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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Uncoupling immune trajectories of response and adverse events from anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2022-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.03.039
PMID:35430299
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了肝细胞癌患者接受抗PD-1免疫治疗的应答和不良反应的免疫轨迹机制 | 首次在肝细胞癌中识别出与抗PD-1治疗应答和不良反应相关的CXCR3+CD8+效应记忆T细胞和CD11c+抗原呈递细胞，并提出了抗PD-1与抗TNFR2联合治疗新策略 | 样本量相对有限（新加坡队列32例，韩国队列29例），需要在更大规模研究中验证 | 解析肝细胞癌患者接受抗PD-1免疫治疗的应答和免疫相关不良反应的免疫机制 | 肝细胞癌患者和小鼠肝细胞癌模型 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术验证, 批量RNA测序 | 小鼠肝细胞癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 批量RNA测序数据 | 新加坡队列32例患者60份外周血样本，韩国队列29例患者，20份治疗前后肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
T cell characteristics associated with toxicity to immune checkpoint blockade in patients with melanoma
2022-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01623-z
PMID:35027754
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析黑色素瘤患者外周血样本，发现与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 首次发现循环中活化的CD4记忆T细胞丰度和TCR多样性这两个治疗前因素与严重免疫相关不良事件的发生相关 | 样本量相对有限（共3个队列，n=27、26和18），需要更大规模研究验证 | 探索与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 接受抗PD-1单药或抗PD-1联合抗CTLA-4治疗的黑色素瘤患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 飞行时间质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序 | NA | 单细胞测序数据，质谱流式数据，RNA测序数据 | 93份治疗前和早期治疗血液样本，3个患者队列（n=27、26和18） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Generation of human islet cell type-specific identity genesets
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29588-8
PMID:35440614
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学元分析构建人类胰岛细胞类型特异性基因集 | 开发了比现有基因集更能准确定义胰岛细胞身份的新型基因集，并展示了其在追踪细胞身份变化和揭示遗传机制方面的有效性 | NA | 开发可靠工具评估胰岛细胞身份，为基于细胞的糖尿病治疗提供支持 | 人类α细胞、β细胞、γ细胞和δ细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates type II interferon and chromatin remodeling pathways in immunosuppression of prostate cancer
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2029298
PMID:35127252
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研究论文 | 本研究揭示MUC1-C蛋白通过整合II型干扰素通路和染色质重塑机制促进前列腺癌免疫抑制 | 首次发现MUC1-C通过调控ARID1A/BAF和NuRD复合物协调II型干扰素通路与染色质重塑的机制关联 | 研究主要基于细胞模型和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明MUC1-C在前列腺癌免疫抑制中的分子机制 | 去势抵抗性前列腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
CRISPRi screens in human iPSC-derived astrocytes elucidate regulators of distinct inflammatory reactive states
2022-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01180-9
PMID:36303069
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞转录组学系统解析了人类iPSC来源星形胶质细胞炎症反应状态的调控机制 | 首次建立人iPSC来源星形胶质细胞的CRISPRi筛选平台，发现STAT3调控两种不同炎症反应状态的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证数据相对有限 | 系统研究炎症性星形胶质细胞反应状态的分子调控机制 | 人诱导多能干细胞分化的星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经退行性疾病 | CRISPR干扰筛选,单细胞RNA测序 | CRISPRi | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01091-3
PMID:34764492
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研究论文 | 开发了一种整合单细胞和批量测序数据识别表型相关细胞亚群的方法Scissor | 首次提出通过整合表型相关的批量表达数据和单细胞数据来识别与特定表型相关的细胞亚群 | NA | 开发识别与表型相关的细胞亚群的计算方法 | 单细胞RNA测序数据和批量表达数据 | 生物信息学 | 肺癌,黑色素瘤,面肩肱型肌营养不良症,阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
