单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2024-08-08 |
Pyruvate: Ferredoxin oxidoreductase is involved in IgA-related microbiota dysbiosis and intestinal inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040774
PMID:36569858
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸脱氢酶：铁氧还蛋白氧化还原酶（PFOR）在免疫球蛋白A（IgA）相关微生物失调和肠道炎症中的作用 | 首次发现PFOR作为IgA结合抗原，可能参与宿主与微生物的相互作用 | NA | 研究PFOR在炎症性肠病（IBD）中的作用及其对宿主-微生物相互作用的影响 | 炎症性肠病患者、兔子模型以及PFOR蛋白 | NA | 炎症性肠病 | 16S rDNA测序、酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白质印迹、质谱分析、单细胞测序 | NA | 微生物群落数据、免疫球蛋白A数据、蛋白质数据 | 炎症性肠病患者样本、兔子模型 |
| 1062 | 2024-08-08 |
Identification of B cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic model and identify immune infiltration in osteosarcoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1026701
PMID:36569871
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序结果，识别B细胞标记基因，并建立预测骨肉瘤预后的模型，同时分析免疫浸润差异。 | 首次通过单细胞测序技术识别B细胞标记基因，并建立了一个具有良好预测性能的骨肉瘤预后模型。 | NA | 探讨B细胞在骨肉瘤预后和免疫浸润中的作用。 | B细胞标记基因、骨肉瘤预后模型及免疫浸润差异。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 261个B细胞标记基因 |
| 1063 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptome analysis of the tumor ecosystems underlying cervical cancer metastasis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.966291
PMID:36569924
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的转录组特征，揭示了宫颈癌淋巴结转移的分子机制 | 首次详细描述了宫颈癌淋巴结转移中上皮细胞和肿瘤微环境的转录组变化，特别是细胞周期、免疫反应相关信号通路和癌症相关成纤维细胞的作用 | 研究仅限于转录组分析，未涉及更深层次的分子机制或其他类型的生物标志物 | 探究宫颈癌淋巴结转移的分子机制 | 宫颈癌原发肿瘤、阳性淋巴结和阴性淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 51,507个单细胞 |
| 1064 | 2024-08-08 |
Dupilumab improves clinical symptoms in children with Netherton syndrome by suppressing Th2-mediated inflammation
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1054422
PMID:36569942
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研究论文 | 本文评估了dupilumab（一种IL-4Rα拮抗剂）在Netherton综合征患儿中的临床反应，并研究了Th1/2/17通路活性和皮肤屏障缺陷蛋白LEKTI表达的变化。 | 首次评估了dupilumab在Netherton综合征患儿中的疗效，并详细分析了其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 研究样本量较小，仅包括四名患儿，且未观察到LEKTI蛋白表达的显著变化。 | 评估dupilumab在Netherton综合征患儿中的临床效果，并探讨其对Th2介导的炎症和皮肤屏障功能的影响。 | 四名患有严重Netherton综合征的儿童。 | NA | Netherton综合征 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 血液，皮肤组织 | 4名患儿 |
| 1065 | 2024-08-08 |
The single-cell landscape of cystic echinococcosis in different stages provided insights into endothelial and immune cell heterogeneity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1067338
PMID:36569953
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同阶段细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞，揭示了疾病进展中的免疫细胞和内皮细胞异质性 | 首次发现具有感染阶段特异性的SPP1+巨噬细胞，并深入探讨了其在晚期感染阶段与血管生成和免疫逃避机制的关系 | NA | 探究细粒棘球蚴病生态系统，特别是晚期感染阶段的血管生成和免疫逃避机制 | 细粒棘球蚴感染小鼠肝脏样本中的免疫和内皮细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 45,199个细胞，来自感染1、3、6个月及未感染的野生型小鼠肝脏样本（两份重复） |
| 1066 | 2024-08-08 |
OPA1 supports mitochondrial dynamics and immune evasion to CD8+ T cell in lung adenocarcinoma
2022, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.14543
PMID:36573240
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研究论文 | 本研究探讨了OPA1在非小细胞肺癌细胞中线粒体融合和免疫逃逸中的作用 | 发现OPA1和MFN1的拷贝数扩增在肺癌组织中高度共现，并且OPA1的高表达与不良预后相关 | NA | 研究OPA1在非小细胞肺癌中的作用及其分子机制 | OPA1在非小细胞肺癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 肺癌组织样本 |
| 1067 | 2024-08-08 |
A high-efficiency PEG-Ca2+-mediated transient transformation system for broccoli protoplasts
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.1081321
PMID:36578340
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研究论文 | 本研究通过优化质粒浓度、PEG4000质量浓度和基因型选择等关键因素，建立了一种高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，并建立了高效通用的西兰花原生质体分离系统。 | 本研究建立了高效的西兰花原生质体瞬时转化系统，能够可靠地获得高活性的原生质体，为国际前沿研究领域如单细胞测序、空间转录组学、植物体细胞杂交、基因功能分析和亚细胞定位提供了重要的技术支持。 | NA | 研究基因功能、亚细胞定位和植物形态发育。 | 西兰花原生质体。 | 植物学 | NA | 瞬时转化技术 | NA | 原生质体 | 使用三种不同基因型的西兰花子叶，原生质体产量超过5×10/mL/g，活性超过95%。 |
| 1068 | 2024-08-08 |
Mechanisms of Panax Ginseng on Treating Sepsis by RNA-Seq Technology
2022, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S393654
PMID:36582454
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研究论文 | 本研究利用网络药理学和RNA-seq技术探讨人参治疗脓毒症的潜在活性靶点和机制 | 通过RNA-seq分析和网络药理学方法，首次揭示了人参中的特定成分如何通过调节关键基因的表达来影响脓毒症的治疗 | 研究主要基于数据库分析和RNA-seq数据，未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探索人参在治疗脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血 | NA | 脓毒症 | RNA-seq | NA | RNA | 4521个与脓毒症相关的基因，86个人参活性成分及其294个活性靶点 |
| 1069 | 2024-08-08 |
Identification of PTPN22 as a potential genetic biomarker for abdominal aortic aneurysm
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1061771
PMID:36588574
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研究论文 | 本文通过综合生物信息学和细胞模型验证，揭示了PTPN22基因作为腹主动脉瘤潜在的遗传生物标志物 | 首次发现PTPN22基因在腹主动脉瘤患者中的表达上调，并验证了其在细胞模型中的表达增加 | 研究仅限于临床样本和细胞模型，未涉及更大规模的人群验证 | 识别腹主动脉瘤的遗传生物标志物，以预测高风险人群 | PTPN22基因及其在腹主动脉瘤中的表达 | 遗传学 | 腹主动脉瘤 | 综合生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自腹主动脉瘤患者的主动脉组织和外周血单个核细胞 |
| 1070 | 2024-08-08 |
Potential biomarkers and immune cell infiltration involved in aortic valve calcification identified through integrated bioinformatics analysis
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.944551
PMID:36589450
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研究论文 | 通过综合生物信息学分析，识别与主动脉瓣钙化相关的潜在生物标志物和免疫细胞浸润 | 识别了SCG2和CCL19作为主动脉瓣钙化的新型潜在生物标志物，并探讨了它们与免疫细胞类型的关系 | NA | 深入理解主动脉瓣钙化的发病机制，并为未来的诊断和免疫治疗提供有价值的信息 | 主动脉瓣钙化疾病及其潜在的生物标志物和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 机器学习算法（LASSO和SVM-RFE），CIBERSORT算法 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据，免疫组织化学染色数据 | 使用了三个公开的基因表达数据集（GSE12644，GSE51472，GSE77287）和一个外部数据集（GSE83453），以及单细胞测序数据集（SRP222100）和人类临床组织样本 |
| 1071 | 2024-08-08 |
Cellular features of localized microenvironments in human meniscal degeneration: a single-cell transcriptomic study
2022-12-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79585
PMID:36548025
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法构建了健康和退化的人类半月板样本的细胞图谱，以探索半月板微环境的稳态及其在退化过程中的变化 | 研究发现了与退化相关的新型软骨细胞亚型，并提出了一个可能的退化机制模型 | NA | 揭示半月板退化的细胞机制 | 人类半月板的健康和退化样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12个健康或退化的半月板样本，来自8名患者 |
| 1072 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of immune cells in patients with acute gout
2022-12-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-25871-2
PMID:36550178
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学工具，分析了急性痛风患者血液和关节液中的免疫细胞亚群及其基因特征 | 首次详细描述了急性痛风患者血液和关节液中免疫细胞亚群的组成和相互作用 | 样本量较小，仅包括五名健康受试者和七名急性痛风患者 | 揭示痛风患者免疫细胞的分子和细胞学特征，为痛风治疗提供指导 | 急性痛风患者的血液和关节液中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 五名健康受试者和七名急性痛风患者 |
| 1073 | 2024-08-08 |
T-cell repertoire diversity: friend or foe for protective antitumor response?
2022-Dec-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02566-0
PMID:36550555
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综述 | 本文综述了通过分析T细胞受体（TCR）库来研究自体和治疗诱导的抗肿瘤免疫反应的方法，并探讨了TCR库的多样性和克隆性与功能反应之间的关系 | 介绍了高通量下一代测序（NGS）和空间转录组学等技术突破，提供了对肿瘤免疫机制的深入见解 | 讨论了当前T细胞测序方法的优势和挑战 | 探讨TCR库的全球指标与功能反应之间的关系，以及特定TCR库对癌症患者预后或治疗反应的预测能力 | T细胞受体库的多样性和克隆性 | NA | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1074 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome reveals core cell populations and androgen-RXFP2 axis involved in deer antler full regeneration
2022-Dec-21, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-022-00153-4
PMID:36542206
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了鹿角完全再生过程中的核心细胞群和雄激素-RXFP2轴的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了鹿角组织中的细胞组成和分子事件，并发现了雄激素-RXFP2轴在鹿角再生中的潜在作用 | 目前对鹿角组织细胞组成的详细解析仍不充分，且雄激素-RXFP2轴的具体作用机制尚需进一步研究 | 揭示鹿角完全再生过程中的细胞组成和分子机制 | 鹿角的完全再生过程及其相关细胞和分子机制 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及八种细胞类型和三种核心亚群的THY1细胞 |
| 1075 | 2024-08-08 |
Robust generation of human-chambered cardiac organoids from pluripotent stem cells for improved modelling of cardiovascular diseases
2022-12-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-03215-1
PMID:36544188
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研究论文 | 本文研究了从人类多能干细胞生成具有腔室结构的心脏类器官的过程，并探讨了其在心血管疾病模型中的应用 | 首次证明了心脏前体细胞数量对类器官腔室形成的重要性，并通过单细胞RNA测序揭示了心脏类器官随时间的成熟过程 | NA | 探索心脏类器官的形成机制及其在疾病模型和药物筛选中的应用 | 人类胚胎干细胞分化的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 定量PCR，单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 涉及第8天、第14天和第21天的心脏类器官样本 |
| 1076 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics highlights immunological dysregulations of monocytes in the pathobiology of COPD
2022-Dec-20, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-022-02293-2
PMID:36539833
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中巨噬细胞的免疫调节异常 | 发现了COPD中巨噬细胞在分子水平上的改变，以及这些改变如何促进COPD的发展 | NA | 探讨COPD的病理生物学机制，特别是与衰老和吸烟相关的免疫调节异常 | COPD患者和年龄分层的对照组肺组织中的66,610个细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 共分析了110,931个细胞，包括9个个体的外部公开数据 |
| 1077 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals differential cell subpopulations and distinct phenotype transition in normal and dissected ascending aorta
2022-12-19, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-022-00584-4
PMID:36536281
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了正常和剥离升主动脉中的差异细胞亚群及独特的表型转变 | 发现了合成型血管平滑肌细胞的新标记物STEAP4，并提出了合成型血管平滑肌细胞可能通过CXCL12-CXCR4/ACKR3轴与中性粒细胞和成纤维细胞相互作用，从而恶化急性胸主动脉剥离进程的潜在机制 | NA | 研究正常和剥离升主动脉中的细胞亚群及其表型转变 | 正常和剥离升主动脉的细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括5名急性胸主动脉剥离患者和4名健康对照 |
| 1078 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptomics of cerebrospinal fluid cells in treatment-naïve multiple sclerosis
2022-Dec-19, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02667-9
PMID:36536441
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研究论文 | 本文通过整合多个多发性硬化症（MS）患者早期复发缓解型（RRMS）的脑脊液（CSF）细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，提供了一个可搜索和交互的资源，以促进多样化的可视化和分析方法。 | 本文通过整合分析验证了MS患者CSF中细胞类型的多样性和B细胞的成熟，并提供了一个易于访问的数据资源。 | 并非所有研究中的改变在所有研究中都能复制。 | 旨在通过分析CSF细胞的单细胞转录组来识别与MS相关的变化，并提供一个交互式资源以促进数据的可访问性。 | 多发性硬化症（MS）患者的脑脊液（CSF）细胞。 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个MS患者早期复发缓解型（RRMS）的CSF细胞数据集 |
| 1079 | 2024-08-08 |
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00589-x
PMID:36536457
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了在阿尔茨海默病（AD）进展中，淀粉样β（Aβ）和tau病理如何协同调节小胶质细胞亚型 | 发现了由Aβ和tau病理共同诱导的新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型，并揭示了Siglecs作为AD进展的生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 探讨Aβ和tau病理在AD进展中对小胶质细胞亚型的调控作用 | 小胶质细胞亚型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自展示Aβ和tau病理的小鼠的小胶质细胞亚型，以及来自人类额上回（SFG）和内嗅皮层（ERC）在不同Braak阶段的数据 |
| 1080 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Atlas of the Atherosclerotic Plaque in the Femoral Artery and the Heterogeneity in Macrophage Subtypes between Carotid and Femoral Atherosclerosis
2022-Dec-16, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9120465
PMID:36547462
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了人股动脉粥样硬化斑块的细胞组成，并与颈动脉粥样硬化数据进行比较，揭示了股动脉和颈动脉在细胞水平上的异质性 | 首次通过单细胞测序技术绘制了股动脉粥样硬化斑块的单细胞图谱，并比较了股动脉和颈动脉在细胞组成上的差异 | 研究仅使用了一个股动脉样本，可能无法完全代表所有股动脉斑块的细胞组成 | 揭示股动脉粥样硬化斑块的细胞组成及其与颈动脉的异质性 | 人股动脉和颈动脉的粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 一个股动脉样本和多个颈动脉样本 |