单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1141	2024-08-08	Dysfunctional intercellular communication and metabolic signaling pathways in thin endometrium 2022, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2022.1050690 PMID:36505055	研究论文	本研究结合单细胞RNA测序和批量测序数据，对薄型子宫内膜的细胞类型和信号通路进行了综合分析	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了薄型子宫内膜中细胞间通信和代谢信号通路的异常	NA	探讨薄型子宫内膜的细胞和分子机制，为治疗提供新策略	薄型子宫内膜的细胞类型和信号通路	数字病理学	妇科疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	四组单细胞RNA测序数据和一组批量测序数据
1142	2024-08-08	Single-cell analysis reveals that Jinwu Gutong capsule attenuates the inflammatory activity of synovial cells in osteoarthritis by inhibiting AKR1C3 2022, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2022.1031996 PMID:36505054	研究论文	研究揭示金乌骨通胶囊通过抑制AKR1C3减轻骨关节炎中滑膜细胞的炎症活性	通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了金乌骨通胶囊对骨关节炎滑膜炎的治疗机制，特别是通过抑制AKR1C3表达	NA	阐明金乌骨通胶囊治疗骨关节炎滑膜炎的精确机制	骨关节炎中的滑膜细胞	数字病理学	骨关节炎	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	具体样本数量未在摘要中提及
1143	2024-08-08	Applications of single-cell RNA sequencing in atopic dermatitis and psoriasis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1038744 PMID:36505405	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在特应性皮炎和银屑病中的应用及其最新进展	scRNA-seq技术的发展提高了对组织中细胞生物多样性的理解，发现了新的细胞亚群，并有助于分析免疫细胞分布和细胞间通讯	当前scRNA-seq技术存在一些局限性和技术问题	探讨scRNA-seq技术在特应性皮炎和银屑病中的最新发现及未来趋势	特应性皮炎和银屑病中的细胞亚群及其在疾病反应中的作用	数字病理学	皮肤疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
1144	2024-08-08	Cell atlas of the immune microenvironment in gastrointestinal cancers: Dendritic cells and beyond 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1007823 PMID:36505406	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在胃肠道癌症免疫微环境中树突状细胞分类和发展轨迹的应用	利用单细胞RNA测序技术揭示了胃肠道癌症肿瘤和微环境的异质性	NA	总结胃肠道癌症中单细胞水平树突状细胞的分类和发展轨迹，并探讨其与T细胞的相互作用及其对免疫治疗反应的影响	胃肠道癌症中的树突状细胞及其与T细胞的相互作用	数字病理学	胃肠道癌症	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA数据	NA
1145	2024-08-08	Caspase-8 activation in neutrophils facilitates autoimmune kidney vasculitis through regulating CD4+ effector memory T cells 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1038134 PMID:36505410	研究论文	本研究通过整合和分析单细胞转录组数据集，发现中性粒细胞中的caspase-8相关通路在肾脏中高度激活，并通过构建中性粒细胞特异性caspase-8敲除小鼠模型，验证了caspase-8在中性粒细胞中对AAVs进展的作用。	本研究首次揭示了中性粒细胞中caspase-8激活通过调节炎症和免疫反应，加剧AAVs的肾小球肾炎。	NA	探讨中性粒细胞中caspase-8激活在自身免疫性肾血管炎中的作用及其机制。	中性粒细胞中的caspase-8激活及其对AAVs进展的影响。	NA	自身免疫性疾病	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	中性粒细胞特异性caspase-8敲除小鼠模型结合AAVs模型
1146	2024-08-08	Single-cell transcriptomics in bone marrow delineates CD56dimGranzymeK+ subset as intermediate stage in NK cell differentiation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1044398 PMID:36505452	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，结合寡核苷酸偶联抗体，分析了新鲜骨髓NK细胞，揭示了CD56dimGranzymeK+子集作为NK细胞分化中间阶段的作用	首次通过单细胞转录组学技术揭示了CD56dimGranzymeK+子集作为NK细胞分化中间阶段的新发现	研究未能在骨髓中发现CD34前体细胞与NK细胞之间的发育联系，暗示骨髓中可能缺乏早期NK细胞阶段	探究人类NK细胞在淋巴组织中的功能和发育关系	人类NK细胞及其在骨髓中的分化过程	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	新鲜骨髓NK细胞
1147	2024-08-08	Development of a polyamine gene expression score for predicting prognosis and treatment response in clear cell renal cell carcinoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1048204 PMID:36505496	研究论文	本研究旨在揭示多胺代谢相关基因（PMRGs）在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的表达与预后价值及其与肿瘤微环境的关联	开发了多胺基因表达评分（PGES），用于准确预测患者的预后和免疫治疗反应	NA	揭示多胺代谢相关基因在透明细胞肾细胞癌中的表达与预后价值及其与肿瘤微环境的关联	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的多胺代谢相关基因表达	数字病理学	肾细胞癌	单细胞测序分析	Lasso回归分析	基因表达数据	777名ccRCC患者
