单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-08 |
Pan-cancer analysis of the prognostic and immunological role of Fanconi anemia complementation group E
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1024989
PMID:36685883
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研究论文 | 本文通过分析多个数据库，研究了Fanconi贫血互补组E（FA-E）基因在多种癌症中的致癌性及其对免疫和预后的影响 | 首次进行了FA-E基因的泛癌分析，探讨了其在癌症中的预后和免疫治疗潜力 | 研究主要基于数据库分析，缺乏临床试验验证 | 全面理解FA-E基因在癌症中的作用 | FA-E基因在不同癌症中的表达、预后和免疫影响 | 数字病理学 | 多种癌症 | 生物信息学方法 | NA | 基因表达数据 | 涉及15和21种癌症的数据 |
| 982 | 2024-08-08 |
Editorial: Artificial intelligence for extracting phenotypic features and disease subtyping applied to single-cell sequencing data
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1083719
PMID:36685925
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 983 | 2024-08-08 |
Fc gamma receptor IIb in tumor-associated macrophages and dendritic cells drives poor prognosis of recurrent glioblastoma through immune-associated signaling pathways
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1046008
PMID:36685974
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研究论文 | 本研究通过分析基因表达数据和临床信息，探讨了FcγRIIb在肿瘤相关巨噬细胞和树突状细胞中通过免疫相关信号通路驱动复发性胶质母细胞瘤不良预后的作用 | 首次揭示了FcγRIIb在复发性胶质母细胞瘤中的驱动作用及其与免疫相关信号通路的关联 | NA | 探讨FcγRIIb在复发性胶质母细胞瘤中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | FcγRIIb在肿瘤相关巨噬细胞和树突状细胞中的表达及其对复发性胶质母细胞瘤预后的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 来自中国胶质瘤基因组图谱和TCGA、REMBRANDT队列的GBM和正常组织样本 |
| 984 | 2024-08-08 |
Identification of therapeutic targets for osteosarcoma by integrating single-cell RNA sequencing and network pharmacology
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1098800
PMID:36686663
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和网络药理学方法，分析了骨肉瘤治疗的有效靶点 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和网络药理学方法，识别了与骨肉瘤进展相关的关键靶点，并预测了潜在的药物-靶点对 | 研究主要基于数据分析和分子对接，尚未进行体内外实验验证 | 识别骨肉瘤治疗的新靶点和潜在药物 | 骨肉瘤的细胞异质性和治疗靶点 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），网络药理学，分子对接分析 | NA | RNA | 基于GSE162454数据集获得了21个细胞簇，GSE36001数据集用于分析 |
| 985 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome in silico analysis reveals conserved regulatory programs in macrophages/monocytes of abdominal aortic aneurysm from multiple mouse models and human
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1062106
PMID:36698942
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法分析了来自多个小鼠模型和人类腹主动脉瘤的单细胞RNA测序数据，揭示了巨噬细胞/单核细胞的保守调控程序 | 首次对多个小鼠模型和人类腹主动脉瘤的单细胞RNA测序数据进行综合分析，识别了巨噬细胞/单核细胞的亚型及其调控网络 | 研究依赖于已发表的数据集，未进行新的实验验证 | 探究腹主动脉瘤中巨噬细胞/单核细胞的转录调控模式及其在疾病发生中的作用 | 腹主动脉瘤中的巨噬细胞/单核细胞及其调控基因和网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个细胞集群，11种细胞类型，涉及多个小鼠模型和人类样本 |
| 986 | 2024-08-08 |
Echidna: integrated simulations of single-cell immune receptor repertoires and transcriptomes
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac062
PMID:36699357
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研究论文 | 本文介绍了Echidna，一个R包，用于模拟单细胞水平的免疫受体库和转录组数据 | Echidna是首个能够模拟包含免疫受体库和基因表达的单细胞数据集的工具 | NA | 开发一个能够模拟单细胞免疫受体库和转录组数据的工具，以辅助软件开发和生物信息学基准测试 | 单细胞免疫受体库和转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 987 | 2024-08-08 |
More accurate estimation of cell composition in bulk expression through robust integration of single-cell information
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac049
PMID:36699374
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研究论文 | 本文介绍了一种基于协方差的单细胞分解（CSCD）方法，用于通过构建基于单细胞数据的参考表达谱和使用约束线性逆模型学习基因特异性批量表达转换，来估计批量数据中的细胞类型比例 | 本文引入了一种更先进的模型，成功地将scRNA-seq和批量RNA-seq数据集中的协方差结构纳入分析，并通过利用线性收缩估计相应的协方差矩阵来解决共线性问题 | Bisque方法受限于单变量模型，无法将基因间相关性纳入分析 | 提高批量表达数据中细胞成分估计的准确性 | 细胞类型比例的估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA-seq | 约束线性逆模型 | RNA-seq数据 | 使用了多个公开可用的数据集 |
| 988 | 2024-08-08 |
scMoC: single-cell multi-omics clustering
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac011
PMID:36699396
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研究论文 | 本文提出了一种名为scMoC的单细胞多组学聚类方法，用于从同一细胞的scRNA-seq和scATAC-seq数据中识别细胞聚类 | scMoC通过利用scRNA-seq数据来克服scATAC-seq数据的高稀疏性，并采用RNA引导的插补策略生成信息丰富的scATAC-seq数据，从而实现基于RNA和ATAC信息的生物学上有意义的集成聚类 | NA | 开发一种方法来利用单细胞多组学数据的互补性进行跨模态细胞聚类 | 单细胞的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 数据 | 使用了不同协议和不同数据稀疏性水平的数据集 |
| 989 | 2024-08-08 |
FlexDotPlot: a universal and modular dot plot visualization tool for complex multifaceted data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac019
PMID:36699406
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FlexDotPlot的R包，用于从多方面数据中生成点图，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | FlexDotPlot提供了一个通用且易于使用的解决方案，具有高度的多功能性，并包含一个交互式的R Shiny应用程序，使非R用户也能轻松生成点图 | NA | 开发一种功能更全面、更易用的点图可视化工具 | 多方面数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据可视化 | NA |
| 990 | 2024-08-08 |
Narciclasine inhibits phospholipase A2 and regulates phospholipid metabolism to ameliorate psoriasis-like dermatitis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1094375
PMID:36700214
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研究论文 | 本文研究了Narciclasine（Ncs）对磷脂酶A2的抑制作用及其对磷脂代谢的调节，以改善银屑病样皮肤病 | Ncs能够抑制角质形成细胞增殖和减少皮肤中免疫细胞的招募，通过抑制与银屑病相关的炎症介质，并直接抑制Th17细胞极化 | NA | 探索Narciclasine作为银屑病治疗新药的潜力 | Narciclasine对银屑病样小鼠模型的治疗效果及其作用机制 | NA | 银屑病 | 转录组学和脂质组学 | NA | 单细胞测序数据 | 使用IMQ诱导的银屑病样小鼠模型进行实验 |
| 991 | 2024-08-08 |
Comparative analysis of thoracic and abdominal aortic aneurysms across the segment and species at the single-cell level
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.1095757
PMID:36703732
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术比较分析了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在不同物种和部位的细胞亚结构和转录组特征 | 首次在单细胞水平上比较了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在人类和鼠模型中的细胞类型变化，并识别了保守的平滑肌细胞和巨噬细胞亚群 | 研究主要集中在鼠模型和临床患者样本，未涉及更多物种的比较 | 探讨使用血管紧张素II诱导的鼠模型研究人类主动脉瘤疾病的合理性和实用性 | 胸主动脉瘤和腹主动脉瘤在人类和鼠模型中的细胞亚结构和转录组特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括临床患者的胸主动脉瘤和腹主动脉瘤样本以及鼠模型的健康和病变主动脉样本 |
| 992 | 2024-08-08 |
MIF promotes cell invasion by the LRP1-uPAR interaction in pancreatic cancer cells
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1028070
PMID:36703790
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞移动抑制因子（MIF）通过LRP1-uPAR相互作用促进胰腺癌细胞侵袭的机制 | 揭示了MIF与uPAR之间的新关联，并解释了MIF如何增强胰腺癌细胞的侵袭能力 | NA | 探究MIF在胰腺癌进展中的作用及其机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组化染色，空间转录组学，流式细胞术 | NA | 组织，基因表达数据 | 使用PDAC组织和PDAC细胞异种移植模型进行研究 |
| 993 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals the heterogeneity of meningeal immunity in a mouse model of Methyl CpG binding protein 2 deficiency
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1056447
PMID:36703978
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了Mecp2缺陷小鼠硬脑膜中的免疫细胞，揭示了MeCP2缺乏对脑膜免疫的影响 | 首次详细描述了MeCP2缺乏小鼠脑膜免疫细胞的异质性及其功能变化 | NA | 探讨MeCP2缺乏对脑膜免疫细胞的影响及其在Rett综合征发展中的作用 | Mecp2缺陷小鼠的脑膜免疫细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | Mecp2缺陷小鼠和对照小鼠的脑膜免疫细胞 |
| 994 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the molecular features of peripheral blood immune cells in children, adults and centenarians
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1081889
PMID:36703979
