单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-08 |
Alzheimer's disease modification mediated by bone marrow-derived macrophages via a TREM2-independent pathway in mouse model of amyloidosis
2022-01, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00149-w
PMID:37118355
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研究论文 | 本研究评估了在淀粉样变性小鼠模型中，单核细胞衍生的巨噬细胞（MDM）是否通过TREM2依赖性途径发挥作用，并探讨了PD-L1免疫检查点阻断对认知改善的影响。 | 发现MDM通过TREM2非依赖性途径在淀粉样变性小鼠模型中具有疾病修饰活性。 | NA | 评估单核细胞衍生的巨噬细胞在淀粉样变性小鼠模型中的作用机制。 | 淀粉样变性小鼠模型中的单核细胞衍生的巨噬细胞。 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Trem25xFAD小鼠 |
| 982 | 2024-08-08 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用，并探讨了其潜在的临床应用 | scRNA-seq技术提供了比传统RNA测序方法更深入的分子机制理解，揭示了肿瘤演化过程中体细胞突变和功能的变化，以及免疫细胞的浸润和激活 | NA | 理解单细胞基因表达模式，追踪异质细胞中的基因表达或突变，评估癌细胞的克隆起源，并确定不同癌细胞亚群的选择性进化 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用和通信，以及肿瘤内遗传异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 983 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics defines Dot1L interacting partners and downstream target genes in the mouse molar dental pulp
2022, The International journal of developmental biology
DOI:10.1387/ijdb.220141db
PMID:36942693
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠磨牙牙髓中Dot1L基因的表达谱及其在不同细胞群中的分布情况 | 首次揭示了Dot1L在小鼠磨牙牙髓中的表达模式及其与下游靶基因的关系，特别是在间充质基质细胞分化中的作用 | 研究仅限于小鼠磨牙牙髓，且未探讨Dot1L在其他组织或物种中的作用 | 探究Dot1L在牙髓组织中的表达及其对间充质基质细胞分化的影响 | 小鼠磨牙牙髓中的Dot1L基因及其在不同细胞群中的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠磨牙牙髓中的多种细胞群，包括间充质基质细胞、免疫细胞、周细胞、成釉细胞和内皮细胞 |
| 984 | 2024-08-08 |
Mixed Response to Cancer Immunotherapy is Driven by Intratumor Heterogeneity and Differential Interlesion Immune Infiltration
2022-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0050
PMID:36923281
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和单细胞测序分析同一患者淋巴结转移瘤样本，揭示了肿瘤内异质性和肿瘤间免疫浸润差异导致免疫治疗混合反应的机制 | 首次通过临床前模型和临床队列研究，证实肿瘤内异质性改变同一患者中肿瘤浸润淋巴细胞的特征，导致免疫治疗混合反应 | 研究样本量有限，且仅基于PD-1阻断疗法的队列研究，可能限制了结果的普适性 | 探讨肿瘤内异质性和肿瘤间免疫浸润差异如何影响免疫治疗反应 | 淋巴结转移瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 全外显子测序，单细胞测序 | NA | 基因组数据，细胞数据 | 503名接受PD-1阻断单药治疗的患者 |
| 985 | 2024-08-08 |
A multi-use deep learning method for CITE-seq and single-cell RNA-seq data integration with cell surface protein prediction and imputation
2022-Nov, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-022-00545-w
PMID:36873621
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research paper | 本文介绍了一种名为sciPENN的多用途深度学习方法，用于CITE-seq和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集成，以及细胞表面蛋白表达预测和插补 | sciPENN方法支持CITE-seq和scRNA-seq数据集成，蛋白质表达预测，蛋白质表达插补，预测和插补不确定性的量化，以及从CITE-seq到scRNA-seq的细胞类型标签转移 | NA | 克服CITE-seq和scRNA-seq数据集成中的计算挑战，提高信息内容 | CITE-seq和scRNA-seq数据集成的多用途深度学习方法 | machine learning | NA | CITE-seq, scRNA-seq | deep learning | single-cell multi-omics data | 多个数据集 |
| 986 | 2024-08-08 |
New perspective of skeletal stem cells
2022, Biomaterials translational
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综述 | 本文综述了骨骼干细胞（SSCs）的空间和时间分布，以及近年来对SSCs多样性和可塑性的研究进展 | 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术，研究了具有不同时空分布的SSCs的谱系轨迹 | NA | 探讨骨骼干细胞的空间和时间分布，并总结近年来对SSCs多样性和可塑性的研究进展 | 骨骼干细胞（SSCs）及其在不同组织中的分布和功能 | 干细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 987 | 2024-08-08 |
Retinal ganglion cell-specific genetic regulation in primary open-angle glaucoma
2022-Jun-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100142
PMID:36778138
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研究论文 | 研究通过将原发性开角型青光眼（POAG）患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞（iPSCs），并分化为视网膜类器官，与健康个体的细胞进行比较，评估疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 研究利用大规模iPSC研究揭示了遗传复杂疾病的上下文特异性特征，并通过单细胞RNA测序识别了簇特异性分子特征 | NA | 评估原发性开角型青光眼患者疾病特异性细胞群体的转录组特征 | 原发性开角型青光眼患者的成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞并分化为视网膜类器官 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共247,520个细胞 |