1148	2024-08-08	Identification of two robust subclasses of sepsis with both prognostic and therapeutic values based on machine learning analysis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1040286 PMID:36505503	研究论文	本研究基于机器学习分析，识别出两种具有预后和治疗价值的脓毒症亚型	通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和K均值聚类分析，成功分类出两种脓毒症亚型，并验证了其临床相关性	NA	开发优化的脓毒症分类方法，以促进个性化治疗和临床结果预测	1936名患者（脓毒症样本1692例，正常样本244例）的数据	机器学习	脓毒症	加权基因共表达网络分析（WGCNA），K均值聚类分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq）	K均值聚类	基因表达数据	1936名患者
1149	2024-08-08	A machine learning framework for scRNA-seq UMI threshold optimization and accurate classification of cell types 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.982019 PMID:36506328	研究论文	本文开发了一种机器学习框架，用于优化scRNA-seq UMI阈值并准确分类细胞类型	提出了一种新的机器学习框架，能够系统地评估最低UMI阈值，并准确分类细胞，提高了细胞回收率	NA	解决scRNA-seq技术中由于UMI阈值设置过高导致的细胞丢失问题	scRNA-seq数据中的细胞类型分类	机器学习	乳腺癌	scRNA-seq	机器学习框架	scRNA-seq数据	乳腺癌患者数据集及两个外部数据集
1150	2024-08-08	Mechanism of action of paclitaxel for treating glioblastoma based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology 2022, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2022.1076958 PMID:36506527	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据和网络药理学方法研究紫杉醇治疗胶质母细胞瘤的作用机制	首次结合单细胞RNA测序和网络药理学分析紫杉醇对胶质母细胞瘤的作用机制	NA	探究紫杉醇治疗胶质母细胞瘤的生物活性、机制及癌细胞杀伤效应	紫杉醇的作用机制及其对胶质母细胞瘤的影响	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	24个细胞簇
1151	2024-08-08	IL-33 induces NF-κB activation in ILC2 that can be suppressed by in vivo and ex vivo 17β-estradiol 2022, Frontiers in allergy IF:3.3Q2 DOI:10.3389/falgy.2022.1062412 PMID:36506643	研究论文	研究IL-33诱导的ILC2中NF-κB活化及其被17β-雌二醇抑制的机制	首次揭示了雌激素对ILC2的抑制作用及其在过敏性疾病治疗中的潜在价值	研究主要集中在动物模型上，需要进一步的人体研究验证	探讨卵巢激素波动对哮喘疾病进展和症状加重的机制	ILC2细胞和NF-κB信号通路	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用了雌性和雄性BALB/c小鼠以及卵巢切除的雌性小鼠
1152	2024-08-08	Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Paraspeckles Expression in Osteosarcoma Tissues 2022, Cancer informatics IF:2.4Q3 DOI:10.1177/11769351221140101 PMID:36507075	研究论文	本文通过单细胞转录组分析方法，研究了骨肉瘤组织中paraspeckles及相关基因的表达情况	首次揭示了paraspeckles及相关基因在骨肉瘤细胞中的表达模式	样本量较小，仅涉及6个骨肉瘤肿瘤组织	探讨paraspeckles及相关基因在骨肉瘤进展中的作用	骨肉瘤组织中的paraspeckles及相关基因表达	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	6个骨肉瘤肿瘤组织
1153	2024-08-08	Interaction between human leukocyte antigen (HLA-C) and killer cell Ig-like receptors (KIR2DL) inhibits the cytotoxicity of natural killer cells in patients with hepatoblastoma 2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2022.947729 PMID:36507493	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术分析了肝母细胞瘤患儿的免疫微环境，发现KIR2DL在NK细胞中的高表达与HLA-C的相互作用抑制了NK细胞的细胞毒性，可能导致肿瘤免疫逃逸。	首次揭示了HLA-C与KIR2DL在肝母细胞瘤中的相互作用及其对NK细胞功能的抑制作用，并提出了通过阻断这种相互作用来增强NK细胞毒性作为新的治疗策略。	研究样本量较小，仅包括两名肝母细胞瘤患儿和一名健康儿童，可能影响结果的普遍性。	探讨肝母细胞瘤患儿的免疫微环境特征及其与疾病发展的关系。	两名肝母细胞瘤患儿和一名健康儿童的外周血和肿瘤组织。	数字病理学	肝母细胞瘤	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	3名儿童（2名肝母细胞瘤患儿和1名健康儿童）
1154	2024-08-08	The Infiltration of Neutrophil Granulocytes Due to Loss of PTEN Was Associated with Poor Response to Immunotherapy in Renal Cell Carcinoma 2022, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S388990 PMID:36510494	研究论文	本文探讨了PTEN缺失与肾细胞癌中中性粒细胞浸润及免疫治疗反应不佳之间的关系。	首次揭示了PTEN状态与肾透明细胞癌中中性粒细胞浸润的关系，并提出了PTEN低表达作为抗PD-1免疫治疗抵抗的候选因素。	NA	研究PTEN在肾细胞癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系。	肾透明细胞癌患者及其实验室细胞系。	数字病理学	肾细胞癌	CRISPR-Cas9, 免疫印迹, qRT-PCR, RNA测序, 免疫组化染色	NA	基因组数据, 转录组数据	多个肾透明细胞癌数据集, 包括批量RNA测序和单细胞RNA测序数据