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同年龄段（从儿童到百岁老人）外周血单个核细胞的分子特征 | 发现了在不同年龄段中，髓系细胞的比例和状态有显著变化，并鉴定了一种新的CD8CCR7GZMB细胞毒性T细胞亚型 | NA | 探究从儿童到百岁老人外周血免疫细胞的分子特征及其与年龄的关系 | 外周血单个核细胞（PBMCs）及其在不同年龄段的分子特征 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括1-12岁（G1）、20-30岁（G2）、30-60岁（G3）、60-80岁（G4）和超过110岁（G5）的多个年龄段 |
| 995 | 2024-08-08 |
Perioperative corticosteroid treatment impairs tumor-infiltrating dendritic cells in patients with newly diagnosed adult-type diffuse gliomas
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1074762
PMID:36703985
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研究论文 | 本研究探讨了围手术期皮质类固醇治疗对新诊断成人型弥漫性胶质瘤患者肿瘤浸润性树突状细胞的影响 | 首次揭示了皮质类固醇治疗对肿瘤浸润性树突状细胞功能障碍的影响 | NA | 研究皮质类固醇治疗对成人型弥漫性胶质瘤患者肿瘤浸润性树突状细胞的影响 | 成人型弥漫性胶质瘤患者的肿瘤浸润性树突状细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 多参数流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 996 | 2024-08-08 |
The submandibular and sublingual glands maintain oral microbial homeostasis through multiple antimicrobial proteins
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.1057327
PMID:36704102
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研究论文 | 本研究探讨了下颌下腺和舌下腺通过多种抗菌蛋白维持口腔微生物稳态的功能 | 首次独立移除小鼠的下颌下腺或舌下腺，通过16S rRNA测序和蛋白质组学分析，揭示了这两种腺体在维持口腔微生物稳态中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小 | 探究下颌下腺和舌下腺在维持口腔微生物稳态中的作用 | 下颌下腺和舌下腺的抗菌蛋白及其对口腔微生物稳态的影响 | NA | NA | 16S rRNA测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、蛋白质数据、RNA数据 | 6只小鼠（3只移除下颌下腺，3只移除舌下腺），3只对照组小鼠 |
| 997 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing research in maternal fetal interface
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.1079961
PMID:36704195
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研究论文 | 本文分析了母胎界面中单细胞转录组学的最新研究，并提供了理解和治疗各种病理妊娠的新方向 | 使用单细胞测序技术，不同于提供平均数据的批量测序，能够以单细胞分辨率解释细胞和分子景观 | NA | 深入理解母胎界面的异质性及其对生理和病理妊娠的影响 | 母胎界面的细胞和分子景观 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 998 | 2024-08-08 |
Inferring cell developmental stage-specific lncRNA regulation in the developing human neocortex with CDSlncR
2022, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2022.1037565
PMID:36710930
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研究论文 | 本文提出了一种名为CDSlncR的新型计算方法，用于推断人类新皮质发育中特定细胞发育阶段的lncRNA调控 | CDSlncR结合了潜在的lncRNA-目标结合信息与单细胞转录组数据，以推断特定细胞发育阶段的lncRNA调控 | 先前的批量数据驱动方法主要限于探索所有细胞的lncRNA调控，而不是特定于细胞发育阶段的lncRNA调控 | 研究特定细胞发育阶段的lncRNA调控 | 人类新皮质发育中的lncRNA调控 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞测序 | CDSlncR | 转录组数据 | 涉及人类新皮质不同发育阶段的单细胞转录组数据 |
| 999 | 2024-08-08 |
Assessment of Fibrinogen-like 2 (FGL2) in Human Chronic Kidney Disease through Transcriptomics Data Analysis
2022-12-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010089
PMID:36671474
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研究论文 | 本研究通过转录组数据分析评估了纤维蛋白原样蛋白2（FGL2）在人类慢性肾脏疾病（CKD）中的表达及其与疾病结果的关联 | 首次在人类CKD中评估FGL2的表达，并探讨了其与肾脏纤维化和疾病进展的关系 | 研究主要基于转录组数据和免疫组织化学分析，可能需要进一步的体内实验验证 | 评估FGL2在人类CKD中的表达及其与疾病结果的关联 | FGL2在CKD患者肾脏中的表达及其与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个独立的CKD队列（NEPTUNE和Innsbruck CKD队列）以及13个人类CKD转录组数据集 |
| 1000 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Molecular Characterization of the Immune Microenvironment in Acute Pancreatitis
2022-12-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13010078
PMID:36671463
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研究论文 | 本研究首次整合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和批量RNA测序（Bulk RNA-Seq）数据，揭示了急性胰腺炎（AP）中免疫微环境的分子特征 | 首次使用scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq数据展示AP中免疫细胞浸润的特征，并探索不同细胞类型的特定分子标记 | NA | 揭示急性胰腺炎中免疫微环境的分子特征和细胞间相互作用网络 | 急性胰腺炎中的免疫细胞浸润和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），批量RNA测序（Bulk RNA-Seq） | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |