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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-08-07 |
4D imaging analysis of the aging mouse neural stem cell niche reveals a dramatic loss of progenitor cell dynamism regulated by the RHO-ROCK pathway
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.007
PMID:35030320
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research paper | 研究通过4D成像分析老龄小鼠神经干细胞微环境,揭示了由RHO-ROCK通路调控的前体细胞动态活性的显著丧失 | 首次使用活体时间流逝成像结合计算机图像分析,探讨了年轻和老龄小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为,并发现RHO-ROCK信号通路在调控这些细胞运动和相互作用中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为及其与年龄相关的变化 | 神经干细胞(NSCs)和过渡放大前体(TAP)细胞的动态行为 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序(RNA-seq) | NA | 图像 | 年轻和老龄的转基因小鼠V-SVZ全装片 | NA | NA | NA | NA |
| 1062 | 2024-08-07 |
CellMeSH: probabilistic cell-type identification using indexed literature
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab834
PMID:34893819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMeSH的新自动化方法,用于基于先前文献识别细胞类型 | CellMeSH结合了基因-细胞类型关联数据库与概率方法进行数据库查询,相比手动构建的数据库更全面且易于更新 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化单细胞RNA测序实验中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 概率方法 | 文本 | 多个小鼠和人类数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1063 | 2024-08-07 |
Temporal analyses of postnatal liver development and maturation by single-cell transcriptomics
2022-02-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.01.004
PMID:35134346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了小鼠出生后1、3、7、21和56天的肝脏发育和成熟过程 | 首次揭示了发育中肝脏内肝细胞的高度异质性以及从中心到门静脉肝细胞的代谢功能分区的逐步构建过程 | NA | 深入理解肝脏在出生后的发育和成熟过程 | 小鼠出生后不同时间点的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 52,834个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1064 | 2024-08-07 |
Biologic correlates of beneficial convalescent plasma therapy in a COVID-19 patient reveal disease resolution mechanisms
2022-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.02.03.22269612
PMID:35132422
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研究论文 | 本研究报告了一例由于恢复期血浆输注导致严重COVID-19完全缓解的病例,并通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析,揭示了与疾病从严重到无病状态过渡相关的关键生物学过程。 | 本研究首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析,揭示了恢复期血浆治疗COVID-19患者后,疾病缓解的生物学机制。 | 本研究仅基于单一病例,可能缺乏广泛的代表性,需要更多病例验证研究结果。 | 探究恢复期血浆治疗COVID-19的生物学机制及其在疾病缓解中的作用。 | 严重COVID-19患者及其恢复期血浆治疗后的生物学变化。 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 1065 | 2024-08-07 |
Enhancing CDK4/6 inhibitor therapy for medulloblastoma using nanoparticle delivery and scRNA-seq-guided combination with sapanisertib
2022-Jan-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5838
PMID:35080986
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研究论文 | 研究通过纳米颗粒递送和单细胞RNA测序指导的组合疗法,增强CDK4/6抑制剂对髓母细胞瘤的治疗效果 | 使用纳米颗粒封装减少药物毒性,改善中枢神经系统药代动力学,并通过单细胞RNA测序分析识别新的联合治疗策略 | 尽管延长了生存期,但复发问题仍未完全解决 | 探索提高CDK4/6抑制剂治疗髓母细胞瘤效果的新方法 | 髓母细胞瘤及其治疗 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用基因工程小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1066 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.005
PMID:35158099
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析,揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 | 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观,并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 | NA | 旨在通过单细胞分析,定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化,以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 | 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1067 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境,揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用,扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1068 | 2024-08-07 |
Age-Dependent Changes in the Plasma and Brain Pharmacokinetics of Amyloid-β Peptides and Insulin
2022, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-215128
PMID:34924382
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研究论文 | 研究年龄对小鼠血浆和脑中Aβ肽和胰岛素药代动力学的影响 | 首次探讨了年龄对Aβ同工型和胰岛素在血浆药代动力学和脑内流入的差异性影响,以及这种影响如何潜在增加阿尔茨海默病风险 | NA | 识别年龄相关的小鼠血浆分布和血脑屏障(BBB)中Aβ肽和胰岛素的转运变化 | 野生型(WT)和阿尔茨海默病转基因(APP/PS1)小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 不同年龄的野生型(WT)和APP/PS1转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1069 | 2024-08-07 |
Don't you forget about me(gakaryocytes)
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009302
PMID:34582554
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综述 | 本文综述了巨核细胞(MKs)在骨髓中的复杂分化过程及其在血小板生成和骨髓稳态中的多重功能 | 文章提出了巨核细胞不仅作为血小板前体,还可能通过细胞膜出芽和在远端器官如肺或肝脏中产生血小板,并参与骨髓稳态的维持 | NA | 探讨巨核细胞在体外和体内形成血小板前体的机制,并批判性地讨论巨核细胞作为免疫调节细胞的假设 | 巨核细胞及其在血小板生成和骨髓稳态中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自成人和胎儿骨髓及肺的巨核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1070 | 2024-08-07 |
Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer
2022-Sep-30, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0036
PMID:35983702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在解析癌症细胞衰老相关基因表达异质性中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了癌症细胞中衰老相关基因表达的多样性及其在肿瘤恶性转化中的作用 | NA | 探讨衰老细胞在肿瘤恶性转化中的作用及衰老相关基因在肿瘤微环境中的功能 | 癌症细胞及肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1071 | 2024-08-07 |
IL-13-programmed airway tuft cells produce PGE2, which promotes CFTR-dependent mucociliary function
2022-07-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159832
PMID:35608904
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研究论文 | 本文研究了IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响,发现IL-13能扩展和编程气道簇细胞向前列腺素E2代谢,进而促进囊性纤维化跨膜传导调节因子依赖的纤毛功能。 | 首次揭示了气道簇细胞在过敏性气道中调节上皮纤毛功能的作用。 | NA | 探讨IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响及其对纤毛功能的作用。 | 气道簇细胞及其在2型炎症中的作用。 | NA | 呼吸道疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用大量和单细胞RNA测序分析气道上皮和鼠模型。 | NA | NA | NA | NA |
| 1072 | 2024-08-07 |
Trophoblast Cell Subtypes and Dysfunction in the Placenta of Individuals with Preeclampsia Revealed by Single‑Cell RNA Sequencing
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0211
PMID:35289305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型及其功能异常的转录组变化 | 首次在单细胞水平上比较了健康对照组和先兆子痫组胎盘中滋养层细胞的转录组差异,并分析了相关的转录因子调控网络 | 研究主要集中在转录组水平,未涉及蛋白质水平或其他层面的功能验证 | 探究先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型的特异性转录组变化及其功能 | 胎盘组织中的滋养层细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,006个细胞,包括11种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 1073 | 2024-08-07 |
Gene Expression Profiling of the Habenula in Rats Exposed to Chronic Restraint Stress
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.2257
PMID:35534192
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研究论文 | 本研究通过基因组范围的基因表达分析,研究了暴露于慢性束缚应激下的大鼠缰核的转录组变化 | 本研究首次识别了379个受慢性应激影响的差异表达基因(DEGs),并分析了这些基因在神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、昼夜节律同步和突触信号传导中的富集情况 | NA | 探讨慢性应激对大鼠缰核基因表达的影响及其在抑郁症发病机制中的作用 | 大鼠缰核的基因表达 | 神经科学 | 抑郁症 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 14天慢性束缚应激暴露的大鼠缰核样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1074 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Infection Induces Ferroptosis of Sinoatrial Node Pacemaker Cells
2022-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320518
PMID:35255712
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响,特别是通过仓鼠模型和人类胚胎干细胞(hESC)衍生的类似窦房结(SAN)起搏细胞进行研究。 | 本文首次展示了SARS-CoV-2可以直接感染心脏的主要起搏细胞,并诱导铁死亡,这是一种可能导致COVID-19患者心律失常的机制。 | 由于难以分离和培养人类SAN细胞,研究主要依赖于仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 探索SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响,并寻找保护这些细胞免受感染的药物。 | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 定量实时聚合酶链反应、免疫染色、单细胞RNA测序和高含量化学筛选。 | NA | RNA | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 1075 | 2024-08-07 |
Long read single cell RNA sequencing reveals the isoform diversity of Plasmodium vivax transcripts
2022-12, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010991
PMID:36525464
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研究论文 | 本研究利用Pacific Biosciences化学方法对单细胞寄生虫进行scRNA-seq库测序,以表征全长Plasmodium vivax转录本 | 首次使用长读长测序技术在单细胞水平上表征Plasmodium vivax的转录本多样性 | NA | 旨在揭示Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | 测序技术 | 疟疾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Pacific Biosciences(PacBio)化学 | NA | 转录组数据 | 多个单细胞寄生虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1076 | 2024-08-07 |
Engineering a niche supporting hematopoietic stem cell development using integrated single-cell transcriptomics
2022-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28781-z
PMID:35332125
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了从胚胎动脉血管中的造血内皮细胞向造血干细胞过渡的转录组特征,并识别了支持造血干细胞成熟和自我更新的信号分子。 | 本文通过伪时间排序揭示了造血内皮细胞向造血干细胞过渡过程中的基因表达动态,并识别了特定表达于发育中的造血干细胞的表面受体及其相应的配体。 | NA | 研究造血干细胞发育所需的信号交互作用,并推进造血干细胞在治疗应用中的工程化目标。 | 造血干细胞(HSCs)及其发育过程中的信号分子。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎动脉血管区域(AGM)来源的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1077 | 2024-08-07 |
SCIFER: approach for analysis of LINE-1 mRNA expression in single cells at a single locus resolution
2022-Aug-26, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-022-00276-0
PMID:36028901
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研究论文 | 介绍了一种名为SCIFER的方法,用于在单细胞RNA测序数据集中以单个位点分辨率量化移动元素的表达 | SCIFER通过唯一地比对单细胞RNA测序读取到基因组并提取单细胞的比对,提高了L1位点识别的准确性 | NA | 研究L1 mRNA在单细胞中的表达模式,特别是在单个位点分辨率下 | L1 mRNA在单细胞中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自人类和小鼠的睾丸的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2024-08-07 |
ESR1 mutant breast cancers show elevated basal cytokeratins and immune activation
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29498-9
PMID:35440136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1079 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human pancreatic islets reveals novel cellular states in type 1 diabetes
2022-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00531-x
PMID:35228745
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析,研究了人类胰腺胰岛在1型糖尿病中的细胞状态 | 开发了一种先进的综合分析策略,用于评估胰腺胰岛并识别典型细胞类型 | NA | 揭示1型糖尿病中胰腺胰岛的新细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组学、飞行时间流式细胞术、原位成像质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 24名1型糖尿病、自身抗体阳性和非糖尿病器官捐赠者的胰腺胰岛 | NA | NA | NA | NA |
| 1080 | 2024-08-07 |
Tipping the balance between erythroid cell differentiation and induction of anemia in response to the inflammatory pathology associated with chronic trypanosome infections
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1051647
PMID:36420267
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研究论文 | 本研究通过筛选10个不同毒力的野外分离株,建立了一个模拟慢性动物锥虫病的实验疾病模型,并深入分析了脾脏巨噬细胞在调节脾脏髓外造血中的作用。 | 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞(TRMs)在调节脾脏髓外造血中的双重作用,并展示了在慢性感染过程中,巨噬细胞激活状态的复杂性。 | NA | 研究慢性锥虫感染引起的炎症病理与红细胞分化及贫血诱导之间的平衡。 | 慢性锥虫感染的实验模型及脾脏巨噬细胞在其中的作用。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个不同毒力的野外分离株 | NA | NA | NA | NA |