单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-08 |
Aberrant metabolic processes promote the immunosuppressive microenvironment in multiple myeloma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1077768
PMID:36532059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性骨髓瘤骨髓中免疫细胞的动态特征，并探讨了异常代谢过程对免疫抑制微环境的影响。 | 发现异常代谢过程与多发性骨髓瘤患者免疫抑制微环境的关联，并提出PIM激酶作为潜在的免疫治疗策略。 | NA | 探讨多发性骨髓瘤中免疫细胞功能障碍的分子机制及其与异常代谢过程的关系。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫细胞及其代谢特征。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1142 | 2024-08-08 |
SFRP4+IGFBP5hi NKT cells induced neural-like cell differentiation to contribute to adenomyosis pain
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.945504
PMID:36532077
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本，发现SFRP4+NKT细胞和大量未分化的多能干细胞在疼痛组中，并揭示了SFRP4+NKT细胞中IGFBP5高表达促进多能干细胞向神经样细胞分化的机制。 | 首次发现SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞能够促进多能干细胞向神经样细胞分化，从而参与子宫内膜异位症疼痛的发生。 | NA | 探讨SFRP4+IGFBP5hi NKT细胞在子宫内膜异位症疼痛中的作用及其机制。 | 子宫内膜异位症患者的组织细胞样本。 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 有痛和无痛的子宫内膜异位症组织细胞样本 |
| 1143 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the Müller subtypes and inner blood-retinal barrier regulatory network in early diabetic retinopathy
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1048634
PMID:36533134
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠视网膜中的35,910个细胞，重点关注糖尿病视网膜病变中构成大鼠血视网膜屏障的主要细胞的退化以及Müller细胞的两个亚群的新定义。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的Müller亚型及其调控网络。 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 阐明糖尿病视网膜病变早期血视网膜屏障的细胞退化及其调控关系。 | 健康和糖尿病大鼠视网膜中的细胞。 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 35,910个细胞 |
| 1144 | 2024-08-08 |
State-of-the-art analytical methods of viral infections in human lung organoids
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0276115
PMID:36538516
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研究论文 | 本文提供了一套详细的实验操作指南，用于研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染过程及其影响 | 本文介绍了多种先进的分析方法，包括蛋白质提取、RNA提取、单细胞RNA测序等，以评估病毒感染的影响和宿主因子的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2在人肺泡样类器官中的感染特性和宿主反应 | 人肺泡样类器官和SARS-CoV-2病毒 | 数字病理学 | COVID-19 | qPCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交 | NA | 蛋白质, RNA, 细胞 | 基于不同供体的人肺泡样类器官 |
| 1145 | 2024-08-08 |
Sci-Seq of Human Fetal Salivary Tissue Introduces Human Transcriptional Paradigms and a Novel Cell Population
2022, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2022.887057
PMID:36540608
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研究论文 | 本研究通过分析人类胎儿唾液腺的单细胞测序数据，识别了发育分支点、新型干细胞样群体及关键信号通路 | 发现了先前未描述的来源于SD并表达高水平干细胞样功能基因的干细胞样细胞群体 | NA | 探索人类唾液腺发育的新型人类特异性发育范式，并为开发转化性人类疗法奠定基础 | 人类胎儿唾液腺的发育及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1146 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals cell type-specific immune regulation associated with anti-NMDA receptor encephalitis in humans
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1075675
PMID:36544777
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控机制 | 首次通过单细胞转录组测序技术，详细描述了抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的转录特征和免疫反应 | NA | 探究抗NMDA受体脑炎患者外周免疫细胞的特异性免疫调控机制 | 抗NMDA受体脑炎患者和健康个体的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 129,217个细胞 |
| 1147 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of WGCNA and machine learning identified diagnostic biomarkers in dilated cardiomyopathy with heart failure
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1089915
PMID:36544902
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研究论文 | 本研究通过综合分析WGCNA和机器学习方法，识别出扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法结合，从多个基因表达数据集中识别出与扩张型心肌病合并心力衰竭高度相关的驱动基因，并构建了有效的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库中的基因表达数据，未涉及临床样本的直接验证 | 探索扩张型心肌病合并心力衰竭的特定诊断生物标志物及其机制 | 扩张型心肌病合并心力衰竭的诊断生物标志物和发病机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | WGCNA, 单细胞RNA测序 | 随机森林, 梯度提升机, 神经网络, 极限梯度提升, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 训练组包括GSE29819和GSE21610数据集，测试组为GSE17800数据集，单细胞RNA测序数据为GSE95140 |
| 1148 | 2024-08-08 |
Global Characteristics and Dynamics of Single Immune Cells After Myocardial Infarction
2022-12-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.122.027228
PMID:36515244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了心肌梗死后小鼠心脏中CD45阳性免疫细胞的异质性和动态变化 | 首次揭示了心肌梗死后免疫细胞亚群的复杂转录谱、通路、细胞相互作用网络及转录调控因子，并发现Fos/AP-1调控网络在炎症反应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探究心肌梗死后免疫细胞的异质性和动态变化，并寻找潜在的治疗干预靶点 | 小鼠心脏中的CD45阳性免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 30,135个CD45免疫细胞 |
| 1149 | 2024-08-08 |
Construction and experimental validation of a B cell senescence-related gene signature to evaluate prognosis and immunotherapeutic sensitivity in bladder cancer
2022-Dec-17, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-022-00936-7
PMID:36527532
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个与B细胞衰老相关的基因特征，用于评估膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了一个B细胞衰老相关基因特征，用于评估膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性，并通过多个大型队列验证了其可靠性和稳健性 | NA | 阐明B细胞衰老相关基因在膀胱癌中的预后价值 | B细胞衰老相关基因在膀胱癌中的预后和免疫治疗敏感性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 训练数据集来自癌症基因组图谱膀胱癌队列，验证数据集包括来自GEO的三个队列、35个临床样本和体外细胞实验 |
| 1150 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing and lineage tracing confirm mesenchyme to epithelial transformation (MET) contributes to repair of the endometrium at menstruation
2022-Dec-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77663
PMID:36524724
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研究论文 | 本研究使用小鼠模型和三种转基因小鼠系，通过单细胞RNA测序技术，探讨了子宫内膜修复过程中上皮细胞是否源自子宫内膜间质中的间充质细胞类型 | 首次发现了一群对损伤有响应的、可塑性强的子宫内膜间质成纤维细胞，这些细胞在子宫内膜修复过程中有助于快速恢复完整的上皮层 | NA | 验证间充质到上皮转化（MET）在子宫内膜月经修复中的作用 | 子宫内膜修复过程中的间充质细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种转基因小鼠系 |
| 1151 | 2024-08-08 |
Loss of Y in leukocytes as a risk factor for critical COVID-19 in men
2022-12-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01144-5
PMID:36514076
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研究论文 | 本研究探讨了染色体Y丢失（LOY）在男性COVID-19重症风险中的作用，通过分析公开的单细胞RNA测序数据和来自重症监护室（ICU）的COVID-19患者的血液样本，发现LOY与COVID-19的严重程度和死亡率相关。 | 首次揭示了LOY与急性、危及生命的传染病之间的联系，并强调了LOY作为影响骨髓细胞系的最显著克隆突变。 | NA | 探讨染色体Y丢失（LOY）在男性COVID-19重症风险中的作用。 | LOY在COVID-19重症男性患者中的分布及其与疾病严重程度的关系。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 211名在重症监护室（ICU）接受治疗的COVID-19患者 |
| 1152 | 2024-08-08 |
TATTOO-seq delineates spatial and cell type-specific regulatory programs in the developing limb
2022-Dec-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add0695
PMID:36516250
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研究论文 | 本文开发并应用了一种无偏的空间分辨单细胞转录组学方法，以识别在鼠肢体发育过程中特化细胞类型出现及其空间整合的遗传程序 | 本文创新性地使用了一种无偏的空间分辨单细胞转录组学方法，揭示了细胞类型特异性和空间位置相关的转录因子表达模式 | NA | 研究胚胎发育中细胞分化和空间组织的遗传调控机制 | 鼠肢体发育中的细胞类型和空间组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1153 | 2024-08-08 |
A multiple sclerosis-protective coding variant reveals an essential role for HDAC7 in regulatory T cells
2022-12-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl3651
PMID:36516268
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研究论文 | 本文研究了一种保护性的组蛋白去乙酰化酶7（HDAC7）变异体在调节性T细胞中的作用，并探讨了其在多发性硬化症（MS）中的潜在保护机制。 | 首次揭示了HDAC7在调节性T细胞中的关键作用，并通过体内外模型验证了其对多发性硬化症的保护作用。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨HDAC7变异体在多发性硬化症中的保护作用及其机制。 | HDAC7变异体在调节性T细胞中的功能及其对多发性硬化症的影响。 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和体外功能 assay 的细胞样本 |
| 1154 | 2024-08-08 |
A pan-cancer analysis of the FAT1 in human tumors
2022-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26008-1
