单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1241	2024-08-08	Single-Cell Sequencing Reveals the Regulatory Role of Maresin1 on Neutrophils during Septic Lung Injury 2022-Nov-23, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells11233733 PMID:36496993	研究论文	本研究利用单细胞测序技术揭示了Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控作用	首次在单细胞水平上揭示了Maresin1对中性粒细胞的调控机制，特别是对Neutrophil-Cxcl3亚群的影响	研究仅限于特定的细胞类型和模型，未来需进一步验证在更广泛细胞类型和临床样本中的效果	探讨Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控机制	中性粒细胞及其在脓毒性肺损伤中的作用	数字病理学	肺损伤	单细胞测序	NA	细胞数据	具体样本数量未在摘要中提及
1242	2024-08-08	Inhibition of the MAPK/c-Jun-EGR1 Pathway Decreases Photoreceptor Cell Death in the rd1 Mouse Model for Inherited Retinal Degeneration 2022-Nov-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms232314600 PMID:36498926	研究论文	本研究探讨了早期生长反应因子-1（EGR1）表达对rd1小鼠模型中视网膜色素变性（RP）光感受器细胞死亡的影响及其机制	揭示了通过抑制MAPK/c-Jun通路减少EGR1和PARP1表达，从而防止光感受器细胞死亡的新治疗途径	NA	研究EGR1在光感受器细胞死亡中的作用及机制	rd1小鼠模型中的光感受器细胞	数字病理学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀（ChIP）、双荧光素酶报告基因分析、蛋白质印迹（western blotting）、免疫荧光染色、TUNEL检测	NA	基因表达数据	rd1小鼠和同源野生型（WT）小鼠
1243	2024-08-08	Preventing Surgery-Induced NK Cell Dysfunction Using Anti-TGF-β Immunotherapeutics 2022-Nov-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms232314608 PMID:36498937	研究论文	研究使用抗TGF-β免疫疗法预防手术后NK细胞功能障碍	首次揭示了手术后TGF-β通过调节NK细胞的信号通路导致IFNγ产生减少，并提出使用抗TGF-β免疫疗法可以预防这种功能障碍	研究样本量较小，仅涉及六名结直肠癌患者	探讨手术后NK细胞功能障碍的机制及可能的治疗方法	手术后患者的NK细胞功能及TGF-β对其的影响	免疫学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	六名结直肠癌患者的外周血单个核细胞
1244	2024-08-08	Bone Marrow Macrophages Induce Inflammation by Efferocytosis of Apoptotic Prostate Cancer Cells via HIF-1α Stabilization 2022-Nov-22, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells11233712 PMID:36496973	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了骨髓巨噬细胞通过吞噬凋亡的前列腺癌细胞，通过HIF-1α稳定化促进炎症反应的分子机制	首次阐明了骨髓巨噬细胞在吞噬凋亡的前列腺癌细胞过程中，HIF-1α的稳定化及其对炎症反应的促进作用	NA	探究骨髓巨噬细胞吞噬凋亡的前列腺癌细胞后，HIF-1α稳定化对炎症反应的影响及其分子机制	骨髓巨噬细胞、凋亡的前列腺癌细胞、HIF-1α	数字病理学	前列腺癌	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
1245	2024-08-08	Single-cell transcriptomes and runx2b-/- mutants reveal the genetic signatures of intermuscular bone formation in zebrafish 2022-Nov, National science review IF:16.3Q1 DOI:10.1093/nsr/nwac152 PMID:36478733	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和runx2b-/-突变体揭示了斑马鱼肌肉间骨形成的遗传特征	首次通过单细胞转录组学分析定义了18种不同的细胞类型，并揭示了肌肉间骨来源于肌腱，以及肌腱-成骨细胞系在肌肉间骨形成中的核心作用	NA	探究斑马鱼肌肉间骨形成的分子基础	斑马鱼的肌肉间骨	数字病理学	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	CRISPR-Cas9	转录组	NA
1246	2024-08-08	Identification of Small Airway Epithelium-Related Hub Genes in Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2022, International journal of chronic obstructive pulmonary disease IF:2.7Q2 DOI:10.2147/COPD.S377026 PMID:36475041	研究论文	本研究通过微阵列数据和单细胞RNA测序数据，识别与慢性阻塞性肺疾病（COPD）相关的小气道上皮细胞的关键基因	首次识别出可能在COPD过程中发挥抗氧化作用的关键基因，并通过单细胞转录组分析揭示了这些基因在COPD中的表达和分布	NA	识别与COPD进展相关的小气道上皮细胞的关键基因	小气道上皮细胞和COPD患者	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	微阵列分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序，实时定量PCR（RT-qPCR）	NA	基因表达数据	34名健康非吸烟者和33名COPD患者的小气道上皮细胞样本，以及单细胞RNA测序数据
1247	2024-08-08	scAnalyzeR: A Comprehensive Software Package With Graphical User Interface for Single-Cell RNA Sequencing Analysis and its Application on Liver Cancer 2022 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3 DOI:10.1177/15330338221142729 PMID:36476060	研究论文	开发了一个名为scAnalyzeR的单细胞RNA测序分析软件包，具有图形用户界面，用于分析和可视化单细胞RNA测序数据，并应用于肝癌研究	scAnalyzeR提供了一个交互式和用户友好的图形界面，简化了单细胞RNA测序数据分析的复杂性，并支持多种技术平台和模型生物的数据输入	NA	开发一个易于使用的单细胞RNA测序分析工具，并展示其在癌症研究中的应用	单细胞RNA测序数据和肝癌肿瘤细胞	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
1248	2024-08-08	Myeloid cell reprogramming alleviates immunosuppression and promotes clearance of metastatic lesions 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1039993 PMID:36479083	研究论文	研究通过静脉注射无药物的聚合物纳米颗粒（NPs）来重编程骨髓细胞，以减轻免疫抑制并促进清除转移性病变	使用无药物的聚合物纳米颗粒重编程骨髓细胞，改变其表型和功能，从而影响肿瘤微环境	研究仅在4T1小鼠模型中进行，需要进一步在其他模型和临床试验中验证	探索通过纳米颗粒重编程骨髓细胞以减轻免疫抑制并促进肿瘤清除的方法	骨髓细胞、纳米颗粒、转移性乳腺癌模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了4T1小鼠模型，具体样本数量未明确
1249	2024-08-08	Identification of immune cell function in breast cancer by integrating multiple single-cell data 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1058239 PMID:36479102	研究论文	本研究通过整合两个公开的乳腺癌单细胞RNA测序数据集，探讨了肿瘤微环境中不同类型免疫细胞的功能	本研究利用单细胞RNA测序技术，全面评估了细胞间的异质性，并揭示了不同细胞类型的基因表达状态	由于样本大小和测序深度的影响，不同细胞类型在乳腺癌中的基因特异性无法完全揭示	旨在识别对乳腺癌免疫微环境至关重要的细胞类型特异性基因，以促进乳腺癌治疗	研究对象包括乳腺癌中的B细胞、T细胞和巨噬细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	整合了两个公开的乳腺癌scRNA-seq数据集
1250	2024-08-08	Optimization of chondrocyte isolation from human articular cartilage to preserve the chondrocyte transcriptome 2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2022.1046127 PMID:36479429	研究论文	本文优化了从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序，以最大限度地保留软骨细胞的转录组	研究引入了在低氧条件下立即处理软骨组织和使用不同浓度的胶原酶II以及Actinomycin D来稳定转录组的方法	NA	优化从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序，以保留软骨细胞的转录组	人类关节软骨中的软骨细胞	NA	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自骨关节炎患者的软骨组织
1251	2024-08-08	Anesthesia and developing brain: What have we learned from recent studies 2022, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fnmol.2022.1017578 PMID:36479527	综述	本文综述了近年来关于麻醉对发育中大脑影响的研究进展，提供了保护不成熟大脑的有用建议和潜在治疗靶点	结合单细胞测序技术筛选非人灵长类动物中的差异基因表达，并在啮齿类动物中进行验证	啮齿类模型中的机制是否具有临床相关性仍不明确，且使用非人灵长类动物模型的研究机构较少	探讨麻醉对发育中大脑的神经毒性影响及其机制，并寻找新的解决方案	发育中的大脑	NA	NA	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	NA
1252	2024-08-08	Immune and non-immune cell subtypes identify novel targets for prognostic and therapeutic strategy: A study based on intratumoral heterogenicity analysis of multicenter scRNA-seq datasets in lung adenocarcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1046121 PMID:36483553	研究论文	本研究基于多中心单细胞RNA测序数据集，分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性，识别了免疫和非免疫细胞亚型，并揭示了潜在的预后和治疗靶点	利用单细胞RNA测序技术，系统分析了肺腺癌的多中心数据集，识别了15种主要细胞类型和57个细胞亚群，并发现了多种潜在的生物标志物	NA	旨在通过分析肺腺癌的肿瘤内异质性，识别新的预后和治疗靶点，以改善临床治疗效果	肺腺癌中的免疫和非免疫细胞亚型	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	多中心数据集
1253	2024-08-08	Naïve B cells with low differentiation improve the immune reconstitution of HIV-infected patients 2022-Dec-22, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2022.105559 PMID:36465118	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的B细胞受体（BCR）谱和B细胞亚型，发现幼稚B细胞和记忆B细胞的基因片段使用主导，且BCR谱的多样性在免疫非应答者中降低。	研究发现幼稚B细胞的低分化与良好的免疫状态相关，并揭示了B细胞周期中免疫特异性基因IgD细胞在免疫非应答者中的降解机制。	NA	理解HIV感染后B细胞介导的免疫反应在免疫重建中的作用	HIV感染患者的B细胞亚型和BCR谱	免疫学	HIV感染	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的外周血单个核细胞
1254	2024-08-08	B cell expansion hinders the stroma-epithelium regenerative cross talk during mucosal healing 2022-12-13, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2022.11.002 PMID:36462502	研究论文	本文通过纵向研究肠道损伤和再生过程中的免疫细胞组成，揭示了B细胞在黏膜愈合过程中的作用及其对上皮-间质细胞相互作用的影响	首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了B细胞在肠道黏膜愈合中的具体作用机制	NA	探究影响肠道再生的细胞机制，特别是在黏膜愈合过程中B细胞的作用	肠道黏膜愈合过程中的免疫细胞组成及B细胞的作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
1255	2024-08-08	Robust Graph Regularized NMF with Dissimilarity and Similarity Constraints for ScRNA-seq Data Clustering 2022-Dec-12, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.2c01305 PMID:36459053	研究论文	本文提出了一种新的单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据表示模型，称为具有不相似性和相似性约束的鲁棒图正则化非负矩阵分解（RGNMF-DS），用于ScRNA-seq数据聚类	采用互补的正则化器（相似和不相似正则化器）来指导矩阵分解，并构建图正则化器以发现ScRNA-seq数据中隐藏的局部几何结构，同时采用-范数来测量重建误差，从而提高模型对噪声的鲁棒性	NA	解决直接聚类ScRNA-seq数据时由于其高维度和噪声导致的性能不佳问题	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	非负矩阵分解（NMF）	基因表达数据	多个ScRNA-seq数据集
1256	2024-08-08	Interferon-dependent SLC14A1+ cancer-associated fibroblasts promote cancer stemness via WNT5A in bladder cancer 2022-12-12, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.005 PMID:36459995	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者样本，发现一种由干扰素信号诱导的、高表达尿素转运蛋白SLC14A1的癌症相关成纤维细胞亚群，该亚群通过WNT5A旁分泌途径促进膀胱癌细胞的干细胞特性	首次报道了SLC14A1+癌症相关成纤维细胞在膀胱癌中的作用及其通过WNT5A途径促进干细胞特性的机制	NA	探讨癌症相关成纤维细胞在膀胱癌治疗反应和患者预后中的作用	膀胱癌患者的癌症相关成纤维细胞及其对癌细胞干细胞特性的影响	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	膀胱癌患者样本
1257	2024-08-08	Targeting HER3 or MEK overcomes acquired Trastuzumab resistance in HER2-positive gastric cancer-derived xenograft 2022-Dec-03, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-022-01259-z PMID:36463209	研究论文	本研究通过建立胃癌PDX模型，探讨了HER2阳性胃癌对Trastuzumab产生耐药性的机制，并验证了联合使用HER3靶向抗体或MEK抑制剂作为克服耐药性的策略。	首次通过单细胞转录组测序、蛋白质组学和基因组变异分析全面描绘了Trastuzumab耐药性的分子机制，并验证了联合治疗策略的有效性。	研究仅限于动物模型，尚未在临床试验中验证。	探讨HER2阳性胃癌对Trastuzumab产生耐药性的机制，并寻找克服耐药性的新策略。	HER2阳性胃癌及其对Trastuzumab的耐药性。	数字病理学	胃癌	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	两个PDX模型（176P和176R）
1258	2024-08-08	m6A epitranscriptomic modification regulates neural progenitor-to-glial cell transition in the retina 2022-12-02, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.79994 PMID:36459087	研究论文	本研究使用视网膜特异性条件性敲除小鼠模型，探讨了m6A表观转录组修饰在视网膜神经前体细胞向胶质细胞转变中的作用	揭示了m6A表观转录组修饰通过调控前体细胞转录本的降解，精细调节视网膜前体细胞向Müller胶质细胞的转录组转变	NA	探讨m6A表观转录组修饰在视网膜发育中的功能	视网膜神经前体细胞和Müller胶质细胞	表观遗传学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），MeRIP-seq	NA	RNA	视网膜特异性条件性敲除小鼠模型
1259	2024-08-08	Personalized health risk assessment based on single-cell RNA sequencing analysis of a male with 45, X/48, XYYY karyotype 2022-12-02, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-25308-w PMID:36460769	研究论文	本文报道了一名具有罕见45, X/48, XYYY核型的14岁男孩，通过单细胞RNA测序分析评估其长期健康风险，特别是癌症风险	利用单细胞RNA测序技术首次详细分析了该核型患者的免疫细胞基因表达差异，并通过数字滴液PCR在DNA水平上验证了这些结果	研究样本数量有限，仅基于单一病例	评估具有45, X/48, XYYY核型个体的长期健康风险，特别是癌症风险	具有罕见45, X/48, XYYY核型的14岁男孩	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	单一病例
1260	2024-08-08	Monocytes deposit migrasomes to promote embryonic angiogenesis 2022-12, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-022-01026-3 PMID:36443426	research paper	研究报告了在鸡胚绒毛尿囊膜中，高迁移性细胞在毛细血管形成区域巡逻并沉积migrasomes，这些细胞被鉴定为单核细胞，其migrasomes富含促血管生成因子，促进胚胎血管生成。	首次发现单核细胞通过沉积富含促血管生成因子的migrasomes来促进胚胎血管生成。	NA	探讨单核细胞在胚胎血管生成中的作用及其机制。	单核细胞、migrasomes、胚胎血管生成。	NA	NA	单细胞测序、定量质谱分析。	NA	细胞、蛋白质。	鸡胚绒毛尿囊膜中的细胞样本。