单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing of Malignant Ascites Reveals Transcriptomic Remodeling of the Tumor Microenvironment during the Progression of Epithelial Ovarian Cancer
2022-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122276
PMID:36553542
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了五名上皮性卵巢癌患者的恶性腹水样本，揭示了肿瘤微环境在疾病进展中的转录组重塑 | 研究首次详细描述了恶性腹水中肿瘤微环境在卵巢癌进展中的动态变化，包括癌细胞状态的转变和相关生物通路的激活 | 研究样本量较小，仅基于五个患者的样本，可能影响结果的普遍性 | 探索上皮性卵巢癌患者恶性腹水中肿瘤微环境在肿瘤进展和复发中的调控机制 | 上皮性卵巢癌患者的恶性腹水样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | 无监督深度嵌入单细胞聚类算法 | 转录组数据 | 4680个单细胞，来自五个上皮性卵巢癌患者（三个诊断样本和两个复发样本） |
| 1122 | 2024-08-08 |
scDSSC: Deep Sparse Subspace Clustering for scRNA-seq Data
2022-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010772
PMID:36534702
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研究论文 | 本文提出了一种结合噪声降低和维度降低的深度稀疏子空间聚类方法scDSSC，用于单细胞RNA测序数据，该方法通过显式建模scRNA-seq数据生成，同时学习特征表示和聚类 | scDSSC方法在多种scRNA-seq数据集上显著提高了聚类性能，并增强了聚类和下游分析的可解释性 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度稀疏子空间聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 数千至数万个细胞 |
| 1123 | 2024-08-08 |
Impact of CD4 T cells on intratumoral CD8 T-cell exhaustion and responsiveness to PD-1 blockade therapy in mouse brain tumors
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005293
PMID:36543376
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研究论文 | 本文研究了CD4 T细胞对小鼠脑肿瘤中肿瘤内CD8 T细胞耗竭和PD-1阻断疗法反应性的影响 | 首次描述了功能失调的CD4 T细胞与终末期CD8 T细胞耗竭的关联，并展示了CD40激动剂与PD-1阻断疗法的协同作用 | NA | 探究CD4 T细胞对CD8 T细胞耗竭和PD-1阻断疗法反应性的影响 | 小鼠脑肿瘤模型中的CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 雌性C57/BL6小鼠的肿瘤浸润淋巴细胞 |
| 1124 | 2024-08-08 |
Modeling resistance of colorectal peritoneal metastases to immune checkpoint blockade in humanized mice
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005345
PMID:36543378
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研究论文 | 本文通过将患者来源的器官样移植到人源化小鼠的盲肠中，创建了一个新的MSI-H CRC肿瘤自发多器官转移模型，并分析了免疫检查点阻断治疗的效果及其与肿瘤免疫环境的关系。 | 结合器官样和人源化小鼠技术，提供了一个新的自发多器官转移模型，并提供了B细胞在抗CTLA-4治疗后产生部位依赖性抗肿瘤免疫中的关键作用的实证。 | NA | 研究免疫检查点阻断治疗在MSI-H CRC肿瘤中的效果及其机制。 | MSI-H CRC肿瘤的自发多器官转移及其对免疫检查点阻断治疗的反应。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 患者来源的器官样移植到人源化小鼠的盲肠中 |
| 1125 | 2024-08-08 |
Characterizing Macrophages Diversity in COVID-19 Patients Using Deep Learning
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122264
PMID:36553530
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研究论文 | 本研究利用深度学习技术分析了COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，以识别与疾病严重程度相关的分子状态 | 本研究首次使用图卷积神经网络模型来预测COVID-19感染的严重程度，并展示了高预测准确率 | NA | 旨在通过计算方法识别与COVID-19感染严重程度相关的分子状态，以理解关键免疫反应的差异 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 图卷积神经网络 | 基因表达数据 | 12个支气管肺泡灌洗液样本，包含63,734个细胞，每个细胞有23,916个基因 |
| 1126 | 2024-08-08 |
The Sum of Two Halves May Be Different from the Whole-Effects of Splitting Sequencing Samples Across Lanes
2022-12-01, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122265
PMID:36553532
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研究论文 | 本文探讨了将样本分批进行高通量测序（HTS）时，跨测序道分割样本对结果的影响 | 系统性地分析了测序设计中被忽略的变异来源，并展示了这种分割对批量和单细胞测序数据分析的定性和定量影响 | 文章未详细说明解决这些问题的具体方法或技术 | 研究测序设计中的变异来源及其对结果稳健性和可重复性的影响 | 批量mRNA测序、批量ChIP测序和单细胞测序数据 | 高通量测序 | NA | 高通量测序（HTS） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1127 | 2024-08-08 |
Colon-Targeted eNAMPT-Specific Peptide Systems for Treatment of DSS-Induced Acute and Chronic Colitis in Mouse
2022-Nov-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox11122376
PMID:36552583