1155	2024-08-08	Development of a Cancer-Associated Fibroblast-Related Prognostic Model in Breast Cancer via Bulk and Single-Cell RNA Sequencing 2022, BioMed research international IF:2.6Q3 DOI:10.1155/2022/2955359 PMID:36510567	研究论文	本文通过批量和单细胞RNA测序技术，开发了一个与癌症相关成纤维细胞相关的乳腺癌预后模型。	本文创新性地利用单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，结合多种生物信息学工具，构建了一个包含五个基因的预后模型，该模型与癌症相关成纤维细胞相关。	NA	开发一个与癌症相关成纤维细胞相关的乳腺癌预后模型。	乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞。	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	Cox回归模型	RNA序列数据	使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)的乳腺癌单细胞RNA测序数据集GSE176078，包含28个细胞集群。
1156	2024-08-08	Analysis of the key ligand receptor CADM1_CADM1 in the regulation of thyroid cancer based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data 2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2022.969914 PMID:36523593	研究论文	本研究分析了关键配体受体CADM1_CADM1在甲状腺癌中的调控作用，基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据	首次发现CADM1_CADM1在甲状腺癌进展中的重要作用，并提供了一种新的潜在预后和治疗配体-受体对	由于对甲状腺癌中配体-受体对的了解有限，针对这些配体-受体对的治疗方法仍面临挑战	研究甲状腺癌中配体-受体对的作用，以寻找新的预后和治疗靶点	甲状腺癌中的CADM1_CADM1配体-受体对	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序	NA	RNA测序数据	65311个单细胞RNA测序样本来自7名不同阶段的甲状腺癌患者，以及包含487个肿瘤样本和58个癌旁样本的批量RNA测序数据集
1157	2024-08-08	A high-efficiency differential expression method for cancer heterogeneity using large-scale single-cell RNA-sequencing data 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1063130 PMID:36523772	研究论文	本文提出了一种高效稳健的差异表达检测方法HEART，用于分析大规模单细胞RNA测序数据，以研究结直肠癌的异质性	HEART方法能够检测多种来源的差异表达基因，不仅限于平均表达水平的变化，具有高准确性和计算效率	NA	研究结直肠癌的异质性及其对癌症治疗效果的影响	结直肠癌的单细胞RNA测序数据	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	统计组合测试	单细胞RNA测序数据	多个模拟数据集和实际数据集，包括PBMC68K数据集和人类脑单细胞数据集
1158	2024-08-08	Combined proteomics and single cell RNA-sequencing analysis to identify biomarkers of disease diagnosis and disease exacerbation for systemic lupus erythematosus 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.969509 PMID:36524113	研究论文	本研究通过结合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，识别系统性红斑狼疮（SLE）的疾病诊断和疾病加重的生物标志物。	本研究首次通过机器学习管道和实验验证，确定了两种生物标志物组合，能够准确区分SLE患者与健康对照组，并区分活动性和非活动性SLE。	NA	旨在发现和验证系统性红斑狼疮的疾病诊断和活动监测的生物标志物。	系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞（PBMC）。	蛋白质组学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（scRNA-seq），酶联免疫吸附试验（ELISA）	机器学习	蛋白质组数据，单细胞RNA测序数据	包括活动性SLE、非活动性SLE、类风湿关节炎（RA）患者和健康对照（HC）的外周血单个核细胞（PBMC）样本。
1159	2024-08-08	Machine learning-based identification of SOX10 as an immune regulator of macrophage in gliomas 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1007461 PMID:36524115	研究论文	本研究利用机器学习方法识别SOX10作为胶质瘤中巨噬细胞的免疫调节因子	发现SOX10在胶质瘤中具有显著的免疫特征和基因组特征，且其高表达与免疫治疗效果相关	NA	探索SOX10在胶质瘤中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力	胶质瘤中的SOX10及其对巨噬细胞的影响	机器学习	脑瘤	单细胞测序	NA	基因组数据	涉及低级别胶质瘤（LGG）、高级别胶质瘤（HGG）及泛癌组
1160	2024-08-08	Single-cell RNA-sequencing in asthma research 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.988573 PMID:36524132	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在哮喘研究中的重要性及其近年来的研究成果	scRNA-seq技术有助于探索哮喘的异质性，识别稀有细胞类型和特定细胞亚群，阐明细胞分化的关键过程，并理解预测免疫功能的调控基因网络	NA	旨在为哮喘的发病机制、药物开发和治疗提供新思路	哮喘的免疫发病机制	digital pathology	哮喘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA