单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing revealed the mechanism of PD-1 resistance affected by the expression profile of peripheral blood immune cells in ESCC
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1004345
PMID:36466860
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）患者外周血免疫细胞表达谱对PD-1抗体耐药性的影响机制 | 首次深入分析了ESCC患者外周血免疫细胞的转录组特征及其对PD-1单抗疗效的影响 | NA | 探讨食管鳞状细胞癌患者免疫微环境转录组特征对免疫抑制剂疗效的影响 | 食管鳞状细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | PD-1单抗敏感和耐药的食管癌患者的外周血免疫细胞 |
| 1282 | 2024-08-08 |
Rapid identification of CMV-specific TCRs via reverse TCR cloning system based on bulk TCR repertoire data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1021067
PMID:36466875
|
研究论文 | 本文开发了一种基于批量TCR组库数据的反向TCR克隆系统，用于快速鉴定CMV特异性TCR | 该系统无需单细胞水平即可有效克隆抗原特异性TCR，并能通过NGS直接获得功能性TCR | NA | 开发一种新的TCR克隆系统，用于从激活标志物阳性的CD8 T细胞中克隆抗原特异性TCR | CMV pp65特异性T细胞反应及其TCR | NA | NA | NGS | NA | TCR组库数据 | 从HLA-A*02:01、HLA-A*02:06、HLA-B*07:02和HLA-B*40:06限制的4-1BB阳性CD8 T细胞中成功扩增了15条TCRα和14条TCRβ链 |
| 1283 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics analysis identifies CD73 as a prognostic biomarker and immunotherapy response predictor in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.969034
PMID:36466881
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，探讨了CD73在头颈鳞状细胞癌中的作用，发现CD73可作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子 | 首次详细分析了CD73在头颈鳞状细胞癌中的表达及其与免疫治疗反应的关系 | 研究主要基于TCGA数据库和公共数据集，需要进一步的临床验证 | 探索CD73在头颈鳞状细胞癌中的功能及其作为预后标志物和免疫治疗反应预测因子的潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 临床数据 | 数据来自TCGA-HNSC项目和多个公共数据库 |
| 1284 | 2024-08-08 |
Transcriptome profiling of abdominal aortic tissues reveals alterations in mRNAs of Takayasu arteritis
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1036233
PMID:36468014
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序分析了Takayasu动脉炎患者腹主动脉组织的转录组变化 | 首次对Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织进行批量RNA测序，揭示了该疾病中mRNA表达的显著变化 | 样本量相对较小，且仅包括手术获取的组织样本 | 探索Takayasu动脉炎中mRNA表达的改变 | Takayasu动脉炎患者的腹主动脉组织 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个腹主动脉组织，其中8个来自肾移植，6个来自Takayasu动脉炎患者 |
| 1285 | 2024-08-08 |
High-level of intratumoral GITR+ CD4 T cells associate with poor prognosis in gastric cancer
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105529
PMID:36419848
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了胃癌患者中GITR+ CD4 T细胞的表达模式及其与预后的关系 | 揭示了GITR+ CD4 T细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其与预后的关联，并发现Treg细胞中GITR蛋白的分布受微环境影响 | NA | 探讨GITR在胃癌中的表达模式及其对预后的影响 | 胃癌患者的GITR+ CD4 T细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1286 | 2024-08-08 |
Expression and regulatory characteristics of peripheral blood immune cells in primary Sjögren's syndrome patients using single-cell transcriptomic
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105509
PMID:36425764
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学技术分析了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞的免疫细胞亚群表达及调控特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞中CD14单核细胞的转录因子表达及目标基因调控情况，并提出了基于表达的CD56CD16 NK细胞分类系统 | 研究样本量较小，仅包括三名患者和三名健康对照 | 探讨原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞亚群的表达及调控特性 | 原发性干燥综合征患者及健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 68,500个外周血单个核细胞，来自三名原发性干燥综合征患者和三名健康对照 |
| 1287 | 2024-08-08 |
Neuronal cell types, projections, and spatial organization of the central amygdala
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105497
PMID:36425768
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学和远距离投射映射，对中央杏仁核（CEA）的细胞类型进行了“自下而上”的理解 | 本文识别了两种在先前研究中未被解决的主要细胞类型，并揭示了与表达相关的新型CEA子域 | NA | 研究中央杏仁核的细胞类型、投射和空间组织 | 中央杏仁核的细胞类型和电路 | NA | NA | 单细胞RNA测序、多重荧光杂交、免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涵盖了所有CEA神经元的三分之一 |
| 1288 | 2024-08-08 |
High precision, high throughput generation of droplets containing single cells
2022-12-06, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00841f
PMID:36416090
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研究论文 | 本文介绍了一种简单的被动微流控系统，能够高效地生成包含单细胞的液滴，具有极高的吞吐量和极低的错误率 | 该技术克服了单细胞封装过程中的随机性问题，显著提高了效率和吞吐量，并增强了组合液滴实验的可预测性 | NA | 开发一种高精度、高吞吐量的单细胞液滴生成技术 | 单细胞封装技术及其在单细胞测序、稀有细胞分离、免疫学或癌症生物学中的多细胞/珠研究中的应用 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | 每分钟生成超过22,000个单细胞加载的液滴 |
| 1289 | 2024-08-08 |
The kidney-more than the sum of its cellular parts
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.08.032
PMID:36411017
|
研究论文 | 本文探讨了肾脏作为一个复杂器官，其细胞间相互作用对生理和病理生理的影响，并利用单细胞测序技术和空间转录组学等方法来解析这些相互作用 | 利用单细胞测序技术和空间转录组学等先进技术，解析肾脏细胞间复杂的生理和病理生理相互作用，并发现新的生物标志物和治疗选项 | NA | 解析肾脏细胞间相互作用的复杂生理和病理生理机制 | 肾脏及其细胞间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1290 | 2024-08-08 |
Urinary single-cell transcriptomics: a promising noninvasive method for assessing acute kidney injury
2022-12, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.09.006
PMID:36411018
|
研究论文 | 探讨利用尿液单细胞RNA测序评估人类急性肾损伤的可行性 | 提出了一种新的非侵入性方法——尿液单细胞RNA测序，用于评估急性肾损伤，可能发现新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索非侵入性方法获取肾脏内部信息，以理解急性肾损伤的机制 | 急性肾损伤患者尿液中的单细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1291 | 2024-08-08 |
Empagliflozin reduces kidney fibrosis and improves kidney function by alternative macrophage activation in rats with 5/6-nephrectomy
2022-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113947
PMID:36411661
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了SGLT2抑制剂empagliflozin在5/6肾切除大鼠模型中对肾脏纤维化和肾功能的改善作用及其机制。 | 首次揭示了empagliflozin通过抑制CD206+CD68+ M2巨噬细胞极化，靶向mTOR和自噬途径，以及减弱CD8+效应T细胞的炎症信号，来改善肾脏功能和形态。 | NA | 探讨empagliflozin在5/6肾切除大鼠中改善肾脏功能和减少纤维化的机制。 | 5/6肾切除大鼠的肾脏细胞。 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个5/6肾切除大鼠的肾脏样本 |
| 1292 | 2024-08-08 |
A single-cell human islet interactome atlas identifies disrupted autocrine and paracrine communications in type 2 diabetes
2022-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac084
PMID:36415826
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学数据分析，构建了人类胰岛互作图谱，并探讨了其在2型糖尿病中的变化 | 首次构建了人类胰岛互作图谱模型，识别了2型糖尿病中失调的自分泌和旁分泌通信 | NA | 研究胰岛细胞间的协同通信，并探讨其在2型糖尿病中的变化 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的胰岛细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 3046个细胞，分为7种细胞类型 |
| 1293 | 2024-08-08 |
Impacts of neoadjuvant chemoradiotherapy on the immune landscape of esophageal squamous cell carcinoma
2022-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104371
PMID:36434949
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了新辅助化疗放疗对食管鳞状细胞癌免疫微环境的影响 | 首次全面描绘了新辅助化疗放疗相关的免疫变化，为理解食管鳞状细胞癌对新辅助化疗放疗的免疫机制提供了深入见解 | NA | 探究新辅助化疗放疗对食管鳞状细胞癌肿瘤免疫微环境的影响 | 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗放疗前后的免疫微环境变化 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 8名男性患者的8个新辅助化疗放疗前样本和7个新辅助化疗放疗后样本 |
| 1294 | 2024-08-08 |
CTLA-4 on thymic epithelial cells complements Aire for T cell central tolerance
2022-11-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2215474119
PMID:36409920
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研究论文 | 研究发现在髓质胸腺上皮细胞（mTECs）中表达的共抑制受体细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4）对T细胞中枢耐受的建立起到补充Aire因子的作用 | 发现CTLA-4在mTECs中的表达对T细胞中枢耐受的建立起到补充Aire因子的作用 | 研究中未发现CTLA-4缺失的胸腺上皮细胞小鼠有主要免疫缺陷，但存在轻微的炎症水平增加和部分Foxp3CD4调节T细胞生成缺陷 | 探讨CTLA-4在胸腺上皮细胞中对T细胞中枢耐受的作用 | 髓质胸腺上皮细胞（mTECs）和CTLA-4的表达 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | CTLA-4缺失的胸腺上皮细胞小鼠 |
| 1295 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing data analysis reveals a highly correlated triphasic transcriptional response to SARS-CoV-2 infection
2022-11-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-04253-4
PMID:36435849
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了SARS-CoV-2感染后的人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官的转录反应 | 揭示了SARS-CoV-2感染后转录反应的非线性模式，包括初始和最终的下调阶段以及中间的上调阶段 | NA | 研究SARS-CoV-2感染后的转录反应机制 | 人支气管上皮细胞和结肠及回肠类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数千个细胞 |
| 1296 | 2024-08-08 |
Identification of molecular classification and gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in HNSCC using cell differentiation trajectories
2022-11-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24533-7
PMID:36437265
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研究论文 | 本文旨在探讨细胞分化轨迹在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的临床意义，通过共识聚类分析识别不同的分子亚型，并基于分化相关基因（DRGs）开发预测HNSCC患者预后的风险模型。 | 本文通过细胞分化轨迹识别了不同的分子亚型，并构建了一个基于差异表达预后DRGs的新型签名，能够预测患者的预后和免疫治疗反应。 | NA | 探索细胞分化轨迹在HNSCC中的临床意义，并开发预测患者预后和免疫治疗反应的分子分类和基因签名。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者及其分子亚型和预后预测。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），共识聚类分析，加权相关网络分析（WGCNA），Cox回归分析 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 1297 | 2024-08-08 |
Bi-potential hPSC-derived Müllerian duct-like cells for full-thickness and functional endometrium regeneration
2022-Nov-23, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-022-00263-2
PMID:36418304
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研究论文 | 研究首次通过有效协议生成人多能干细胞衍生的Müllerian管样细胞，这些细胞能够分化为子宫内膜上皮和基质细胞，并在体内外重建全层子宫内膜 | 本研究首次生成了人多能干细胞衍生的Müllerian管样细胞，这些细胞具有双向分化潜能，能够重建全层子宫内膜，并显示出在体内修复子宫内膜结构和恢复妊娠功能的能力 | NA | 开发基于干细胞的组织再生策略，用于治疗严重的子宫内膜损伤 | 人多能干细胞衍生的Müllerian管样细胞及其在子宫内膜再生中的应用 | NA | 子宫内膜损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1298 | 2024-08-08 |
Establishment of an ovarian cancer omentum metastasis-related prognostic model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2022-Nov-23, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-022-01059-0
PMID:36424614
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，建立了一个与卵巢癌网膜转移相关的预后模型。 | 首次在单细胞水平上分析卵巢癌网膜转移，探索和理解细胞功能和遗传水平的网膜转移及预后。 | NA | 建立一个与卵巢癌网膜转移相关的预后模型，并分析这些基因在卵巢癌网膜转移中的潜在机制。 | 卵巢癌网膜转移的细胞类型、分化轨迹、肿瘤微环境及免疫浸润。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO, Cox回归 | 基因表达数据 | 9885个细胞来自6名患者，GSE132342数据集包含3769名患者，TCGA-OV数据集包含379名患者。 |
| 1299 | 2024-08-08 |
How vascular smooth muscle cell phenotype switching contributes to vascular disease
2022-11-21, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-022-00993-2
PMID:36411459
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞（VSMCs）在血管疾病中的表型转换及其分子机制和功能角色 | 近年来，由于单细胞测序和细胞谱系追踪技术的快速发展，揭示了多种VSMCs表型在血管老化、动脉粥样硬化（AS）和主动脉瘤（AA）中的存在 | NA | 探讨VSMCs表型转换在血管老化、AS和AA中的分子机制及其贡献 | 血管平滑肌细胞的表型转换及其在血管疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、细胞谱系追踪 | NA | NA | NA |
| 1300 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Cuproptosis-Related Genes in Prognosis and Immune Infiltration of Hepatocellular Carcinoma Based on Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2022-Nov-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14225713
PMID:36428805
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研究论文 | 本研究通过大量和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于铜死亡相关基因（CRGs）的多基因签名模型，用于预测肝细胞癌（HCC）的预后和免疫浸润特征 | 首次综合分析了CRGs在HCC中的预后潜力和肿瘤免疫微环境（TIME）特征 | NA | 研究CRGs在HCC中的预后价值和免疫微环境特征 | 肝细胞癌（HCC）中的铜死亡相关基因（CRGs） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | RNA测序数据 | 两个队列的数据用于验证 |