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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2024-08-08 |
Assessment of Fibrinogen-like 2 (FGL2) in Human Chronic Kidney Disease through Transcriptomics Data Analysis
2022-12-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010089
PMID:36671474
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研究论文 | 本研究通过转录组数据分析评估了纤维蛋白原样蛋白2(FGL2)在人类慢性肾脏疾病(CKD)中的表达及其与疾病结果的关联 | 首次在人类CKD中评估FGL2的表达,并探讨了其与肾脏纤维化和疾病进展的关系 | 研究主要基于转录组数据和免疫组织化学分析,可能需要进一步的体内实验验证 | 评估FGL2在人类CKD中的表达及其与疾病结果的关联 | FGL2在CKD患者肾脏中的表达及其与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个独立的CKD队列(NEPTUNE和Innsbruck CKD队列)以及13个人类CKD转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1162 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Molecular Characterization of the Immune Microenvironment in Acute Pancreatitis
2022-12-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010078
PMID:36671463
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研究论文 | 本研究首次整合单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序(Bulk RNA-Seq)数据,揭示了急性胰腺炎(AP)中免疫微环境的分子特征 | 首次使用scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq数据展示AP中免疫细胞浸润的特征,并探索不同细胞类型的特定分子标记 | NA | 揭示急性胰腺炎中免疫微环境的分子特征和细胞间相互作用网络 | 急性胰腺炎中的免疫细胞浸润和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),批量RNA测序(Bulk RNA-Seq) | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1163 | 2024-08-08 |
GAGAM v1.2: An Improvement on Peak Labeling and Genomic Annotated Gene Activity Matrix Construction
2022-12-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14010115
PMID:36672856
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研究论文 | 本文介绍了GAGAM v1.2,一个改进版的基因组注释基因活性矩阵,旨在通过功能注释将峰值与基因关联,提高单细胞ATAC-seq数据的可解释性和信息量。 | 提出了一种改进的基因组注释基因活性矩阵(GAGAM)概念,通过标记峰值并将其与基因通过全基因组功能注释关联,使得不同数据集可比较,并能关联基因的可访问性和表达。 | NA | 改进基因活性矩阵的概念,使其能更好地处理和解释单细胞ATAC-seq数据,并能与单细胞RNA测序数据进行比较。 | 单细胞ATAC-seq数据的可解释性和信息量,以及与单细胞RNA测序数据的比较。 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 基因活性矩阵(GAM) | 基因组数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1164 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of H5N1-HA-Stimulated Alpaca PBMCs
2022-12-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010060
PMID:36671445
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了H5N1病毒HA抗原刺激下的羊驼外周血单个核细胞的免疫反应 | 首次在单细胞水平上研究了羊驼外周血单个核细胞对H5N1病毒HA抗原的特异性免疫动态 | NA | 旨在了解羊驼对抗病毒的免疫系统,并促进在骆驼科动物中开发更有效的疫苗和抗体 | 羊驼外周血单个核细胞在H5N1病毒HA抗原刺激下的免疫反应 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞测序技术(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 一个羊驼的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1165 | 2024-08-08 |
Application of Single-Cell RNA Sequencing in Ovarian Development
2022-12-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010047
PMID:36671432
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在卵巢发育中的应用 | scRNA-seq技术在分析复杂组织中的单个细胞、分类细胞类型、表征单细胞、描绘细胞发育轨迹以及研究细胞间相互作用方面具有显著优势 | NA | 提高对卵巢细胞特征和发育的理解,从而识别卵巢相关疾病的新治疗靶点 | 卵巢中的不同细胞亚群及其发育过程和细胞间通信 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1166 | 2024-08-08 |
Development and validation of a prognostic model and gene co-expression networks for breast carcinoma based on scRNA-seq and bulk-seq data
2022-Dec, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-5684
PMID:36660733
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研究论文 | 本文开发并验证了一种基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量测序数据的前列腺癌预后模型和基因共表达网络 | 利用scRNA-seq技术研究复杂肿瘤微环境中的细胞变化,构建了单细胞分辨率的基因共表达网络,并开发了一个可靠的预测模型 | NA | 研究前列腺癌进展中的转录组学和基因共表达网络,并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 前列腺癌的恶性上皮细胞和基因共表达网络 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox | 基因表达数据 | 58个样本的scRNA-seq数据,超过300个已发表的转录组学数据集和31个CRISPR筛选数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1167 | 2024-08-08 |
Construction of a three commitment points for S phase entry cell cycle model and immune-related ceRNA network to explore novel therapeutic options for psoriasis
2022-09-15, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022630
PMID:36654055
