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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1041 | 2024-08-08 |
Narciclasine inhibits phospholipase A2 and regulates phospholipid metabolism to ameliorate psoriasis-like dermatitis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1094375
PMID:36700214
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研究论文 | 本文研究了Narciclasine(Ncs)对磷脂酶A2的抑制作用及其对磷脂代谢的调节,以改善银屑病样皮肤病 | Ncs能够抑制角质形成细胞增殖和减少皮肤中免疫细胞的招募,通过抑制与银屑病相关的炎症介质,并直接抑制Th17细胞极化 | NA | 探索Narciclasine作为银屑病治疗新药的潜力 | Narciclasine对银屑病样小鼠模型的治疗效果及其作用机制 | NA | 银屑病 | 转录组学和脂质组学 | NA | 单细胞测序数据 | 使用IMQ诱导的银屑病样小鼠模型进行实验 |
1042 | 2024-08-08 |
Comparative analysis of thoracic and abdominal aortic aneurysms across the segment and species at the single-cell level
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1095757
PMID:36703732
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术比较分析了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在不同物种和部位的细胞亚结构和转录组特征 | 首次在单细胞水平上比较了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在人类和鼠模型中的细胞类型变化,并识别了保守的平滑肌细胞和巨噬细胞亚群 | 研究主要集中在鼠模型和临床患者样本,未涉及更多物种的比较 | 探讨使用血管紧张素II诱导的鼠模型研究人类主动脉瘤疾病的合理性和实用性 | 胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在人类和鼠模型中的细胞亚结构和转录组特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括临床患者的胸主动脉瘤和腹主动脉瘤样本以及鼠模型的健康和病变主动脉样本 |
1043 | 2024-08-08 |
MIF promotes cell invasion by the LRP1-uPAR interaction in pancreatic cancer cells
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1028070
PMID:36703790
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞移动抑制因子(MIF)通过LRP1-uPAR相互作用促进胰腺癌细胞侵袭的机制 | 揭示了MIF与uPAR之间的新关联,并解释了MIF如何增强胰腺癌细胞的侵袭能力 | NA | 探究MIF在胰腺癌进展中的作用及其机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组化染色,空间转录组学,流式细胞术 | NA | 组织,基因表达数据 | 使用PDAC组织和PDAC细胞异种移植模型进行研究 |
1044 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals the heterogeneity of meningeal immunity in a mouse model of Methyl CpG binding protein 2 deficiency
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1056447
PMID:36703978
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了Mecp2缺陷小鼠硬脑膜中的免疫细胞,揭示了MeCP2缺乏对脑膜免疫的影响 | 首次详细描述了MeCP2缺乏小鼠脑膜免疫细胞的异质性及其功能变化 | NA | 探讨MeCP2缺乏对脑膜免疫细胞的影响及其在Rett综合征发展中的作用 | Mecp2缺陷小鼠的脑膜免疫细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | Mecp2缺陷小鼠和对照小鼠的脑膜免疫细胞 |
1045 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the molecular features of peripheral blood immune cells in children, adults and centenarians
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1081889
PMID:36703979
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同年龄段(从儿童到百岁老人)外周血单个核细胞的分子特征 | 发现了在不同年龄段中,髓系细胞的比例和状态有显著变化,并鉴定了一种新的CD8CCR7GZMB细胞毒性T细胞亚型 | NA | 探究从儿童到百岁老人外周血免疫细胞的分子特征及其与年龄的关系 | 外周血单个核细胞(PBMCs)及其在不同年龄段的分子特征 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 包括1-12岁(G1)、20-30岁(G2)、30-60岁(G3)、60-80岁(G4)和超过110岁(G5)的多个年龄段 |
1046 | 2024-08-08 |
Perioperative corticosteroid treatment impairs tumor-infiltrating dendritic cells in patients with newly diagnosed adult-type diffuse gliomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1074762
PMID:36703985
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研究论文 | 本研究探讨了围手术期皮质类固醇治疗对新诊断成人型弥漫性胶质瘤患者肿瘤浸润性树突状细胞的影响 | 首次揭示了皮质类固醇治疗对肿瘤浸润性树突状细胞功能障碍的影响 | NA | 研究皮质类固醇治疗对成人型弥漫性胶质瘤患者肿瘤浸润性树突状细胞的影响 | 成人型弥漫性胶质瘤患者的肿瘤浸润性树突状细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 多参数流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
1047 | 2024-08-08 |
The submandibular and sublingual glands maintain oral microbial homeostasis through multiple antimicrobial proteins
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.1057327
PMID:36704102
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研究论文 | 本研究探讨了下颌下腺和舌下腺通过多种抗菌蛋白维持口腔微生物稳态的功能 | 首次独立移除小鼠的下颌下腺或舌下腺,通过16S rRNA测序和蛋白质组学分析,揭示了这两种腺体在维持口腔微生物稳态中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型,且样本量较小 | 探究下颌下腺和舌下腺在维持口腔微生物稳态中的作用 | 下颌下腺和舌下腺的抗菌蛋白及其对口腔微生物稳态的影响 | NA | NA | 16S rRNA测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、蛋白质数据、RNA数据 | 6只小鼠(3只移除下颌下腺,3只移除舌下腺),3只对照组小鼠 |
1048 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing research in maternal fetal interface
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1079961
PMID:36704195
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研究论文 | 本文分析了母胎界面中单细胞转录组学的最新研究,并提供了理解和治疗各种病理妊娠的新方向 | 使用单细胞测序技术,不同于提供平均数据的批量测序,能够以单细胞分辨率解释细胞和分子景观 | NA | 深入理解母胎界面的异质性及其对生理和病理妊娠的影响 | 母胎界面的细胞和分子景观 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
1049 | 2024-08-08 |
Inferring cell developmental stage-specific lncRNA regulation in the developing human neocortex with CDSlncR
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1037565
PMID:36710930
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研究论文 | 本文提出了一种名为CDSlncR的新型计算方法,用于推断人类新皮质发育中特定细胞发育阶段的lncRNA调控 | CDSlncR结合了潜在的lncRNA-目标结合信息与单细胞转录组数据,以推断特定细胞发育阶段的lncRNA调控 | 先前的批量数据驱动方法主要限于探索所有细胞的lncRNA调控,而不是特定于细胞发育阶段的lncRNA调控 | 研究特定细胞发育阶段的lncRNA调控 | 人类新皮质发育中的lncRNA调控 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞测序 | CDSlncR | 转录组数据 | 涉及人类新皮质不同发育阶段的单细胞转录组数据 |
1050 | 2024-08-08 |
Assessment of Fibrinogen-like 2 (FGL2) in Human Chronic Kidney Disease through Transcriptomics Data Analysis
2022-12-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010089
PMID:36671474
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研究论文 | 本研究通过转录组数据分析评估了纤维蛋白原样蛋白2(FGL2)在人类慢性肾脏疾病(CKD)中的表达及其与疾病结果的关联 | 首次在人类CKD中评估FGL2的表达,并探讨了其与肾脏纤维化和疾病进展的关系 | 研究主要基于转录组数据和免疫组织化学分析,可能需要进一步的体内实验验证 | 评估FGL2在人类CKD中的表达及其与疾病结果的关联 | FGL2在CKD患者肾脏中的表达及其与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个独立的CKD队列(NEPTUNE和Innsbruck CKD队列)以及13个人类CKD转录组数据集 |
1051 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Molecular Characterization of the Immune Microenvironment in Acute Pancreatitis
2022-12-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010078
PMID:36671463
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研究论文 | 本研究首次整合单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序(Bulk RNA-Seq)数据,揭示了急性胰腺炎(AP)中免疫微环境的分子特征 | 首次使用scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq数据展示AP中免疫细胞浸润的特征,并探索不同细胞类型的特定分子标记 | NA | 揭示急性胰腺炎中免疫微环境的分子特征和细胞间相互作用网络 | 急性胰腺炎中的免疫细胞浸润和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),批量RNA测序(Bulk RNA-Seq) | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
1052 | 2024-08-08 |
GAGAM v1.2: An Improvement on Peak Labeling and Genomic Annotated Gene Activity Matrix Construction
2022-12-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14010115
PMID:36672856
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研究论文 | 本文介绍了GAGAM v1.2,一个改进版的基因组注释基因活性矩阵,旨在通过功能注释将峰值与基因关联,提高单细胞ATAC-seq数据的可解释性和信息量。 | 提出了一种改进的基因组注释基因活性矩阵(GAGAM)概念,通过标记峰值并将其与基因通过全基因组功能注释关联,使得不同数据集可比较,并能关联基因的可访问性和表达。 | NA | 改进基因活性矩阵的概念,使其能更好地处理和解释单细胞ATAC-seq数据,并能与单细胞RNA测序数据进行比较。 | 单细胞ATAC-seq数据的可解释性和信息量,以及与单细胞RNA测序数据的比较。 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 基因活性矩阵(GAM) | 基因组数据 | 数千个细胞 |
1053 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of H5N1-HA-Stimulated Alpaca PBMCs
2022-12-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010060
PMID:36671445
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了H5N1病毒HA抗原刺激下的羊驼外周血单个核细胞的免疫反应 | 首次在单细胞水平上研究了羊驼外周血单个核细胞对H5N1病毒HA抗原的特异性免疫动态 | NA | 旨在了解羊驼对抗病毒的免疫系统,并促进在骆驼科动物中开发更有效的疫苗和抗体 | 羊驼外周血单个核细胞在H5N1病毒HA抗原刺激下的免疫反应 | 数字病理学 | 禽流感 | 单细胞测序技术(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 一个羊驼的外周血单个核细胞 |
1054 | 2024-08-08 |
Application of Single-Cell RNA Sequencing in Ovarian Development
2022-12-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010047
PMID:36671432
