单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1081	2024-08-08	Characteristic analysis of skin keratinocytes in patients with type 2 diabetes based on the single-cell levels 2022-Oct-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000002323 PMID:36583863	研究论文	本研究旨在探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞在单细胞水平的转录特征，为揭示病理条件下角质形成细胞的病理机制提供实验数据	本研究首次在单细胞水平上分析了2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征，并筛选出一系列差异表达基因	研究样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者，可能影响结果的普遍性和可靠性	探索2型糖尿病患者皮肤角质形成细胞的转录特征	2型糖尿病患者的皮肤角质形成细胞	NA	2型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病患者的皮肤组织样本
1082	2024-08-08	Resolving the gene expression maps of human first-trimester chorionic villi with spatial transcriptome 2022, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2022.1060298 PMID:36561369	研究论文	本研究使用改进的Stereo-seq方法，对两名孕妇早期绒毛膜绒毛的空间转录组进行了分析，揭示了绒毛膜绒毛中主要细胞类型的基因表达模式及其空间定位。	本研究首次使用PFA固定的人类绒毛膜绒毛样本进行空间转录组分析，显著改善了组织形态和RNA信号的特异性。	研究样本仅来自两名孕妇，可能限制了结果的普遍性。	旨在通过空间转录组技术解析人类早期绒毛膜绒毛的基因表达图谱，以深入理解胎盘的结构和功能。	人类早期绒毛膜绒毛的基因表达及其空间分布。	数字病理学	NA	空间转录组技术	NA	空间转录组数据	两名孕妇的绒毛膜绒毛样本
1083	2024-08-08	Inflammatory role of microglia in brain injury caused by subarachnoid hemorrhage 2022, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2 DOI:10.3389/fncel.2022.956185 PMID:36561497	综述	本文综述了微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的炎症作用及其最新进展	探讨了微胶质细胞通过TLR4、CaSR和TREM-1等受体介导的信号通路在脑水肿、神经元凋亡和血脑屏障破坏中的双重作用	NA	探讨微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的病理机制	微胶质细胞在蛛网膜下腔出血后早期脑损伤中的作用	神经科学	脑血管疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
1084	2024-08-08	Case report: Clinical and single-cell transcriptome sequencing analysis of a mixed gangliocytoma-adenoma presenting as acromegaly 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1088803 PMID:36568175	病例报告	本文报告了一例混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA）表现为肢端肥大症的28岁男性患者的临床和单细胞转录组测序分析	本病例报告详细描述了MGA手术和放疗后的唯一临床和分子报告，并通过单细胞转录组测序分析揭示了肿瘤内异质性	NA	增强对MGA诊断和治疗的理解，并通过单细胞转录组测序分析提供对后续基础研究的支持	混合性神经节细胞瘤-腺瘤（MGA）	NA	神经节细胞瘤-腺瘤	单细胞转录组测序	NA	临床数据、病理学数据、超微结构数据、单细胞转录组数据	一例28岁男性患者
1085	2024-08-08	Integrating single-cell RNA sequencing and prognostic model revealed the carcinogenicity and clinical significance of FAM83D in ovarian cancer 2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2022.1055648 PMID:36568230	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和预后模型，探讨了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义	首次通过单细胞RNA测序和预后模型整合分析，揭示了FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义，并发现了miR-138-5p对FAM83D致癌作用的调控	NA	探讨FAM83D在卵巢癌中的致癌性和临床意义	FAM83D在卵巢癌中的作用及其与miR-138-5p的相互作用	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	Lasso-Cox回归分析	细胞	正常卵巢和高级别浆液性卵巢癌组织中的细胞
1086	2024-08-08	Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses reveal a prognostic signature of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinoma 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1028469 PMID:36568368	研究论文	本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的预后标志	首次通过单细胞RNA测序技术识别出头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并构建了基于4个基因的预后标志	研究样本来源于公共数据库，可能存在一定的数据偏差；预后标志的临床应用需要进一步的临床试验验证	识别头颈鳞状细胞癌中与预后相关的癌症相关成纤维细胞亚型，并探讨其在分子特征、免疫特征及免疫治疗和化疗中的潜在作用	头颈鳞状细胞癌中的癌症相关成纤维细胞	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	样本来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库，具体数量未详细说明
1087	2024-08-08	TP53-related signature for predicting prognosis and tumor microenvironment characteristics in bladder cancer: A multi-omics study 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.1057302 PMID:36568387	研究论文	本研究探讨了TP53基因突变在膀胱癌中的作用，构建了一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和肿瘤微环境特征。	本研究首次构建了基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应，并通过多种组学方法深入分析了TP53活性与肿瘤微环境的关系。	本研究主要基于多组学数据进行分析，未来需要更多的临床验证来证实该特征的可靠性和实用性。	探索TP53突变在膀胱癌中的作用，构建一个基于TP53调控基因的特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应。	膀胱癌患者，特别是TP53突变对肿瘤微环境和预后的影响。	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序、单细胞质谱流式细胞术（CyTOF）、成像质谱流式细胞术（IMC）	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	具体样本数量未在摘要中明确提及
1088	2024-08-08	Autologous cord blood mononuclear cell infusion for the prevention of bronchopulmonary dysplasia in very preterm monozygotic twins: A study protocol for a randomized, placebo-controlled, double-blinded multicenter trial 2022, Frontiers in pediatrics IF:2.1Q2 DOI:10.3389/fped.2022.884366 PMID:36568414	研究论文	本研究旨在评估自体脐带血单个核细胞输注预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良的效果，并探讨其保护机制	这是首个随机、安慰剂对照、双盲的多中心试验，用于评估自体脐带血单个核细胞输注在预防同卵双胞胎早产儿支气管肺发育不良中的疗效	遗传异质性可能降低对照组和干预组之间的可比性，尤其是在小样本试验中	研究自体脐带血单个核细胞输注在预防极早产同卵双胞胎支气管肺发育不良中的效果及其保护机制	极早产（小于32周妊娠）的同卵双胞胎新生儿	NA	新生儿疾病	单细胞RNA测序	NA	细胞	60对同卵双胞胎早产新生儿
1089	2024-08-08	Pyruvate: Ferredoxin oxidoreductase is involved in IgA-related microbiota dysbiosis and intestinal inflammation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1040774 PMID:36569858	研究论文	本研究探讨了乳酸脱氢酶：铁氧还蛋白氧化还原酶（PFOR）在免疫球蛋白A（IgA）相关微生物失调和肠道炎症中的作用	首次发现PFOR作为IgA结合抗原，可能参与宿主与微生物的相互作用	NA	研究PFOR在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对宿主-微生物相互作用的影响	炎症性肠病患者、兔子模型以及PFOR蛋白	NA	炎症性肠病	16S rDNA测序、酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白质印迹、质谱分析、单细胞测序	NA	微生物群落数据、免疫球蛋白A数据、蛋白质数据	炎症性肠病患者样本、兔子模型
1090	2024-08-08	Identification of B cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic model and identify immune infiltration in osteosarcoma 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1026701 PMID:36569871	研究论文	本研究基于单细胞测序结果，识别B细胞标记基因，并建立预测骨肉瘤预后的模型，同时分析免疫浸润差异。	首次通过单细胞测序技术识别B细胞标记基因，并建立了一个具有良好预测性能的骨肉瘤预后模型。	NA	探讨B细胞在骨肉瘤预后和免疫浸润中的作用。	B细胞标记基因、骨肉瘤预后模型及免疫浸润差异。	数字病理学	骨肉瘤	单细胞测序	NA	基因数据	261个B细胞标记基因
1091	2024-08-08	Integrated single-cell transcriptome analysis of the tumor ecosystems underlying cervical cancer metastasis 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.966291 PMID:36569924	研究论文	本研究通过单细胞测序技术分析了宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的转录组特征，揭示了宫颈癌淋巴结转移的分子机制	首次详细描述了宫颈癌淋巴结转移中上皮细胞和肿瘤微环境的转录组变化，特别是细胞周期、免疫反应相关信号通路和癌症相关成纤维细胞的作用	研究仅限于转录组分析，未涉及更深层次的分子机制或其他类型的生物标志物	探究宫颈癌淋巴结转移的分子机制	宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的单细胞转录组	数字病理学	宫颈癌	单细胞测序	NA	转录组数据	51,507个单细胞
1092	2024-08-08	Dupilumab improves clinical symptoms in children with Netherton syndrome by suppressing Th2-mediated inflammation 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1054422 PMID:36569942	研究论文	本文评估了dupilumab（一种IL-4Rα拮抗剂）在Netherton综合征患儿中的临床反应，并研究了Th1/2/17通路活性和皮肤屏障缺陷蛋白LEKTI表达的变化。	首次评估了dupilumab在Netherton综合征患儿中的疗效，并详细分析了其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。	研究样本量较小，仅包括四名患儿，且未观察到LEKTI蛋白表达的显著变化。	评估dupilumab在Netherton综合征患儿中的临床效果，并探讨其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。	四名患有严重Netherton综合征的儿童。	NA	Netherton综合征	流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化分析	NA	血液，皮肤组织	4名患儿
1093	2024-08-08	The single-cell landscape of cystic echinococcosis in different stages provided insights into endothelial and immune cell heterogeneity 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.1067338 PMID:36569953	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同阶段细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞，揭示了疾病进展中的免疫细胞和内皮细胞异质性	首次发现具有感染阶段特异性的SPP1+巨噬细胞，并深入探讨了其在晚期感染阶段与血管生成和免疫逃避机制的关系	NA	探究细粒棘球蚴病生态系统，特别是晚期感染阶段的血管生成和免疫逃避机制	细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞	数字病理学	寄生虫病	单细胞RNA测序	NA	转录组	45,199个细胞，来自感染1、3、6个月及未感染的野生型小鼠肝脏样本（两份重复）
1094	2024-08-08	OPA1 supports mitochondrial dynamics and immune evasion to CD8+ T cell in lung adenocarcinoma 2022, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.14543 PMID:36573240	研究论文	本研究探讨了OPA1在非小细胞肺癌细胞中线粒体融合和免疫逃逸中的作用	发现OPA1和MFN1的拷贝数扩增在肺癌组织中高度共现，并且OPA1的高表达与不良预后相关	NA	研究OPA1在非小细胞肺癌中的作用及其分子机制	OPA1在非小细胞肺癌细胞中的作用	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	多组学数据	肺癌组织样本
1095	2024-08-08	A high-efficiency PEG-Ca2+-mediated transient transformation system for broccoli protoplasts 2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2022.1081321 PMID:36578340	研究论文	本研究通过优化质粒浓度、PEG4000质量浓度和基因型选择等关键因素，建立了一种高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，并建立了高效通用的西兰花原生质体分离系统。	本研究建立了高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，能够可靠地获得高活性的原生质体，为国际前沿研究领域如单细胞测序、空间转录组学、植物体细胞杂交、基因功能分析和亚细胞定位提供了重要的技术支持。	NA	研究基因功能、亚细胞定位和植物形态发育。	西兰花原生质体。	植物学	NA	瞬时转化技术	NA	原生质体	使用三种不同基因型的西兰花子叶，原生质体产量超过5×10/mL/g，活性超过95%。
1096	2024-08-08	Mechanisms of Panax Ginseng on Treating Sepsis by RNA-Seq Technology 2022, Infection and drug resistance IF:2.9Q2 DOI:10.2147/IDR.S393654 PMID:36582454	研究论文	本研究利用网络药理学和RNA-seq技术探讨人参治疗脓毒症的潜在活性靶点和机制	通过RNA-seq分析和网络药理学方法，首次揭示了人参中的特定成分如何通过调节关键基因的表达来影响脓毒症的治疗	研究主要基于数据库分析和RNA-seq数据，未来需要更多的临床试验来验证这些发现	探索人参在治疗脓毒症中的作用机制	脓毒症患者和健康志愿者的外周血	NA	脓毒症	RNA-seq	NA	RNA	4521个与脓毒症相关的基因，86个人参活性成分及其294个活性靶点
1097	2024-08-08	Identification of PTPN22 as a potential genetic biomarker for abdominal aortic aneurysm 2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2022.1061771 PMID:36588574	研究论文	本文通过综合生物信息学和细胞模型验证，揭示了PTPN22基因作为腹主动脉瘤潜在的遗传生物标志物	首次发现PTPN22基因在腹主动脉瘤患者中的表达上调，并验证了其在细胞模型中的表达增加	研究仅限于临床样本和细胞模型，未涉及更大规模的人群验证	识别腹主动脉瘤的遗传生物标志物，以预测高风险人群	PTPN22基因及其在腹主动脉瘤中的表达	遗传学	腹主动脉瘤	综合生物信息学分析，单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自腹主动脉瘤患者的主动脉组织和外周血单个核细胞
1098	2024-08-08	Potential biomarkers and immune cell infiltration involved in aortic valve calcification identified through integrated bioinformatics analysis 2022, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2022.944551 PMID:36589450	研究论文	通过综合生物信息学分析，识别与主动脉瓣钙化相关的潜在生物标志物和免疫细胞浸润	识别了SCG2和CCL19作为主动脉瓣钙化的新型潜在生物标志物，并探讨了它们与免疫细胞类型的关系	NA	深入理解主动脉瓣钙化的发病机制，并为未来的诊断和免疫治疗提供有价值的信息	主动脉瓣钙化疾病及其潜在的生物标志物和免疫细胞浸润	数字病理学	心血管疾病	机器学习算法（LASSO和SVM-RFE），CIBERSORT算法	NA	基因表达数据，单细胞测序数据，免疫组织化学染色数据	使用了三个公开的基因表达数据集（GSE12644，GSE51472，GSE77287）和一个外部数据集（GSE83453），以及单细胞测序数据集（SRP222100）和人类临床组织样本
1099	2024-08-08	Cellular features of localized microenvironments in human meniscal degeneration: a single-cell transcriptomic study 2022-12-22, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.79585 PMID:36548025	研究论文	本研究通过单细胞转录组学方法构建了健康和退化的人类半月板样本的细胞图谱，以探索半月板微环境的稳态及其在退化过程中的变化	研究发现了与退化相关的新型软骨细胞亚型，并提出了一个可能的退化机制模型	NA	揭示半月板退化的细胞机制	人类半月板的健康和退化样本	数字病理学	骨关节炎	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	12个健康或退化的半月板样本，来自8名患者
1100	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing of immune cells in patients with acute gout 2022-12-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-25871-2 PMID:36550178	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学工具，分析了急性痛风患者血液和关节液中的免疫细胞亚群及其基因特征	首次详细描述了急性痛风患者血液和关节液中免疫细胞亚群的组成和相互作用	样本量较小，仅包括五名健康受试者和七名急性痛风患者	揭示痛风患者免疫细胞的分子和细胞学特征，为痛风治疗提供指导	急性痛风患者的血液和关节液中的免疫细胞亚群	数字病理学	痛风	单细胞RNA测序	NA	基因数据	五名健康受试者和七名急性痛风患者