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研究论文 | 本文构建了S期进入细胞周期的三个承诺点(CP1-3)模型和免疫相关的ceRNA网络,以探索银屑病的新治疗方案 | 首次探索了ceRNA调控机制在银屑病中角质形成细胞与免疫系统相互作用中的作用,并基于ceRNA网络筛选潜在的治疗药物 | NA | 探索银屑病中角质形成细胞增殖和分化的机制及ceRNA网络在其中的作用,并寻找新的治疗药物 | 银屑病中的角质形成细胞和免疫系统 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,分子对接 | NA | 基因表达数据 | 基于银屑病皮肤活检的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1168 | 2024-08-08 |
A novel cuproptosis-related lncRNA prognostic signature for predicting treatment and immune environment of head and neck squamous cell carcinoma
2022-08-19, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022564
PMID:36653989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索了头颈鳞状细胞癌(HNSCC)肿瘤微环境中铜死亡相关基因的表达,并构建了一个基于铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后模型 | 首次探索了铜死亡在HNSCC中的应用,并构建了一个新的铜死亡相关lncRNA预后模型 | NA | 研究铜死亡在头颈鳞状细胞癌治疗和免疫环境预测中的作用 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同风险评分的HNSCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1169 | 2024-08-08 |
A pan-cancer and single-cell sequencing analysis of CD161, a promising onco-immunological biomarker in tumor microenvironment and immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040289
PMID:36660546
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研究论文 | 本研究通过泛癌和单细胞测序分析,探讨了CD161作为肿瘤微环境和免疫治疗中的有前景的肿瘤免疫生物标志物的角色。 | 首次通过单细胞测序分析了CD161在多种肿瘤类型中的表达模式,并揭示了其在肿瘤进展和T细胞免疫中的关键作用。 | 研究主要集中在CD161的表达和功能分析,未涉及其在临床治疗中的具体应用效果。 | 探讨CD161在肿瘤微环境和免疫治疗中的作用,评估其作为肿瘤免疫治疗靶点的潜力。 | CD161在多种癌症中的表达、突变图谱、CNVs和SNVs变异、通路富集、药物敏感性以及与T细胞和巨噬细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 涉及多种肿瘤类型的癌细胞和T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1170 | 2024-08-08 |
Integrative multi-omic analysis of radiation-induced skin injury reveals the alteration of fatty acid metabolism in early response of ionizing radiation
2022-Dec, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.01.001
PMID:36639278
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析,探讨了电离辐射诱导的皮肤损伤早期反应中的分子事件及其机制 | 首次揭示了电离辐射早期反应中皮肤脂肪酸代谢的改变,并详细研究了ACADVL在脂肪酸代谢中的重要作用 | NA | 研究电离辐射对皮肤组织的早期分子反应及其机制 | 小鼠、大鼠的皮肤组织以及人类角质形成细胞和皮肤成纤维细胞 | 代谢组学 | 辐射损伤 | 液相色谱-质谱联用(LC-MS)、mRNA测序(mRNA-Seq)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 代谢物、基因表达数据 | 涉及小鼠、大鼠、猴子以及人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1171 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics and network pharmacology reveal therapeutic targets of Jianpi Yiqi Bugan Yishen decoction in immune cell subsets of children with myasthenia gravis
2022-Dec, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-22-593
PMID:36643680
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和网络药理学方法,揭示了健脾益气补肝益肾汤在治疗儿童重症肌无力中的作用机制及其活性成分和潜在治疗靶点 | 本研究首次结合单细胞转录组学和网络药理学方法,探讨了健脾益气补肝益肾汤在儿童重症肌无力治疗中的作用机制和潜在靶点 | NA | 探索健脾益气补肝益肾汤治疗儿童重症肌无力的作用机制,并评估其活性成分和潜在治疗靶点 | 儿童重症肌无力的免疫细胞亚群及健脾益气补肝益肾汤的作用机制 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 20只Lewis大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1172 | 2024-08-08 |
Correlation between oncogene integrator complex subunit 7 and a poor prognosis in lung adenocarcinoma
2022-Dec, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-22-1533
PMID:36647477
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research paper | 研究整合子复合体亚单位7(INTS7)在肺腺癌(LUAD)中的临床意义及其对细胞行为的影响 | 首次探讨了INTS7在肺腺癌中的表达与患者预后的关系,并验证了INTS7作为治疗靶点和预后标志物的潜力 | 研究主要基于公开数据集和细胞实验,未来需要更多临床样本验证 | 探讨INTS7在肺腺癌中的临床意义及其对细胞行为的影响 | 肺腺癌组织、细胞系及患者预后 | digital pathology | lung cancer | 单细胞测序 | NA | RNA | 包括33种癌症类型的数据集及肺腺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 1173 | 2024-08-08 |
Tumor-infiltrating lymphocyte: features and prognosis of lymphocytes infiltration on colorectal cancer
2022-06, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2162660
PMID:36633318
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研究论文 | 本研究旨在探讨结直肠癌中肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的特征及其对预后的影响 | 首次综合多个队列数据库,详细描述了TILs在结直肠癌中的特征、比例及预后价值 | NA | 研究TILs在结直肠癌中的特征及其对预后的影响 | 结直肠癌中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及四个基因表达综合系列(GSE)的结直肠癌队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1174 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals diversity of Müller cells with different metabolic-mitochondrial signatures in normal and degenerated macula
