单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1381 - 1400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1381 | 2024-08-08 |
A spatiotemporally resolved single-cell atlas of the Plasmodium liver stage
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05406-5
PMID:36352220
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和单分子转录成像技术，研究了鼠疟原虫在肝脏阶段与宿主肝细胞的时空表达程序 | 首次揭示了肝细胞分区对寄生虫分子水平发育的影响，并识别了不同区域中寄生虫基因表达的差异 | NA | 旨在深入理解疟原虫肝脏阶段的感染机制 | 鼠疟原虫Plasmodium berghei ANKA及其宿主肝细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，单分子转录成像 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未明确提及 |
| 1382 | 2024-08-08 |
The neurons that restore walking after paralysis
2022-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05385-7
PMID:36352232
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研究论文 | 本文展示了通过在神经康复期间对腰椎脊髓进行时空经皮电刺激（EES），在九名慢性脊髓损伤患者中恢复行走能力 | 本文首次识别出在脊髓损伤后通过EES恢复行走所必需的特定神经元亚群，并展示了这些神经元在恢复行走中的关键作用 | NA | 旨在识别脊髓损伤后恢复行走所必需的神经元亚群 | 慢性脊髓损伤患者及小鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 分子数据 | 九名慢性脊髓损伤患者及小鼠模型 |
| 1383 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Distinct Cardiac-Derived Stromal Cell Subpopulations
2022-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9110374
PMID:36354773
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了新生儿和儿童来源的心脏基质细胞亚群，以优化基于心脏基质细胞的治疗并改善患者预后 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究新生儿和儿童心脏基质细胞的亚群差异，并识别出与纤维化和免疫反应相关的基因上调 | 研究仅限于新生儿和儿童的心脏基质细胞样本，未来研究需扩展到更多年龄段和样本类型 | 旨在通过单细胞水平的研究，识别和表征心脏基质细胞亚型，以优化基于心脏基质细胞的治疗 | 新生儿和儿童的心脏基质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个新生儿心脏基质细胞样本和5个儿童心脏基质细胞样本 |
| 1384 | 2024-08-08 |
A Case Series Exploration of Multi-Regional Expression Heterogeneity in Triple-Negative Breast Cancer Patients
2022-Nov-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232113322
PMID:36362107
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研究论文 | 本研究探索了三阴性乳腺癌患者中的多区域表达异质性，通过评估基因表达和影像学来源的多区域差异 | 开发了一种新的分析框架来解析和表征不同类型的变异性，并进行了贝叶斯变化点分析来评估和分类区域变异性 | 研究样本量有限，仅涉及10名三阴性乳腺癌患者 | 探索三阴性乳腺癌中的肿瘤内异质性及其对治疗抵抗的影响 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 贝叶斯变化点分析 | 基因表达数据和影像数据 | 10名三阴性乳腺癌患者，每个肿瘤2-4个区域 |
| 1385 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis constructed the macrophage related gene-related signature in lung adenocarcinoma and verified by an independent cohort
2022-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110520
PMID:36372305
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组分析构建了与巨噬细胞相关的基因特征，并在肺腺癌中进行了验证 | 首次基于巨噬细胞在肺腺癌中的不同免疫模式，构建了一个四基因的预后特征 | NA | 探索巨噬细胞与肺腺癌患者预后的关系，并构建预后特征 | 肺腺癌患者的巨噬细胞相关基因和免疫模式 | 数字病理学 | 肺腺癌 | sc-RNAseq, ssGSEA, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 两个sc-RNAseq数据集，TCGA-LUAD队列，五个GEO-LUAD数据集和包含112个肺腺癌样本的独立队列 |
| 1386 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights the functional role of human endogenous retroviruses in gallbladder cancer
2022-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104319
PMID:36374772
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人内源性逆转录病毒在胆囊癌中的功能作用 | 发现HERVs在胆囊癌中以细胞类型特异性的方式转录，并与不同的生物学效应相关，HERVH可能作为胆囊癌的早期诊断标志物 | NA | 探索HERVs在胆囊癌中的转录景观及其潜在功能影响 | 胆囊癌组织及其配对邻近组织中的HERVs | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名胆囊癌患者的肿瘤组织及其配对邻近组织 |
| 1387 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis Identified ASTN2 as a Migration Biomarker in Adult Glioblastoma
2022-Oct-30, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12111472
PMID:36358398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，在成人胶质母细胞瘤中鉴定了ASTN2作为迁移生物标志物 | 首次报道了ASTN2在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并验证了其在临床预后中的不良影响 | NA | 探索成人胶质母细胞瘤中ASTN2的表达及其对细胞迁移能力的影响 | 成人胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1388 | 2024-08-08 |
