单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2024-08-08 |
Somatic mutations of activating signalling, transcription factor, and tumour suppressor are a precondition for leukaemia transformation in myelodysplastic syndromes
2022-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17613
PMID:36380727
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研究论文 | 本文通过配对自控测序技术，包括靶向、全外显子和单细胞RNA测序，分析了72名从骨髓增生异常综合征（MDS）转变为急性髓系白血病（AML）的患者，以寻找与AML转化相关的突变（TRMs）。 | 首次通过配对自控测序技术，结合靶向、全外显子和单细胞RNA测序，系统地分析了MDS向AML转化过程中的相关突变。 | 研究仅限于一小部分基因，且样本量相对较小。 | 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的生物学机制。 | 72名从骨髓增生异常综合征转变为急性髓系白血病的患者。 | 数字病理学 | 白血病 | 靶向测序、全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 72名患者 |
| 1302 | 2024-08-08 |
Glucagon-like Peptide-1 receptor Tie2+ cells are essential for the cardioprotective actions of liraglutide in mice with experimental myocardial infarction
2022-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2022.101641
PMID:36396031
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研究论文 | 本文研究了胰高血糖素样肽-1受体（GLP-1R）在心肌梗死小鼠模型中的心脏保护作用，特别是GLP-1R在Tie2+细胞中的表达及其对liraglutide治疗反应的影响 | 首次揭示了小鼠Tie2+内皮细胞GLP-1R作为GLP-1R激动剂心脏保护作用的关键靶点，并强调了心脏GLP-1R表达的物种特异性差异 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类心脏中GLP-1R的作用机制 | 探讨GLP-1R在心肌梗死中的心脏保护作用及其在不同细胞类型中的表达 | 小鼠和人类心脏细胞中的GLP-1R表达及其在心肌梗死中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光激活细胞分选，RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 小鼠和人类心脏细胞样本 |
| 1303 | 2024-08-08 |
Dual-Stream Subspace Clustering Network for revealing gene targets in Alzheimer's disease
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106305
PMID:36401971
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研究论文 | 本文提出了一种基于卷积神经网络的新型基因聚类方法——双流子空间聚类网络（DS-SCNet），用于从大规模单细胞RNA-seq数据中准确识别重要基因簇 | DS-SCNet能够在大规模单细胞RNA-seq数据中准确识别重要基因簇，并在模拟数据集上优于主流基因聚类方法 | NA | 揭示阿尔茨海默病中的基因靶点 | 单细胞RNA-seq数据中的基因簇 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | CNN | 基因表达数据 | 分析了包含10,850个基因的单细胞RNA-seq数据，来自6673个细胞 |
| 1304 | 2024-08-08 |
Integrative analysis of multiomics data identifies selenium-related gene ALAD associating with keshan disease
2022-11-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本文通过综合分析多组学数据，发现与克山病相关的硒相关基因ALAD，并探讨其在克山病发病机制中的作用 | 首次证明硒相关基因ALAD对维持正常线粒体活性至关重要，为克山病的硒缺乏假说提供了强有力的分子证据 | NA | 探究克山病的分子机制及硒相关基因ALAD的作用 | 克山病患者及对照组的多组学数据 | 数字病理学 | 克山病 | 全外显子测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 68名克山病患者和100名对照组 |
| 1305 | 2024-08-08 |
Characteristics of lymphocyte subset alterations in COVID-19 patients with different levels of disease severity
2022-11-19, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-022-01926-8
PMID:36403042
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研究论文 | 本研究探讨了不同严重程度的COVID-19患者淋巴细胞亚群的变化特征 | 首次详细分析了COVID-19患者中淋巴细胞亚群的变化及其与疾病严重程度的关系 | 研究样本主要集中在武汉火神山医院，可能存在地域性偏差 | 探究COVID-19患者淋巴细胞亚群的变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的淋巴细胞亚群及其与疾病严重程度的关系 | NA | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 548名住院COVID-19患者和125名住院COVID-19患者的淋巴细胞亚群 |
| 1306 | 2024-08-08 |
A Myb enhancer-guided analysis of basophil and mast cell differentiation
2022-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34906-1
PMID:36400777
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研究论文 | 本文通过分析Myb基因的-68增强子，揭示了其在嗜碱性粒细胞和肥大细胞分化中的作用 | 首次识别了Myb基因的-68增强子，并展示了其如何标记嗜碱性粒细胞和肥大细胞，以及如何通过单细胞RNA测序揭示这些细胞的分化轨迹 | NA | 深入理解MYB表达在细胞系相关方式中的调控机制 | Myb基因的-68增强子在嗜碱性粒细胞和肥大细胞分化中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1307 | 2024-08-08 |
SIGIRR deficiency contributes to CD4 T cell abnormalities by facilitating the IL1/C/EBPβ/TNF-α signaling axis in rheumatoid arthritis
