单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1161 - 1180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2024-08-08 |
scCapsNet-mask: an updated version of scCapsNet with extended applicability in functional analysis related to scRNA-seq data
2022-Dec-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-05098-8
PMID:36510124
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研究论文 | 本文介绍了scCapsNet-mask，这是scCapsNet的更新版本，旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的解释性和非标准测试样本处理问题 | scCapsNet-mask通过引入掩码机制，改善了模型的解释性，并能更合理地处理非标准样本 | NA | 开发一种新的深度学习模型，以提高单细胞RNA测序数据分析的解释性和处理非标准样本的能力 | 单细胞RNA测序数据及其在功能分析中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CapsNet | RNA测序数据 | NA |
| 1162 | 2024-08-08 |
Construction and experimental validation of an acetylation-related gene signature to evaluate the recurrence and immunotherapeutic response in early-stage lung adenocarcinoma
2022-Dec-11, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01413-7
PMID:36503492
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研究论文 | 本文构建了一个与乙酰化相关的基因特征，用于评估早期肺腺癌的复发和免疫治疗反应，并通过实验验证了其有效性。 | 首次开发了一个包含RBBP7和YEATS2的乙酰化相关基因特征，用于评估早期肺腺癌的无复发生存率和免疫治疗反应。 | NA | 构建并验证一个乙酰化相关基因特征，以评估早期肺腺癌的复发和免疫治疗效果。 | 早期肺腺癌患者及其免疫治疗反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组测序、基因组差异分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、Lasso回归、单变量Cox回归、多变量Cox回归、基因表达综合数据库检索、单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 23例早期肺腺癌样本，以及来自癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的多个独立数据集 |
| 1163 | 2024-08-08 |
Isolation of TTF-1 Positive Circulating Tumor Cells for Single-Cell Sequencing by Using an Automatic Platform Based on Microfluidic Devices
2022-Dec-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232315139
PMID:36499466
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研究论文 | 本研究开发了一种基于微流控设备的自动化平台，用于分离TTF-1阳性循环肿瘤细胞（CTC）进行单细胞测序 | 本研究整合了自动CTC富集和染色机、AI辅助的自动CTC扫描和识别系统以及自动细胞挑选机，实现了对目标CTC的精确识别和分离 | NA | 研究目的是开发一种精确有效的CTC分离方法，以便进行下游的单细胞测序分析 | 研究对象包括来自三位癌症患者（两位患有肺癌，一位同时患有肺癌和甲状腺癌）的外周血中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | AI辅助系统 | 细胞 | 三位癌症患者的外周血样本 |
| 1164 | 2024-08-08 |
Comprehensive multi-omics analysis of the m7G in pan-cancer from the perspective of predictive, preventive, and personalized medicine
2022-Dec, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-022-00305-1
PMID:36505892
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，探讨了m7G在泛癌中的作用，并评估了其在预测、预防和个性化医学中的应用潜力 | 首次探索了m7G在泛癌中的作用，并将其作为预测临床结果和免疫治疗效果的创新标志物 | NA | 旨在通过泛癌分析m7G，探索其潜在机制，并促进预测、预防和个性化医学的发展 | m7G与肿瘤免疫的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | XGBoost和随机森林 | 基因表达、遗传变异、临床信息、甲基化和数字病理切片 | 33种癌症类型 |
| 1165 | 2024-08-08 |
Primate gastrulation and early organogenesis at single-cell resolution
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05526-y
PMID:36517595
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研究论文 | 本文通过收集六个阶段8-11的食蟹猴胚胎，进行了56,636个单细胞的深度转录组分析，揭示了灵长类动物原肠形成和早期器官发生的主要细胞类型的转录组特征 | 首次提供了灵长类动物原肠形成和早期器官发生的全面单细胞转录组图谱，填补了该领域的知识空白 | NA | 旨在填补非人灵长类动物从原肠形成到早期器官发生阶段的体内数据空白，并提供对人类胚胎发育和发育障碍的理解 | 食蟹猴胚胎的单细胞转录组 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 六个食蟹猴胚胎，共56,636个单细胞 |
| 1166 | 2024-08-08 |
Preconditioning of the immune system modulates the response of papillary thyroid cancer to immune checkpoint inhibitors
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005538
PMID:36521928
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统预处理对甲状腺乳头状癌（PTC）对免疫检查点抑制剂（ICIs）反应的影响 | 首次揭示了免疫系统预处理对PTC对ICIs反应的影响，并展示了不同ICIs对甲状腺免疫细胞浸润的具体和共享效应 | 研究仅限于小鼠模型，结果需要进一步在人类患者中验证 | 测试免疫系统预处理是否调节ICIs的治疗效果 | 甲状腺乳头状癌（PTC）和碘加剧的甲状腺炎（IET） | NA | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 122只小鼠 |
| 1167 | 2024-08-08 |
Comprehensive Transcriptomic Analysis of VISTA in Acute Myeloid Leukemia: Insights into Its Prognostic Value
2022-Nov-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314885
PMID:36499220
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研究论文 | 研究探讨了VISTA在急性髓系白血病中的转录组表达及其对预后的影响 | 首次详细分析了VISTA在急性髓系白血病中的表达模式及其与疾病复发和治疗抵抗的关系 | 研究主要基于公开的骨髓样本数据，可能存在样本选择偏倚 | 探索VISTA作为免疫检查点调节因子在急性髓系白血病患者中产生免疫逃逸环境的作用 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病细胞系 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 批量和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量健康个体和急性髓系白血病患者的骨髓样本 |
| 1168 | 2024-08-08 |
Retraction notice to "Parallel bimodal single-cell sequencing of transcriptome and methylome provides molecular and translational insights on oocyte maturation and maternal aging" [Genomics, 114/3 (2022) 110379]
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110541
PMID:36528977
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1169 | 2024-08-08 |
Deciphering the immuno-pathological role of FLT, and evaluation of a novel dual inhibitor of topoisomerases and mutant-FLT3 for treating leukemia
2022, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:36504887
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研究论文 | 本研究利用AML患者的bulk和单细胞RNA测序数据，探讨FLT3基因变异对AML患者T细胞表型和免疫反应的临床意义，并评估新型小分子化合物Lwk-n019作为双靶点抑制剂的抗癌潜力 | 本研究首次评估了Lwk-n019作为双靶点抑制剂，同时抑制拓扑异构酶和突变型FLT3，具有高选择性和强效的抗癌活性 | 研究尚未完全阐明Lwk-n019的全部治疗特性和FLT3在拓扑异构酶抑制中的详细机制 | 探讨FLT3在AML中的免疫病理作用，并评估新型双靶点抑制剂Lwk-n019的治疗潜力 | 急性髓系白血病（AML）患者及其FLT3基因变异 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | RNA | AML患者的bulk和单细胞RNA测序数据 |
| 1170 | 2024-08-08 |
Dysfunctional intercellular communication and metabolic signaling pathways in thin endometrium
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.1050690
PMID:36505055
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和批量测序数据，对薄型子宫内膜的细胞类型和信号通路进行了综合分析 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了薄型子宫内膜中细胞间通信和代谢信号通路的异常 | NA | 探讨薄型子宫内膜的细胞和分子机制，为治疗提供新策略 | 薄型子宫内膜的细胞类型和信号通路 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四组单细胞RNA测序数据和一组批量测序数据 |
| 1171 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals that Jinwu Gutong capsule attenuates the inflammatory activity of synovial cells in osteoarthritis by inhibiting AKR1C3
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.1031996
PMID:36505054
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研究论文 | 研究揭示金乌骨通胶囊通过抑制AKR1C3减轻骨关节炎中滑膜细胞的炎症活性 | 通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了金乌骨通胶囊对骨关节炎滑膜炎的治疗机制，特别是通过抑制AKR1C3表达 | NA | 阐明金乌骨通胶囊治疗骨关节炎滑膜炎的精确机制 | 骨关节炎中的滑膜细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1172 | 2024-08-08 |
Applications of single-cell RNA sequencing in atopic dermatitis and psoriasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1038744
PMID:36505405
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在特应性皮炎和银屑病中的应用及其最新进展 | scRNA-seq技术的发展提高了对组织中细胞生物多样性的理解，发现了新的细胞亚群，并有助于分析免疫细胞分布和细胞间通讯 | 当前scRNA-seq技术存在一些局限性和技术问题 | 探讨scRNA-seq技术在特应性皮炎和银屑病中的最新发现及未来趋势 | 特应性皮炎和银屑病中的细胞亚群及其在疾病反应中的作用 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1173 | 2024-08-08 |
Cell atlas of the immune microenvironment in gastrointestinal cancers: Dendritic cells and beyond
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1007823
PMID:36505406
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胃肠道癌症免疫微环境中树突状细胞分类和发展轨迹的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胃肠道癌症肿瘤和微环境的异质性 | NA | 总结胃肠道癌症中单细胞水平树突状细胞的分类和发展轨迹，并探讨其与T细胞的相互作用及其对免疫治疗反应的影响 | 胃肠道癌症中的树突状细胞及其与T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | NA |
| 1174 | 2024-08-08 |
Caspase-8 activation in neutrophils facilitates autoimmune kidney vasculitis through regulating CD4+ effector memory T cells
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1038134
PMID:36505410
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研究论文 | 本研究通过整合和分析单细胞转录组数据集，发现中性粒细胞中的caspase-8相关通路在肾脏中高度激活，并通过构建中性粒细胞特异性caspase-8敲除小鼠模型，验证了caspase-8在中性粒细胞中对AAVs进展的作用。 | 本研究首次揭示了中性粒细胞中caspase-8激活通过调节炎症和免疫反应，加剧AAVs的肾小球肾炎。 | NA | 探讨中性粒细胞中caspase-8激活在自身免疫性肾血管炎中的作用及其机制。 | 中性粒细胞中的caspase-8激活及其对AAVs进展的影响。 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 中性粒细胞特异性caspase-8敲除小鼠模型结合AAVs模型 |
| 1175 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in bone marrow delineates CD56dimGranzymeK+ subset as intermediate stage in NK cell differentiation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1044398
PMID:36505452
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，结合寡核苷酸偶联抗体，分析了新鲜骨髓NK细胞，揭示了CD56dimGranzymeK+子集作为NK细胞分化中间阶段的作用 | 首次通过单细胞转录组学技术揭示了CD56dimGranzymeK+子集作为NK细胞分化中间阶段的新发现 | 研究未能在骨髓中发现CD34前体细胞与NK细胞之间的发育联系，暗示骨髓中可能缺乏早期NK细胞阶段 | 探究人类NK细胞在淋巴组织中的功能和发育关系 | 人类NK细胞及其在骨髓中的分化过程 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 新鲜骨髓NK细胞 |
| 1176 | 2024-08-08 |
Development of a polyamine gene expression score for predicting prognosis and treatment response in clear cell renal cell carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1048204
PMID:36505496
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研究论文 | 本研究旨在揭示多胺代谢相关基因（PMRGs）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的表达与预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 开发了多胺基因表达评分（PGES），用于准确预测患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 揭示多胺代谢相关基因在透明细胞肾细胞癌中的表达与预后价值及其与肿瘤微环境的关联 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的多胺代谢相关基因表达 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序分析 | Lasso回归分析 | 基因表达数据 | 777名ccRCC患者 |
| 1177 | 2024-08-08 |
Identification of two robust subclasses of sepsis with both prognostic and therapeutic values based on machine learning analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040286
PMID:36505503
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研究论文 | 本研究基于机器学习分析，识别出两种具有预后和治疗价值的脓毒症亚型 | 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和K均值聚类分析，成功分类出两种脓毒症亚型，并验证了其临床相关性 | NA | 开发优化的脓毒症分类方法，以促进个性化治疗和临床结果预测 | 1936名患者（脓毒症样本1692例，正常样本244例）的数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），K均值聚类分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | K均值聚类 | 基因表达数据 | 1936名患者 |
| 1178 | 2024-08-08 |
A machine learning framework for scRNA-seq UMI threshold optimization and accurate classification of cell types
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.982019
PMID:36506328
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研究论文 | 本文开发了一种机器学习框架，用于优化scRNA-seq UMI阈值并准确分类细胞类型 | 提出了一种新的机器学习框架，能够系统地评估最低UMI阈值，并准确分类细胞，提高了细胞回收率 | NA | 解决scRNA-seq技术中由于UMI阈值设置过高导致的细胞丢失问题 | scRNA-seq数据中的细胞类型分类 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 机器学习框架 | scRNA-seq数据 | 乳腺癌患者数据集及两个外部数据集 |
| 1179 | 2024-08-08 |
Mechanism of action of paclitaxel for treating glioblastoma based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1076958
PMID:36506527
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据和网络药理学方法研究紫杉醇治疗胶质母细胞瘤的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和网络药理学分析紫杉醇对胶质母细胞瘤的作用机制 | NA | 探究紫杉醇治疗胶质母细胞瘤的生物活性、机制及癌细胞杀伤效应 | 紫杉醇的作用机制及其对胶质母细胞瘤的影响 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24个细胞簇 |
| 1180 | 2024-08-08 |
IL-33 induces NF-κB activation in ILC2 that can be suppressed by in vivo and ex vivo 17β-estradiol
2022, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2022.1062412
PMID:36506643
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研究论文 | 研究IL-33诱导的ILC2中NF-κB活化及其被17β-雌二醇抑制的机制 | 首次揭示了雌激素对ILC2的抑制作用及其在过敏性疾病治疗中的潜在价值 | 研究主要集中在动物模型上，需要进一步的人体研究验证 | 探讨卵巢激素波动对哮喘疾病进展和症状加重的机制 | ILC2细胞和NF-κB信号通路 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了雌性和雄性BALB/c小鼠以及卵巢切除的雌性小鼠 |