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在卵巢发育中的应用 | scRNA-seq技术在分析复杂组织中的单个细胞、分类细胞类型、表征单细胞、描绘细胞发育轨迹以及研究细胞间相互作用方面具有显著优势 | NA | 提高对卵巢细胞特征和发育的理解,从而识别卵巢相关疾病的新治疗靶点 | 卵巢中的不同细胞亚群及其发育过程和细胞间通信 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
1055 | 2024-08-08 |
Development and validation of a prognostic model and gene co-expression networks for breast carcinoma based on scRNA-seq and bulk-seq data
2022-Dec, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-22-5684
PMID:36660733
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研究论文 | 本文开发并验证了一种基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量测序数据的前列腺癌预后模型和基因共表达网络 | 利用scRNA-seq技术研究复杂肿瘤微环境中的细胞变化,构建了单细胞分辨率的基因共表达网络,并开发了一个可靠的预测模型 | NA | 研究前列腺癌进展中的转录组学和基因共表达网络,并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 前列腺癌的恶性上皮细胞和基因共表达网络 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox | 基因表达数据 | 58个样本的scRNA-seq数据,超过300个已发表的转录组学数据集和31个CRISPR筛选数据集 |
1056 | 2024-08-08 |
Construction of a three commitment points for S phase entry cell cycle model and immune-related ceRNA network to explore novel therapeutic options for psoriasis
2022-09-15, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022630
PMID:36654055
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研究论文 | 本文构建了S期进入细胞周期的三个承诺点(CP1-3)模型和免疫相关的ceRNA网络,以探索银屑病的新治疗方案 | 首次探索了ceRNA调控机制在银屑病中角质形成细胞与免疫系统相互作用中的作用,并基于ceRNA网络筛选潜在的治疗药物 | NA | 探索银屑病中角质形成细胞增殖和分化的机制及ceRNA网络在其中的作用,并寻找新的治疗药物 | 银屑病中的角质形成细胞和免疫系统 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,分子对接 | NA | 基因表达数据 | 基于银屑病皮肤活检的单细胞RNA测序数据 |
1057 | 2024-08-08 |
A novel cuproptosis-related lncRNA prognostic signature for predicting treatment and immune environment of head and neck squamous cell carcinoma
2022-08-19, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2022564
PMID:36653989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索了头颈鳞状细胞癌(HNSCC)肿瘤微环境中铜死亡相关基因的表达,并构建了一个基于铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后模型 | 首次探索了铜死亡在HNSCC中的应用,并构建了一个新的铜死亡相关lncRNA预后模型 | NA | 研究铜死亡在头颈鳞状细胞癌治疗和免疫环境预测中的作用 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同风险评分的HNSCC患者 |
1058 | 2024-08-08 |
A pan-cancer and single-cell sequencing analysis of CD161, a promising onco-immunological biomarker in tumor microenvironment and immunotherapy
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1040289
PMID:36660546
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研究论文 | 本研究通过泛癌和单细胞测序分析,探讨了CD161作为肿瘤微环境和免疫治疗中的有前景的肿瘤免疫生物标志物的角色。 | 首次通过单细胞测序分析了CD161在多种肿瘤类型中的表达模式,并揭示了其在肿瘤进展和T细胞免疫中的关键作用。 | 研究主要集中在CD161的表达和功能分析,未涉及其在临床治疗中的具体应用效果。 | 探讨CD161在肿瘤微环境和免疫治疗中的作用,评估其作为肿瘤免疫治疗靶点的潜力。 | CD161在多种癌症中的表达、突变图谱、CNVs和SNVs变异、通路富集、药物敏感性以及与T细胞和巨噬细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 涉及多种肿瘤类型的癌细胞和T细胞 |
1059 | 2024-08-08 |
Integrative multi-omic analysis of radiation-induced skin injury reveals the alteration of fatty acid metabolism in early response of ionizing radiation
2022-Dec, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.01.001
PMID:36639278
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析,探讨了电离辐射诱导的皮肤损伤早期反应中的分子事件及其机制 | 首次揭示了电离辐射早期反应中皮肤脂肪酸代谢的改变,并详细研究了ACADVL在脂肪酸代谢中的重要作用 | NA | 研究电离辐射对皮肤组织的早期分子反应及其机制 | 小鼠、大鼠的皮肤组织以及人类角质形成细胞和皮肤成纤维细胞 | 代谢组学 | 辐射损伤 | 液相色谱-质谱联用(LC-MS)、mRNA测序(mRNA-Seq)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 代谢物、基因表达数据 | 涉及小鼠、大鼠、猴子以及人类样本 |
1060 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics and network pharmacology reveal therapeutic targets of Jianpi Yiqi Bugan Yishen decoction in immune cell subsets of children with myasthenia gravis
2022-Dec, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-22-593
PMID:36643680
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和网络药理学方法,揭示了健脾益气补肝益肾汤在治疗儿童重症肌无力中的作用机制及其活性成分和潜在治疗靶点 | 本研究首次结合单细胞转录组学和网络药理学方法,探讨了健脾益气补肝益肾汤在儿童重症肌无力治疗中的作用机制和潜在靶点 | NA | 探索健脾益气补肝益肾汤治疗儿童重症肌无力的作用机制,并评估其活性成分和潜在治疗靶点 | 儿童重症肌无力的免疫细胞亚群及健脾益气补肝益肾汤的作用机制 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 20只Lewis大鼠 |