单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 4053 篇文献,本页显示第 1041 - 1060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1041 2024-08-07
Characterization of the microenvironment of diabetic foot ulcers and potential drug identification based on scRNA-seq
2022, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析糖尿病足溃疡(DFUs)的微环境,并通过机器学习算法和免疫荧光技术识别潜在的治疗药物。 首次通过单细胞RNA测序和机器学习算法详细分析了DFUs的微环境,并识别了新的潜在药物靶点。 研究主要基于已有的数据库数据,未涉及大规模的临床试验验证。 揭示糖尿病足溃疡的微环境特征并识别潜在的治疗药物。 糖尿病足溃疡的微环境和潜在药物靶点。 数字病理学 糖尿病 scRNA-seq 逻辑回归机器学习算法 单细胞RNA测序数据 涉及两个数据集GSE165816和GSE199939,具体样本数量未详细说明。 NA NA NA NA
1042 2024-08-07
Dysregulated Cell-Cell Communication Characterizes Pulmonary Fibrosis
2022-10-21, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究使用NicheNet R包和公开的单细胞RNA测序数据,探讨了基因变异如何影响肺纤维化的发生,并分析了肺泡上皮细胞在不同环境中的变化 本研究首次验证了肺泡上皮细胞类型I的丢失与肺纤维化中单细胞RNA转录组的关系,并发现了ADAM17蛋白在肺纤维化中的潜在作用 NA 探讨基因变异如何影响肺纤维化的发生 肺泡上皮细胞在不同环境中的变化 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA RNA序列 控制组、基因变异组和纤维化环境中的样本 NA NA NA NA
1043 2024-08-07
Development of a single-cell atlas for woodland strawberry (Fragaria vesca) leaves during early Botrytis cinerea infection using single cell RNA-seq
2022-Jan-19, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,构建了林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的单细胞图谱,并分析了不同细胞类型的基因表达模式 首次报道了植物病原入侵过程中单细胞转录组景观,为宿主-病原体相互作用的全面动态提供了新见解 NA 研究植物在病原体入侵时的防御反应及信号转导过程 林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的细胞类型及基因表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 超过50,000个单细胞 NA NA NA NA
1044 2024-08-07
Cell Layers: uncovering clustering structure in unsupervised single-cell transcriptomic analysis
2022, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文开发了一种名为Cell Layers的交互式Sankey工具,用于在不同聚类分辨率下定量研究基因表达、共表达、生物过程和聚类完整性 Cell Layers工具通过链接分子数据和聚类评估指标,增强了单细胞聚类的可解释性,并提供了对细胞群体的新见解 NA 开发一种新的工具来提高单细胞转录组无监督聚类的解释性 单细胞转录组数据及其聚类结果 生物信息学 NA 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
1045 2024-08-07
The vascular phenotype of BPD: new basic science insights-new precision medicine approaches
2022-Dec-22, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本文探讨了支气管肺发育不良(BPD)的血管表型,并提出了基于细胞和微小RNA的精准医疗方法 利用单细胞RNA测序技术深入研究了BPD-PH中发育性内皮细胞耗竭,并提出了基于外泌体和微小RNA的治疗策略 需要更多关于中断通路、干预时机和递送方式的研究 探索BPD中血管表型的分子机制,并开发新的治疗策略 BPD患儿的肺血管发育和肺动脉高压 生物医学 新生儿疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
1046 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing analyses: interference by the genes that encode the B-cell and T-cell receptors
2022-Dec-06, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
研究论文 本文研究了单细胞RNA测序数据中B细胞和T细胞受体编码基因对无监督聚类和下游分析的影响 首次系统分析了包含与排除B细胞和T细胞受体编码基因对单细胞RNA测序数据分析的影响 仅限于B细胞和T细胞的研究,未涉及其他细胞类型 探讨B细胞和T细胞受体编码基因在单细胞RNA测序中的作用 B细胞和T细胞 基因组学 自身免疫病 单细胞RNA测序 NA RNA 未具体说明样本数量 NA NA NA NA
1047 2024-08-07
Dissecting Heterogeneity Reveals a Unique BAMBIhigh MFGE8high Subpopulation of Human UC-MSCs
2022-Nov-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过大规模单细胞转录组图谱分析,揭示了人类脐带间充质干细胞(UC-MSCs)的异质性,并鉴定出一个独特的BAMBI高表达和MFGE8高表达的C1亚群 首次实验验证了从scRNA-seq样本中分类的UC-MSC亚群的功能,并发现了一个具有独特表型和转录组特征的BAMBI MFGE8 C1亚群 研究主要集中在体外和体内狼疮小鼠模型中,未来需要进一步在更多疾病模型中验证这些发现 阐明人类UC-MSCs的本质,并选择最优的MSC类型用于未来特定疾病的治疗 人类脐带间充质干细胞及其亚群的功能和特性 细胞生物学 自身免疫性疾病 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 多个UC-MSC样本 NA NA NA NA
1048 2024-08-07
Single-cell immune profiling reveals a developmentally distinct CD4+ GM-CSF+ T-cell lineage that induces GI tract GVHD
2022-05-10, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析(scRNAseq)揭示了在移植物抗宿主病(GVHD)中出现的两种CD4+ GM-CSF+ T细胞群体,它们根据是否共表达干扰素-γ(IFN-γ)而区分 本研究首次识别出一种在GVHD中出现的独特的CD4+ GM-CSF+ IFN-γ- T细胞亚群,该亚群具有独特的转录组特征和T细胞受体库 NA 揭示在GVHD中CD4+ GM-CSF+ T细胞的异质性,并定义一种独特的T辅助细胞亚型 CD4+ GM-CSF+ T细胞在GVHD中的作用和特性 免疫学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序分析(scRNAseq) NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
1049 2024-08-07
SpotClean adjusts for spot swapping in spatial transcriptomics data
2022-05-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为SpotClean的概率模型,用于调整空间转录组学数据中的点交换伪影,以提供更准确的基因特异性UMI计数估计 SpotClean模型能够显著改善标记基因分析和聚类效果,特别是在组织区域不易分离的情况下 NA 提高空间转录组学实验中下游分析的效力和精度 空间转录组学数据中的点交换伪影 分子医学 癌症 空间转录组学 概率模型 转录组数据 数千个点 NA NA NA NA
1050 2024-08-07
An Overview on Single-Cell Technology for Hepatocellular Carcinoma Diagnosis
2022-01-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了单细胞技术在肝细胞癌诊断中的应用 单细胞技术能够分析肿瘤组织样本中的每个单细胞,从而深入了解癌症的遗传异质性,有助于识别和评估罕见的细胞群体 文章中提到的挑战包括单细胞技术的局限性和实施中的困难 促进肝细胞癌的个性化诊断和治疗 肝细胞癌的诊断、肿瘤微环境分析、单细胞基因组测序、单细胞转录组学、单细胞组学测序用于生物标志物开发、肝细胞癌的起源和进化 数字病理学 肝细胞癌 单细胞技术 NA 基因表达模式 NA NA NA NA NA
1051 2024-08-07
Imipridones affect tumor bioenergetics and promote cell lineage differentiation in diffuse midline gliomas
2022-09-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
research paper 研究伊米普利酮类药物对弥漫中线胶质瘤的肿瘤生物能量学和细胞谱系分化的影响 首次详细描述了ONC201及其衍生物ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制,包括对肿瘤细胞代谢和线粒体损伤的影响,以及诱导细胞谱系分化的能力 NA 探究伊米普利酮类药物ONC201和ONC206在弥漫中线胶质瘤中的抗癌机制 弥漫中线胶质瘤的细胞和动物模型,以及患者样本 digital pathology 脑癌 Seahorse XF Cell Mito Stress Test, MitoSOX, TMRM assay, 电子显微镜成像, bulk和单细胞RNA-seq NA 细胞, 动物模型, 患者样本 体外模型18个, 体内模型包括小鼠和斑马鱼, 患者样本20个 NA NA NA NA
1052 2024-08-07
Targeting macrophages for enhancing CD47 blockade-elicited lymphoma clearance and overcoming tumor-induced immunosuppression
2022-06-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过高通量筛选发现紫杉醇能增强巨噬细胞对非霍奇金淋巴瘤的吞噬能力,从而提高CD47阻断疗法的疗效 首次发现紫杉醇能直接增强巨噬细胞的吞噬能力,并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制 研究主要基于实验模型,尚未在临床试验中验证 探索通过调节肿瘤微环境增强淋巴瘤治疗效果的新策略 非霍奇金淋巴瘤及其相关巨噬细胞 肿瘤学 非霍奇金淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及 NA NA NA NA
1053 2024-08-07
Müller Glial Expression of REDD1 Is Required for Retinal Neurodegeneration and Visual Dysfunction in Diabetic Mice
2022-05-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 研究探讨了REDD1蛋白在糖尿病小鼠视网膜病变中的作用,特别是在Müller胶质细胞中的表达。 首次揭示了Müller胶质细胞中REDD1的表达对糖尿病引起的视网膜病变、神经退行性和视觉功能障碍的关键作用。 研究仅限于小鼠模型,需要进一步的人体研究来验证这些发现。 探究REDD1在糖尿病视网膜病变中的作用及其机制。 糖尿病小鼠的视网膜和人类Müller细胞在高糖条件下的反应。 NA 糖尿病 单细胞测序 NA 蛋白质表达数据 包括糖尿病控制小鼠和REDD1-mgKO小鼠的视网膜样本,以及暴露于高糖条件下的人类Müller细胞培养物。 NA NA NA NA