PMID:36517565
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研究论文 | 本研究探讨了FAT1在33种肿瘤中的潜在致癌作用，基于The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omibus数据集 | 首次进行了FAT1在多种癌症中的泛癌研究，提供了对FAT1致癌作用的全面理解 | NA | 探索FAT1在多种肿瘤中的致癌作用 | FAT1基因在33种肿瘤中的表达及其与肿瘤预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤样本 |
| 1155 | 2024-08-08 |
Locally organised and activated Fth1hi neutrophils aggravate inflammation of acute lung injury in an IL-10-dependent manner
2022-12-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35492-y
PMID:36513690
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了脂多糖诱导的小鼠急性肺损伤肺部中两种转录和功能异质性的中性粒细胞群体，并探讨了它们在急性肺损伤中的作用 | 首次揭示了急性肺损伤中肺部中性粒细胞的表型异质性，并发现了Fth1 Neu亚型在炎症反应中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证结果 | 探讨急性肺损伤中中性粒细胞的表型异质性及其在疾病发展中的作用 | 急性肺损伤中的中性粒细胞 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肺部组织样本 |
| 1156 | 2024-08-08 |
Single-cell microglial transcriptomics during demyelination defines a microglial state required for lytic carcass clearance
2022-12-13, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00584-2
PMID:36514132
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了在脱髓鞘过程中小胶质细胞的转录组变化，并探讨了小胶质细胞在清除溶解的细胞残骸中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了在脱髓鞘过程中小胶质细胞的特定转录组状态，并证明了小胶质细胞在清除溶解的细胞残骸中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果。 | 探讨小胶质细胞在脱髓鞘过程中的响应和调控机制。 | 小胶质细胞在脱髓鞘过程中的转录组变化及其在清除细胞残骸中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了基因命运图谱的小胶质细胞样本 |
| 1157 | 2024-08-08 |
The dynamic dysregulated network identifies stage-specific markers during lung adenocarcinoma malignant progression and metastasis
2022-Dec-13, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2022.11.019
PMID:36514354
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研究论文 | 本研究通过全面的单细胞转录组分析，揭示了肺腺癌（LUAD）进展过程中不同阶段的细胞组成异质性，并识别了与LUAD进展和转移相关的阶段特异性风险基因。 | 本研究构建了早期进展和转移失调网络，并揭示了LUAD进展过程中基因调控的动态变化，识别了不同阶段的预后标记基因。 | NA | 旨在深入理解肺腺癌进展和脑转移的分子机制。 | 肺腺癌（LUAD）的进展和脑转移。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自正常、早期阶段、晚期阶段和脑转移LUAD的数据 |
| 1158 | 2024-08-08 |
Mucosal exposure to non-tuberculous mycobacteria elicits B cell-mediated immunity against pulmonary tuberculosis
2022-12-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111783
PMID:36516760
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研究论文 | 研究探讨了非结核分枝杆菌（NTM）黏膜暴露对肺结核免疫保护的影响，特别是在BCG疫苗接种和持续NTM暴露的小鼠模型中。 | 首次揭示了NTM暴露与BCG疫苗对肺结核保护效果之间的直接关系，并强调了B细胞在此过程中的关键作用。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探索非结核分枝杆菌暴露对肺结核免疫保护的影响，以及B细胞在此过程中的作用。 | 研究对象包括非结核分枝杆菌、结核分枝杆菌以及BCG疫苗接种的小鼠。 | 免疫学 | 肺结核 | 空间转录组学、免疫组织化学 | 小鼠模型 | 血液和呼吸道样本 | 未具体说明小鼠数量 |
| 1159 | 2024-08-08 |
Deep transfer learning enables lesion tracing of circulating tumor cells
2022-12-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35296-0
PMID:36509761
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研究论文 | 本文设计了一种基于迁移学习的算法CTC-Tracer，用于校正原发癌细胞与循环肿瘤细胞（CTC）之间的分布偏移，从而将原发癌细胞图谱中的病变标签转移到CTC上 | 提出了CTC-Tracer算法，利用迁移学习技术解决CTC scRNA-seq数据积累不足和先验知识缺乏的问题 | NA | 开发一种算法以实现循环肿瘤细胞的病变追踪 | 循环肿瘤细胞（CTC）及其病变类型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 迁移学习 | RNA测序数据 | 8个独立的标准数据集以及一个包含单个CTC、CTC簇和两个异种移植的复杂数据集 |
| 1160 | 2024-08-08 |
scCapsNet-mask: an updated version of scCapsNet with extended applicability in functional analysis related to scRNA-seq data
2022-Dec-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-05098-8
PMID:36510124
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研究论文 | 本文介绍了scCapsNet-mask，这是scCapsNet的更新版本，旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的解释性和非标准测试样本处理问题 | scCapsNet-mask通过引入掩码机制，改善了模型的解释性，并能更合理地处理非标准样本 | NA | 开发一种新的深度学习模型，以提高单细胞RNA测序数据分析的解释性和处理非标准样本的能力 | 单细胞RNA测序数据及其在功能分析中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CapsNet | RNA测序数据 | NA |