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了NAMPT和CYBB在结肠炎患者和鼠模型中的表达上调，并开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽能够靶向结肠并抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，有效减轻DSS诱导的急性和慢性结肠炎。 | 开发了一种新型重组TK肽rCT-NAMPT，该肽具有结肠靶向性并能抑制NAMPT与CYBB或TLR4的相互作用，为结肠炎治疗提供了新的候选药物。 | NA | 研究NAMPT在炎症巨噬细胞中的作用及其在结肠炎治疗中的潜在应用。 | NAMPT和CYBB在结肠炎中的表达及新型重组TK肽rCT-NAMPT的开发与应用。 | NA | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1128 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Identifies Master Regulators Affected by Panobinostat in Neuroblastoma Cells
2022-11-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122240
PMID:36553506
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了泛HDAC抑制剂panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的作用，并识别了受其影响的转录调控因子。 | 利用单细胞测序技术在神经母细胞瘤细胞中研究panobinostat的作用，具有前所未有的分辨率。 | NA | 探究panobinostat在神经母细胞瘤细胞中的分子机制和基因调控网络。 | 神经母细胞瘤细胞和panobinostat的作用。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1129 | 2024-08-08 |
A Dual-Channel Microfluidic Chip for Single Tobacco Protoplast Isolation and Dynamic Capture
2022-Nov-29, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi13122109
PMID:36557407
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研究论文 | 本研究设计了一种基于PDMS的双通道微流控芯片，用于单个烟草原生质体的分离和动态捕获 | 本研究提供了一种新的高吞吐量单原生质体研究策略，并为单细胞捕获机制奠定了理论基础 | NA | 研究单个原生质体的分离和捕获，以满足基因功能验证、亚细胞定位和单细胞测序的需求 | 烟草原生质体和聚苯乙烯微球 | 微流控技术 | NA | 微流控芯片 | NA | NA | 单个烟草原生质体的捕获效率为83.33%，入口流速为0.75 μL/min |
| 1130 | 2024-08-08 |
Advances in Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in Poultry Science
2022-11-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13122211
PMID:36553479
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review | 本文综述了单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用潜力 | 单细胞测序技术在禽类科学中的应用报道较少 | 探讨单细胞测序技术在禽类科学中的应用及其创新 | 单细胞测序技术及其在禽类科学中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因、表型和细胞生物学机制 | 单个细胞 |
| 1131 | 2024-08-08 |
Microglia-specific transcriptional repression of interferon-regulated genes after prolonged stress in mice
2022-Nov, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100495
PMID:36532375
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研究论文 | 研究探讨了小鼠在长期轻度压力下，小胶质细胞特异性的表观基因组变化及其对干扰素调节基因的转录抑制作用 | 首次揭示了小胶质细胞在长期压力下对干扰素调节基因的转录抑制，且这一现象与干扰素的产生无关，而是可能与Activating Transcription Factor 3 (ATF3)的增加有关 | NA | 探究长期压力下小胶质细胞的表观基因组变化及其对神经炎症的影响 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 12周暴露于轻度压力的小鼠 |
| 1132 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic, transcriptomic, and metabolomic characterization of human atherosclerosis
2022-Nov, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-4852
PMID:36544681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、转录组学和代谢组学分析，深入探讨了人类动脉粥样硬化的细胞间相互作用和关键基因 | 本研究首次综合分析了单细胞测序数据、主动脉转录组和代谢组数据，揭示了动脉粥样硬化的关键基因和信号通路 | NA | 深入理解动脉粥样硬化斑块形成的细胞间连接和关键中心基因 | 人类动脉粥样硬化的细胞类型、亚型分化轨迹、相互作用网络和重要转录因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 涉及多种细胞类型，包括T细胞、单核细胞、平滑肌细胞、内皮细胞、B细胞、成纤维细胞、浆细胞、肥大细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞 |
| 1133 | 2024-08-08 |
Intermittent protein restriction protects islet β cells and improves glucose homeostasis in diabetic mice
2022-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.12.024
PMID:36546138
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研究论文 | 本研究探讨了间歇性蛋白质限制（IPR）在糖尿病控制中的有效性 | IPR不仅显著降低了糖尿病小鼠的高血糖，还改善了胰岛β细胞的数量、增殖和功能，并减少了肝脏中的葡萄糖产生 | NA | 探索间歇性蛋白质限制在糖尿病治疗中的效果 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了链脲佐菌素处理和瘦素受体缺陷的db/db小鼠模型 |
| 1134 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γδ T cells
2022-02-26, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2021.11.013