| 988 | 2024-08-08 |
Genetic perturbations go spatial
2022-Apr-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100120
PMID:36776528
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用蛋白质条码（Pro-Codes）追踪CRISPR修饰细胞并测量其对肿瘤微环境影响的方法 | 首次采用蛋白质条码和空间转录组学技术，对完整组织中的CRISPR修饰细胞进行多重成像和空间转录组学分析 | NA | 研究细胞内在特征及其与环境的相互作用对组织-肿瘤交互作用的影响 | CRISPR修饰细胞及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | NA | CRISPR, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA |
| 989 | 2024-08-08 |
Integration of multiple lineage measurements from the same cell reconstructs parallel tumor evolution
2022-Feb-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100096
PMID:36778661
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞全基因组测序技术和病毒谱系追踪，模拟结直肠癌肿瘤进化过程，构建高分辨率的克隆进化树 | 首次使用单细胞全基因组测序结合病毒谱系追踪技术，在结直肠癌肿瘤模型中重建肿瘤进化过程 | 研究仅限于结直肠癌肿瘤模型，可能需要进一步验证在其他类型肿瘤中的适用性 | 研究肿瘤内部异质性（ITH）和肿瘤进化过程 | 结直肠癌肿瘤模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞全基因组测序（WGS） | NA | 基因组数据 | 1,641个单细胞 |
| 990 | 2024-08-08 |
Overexpression of PKMYT1 associated with poor prognosis and immune infiltration may serve as a target in triple-negative breast cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1002186
PMID:36793346
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合临床样本和实验，探讨了蛋白激酶PKMYT1在乳腺癌中的功能作用 | 首次研究了PKMYT1在乳腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | NA | 探索PKMYT1在乳腺癌中的表达及其对预后和免疫浸润的影响 | 乳腺癌组织，特别是三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 生物信息学分析，单细胞测序 | NA | RNA序列 | 涉及乳腺癌组织和细胞系 |
| 991 | 2024-08-08 |
Mapping the tumor microenvironment in bladder cancer and exploring the prognostic genes by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1105026
PMID:36741702
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研究论文 | 本研究使用10X单细胞RNA测序技术分析了七份膀胱肿瘤组织及其对应的正常组织，构建了膀胱癌肿瘤微环境图谱，并探索了与预后相关的关键基因 | 首次构建了膀胱癌的完整肿瘤微环境图谱，并细分了膀胱癌上皮细胞的14个亚群，揭示了高度的肿瘤内异质性 | NA | 探索膀胱癌肿瘤微环境并识别与预后相关的关键基因 | 膀胱癌肿瘤组织及其对应的正常组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 10X单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七份膀胱肿瘤组织（三份非肌肉侵袭性膀胱癌和四份肌肉侵袭性膀胱癌）及七份对应的正常组织 |
| 992 | 2024-08-08 |
Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues
2022-Nov, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243
PMID:36712323
|
研究论文 | 本文分析了GTEx项目中43种组织的RNA-seq数据，研究了基因表达变异性的性别差异及其生物学意义 | 首次系统地探讨了基因表达变异性的性别差异，并发现这些差异与性激素反应、免疫反应等多种生物学功能相关 | NA | 探究性别差异在个体间基因表达变异性中的作用及其生物学和医学意义 | 人类不同组织中的基因表达变异性 | 基因组学 | 甲状腺疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 43种组织 |
| 993 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals intratumoral heterogeneity and potential mechanisms of malignant progression in prostate cancer with perineural invasion
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1073232
PMID:36712886
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三名伴有神经周围侵犯的前列腺癌患者的肿瘤组织，揭示了肿瘤内异质性及其在恶性进展中的潜在机制 | 首次在单细胞水平上详细分析了伴有神经周围侵犯的前列腺癌的细胞异质性和相关基因表达模式 | 研究样本仅限于三名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解伴有神经周围侵犯的前列腺癌的细胞异质性和恶性进展机制 | 伴有神经周围侵犯的前列腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 基因表达数据 | 约17,000个单细胞转录组，来自三名患者 |
| 994 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087010
PMID:36713384
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了活动性结核病（ATB）患者血液中CD14+单核细胞的不同亚群对免疫特征的贡献 | 首次证明中间型和经典型单核细胞分别对ATB的血液免疫特征有贡献，并识别出可能与疾病相关的新亚群和基因特征 | NA | 研究活动性结核病患者血液中单核细胞的免疫特征及其在疾病中的作用 | 活动性结核病患者和健康对照者的血液样本中的单核细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞分析 | NA | 基因表达数据 | 活动性结核病患者和健康对照者的配对血液样本 |
| 995 | 2024-08-08 |
Secondary myeloid neoplasms after CD19 CAR T therapy in patients with refractory/relapsed B-cell lymphoma: Case series and review of literature
