单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2024-09-23	Multiomic analysis reveals conservation of cancer-associated fibroblast phenotypes across species and tissue of origin 2022-11-14, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2022.09.015 PMID:36270275	研究论文	本文通过多组学分析揭示了癌症相关成纤维细胞表型在不同物种和组织来源中的保守性	本文首次通过配对的染色质可及性和转录组分析，综合分析了癌症相关成纤维细胞的亚群，并识别出三种超群：稳态样、机械应答和免疫调节型成纤维细胞	NA	研究癌症相关成纤维细胞的异质性及其在不同物种和组织中的保守性	癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用	数字病理学	NA	单细胞RNA测序、染色质可及性分析	NA	转录组、蛋白质组	多个组织类型和物种的样本
102	2024-09-23	Cellular and molecular profiles of larval and adult Xenopus corneal epithelia resolved at the single-cell level 2022-11, Developmental biology IF:2.5Q2 DOI:10.1016/j.ydbio.2022.08.007 PMID:36049533	研究论文	研究通过单细胞RNA测序分析了青蛙角膜上皮细胞在幼体和成体阶段的细胞和分子特征	揭示了角膜发育和成熟过程中细胞多样性的增加以及转录组、基因调控网络和细胞间通讯动力学的显著变化，并识别出潜在的幼体和成体角膜上皮干细胞	NA	探索角膜上皮干细胞及其增殖后代在维持角膜透明度和稳态中的作用	青蛙幼体和成体角膜上皮细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	幼体和成体青蛙角膜细胞
103	2024-09-23	Directed differentiation of human pluripotent stem cells into diverse organ-specific mesenchyme of the digestive and respiratory systems 2022-11, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-022-00733-3 PMID:35978039	研究论文	本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的协议	利用单细胞转录组学揭示的小鼠前肠器官发生中的信号网络和分子标记，成功将人类多能干细胞分化为多种器官特异性间充质	目前主要集中在间充质的生成，尚未涉及复杂人体组织的工程化	开发一种将人类多能干细胞定向分化为消化和呼吸系统中多种器官特异性间充质的方法	人类多能干细胞及其分化产物	再生医学	NA	单细胞转录组学	NA	细胞	4-7天的培养时间，不同类型的间充质细胞比例为60-90%纯度的肝隔膜横纹肌样细胞，70-80%纯度的肝样成纤维细胞，以及约35%的呼吸样、胃样或食管样间充质细胞
104	2024-09-23	Loss of non-motor kinesin KIF26A causes congenital brain malformations via dysregulated neuronal migration and axonal growth as well as apoptosis 2022-10-24, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2022.09.011 PMID:36228617	研究论文	研究了非运动驱动蛋白KIF26A缺失导致先天性脑畸形的机制	首次揭示了KIF26A在脑发育中的功能，并解释了其在神经元迁移、轴突生长和凋亡中的作用	NA	探讨KIF26A缺失对脑发育的影响及其分子机制	KIF26A基因、先天性脑畸形患者、小鼠和人类iPSC衍生的类器官模型	NA	先天性脑畸形	单细胞RNA测序	NA	RNA	包含KIF26A功能缺失变异的患者队列、小鼠模型和人类iPSC衍生的类器官模型
105	2024-09-23	Systematic Comparison of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Models Identifies a Conserved Highly Plastic Basal Cell State 2022-Oct-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1742 PMID:35952360	研究论文	本文系统比较了胰腺导管腺癌模型，发现了一种高度可塑的基底细胞状态	揭示了在不同生长条件下胰腺导管腺癌细胞的异质性变化，并发现了一种高度可塑的基底细胞状态	NA	研究胰腺导管腺癌的细胞异质性和可塑性	胰腺导管腺癌细胞在不同生长条件下的异质性	数字病理学	胰腺癌	单细胞基因组学	NA	基因表达数据	涉及多种体外和体内生长条件下的胰腺导管腺癌细胞样本
106	2024-09-23	Opposing roles of hepatic stellate cell subpopulations in hepatocarcinogenesis 2022-10, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-022-05289-6 PMID:36198802	研究论文	研究了肝星状细胞亚群在肝癌发生中的相反作用	揭示了肝星状细胞亚群在肝癌发生中的双重功能，并阐明了其在慢性肝病进展中的动态变化	NA	探讨肝星状细胞在肝癌发生中的作用及其机制	肝星状细胞及其亚群在肝癌发生中的功能	NA	肝癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
107	2024-09-23	Impact of T-cell immunity on chemotherapy response in childhood acute lymphoblastic leukemia 2022-09-29, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2021014495 PMID:35675514	研究论文	本文研究了T细胞免疫对儿童急性淋巴细胞白血病化疗反应的影响	首次系统评估了T细胞免疫对Ph+ ALL治疗结果的影响，并揭示了T细胞免疫在抑制耐药白血病细胞生长中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和少量儿童样本，需要进一步的人体临床研究验证	探讨T细胞免疫在儿童急性淋巴细胞白血病化疗反应中的作用	T细胞免疫、Ph+ ALL、化疗反应	NA	白血病	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	102名儿童
108	2024-09-23	DNMT3A mutations define a unique biological and prognostic subgroup associated with cytotoxic T cells in PTCL-NOS 2022-09-15, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2021015019 PMID:35639959	研究论文	研究探讨了DNMT3A突变在PTCL-NOS中的作用及其与细胞毒性T细胞的关系	首次发现DNMT3A突变在PTCL-TBX21中与细胞毒性T细胞基因特征的显著富集相关，并验证了其在免疫组化和基因表达层面的影响	研究主要集中在PTCL-TBX21和PTCL-GATA3亚型，其他PTCL亚型的研究较少	探讨DNMT3A突变在PTCL-NOS中的生物学意义及其对预后的影响	PTCL-NOS中的DNMT3A突变及其与细胞毒性T细胞的关系	数字病理学	淋巴瘤	RNA测序	NA	基因表达数据	包括PTCL-TBX21和PTCL-GATA3亚型的多个病例，以及CD8+ T细胞系和原代CD3+ T细胞培养
109	2024-09-23	Single-cell analyses reveal early thymic progenitors and pre-B cells in zebrafish 2022-09-05, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20220038 PMID:35938989	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼骨髓和胸腺中的约70,000个细胞，揭示了斑马鱼免疫细胞发育的基因表达图谱	首次在斑马鱼中发现了早期胸腺祖细胞和前B细胞，并揭示了B细胞和T细胞的发育轨迹	NA	阐明斑马鱼淋巴细胞发育的关键方面，并探索其效应功能的广度	斑马鱼的免疫细胞发育	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	约70,000个细胞
110	2024-09-23	Secretory Cells Are the Primary Source of pIgR in Small Airways 2022-09, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2021-0548OC PMID:35687143	研究论文	研究探讨了慢性阻塞性肺疾病（COPD）小气道中分泌性IgA（SIgA）丢失的原因及其与pIgR表达的关系	首次在单细胞分辨率下定义和量化了人类气道中pIgR表达的细胞类型，并评估了中性粒细胞弹性蛋白酶和非类型细菌分泌的蛋白酶对SIgA降解的影响	研究主要集中在人类和小鼠模型上，可能无法完全代表所有COPD患者的复杂情况	探讨COPD小气道中SIgA丢失的原因及其与pIgR表达的关系	人类和小鼠的气道细胞，特别是分泌细胞和纤毛细胞	NA	慢性阻塞性肺疾病	RNA杂交、免疫染色、单细胞RNA测序	NA	RNA	人类和小鼠的气道细胞样本
111	2024-09-23	Single-cell Transcriptomics Reveals Dynamic Role of Smooth Muscle Cells and Enrichment of Immune Cell Subsets in Human Abdominal Aortic Aneurysms 2022-09-01, Annals of surgery IF:7.5Q1 DOI:10.1097/SLA.0000000000005551 PMID:35762613	研究论文	研究通过单细胞转录组学揭示了平滑肌细胞和免疫细胞亚群在人类腹主动脉瘤中的动态作用	首次全面描述了人类腹主动脉瘤组织中的细胞景观，并通过单细胞RNA测序识别了17个代表8种细胞谱系的集群	NA	确定与腹主动脉瘤发展相关的细胞特异性基因表达谱	腹主动脉瘤组织和对照组织中的细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
112	2024-09-23	Diverse stem cells for periodontal tissue formation and regeneration 2022-09, Genesis (New York, N.Y. : 2000) DOI:10.1002/dvg.23495 PMID:35916433	研究论文	本文探讨了牙周组织形成和再生中多种干细胞的作用	利用单细胞RNA测序分析揭示了牙周组织中细胞的异质性和细胞类型特异性标记，以及它们与牙囊中前体细胞的发育关系	NA	揭示牙周组织中间充质祖细胞的基本特性，为未来开发更有效的基于干细胞的牙周组织再生疗法提供新知识	牙周组织中的间充质干细胞（PDLSCs）及其在牙周再生中的作用	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
113	2024-09-23	Distinct cellular dynamics associated with response to CAR-T therapy for refractory B cell lymphoma 2022-09, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-022-01959-0 PMID:36097221	研究论文	研究了CAR-T疗法对难治性B细胞淋巴瘤患者的细胞动力学特征	揭示了不同CAR-T产品在治疗反应中的细胞动力学差异，并发现了CAR-T调节细胞在非应答者中的作用	仅分析了32名患者的样本，可能无法全面代表所有患者的情况	探讨CAR-T疗法在难治性B细胞淋巴瘤患者中的治疗反应机制	32名接受CAR-T治疗的难治性B细胞淋巴瘤患者	数字病理学	淋巴瘤	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	105个治疗前后的外周血单核细胞样本和输注产品
114	2024-09-23	Donor Macrophages Modulate Rejection After Heart Transplantation 2022-08-23, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.121.057400 PMID:35880523	研究论文	研究捐赠者巨噬细胞在心脏移植后调节排斥反应的作用	首次揭示了捐赠者巨噬细胞在心脏移植排斥反应中的关键作用，并提出了通过靶向MYD88信号通路来抑制排斥反应的新疗法	研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探讨捐赠者巨噬细胞在心脏移植后急性细胞排斥反应中的作用	捐赠者和受者的巨噬细胞及其在心脏移植后的功能	NA	NA	单细胞RNA测序、基因敲除、细胞消融	NA	RNA	老鼠模型中的心脏移植样本
115	2024-09-23	Droplet microfluidics for functional temporal analysis and cell recovery on demand using microvalves: application in immunotherapies for cancer 2022-08-23, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d2lc00435f PMID:35904070	研究论文	本文介绍了一种基于微阀的液滴微流控技术，用于实时功能分析和按需细胞回收，并应用于癌症免疫疗法	本文提出了一种自下而上的单细胞分析方法，通过微流控技术实现细胞的功能表型分析和后续的单细胞组学分析	NA	开发一种能够实时监测细胞毒性和空间协调性的微流控设备，并实现按需细胞回收，以应用于癌症免疫疗法	自然杀伤细胞（NK细胞）和肿瘤细胞	数字病理学	癌症	微流控技术	NA	细胞	每个液滴包含一个自然杀伤细胞和一个肿瘤细胞
116	2024-09-23	Overlapping transcriptional programs promote survival and axonal regeneration of injured retinal ganglion cells 2022-08-17, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2022.06.002 PMID:35767994	研究论文	研究分析了三种干预措施对视网膜神经节细胞（RGCs）在视神经挤压（ONC）损伤后生存和轴突再生的转录程序的影响	通过单细胞转录组学分析，揭示了不同干预措施对RGCs生存和再生的基因表达模式，并发现过度表达与再生程序相关的基因可以增强生存和轴突再生	研究中使用的干预措施尚未达到临床应用的有效程度	揭示促进视网膜神经节细胞在损伤后生存和轴突再生的转录途径	视网膜神经节细胞（RGCs）及其在视神经挤压（ONC）损伤后的生存和轴突再生	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	46种视网膜神经节细胞类型
117	2024-09-23	Single-cell transcriptome analysis of regenerating RGCs reveals potent glaucoma neural repair genes 2022-08-17, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2022.06.022 PMID:35952672	研究论文	本文通过单细胞转录组分析，研究了再生视网膜神经节细胞（RGCs）中的青光眼神经修复基因	开发了一种策略，能够特异性地标记和纯化再生RGCs和存活RGCs，并发现了新的再生相关基因Anxa2，其在Pten缺失诱导的轴突再生中具有显著作用	NA	研究青光眼神经修复的潜在基因	再生视网膜神经节细胞（RGCs）和存活RGCs	数字病理学	青光眼	Smart-Seq2单细胞转录组分析	NA	转录组	来自Pten缺失小鼠的再生RGCs和存活RGCs
118	2024-09-23	Data-Rich Spatial Profiling of Cancer Tissue: Astronomy Informs Pathology 2022-08-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3748 PMID:35522154	研究论文	本文探讨了天文学中的大数据分析方法如何应用于癌症组织的空间特征分析，特别是通过多重免疫荧光（mIF）病理图像探索肿瘤微环境的组织结构	提出了AstroPath平台，该平台借鉴天文学的数据分析模式，用于生成和展示肿瘤免疫图谱，支持mIF免疫肿瘤生物标志物的开发	NA	研究天文学中的大数据分析方法如何应用于病理学，特别是肿瘤微环境的空间关系分析	癌症组织的空间关系，特别是肿瘤微环境的组织结构	数字病理学	NA	多重免疫荧光（mIF）	NA	图像	NA
119	2024-09-23	Activation of Tumor-Cell STING Primes NK-Cell Therapy 2022-08-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0017 PMID:35678717	研究论文	研究报告了恶性胸膜间皮瘤细胞中STING的表达及其对STING激动剂的反应，并探讨了STING激动剂与自然杀伤细胞（NK细胞）和嵌合抗原受体NK细胞（CAR-NK细胞）联合治疗的效果	揭示了STING激动剂在人类肿瘤样本中激活先天性和细胞免疫疗法的基本重要性，并支持将STING激动剂与NK和CAR-NK细胞疗法结合进行测试	NA	研究STING激动剂在人类肿瘤中的作用机制，并开发激活有效先天性抗肿瘤免疫的联合疗法	恶性胸膜间皮瘤细胞、STING激动剂、自然杀伤细胞（NK细胞）和嵌合抗原受体NK细胞（CAR-NK细胞）	免疫学	胸膜间皮瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	患者来源的器官型肿瘤球体
120	2024-09-23	Multiplexed LNP-mRNA vaccination against pathogenic coronavirus species 2022-08-02, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111160 PMID:35921835	研究论文	本文开发了针对SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV的多重脂质纳米颗粒（LNP）-mRNA疫苗候选物，并在动物模型中测试了多重LNP-mRNA如何诱导有效的免疫反应	本文首次展示了多重LNP-mRNA疫苗在动物模型中对多种冠状病毒的有效免疫反应，并比较了同时和顺序接种的效果	研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证	开发针对多种冠状病毒的多重疫苗，并优化接种方案	SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV	NA	NA	LNP-mRNA疫苗技术	NA	单细胞RNA测序数据	动物模型