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.1079498
PMID:36620436
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研究论文 | 本研究通过整合早期年龄相关性黄斑变性(AMD)患者和健康捐赠者的单细胞转录组数据,揭示了具有不同代谢-线粒体特征的穆勒细胞亚群 | 本研究首次展示了早期AMD中穆勒细胞亚群的变化主要是亚群丰度的改变,而非新亚群的产生,并通过转录因子富集分析强调了代谢-线粒体状态的关键调节因子 | NA | 揭示早期年龄相关性黄斑变性中穆勒细胞的新特征及其与视网膜神经胶质化的关联 | 穆勒细胞在正常和退化黄斑中的多样性及其代谢-线粒体特征 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 早期AMD患者和健康捐赠者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1175 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq identifies factors necessary for the regenerative phenotype of prostate luminal epithelial progenitors
2022, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
PMID:36636696
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,确认了激素完整和去势小鼠前列腺中管腔前体细胞群的身份,并识别了维持前列腺器官样再生表型所需的因素。 | 首次使用单细胞RNA测序技术确认前列腺管腔前体细胞群的身份,并识别了维持其再生表型所需的关键因素。 | 研究主要集中在小鼠和人类的前列腺器官样上,未来需进一步验证这些因素在体内环境中的作用。 | 定义正常的前列腺前体细胞表型,并发现可能导致可药物化靶点的因果网络,以对抗前列腺增生疾病。 | 前列腺管腔上皮前体细胞及其再生表型。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括激素完整和去势的小鼠前列腺及人类前列腺器官样。 | NA | NA | NA | NA |
| 1176 | 2024-08-08 |
The Enrichment of Specific Hair Follicle-Associated Cell Populations in Plucked Hairs Offers an Opportunity to Study Gene Expression Underlying Hair Traits
2022-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24010561
PMID:36614000
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研究论文 | 本研究通过比较马的拔毛和皮肤活检样本的RNA-seq结果,探讨了不同样本收集方法对特定细胞群基因表达的影响 | 首次比较了非侵入性的拔毛和侵入性的皮肤活检样本收集方法在细胞类型富集方面的差异 | NA | 探讨不同样本收集方法对特定细胞群基因表达的影响 | 马的拔毛和皮肤活检样本 | 基因表达研究 | NA | RNA-seq | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1177 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils the Dedifferentiation Mechanism of Lung Adenocarcinoma Stem Cells
2022-Dec-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24010482
PMID:36613925
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了肺腺癌干细胞的去分化机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术探索肺腺癌干细胞的转录组特征,并识别出与去分化相关的关键转录因子和特定标记物 | 研究仅基于PC-9细胞系,可能需要进一步在更多样品中验证结果 | 揭示肺腺癌干细胞的特性及其分子机制,为开发新的治疗策略提供见解 | 肺腺癌干细胞(LCSCs)及其去分化机制 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 7320个肺腺癌干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1178 | 2024-08-08 |
Deciphering Tumour Microenvironment of Liver Cancer through Deconvolution of Bulk RNA-Seq Data with Single-Cell Atlas
2022-Dec-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15010153
PMID:36612149
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研究论文 | 本研究通过使用单细胞RNA测序图谱对批量RNA测序数据进行反卷积,解析了肝癌的肿瘤微环境 | 利用反卷积算法处理批量RNA测序数据,减少了对单细胞RNA测序数据集的需求,从而降低了成本 | NA | 旨在理解肝癌的肿瘤微环境,为精准治疗提供依据 | 肝癌的肿瘤微环境及其细胞组成 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Cibersortx | RNA测序数据 | 使用了八个RNA测序和一个微阵列数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1179 | 2024-08-08 |
SPOC domain-containing protein 1 regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cells through adenylate kinase 4
2022-Dec-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v14.i12.822
PMID:36619695
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research paper | 研究SPOC域包含蛋白1(SPOCD1)在人类精原干细胞(SSCs)增殖和凋亡中的作用及机制 | 首次揭示了SPOCD1通过调控腺苷酸激酶4(AK4)影响人类精原干细胞的增殖和凋亡 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要进一步的体内实验验证 | 探讨SPOCD1在人类精原干细胞增殖中的作用及其机制 | 人类精原干细胞(SSCs) | NA | male infertility | single-cell RNA sequencing (RNA-seq) | NA | RNA-seq data | 涉及非阻塞性无精症(NOA)患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1180 | 2024-08-08 |
Human Placental Endothelial Cell and Trophoblast Heterogeneity and Differentiation Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2022-12-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12010087
PMID:36611882
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了人类胎盘中内皮细胞和滋养层细胞的异质性和分化 | 本研究首次提供了妊娠6至16周人类胎盘的高分辨率分子图谱,揭示了胎盘细胞的复杂性及其在早期妊娠中的转录网络和信号传导 | NA | 深入理解胎盘行为并改善妊娠结局 | 人类胎盘中的内皮细胞和滋养层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自11名正常妊娠患者的胎盘绒毛组织 | NA | NA | NA | NA |