单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1301 2024-08-08
An Oxidative Stress-Related Gene Signature in Granulosa Cells Is Associated with Ovarian Aging
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本文研究了颗粒细胞中与氧化应激相关的基因特征与卵巢衰老的关系 首次在非人灵长类和人类数据集中验证了与卵巢衰老相关的颗粒细胞氧化应激基因特征 NA 探讨颗粒细胞中氧化应激相关基因特征与卵巢衰老的关联 颗粒细胞中的氧化应激相关基因 NA 卵巢衰老 单细胞转录组测序, qPCR NA 转录组数据 非人灵长类和人类样本, 以及人卵巢颗粒细胞瘤细胞系KGN和小鼠颗粒细胞
1302 2024-08-08
Single-cell transcriptome sequencing revealing the difference in photosynthesis and carbohydrate metabolism between epidermal cells and non-epidermal cells of Gracilariopsis lemaneiformis (Rhodophyta)
2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了Gracilariopsis lemaneiformis(红藻)的表皮细胞和非表皮细胞在正常光照条件下的光合作用和碳水化合物代谢差异 首次揭示了表皮细胞和非表皮细胞在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异,并发现了光合产物在细胞间的运输 NA 探究不同细胞类型在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异及其碳分配机制 Gracilariopsis lemaneiformis的表皮细胞和非表皮细胞 NA NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 3436个差异表达基因
1303 2024-08-08
Single-cell sequencing reveals the landscape of the tumor microenvironment in a skeletal undifferentiated pleomorphic sarcoma patient
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了一名骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织,揭示了肿瘤微环境的细胞组成和相关标志基因 首次利用单细胞RNA测序技术详细解析了骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境,并识别了潜在的治疗靶点 研究仅基于单一病例,结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 探讨骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境及其潜在治疗策略 骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织 数字病理学 软组织肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 单一病例
1304 2024-08-08
Combined bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq identifies a necroptosis-related prognostic signature associated with inhibitory immune microenvironment in glioma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术,识别出与胶质瘤抑制性免疫微环境相关的坏死性凋亡相关预后标志物 首次构建了基于18个坏死性凋亡相关基因的预后标志物,并验证了其在不同数据集中的预测能力 NA 探讨坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的预后价值及其与免疫微环境的关系 胶质瘤患者的预后及免疫微环境 数字病理学 脑瘤 RNA-seq NA 基因表达数据 159个坏死性凋亡相关基因,TCGA数据集及两个外部CGGA数据集
1305 2024-08-08
Heterogeneity of neutrophils and inflammatory responses in patients with COVID-19 and healthy controls
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者和健康对照者的外周血中性粒细胞,揭示了与疾病严重程度相关的不同成熟中性粒细胞亚群 首次详细分析了COVID-19患者中性粒细胞的异质性及其在炎症反应中的作用 由于技术挑战,对中性粒细胞的深入分析有限 探究COVID-19患者与健康对照者中性粒细胞反应的差异 COVID-19患者和健康对照者的中性粒细胞 NA COVID-19 单细胞RNA测序 NA RNA 包括轻度和重度COVID-19患者及健康对照者的外周血中性粒细胞
1306 2024-08-08
Single cell sequencing revealed the mechanism of PD-1 resistance affected by the expression profile of peripheral blood immune cells in ESCC
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血免疫细胞表达谱对PD-1抗体耐药性的影响机制 首次深入分析了ESCC患者外周血免疫细胞的转录组特征及其对PD-1单抗疗效的影响 NA 探讨食管鳞状细胞癌患者免疫微环境转录组特征对免疫抑制剂疗效的影响 食管鳞状细胞癌患者的外周血免疫细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 PD-1单抗敏感和耐药的食管癌患者的外周血免疫细胞
1307 2024-08-08
Rapid identification of CMV-specific TCRs via reverse TCR cloning system based on bulk TCR repertoire data
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文开发了一种基于批量TCR组库数据的反向TCR克隆系统,用于快速鉴定CMV特异性TCR 该系统无需单细胞水平即可有效克隆抗原特异性TCR,并能通过NGS直接获得功能性TCR NA 开发一种新的TCR克隆系统,用于从激活标志物阳性的CD8 T细胞中克隆抗原特异性TCR CMV pp65特异性T细胞反应及其TCR NA NA NGS NA TCR组库数据 从HLA-A*02:01、HLA-A*02:06、HLA-B*07:02和HLA-B*40:06限制的4-1BB阳性CD8 T细胞中成功扩增了15条TCRα和14条TCRβ链
1308 2024-08-08
Integrated multi-omics analysis identifies CD73 as a prognostic biomarker and immunotherapy response predictor in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过综合多组学分析,探讨了CD73在头颈鳞状细胞癌中的作用,发现CD73可作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子 首次详细分析了CD73在头颈鳞状细胞癌中的表达及其与免疫治疗反应的关系 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集,需要进一步的临床验证 探索CD73在头颈鳞状细胞癌中的功能及其作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子的潜力 头颈鳞状细胞癌患者 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 RNA测序, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 临床数据 数据来自TCGA-HNSC项目和多个公共数据库
1309 2024-08-08
Transcriptome profiling of abdominal aortic tissues reveals alterations in mRNAs of Takayasu arteritis
2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过批量RNA测序分析了Takayasu动脉炎患者腹主动脉组织的转录组变化 首次对Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织进行批量RNA测序,揭示了该疾病中mRNA表达的显著变化 样本量相对较小,且仅包括手术获取的组织样本 探索Takayasu动脉炎中mRNA表达的改变 Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织 数字病理学 Takayasu动脉炎 批量RNA测序 NA 转录组数据 14个腹主动脉组织,其中8个来自肾移植,6个来自Takayasu动脉炎患者
1310 2024-08-08
High-level of intratumoral GITR+ CD4 T cells associate with poor prognosis in gastric cancer
2022-Dec-22, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了胃癌患者中GITR+ CD4 T细胞的表达模式及其与预后的关系 揭示了GITR+ CD4 T细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其与预后的关联,并发现Treg细胞中GITR蛋白的分布受微环境影响 NA 探讨GITR在胃癌中的表达模式及其对预后的影响 胃癌患者的GITR+ CD4 T细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
1311 2024-08-08
Expression and regulatory characteristics of peripheral blood immune cells in primary Sjögren's syndrome patients using single-cell transcriptomic
2022-Dec-22, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究使用单细胞转录组学技术分析了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞的免疫细胞亚群表达及调控特征 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞中CD14单核细胞的转录因子表达及目标基因调控情况,并提出了基于表达的CD56CD16 NK细胞分类系统 研究样本量较小,仅包括三名患者和三名健康对照 探讨原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞亚群的表达及调控特性 原发性干燥综合征患者及健康对照的外周血单个核细胞 数字病理学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 68,500个外周血单个核细胞,来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康对照
1312 2024-08-08
Neuronal cell types, projections, and spatial organization of the central amygdala
2022-Dec-22, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学和远距离投射映射,对中央杏仁核(CEA)的细胞类型进行了“自下而上”的理解 本文识别了两种在先前研究中未被解决的主要细胞类型,并揭示了与表达相关的新型CEA子域 NA 研究中央杏仁核的细胞类型、投射和空间组织 中央杏仁核的细胞类型和电路 NA NA 单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学 NA 细胞 涵盖了所有CEA神经元的三分之一
1313 2024-08-08
High precision, high throughput generation of droplets containing single cells
2022-12-06, Lab on a chip IF:6.1Q2
研究论文 本文介绍了一种简单的被动微流控系统,能够高效地生成包含单细胞的液滴,具有极高的吞吐量和极低的错误率 该技术克服了单细胞封装过程中的随机性问题,显著提高了效率和吞吐量,并增强了组合液滴实验的可预测性 NA 开发一种高精度、高吞吐量的单细胞液滴生成技术 单细胞封装技术及其在单细胞测序、稀有细胞分离、免疫学或癌症生物学中的多细胞/珠研究中的应用 微流控技术 NA 微流控技术 NA NA 每分钟生成超过22,000个单细胞加载的液滴
1314 2024-08-08
The kidney-more than the sum of its cellular parts
2022-12, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文探讨了肾脏作为一个复杂器官,其细胞间相互作用对生理和病理生理的影响,并利用单细胞测序技术和空间转录组学等方法来解析这些相互作用 利用单细胞测序技术和空间转录组学等先进技术,解析肾脏细胞间复杂的生理和病理生理相互作用,并发现新的生物标志物和治疗选项 NA 解析肾脏细胞间相互作用的复杂生理和病理生理机制 肾脏及其细胞间的相互作用 数字病理学 NA 单细胞测序技术,空间转录组学 NA 转录组数据 NA
1315 2024-08-08
Urinary single-cell transcriptomics: a promising noninvasive method for assessing acute kidney injury
2022-12, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 探讨利用尿液单细胞RNA测序评估人类急性肾损伤的可行性 提出了一种新的非侵入性方法——尿液单细胞RNA测序,用于评估急性肾损伤,可能发现新的生物标志物和治疗靶点 NA 探索非侵入性方法获取肾脏内部信息,以理解急性肾损伤的机制 急性肾损伤患者尿液中的单细胞 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA
1316 2024-08-08
Empagliflozin reduces kidney fibrosis and improves kidney function by alternative macrophage activation in rats with 5/6-nephrectomy
2022-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析了SGLT2抑制剂empagliflozin在5/6肾切除大鼠模型中对肾脏纤维化和肾功能的改善作用及其机制。 首次揭示了empagliflozin通过抑制CD206+CD68+ M2巨噬细胞极化,靶向mTOR和自噬途径,以及减弱CD8+效应T细胞的炎症信号,来改善肾脏功能和形态。 NA 探讨empagliflozin在5/6肾切除大鼠中改善肾脏功能和减少纤维化的机制。 5/6肾切除大鼠的肾脏细胞。 数字病理学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个5/6肾切除大鼠的肾脏样本
1317 2024-08-08
A single-cell human islet interactome atlas identifies disrupted autocrine and paracrine communications in type 2 diabetes
2022-Dec, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组学数据分析,构建了人类胰岛互作图谱,并探讨了其在2型糖尿病中的变化 首次构建了人类胰岛互作图谱模型,识别了2型糖尿病中失调的自分泌和旁分泌通信 NA 研究胰岛细胞间的协同通信,并探讨其在2型糖尿病中的变化 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的胰岛细胞 NA 2型糖尿病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 3046个细胞,分为7种细胞类型
1318 2024-08-08
Impacts of neoadjuvant chemoradiotherapy on the immune landscape of esophageal squamous cell carcinoma
2022-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了新辅助化疗放疗对食管鳞状细胞癌免疫微环境的影响 首次全面描绘了新辅助化疗放疗相关的免疫变化,为理解食管鳞状细胞癌对新辅助化疗放疗的免疫机制提供了深入见解 NA 探究新辅助化疗放疗对食管鳞状细胞癌肿瘤免疫微环境的影响 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗放疗前后的免疫微环境变化 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 8名男性患者的8个新辅助化疗放疗前样本和7个新辅助化疗放疗后样本
1319 2024-08-08
CTLA-4 on thymic epithelial cells complements Aire for T cell central tolerance
2022-11-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究发现在髓质胸腺上皮细胞(mTECs)中表达的共抑制受体细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA-4)对T细胞中枢耐受的建立起到补充Aire因子的作用 发现CTLA-4在mTECs中的表达对T细胞中枢耐受的建立起到补充Aire因子的作用 研究中未发现CTLA-4缺失的胸腺上皮细胞小鼠有主要免疫缺陷,但存在轻微的炎症水平增加和部分Foxp3CD4调节T细胞生成缺陷 探讨CTLA-4在胸腺上皮细胞中对T细胞中枢耐受的作用 髓质胸腺上皮细胞(mTECs)和CTLA-4的表达 免疫学 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 CTLA-4缺失的胸腺上皮细胞小鼠
1320 2024-08-08
Single-cell RNA-sequencing data analysis reveals a highly correlated triphasic transcriptional response to SARS-CoV-2 infection
2022-11-27, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术分析了SARS-CoV-2感染后的人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官的转录反应 揭示了SARS-CoV-2感染后转录反应的非线性模式,包括初始和最终的下调阶段以及中间的上调阶段 NA 研究SARS-CoV-2感染后的转录反应机制 人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 数千个细胞
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