A Resilience Related Glial-Neurovascular Network Is Transcriptionally Activated after Chronic Social Defeat in Male Mice
2022-10-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213405
PMID:36359800
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研究论文 | 本研究通过数据驱动的行为分层和单细胞转录组学分析，探讨了慢性社交挫败应激后小鼠海马体的分子机制 | 揭示了慢性应激后海马体在神经免疫反应、血管生成、髓鞘形成和神经发生中的作用，并证明了雷帕霉素作为药物干预可以显著增加应激恢复力 | NA | 理解慢性应激反应的分子过程并探索针对性的干预措施 | 小鼠海马体在慢性社交挫败应激后的分子响应 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1389 | 2024-08-08 |
Multiplexed Digital Spatial Protein Profiling Reveals Distinct Phenotypes of Mononuclear Phagocytes in Livers with Advanced Fibrosis
2022-10-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11213387
PMID:36359782
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研究论文 | 本研究利用多重数字空间蛋白质分析技术，揭示了晚期肝纤维化中肝内单核吞噬细胞的独特蛋白质特征 | 首次使用空间定义的基于蛋白质的多重分析技术，展示了早期和晚期肝纤维化中门静脉单核吞噬细胞表型的关键差异 | NA | 旨在通过多重数字空间蛋白质分析技术，推导出预测晚期肝纤维化的独特蛋白质特征 | 肝内单核吞噬细胞在晚期肝纤维化中的表型 | 数字病理学 | 肝病 | 多重数字空间蛋白质分析（Nanostring GeoMX） | NA | 蛋白质数据 | 64个门静脉感兴趣区域（ROIs） |
| 1390 | 2024-08-08 |
Prognosis and Immunological Characteristics of PGK1 in Lung Adenocarcinoma: A Systematic Analysis
2022-Oct-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215228
PMID:36358653
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研究论文 | 本文通过系统分析探讨了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在肺腺癌（LUAD）中的预后和免疫学特性 | 首次确定了PGK1在肺腺癌中改变肿瘤微环境（TME）的作用，并揭示了PGK1与多种免疫细胞和免疫检查点的关联 | 需要更多的实验和临床转化研究来验证PGK1在肺腺癌中的作用 | 研究PGK1在肺腺癌中的预后和免疫学特性，探索潜在的免疫代谢联合治疗策略 | 肺腺癌中的PGK1基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | DNA测序、mRNA测序、甲基化修饰、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、蛋白质数据 | 多个独立公共数据集中的大量样本 |
| 1391 | 2024-08-08 |
Exploring Transcriptomic Landscapes in Red Blood Cells, in Their Extracellular Vesicles and on a Single-Cell Level
2022-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232112897
PMID:36361688
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研究论文 | 本文通过下一代测序和单细胞RNA测序技术，研究了红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了红细胞中约10%的细胞含有可检测水平的mRNA，并形成了基于转录组的三个亚群 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探索红细胞及其细胞外囊泡的转录组特征，并研究这些转录组在细胞间通讯中的作用 | 红细胞及其细胞外囊泡的转录组 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1392 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Differentiation Trajectories of Infiltrating CD8+ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2022-Oct-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14215183
PMID:36358600
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和分化轨迹 | 首次详细描述了肺腺癌中CD8+ T细胞的分化轨迹和功能状态，并筛选出影响患者预后的关键基因 | 研究仅基于单个数据集，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 深入理解肺腺癌中浸润性CD8+ T细胞的异质性和功能耗竭，并寻找潜在的治疗靶点 | 肺腺癌中的CD8+ T细胞及其分化轨迹 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE131907数据集中的样本，并在TCGA样本中进行了验证 |
| 1393 | 2024-08-08 |
Novel IKZF3 transcriptomic signature correlates with positive outcomes of skin cutaneous melanoma: A pan-cancer analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1036402
PMID:36353107
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研究论文 | 本研究通过多数据库分析，探讨了Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤（SKCM）之间的潜在关系，并评估了其在不同癌症类型中的转录特征和临床预后。 | 首次识别出Ikaros基因家族在不同癌症中的泛癌基因组特征，并发现其高表达与SKCM的良好免疫状态和有益临床结果相关。 | NA | 研究Ikaros家族基因与皮肤皮肤黑色素瘤的关系及其在不同癌症类型中的表达特征和临床预后。 | Ikaros家族基因在皮肤皮肤黑色素瘤及其他癌症中的表达及其与临床预后的关系。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10,327个转录组样本 |
| 1394 | 2024-08-08 |
Identification of biomarkers for hepatocellular carcinoma based on single cell sequencing and machine learning algorithms
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.873218
PMID:36353113
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和机器学习算法，从八名肝细胞癌患者的肿瘤细胞和配对正常肝细胞中筛选出区分肝细胞癌和正常肝组织的核心生物标志物 | 采用单细胞RNA测序技术揭示肿瘤异质性，并结合机器学习算法筛选生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及八名患者 | 提高肝细胞癌患者的预后 | 肝细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 八名肝细胞癌患者 |
| 1395 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of human gut T cells identifies cytotoxic CD4+CD8A+ T cells related to mouse CD4 cytotoxic T cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.977117
PMID:36353619
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在人类肠道T细胞中鉴定出与小鼠CD4细胞毒性T细胞相关的细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞 | 首次在人类肠道中发现细胞毒性CD4+CD8A+ T细胞，并与小鼠CD4细胞毒性T细胞进行比较分析 | 研究主要集中在肠道炎症疾病患者，未涉及其他疾病状态 | 鉴定人类肠道中的细胞毒性CD4 T细胞，并分析其在炎症性肠病（IBD）患者中的特征 | 人类肠道T细胞及炎症性肠病患者的细胞毒性CD4 T细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1396 | 2024-08-08 |
TREM2 knockdown improves the therapeutic effect of PD-1 blockade in hepatocellular carcinoma
2022-12-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.10.079
PMID:36332476
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研究论文 | 研究通过使用自补体腺相关病毒（scAAV）在体内有效抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的TREM2表达，发现TREM2敲低能抑制肝细胞癌的生长，并增强PD-1免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次揭示了TREM2在肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表达功能，并发现TREM2敲低能重塑TAMs为免疫刺激状态，增强PD-1阻断疗法的疗效 | NA | 探讨TREM2在肝细胞癌中的作用及其对PD-1阻断疗法效果的影响 | 肝细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用TREM2敲除小鼠和野生型小鼠进行比较研究 |
| 1397 | 2024-08-08 |
Protocol to isolate live single cells while retaining spatial information by combining cell photolabeling and FACS
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101795
PMID:36325581
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研究论文 | 本文介绍了一种结合细胞光标记和荧光激活细胞分选（FACS）的方法，用于从原发性乳腺癌肿瘤中分离活单细胞并保留空间信息 | 提出了一种名为PADME的新方法，通过光转换区域来解剖微环境，从而在分离单细胞的同时保留其空间定位 | NA | 开发一种新的技术方法，用于在分离活单细胞的同时保留其空间信息 | 原发性乳腺癌肿瘤中的活单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | NA |
| 1398 | 2024-08-08 |
Rethinking the visceral innervation --- Peek into the emerging field of molecular dissection of neural signals
2022-12-10, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.09.011
PMID:36344152
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研究论文 | 本文探讨了神经系统与内脏之间的交流，特别是内脏神经支配的细胞和分子特性，并介绍了单细胞RNA测序等新兴技术在神经科学中的应用 | 本文利用单细胞RNA测序等新兴技术，为解决内脏神经支配的未解之谜提供了强大的工具 | NA | 旨在基于最新的研究进展，深入理解神经系统在维持体内平衡中的整合作用 | 神经系统与内脏之间的交流及其细胞和分子特性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1399 | 2024-08-08 |
Combined PD-L1 and TIM3 blockade improves expansion of fit human CD8+ antigen-specific T cells for adoptive immunotherapy
2022-Dec-08, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2022.09.016
PMID:36320412
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研究论文 | 本文研究了通过结合PD-L1和TIM3阻断剂来改善人类CD8+抗原特异性T细胞的扩增，以用于过继免疫治疗 | 本文首次提出结合PD-L1和TIM3阻断剂来改善抗原特异性T细胞的扩增，而不引起T细胞功能障碍 | 研究主要集中在EBV和WT1抗原特异性CD8 T细胞上，可能不适用于所有类型的抗原特异性T细胞 | 旨在改善抗原特异性T细胞的扩增，以提高过继免疫治疗的效果 | 人类CD8+抗原特异性T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(RNA-seq)和T细胞受体(TCR)谱分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 1400 | 2024-08-08 |
In vivo single-cell transcriptomics reveal Klebsiella pneumoniae skews lung macrophages to promote infection
2022-12-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202216888
PMID:36337046
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研究论文 | 本文揭示了耐药性细菌克雷伯氏肺炎菌如何通过改变肺泡巨噬细胞的极化状态来促进感染的机制 | 首次发现克雷伯氏肺炎菌通过诱导肺泡巨噬细胞向M(Kp)型极化，利用TLR-I型IFN-IL10-STAT6轴重塑巨噬细胞，这是一种新的克服宿主限制的策略 | NA | 阐明耐药性细菌克雷伯氏肺炎菌与宿主防御之间的相互作用机制 | 肺泡巨噬细胞的极化状态及克雷伯氏肺炎菌对其的影响 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞的单细胞转录组数据 |