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1063986
PMID:36713414
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病例系列和文献综述 | 本文介绍了四例在接受CD19 CAR T细胞治疗后出现继发性骨髓肿瘤的难治/复发性B细胞淋巴瘤患者的病例，并进行了文献综述。 | 使用单细胞RNA测序技术比较了MDS患者和健康捐赠者的骨髓样本，并描述了CD34+细胞的转录改变。 | 样本量较小，仅包括四例患者，且均为来自东部中国的两家医院的病例。 | 研究CD19 CAR T细胞治疗后难治/复发性B细胞淋巴瘤患者中继发性骨髓肿瘤的发生和发展。 | 难治/复发性B细胞淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后出现的继发性骨髓肿瘤。 | NA | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 骨髓样本 | 4例患者 |
| 996 | 2024-08-08 |
Activated autophagy of innate immune cells during the early stages of major trauma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1090358
PMID:36713435
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的调控作用 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的关键作用 | 研究样本量有限，且仅限于重大创伤患者早期阶段 | 探究重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的调控作用及其对免疫功能的影响 | 重大创伤患者的固有免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 167名重大创伤患者和3名对照参与者的外周血单个核细胞 |
| 997 | 2024-08-08 |
Associative analysis of multi-omics data indicates that acetylation modification is widely involved in cigarette smoke-induced chronic obstructive pulmonary disease
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1030644
PMID:36714109
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研究论文 | 本研究通过多组学数据关联分析，探讨了蛋白乙酰化修饰在香烟烟雾诱导的慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的作用 | 首次系统性地研究了蛋白乙酰化修饰在COPD中的作用，并通过多组学数据关联分析揭示了其在疾病发展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证结果 | 全面系统地研究香烟烟雾引起的慢性阻塞性肺疾病的分子机制，并探索蛋白乙酰化修饰在其中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）及其分子机制 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序（RNA-seq）、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组学、蛋白质组学、乙酰组学数据 | C57BL/6J小鼠模型，COPD患者肺组织样本 |
| 998 | 2024-08-08 |
Mass cytometry and single-cell RNA sequencing reveal immune cell characteristics of active and inactive phases of Crohn's disease
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1064106
PMID:36714133
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，揭示了克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞特征 | 首次综合运用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了克罗恩病不同阶段患者的免疫细胞特征，并通过KEGG通路富集分析和CellChat分析揭示了细胞间的相互作用网络 | NA | 旨在了解克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞特征 | 克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 包括活动期克罗恩病（CDa）、非活动期克罗恩病（CDin）和健康对照（HC）的数据 |
| 999 | 2024-08-08 |
Identification and validation of a muscle failure index to predict prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma through integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1057088
PMID:36733390
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研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，识别并验证了一个肌肉衰竭指数（MFI），用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 提出了一种基于肌肉衰竭相关基因的新评分系统MFI，并验证了其在预测肺腺癌预后和免疫治疗敏感性中的作用 | NA | 研究肌肉衰竭相关基因在肺腺癌发生中的作用，并构建一个可靠的MFI模型以指导临床决策 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | RNA测序数据 | 包括早期、晚期和脑转移的肺腺癌组织及正常肺组织 |
| 1000 | 2024-08-08 |
High-fiber-diet-related metabolites improve neurodegenerative symptoms in patients with obesity with diabetes mellitus by modulating the hippocampal-hypothalamic endocrine axis
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.1026904
PMID:36733447
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研究论文 | 本研究通过转录组和代谢组分析，探讨了高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 本研究首次通过分子对接分析，发现与高纤维饮食相关的代谢标志物醋酰氨基苯甲酸与SPEG蛋白具有最强的结合亲和力，可能通过靶向SPEG蛋白改善肥胖患者的糖尿病和神经退行性疾病 | NA | 探讨高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 高纤维饮食相关的代谢物、糖尿病前期痴呆的血液甲基化谱、阿尔茨海默病患者海马样本的单细胞测序数据 | NA | 糖尿病、神经退行性疾病 | 转录组分析、代谢组分析、单细胞测序、分子对接 | PCA、AutoDock | 基因表达矩阵、甲基化谱、单细胞测序数据 | 24个与高纤维饮食、T2DM和AD相关的标记基因 |