PMID:36546093
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研究论文 | 本文通过结合转录组和染色质分析，构建了小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的单细胞转录组和染色质可及性图谱 | 首次揭示了γδ T1和γδ T17细胞在这些组织中的异质性，并推断了其潜在的调控机制，同时发现了具有未成熟特性的新型Gzma γδ T细胞亚群 | NA | 解析小鼠γδ T细胞的异质性及其在不同组织中的功能 | 小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的转录组和染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 小鼠γδ T细胞在淋巴、脾脏和胸腺中的样本 |
| 1135 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory Predicts Prognosis and Immunotherapeutic Response in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2022, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2022/8422339
PMID:36530957
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其在预后和免疫治疗反应中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析鉴定了ccRCC细胞中的不同分化状态和分化相关基因（DRGs），并结合机器学习构建了预后风险模型 | NA | 研究ccRCC细胞的分化状态对预后和免疫治疗反应的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | RNA序列数据 | 涉及83种化合物或抑制剂的响应差异分析 |
| 1136 | 2024-08-08 |
A mitochondria-related signature for predicting immune microenvironment and therapeutic response in osteosarcoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1085065
PMID:36531021
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研究论文 | 本文构建了一个与线粒体相关的特征，用于预测骨肉瘤中的免疫微环境和治疗反应 | 首次在骨肉瘤中建立了一个与线粒体相关的特征，用于综合评估线粒体在骨肉瘤中的致病和调节作用 | NA | 开发一个与线粒体相关的特征，以预测骨肉瘤中的免疫微环境、化疗药物和预后 | 骨肉瘤患者的线粒体相关特征及其在免疫微环境和治疗反应中的预测价值 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的骨肉瘤样本的转录组数据和临床信息 |
| 1137 | 2024-08-08 |
The new ceRNA crosstalk between mRNAs and miRNAs in intervertebral disc degeneration
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1083983
PMID:36531954
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研究论文 | 本研究旨在从多维度转录组学角度揭示椎间盘退变的发病分子机制 | 本研究通过分析公共数据库中的转录组数据，发现了与椎间盘退变相关的新的竞争性内源RNA（ceRNA）网络，并识别了关键基因 | NA | 揭示椎间盘退变的发病分子机制，寻找有效的诊断生物标志物和新的治疗策略 | 椎间盘退变相关的mRNA和microRNA表达谱 | 数字病理学 | 脊椎疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及两个批量数据集（GSE67567和GSE167199）和一个单细胞RNA测序数据集（GSE199866） |
| 1138 | 2024-08-08 |
Junctional adhesion molecule-A is dispensable for myeloid cell recruitment and diversification in the tumor microenvironment
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003975
PMID:36531986
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研究论文 | 研究探讨了连接粘附分子-A（JAM-A）在肿瘤微环境中对骨髓细胞招募和多样化的作用 | 发现肿瘤可以绕过JAM-A对骨髓细胞招募和重编程的需求 | NA | 探究JAM-A在肿瘤微环境中对骨髓细胞功能的影响 | 连接粘附分子-A（JAM-A）及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用骨髓特异性JAM-A缺陷小鼠进行研究 |
| 1139 | 2024-08-08 |
Krebs von den lungen-6 as a clinical marker for hypersensitivity pneumonitis: A meta-analysis and bioinformatics analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1041098
PMID:36532009
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meta-analysis | 本研究通过meta分析和生物信息学分析探讨了Krebs von den lungen-6（KL-6）在不同类型超敏性肺炎（HP）中的浓度变化 | 本研究首次通过meta分析和生物信息学分析综合评估了KL-6在HP患者和健康对照中的表达差异 | NA | 阐明KL-6在不同类型超敏性肺炎中的浓度变化 | 超敏性肺炎患者和健康对照的KL-6浓度 | NA | 超敏性肺炎 | meta分析, 生物信息学分析 | NA | mRNA表达数据 | 20项研究 |
| 1140 | 2024-08-08 |
Dysfunction of CCR1+ decidual macrophages is a potential risk factor in the occurrence of unexplained recurrent pregnancy loss
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1045532
PMID:36532057
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据和临床样本的功能实验，发现CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的作用 | 首次揭示了CCR1+基质巨噬细胞在不明原因反复流产中的关键作用，并阐明了其免疫抑制和迁移调控特性 | NA | 探讨不明原因反复流产的潜在风险因素 | CCR1+基质巨噬细胞及其在不明原因反复流产中的作用 | NA | 生殖系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 涉及正常早期妊娠和不明原因反复流产患者的基质样本 |