单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1281 2024-08-08
Clinical Implications and Molecular Characterization of Drebrin-Positive, Tumor-Infiltrating Exhausted T Cells in Lung Cancer
2022-Nov-08, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究评估了34例病理分期为I-IIIA的鳞状细胞肺癌手术标本中表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的临床意义和分子特征 首次探讨了表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞在肺癌中的临床意义和分子特征 研究样本量有限,仅包括34例手术标本 探讨表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞在肺癌中的临床意义和分子特征 表达drebrin的肿瘤浸润淋巴细胞及其在肺癌中的作用 数字病理学 肺癌 荧光多重免疫组织化学, 单细胞RNA测序 NA 图像 34例手术标本
1282 2024-08-08
Identification and Isolation of Burst-Forming Unit and Colony-Forming Unit Erythroid Progenitors from Mouse Tissue by Flow Cytometry
2022-11-04, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文通过分析小鼠骨髓的单细胞RNA测序数据,开发了一种新的流式细胞术方法,用于直接前瞻性和完整地分离纯化的小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞。 本文首次开发了一种新的流式细胞术方法,能够直接前瞻性和完整地分离纯化的小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞,并识别其他祖细胞亚群。 NA 开发一种新的流式细胞术方法,用于直接前瞻性和完整地分离纯化的小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞。 小鼠骨髓或脾脏中的BFU-e和CFU-e红系祖细胞及其他祖细胞亚群。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 基因表达数据 小鼠骨髓或脾脏细胞
1283 2024-08-08
Re-exploring tissue regeneration by novel spatial transcriptomics technologies
2022-11, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1284 2024-08-08
Delineating the dynamic evolution from preneoplasia to invasive lung adenocarcinoma by integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics
2022-11, Experimental & molecular medicine
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,研究了肺腺癌从原位腺癌到微小浸润性腺癌再到浸润性腺癌的动态演变过程 首次揭示了肺腺癌从原位腺癌到浸润性腺癌过程中细胞亚群的变化及其空间分布特征 NA 阐明肺腺癌从原位腺癌到浸润性腺癌的细胞生态和空间微环境 肺腺癌的细胞亚群及其在疾病进展中的变化 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST) NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
1285 2024-08-08
Where Are They Now: Spatial and Molecular Diversity of Tissue-Resident Macrophages in the Kidney
2022-05, Seminars in nephrology IF:2.8Q2
研究论文 本文探讨了肾脏组织驻留巨噬细胞(KRMs)的空间和分子多样性及其在肾脏疾病中的作用 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,识别了KRMs的不同亚群,这些亚群在分子、功能和空间上具有独特性,并能在肾脏损伤后动态变化 NA 旨在理解KRMs亚群的多样性,以开发治疗肾脏疾病和促进肾脏健康的新疗法 肾脏组织驻留巨噬细胞(KRMs)及其在肾脏疾病中的作用 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序和空间转录组学 NA 分子数据 具体样本数量未在摘要中提及
1286 2024-08-08
Neurons and glial cells acquire a senescent signature after repeated mild traumatic brain injury in a sex-dependent manner
2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了反复轻度创伤性脑损伤(rmTBI)后神经元和胶质细胞的衰老特征及其性别依赖性 首次揭示了反复轻度创伤性脑损伤后神经元和胶质细胞的衰老特征,并发现了性别差异 研究仅限于小鼠模型,且治疗效果在性别间存在差异 探究反复轻度创伤性脑损伤后的神经病理机制及性别差异 C57BL/6小鼠的神经元和胶质细胞 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA RNA C57BL/6小鼠
1287 2024-08-08
The integrated transcriptome bioinformatics analysis identifies key genes and cellular components for proliferative diabetic retinopathy
2022, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过综合转录组生物信息学分析,识别出与增生性糖尿病视网膜病变(PDR)相关的关键基因和细胞组分 本研究通过整合公共的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别出PDR的新基因标志物和潜在治疗靶点 本研究仅使用了有限数量的PDR患者样本进行分析,可能影响结果的普遍性 揭示增生性糖尿病视网膜病变的内在分子机制 增生性糖尿病视网膜病变的关键基因和细胞组分 数字病理学 糖尿病并发症 RNA测序 NA 转录组数据 包括11名PDR患者和7名对照的批量RNA测序数据,以及5名PDR患者的单细胞RNA测序数据
1288 2024-08-08
Immune checkpoint inhibitors plus chemotherapy in patients with locally advanced or metastatic pulmonary sarcomatoid carcinoma: a multicentric real-world study
2022, Therapeutic advances in medical oncology IF:4.3Q2
研究论文 本研究评估了免疫检查点抑制剂(ICIs)联合化疗在局部晚期或转移性肺肉瘤样癌(PSC)患者中的疗效 首次在多中心真实世界研究中评估了ICIs联合化疗在PSC患者中的疗效,并通过单细胞RNA测序揭示了PSC的免疫细胞炎症肿瘤微环境 NA 评估ICIs联合化疗在PSC患者中的疗效 局部晚期或转移性肺肉瘤样癌患者 数字病理学 肺肉瘤样癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 42名PSC患者
1289 2024-08-08
Molecular and subregion mechanisms of episodic memory phenotypes in temporal lobe epilepsy
2022, Brain communications IF:4.1Q2
研究论文 本研究通过空间定量技术分析了颞叶癫痫患者在四个与情景记忆相关的大脑区域(齿状回、CA3、CA1、新皮质)中目标蛋白质和转录本的差异表达,以探讨情景记忆障碍的分子和亚区域机制。 本研究首次在颞叶癫痫患者中使用空间转录组学技术,揭示了不同大脑亚区域在情景记忆障碍中的独特分子特征,并发现BDNF在CA3相关网络中作为调节认知、记忆等过程的关键枢纽。 研究样本量较小,仅包括16名药物难治性颞叶癫痫患者,且仅限于与海马硬化相关的病例。 探讨颞叶癫痫中情景记忆障碍的分子和亚区域机制。 颞叶癫痫患者的情景记忆障碍及其相关大脑区域的分子变化。 神经科学 癫痫 空间定量技术 NA 蛋白质和转录本数据 16名成年颞叶癫痫患者
1290 2024-08-08
The diversity of trophoblast cells and niches of placenta accreta spectrum disorders revealed by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了胎盘植入谱系障碍中滋养层细胞和微环境的多样性 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胎盘植入谱系障碍的病理景观,并揭示了滋养层细胞与母体基质细胞之间的增强互动 研究主要集中在胎盘植入谱系障碍的病理机制上,未来需要进一步探索针对性的转化研究 深入理解胎盘植入谱系障碍的病理机制 胎盘植入谱系障碍中的滋养层细胞和微环境 数字病理学 妊娠并发症 单细胞RNA测序 NA RNA序列 来自同一胎盘植入谱系障碍胎盘的代表性侵袭部分和正常部分
1291 2024-08-08
Evaluation of single-cell RNA-seq clustering algorithms on cancer tumor datasets
2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本文开发了一个框架,用于系统评估单细胞RNA测序(RNA-seq)聚类算法在癌症肿瘤数据集上的性能 使用一系列成熟的指标生成统一的质控得分和算法排名,并对15种不同的单细胞RNA-seq聚类算法在八个不同的癌症数据集上进行了性能评估 NA 评估单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 单细胞RNA-seq聚类算法在癌症数据集上的性能 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 八个不同的癌症数据集
1292 2024-08-08
Integrative analysis deciphers the heterogeneity of cancer-associated fibroblast and implications on clinical outcomes in ovarian cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过分析卵巢癌样本的单细胞RNA测序数据,识别出两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型,并探讨了它们对临床结果的影响 首次揭示了CAF_c1亚型的特征,可作为新的预后指标和免疫治疗预测标记 NA 探究癌症相关成纤维细胞的异质性及其对卵巢癌患者临床结果的影响 卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 具体样本数量未在摘要中提及
1293 2024-08-08
Genetic mutation and tumor microbiota determine heterogenicity of tumor immune signature: Evidence from gastric and colorectal synchronous cancers
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过多组学分析,包括单细胞RNA测序、全外显子测序和微生物组测序,探讨了胃癌和结直肠癌同步原发肿瘤的肿瘤免疫特征的异质性及其决定因素。 首次揭示了遗传突变和肿瘤微生物组对胃癌和结直肠癌免疫微环境异质性的影响。 NA 阐明胃癌和结直肠癌预后和药物反应差异的决定因素。 胃癌和结直肠癌的同步原发肿瘤。 数字病理学 胃癌, 结直肠癌 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 微生物组测序 NA 基因组数据, 微生物组数据 具体样本数量未在摘要中明确提及
1294 2024-08-08
