单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2024-09-23	Single-cell transcriptomic signatures and gene regulatory networks modulated by Wls in mammalian midline facial formation and clefts 2022-07-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.200533 PMID:35781558	研究论文	研究了Wls蛋白在哺乳动物中线面部形成和裂隙中的单细胞转录组特征和基因调控网络	结合小鼠遗传学和基因组学方法，揭示了Wls在正常和缺陷的中面部形态发生中的机制，并提供了单细胞分辨率的转录组图谱	NA	探讨Wls蛋白在哺乳动物中线面部形成和裂隙中的作用机制	小鼠的中面部形态发生和相关缺陷	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
122	2024-09-23	Dissecting the treatment-naive ecosystem of human melanoma brain metastasis 2022-07-07, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2022.06.007 PMID:35803246	研究论文	本文通过单细胞/核RNA测序和空间单细胞转录组学分析，揭示了未经治疗的黑色素瘤脑转移的生态系统	首次在未经治疗的黑色素瘤脑转移中进行了全面的单细胞/核RNA测序和空间单细胞转录组学分析，揭示了其独特的生物学特征和免疫微环境	研究样本量较小，且仅限于未经治疗的黑色素瘤脑转移	深入理解黑色素瘤脑转移的生物学特征和免疫微环境	未经治疗的黑色素瘤脑转移和颅外黑色素瘤转移	数字病理学	黑色素瘤	单细胞/核RNA测序、空间单细胞转录组学、T细胞受体测序、RNA/ATAC测序、蛋白质组学、多重成像	NA	RNA	22例未经治疗的黑色素瘤脑转移和10例颅外黑色素瘤转移
123	2024-09-23	Ethanol Consumption Induces Nonspecific Inflammation and Functional Defects in Alveolar Macrophages 2022-07, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2021-0346OC PMID:35380939	研究论文	研究长期酒精摄入对肺泡巨噬细胞免疫功能的影响	首次使用恒河猴模型研究长期酒精摄入对肺泡巨噬细胞的免疫功能和基因表达的影响	研究仅限于恒河猴模型，结果可能不完全适用于人类	探讨长期酒精摄入对肺泡巨噬细胞免疫功能的影响及其机制	肺泡巨噬细胞	NA	NA	RNA测序，染色质可及性测序	NA	RNA数据，染色质可及性数据	恒河猴模型中的肺泡巨噬细胞样本
124	2024-09-23	Profiling of mature-stage human breast milk cells identifies six unique lactocyte subpopulations 2022-07, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abm6865 PMID:35767604	研究论文	研究分析了成熟阶段人乳中的细胞，识别出六个独特的乳细胞亚群	首次通过全面分析流式细胞术、定量PCR和单细胞RNA测序数据，识别出人乳中六个独特的上皮乳细胞亚群，包括三个先前未被发现的亚群	NA	研究健康捐赠者成熟阶段人乳中的细胞特性，并识别其独特的亚群	成熟阶段人乳中的细胞	NA	NA	流式细胞术、定量PCR、单细胞RNA测序	NA	蛋白质、基因、转录组	健康捐赠者的成熟阶段人乳样本
125	2024-09-23	MECP2-related pathways are dysregulated in a cortical organoid model of myotonic dystrophy 2022-06-29, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abn2375 PMID:35767654	研究论文	本文研究了MECP2相关通路在肌强直性营养不良皮质类器官模型中的失调	首次展示了CUG焦点在DM1患者来源的iPSCs衍生的3D皮质类器官成熟早期引起的CELF2蛋白超磷酸化，并揭示了MECP2通路的失调	NA	探究CTG微卫星重复扩展在肌强直性营养不良1型中导致中枢神经系统发育缺陷的分子机制	DM1患者来源的iPSCs衍生的3D皮质类器官	数字病理学	肌强直性营养不良	单细胞RNA测序、增强的交联和免疫沉淀分析	NA	RNA	NA
126	2024-09-23	Single-cell transcriptome and accessible chromatin dynamics during endocrine pancreas development 2022-06-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2201267119 PMID:35733248	研究论文	本文通过单细胞转录组学和染色质可及性分析，研究了小鼠胰腺内分泌细胞的分化过程	本文揭示了调控β-、α-和δ-细胞谱系的转录因子网络，并通过基因组足迹分析确定了调控胰腺细胞发育的转录因子-DNA相互作用	NA	解析调控细胞类型特化的基因调控网络，加速发现稀有细胞谱系关系及其机制	小鼠胰腺内分泌细胞的分化过程	发育生物学	糖尿病	单细胞转录组学、染色质可及性分析、基因组足迹分析	NA	转录组数据、染色质可及性数据	小鼠胰腺内分泌细胞
127	2024-09-23	Targeted Suppression of miRNA-33 Using pHLIP Improves Atherosclerosis Regression 2022-06-24, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320296 PMID:35534923	研究论文	研究使用pHLIP递送系统靶向抑制miRNA-33，以改善动脉粥样硬化的消退	首次使用pHLIP递送系统靶向抑制miRNA-33，避免了传统方法的副作用，并有效改善了动脉粥样硬化的消退	研究仅在特定细胞和组织中验证了效果，尚未在大规模临床试验中验证	开发一种新的靶向递送系统，用于治疗与动脉粥样硬化相关的心血管疾病	miRNA-33在动脉粥样硬化斑块中的作用及pHLIP递送系统的有效性	心血管疾病	动脉粥样硬化	pH低插入肽（pHLIP）	NA	单细胞RNA转录组	动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞
128	2024-09-23	Transcriptional and functional motifs defining renal function revealed by single-nucleus RNA sequencing 2022-06-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2203179119 PMID:35696569	研究论文	本研究通过单核RNA测序技术揭示了果蝇肾脏系统的转录和功能基序	首次通过单核RNA测序技术对果蝇肾脏系统进行全面分析，识别出多种细胞类型及其特异性转录因子，并提供了跨物种的细胞类型匹配	研究仅限于果蝇肾脏系统，未涉及其他物种或疾病模型	揭示果蝇肾脏系统的细胞多样性、谱系和功能	果蝇肾脏系统的Malpighian管和肾细胞	数字病理学	NA	单核RNA测序	NA	RNA	包含11个不同细胞群的成年果蝇肾脏系统样本
129	2024-09-23	Memory-like NK cells armed with a neoepitope-specific CAR exhibit potent activity against NPM1 mutated acute myeloid leukemia 2022-06-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2122379119 PMID:35696582	研究论文	研究展示了通过使用新表位特异性CAR武装的CIML NK细胞对NPM1突变型急性髓系白血病具有强大的抗肿瘤活性	首次展示了使用新表位特异性CAR武装的CIML NK细胞能够显著增强对NPM1突变型AML的抗肿瘤反应，同时避免脱靶毒性	研究结果基于体外和异种移植模型，需要在临床试验中进一步验证	探索使用新表位特异性CAR武装的CIML NK细胞对NPM1突变型急性髓系白血病的治疗潜力	NPM1突变型急性髓系白血病细胞和患者来源的白血病细胞	免疫学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序和质谱流式细胞术	NA	细胞	体外实验涉及AML细胞系和患者来源的白血病细胞，体内实验涉及异种移植模型
130	2024-09-23	Chemotherapy Coupled to Macrophage Inhibition Induces T-cell and B-cell Infiltration and Durable Regression in Triple-Negative Breast Cancer 2022-06-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3714 PMID:35442423	研究论文	研究化疗结合巨噬细胞抑制在三阴性乳腺癌中的免疫刺激作用	开发了一种治疗方案，结合低剂量环磷酰胺和CSF1R抑制剂，有效治疗高度侵袭性的三阴性乳腺癌小鼠模型	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探讨化疗结合巨噬细胞抑制在三阴性乳腺癌中的免疫治疗效果	三阴性乳腺癌小鼠模型及其肿瘤微环境中的免疫细胞	NA	乳腺癌	单细胞RNA测序、高维成像技术	NA	RNA、图像	多个三阴性乳腺癌小鼠模型
131	2024-09-23	Single-cell RNA sequencing reveals immunological rewiring at the maternal-fetal interface following asymptomatic/mild SARS-CoV-2 infection 2022-06-14, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110938 PMID:35662411	研究论文	研究了无症状/轻度SARS-CoV-2感染对妊娠期母胎界面免疫重塑的影响	首次揭示了无症状/轻度SARS-CoV-2感染对妊娠期母胎界面免疫反应的影响，包括抗原呈递和I型干扰素信号通路的减弱、组织驻留的蜕膜巨噬细胞的丢失以及细胞因子/趋化因子信号的增强	研究仅限于血液和足月蜕膜样本，未涵盖其他妊娠阶段或组织类型	探讨无症状/轻度SARS-CoV-2感染对妊娠期母胎界面免疫反应的影响	妊娠期无症状/轻度SARS-CoV-2感染的孕妇及其血液和足月蜕膜样本	数字病理学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	血液和足月蜕膜样本
132	2024-09-23	Association of pyroptosis and severeness of COVID-19 as revealed by integrated single-cell transcriptome data analysis 2022-Jun, Immunoinformatics (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1016/j.immuno.2022.100013 PMID:35434695	研究论文	本文通过整合单细胞转录组数据分析，探讨了细胞焦亡与COVID-19严重程度之间的关联	首次揭示了细胞焦亡在SARS-CoV-2诱导的细胞因子风暴中的关键作用，并开发了一种评估单细胞焦亡状态的评分方法	研究仅基于四个研究的单细胞转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	探讨细胞焦亡与COVID-19严重程度之间的关系，并开发新的评估方法	COVID-19患者的免疫细胞，包括巨噬细胞、中性粒细胞、T细胞和B细胞	NA	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	37,607个免疫细胞，来自四个研究的COVID-19患者
133	2024-09-23	Myeloid LXR (Liver X Receptor) Deficiency Induces Inflammatory Gene Expression in Foamy Macrophages and Accelerates Atherosclerosis 2022-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.122.317583 PMID:35477277	研究论文	研究探讨了髓系LXR（肝X受体）缺乏对泡沫巨噬细胞炎症基因表达和动脉粥样硬化的影响	首次揭示了髓系LXR在促进Trem2基因表达程序和抑制动脉粥样硬化斑块中泡沫细胞炎症中的关键作用	NA	探讨LXR在动脉粥样硬化斑块中泡沫细胞的抗炎作用	髓系LXR缺乏对泡沫巨噬细胞和动脉粥样硬化的影响	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	高胆固醇血症小鼠的斑块细胞
134	2024-09-23	Expansion, persistence, and efficacy of donor memory-like NK cells infused for posttransplant relapse 2022-06-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI154334 PMID:35349491	研究论文	研究了供体记忆样NK细胞在移植后复发中的扩展、持久性和疗效	采用细胞因子诱导的记忆样NK细胞（CIML NK细胞）进行治疗，显示出快速扩展和长期持久性	研究样本量较小，需要进一步研究其独特的体内生物学特性和与T细胞及肿瘤目标的相互作用	评估CIML NK细胞在移植后复发中的治疗潜力	移植后复发的骨髓恶性肿瘤患者	NA	血液肿瘤	质谱流式细胞术和单细胞RNA测序	NA	细胞	6名患者
135	2024-09-23	Molecular Characterization of Membranous Nephropathy 2022-06, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2021060784 PMID:35477557	研究论文	研究利用机器学习框架预测基于基因表达的膜性肾病诊断，并识别膜性肾病特异性基因模块	首次通过机器学习方法识别膜性肾病的特异性基因表达特征，并发现这些基因在肾小球功能网络中的功能富集	研究仅基于NEPTUNE和ERCB两个队列的数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	揭示膜性肾病的分子特征，为疾病分类和靶向治疗提供依据	膜性肾病与其他肾小球疾病的基因表达差异	机器学习	肾病	单细胞测序	机器学习框架	基因表达数据	NEPTUNE和ERCB两个队列的参与者，以及参考肾切除组织的单细胞测序数据
136	2024-09-23	Variant-specific vaccination induces systems immune responses and potent in vivo protection against SARS-CoV-2 2022-05-17, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100634 PMID:35561673	研究论文	研究了针对SARS-CoV-2不同变种的LNP-mRNA疫苗在动物模型中的免疫反应和体内保护效果	首次系统研究了针对SARS-CoV-2野生型和变种（B.1.351和B.1.617）的LNP-mRNA疫苗的免疫反应和体内保护效果	研究仅限于动物模型，尚未在人体中进行验证	评估针对SARS-CoV-2不同变种的LNP-mRNA疫苗的免疫反应和体内保护效果	SARS-CoV-2的野生型和变种（B.1.351和B.1.617）	疫苗学	COVID-19	LNP-mRNA疫苗	NA	单细胞转录组数据	动物模型
137	2024-09-23	Regulation of developmental hierarchy in Drosophila neural stem cell tumors by COMPASS and Polycomb complexes 2022-05-13, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abi4529 PMID:35544555	研究论文	研究了COMPASS和Polycomb复合物在果蝇神经干细胞肿瘤中对发育层次的调控作用	揭示了COMPASS和Polycomb复合物在肿瘤发育层次中的协同作用，以及它们对癌症干细胞（CSC）可塑性和异质性的影响	NA	探讨COMPASS和Polycomb复合物在肿瘤细胞层次结构、组成和生长中的作用	果蝇神经干细胞肿瘤中的COMPASS和Polycomb复合物	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
138	2024-09-23	MYC drives aggressive prostate cancer by disrupting transcriptional pause release at androgen receptor targets 2022-05-13, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-30257-z PMID:35562350	研究论文	研究探讨了MYC在前列腺癌中的作用及其对雄激素受体转录程序的影响	首次揭示了MYC过表达通过干扰转录暂停释放来对抗雄激素受体转录程序，从而促进前列腺癌的发展	NA	探讨MYC在前列腺癌中的作用及其对雄激素受体转录程序的影响	前列腺癌细胞及临床样本	数字病理学	前列腺癌	单细胞转录组学和ChIP-seq	NA	转录组数据	临床样本和前列腺癌细胞
139	2024-09-23	Acquisition of NOTCH dependence is a hallmark of human intestinal stem cell maturation 2022-05-10, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2022.03.007 PMID:35395175	研究论文	研究了NOTCH信号在人类肠道干细胞成熟过程中的作用	首次通过单细胞转录组学观察到OLFM4基因在人类发育过程中表达的变化，并验证了NOTCH信号依赖性随发育增加的假设	仅限于体外实验，未涉及体内验证	探讨NOTCH信号在人类肠道干细胞成熟过程中的作用	人类肠道干细胞及其在不同发育阶段的依赖性	NA	NA	单细胞转录组学、RNA测序	NA	转录组数据	不同发育阶段的肠道组织样本
140	2024-09-23	Single-cell analysis of human testis aging and correlation with elevated body mass index 2022-05-09, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2022.04.004 PMID:35504286	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年男性睾丸细胞的基因表达变化，并探讨了这些变化与身体质量指数的关系	首次在单细胞水平上系统分析了人类睾丸衰老的分子和基因组变化，并发现这些变化与身体质量指数相关	研究样本仅包括年轻和老年男性，未涵盖其他年龄段；研究结果可能受样本量限制	探讨人类睾丸衰老的分子机制及其与身体质量指数的关系	年轻和老年男性的睾丸细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	44,000个细胞，来自年轻和老年男性