癌中的预后和免疫学特性,探索潜在的免疫代谢联合治疗策略 | 肺腺癌中的PGK1基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | DNA测序、mRNA测序、甲基化修饰、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、蛋白质数据 | 多个独立公共数据集中的大量样本 |
1419 | 2024-08-08 |
Exploring Transcriptomic Landscapes in Red Blood Cells, in Their Extracellular Vesicles and on a Single-Cell Level
2022-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232112897
PMID:36361688
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研究论文 | 本文通过下一代测序和单细胞RNA测序技术,研究了红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了红细胞中约10%的细胞含有可检测水平的mRNA,并形成了基于转录组的三个亚群 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探索红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征,并研究这些转录组在细胞间通讯中的作用 | 红细胞及其细胞外囊泡的转录组 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
1420 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Differentiation Trajectories of Infiltrating CD8+ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2022-Oct-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215183
PMID:36358600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和分化轨迹 | 首次详细描述了肺腺癌中CD8+ T细胞的分化轨迹和功能状态,并筛选出影响患者预后的关键基因 | 研究仅基于单个数据集,结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 深入理解肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和功能耗竭,并寻找潜在的治疗靶点 | 肺腺癌中的CD8+ T细胞及其分化轨迹 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE131907数据集中的样本,并在TCGA样本中进行了验证 |