单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2024-08-08 |
Construction and experimental validation of a B cell senescence-related gene signature to evaluate prognosis and immunotherapeutic sensitivity in bladder cancer
2022-Dec-17, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-022-00936-7
PMID:36527532
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个与B细胞衰老相关的基因特征，用于评估膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了一个B细胞衰老相关基因特征，用于评估膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性，并通过多个大型队列验证了其可靠性和稳健性 | NA | 阐明B细胞衰老相关基因在膀胱癌中的预后价值 | B细胞衰老相关基因在膀胱癌中的预后和免疫治疗敏感性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 训练数据集来自癌症基因组图谱膀胱癌队列，验证数据集包括来自GEO的三个队列、35个临床样本和体外细胞实验 |
| 1122 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing and lineage tracing confirm mesenchyme to epithelial transformation (MET) contributes to repair of the endometrium at menstruation
2022-Dec-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.77663
PMID:36524724
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研究论文 | 本研究使用小鼠模型和三种转基因小鼠系，通过单细胞RNA测序技术，探讨了子宫内膜修复过程中上皮细胞是否源自子宫内膜间质中的间充质细胞类型 | 首次发现了一群对损伤有响应的、可塑性强的子宫内膜间质成纤维细胞，这些细胞在子宫内膜修复过程中有助于快速恢复完整的上皮层 | NA | 验证间充质到上皮转化（MET）在子宫内膜月经修复中的作用 | 子宫内膜修复过程中的间充质细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种转基因小鼠系 |
| 1123 | 2024-08-08 |
Loss of Y in leukocytes as a risk factor for critical COVID-19 in men
2022-12-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01144-5
PMID:36514076
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研究论文 | 本研究探讨了染色体Y丢失（LOY）在男性COVID-19重症风险中的作用，通过分析公开的单细胞RNA测序数据和来自重症监护室（ICU）的COVID-19患者的血液样本，发现LOY与COVID-19的严重程度和死亡率相关。 | 首次揭示了LOY与急性、危及生命的传染病之间的联系，并强调了LOY作为影响骨髓细胞系的最显著克隆突变。 | NA | 探讨染色体Y丢失（LOY）在男性COVID-19重症风险中的作用。 | LOY在COVID-19重症男性患者中的分布及其与疾病严重程度的关系。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 211名在重症监护室（ICU）接受治疗的COVID-19患者 |
| 1124 | 2024-08-08 |
TATTOO-seq delineates spatial and cell type-specific regulatory programs in the developing limb
2022-Dec-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add0695
PMID:36516250
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研究论文 | 本文开发并应用了一种无偏的空间分辨单细胞转录组学方法，以识别在鼠肢体发育过程中特化细胞类型出现及其空间整合的遗传程序 | 本文创新性地使用了一种无偏的空间分辨单细胞转录组学方法，揭示了细胞类型特异性和空间位置相关的转录因子表达模式 | NA | 研究胚胎发育中细胞分化和空间组织的遗传调控机制 | 鼠肢体发育中的细胞类型和空间组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1125 | 2024-08-08 |
A multiple sclerosis-protective coding variant reveals an essential role for HDAC7 in regulatory T cells
2022-12-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl3651
PMID:36516268
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研究论文 | 本文研究了一种保护性的组蛋白去乙酰化酶7（HDAC7）变异体在调节性T细胞中的作用，并探讨了其在多发性硬化症（MS）中的潜在保护机制。 | 首次揭示了HDAC7在调节性T细胞中的关键作用，并通过体内外模型验证了其对多发性硬化症的保护作用。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨HDAC7变异体在多发性硬化症中的保护作用及其机制。 | HDAC7变异体在调节性T细胞中的功能及其对多发性硬化症的影响。 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和体外功能 assay 的细胞样本 |
| 1126 | 2024-08-08 |
A pan-cancer analysis of the FAT1 in human tumors
2022-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26008-1
PMID:36517565
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研究论文 | 本研究探讨了FAT1在33种肿瘤中的潜在致癌作用，基于The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omibus数据集 | 首次进行了FAT1在多种癌症中的泛癌研究，提供了对FAT1致癌作用的全面理解 | NA | 探索FAT1在多种肿瘤中的致癌作用 | FAT1基因在33种肿瘤中的表达及其与肿瘤预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤样本 |
| 1127 | 2024-08-08 |
Locally organised and activated Fth1hi neutrophils aggravate inflammation of acute lung injury in an IL-10-dependent manner
2022-12-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35492-y
PMID:36513690
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了脂多糖诱导的小鼠急性肺损伤肺部中两种转录和功能异质性的中性粒细胞群体，并探讨了它们在急性肺损伤中的作用 | 首次揭示了急性肺损伤中肺部中性粒细胞的表型异质性，并发现了Fth1 Neu亚型在炎症反应中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证结果 | 探讨急性肺损伤中中性粒细胞的表型异质性及其在疾病发展中的作用 | 急性肺损伤中的中性粒细胞 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肺部组织样本 |
| 1128 | 2024-08-08 |
Single-cell microglial transcriptomics during demyelination defines a microglial state required for lytic carcass clearance
2022-12-13, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00584-2
PMID:36514132
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了在脱髓鞘过程中小胶质细胞的转录组变化，并探讨了小胶质细胞在清除溶解的细胞残骸中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了在脱髓鞘过程中小胶质细胞的特定转录组状态，并证明了小胶质细胞在清除溶解的细胞残骸中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果。 | 探讨小胶质细胞在脱髓鞘过程中的响应和调控机制。 | 小胶质细胞在脱髓鞘过程中的转录组变化及其在清除细胞残骸中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了基因命运图谱的小胶质细胞样本 |
| 1129 | 2024-08-08 |
The dynamic dysregulated network identifies stage-specific markers during lung adenocarcinoma malignant progression and metastasis
2022-Dec-13, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2022.11.019
PMID:36514354
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研究论文 | 本研究通过全面的单细胞转录组分析，揭示了肺腺癌（LUAD）进展过程中不同阶段的细胞组成异质性，并识别了与LUAD进展和转移相关的阶段特异性风险基因。 | 本研究构建了早期进展和转移失调网络，并揭示了LUAD进展过程中基因调控的动态变化，识别了不同阶段的预后标记基因。 | NA | 旨在深入理解肺腺癌进展和脑转移的分子机制。 | 肺腺癌（LUAD）的进展和脑转移。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自正常、早期阶段、晚期阶段和脑转移LUAD的数据 |
| 1130 | 2024-08-08 |
Mucosal exposure to non-tuberculous mycobacteria elicits B cell-mediated immunity against pulmonary tuberculosis
2022-12-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111783
PMID:36516760
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研究论文 | 研究探讨了非结核分枝杆菌（NTM）黏膜暴露对肺结核免疫保护的影响，特别是在BCG疫苗接种和持续NTM暴露的小鼠模型中。 | 首次揭示了NTM暴露与BCG疫苗对肺结核保护效果之间的直接关系，并强调了B细胞在此过程中的关键作用。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探索非结核分枝杆菌暴露对肺结核免疫保护的影响，以及B细胞在此过程中的作用。 | 研究对象包括非结核分枝杆菌、结核分枝杆菌以及BCG疫苗接种的小鼠。 | 免疫学 | 肺结核 | 空间转录组学、免疫组织化学 | 小鼠模型 | 血液和呼吸道样本 | 未具体说明小鼠数量 |
| 1131 | 2024-08-08 |
Deep transfer learning enables lesion tracing of circulating tumor cells
2022-12-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35296-0
PMID:36509761
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研究论文 | 本文设计了一种基于迁移学习的算法CTC-Tracer，用于校正原发癌细胞与循环肿瘤细胞（CTC）之间的分布偏移，从而将原发癌细胞图谱中的病变标签转移到CTC上 | 提出了CTC-Tracer算法，利用迁移学习技术解决CTC scRNA-seq数据积累不足和先验知识缺乏的问题 | NA | 开发一种算法以实现循环肿瘤细胞的病变追踪 | 循环肿瘤细胞（CTC）及其病变类型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 迁移学习 | RNA测序数据 | 8个独立的标准数据集以及一个包含单个CTC、CTC簇和两个异种移植的复杂数据集 |
| 1132 | 2024-08-08 |
scCapsNet-mask: an updated version of scCapsNet with extended applicability in functional analysis related to scRNA-seq data
2022-Dec-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-05098-8
PMID:36510124
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研究论文 | 本文介绍了scCapsNet-mask，这是scCapsNet的更新版本，旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的解释性和非标准测试样本处理问题 | scCapsNet-mask通过引入掩码机制，改善了模型的解释性，并能更合理地处理非标准样本 | NA | 开发一种新的深度学习模型，以提高单细胞RNA测序数据分析的解释性和处理非标准样本的能力 | 单细胞RNA测序数据及其在功能分析中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CapsNet | RNA测序数据 | NA |
| 1133 | 2024-08-08 |
Construction and experimental validation of an acetylation-related gene signature to evaluate the recurrence and immunotherapeutic response in early-stage lung adenocarcinoma
2022-Dec-11, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-022-01413-7
PMID:36503492
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研究论文 | 本文构建了一个与乙酰化相关的基因特征，用于评估早期肺腺癌的复发和免疫治疗反应，并通过实验验证了其有效性。 | 首次开发了一个包含RBBP7和YEATS2的乙酰化相关基因特征，用于评估早期肺腺癌的无复发生存率和免疫治疗反应。 | NA | 构建并验证一个乙酰化相关基因特征，以评估早期肺腺癌的复发和免疫治疗效果。 | 早期肺腺癌患者及其免疫治疗反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组测序、基因组差异分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、Lasso回归、单变量Cox回归、多变量Cox回归、基因表达综合数据库检索、单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 23例早期肺腺癌样本，以及来自癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的多个独立数据集 |
| 1134 | 2024-08-08 |
Isolation of TTF-1 Positive Circulating Tumor Cells for Single-Cell Sequencing by Using an Automatic Platform Based on Microfluidic Devices
2022-Dec-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232315139
PMID:36499466
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研究论文 | 本研究开发了一种基于微流控设备的自动化平台，用于分离TTF-1阳性循环肿瘤细胞（CTC）进行单细胞测序 | 本研究整合了自动CTC富集和染色机、AI辅助的自动CTC扫描和识别系统以及自动细胞挑选机，实现了对目标CTC的精确识别和分离 | NA | 研究目的是开发一种精确有效的CTC分离方法，以便进行下游的单细胞测序分析 | 研究对象包括来自三位癌症患者（两位患有肺癌，一位同时患有肺癌和甲状腺癌）的外周血中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | AI辅助系统 | 细胞 | 三位癌症患者的外周血样本 |
| 1135 | 2024-08-08 |
Comprehensive multi-omics analysis of the m7G in pan-cancer from the perspective of predictive, preventive, and personalized medicine
2022-Dec, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-022-00305-1
PMID:36505892
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析，探讨了m7G在泛癌中的作用，并评估了其在预测、预防和个性化医学中的应用潜力 | 首次探索了m7G在泛癌中的作用，并将其作为预测临床结果和免疫治疗效果的创新标志物 | NA | 旨在通过泛癌分析m7G，探索其潜在机制，并促进预测、预防和个性化医学的发展 | m7G与肿瘤免疫的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | XGBoost和随机森林 | 基因表达、遗传变异、临床信息、甲基化和数字病理切片 | 33种癌症类型 |
| 1136 | 2024-08-08 |
Primate gastrulation and early organogenesis at single-cell resolution
2022-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05526-y
PMID:36517595
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研究论文 | 本文通过收集六个阶段8-11的食蟹猴胚胎，进行了56,636个单细胞的深度转录组分析，揭示了灵长类动物原肠形成和早期器官发生的主要细胞类型的转录组特征 | 首次提供了灵长类动物原肠形成和早期器官发生的全面单细胞转录组图谱，填补了该领域的知识空白 | NA | 旨在填补非人灵长类动物从原肠形成到早期器官发生阶段的体内数据空白，并提供对人类胚胎发育和发育障碍的理解 | 食蟹猴胚胎的单细胞转录组 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 六个食蟹猴胚胎，共56,636个单细胞 |
| 1137 | 2024-08-08 |
Preconditioning of the immune system modulates the response of papillary thyroid cancer to immune checkpoint inhibitors
2022-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005538
PMID:36521928
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统预处理对甲状腺乳头状癌（PTC）对免疫检查点抑制剂（ICIs）反应的影响 | 首次揭示了免疫系统预处理对PTC对ICIs反应的影响，并展示了不同ICIs对甲状腺免疫细胞浸润的具体和共享效应 | 研究仅限于小鼠模型，结果需要进一步在人类患者中验证 | 测试免疫系统预处理是否调节ICIs的治疗效果 | 甲状腺乳头状癌（PTC）和碘加剧的甲状腺炎（IET） | NA | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 122只小鼠 |
| 1138 | 2024-08-08 |
Comprehensive Transcriptomic Analysis of VISTA in Acute Myeloid Leukemia: Insights into Its Prognostic Value
2022-Nov-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232314885
PMID:36499220
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研究论文 | 研究探讨了VISTA在急性髓系白血病中的转录组表达及其对预后的影响 | 首次详细分析了VISTA在急性髓系白血病中的表达模式及其与疾病复发和治疗抵抗的关系 | 研究主要基于公开的骨髓样本数据，可能存在样本选择偏倚 | 探索VISTA作为免疫检查点调节因子在急性髓系白血病患者中产生免疫逃逸环境的作用 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病细胞系 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 批量和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量健康个体和急性髓系白血病患者的骨髓样本 |
| 1139 | 2024-08-08 |
Retraction notice to "Parallel bimodal single-cell sequencing of transcriptome and methylome provides molecular and translational insights on oocyte maturation and maternal aging" [Genomics, 114/3 (2022) 110379]
2022-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110541
PMID:36528977
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1140 | 2024-08-08 |
Deciphering the immuno-pathological role of FLT, and evaluation of a novel dual inhibitor of topoisomerases and mutant-FLT3 for treating leukemia
2022, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:36504887
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研究论文 | 本研究利用AML患者的bulk和单细胞RNA测序数据，探讨FLT3基因变异对AML患者T细胞表型和免疫反应的临床意义，并评估新型小分子化合物Lwk-n019作为双靶点抑制剂的抗癌潜力 | 本研究首次评估了Lwk-n019作为双靶点抑制剂，同时抑制拓扑异构酶和突变型FLT3，具有高选择性和强效的抗癌活性 | 研究尚未完全阐明Lwk-n019的全部治疗特性和FLT3在拓扑异构酶抑制中的详细机制 | 探讨FLT3在AML中的免疫病理作用，并评估新型双靶点抑制剂Lwk-n019的治疗潜力 | 急性髓系白血病（AML）患者及其FLT3基因变异 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | RNA | AML患者的bulk和单细胞RNA测序数据 |