单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1181 - 1200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2024-08-08 |
[Research Progress of Single-cell Transcriptome Sequencing Technology in Physiological Hematopoiesis--Review]
2022-Dec, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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综述 | 本文综述了近年来大规模单细胞转录组测序技术在生理性造血领域的研究进展 | 单细胞转录组测序技术为研究者提供了一个独特的视角，使得绘制生物体造血发育的最详细细胞命运转变图成为可能 | 由于技术限制，难以追踪造血器官中单细胞的造血活动 | 探讨单细胞转录组测序技术在生理性造血领域的应用 | 生理性造血过程中的细胞分化路径 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞 |
| 1182 | 2024-08-08 |
Evaluation of pulmonary single-cell identity specificity in scRNA-seq analysis
2022-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1132
PMID:36495131
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1183 | 2024-08-08 |
ACAP1 Deficiency Predicts Inferior Immunotherapy Response in Solid Tumors
2022-Dec-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14235951
PMID:36497434
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研究论文 | 本研究探讨了ACAP1在淋巴细胞中的表达及其对免疫治疗反应的影响 | 首次全面分析了ACAP1在肿瘤浸润淋巴细胞中的表达及其对免疫治疗反应的影响 | NA | 研究ACAP1在淋巴细胞中的功能及其对免疫治疗反应的预测作用 | ACAP1在淋巴细胞中的表达及其对免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫治疗队列, 基因集富集分析(GSEA) | NA | 基因组数据 | 多个批量RNA测序数据集, 单细胞测序数据集, 免疫治疗队列 |
| 1184 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing combined with bulk RNA-sequencing analysis of peripheral blood reveals the characteristics and key immune cell genes of ulcerative colitis
2022-Nov-26, World journal of clinical cases
IF:1.0Q3
DOI:10.12998/wjcc.v10.i33.12116
PMID:36483809
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合批量RNA测序（RNA-seq）分析溃疡性结肠炎（UC）患者的外周血细胞亚型，揭示UC的核心基因及其与免疫细胞的关系 | 利用scRNA-seq技术精确获取肠道数千个细胞的基因表达模式，结合WGCNA和LASSO分析，识别出与UC相关的核心基因RhoB、CTSD和ZYX | NA | 旨在识别能够预测UC患者对特定治疗药物反应的临床表型和生物标志物，从而辅助UC的诊断和治疗 | 溃疡性结肠炎（UC）患者的外周血细胞亚型及其核心基因 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），最小绝对收缩和选择算子（LASSO） | 基因表达数据 | 约24340个细胞，17种细胞类型 |
| 1185 | 2024-08-08 |
Caerin 1.1/1.9 Enhances Antitumour Immunity by Activating the IFN-α Response Signalling Pathway of Tumour Macrophages
2022-Nov-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14235785
PMID:36497272
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研究论文 | 本研究探讨了caerin 1.1/1.9肽通过激活肿瘤巨噬细胞的IFN-α反应信号通路增强抗肿瘤免疫的效果 | 本研究首次揭示了caerin 1.1/1.9肽通过诱导IL-12分泌的Ly6C+F4/80+巨噬细胞浸润肿瘤，增强IFN-α反应信号，从而清除肿瘤 | 研究主要基于小鼠移植瘤模型和早期宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据，可能需要更多临床数据验证 | 探讨caerin 1.1/1.9肽在增强抗肿瘤免疫治疗中的作用 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和小鼠移植瘤模型 | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠移植瘤模型和早期宫颈癌患者的TAMs |
| 1186 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Regulatory Role of Maresin1 on Neutrophils during Septic Lung Injury
2022-Nov-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11233733
PMID:36496993
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术揭示了Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控作用 | 首次在单细胞水平上揭示了Maresin1对中性粒细胞的调控机制，特别是对Neutrophil-Cxcl3亚群的影响 | 研究仅限于特定的细胞类型和模型，未来需进一步验证在更广泛细胞类型和临床样本中的效果 | 探讨Maresin1在脓毒性肺损伤中对中性粒细胞的调控机制 | 中性粒细胞及其在脓毒性肺损伤中的作用 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1187 | 2024-08-08 |
Inhibition of the MAPK/c-Jun-EGR1 Pathway Decreases Photoreceptor Cell Death in the rd1 Mouse Model for Inherited Retinal Degeneration
2022-Nov-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314600
PMID:36498926
