单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2024-08-08 |
Ascertaining cells' synaptic connections and RNA expression simultaneously with barcoded rabies virus libraries
2022-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34334-1
PMID:36384944
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SBARRO的方法，利用单细胞RNA测序揭示基于条形码狂犬病毒路径的单突触关系，并描述了体外多种小鼠脑细胞类型的突触网络 | SBARRO方法能够同时确定细胞的突触连接和RNA表达，通过追踪个体狂犬病毒克隆在细胞间的传播，为神经回路的突触组织提供了新的研究机会 | NA | 开发一种新方法来系统描述突触网络及其分子特性 | 小鼠脑细胞类型的突触网络及其分子特性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个突触关系 |
| 1342 | 2024-08-08 |
Differential effects of periodontal microbiome on the rheumatoid factor induction during rheumatoid arthritis pathogenesis
2022-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-21788-y
PMID:36385263
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研究论文 | 本研究探讨了牙周微生物群在类风湿关节炎发病过程中对类风湿因子诱导的影响 | 首次通过16S rRNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了不同牙周细菌种类对类风湿因子诱导的差异性影响 | 研究主要集中在小鼠模型和临床患者的牙周微生物群分析，未来需进一步验证在更广泛人群中的适用性 | 探究牙周微生物群与类风湿因子在类风湿关节炎发病中的关系 | 类风湿关节炎患者和胶原诱导关节炎小鼠的牙周微生物群及类风湿因子状态 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 微生物群数据, 基因表达数据 | 包括类风湿关节炎患者和胶原诱导关节炎小鼠的样本 |
| 1343 | 2024-08-08 |
Tissue-specific transcriptional profiles and heterogeneity of natural killer cells and group 1 innate lymphoid cells
2022-11-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100812
PMID:36384102
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术探讨了自然杀伤细胞（NK细胞）和第1型先天淋巴细胞（ILC1s）在不同组织中的异质性 | 首次揭示了NK细胞和ILC1s在不同组织中的转录特征和异质性，并鉴定了区分这些细胞亚群的关键基因 | NA | 探索NK细胞和ILC1s在不同组织中的异质性及其转录特征 | 自然杀伤细胞（NK细胞）和第1型先天淋巴细胞（ILC1s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1344 | 2024-08-08 |
CD8+ T cell metabolic rewiring defined by scRNA-seq identifies a critical role of ASNS expression dynamics in T cell differentiation
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111639
PMID:36384124
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了CD8 T细胞在体外激活和分化过程中的代谢重编程，并发现ASNS表达动态在T细胞分化中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CD8 T细胞在激活和分化过程中对非必需氨基酸合成与摄取的依赖性变化，并发现ASNS表达动态对T细胞分化的调控作用 | NA | 研究CD8 T细胞在免疫应答中的代谢重编程及其对T细胞分化的影响 | CD8 T细胞的代谢重编程和ASNS表达动态 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1345 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of multiple myelomas refines the molecular features of bortezomib treatment responsiveness
2022-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00884-z
PMID:36380017
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物，分析博来霉素治疗反应的分子特征 | 使用单细胞RNA测序技术识别了与博来霉素反应相关的细胞类型和基因网络，并建立了一个结合临床变量和基因表达的模型来预测治疗反应 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的细胞类型和基因表达模式 | 探索多发性骨髓瘤中博来霉素治疗反应的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物中的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18名未经治疗的多发性骨髓瘤患者 |
| 1346 | 2024-08-08 |
Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer
2022-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05435-0
PMID:36385528
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研究论文 | 本文通过应用原位空间分析技术和单细胞RNA测序，揭示了口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中肿瘤内微生物群的空间、细胞和分子相互作用 | 开发了一种名为INVADEseq的单细胞RNA测序方法，并首次展示了细菌群落占据的微环境与恶性细胞的关联 | NA | 研究肿瘤内微生物群对肿瘤空间和细胞异质性的影响 | 口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中的肿瘤内微生物群及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | 口腔癌，结直肠癌 | 10x Visium空间转录组学，GeoMx数字空间分析，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 患者肿瘤样本 |
| 1347 | 2024-08-08 |
Human striatal organoids derived from pluripotent stem cells recapitulate striatal development and compartments
2022-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001868
PMID:36395338
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研究论文 | 本文开发了一种从人类多能干细胞构建人纹状体类器官的方法，这些类器官能够部分复制胎儿纹状体的发育并形成纹状体和基质样隔间。 | 首次成功从人类多能干细胞中构建出能够复制胎儿纹状体发育的人纹状体类器官，并展示了其在神经电路研究和治疗策略测试中的应用潜力。 | NA | 解码与纹状体相关的神经疾病的发病机制并开发治疗策略。 | 人纹状体类器官及其在神经电路和治疗策略研究中的应用。 | NA | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 类器官 | NA |
| 1348 | 2024-08-08 |
How is spatial transcriptomics influencing cancer research and diagnostics?
2022-11, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2022-0111
PMID:36398881
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学在肿瘤生物学和诊断研究中的应用 | 空间转录组学自2016年开发以来，其受欢迎程度持续上升 | NA | 研究空间转录组学在癌症研究和诊断中的影响 | 空间转录组学在肿瘤生物学和诊断研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1349 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesity
2022-11, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00674-x
PMID:36400935
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肥胖不同阶段雄性小鼠七个器官的约375,000个血管内皮细胞的转录组，揭示了肥胖对内皮细胞的器官特异性影响 | 首次揭示了肥胖对不同器官内皮细胞亚型的特异性影响，并发现肥胖诱导的转录组异常在持续肥胖中加剧，且部分可通过饮食干预和体重减轻缓解 | 研究仅限于雄性小鼠，且未探讨性别差异对结果的影响 | 探究肥胖对不同器官内皮细胞的影响及其潜在的器官特异性脆弱性 | 肥胖不同阶段雄性小鼠的七个器官内皮细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约375,000个内皮细胞 |
| 1350 | 2024-08-08 |
Targeting leptin-positive adipocytes by expressing the Cre recombinase transgene under the endogenous leptin gene
2022-Oct-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.22-236
PMID:36384730
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研究论文 | 本文报道了构建和验证Lep-Cre小鼠品系，该品系通过CRISPR-Cas9技术编辑内源性Lep基因，生成Lep-肽2A（P2A）-Cre融合基因，用于特异性标记LEP阳性脂肪细胞 | 首次构建了特异性靶向LEP脂肪细胞的Lep-Cre小鼠品系 | 在周围器官中观察到不同程度的泄漏活性，但在下丘脑的室旁核中未观察到 | 研究LEP脂肪细胞的发育和生理 | LEP阳性脂肪细胞 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | Lep-Cre Rosa26-loxP-Stop-loxP-tdTomato小鼠 |
| 1351 | 2024-08-08 |
Identification of novel prognostic biomarkers for osteosarcoma: a bioinformatics analysis of differentially expressed genes in the mesenchymal stem cells from single-cell sequencing data set
2022-Oct, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-2370
PMID:36388032
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据集，探索了间充质干细胞（MSCs）在高级骨肉瘤（OS）中的特异性差异表达基因（DEGs），并识别了新的预后生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据集，识别了MSCs与骨形成细胞之间的特异性DEGs，并进一步分析了这些基因的预后价值。 | 本研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证以确认这些基因的预后价值。 | 探索间充质干细胞在骨肉瘤生长和进展中的作用，并识别新的预后生物标志物。 | 间充质干细胞（MSCs）和骨肉瘤细胞中的差异表达基因。 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自GSE152048数据集的MSCs特异性DEGs，并进一步验证了GSE42352数据集中的表达情况。 |
| 1352 | 2024-08-08 |
CommPath: An R package for inference and analysis of pathway-mediated cell-cell communication chain from single-cell transcriptomics
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.10.028
PMID:36382188
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研究论文 | 介绍CommPath，一个用于分析和可视化单细胞转录组数据中配体-受体相互作用和通路介导的细胞间通信链的R包和网络服务器 | CommPath能够优先考虑引发接收细胞特定生物学反应的功能性配体-受体关联，并识别对接收细胞下游细胞类型的影响 | NA | 开发工具以分析单细胞转录组数据中的细胞间通信链 | 配体-受体相互作用和细胞间通信链 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1353 | 2024-08-08 |
MLN2238 exerts its anti-tumor effects via regulating ROS/JNK/mitochondrial signaling pathways in intrahepatic cholangiocarcinoma
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1040847
PMID:36386204
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研究论文 | 研究探讨了MLN2238通过调控ROS/JNK/线粒体信号通路在肝内胆管癌中的抗肿瘤作用 | 使用单细胞RNA测序技术深入探索细胞多样性和分子复杂性，以及MLN2238作为新一代蛋白酶体抑制剂在肝内胆管癌中的作用机制 | 研究仅基于10个肝内胆管癌样本的4,239个合格单细胞RNA测序数据，样本量相对较小 | 探索MLN2238在肝内胆管癌中的作用及其机制，评估其作为治疗选择的潜力 | 肝内胆管癌细胞及其信号通路 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个肝内胆管癌样本，4,239个单细胞 |
| 1354 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Transcriptional Changes in the Cartilage of Subchondral Insufficiency Fracture of the Knee
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S385648
PMID:36386577
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了膝关节次髁不足骨折患者的软骨转录组变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术阐明了膝关节次髁不足骨折和骨关节炎患者软骨中的转录组变化和独特的细胞类型亚群 | NA | 探究膝关节次髁不足骨折对软骨转录组的影响 | 膝关节次髁不足骨折和骨关节炎患者的软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 1355 | 2024-08-08 |
Sympathectomy Ameliorates CFA-Induced Mechanical Allodynia via Modulating Phenotype of Macrophages in Sensory Ganglion in Mice
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S388322
PMID:36386581
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研究论文 | 本研究探讨了交感神经系统在诱发性炎症疼痛中的作用，特别是其对三叉神经节巨噬细胞表型的影响 | 首次研究了交感神经系统对三叉神经节巨噬细胞的调节作用，并探讨了其在诱发性炎症疼痛中的机制 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨交感神经系统在人类疼痛中的作用 | 研究交感神经系统在口腔面部炎症疼痛中的作用及其对三叉神经节巨噬细胞的影响 | 交感神经系统、三叉神经节巨噬细胞、诱发性炎症疼痛 | NA | NA | 免疫组织化学、液相色谱、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 雄性C57BL/6小鼠 |
| 1356 | 2024-08-08 |
Macrophage-Specific Cathepsin as a Marker Correlated with Prognosis and Tumor Microenvironmental Characteristics of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S375250
PMID:36386587
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞特异性半胱氨酸蛋白酶Z（CTSZ）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的表达模式及其与预后和肿瘤微环境特征的关系 | 首次揭示了巨噬细胞特异性CTSZ在ccRCC中的表达与肿瘤微环境特征及患者预后的关联 | NA | 探讨CTSZ在ccRCC中的表达及其与预后和肿瘤微环境特征的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的CTSZ表达 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 免疫组织化学、双标记免疫荧光、单细胞测序、多组学数据分析 | NA | 组织样本、单细胞测序数据 | 两个独立的抗PD-1治疗临床试验的数据 |
| 1357 | 2024-08-08 |
Influence of single-cell RNA sequencing data integration on the performance of differential gene expression analysis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1009316
PMID:36386846
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研究论文 | 本文评估了六种单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析性能的影响 | 本文选择了仅返回完整表达矩阵的数据整合方法，并评估了它们在两个具有相同生物学研究设计的单细胞数据集上的表现 | 大多数测试的方法在整合后改变了数据分布，这对使用参数方法进行分析产生了负面影响 | 研究单细胞RNA测序数据整合方法对差异基因表达分析的影响 | 六种数据整合方法在两个单细胞RNA测序数据集上的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个单细胞RNA测序数据集 |
| 1358 | 2024-08-08 |
The Mechanisms of Systemic Inflammatory and Immunosuppressive Acute-on-Chronic Liver Failure and Application Prospect of Single-Cell Sequencing
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/5091275
PMID:36387424
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研究论文 | 本文探讨了急性-慢性肝衰竭（ACLF）的系统性炎症和免疫抑制机制，并介绍了单细胞测序技术在该领域的应用前景 | 文章介绍了单细胞RNA测序技术在研究ACLF中的潜在应用，以深入理解ACLF的单细胞基因表达 | NA | 研究ACLF的炎症和免疫抑制机制，并探索单细胞测序技术的应用 | ACLF患者的系统性炎症和免疫抑制过程，以及单细胞测序技术 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1359 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of fibroblasts molecular features in papillary thyroid cancer combining single-cell and bulk RNA sequencing technology
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.1019072
PMID:36387901
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞和批量RNA测序技术，对乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞分子特征进行了综合分析 | 首次在甲状腺癌中对成纤维细胞进行了详细的研究，并建立了一个纤维化评分模型用于预测甲状腺癌患者的预后 | 研究主要基于TCGA数据集和单一的临床队列，可能需要更多样本和不同来源的数据以验证结果的普遍性 | 探索乳头状甲状腺癌中成纤维细胞的分子特征及其在癌症微环境中的作用 | 乳头状甲状腺癌中的成纤维细胞及其相关基因表达和预后价值 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了TCGA数据集和临床组织样本进行验证 |
| 1360 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals the communications between extracellular matrix-related components and Schwann cells contributing to the earlobe keloid formation
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1000324
PMID:36388926
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了耳垂瘢痕疙瘩形成过程中细胞外基质相关成分与施万细胞之间的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序构建了耳垂瘢痕疙瘩的细胞图谱，并发现了施万细胞与细胞外基质相关细胞群之间的强相互作用 | 研究主要集中在耳垂瘢痕疙瘩，其他部位瘢痕疙瘩的研究较少 | 探索耳垂瘢痕疙瘩形成的分子机制 | 耳垂瘢痕疙瘩样本及其邻近正常皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 31,379个细胞 |