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当前共找到 4054 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究TCDD暴露对斑马鱼精子发生的破坏机制 | 首次在环境相关浓度TCDD暴露下，利用单细胞RNA-seq技术解析斑马鱼睾丸中各细胞类型对病理学的不同贡献 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向人类推广需谨慎 | 探究TCDD暴露导致男性不育的环境暴露解释 | 斑马鱼睾丸组织中的各类生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期暴露TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 122 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung endothelial cells identifies dynamic inflammatory and regenerative subpopulations
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.158079
PMID:35511435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序识别肺内皮细胞在炎症损伤过程中的动态炎症和再生亚群 | 首次在肺微血管内皮中发现具有明确功能分工的免疫反应亚群(immuneEC)和血管发育亚群(devEC)，并证实Sox17过表达可抑制内皮细胞炎症激活 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型，在其他类型肺损伤中的普适性需进一步验证 | 探究肺内皮细胞亚群在炎症损伤过程中的动态变化和功能分工 | 肺血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 35,973个肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
PLCG2 is associated with the inflammatory response and is induced by amyloid plaques in Alzheimer's disease
2022-02-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01022-0
PMID:35180881
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研究论文 | 本研究探讨了PLCG2在阿尔茨海默病炎症反应中的作用及其与淀粉样斑块的关联 | 首次在人类AD患者和5xFAD小鼠模型中系统验证PLCG2表达与淀粉样斑块密度的正相关性，并通过单细胞RNA测序揭示其与炎症反应信号通路的关联 | 研究主要基于相关性分析，PLCG2在AD中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明PLCG2在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 晚发性阿尔茨海默病患者、5xFAD小鼠模型、野生型和Plcg2失活小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 免疫染色 | 差异表达分析, 共表达网络分析 | 基因表达数据, 组织图像数据 | 1249例人类脑组织样本，小鼠模型若干 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
Deep learning tackles single-cell analysis-a survey of deep learning for scRNA-seq analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab531
PMID:34929734
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综述 | 本文系统综述了深度学习在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 建立了变分自编码器、自编码器、生成对抗网络和监督深度学习模型的统一数学表示框架，并关联模型损失函数与数据处理步骤的具体目标 | 仅涵盖25种深度学习算法，未涉及所有现有方法 | 为单细胞RNA测序数据分析提供深度学习算法的系统综述和选择指南 | 单细胞RNA测序数据处理流程中的深度学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 自编码器, 生成对抗网络, 监督深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
Processing and cryopreservation of human ureter tissues for single-cell and spatial transcriptomics assays
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101854
PMID:36595885
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研究论文 | 本文介绍了用于单细胞和空间转录组学分析的人类输尿管组织处理与冷冻保存优化方案 | 开发了针对人类输尿管组织的单细胞悬液制备和冷冻保存优化方案，以及适用于10x Genomics Visium空间基因表达平台的组织冷冻保存方法 | NA | 建立人类输尿管组织的单细胞和空间转录组学分析样本制备标准流程 | 人类输尿管组织（来自膀胱切除术后） | 单细胞测序技术 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
| 126 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional profiling reveals heterogeneity and developmental trajectories of Ewing sarcoma
2022-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04073-3
PMID:35713707
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示尤文肉瘤的异质性、发育轨迹及其与神经嵴细胞起源的关系 | 首次在单细胞分辨率揭示尤文肉瘤的发育轨迹异质性，发现JAK1基因在肿瘤发生中的关键作用及潜在治疗价值 | 样本量较小（仅4个肿瘤组织），需要更大规模验证 | 探究尤文肉瘤的细胞异质性、发育轨迹和肿瘤发生机制 | 尤文肉瘤肿瘤组织样本 | 单细胞转录组学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | K-近邻算法, Monocle2伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 4个尤文肉瘤肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
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研究论文 | 本研究通过生理指标和单细胞转录组学揭示了高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次系统揭示了肠道上皮细胞在饮食改变后1天内的快速转录组适应机制 | 研究仅关注短期反应，长期影响仍需进一步探索 | 探究饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制 | 小鼠肠道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学，计算轨迹分析 | NA | 转录组数据，生理指标数据 | 高脂饮食处理的小鼠肠道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
|
研究论文 | 介绍了一种名为clampFISH 2.0的新型原位RNA检测方法，能够快速、可扩展地检测和扩增RNA信号 | 采用反向挂锁设计，可同时高效检测多种RNA物种并指数级扩增信号，相比前代方法显著减少时间和成本 | NA | 开发高效的多重RNA原位检测和信号扩增技术 | RNA分子在单细胞和组织切片中的检测 | 空间转录组学 | NA | clampFISH 2.0, 原位RNA标记 | NA | RNA检测信号 | 超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学, 多重信号扩增, 顺序检测 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 首次构建了结直肠癌中'干细胞-侵袭路径'的分支轨迹，并建立了多层调控网络来阐明肿瘤细胞获得侵袭特性的关键机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，生物信息学分析 | 聚类分析，伪时间分析，基因集变异分析，基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
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研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病但谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛中α细胞功能异常的特征 | 首次发现在胰岛自身免疫早期阶段，当β细胞数量仍正常时α细胞功能已出现异常 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 研究单自身抗体阳性个体胰岛细胞功能异常的早期特征 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛组织 | 糖尿病研究 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，分子表型分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学数据，功能测定数据 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示罕见人类喉软骨肉瘤的细胞组成和肿瘤微环境特征 | 首次系统研究喉软骨肉瘤的单细胞转录组景观，发现SLAMF9基因在肿瘤非免疫细胞中的特异性表达 | 仅分析单一样本，样本量有限 | 解析喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 74岁男性原发性喉软骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 喉软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 1例患者，5455个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqac015
PMID:35434632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现机械疗法能够重编程衰老肌肉基质细胞，促进废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 首次揭示机械疗法通过调节衰老肌肉中基质细胞的基因表达模式，使其更接近年轻肌肉状态，从而促进细胞外基质重塑 | 研究主要基于大鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究机械疗法是否能够促进衰老肌肉在废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 成年和老年大鼠的腓肠肌单核细胞 | 单细胞转录组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序，同位素示踪，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像数据 | 成年和老年大鼠腓肠肌单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
IFN-γ transforms the transcriptomic landscape and triggers myeloid cell hyperresponsiveness to cause lethal lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011132
PMID:36203588
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研究论文 | 本研究揭示了流感诱导的IFN-γ通过触发髓系细胞过度反应导致MRSA共感染时致命性肺损伤的机制 | 首次证明IFN-γ受体信号驱动髓系细胞（特别是CD11c单核吞噬细胞）转录组重编程和过度反应，导致炎症因子风暴和肺组织损伤 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究急性呼吸窘迫综合征（ARDS）发病机制中IFN-γ信号通路的作用 | 小鼠模型中的免疫细胞，特别是髓系细胞和单核吞噬细胞 | 免疫学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
Human B Cells Mediate Innate Anti-Cancer Cytotoxicity Through Concurrent Engagement of Multiple TNF Superfamily Ligands
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.837842
PMID:35392082
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研究论文 | 研究发现人类循环B细胞通过同时表达多种TNF超家族配体介导先天性抗癌细胞毒性 | 首次揭示B细胞作为适应性免疫介质也具有先天性抗癌细胞毒性功能，通过同时表达四种跨膜TNFSF配体协同作用 | 研究样本主要来自头颈鳞状细胞癌患者，需要验证在其他癌症类型中的普适性 | 探索B细胞在先天性抗癌免疫中的作用机制 | 人类外周血B细胞及多种白血病和实体瘤细胞 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 健康个体和头颈鳞状细胞癌患者的外周血B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Locus-specific expression of transposable elements in single cells with CELLO-seq
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01093-1
PMID:34782740
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研究论文 | 开发了结合长读长单细胞RNA测序与计算分析的CELLO-seq方法，用于在单细胞水平测量转座子元件在特定位点的表达 | 首次实现了在单细胞分辨率下对转座子元件进行位点特异性表达分析，解决了短读长测序技术无法准确定位高重复序列的难题 | 对于小鼠中极少数非常年轻的转座子元件仍无法高置信度地映射回参考基因组 | 开发能够准确测量转座子元件位点特异性表达的单细胞测序技术 | 二细胞期小鼠卵裂球和人类诱导多能干细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 二细胞期小鼠卵裂球和人类诱导多能干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CELLO-seq（单细胞长读长RNA测序） |
| 136 | 2025-10-06 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
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研究论文 | 介绍使用BASiCS Bioconductor包分析单细胞RNA测序数据中基因表达变异性的分步计算工作流程 | 提供集成框架同时进行数据标准化、技术噪音量化和下游分析，并在分析步骤间传播统计不确定性 | 依赖于公开可用数据集，需要用户具备一定的生物信息学分析能力 | 开发稳健量化单细胞基因表达变异性的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 公开可用数据集（未指定具体样本数量） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
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研究论文 | 本研究揭示了SH3GLB1通过调控自噬介导线粒体代谢从而促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制 | 首次发现SH3GLB1通过自噬调控线粒体代谢功能介导胶质母细胞瘤对TMZ的耐药性 | 机制研究主要基于体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、动物模型和临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析、细胞分子检测 | NA | RNA转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床肿瘤样本和细胞系，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals three sequential phases of gene expression during zebrafish sensory hair cell regeneration
2022-03-28, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.03.001
PMID:35316618
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示斑马鱼感觉毛细胞再生过程中基因表达的三个连续阶段 | 首次以高时空分辨率揭示斑马鱼感觉毛细胞再生的三个连续转录激活模块 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 理解感觉毛细胞再生的分子机制和转录动态 | 斑马鱼感觉毛细胞 | 单细胞生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
The promising role of new molecular biomarkers in prostate cancer: from coding and non-coding genes to artificial intelligence approaches
2022-09, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-022-00537-2
PMID:35422101
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综述 | 本文系统综述了前列腺癌新型分子标志物（包括编码和非编码基因）及人工智能方法的最新研究进展 | 整合了转录组学、基因组学和人工智能方法在前列腺癌生物标志物发现中的协同应用 | NA | 概述通过转录组学、基因组学和人工智能发现新型分子标志物的最新进展，以改善前列腺癌患者的临床管理 | 前列腺癌相关分子标志物和人工智能分析方法 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 全基因组测序, RNA测序, 外显子组测序, 空间转录组学 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 全基因组测序, 外显子组测序, RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Mitochondrial dysfunction induces ALK5-SMAD2-mediated hypovascularization and arteriovenous malformations in mouse retinas
2022-12-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35262-w
PMID:36496409
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体功能障碍通过ALK5-SMAD2信号通路导致小鼠视网膜血管发育异常和动静脉畸形的机制 | 首次发现线粒体功能障碍通过诱导SMAD2线粒体定位和MAPKs介导的磷酸化增强ALK5-SMAD2信号通路，导致视网膜血管异常 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病中验证 | 探究线粒体功能障碍导致视网膜血管发育异常的分子机制 | 内皮细胞特异性缺失Tfam、Cox10或Trx2基因的小鼠视网膜 | 分子生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像 | 三种不同基因敲除小鼠品系的视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |