单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1261	2024-08-08	Single-cell RNA sequence presents atlas analysis for chondrocytes in the talus and reveals the potential mechanism in coping with mechanical stress 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.1047119 PMID:36438550	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术对健康距骨软骨细胞进行图谱分析，并揭示了软骨细胞应对机械应力的潜在机制	本研究首次对健康距骨软骨细胞进行了单细胞RNA测序图谱分析，并发现了两种新的软骨细胞亚群MirCs和SpCs	研究样本仅来自五名志愿者，可能影响结果的普遍性	旨在深入了解软骨细胞的功能，并为疾病治疗提供潜在的治疗靶点	距骨软骨细胞及其在机械应力下的功能	数字病理学	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	五名健康志愿者的距骨软骨组织
1262	2024-08-08	The single-cell expression profile of transposable elements and transcription factors in human early biparental and uniparental embryonic development 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.1020490 PMID:36438554	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据，综合分析了人类早期双亲和单亲胚胎发育中转座元件（TEs）和转录因子（TFs）的表达模式	首次系统地研究了正常和异常人类胚胎发育中TEs和TFs的相互作用	NA	探讨转座元件和转录因子在人类早期胚胎发育中的表达模式及其相互作用	人类早期双亲和单亲胚胎中的转座元件和转录因子	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	双亲和单亲胚胎样本
1263	2024-08-08	Identification and validation of a signature based on macrophage cell marker genes to predict recurrent miscarriage by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1053819 PMID:36439123	研究论文	本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，鉴定并验证了基于巨噬细胞标记基因的特征，用于预测复发性流产	首次结合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与复发性流产密切相关的七个核心基因，并构建了预测模型	样本量相对较小，需要进一步的大规模验证	寻找复发性流产的有效诊断标记和治疗靶点	复发性流产患者的蜕膜和绒毛组织	NA	复发性流产	RNA测序	LASSO, Random Forest, SVM-RFE	RNA	16个蜕膜和绒毛组织样本，包括5个正常患者和3个复发性流产患者
1264	2024-08-08	Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the biological significance of NAD + metabolism-related genes in the initial diagnosis and relapse of childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1043111 PMID:36439178	研究论文	本研究通过整合RNA-seq和scRNA-seq数据，探讨了NAD+代谢相关基因在儿童B细胞急性淋巴细胞白血病初诊和复发中的生物学意义	首次通过机器学习方法识别出NADSYN1、SIRT3和PARP6作为B-ALL的生物标志物，并揭示了这些标志物在单细胞水平上的作用机制	NA	探索NAD+代谢相关基因在儿童B细胞急性淋巴细胞白血病初诊和复发中的生物学意义及其作用机制	儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者的NAD+代谢相关基因	数字病理学	白血病	RNA-seq, scRNA-seq	随机森林算法	转录组数据, 单细胞测序数据	GSE3912和GSE130116数据集中的B-ALL患者样本
1265	2024-08-08	Heparin binding epidermal growth factor-like growth factor is a prognostic marker correlated with levels of macrophages infiltrated in lung adenocarcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.963896 PMID:36439487	研究论文	本文探讨了肝素结合表皮生长因子样生长因子（HB-EGF）在肺腺癌中的表达及其与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的关系	首次揭示了HB-EGF在肺腺癌中作为潜在的预后标志物和治疗靶点的作用	研究主要基于公共数据库和单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚	研究HB-EGF在肺腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润的相关性	肺腺癌患者及肿瘤微环境中的免疫细胞	数字病理学	肺腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用TCGA数据库和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据，具体样本数量未详细说明
1266	2024-08-08	A ferroptosis-related gene signature associated with immune landscape and therapeutic response in osteosarcoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1024915 PMID:36439512	研究论文	本研究探讨了铁死亡相关基因在骨肉瘤中的表达及其对患者预后和治疗策略的影响	构建了一个包含8个铁死亡调控因子的预后标志物，能有效预测骨肉瘤患者的免疫景观、预后及化疗放疗策略	NA	阐明铁死亡调控因子在骨肉瘤中的潜在价值，预测患者的预后和治疗策略	骨肉瘤患者的铁死亡调控因子表达及其预后价值	数字病理学	骨肉瘤	基因集变异分析（GSVA），单样本基因集富集分析（ssGSEA），ESTIMATE算法，单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
1267	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing and microarray analyses to explore the pathological mechanisms of chronic thromboembolic pulmonary hypertension 2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2022.900353 PMID:36440052	研究论文	本研究利用基因芯片和单细胞RNA测序技术探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）的病理机制	首次通过基因芯片和单细胞RNA测序数据分析了CTEPH进展过程中的关键mRNAs、miRNAs和circRNAs及其可能的调控关系	NA	探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压的病理机制	CTEPH患者的周围血样和肺动脉内膜切除组织	数字病理学	肺动脉高压	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因芯片	NA	mRNA表达谱、miRNA芯片、circRNA芯片	5名CTEPH患者和5名健康对照者的周围血样，以及5名CTEPH患者的肺动脉内膜切除组织
1268	2024-08-08	Complex interaction and heterogeneity among cancer stem cells in head and neck squamous cell carcinoma revealed by single-cell sequencing 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1050951 PMID:36451812	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症干细胞的复杂相互作用和异质性及其对肿瘤微环境形成的影响	本研究首次详细描述了头颈鳞状细胞癌中癌症干细胞的转录组图谱，揭示了其功能多样性和在肿瘤进展中的关键作用	研究仅基于公共数据库中的20个头颈鳞状细胞癌组织样本，可能无法完全代表所有病例	确定头颈鳞状细胞癌中癌症干细胞的异质性及其对肿瘤微环境形成的影响	头颈鳞状细胞癌中的癌症干细胞	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	20个头颈鳞状细胞癌组织样本
1269	2024-08-08	Construction of a novel choline metabolism-related signature to predict prognosis, immune landscape, and chemotherapy response in colon adenocarcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1038927 PMID:36451813	研究论文	本文构建了一种新的胆碱代谢相关特征，用于预测结肠腺癌的预后、免疫景观和化疗反应	首次构建了胆碱代谢相关特征，并验证了其在预测结肠腺癌患者预后、免疫微环境和化疗反应中的应用价值	NA	研究胆碱代谢相关特征在结肠腺癌中的预后预测、免疫微环境和化疗反应中的应用	结肠腺癌患者的预后、免疫微环境和化疗反应	数字病理学	结肠腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	训练集为TCGA-COAD，验证集为GSE17536
1270	2024-08-08	Self-assembly of X-shaped antibody to combine the activity of IgG and IgA for enhanced tumor killing 2022, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.74903 PMID:36451853	研究论文	本文开发了一种基于分子自组装原理的X形抗体（X-body），结合了IgG和IgA的活性，有效招募和激活NK细胞、巨噬细胞和中性粒细胞以杀死肿瘤细胞	X-body结合了IgG和IgA的活性，能够有效招募和激活多种免疫细胞，提高肿瘤杀伤效果	NA	开发一种新的肿瘤靶向治疗策略	X形抗体（X-body）及其在肿瘤治疗中的应用	NA	肿瘤	表面等离子体共振、负染色透射电子显微镜、单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	细胞	多个同基因小鼠模型中的肿瘤细胞和肿瘤浸润免疫细胞
1271	2024-08-08	Pueraria lobata Potentially Treating Prostate Cancer on Single-Cell Level by Network Pharmacology and AutoDock: Clinical Findings and Drug Targets 2022, Computational and mathematical methods in medicine DOI:10.1155/2022/3758219 PMID:36452480	研究论文	本研究通过网络药理学和AutoDock技术，探讨了葛根（Pueraria lobata）在单细胞水平上治疗前列腺癌（PCa）的潜在机制	构建了葛根在前列腺癌单细胞水平的药物-活性成分-靶点通路网络，揭示了其通过调节多个生物过程和相关信号通路来干预前列腺癌的发生和发展	NA	探索和改进前列腺癌的新治疗模式	前列腺癌的单细胞序列和葛根的活性成分及靶点	数字病理学	前列腺癌	分子对接	NA	基因表达数据	NA
1272	2024-08-08	Corrigendum: Single-cell transcriptomics reveals the complexity of the tumor microenvironment of treatment-naive osteosarcoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1077067 PMID:36457508	correction	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1273	2024-08-08	Single-cell transcriptomic analysis of the tumor ecosystem of adenoid cystic carcinoma 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1063477 PMID:36465348	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了腺样囊性癌（ACC）肿瘤生态系统的转录组特征	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ACC中不同类型上皮细胞的转录组特征，并识别出具有特殊拷贝数变异的癌前细胞	研究样本仅限于三位患者，可能影响结果的普遍性	探究腺样囊性癌的肿瘤生态系统及其生物学行为	腺样囊性癌的肿瘤组织和癌旁组织中的细胞	数字病理学	腺样囊性癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	49,948个细胞来自三位患者的癌旁组织和肿瘤组织
1274	2024-08-08	SERPINB9 is commonly amplified and high expression in cancer cells correlates with poor immune checkpoint blockade response 2022, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2022.2139074 PMID:36465485	研究论文	研究探讨了SERPINB9基因在癌症细胞中的高表达与免疫检查点阻断（ICB）反应不良之间的关系	首次揭示了SERPINB9基因在癌症细胞中的高表达与ICB反应不良的相关性，并探讨了其在免疫治疗抵抗中的潜在作用	研究主要集中在非小细胞肺癌（NSCLC）和黑色素瘤，可能不适用于所有癌症类型	探索SERPINB9基因在癌症细胞中的作用及其对免疫治疗反应的影响	SERPINB9基因在癌症细胞中的表达及其对免疫检查点阻断反应的影响	数字病理学	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括NSCLC和黑色素瘤的多个细胞系
1275	2024-08-08	A spatiotemporal steroidogenic regulatory network in human fetal adrenal glands and gonads 2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2022.1036517 PMID:36465633	research paper	本研究通过10× Genomics单细胞转录组技术和空间转录组学技术，对7至14周孕周的人类胎儿肾上腺和性腺进行了测序，重建了它们的位置信息，并探讨了性激素合成过程中的细胞协调机制。	首次揭示了人类胎儿肾上腺和性腺中脱氢表雄酮（DHEA）合成的重要酶基因表达变化，以及这一变化在性别分化窗口期对DHEA和皮质醇合成的加速作用。	NA	探讨人类胎儿肾上腺和性腺中性激素合成的主要前体脱氢表雄酮（DHEA）的生物学机制。	人类胎儿肾上腺和性腺。	NA	NA	10× Genomics单细胞转录组技术，空间转录组学	NA	转录组	7至14周孕周的人类胎儿肾上腺和性腺样本
1276	2024-08-08	An Oxidative Stress-Related Gene Signature in Granulosa Cells Is Associated with Ovarian Aging 2022, Oxidative medicine and cellular longevity DOI:10.1155/2022/1070968 PMID:36466095	研究论文	本文研究了颗粒细胞中与氧化应激相关的基因特征与卵巢衰老的关系	首次在非人灵长类和人类数据集中验证了与卵巢衰老相关的颗粒细胞氧化应激基因特征	NA	探讨颗粒细胞中氧化应激相关基因特征与卵巢衰老的关联	颗粒细胞中的氧化应激相关基因	NA	卵巢衰老	单细胞转录组测序, qPCR	NA	转录组数据	非人灵长类和人类样本, 以及人卵巢颗粒细胞瘤细胞系KGN和小鼠颗粒细胞
1277	2024-08-08	Single-cell transcriptome sequencing revealing the difference in photosynthesis and carbohydrate metabolism between epidermal cells and non-epidermal cells of Gracilariopsis lemaneiformis (Rhodophyta) 2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2022.968158 PMID:36466256	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了Gracilariopsis lemaneiformis（红藻）的表皮细胞和非表皮细胞在正常光照条件下的光合作用和碳水化合物代谢差异	首次揭示了表皮细胞和非表皮细胞在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异，并发现了光合产物在细胞间的运输	NA	探究不同细胞类型在光合作用和碳水化合物代谢方面的差异及其碳分配机制	Gracilariopsis lemaneiformis的表皮细胞和非表皮细胞	NA	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	3436个差异表达基因
1278	2024-08-08	Single-cell sequencing reveals the landscape of the tumor microenvironment in a skeletal undifferentiated pleomorphic sarcoma patient 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1019870 PMID:36466840	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了一名骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织，揭示了肿瘤微环境的细胞组成和相关标志基因	首次利用单细胞RNA测序技术详细解析了骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境，并识别了潜在的治疗靶点	研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证	探讨骨骼未分化多形性肉瘤的肿瘤微环境及其潜在治疗策略	骨骼未分化多形性肉瘤患者的肿瘤组织和癌旁组织	数字病理学	软组织肉瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	单一病例
1279	2024-08-08	Combined bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq identifies a necroptosis-related prognostic signature associated with inhibitory immune microenvironment in glioma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1013094 PMID:36466844	研究论文	本研究通过结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术，识别出与胶质瘤抑制性免疫微环境相关的坏死性凋亡相关预后标志物	首次构建了基于18个坏死性凋亡相关基因的预后标志物，并验证了其在不同数据集中的预测能力	NA	探讨坏死性凋亡相关基因在胶质瘤中的预后价值及其与免疫微环境的关系	胶质瘤患者的预后及免疫微环境	数字病理学	脑瘤	RNA-seq	NA	基因表达数据	159个坏死性凋亡相关基因，TCGA数据集及两个外部CGGA数据集
1280	2024-08-08	Heterogeneity of neutrophils and inflammatory responses in patients with COVID-19 and healthy controls 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.970287 PMID:36466858	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者和健康对照者的外周血中性粒细胞，揭示了与疾病严重程度相关的不同成熟中性粒细胞亚群	首次详细分析了COVID-19患者中性粒细胞的异质性及其在炎症反应中的作用	由于技术挑战，对中性粒细胞的深入分析有限	探究COVID-19患者与健康对照者中性粒细胞反应的差异	COVID-19患者和健康对照者的中性粒细胞	NA	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括轻度和重度COVID-19患者及健康对照者的外周血中性粒细胞