2022-11-18, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00563-9
PMID:36401167
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研究论文 | 本研究探讨了SIGIRR在类风湿关节炎中对记忆CD4 T细胞的作用及其分子机制 | 首次揭示了SIGIRR通过调控IL-1/C/EBPβ/TNF-α信号轴在类风湿关节炎中对记忆CD4 T细胞的影响 | NA | 研究SIGIRR在类风湿关节炎中对记忆CD4 T细胞的作用及其分子机制 | SIGIRR在记忆CD4 T细胞中的分布和表达，以及其对类风湿关节炎疾病活动的影响 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组学、批量RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 健康人群和类风湿关节炎患者的记忆CD4 T细胞，以及AIA小鼠模型 |
| 1308 | 2024-08-08 |
Integrating Single-cell RNA-seq to construct a Neutrophil prognostic model for predicting immune responses in non-small cell lung cancer
2022-11-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03723-x
PMID:36401283
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建了一个针对非小细胞肺癌中中性粒细胞的预后模型，以预测患者的免疫反应和预后 | 首次构建了基于中性粒细胞分化相关基因的预后风险模型，并成功预测了患者的总生存时间和免疫治疗反应 | NA | 探索非小细胞肺癌免疫微环境中的复杂通讯网络，明确免疫细胞与肿瘤之间的相互作用 | 非小细胞肺癌中的中性粒细胞及其在免疫反应中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Elastic Net和多元Cox回归模型 | RNA序列数据 | 分析了来自非小细胞肺癌样本的28个主要细胞集群 |
| 1309 | 2024-08-08 |
Systematic investigation of imprinted gene expression and enrichment in the mouse brain explored at single-cell resolution
2022-Nov-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08986-8
PMID:36384442
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据，系统研究了小鼠大脑中印记基因的表达和富集情况 | 首次正式测试了印记基因在大脑中的过度表达，并确定了特定脑区和神经元亚群中的富集情况 | NA | 探讨印记基因在大脑中的表达和富集情况，以及其对神经系统和行为的影响 | 小鼠大脑中的印记基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13个单细胞RNA测序数据集 |
| 1310 | 2024-08-08 |
Prescreening of tumor samples for tumor-centric transcriptome analyses of lung adenocarcinoma
2022-Nov-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-10317-9
PMID:36397035
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研究论文 | 本文开发了一种针对肺腺癌的肿瘤细胞预筛选策略，以确保在单细胞RNA测序分析中包含肿瘤细胞 | 提出了使用CEACAM5和HMGB3作为基于RT-PCR的预筛选标记物，以促进肺腺癌的肿瘤中心单细胞RNA测序分析 | NA | 开发一种预筛选策略，以确保在肿瘤中心的单细胞RNA测序分析中包含肿瘤细胞 | 肺腺癌的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 使用了肺癌细胞系、正常与肺癌组织以及有无转移的淋巴结活检样本 |
| 1311 | 2024-08-08 |
Innate immune imprints in SARS-CoV-2 Omicron variant infection convalescents
2022-11-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01237-y
PMID:36379915
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、表面蛋白质组分析和血浆细胞因子定量，描绘了SARS-CoV-2 Omicron变异株感染康复者的先天免疫景观 | 首次详细描述了Omicron感染康复者中免疫细胞的印迹特征，包括单核细胞反应和细胞因子响应 | NA | 探究SARS-CoV-2 Omicron变异株感染康复者的先天免疫印迹特征 | SARS-CoV-2 Omicron变异株感染康复者的免疫细胞和细胞因子 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，表面蛋白质组分析，细胞因子定量 | NA | 细胞和分子数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1312 | 2024-08-08 |
Mechanisms of cooperative cell-cell interactions in skeletal muscle regeneration
2022-Nov-16, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-022-00234-6
PMID:36380396
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综述 | 本文综述了骨骼肌再生过程中细胞间相互作用的机制，特别关注骨骼肌干细胞的作用 | 利用单细胞测序技术识别了与肌肉再生相关的新细胞亚群及其调控机制 | NA | 探讨骨骼肌再生过程中细胞间相互作用的机制 | 骨骼肌干细胞、免疫细胞、成纤维脂肪祖细胞和血管内皮细胞 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | 细胞数据 | NA |
| 1313 | 2024-08-08 |
Ascertaining cells' synaptic connections and RNA expression simultaneously with barcoded rabies virus libraries
2022-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34334-1
PMID:36384944
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SBARRO的方法，利用单细胞RNA测序揭示基于条形码狂犬病毒路径的单突触关系，并描述了体外多种小鼠脑细胞类型的突触网络 | SBARRO方法能够同时确定细胞的突触连接和RNA表达，通过追踪个体狂犬病毒克隆在细胞间的传播，为神经回路的突触组织提供了新的研究机会 | NA | 开发一种新方法来系统描述突触网络及其分子特性 | 小鼠脑细胞类型的突触网络及其分子特性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个突触关系 |
| 1314 | 2024-08-08 |
Differential effects of periodontal microbiome on the rheumatoid factor induction during rheumatoid arthritis pathogenesis
2022-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-21788-y
PMID:36385263
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研究论文 | 本研究探讨了牙周微生物群在类风湿关节炎发病过程中对类风湿因子诱导的影响 | 首次通过16S rRNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了不同牙周细菌种类对类风湿因子诱导的差异性影响 | 研究主要集中在小鼠模型和临床患者的牙周微生物群分析，未来需进一步验证在更广泛人群中的适用性 | 探究牙周微生物群与类风湿因子在类风湿关节炎发病中的关系 | 类风湿关节炎患者和胶原诱导关节炎小鼠的牙周微生物群及类风湿因子状态 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 微生物群数据, 基因表达数据 | 包括类风湿关节炎患者和胶原诱导关节炎小鼠的样本 |
| 1315 | 2024-08-08 |
Tissue-specific transcriptional profiles and heterogeneity of natural killer cells and group 1 innate lymphoid cells
2022-11-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100812
PMID:36384102
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术探讨了自然杀伤细胞（NK细胞）和第1型先天淋巴细胞（ILC1s）在不同组织中的异质性 | 首次揭示了NK细胞和ILC1s在不同组织中的转录特征和异质性，并鉴定了区分这些细胞亚群的关键基因 | NA | 探索NK细胞和ILC1s在不同组织中的异质性及其转录特征 | 自然杀伤细胞（NK细胞）和第1型先天淋巴细胞（ILC1s） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1316 | 2024-08-08 |
CD8+ T cell metabolic rewiring defined by scRNA-seq identifies a critical role of ASNS expression dynamics in T cell differentiation
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111639
PMID:36384124
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了CD8 T细胞在体外激活和分化过程中的代谢重编程，并发现ASNS表达动态在T细胞分化中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CD8 T细胞在激活和分化过程中对非必需氨基酸合成与摄取的依赖性变化，并发现ASNS表达动态对T细胞分化的调控作用 | NA | 研究CD8 T细胞在免疫应答中的代谢重编程及其对T细胞分化的影响 | CD8 T细胞的代谢重编程和ASNS表达动态 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1317 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of multiple myelomas refines the molecular features of bortezomib treatment responsiveness
2022-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-022-00884-z
PMID:36380017
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物，分析博来霉素治疗反应的分子特征 | 使用单细胞RNA测序技术识别了与博来霉素反应相关的细胞类型和基因网络，并建立了一个结合临床变量和基因表达的模型来预测治疗反应 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的细胞类型和基因表达模式 | 探索多发性骨髓瘤中博来霉素治疗反应的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物中的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18名未经治疗的多发性骨髓瘤患者 |
| 1318 | 2024-08-08 |
Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer
2022-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05435-0
PMID:36385528
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研究论文 | 本文通过应用原位空间分析技术和单细胞RNA测序，揭示了口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中肿瘤内微生物群的空间、细胞和分子相互作用 | 开发了一种名为INVADEseq的单细胞RNA测序方法，并首次展示了细菌群落占据的微环境与恶性细胞的关联 | NA | 研究肿瘤内微生物群对肿瘤空间和细胞异质性的影响 | 口腔鳞状细胞癌和结直肠癌中的肿瘤内微生物群及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | 口腔癌，结直肠癌 | 10x Visium空间转录组学，GeoMx数字空间分析，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 患者肿瘤样本 |
| 1319 | 2024-08-08 |
Human striatal organoids derived from pluripotent stem cells recapitulate striatal development and compartments
2022-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001868
PMID:36395338
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研究论文 | 本文开发了一种从人类多能干细胞构建人纹状体类器官的方法，这些类器官能够部分复制胎儿纹状体的发育并形成纹状体和基质样隔间。 | 首次成功从人类多能干细胞中构建出能够复制胎儿纹状体发育的人纹状体类器官，并展示了其在神经电路研究和治疗策略测试中的应用潜力。 | NA | 解码与纹状体相关的神经疾病的发病机制并开发治疗策略。 | 人纹状体类器官及其在神经电路和治疗策略研究中的应用。 | NA | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 类器官 | NA |
| 1320 | 2024-08-08 |
How is spatial transcriptomics influencing cancer research and diagnostics?
2022-11, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2022-0111
PMID:36398881
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学在肿瘤生物学和诊断研究中的应用 | 空间转录组学自2016年开发以来，其受欢迎程度持续上升 | NA | 研究空间转录组学在癌症研究和诊断中的影响 | 空间转录组学在肿瘤生物学和诊断研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |