单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling reveals intra-tumoral heterogeneity in human chordomas
2022-Sep, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03152-1
PMID:35084549
|
研究论文 | 这项研究探讨了人类软骨瘤中的肿瘤异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了软骨瘤的转录组特征及其异质性 | 仅涉及6个软骨瘤样本，样本量较小 | 评估软骨瘤的肿瘤异质性并识别潜在的治疗靶点 | 六个软骨瘤样本和分析的33,737个细胞 | 数字病理 | 软骨瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 6个软骨瘤样本，分析了33,737个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 942 | 2024-08-05 |
MAIT cells accumulate in ovarian cancer-elicited ascites where they retain their capacity to respond to MR1 ligands and cytokine cues
2022-May, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03118-9
PMID:34854949
|
研究论文 | 本研究探讨了卵巢癌引起的腹水中MAIT细胞的特征及其免疫功能 | 揭示了MAIT细胞在卵巢癌腹水中的功能，及其在肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且仅展示了功能标志而未进行深入机制研究 | 研究MAIT细胞在卵巢癌中的积累及其免疫反应能力 | 主要研究了卵巢癌患者及小鼠模型中的MAIT细胞 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 23名卵巢癌患者的腹水样本 | NA | NA | NA | NA |
| 943 | 2024-08-05 |
Construction of TME and Identification of crosstalk between malignant cells and macrophages by SPP1 in hepatocellular carcinoma
2022-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02967-8
PMID:34028567
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了肝细胞癌中的肿瘤微环境及SPP1在恶性细胞与巨噬细胞之间的交互作用 | 提出了一种新的表观遗传免疫评分系统(EIRS)，并揭示SPP1作为HCC患者预后差的免疫相关预测因子 | 研究主要依赖于已有的数据库，可能限制了对内在机制的更深入理解 | 探讨肝细胞癌的免疫微环境及其对疾病进展的影响 | 以肝细胞癌(HCC)患者为研究对象，分析肿瘤微环境的特征及与巨噬细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 944 | 2024-08-05 |
CD74+ macrophages are associated with favorable prognosis and immune contexture in hepatocellular carcinoma
2022-Jan, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-02962-z
PMID:34009409
|
研究论文 | 本研究探讨了CD74+巨噬细胞在肝细胞癌中的作用及其与预后和免疫环境的关系 | 本研究首次展示了CD74在肝细胞癌肿瘤微环境中的重要作用，并揭示了其与CD8细胞毒性T淋巴细胞浸润之间的关联 | 研究主要依赖于来自单一医院和TCGA的数据，可能存在样本代表性问题 | 探讨CD74在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本和相关的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫组化, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 单细胞数据 | 来自中山医院的肝细胞癌组织样本和TCGA数据 | NA | NA | NA | NA |
| 945 | 2024-08-07 |
Chronic superphysiologic AMH promotes premature luteinization of antral follicles in human ovarian xenografts
2022-03-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi7315
PMID:35263130
|
research paper | 研究探讨了超生理水平的抗穆勒氏管激素（AMH）对人类卵巢异种移植中卵泡黄素化的影响 | 首次通过共移植人卵巢皮质与表达AMH的血管内皮细胞，并进行单细胞RNA测序，揭示了超生理水平AMH对卵泡发育的影响 | 研究样本量较小，且仅限于免疫缺陷小鼠模型 | 探究AMH对卵泡发育的影响及其可能导致的排卵功能障碍 | 人卵巢皮质中的卵泡 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共观察了38个卵泡（19个对照组和19个AMH组） | NA | NA | NA | NA |
| 946 | 2024-08-07 |
Clonal hematopoiesis, myeloid disorders and BAX-mutated myelopoiesis in patients receiving venetoclax for CLL
2022-02-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021012775
PMID:34469514
|
研究论文 | 研究长期使用BCL2抑制剂venetoclax治疗慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者中出现的骨髓异常和BAX突变情况 | 首次发现BAX突变在venetoclax治疗CLL患者中的骨髓细胞中独立出现，并与BCL2突变在同一患者中同时存在 | 研究样本量有限，且仅限于接受venetoclax治疗的CLL患者 | 探究长期使用venetoclax治疗CLL患者中骨髓细胞的临床和分子异常 | 接受venetoclax治疗的CLL患者及其骨髓细胞 | 血液学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因突变数据 | 89名患者，其中41名患者的骨髓样本进行了详细分析 | NA | NA | NA | NA |
| 947 | 2024-08-07 |
Single-cell genome-wide association reveals that a nonsynonymous variant in ERAP1 confers increased susceptibility to influenza virus
2022-Nov-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100207
PMID:36465279
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scHi-HOST的单细胞高通量人类易感性测试方法，用于快速识别影响抵抗力和易感性的遗传变异，并应用于流感A病毒的研究 | scHi-HOST方法结合单细胞RNA测序技术，能够在混合感染的细胞系中同时确定遗传身份，揭示与病毒负担相关的遗传变异，并识别表达数量性状位点 | NA | 研究流感A病毒的遗传易感性 | 流感A病毒及相关的遗传变异 | 基因组学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 涉及欧洲、非洲和亚洲起源的细胞系及人类志愿者 | NA | NA | NA | NA |
| 948 | 2024-08-07 |
Live, die, or regenerate? New insights from multi-omic analyses
2022-08-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.07.026
PMID:35981522
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了视网膜神经保护和视神经再生的新策略 | 通过多组学筛选和单细胞RNA测序技术，发现了轴突损伤信号转导和再生过程中的关键转录调控因子 | NA | 探索视网膜神经保护和视神经再生的分子机制 | 视网膜神经保护和视神经再生中的关键分子 | 数字病理学 | NA | 多组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 949 | 2024-08-07 |
Follicular Lymphoma Microenvironment Characteristics Associated with Tumor Cell Mutations and MHC Class II Expression
2022-09-06, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-21-0075
PMID:35687817
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了滤泡性淋巴瘤（FL）的肿瘤微环境，并探讨了肿瘤细胞突变与主要组织相容性复合体II类（MHC II）表达之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了FL的肿瘤和免疫细胞群体，并揭示了MHC II表达与T细胞表型特征的关联 | NA | 研究FL的肿瘤微环境特征及其与肿瘤细胞突变和MHC II表达的关系 | 滤泡性淋巴瘤的肿瘤微环境和免疫细胞群体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 950 | 2024-08-07 |
The challenges and opportunities of scRNA-seq in COVID-19 research and clinical translation
2022-12-15, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-022-01923-x
PMID:36522785
|
评论 | 本文讨论了单细胞RNA测序在COVID-19研究中的应用，以及其在加速基础研究和治疗开发方面的挑战和前景 | 单细胞RNA测序技术在COVID-19研究中提高了对疾病发病机制和免疫特性的理解 | 讨论了当前利用单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 加速COVID-19和其他新兴传染病的基本研究和治疗开发 | COVID-19和其他新兴传染病 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 951 | 2024-08-07 |
Resolution of the curse of dimensionality in single-cell RNA sequencing data analysis
2022-08-09, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201591
PMID:35944930
|
研究论文 | 本文提出了一种名为RECODE的高维统计方法，用于解决单细胞RNA测序数据分析中的维度灾难问题 | RECODE方法不涉及维度降低，能够恢复所有基因的表达值，包括低表达基因，实现细胞命运转变的精确描绘和罕见细胞的识别 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的维度灾难问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 众多单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 952 | 2024-08-07 |
MAIT and Vδ2 unconventional T cells are supported by a diverse intestinal microbiome and correlate with favorable patient outcome after allogeneic HCT
2022-05-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj2829
PMID:35613281
|
研究论文 | 研究了异基因造血细胞移植后肠道微生物多样性与MAIT和Vδ2非传统T细胞数量增加及患者良好预后之间的关系 | 首次揭示了肠道微生物多样性与MAIT和Vδ2细胞数量增加及患者预后改善之间的免疫学联系 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模研究验证 | 探讨异基因造血细胞移植后肠道微生物多样性对患者免疫细胞和预后的影响 | 异基因造血细胞移植后的患者及其肠道微生物和免疫细胞 | 免疫学 | 血液疾病 | 单细胞转录组学和流式细胞术 | NA | 细胞 | 174名接受异基因造血细胞移植的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 953 | 2024-08-07 |
Targeting p21Cip1 highly expressing cells in adipose tissue alleviates insulin resistance in obesity
2022-01-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.11.002
PMID:34813734
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，发现并验证了在肥胖状态下脂肪组织中高表达p21的细胞群体，通过清除这些细胞可以缓解胰岛素抵抗。 | 首次发现并验证了p21高表达细胞在肥胖相关胰岛素抵抗中的关键作用，并提出了通过清除这些细胞来治疗胰岛素抵抗的新策略。 | 研究主要在动物模型和小规模人体实验中进行，需要进一步的大规模临床试验验证。 | 探索并验证针对肥胖状态下脂肪组织中p21高表达细胞的治疗策略，以缓解胰岛素抵抗。 | 肥胖状态下脂肪组织中的p21高表达细胞及其在胰岛素抵抗中的作用。 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了p21-Cre小鼠模型和人体脂肪样本进行实验。 | NA | NA | NA | NA |
| 954 | 2024-08-07 |
Characterization of transcript enrichment and detection bias in single-nucleus RNA-seq for mapping of distinct human adipocyte lineages
2022-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275509.121
PMID:35042723
|
研究论文 | 本研究比较了从人类白色和棕色脂肪细胞系中分离的单核细胞和成熟脂肪细胞的转录组景观与全细胞转录组，展示了单核RNA测序（snRNA-seq）在识别脂肪生成各阶段广泛细胞类型的能力 | 提出了针对snRNA-seq技术检测偏差的归一化策略，并展示了scRNA-seq和snRNA-seq数据集的成功整合 | snRNA-seq存在固有的转录本富集和检测偏差，可能不足以映射脂肪组织中的重要转录特征 | 探讨snRNA-seq在脂肪组织细胞多样性表征中的应用 | 人类白色和棕色脂肪细胞系的单核细胞和成熟脂肪细胞的转录组 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 人类白色和棕色脂肪细胞系的单核细胞和成熟脂肪细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 955 | 2024-08-07 |
iMyoblasts for ex vivo and in vivo investigations of human myogenesis and disease modeling
2022-01-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.70341
PMID:35076017
|
研究论文 | 研究使用无转基因的人类诱导多能干细胞（iPSCs）生成骨骼肌成肌细胞（iMyoblasts），并探讨其在体外和体内对人类肌生成和疾病模型的应用 | iMyoblasts具有胎儿样转录组特征，与成人肌肉活检成肌细胞（bMyoblasts）和iPSC诱导的肌肉前体细胞不同，能够稳定传代并保持肌管分化和储备细胞再生的双重承诺 | NA | 探索iMyoblasts在人类肌生成和疾病发病机制研究中的应用，以及肌肉干细胞治疗药物的开发 | iMyoblasts在体外和体内的应用，以及其在疾病模型中的分子病理学和治疗响应 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 免疫荧光、流式细胞术、qPCR、数字RNA表达谱分析、scRNA-Seq | NA | RNA | 多个iMyoblasts样本，包括来自不同肌肉疾病患者的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 956 | 2024-08-07 |
Uncovering emergent phenotypes in endothelial cells by clustering of surrogates of cardiovascular risk factors
2022-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-05404-7
PMID:35079076
|
研究论文 | 本文通过分析人冠状动脉内皮细胞的全基因表达，研究了化学性低氧、氧化脂质、IL-1β诱导的炎症、振荡流及其组合刺激对内皮细胞功能障碍的影响。 | 发现风险因素的聚类与单独刺激的总和不同，导致内皮细胞中出现如细胞增殖等新表型。 | NA | 揭示内皮细胞中风险因素的聚类如何影响内皮功能障碍的分子基础。 | 人冠状动脉内皮细胞及其在不同风险因素刺激下的基因表达和细胞过程。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人冠状动脉粥样硬化斑块样本 | NA | NA | NA | NA |
| 957 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell transcriptomes and chromatin landscapes reveals regulatory programs driving pharyngeal organ development
2022-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28067-4
PMID:35075189
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和染色质可及性数据，揭示了驱动咽器官发育的调控程序。 | 本文首次应用单细胞转录组和染色质可及性测序技术，生成涵盖咽内胚层模式化至发育中胚胎器官特异性上皮出现的多组学发育资源。 | NA | 旨在填补对咽内胚层发育分子基础和基因调控网络的全面和整合性理解的空白。 | 咽内胚层的发育及其在人类发育综合征中的作用。 | 基因组学 | 发育障碍 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 涉及发育中的小鼠胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 958 | 2024-08-07 |
Dynamics and Pathways of Chromosome Structural Organizations during Cell Transdifferentiation
2022-Jan-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.1c00416
PMID:35098228
|
研究论文 | 研究细胞转分化过程中染色体结构组织的动态变化和路径 | 开发了一种非平衡景观切换模型，用于研究人成纤维细胞和神经元细胞之间状态转换过程中染色体结构的动态变化 | NA | 揭示细胞转分化的分子机制 | 人成纤维细胞和神经元细胞的染色体结构 | NA | NA | 非平衡景观切换模型 | NA | 染色体结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 959 | 2024-08-07 |
Expression of the transcription factor PU.1 induces the generation of microglia-like cells in human cortical organoids
2022-01-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28043-y
PMID:35058453
|
研究论文 | 本文开发了一种在人皮质类器官（hCOs）中生成功能性小胶质细胞的方法，并研究了小胶质细胞在由淀粉样β（Aβ）诱导的炎症中的作用。 | 通过过表达髓系特异性转录因子PU.1，在hCOs中生成小胶质细胞样细胞，并将其移植到小鼠大脑中，利用单细胞转录组学分析其功能。 | NA | 研究小胶质细胞在神经发育和神经退行性疾病中的作用。 | 人皮质类器官（hCOs）中的小胶质细胞。 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 960 | 2024-08-07 |
Developmental single-cell transcriptomics of hypothalamic POMC neurons reveal the genetic trajectories of multiple neuropeptidergic phenotypes
2022-01-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.72883
PMID:35044906
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和翻译核糖体亲和纯化结合RNA测序（TRAP-seq）技术，探讨了下丘脑弓状核中的POMC神经元在发育过程中的转录组和翻译组特征 | 本研究首次揭示了POMC神经元在发育过程中多样化的遗传轨迹，以及这些神经元在成熟过程中形成的多种神经肽能表型 | NA | 探究下丘脑POMC神经元的发育转录程序，以及这些程序如何指定神经元的身份和功能 | 下丘脑弓状核中的POMC神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），翻译核糖体亲和纯化结合RNA测序（TRAP-seq） | NA | 转录组数据 | 多个发育阶段的下丘脑POMC神经元 | NA | NA | NA | NA |