Early renal structural changes and potential biomarkers in diabetic nephropathy
2022, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 本文综述了糖尿病肾病早期肾小球和肾小管结构变化及相关生物标志物的研究进展 详细描述了肾小球损伤标志物SMAD1和Podocalyxin,以及肾小管损伤标志物NGAL、Netrin-1和L-FABP在糖尿病肾病中的作用 NA 探讨糖尿病肾病早期诊断的生物标志物,以改善肾功能和延缓疾病进展 糖尿病肾病中的早期肾结构变化和潜在生物标志物 NA 糖尿病肾病 蛋白质组学和单细胞RNA测序 NA 蛋白质和RNA NA
1295 2024-08-08
Highly sensitive and specific responses of shrimp gill cells to high pH stress based on single cell RNA-seq analysis
2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了虾鳃细胞对高pH应激的高度敏感和特异性反应 首次揭示了虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子机制,特别是柱状细胞中免疫相关基因的上调和新免疫细胞亚群的出现 NA 探究虾鳃细胞在高pH应激下的细胞和分子响应机制 虾鳃细胞在高pH应激下的反应 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 三种主要鳃细胞类型,包括柱状细胞、血细胞和隔膜细胞
1296 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals a novel inhibitory effect of ApoA4 on NAFL mediated by liver-specific subsets of myeloid cells
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ApoA4通过肝脏特异性髓系细胞对NAFL的抑制作用 发现ApoA4通过调节特定免疫细胞亚群和相关基因表达,对NAFL具有抑制作用 NA 研究ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及其机制 ApoA4对NAFL中肝脏免疫细胞的影响及特定免疫细胞亚群的作用 数字病理学 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自WT和ApoA4缺陷小鼠的肝脏免疫细胞
1297 2024-08-08
Signatures of EMT, immunosuppression, and inflammation in primary and recurrent human cutaneous squamous cell carcinoma at single-cell resolution
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的动态变化,并探讨了肿瘤微环境的异质性及其与疾病进展的关系 首次在单细胞分辨率下研究了原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中肿瘤微环境的动态变化,揭示了免疫抑制微环境和炎症特征的差异 NA 探究皮肤鳞状细胞癌进展的关键机制,为预防和治疗复发提供新策略 原发性和复发性皮肤鳞状细胞癌中的上皮细胞、T细胞、髓系细胞和成纤维细胞 数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
1298 2024-08-08
Single-cell transcriptomics of peripheral blood reveals anti-tumor systemic immunity induced by oncolytic virotherapy
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术分析了基于HSV-2的溶瘤病毒OH2治疗后小鼠外周血的免疫反应 首次全面描述了溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响,揭示了OH2诱导的系统免疫重塑和激活机制 NA 探究溶瘤病毒治疗对系统免疫的影响及其抗肿瘤机制 溶瘤病毒OH2治疗后的小鼠外周血样本 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
1299 2024-08-08
The landscape of cancer-associated fibroblasts in colorectal cancer liver metastases
2022, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞(CAFs),揭示了CAFs的不同亚群及其在肿瘤微环境中的作用 本研究首次在单细胞分辨率下分析了大量结直肠癌肝转移中的CAFs,并开发了针对LTBP2的全人源抗体,为靶向治疗提供了新策略 NA 探究结直肠癌肝转移中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤发展中的作用 结直肠癌肝转移中的癌症相关成纤维细胞和癌细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 4,397个来自六个结直肠癌肝转移样本的CAFs
1300 2024-08-08
Relative infectivity of the SARS-CoV-2 Omicron variant in human alveolar cells
2022-Dec-22, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过整合人肺泡类器官和单细胞转录组测序技术,评估了SARS-CoV-2变种(包括GR、Alpha、Delta和Omicron)对人类肺泡细胞的相对感染性 首次在多病毒共感染条件下测量了Omicron变种的相对感染性,并提供了新的实验程序用于监测新兴病毒变种 NA 比较不同SARS-CoV-2变种的感染性,为公共卫生提供关键信息 SARS-CoV-2的GR、Alpha、Delta和Omicron变种 NA NA 单细胞转录组测序 NA 转录组 涉及四种高传染性SARS-CoV-2变种
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