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研究论文 | 本研究探讨了早期生长反应因子-1（EGR1）表达对rd1小鼠模型中视网膜色素变性（RP）光感受器细胞死亡的影响及其机制 | 揭示了通过抑制MAPK/c-Jun通路减少EGR1和PARP1表达，从而防止光感受器细胞死亡的新治疗途径 | NA | 研究EGR1在光感受器细胞死亡中的作用及机制 | rd1小鼠模型中的光感受器细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀（ChIP）、双荧光素酶报告基因分析、蛋白质印迹（western blotting）、免疫荧光染色、TUNEL检测 | NA | 基因表达数据 | rd1小鼠和同源野生型（WT）小鼠 |
| 1188 | 2024-08-08 |
Preventing Surgery-Induced NK Cell Dysfunction Using Anti-TGF-β Immunotherapeutics
2022-Nov-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314608
PMID:36498937
|
研究论文 | 研究使用抗TGF-β免疫疗法预防手术后NK细胞功能障碍 | 首次揭示了手术后TGF-β通过调节NK细胞的信号通路导致IFNγ产生减少，并提出使用抗TGF-β免疫疗法可以预防这种功能障碍 | 研究样本量较小，仅涉及六名结直肠癌患者 | 探讨手术后NK细胞功能障碍的机制及可能的治疗方法 | 手术后患者的NK细胞功能及TGF-β对其的影响 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六名结直肠癌患者的外周血单个核细胞 |
| 1189 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Macrophages Induce Inflammation by Efferocytosis of Apoptotic Prostate Cancer Cells via HIF-1α Stabilization
2022-Nov-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11233712
PMID:36496973
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了骨髓巨噬细胞通过吞噬凋亡的前列腺癌细胞，通过HIF-1α稳定化促进炎症反应的分子机制 | 首次阐明了骨髓巨噬细胞在吞噬凋亡的前列腺癌细胞过程中，HIF-1α的稳定化及其对炎症反应的促进作用 | NA | 探究骨髓巨噬细胞吞噬凋亡的前列腺癌细胞后，HIF-1α稳定化对炎症反应的影响及其分子机制 | 骨髓巨噬细胞、凋亡的前列腺癌细胞、HIF-1α | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1190 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes and runx2b-/- mutants reveal the genetic signatures of intermuscular bone formation in zebrafish
2022-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwac152
PMID:36478733
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和runx2b-/-突变体揭示了斑马鱼肌肉间骨形成的遗传特征 | 首次通过单细胞转录组学分析定义了18种不同的细胞类型，并揭示了肌肉间骨来源于肌腱，以及肌腱-成骨细胞系在肌肉间骨形成中的核心作用 | NA | 探究斑马鱼肌肉间骨形成的分子基础 | 斑马鱼的肌肉间骨 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | CRISPR-Cas9 | 转录组 | NA |
| 1191 | 2024-08-08 |
Identification of Small Airway Epithelium-Related Hub Genes in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2022, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S377026
PMID:36475041
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研究论文 | 本研究通过微阵列数据和单细胞RNA测序数据，识别与慢性阻塞性肺疾病（COPD）相关的小气道上皮细胞的关键基因 | 首次识别出可能在COPD过程中发挥抗氧化作用的关键基因，并通过单细胞转录组分析揭示了这些基因在COPD中的表达和分布 | NA | 识别与COPD进展相关的小气道上皮细胞的关键基因 | 小气道上皮细胞和COPD患者 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 微阵列分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞RNA测序，实时定量PCR（RT-qPCR） | NA | 基因表达数据 | 34名健康非吸烟者和33名COPD患者的小气道上皮细胞样本，以及单细胞RNA测序数据 |
| 1192 | 2024-08-08 |
scAnalyzeR: A Comprehensive Software Package With Graphical User Interface for Single-Cell RNA Sequencing Analysis and its Application on Liver Cancer
2022 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338221142729
PMID:36476060
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研究论文 | 开发了一个名为scAnalyzeR的单细胞RNA测序分析软件包，具有图形用户界面，用于分析和可视化单细胞RNA测序数据，并应用于肝癌研究 | scAnalyzeR提供了一个交互式和用户友好的图形界面，简化了单细胞RNA测序数据分析的复杂性，并支持多种技术平台和模型生物的数据输入 | NA | 开发一个易于使用的单细胞RNA测序分析工具，并展示其在癌症研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据和肝癌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1193 | 2024-08-08 |
Myeloid cell reprogramming alleviates immunosuppression and promotes clearance of metastatic lesions
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1039993
PMID:36479083
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研究论文 | 研究通过静脉注射无药物的聚合物纳米颗粒（NPs）来重编程骨髓细胞，以减轻免疫抑制并促进清除转移性病变 | 使用无药物的聚合物纳米颗粒重编程骨髓细胞，改变其表型和功能，从而影响肿瘤微环境 | 研究仅在4T1小鼠模型中进行，需要进一步在其他模型和临床试验中验证 | 探索通过纳米颗粒重编程骨髓细胞以减轻免疫抑制并促进肿瘤清除的方法 | 骨髓细胞、纳米颗粒、转移性乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了4T1小鼠模型，具体样本数量未明确 |
| 1194 | 2024-08-08 |
Identification of immune cell function in breast cancer by integrating multiple single-cell data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1058239
PMID:36479102
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研究论文 | 本研究通过整合两个公开的乳腺癌单细胞RNA测序数据集，探讨了肿瘤微环境中不同类型免疫细胞的功能 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面评估了细胞间的异质性，并揭示了不同细胞类型的基因表达状态 | 由于样本大小和测序深度的影响，不同细胞类型在乳腺癌中的基因特异性无法完全揭示 | 旨在识别对乳腺癌免疫微环境至关重要的细胞类型特异性基因，以促进乳腺癌治疗 | 研究对象包括乳腺癌中的B细胞、T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 整合了两个公开的乳腺癌scRNA-seq数据集 |
| 1195 | 2024-08-08 |
Optimization of chondrocyte isolation from human articular cartilage to preserve the chondrocyte transcriptome
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.1046127
PMID:36479429
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研究论文 | 本文优化了从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序，以最大限度地保留软骨细胞的转录组 | 研究引入了在低氧条件下立即处理软骨组织和使用不同浓度的胶原酶II以及Actinomycin D来稳定转录组的方法 | NA | 优化从人类关节软骨中分离软骨细胞的程序，以保留软骨细胞的转录组 | 人类关节软骨中的软骨细胞 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自骨关节炎患者的软骨组织 |
| 1196 | 2024-08-08 |
Anesthesia and developing brain: What have we learned from recent studies
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1017578
PMID:36479527
|
综述 | 本文综述了近年来关于麻醉对发育中大脑影响的研究进展，提供了保护不成熟大脑的有用建议和潜在治疗靶点 | 结合单细胞测序技术筛选非人灵长类动物中的差异基因表达，并在啮齿类动物中进行验证 | 啮齿类模型中的机制是否具有临床相关性仍不明确，且使用非人灵长类动物模型的研究机构较少 | 探讨麻醉对发育中大脑的神经毒性影响及其机制，并寻找新的解决方案 | 发育中的大脑 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1197 | 2024-08-08 |
Immune and non-immune cell subtypes identify novel targets for prognostic and therapeutic strategy: A study based on intratumoral heterogenicity analysis of multicenter scRNA-seq datasets in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1046121
PMID:36483553
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研究论文 | 本研究基于多中心单细胞RNA测序数据集，分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性，识别了免疫和非免疫细胞亚型，并揭示了潜在的预后和治疗靶点 | 利用单细胞RNA测序技术，系统分析了肺腺癌的多中心数据集，识别了15种主要细胞类型和57个细胞亚群，并发现了多种潜在的生物标志物 | NA | 旨在通过分析肺腺癌的肿瘤内异质性，识别新的预后和治疗靶点，以改善临床治疗效果 | 肺腺癌中的免疫和非免疫细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 多中心数据集 |
| 1198 | 2024-08-08 |
Naïve B cells with low differentiation improve the immune reconstitution of HIV-infected patients
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105559
PMID:36465118
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的B细胞受体（BCR）谱和B细胞亚型，发现幼稚B细胞和记忆B细胞的基因片段使用主导，且BCR谱的多样性在免疫非应答者中降低。 | 研究发现幼稚B细胞的低分化与良好的免疫状态相关，并揭示了B细胞周期中免疫特异性基因IgD细胞在免疫非应答者中的降解机制。 | NA | 理解HIV感染后B细胞介导的免疫反应在免疫重建中的作用 | HIV感染患者的B细胞亚型和BCR谱 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及健康对照组、HIV感染的免疫应答者和非应答者的外周血单个核细胞 |
| 1199 | 2024-08-08 |
B cell expansion hinders the stroma-epithelium regenerative cross talk during mucosal healing
2022-12-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.11.002
PMID:36462502
|
研究论文 | 本文通过纵向研究肠道损伤和再生过程中的免疫细胞组成，揭示了B细胞在黏膜愈合过程中的作用及其对上皮-间质细胞相互作用的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了B细胞在肠道黏膜愈合中的具体作用机制 | NA | 探究影响肠道再生的细胞机制，特别是在黏膜愈合过程中B细胞的作用 | 肠道黏膜愈合过程中的免疫细胞组成及B细胞的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1200 | 2024-08-08 |
Robust Graph Regularized NMF with Dissimilarity and Similarity Constraints for ScRNA-seq Data Clustering
2022-Dec-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.2c01305
PMID:36459053
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序（ScRNA-seq）数据表示模型，称为具有不相似性和相似性约束的鲁棒图正则化非负矩阵分解（RGNMF-DS），用于ScRNA-seq数据聚类 | 采用互补的正则化器（相似和不相似正则化器）来指导矩阵分解，并构建图正则化器以发现ScRNA-seq数据中隐藏的局部几何结构，同时采用-范数来测量重建误差，从而提高模型对噪声的鲁棒性 | NA | 解决直接聚类ScRNA-seq数据时由于其高维度和噪声导致的性能不佳问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 多个ScRNA-seq数据集 |