1054 2024-08-07
Cellular heterogeneity of human fallopian tubes in normal and hydrosalpinx disease states identified using scRNA-seq
2022-04-11, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了来自正常和输卵管积水疾病状态的人类输卵管细胞的异质性 首次构建了包含12种主要细胞类型的输卵管细胞图谱,并识别出四种纤毛和六种非纤毛分泌上皮亚型 仅分析了四名健康和两名输卵管积水患者的样本,样本量有限 探究输卵管稳态在正常发育和疾病中的细胞异质性 人类输卵管细胞 数字病理学 不孕症 scRNA-seq NA 细胞数据 59,738个细胞来自四名健康受试者,17,798个细胞来自两名输卵管积水患者 NA NA NA NA
1055 2024-08-07
Neuroinflammation creates an immune regulatory niche at the meningeal lymphatic vasculature near the cribriform plate
2022-04, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 研究发现在神经炎症期间,筛板附近的脑膜淋巴管通过淋巴管生成来排出多余液体,并可能获得改变的表型以调节免疫。 首次报道了神经炎症期间,筛板附近的脑膜淋巴管上调与抗原呈递相关的基因,如主要组织相容性复合体II类、粘附分子和免疫调节分子,形成一个免疫调节微环境。 NA 探讨神经炎症期间脑膜淋巴管在免疫调节中的作用。 健康和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中筛板附近的脑膜淋巴管。 NA 神经炎症 单细胞RNA测序 NA RNA 健康和EAE小鼠模型的脑膜淋巴管样本 NA NA NA NA
1056 2024-08-07
NGF-p75 signaling coordinates skeletal cell migration during bone repair
2022-03-18, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文研究了神经生长因子(NGF)通过p75信号通路在颅骨损伤后调节骨再生中的作用 首次揭示了NGF通过p75信号通路在骨修复过程中协调骨骼细胞迁移的机制 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探讨骨损伤后神经信号与骨再生之间的关系 神经生长因子(NGF)及其p75受体在骨修复中的作用 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 小鼠模型 NA NA NA NA
1057 2024-08-07
Clonal lineage tracing reveals shared origin of conventional and plasmacytoid dendritic cells
2022-03-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究使用诱导性谱系追踪结合克隆DNA条形码和单细胞转录组及表型分析(CITE-seq),在未经处理的成年小鼠中研究树突状细胞(DCs)的发育过程 揭示了常规DCs(cDCs)和浆细胞样DCs(pDCs)的共同起源,并提出了DC发育的新模式 NA 阐明树突状细胞的发育起源 树突状细胞(包括常规DCs和浆细胞样DCs)的发育过程 NA NA CITE-seq NA 单细胞转录组 成年小鼠 NA NA NA NA
1058 2024-08-07
Cell type-specific mechanism of Setd1a heterozygosity in schizophrenia pathogenesis
2022-03-04, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过生成Setd1a半合子不足的小鼠模型,探讨了这一与精神分裂症相关的表观遗传因子如何在高度相关的脑区影响基因表达 首次通过单细胞RNA测序揭示了Setd1a半合子不足在不同细胞类型中的高度可变的转录适应性,并发现这些变化与神经元形态发生和突触功能相关的基因失调有关 NA 理解Setd1a半合子不足在精神分裂症发病机制中的细胞特异性机制 Setd1a半合子不足的小鼠模型及其在精神分裂症相关脑区的基因表达变化 神经科学 精神分裂症 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 NA NA NA NA NA
1059 2024-08-07
Systems-based approaches to study immunometabolism
2022-03, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
综述 本文综述了利用系统生物学方法研究免疫细胞代谢的现状和挑战 介绍了数学建模方法用于系统性分析免疫细胞代谢变化 讨论了代谢建模技术的应用和不足 定义免疫代谢的系统性质,总结细胞和系统层面的研究方法 免疫细胞的代谢 系统生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 数学模型 细胞数据 NA NA NA NA NA
1060 2024-08-07
Identification of kidney injury released circulating osteopontin as causal agent of respiratory failure
2022-02-25, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和配体-受体分析,识别了急性肾损伤(AKI)引起的急性肺损伤(ALI)中,肾脏释放的循环骨桥蛋白(OPN)作为关键介质的作用 首次揭示了肾脏释放的OPN在AKI-ALI中的因果作用,并证明了OPN抑制剂在预防AKI-ALI中的有效性 研究主要在动物模型中进行,需要在人类中进一步验证 识别并验证介导组织损伤间相互作用的分子 急性肾损伤和急性肺损伤 NA 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 小鼠模型和人类患者样本 NA NA NA NA
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