单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Identifies Drug-Resistance Signature and Immunosuppressive Microenvironment in Metastatic Small Cell Lung Cancer (Advanced Genetics 2/03)
2022-Jun, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202270021
PMID:36618025
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了转移性小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | NA | 揭示小细胞肺癌中的药物抗性特征和免疫抑制微环境 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1062 | 2024-08-08 |
Appropriate level of cuproptosis may be involved in alleviating pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1039510
PMID:36601107
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研究论文 | 本研究探讨了铜死亡与肺纤维化之间的关系，并发现适当的铜死亡水平可能有助于抑制肺纤维化 | 首次揭示铜死亡与纤维化之间的负相关关系 | NA | 探索铜死亡与肺纤维化之间的关系 | 人类和小鼠的肺纤维化单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的肺纤维化样本 |
| 1063 | 2024-08-08 |
Obeticholic acid and 5β-cholanic acid 3 exhibit anti-tumor effects on liver cancer through CXCL16/CXCR6 pathway
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1095915
PMID:36605219
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研究论文 | 本研究通过分析人肝细胞癌单细胞RNA测序数据，验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并探讨了obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用在此过程中的作用 | 首次在人体中验证了CXCL16/CXCR6通路在肝癌中的抗肿瘤作用，并发现obeticholic acid和5β-cholanic acid 3的联合使用具有显著的肿瘤抑制效果 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和动物模型，尚未在临床试验中得到验证 | 探讨CXCL16/CXCR6通路在肝细胞癌中的作用及潜在的免疫治疗策略 | 肝细胞癌及其相关细胞和分子机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 1064 | 2024-08-08 |
Necroptosis-related lncRNAs: Combination of bulk and single-cell sequencing reveals immune landscape alteration and a novel prognosis stratification approach in lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1010976
PMID:36605426
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研究论文 | 本研究通过结合批量和单细胞测序技术，构建了一种基于坏死相关长非编码RNA风险评分（NecroLRS）和临床病理参数的预测模型，用于肺腺癌的预后分层和免疫微环境改变的研究 | 首次揭示了坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用，并提出了一种新的基于K-means聚类的分层算法，用于从单细胞角度解析坏死在肺腺癌预后中的机制 | NA | 探索坏死相关长非编码RNA在肺腺癌预后中的作用及其对免疫微环境的影响 | 肺腺癌患者的预后分层和免疫微环境改变 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 批量测序和单细胞测序 | K-means聚类 | RNA | 4个人类肺腺癌细胞系 |
| 1065 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals that SAA1+ epithelial cells promote distant metastasis of esophageal squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1099271
PMID:36605443
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）中SAA1+上皮细胞的新亚群，该亚群与ESCC的远处转移密切相关。 | 发现了ESCC中一种新的SAA1+恶性细胞亚群，该亚群具有高度侵袭性并关联ESCC的远处转移。 | NA | 探索ESCC肿瘤组织的异质性及寻找具有特殊生物学功能的ESCC新亚群。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的SAA1+上皮细胞。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | 预测模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1066 | 2024-08-08 |
NR4A2 may be a potential diagnostic biomarker for myocardial infarction: A comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1061800
PMID:36618351
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了NR4A2作为心肌梗死潜在诊断生物标志物的可能性 | 首次通过免疫浸润分析和疾病本体富集分析，确定了NR4A2在心肌梗死诊断中的重要价值 | 仅使用了一个数据集进行模型准确性测试，可能需要更多数据集验证 | 旨在预测和验证心肌梗死诊断的关键基因 | 心肌梗死及其诊断生物标志物 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE66360数据集，包含335个差异表达基因 |
| 1067 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to dissect the immunological network of liver fibrosis in Schistosoma japonicum-infected mice
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.980872
PMID:36618421
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫机制 | 首次应用单细胞测序技术解析日本血吸虫感染小鼠肝纤维化的免疫网络 | 样本量较小，仅包括一只感染小鼠和一只正常小鼠 | 深入理解日本血吸虫感染导致的肝纤维化机制 | 日本血吸虫感染小鼠的肝纤维化过程 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1只感染小鼠和1只正常小鼠 |
| 1068 | 2024-08-08 |
Neurogenesis potential of oligodendrocyte precursor cells from oligospheres and injured spinal cord
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.1049562
PMID:36619671
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研究论文 | 本研究探讨了从寡球体和受损脊髓中提取的少突胶质前体细胞（OPCs）的神经发生潜力 | 首次发现OPCs参与寡球体的形成，并能进一步分化为类神经细胞，以及在寡球体分化过程中检测到少突胶质细胞和神经细胞的中间状态 | NA | 研究OPCs在受损髓鞘再生中的神经发生潜力及其机制 | 少突胶质前体细胞（OPCs）及其在脊髓损伤后的分化和神经发生潜力 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），生物信息学分析，免疫荧光染色，分子实验 | NA | RNA | 幼年和成年小鼠的脊髓损伤模型 |
| 1069 | 2024-08-08 |
Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols
2022-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09014-5
PMID:36581800
|
研究论文 | 本文评估了四种基于板的全长转录单细胞mRNA测序协议的性能 | 首次对四种不同板基单细胞RNA测序协议进行性能评估，特别是针对高基因检测灵敏度、样本间重复性和最小操作时间 | 仅评估了四种特定的板基单细胞RNA测序协议，未涉及其他类型的测序技术 | 评估不同单细胞mRNA测序协议在临床应用中的性能 | 四种基于板的单细胞RNA测序协议 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1070 | 2024-08-08 |
Lack of evidence for increased transcriptional noise in aged tissues
2022-12-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80380
PMID:36576247
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研究论文 | 本文通过开发新的计算工具和分析方法，研究了衰老组织中转录噪音的变化，并发现转录噪音的增加并非衰老的普遍特征 | 开发了新的计算工具和方法来量化衰老相关的转录噪音，并分析了细胞类型特异性的转录噪音变化 | 研究仅限于分析已有的单细胞RNA测序数据集，可能未能涵盖所有类型的组织和细胞 | 探究衰老组织中转录噪音的变化是否为衰老的基本特征 | 衰老组织中的转录噪音变化及细胞类型特异性的转录噪音变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 七个衰老数据集 |
| 1071 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing revealed the liver heterogeneity between egg-laying duck and ceased-laying duck
2022-Dec-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09089-0
PMID:36577943
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了产蛋期和停蛋期鸭肝脏细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了产蛋期和停蛋期鸭肝脏细胞的异质性，并发现了与产蛋和停蛋相关的特定基因表达模式 | NA | 探究产蛋期和停蛋期鸭肝脏的分子机制 | 产蛋期和停蛋期鸭的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20,000个单细胞 |
| 1072 | 2024-08-08 |
Dissecting the fate of Foxl2-expressing cells in fetal ovary using lineage tracing and single-cell transcriptomics
2022-Dec-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00492-1
PMID:36575161
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学分析了胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞的命运 | 首次揭示了Foxl2表达细胞在XX性腺中具有多能性，并且theca-interstitial细胞来源于不同的前体细胞 | NA | 研究胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞在性分化后的命运 | 胎儿卵巢中表达Foxl2的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1073 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies murine heart molecular features at embryonic and neonatal stages
2022-12-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35691-7
PMID:36575170
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research paper | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了小鼠心脏在胚胎早期到新生儿晚期的转录特征 | 首次全面捕捉了小鼠心脏发育过程中各阶段的转录组变化，填补了以往研究的空白 | NA | 研究小鼠心脏在胚胎和新生儿阶段的分子特征 | 小鼠心脏的转录组特征 | digital pathology | NA | single-cell sequencing | NA | transcriptomic data | 涉及小鼠心脏从早期胚胎到晚期新生儿的多个阶段 |
| 1074 | 2024-08-08 |
Non-negative low-rank representation based on dictionary learning for single-cell RNA-sequencing data analysis
2022-Dec-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-09027-0
PMID:36564711
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研究论文 | 本文提出了一种基于字典学习的非负低秩表示方法（DLNLRR），用于单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别 | DLNLRR方法能够在优化过程中更新字典，实现字典学习和低秩表示学习的同时进行，并且不依赖于谱聚类算法，可以直接基于低秩矩阵进行聚类 | NA | 有效且准确地从大量细胞混合物中识别细胞集群 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示 | 数据矩阵 | 大量真实单细胞数据集 |
| 1075 | 2024-08-08 |
Identification of cellular heterogeneity and key signaling pathways associated with vascular remodeling and calcification in young and old primate aortas based on single-cell analysis
2022-12-23, Aging
DOI:10.18632/aging.204442
PMID:36566020
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析年轻和老年猴主动脉中血管内皮细胞和平滑肌细胞的异质性，并识别与血管重塑和钙化相关的关键信号通路 | 识别了与血管重塑和钙化相关的新型内皮细胞亚群，并分析了随年龄变化的细胞通讯及相关的信号通路 | NA | 旨在理解血管壁细胞异质性及细胞亚群间通讯变化在衰老过程中的作用，以预防与年龄相关的心血管疾病 | 年轻和老年猴的主动脉 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 年轻和老年猴的主动脉样本 |
| 1076 | 2024-08-08 |
Distance covariance entropy reveals primed states and bifurcation dynamics in single-cell RNA-Seq data
2022-Dec-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105709
PMID:36578319
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DICE的计算方法，用于分析单细胞RNA-Seq数据中的表达协变熵模式，以揭示细胞命运转变中的启动状态和分支动态 | DICE方法能够仅使用单细胞RNA-Seq数据预测多能启动状态及其调控因子，并在后续验证中使用单细胞表观基因组数据 | NA | 研究细胞命运转变过程，特别是启动状态和分支动态 | 单细胞RNA-Seq数据中的细胞命运转变 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-Seq数据 | NA |
| 1077 | 2024-08-08 |
Downregulation of the Protein C Signaling System Is Associated with COVID-19 Hypercoagulability-A Single-Cell Transcriptomics Analysis
2022-12-09, Viruses
DOI:10.3390/v14122753
PMID:36560757
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了COVID-19患者肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮中蛋白C信号系统的表达变化，发现蛋白C及其下游信号级联成分在COVID-19患者中下调，可能与COVID-19的高凝状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析了COVID-19患者中蛋白C信号系统的表达变化，揭示了蛋白C在COVID-19高凝状态中的潜在机制作用。 | 研究样本仅来自COVID-19 Cell Atlas数据库，可能存在样本选择偏倚；未详细说明数据分析的具体方法和统计学意义。 | 探索COVID-19相关凝血病中蛋白C信号网络的潜在表达变化。 | COVID-19患者的肝脏、外周血单个核细胞和鼻上皮。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 1078 | 2024-08-08 |
Isolation of Nuclei from Flash-frozen Liver Tissue for Single-cell Multiomics
2022-12-09, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64792
PMID:36571404
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研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻保存的肝脏组织中分离细胞核的稳健且可重复的协议 | 该方法能够产生高质量的细胞核，适用于下游单细胞组学方法，如单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq）以及多模态组学（联合RNA-seq和ATAC-seq） | NA | 研究肝脏在健康和疾病状态下的单细胞分辨率特征 | 从健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物冷冻肝脏样本中分离的细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序（ATAC-seq） | NA | 细胞核 | 涉及健康和疾病的人类、小鼠和非人类灵长类动物的冷冻肝脏样本 |
| 1079 | 2024-08-08 |
Improved Macrophage Enrichment from Mouse Skeletal Muscle
2022-Dec-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4561
PMID:36561115
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研究论文 | 本文详细描述了一种从年轻和老年小鼠骨骼肌中分离CD45/CD11b巨噬细胞富集细胞的优化方法 | 提出了一种新的方法来高效分离骨骼肌中的巨噬细胞，具有足够的纯度和产量，适用于各种下游分析 | NA | 研究骨骼肌中巨噬细胞的功能及其在骨骼肌老化中的作用 | 小鼠骨骼肌中的巨噬细胞 | NA | NA | 流式细胞术分析，荧光激活细胞分选(FACS)，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的骨骼肌巨噬细胞 |
| 1080 | 2024-08-08 |
Multicenter dose-escalation Phase I trial of mitomycin C pressurized intraperitoneal aerosolized chemotherapy in combination with systemic chemotherapy for appendiceal and colorectal peritoneal metastases: rationale and design
2022-Dec, Pleura and peritoneum
IF:1.4Q3
DOI:10.1515/pp-2022-0116
PMID:36560966
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research paper | 本研究旨在进行一项多中心剂量递增的I期试验，评估米托蒽醌加压腹腔内气雾化疗（MMC-PIPAC）与系统化疗（FOLFIRI）联合治疗阑尾癌或结直肠癌腹膜转移的效果 | MMC-PIPAC是一种治疗腹膜转移的微创方法，本研究将探索其与系统化疗联合使用的推荐剂量和安全性 | NA | 确定MMC-PIPAC与FOLFIRI联合使用的推荐剂量，并评估其早期疗效信号 | 阑尾癌或结直肠癌腹膜转移患者 | NA | colorectal cancer | PIPAC | NA | blood and tissue specimens | 21名可评估患者 |