单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2024-08-08 |
High-fiber-diet-related metabolites improve neurodegenerative symptoms in patients with obesity with diabetes mellitus by modulating the hippocampal-hypothalamic endocrine axis
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.1026904
PMID:36733447
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研究论文 | 本研究通过转录组和代谢组分析，探讨了高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 本研究首次通过分子对接分析，发现与高纤维饮食相关的代谢标志物醋酰氨基苯甲酸与SPEG蛋白具有最强的结合亲和力，可能通过靶向SPEG蛋白改善肥胖患者的糖尿病和神经退行性疾病 | NA | 探讨高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 高纤维饮食相关的代谢物、糖尿病前期痴呆的血液甲基化谱、阿尔茨海默病患者海马样本的单细胞测序数据 | NA | 糖尿病、神经退行性疾病 | 转录组分析、代谢组分析、单细胞测序、分子对接 | PCA、AutoDock | 基因表达矩阵、甲基化谱、单细胞测序数据 | 24个与高纤维饮食、T2DM和AD相关的标记基因 |
| 1002 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals cellular heterogeneity from deep fascia in patients with acute compartment syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1062479
PMID:36741388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了急性腔隙综合征患者深层筋膜中的特定高应力腔隙亚群和免疫细胞及成纤维细胞亚群的变化 | 样本量较小，仅包括6名患者 | 探究急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞 | 数字病理学 | 急性腔隙综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名患者（高应力组3名，正常应力组3名） |
| 1003 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of myeloid cells in HPV+ tonsillar cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087843
PMID:36741389
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞组成 | 揭示了HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的四种树突状细胞系和两种巨噬细胞极化过程，以及它们的成熟序列特征 | NA | 探究HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的起源和动态变化，并识别可用于评估患者预后的髓系生物标志物 | HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞 | 数字病理学 | 扁桃体癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用26重流式细胞术验证了大部分单细胞RNA-seq集群 |
| 1004 | 2024-08-08 |
Multimodal human thymic profiling reveals trajectories and cellular milieu for T agonist selection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1092028
PMID:36741401
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研究论文 | 本文通过多模态人类胸腺分析，揭示了T细胞受体(TCRs)阳性选择过程中的细胞命运和细胞微环境 | 首次使用CITE-seq和空间转录组学技术对小儿人类胸腺进行分析，揭示了胸腺细胞在TCR信号传导标记物表达后的发育轨迹和时间诱导模式 | NA | 研究胸腺细胞发育、选择和谱系选择过程中的空间背景和细胞间相互作用 | 胸腺细胞和其发育过程中的细胞微环境 | 免疫学 | NA | CITE-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小儿人类胸腺样本 |
| 1005 | 2024-08-08 |
Exosomal miRNA-profiling of pleural effusion in lung adenocarcinoma and tuberculosis
2022, Frontiers in surgery
IF:1.6Q2
DOI:10.3389/fsurg.2022.1050242
PMID:36684253
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研究论文 | 本文研究了肺腺癌和结核病引起的胸腔积液中的外泌体miRNA表达谱，以区分良性和恶性胸腔积液。 | 本研究首次鉴定了肺腺癌和结核病胸腔积液中的外泌体miRNA表达谱，并揭示了这些miRNA在胸腔积液形成中的分子机制。 | NA | 旨在通过分析外泌体miRNA表达谱来区分肺腺癌和结核病引起的胸腔积液，并阐明其在胸腔积液形成中的作用。 | 肺腺癌和结核病引起的胸腔积液中的外泌体miRNA。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 深度测序 | NA | miRNA | 99个上调和91个下调的miRNAs在恶性胸腔积液中，7个差异表达的miRNAs通过qRT-PCR验证。 |
| 1006 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome sequencing atlas of cassava tuberous root
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.1053669
PMID:36684718
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，构建了木薯块根在两个发育阶段的高分辨率单细胞转录组图谱 | 首次在非模式植物中应用单细胞转录组测序技术，特别是在富含次生代谢产物的库器官中 | NA | 探索木薯块根细胞分化和发育过程 | 木薯块根在两个发育阶段的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 14,566个细胞 |
| 1007 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics: A new tool for studying diabetic kidney disease
2022, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2022.1053850
PMID:36685214
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在糖尿病肾病（DKD）研究中的应用，并强调了特定组织或细胞类型中涉及DKD发生和发展的关键信号通路 | 单细胞转录组学技术，包括转录组学、表观遗传学、代谢组学和蛋白质组学等，能够分析特定细胞类型和状态，具体表达的基因或通路，细胞分化轨迹，细胞间通讯以及在各种疾病中基因的调控或共表达 | NA | 探讨单细胞转录组学在糖尿病肾病研究中的应用，以深入理解其发病机制和治疗策略 | 糖尿病肾病（DKD）及其相关细胞类型和信号通路 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1008 | 2024-08-08 |
Comprehensive bulk and single-cell transcriptome profiling give useful insights into the characteristics of osteoarthritis associated synovial macrophages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1078414
PMID:36685529
|
研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞转录组数据，揭示了与骨关节炎相关的滑膜巨噬细胞的特征 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了骨关节炎滑膜微环境中巨噬细胞的细胞通讯模式，并发现了具有强抗炎能力的M2样巨噬细胞 | 研究主要集中在巨噬细胞上，未全面探讨其他免疫细胞类型在骨关节炎中的作用 | 旨在识别骨关节炎滑膜免疫浸润过程中的关键分子和细胞事件，并提供潜在的诊断和治疗靶点 | 骨关节炎相关的滑膜巨噬细胞及其在疾病发展中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | LASSO模型 | 转录组数据 | 共分析了172个与骨关节炎滑膜炎相关的差异表达基因 |
| 1009 | 2024-08-08 |
Single-cell omics: A new direction for functional genetic research in human diseases and animal models
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1100016
PMID:36685871
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术的发展及其在人类疾病和动物模型中的应用 | 单细胞组学技术能够揭示不同遗传层面的异质性及其关联，提供更全面的生物调控网络遗传图谱 | NA | 探讨单细胞组学技术在人类疾病分子生物学机制阐释和动物模型构建中的应用前景 | 单细胞组学技术、单细胞多组学技术、多组学数据整合方法、人类器官和疾病、经典实验室细胞系及动物疾病模型 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 1010 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of the prognostic and immunological role of Fanconi anemia complementation group E
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1024989
PMID:36685883
|
研究论文 | 本文通过分析多个数据库，研究了Fanconi贫血互补组E（FA-E）基因在多种癌症中的致癌性及其对免疫和预后的影响 | 首次进行了FA-E基因的泛癌分析，探讨了其在癌症中的预后和免疫治疗潜力 | 研究主要基于数据库分析，缺乏临床试验验证 | 全面理解FA-E基因在癌症中的作用 | FA-E基因在不同癌症中的表达、预后和免疫影响 | 数字病理学 | 多种癌症 | 生物信息学方法 | NA | 基因表达数据 | 涉及15和21种癌症的数据 |
| 1011 | 2024-08-08 |
Editorial: Artificial intelligence for extracting phenotypic features and disease subtyping applied to single-cell sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1083719
PMID:36685925
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1012 | 2024-08-08 |
Fc gamma receptor IIb in tumor-associated macrophages and dendritic cells drives poor prognosis of recurrent glioblastoma through immune-associated signaling pathways
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1046008
PMID:36685974
|
研究论文 | 本研究通过分析基因表达数据和临床信息，探讨了FcγRIIb在肿瘤相关巨噬细胞和树突状细胞中通过免疫相关信号通路驱动复发性胶质母细胞瘤不良预后的作用 | 首次揭示了FcγRIIb在复发性胶质母细胞瘤中的驱动作用及其与免疫相关信号通路的关联 | NA | 探讨FcγRIIb在复发性胶质母细胞瘤中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | FcγRIIb在肿瘤相关巨噬细胞和树突状细胞中的表达及其对复发性胶质母细胞瘤预后的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 来自中国胶质瘤基因组图谱和TCGA、REMBRANDT队列的GBM和正常组织样本 |
| 1013 | 2024-08-08 |
Identification of therapeutic targets for osteosarcoma by integrating single-cell RNA sequencing and network pharmacology
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1098800
PMID:36686663
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和网络药理学方法，分析了骨肉瘤治疗的有效靶点 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法，识别了与骨肉瘤进展相关的关键靶点，并预测了潜在的药物-靶点对 | 研究主要基于数据分析和分子对接，尚未进行体内外实验验证 | 识别骨肉瘤治疗的新靶点和潜在药物 | 骨肉瘤的细胞异质性和治疗靶点 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），网络药理学，分子对接分析 | NA | RNA | 基于GSE162454数据集获得了21个细胞簇，GSE36001数据集用于分析 |
| 1014 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome in silico analysis reveals conserved regulatory programs in macrophages/monocytes of abdominal aortic aneurysm from multiple mouse models and human
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1062106
PMID:36698942
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法分析了来自多个小鼠模型和人类腹主动脉瘤的单细胞RNA测序数据，揭示了巨噬细胞/单核细胞的保守调控程序 | 首次对多个小鼠模型和人类腹主动脉瘤的单细胞RNA测序数据进行综合分析，识别了巨噬细胞/单核细胞的亚型及其调控网络 | 研究依赖于已发表的数据集，未进行新的实验验证 | 探究腹主动脉瘤中巨噬细胞/单核细胞的转录调控模式及其在疾病发生中的作用 | 腹主动脉瘤中的巨噬细胞/单核细胞及其调控基因和网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个细胞集群，11种细胞类型，涉及多个小鼠模型和人类样本 |
| 1015 | 2024-08-08 |
Echidna: integrated simulations of single-cell immune receptor repertoires and transcriptomes
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac062
PMID:36699357
|
研究论文 | 本文介绍了Echidna，一个R包，用于模拟单细胞水平的免疫受体库和转录组数据 | Echidna是首个能够模拟包含免疫受体库和基因表达的单细胞数据集的工具 | NA | 开发一个能够模拟单细胞免疫受体库和转录组数据的工具，以辅助软件开发和生物信息学基准测试 | 单细胞免疫受体库和转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1016 | 2024-08-08 |
More accurate estimation of cell composition in bulk expression through robust integration of single-cell information
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac049
PMID:36699374
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于协方差的单细胞分解（CSCD）方法，用于通过构建基于单细胞数据的参考表达谱和使用约束线性逆模型学习基因特异性批量表达转换，来估计批量数据中的细胞类型比例 | 本文引入了一种更先进的模型，成功地将scRNA-seq和批量RNA-seq数据集中的协方差结构纳入分析，并通过利用线性收缩估计相应的协方差矩阵来解决共线性问题 | Bisque方法受限于单变量模型，无法将基因间相关性纳入分析 | 提高批量表达数据中细胞成分估计的准确性 | 细胞类型比例的估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA-seq | 约束线性逆模型 | RNA-seq数据 | 使用了多个公开可用的数据集 |
| 1017 | 2024-08-08 |
scMoC: single-cell multi-omics clustering
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac011
PMID:36699396
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scMoC的单细胞多组学聚类方法，用于从同一细胞的scRNA-seq和scATAC-seq数据中识别细胞聚类 | scMoC通过利用scRNA-seq数据来克服scATAC-seq数据的高稀疏性，并采用RNA引导的插补策略生成信息丰富的scATAC-seq数据，从而实现基于RNA和ATAC信息的生物学上有意义的集成聚类 | NA | 开发一种方法来利用单细胞多组学数据的互补性进行跨模态细胞聚类 | 单细胞的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 数据 | 使用了不同协议和不同数据稀疏性水平的数据集 |
| 1018 | 2024-08-08 |
FlexDotPlot: a universal and modular dot plot visualization tool for complex multifaceted data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac019
PMID:36699406
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FlexDotPlot的R包，用于从多方面数据中生成点图，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | FlexDotPlot提供了一个通用且易于使用的解决方案，具有高度的多功能性，并包含一个交互式的R Shiny应用程序，使非R用户也能轻松生成点图 | NA | 开发一种功能更全面、更易用的点图可视化工具 | 多方面数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据可视化 | NA |
| 1019 | 2024-08-08 |
Narciclasine inhibits phospholipase A2 and regulates phospholipid metabolism to ameliorate psoriasis-like dermatitis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1094375
PMID:36700214
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研究论文 | 本文研究了Narciclasine（Ncs）对磷脂酶A2的抑制作用及其对磷脂代谢的调节，以改善银屑病样皮肤病 | Ncs能够抑制角质形成细胞增殖和减少皮肤中免疫细胞的招募，通过抑制与银屑病相关的炎症介质，并直接抑制Th17细胞极化 | NA | 探索Narciclasine作为银屑病治疗新药的潜力 | Narciclasine对银屑病样小鼠模型的治疗效果及其作用机制 | NA | 银屑病 | 转录组学和脂质组学 | NA | 单细胞测序数据 | 使用IMQ诱导的银屑病样小鼠模型进行实验 |
| 1020 | 2024-08-08 |
Comparative analysis of thoracic and abdominal aortic aneurysms across the segment and species at the single-cell level
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1095757
PMID:36703732
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术比较分析了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在不同物种和部位的细胞亚结构和转录组特征 | 首次在单细胞水平上比较了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在人类和鼠模型中的细胞类型变化，并识别了保守的平滑肌细胞和巨噬细胞亚群 | 研究主要集中在鼠模型和临床患者样本，未涉及更多物种的比较 | 探讨使用血管紧张素II诱导的鼠模型研究人类主动脉瘤疾病的合理性和实用性 | 胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在人类和鼠模型中的细胞亚结构和转录组特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括临床患者的胸主动脉瘤和腹主动脉瘤样本以及鼠模型的健康和病变主动脉样本 |