Temporal transcriptomic analysis using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation in severe COVID-19
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157255
PMID:35175937
|
研究论文 | 开发了TrendCatcher R软件包用于识别和可视化时间序列转录组数据中的动态基因表达模式和生物过程 | 开发了新的开源工具TrendCatcher，能够识别动态差异表达基因的不同时间模式并可视化生物学通路的时间进程 | NA | 开发时间序列转录组数据分析工具并应用于COVID-19研究 | COVID-19患者外周血转录组数据 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 平滑样条ANOVA模型, 断点搜索策略 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Network inference with Granger causality ensembles on single-cell transcriptomics
2022-02-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110333
PMID:35139376
|
研究论文 | 提出一种基于Granger因果关系集成学习的单细胞转录组基因调控网络推断算法SINGE | 使用基于核的Granger因果关系回归处理不规则伪时间序列，并通过集成回归分析聚合预测结果 | 对个别调控因子表现不佳，且对无信息量的伪时间序列敏感 | 从有序单细胞基因表达数据推断基因调控网络 | 小鼠胚胎干细胞分化过程中的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Granger因果关系回归，集成学习 | 单细胞基因表达数据 | 两个小鼠胚胎干细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Delivery of costimulatory blockade to lymph nodes promotes transplant acceptance in mice
2022-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159672
PMID:36519543
|
研究论文 | 本研究探索了通过淋巴结靶向纳米递送抗CD40L抗体促进小鼠心脏移植耐受的机制 | 首次发现成纤维网状细胞在抗CD40L诱导移植耐受中的关键作用，并开发了MECA-79修饰的纳米颗粒实现淋巴结特异性递送 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在大型动物或人体中验证 | 研究淋巴结靶向递送共刺激阻断剂促进心脏移植耐受的机制 | 小鼠心脏移植模型 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 单细胞RNA测序, 纳米颗粒递送技术 | NA | 基因表达数据, 移植存活数据 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
MuSiC2: cell-type deconvolution for multi-condition bulk RNA-seq data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac430
PMID:36208175
|
研究论文 | 提出MuSiC2方法用于多条件下批量RNA-seq数据的细胞类型反卷积分析 | 扩展MuSiC方法，通过迭代估计程序解决批量RNA-seq数据与单细胞参考数据临床条件不匹配时的细胞类型比例估计偏差问题 | 需要至少一个与单细胞参考数据不同的临床条件，且依赖参考数据的质量 | 开发适用于多临床条件下批量RNA-seq数据的细胞类型反卷积方法 | 人类胰岛和视网膜组织的批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 迭代估计算法 | 基因表达数据 | 两个批量RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
A multi-use deep learning method for CITE-seq and single-cell RNA-seq data integration with cell surface protein prediction and imputation
2022-Nov, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-022-00545-w
PMID:36873621
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研究论文 | 提出一种名为sciPENN的多功能深度学习方法，用于整合CITE-seq和单细胞RNA-seq数据，并实现细胞表面蛋白预测和填补 | 开发支持多种功能的一体化深度学习框架，包括数据整合、蛋白表达预测与填补、不确定性量化及细胞类型标签转移 | NA | 解决CITE-seq和单细胞RNA-seq数据整合中的计算挑战，提高数据利用效率 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | 免疫相关疾病，流感，COVID-19 | CITE-seq，单细胞RNA-seq | 深度学习 | 单细胞RNA和蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究TCDD暴露对斑马鱼精子发生的破坏机制 | 首次在环境相关浓度TCDD暴露下，利用单细胞RNA-seq技术解析斑马鱼睾丸中各细胞类型对病理学的不同贡献 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向人类推广需谨慎 | 探究TCDD暴露导致男性不育的环境暴露解释 | 斑马鱼睾丸组织中的各类生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期暴露TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 133 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung endothelial cells identifies dynamic inflammatory and regenerative subpopulations
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.158079
PMID:35511435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序识别肺内皮细胞在炎症损伤过程中的动态炎症和再生亚群 | 首次在肺微血管内皮中发现具有明确功能分工的免疫反应亚群(immuneEC)和血管发育亚群(devEC)，并证实Sox17过表达可抑制内皮细胞炎症激活 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型，在其他类型肺损伤中的普适性需进一步验证 | 探究肺内皮细胞亚群在炎症损伤过程中的动态变化和功能分工 | 肺血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 35,973个肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
PLCG2 is associated with the inflammatory response and is induced by amyloid plaques in Alzheimer's disease
2022-02-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01022-0
PMID:35180881
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研究论文 | 本研究探讨了PLCG2在阿尔茨海默病炎症反应中的作用及其与淀粉样斑块的关联 | 首次在人类AD患者和5xFAD小鼠模型中系统验证PLCG2表达与淀粉样斑块密度的正相关性，并通过单细胞RNA测序揭示其与炎症反应信号通路的关联 | 研究主要基于相关性分析，PLCG2在AD中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明PLCG2在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 晚发性阿尔茨海默病患者、5xFAD小鼠模型、野生型和Plcg2失活小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 免疫染色 | 差异表达分析, 共表达网络分析 | 基因表达数据, 组织图像数据 | 1249例人类脑组织样本，小鼠模型若干 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Deep learning tackles single-cell analysis-a survey of deep learning for scRNA-seq analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab531
PMID:34929734
|
综述 | 本文系统综述了深度学习在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 建立了变分自编码器、自编码器、生成对抗网络和监督深度学习模型的统一数学表示框架，并关联模型损失函数与数据处理步骤的具体目标 | 仅涵盖25种深度学习算法，未涉及所有现有方法 | 为单细胞RNA测序数据分析提供深度学习算法的系统综述和选择指南 | 单细胞RNA测序数据处理流程中的深度学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 自编码器, 生成对抗网络, 监督深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Processing and cryopreservation of human ureter tissues for single-cell and spatial transcriptomics assays
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101854
PMID:36595885
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研究论文 | 本文介绍了用于单细胞和空间转录组学分析的人类输尿管组织处理与冷冻保存优化方案 | 开发了针对人类输尿管组织的单细胞悬液制备和冷冻保存优化方案，以及适用于10x Genomics Visium空间基因表达平台的组织冷冻保存方法 | NA | 建立人类输尿管组织的单细胞和空间转录组学分析样本制备标准流程 | 人类输尿管组织（来自膀胱切除术后） | 单细胞测序技术 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
| 137 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma
2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04073-3
PMID:35713707
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示尤文肉瘤的异质性、发育轨迹及其与神经嵴细胞起源的关系 | 首次在单细胞分辨率揭示尤文肉瘤的发育轨迹异质性，发现JAK1基因在肿瘤发生中的关键作用及潜在治疗价值 | 样本量较小（仅4个肿瘤组织），需要更大规模验证 | 探究尤文肉瘤的细胞异质性、发育轨迹和肿瘤发生机制 | 尤文肉瘤肿瘤组织样本 | 单细胞转录组学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | K-近邻算法, Monocle2伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 4个尤文肉瘤肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
|
研究论文 | 本研究通过生理指标和单细胞转录组学揭示了高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次系统揭示了肠道上皮细胞在饮食改变后1天内的快速转录组适应机制 | 研究仅关注短期反应，长期影响仍需进一步探索 | 探究饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制 | 小鼠肠道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学，计算轨迹分析 | NA | 转录组数据，生理指标数据 | 高脂饮食处理的小鼠肠道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
|
研究论文 | 介绍了一种名为clampFISH 2.0的新型原位RNA检测方法，能够快速、可扩展地检测和扩增RNA信号 | 采用反向挂锁设计，可同时高效检测多种RNA物种并指数级扩增信号，相比前代方法显著减少时间和成本 | NA | 开发高效的多重RNA原位检测和信号扩增技术 | RNA分子在单细胞和组织切片中的检测 | 空间转录组学 | NA | clampFISH 2.0, 原位RNA标记 | NA | RNA检测信号 | 超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学, 多重信号扩增, 顺序检测 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 首次构建了结直肠癌中'干细胞-侵袭路径'的分支轨迹，并建立了多层调控网络来阐明肿瘤细胞获得侵袭特性的关键机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，生物信息学分析 | 聚类分析，伪时间分析，基因集变异分析，基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |