单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2024-08-07 |
Single-cell computational machine learning approaches to immune-mediated inflammatory disease: New tools uncover novel fibroblast and macrophage interactions driving pathogenesis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1076700
PMID:36685542
|
综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术结合计算生物学方法，探索纤维母细胞与骨髓细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用及其临床意义 | 介绍了新的计算生物学技术，如维度降低、聚类和轨迹推断，以及这些技术在揭示纤维母细胞亚群与巨噬细胞之间新型相互作用中的应用 | 需要更强大的模型来进一步分析纤维母细胞的异质性及其与骨髓细胞的相互作用 | 总结计算技术在分类纤维母细胞异质性及其与骨髓细胞在特定生物学和临床环境中的相互作用方面的关键进展 | 纤维母细胞的异质性及其与巨噬细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用 | 机器学习 | 免疫介导炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 942 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals striking heterogeneity and functional organization of dendritic and monocytic cells in the bovine mesenteric lymph node
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1099357
PMID:36685557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了牛肠系膜淋巴结中树突状细胞和单核细胞的异质性和功能组织 | 揭示了树突状细胞和单核细胞的十个集群和七个集群，具有明显的转录组特征，并定义了淋巴结定居子集及其前体，以及高度激活的迁移树突状细胞子集 | NA | 研究树突状细胞和单核细胞在次级淋巴组织中启动和塑造适应性免疫反应的复杂系统 | 牛肠系膜淋巴结中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 三头成年牛的肠系膜淋巴结 | NA | NA | NA | NA |
| 943 | 2024-08-07 |
Disordered T cell-B cell interactions in autoantibody-positive inflammatory arthritis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1068399
PMID:36685593
|
研究论文 | 研究探讨了在幼年寡关节炎（oligo JIA）中，Tph细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 | 通过单细胞转录组学技术，进一步定义了Tph细胞的基因特征，并发现ANA阳性患者的Tph细胞上调了与B细胞帮助相关的基因 | NA | 确定在幼年寡关节炎中，T细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 | Tph细胞在幼年寡关节炎患者中的分布及其与B细胞的相互作用 | NA | 幼年寡关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 944 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the identity and regulators of human mast cell progenitors
2022-08-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022006969
PMID:35500226
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析揭示了人类肥大细胞前体细胞的身份及其调控因子 | 首次展示了FcεRI在肥大细胞前体阶段表达的时间关联，并揭示了外部刺激对肥大细胞前体FcεRI表达的调控作用 | NA | 探讨肥大细胞前体细胞的特征及其在疾病中的作用 | 人类肥大细胞前体细胞及其在过敏性哮喘和系统性肥大细胞增多症中的作用 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 成人外周血中的CD34+造血前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 945 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing distinguishes dendritic cell subsets in the rat, allowing advanced characterization of the effects of FMS-like tyrosine kinase 3 ligand
2022-Jul, Scandinavian journal of immunology
IF:4.1Q2
DOI:10.1111/sji.13159
PMID:35285040
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合多色光谱流式细胞术，对大鼠模型中的组织驻留树突状细胞进行鉴定和表征，并研究了FMS样酪氨酸激酶3配体（FLT3L）对其的影响。 | 首次将单细胞RNA测序与多色光谱流式细胞术结合，用于鉴定和表征大鼠模型中的组织驻留树突状细胞，并详细研究了FLT3L对其数量和表型的影响。 | 研究主要集中在肝脏、脾脏和肠系膜淋巴结中的树突状细胞，未涉及其他组织或器官。 | 探讨FLT3L对大鼠组织驻留树突状细胞数量和表型的影响。 | 大鼠模型中的组织驻留树突状细胞及其亚型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了Lewis大鼠进行体内实验。 | NA | NA | NA | NA |
| 946 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and clonality of kidney-infiltrating T cells in murine lupus nephritis
2022-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156048
PMID:35271505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序分析了小鼠狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的异质性和克隆性 | 发现CD8+和CD4+肾脏浸润T细胞在狼疮性肾炎中的不同分化状态，揭示了肾脏微环境对T细胞的抑制作用 | NA | 探讨狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的功能状态及其与疾病进展的关系 | 小鼠狼疮性肾炎模型中的肾脏浸润T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 947 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity and convergence of the tumor microenvironment in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003419
PMID:36685571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序数据分析，揭示了结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 | 本研究首次通过追踪分化轨迹，揭示了脂质代谢重塑和免疫功能抑制的关系，并构建了具有良好预后价值的免疫风险模型和临床风险模型 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 | 结直肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从肿瘤、癌旁组织和外周血中鉴定出8种主要细胞类型和25个亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 948 | 2024-08-07 |
The relevance between hypoxia-dependent spatial transcriptomics and the prognosis and efficacy of immunotherapy in claudin-low breast cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1042835
PMID:36685583
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学（ST）与免疫荧光技术，探讨了人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤中与缺氧相关的空间异质性及其对免疫治疗预后和疗效的影响。 | 首次揭示了claudin-低乳腺癌中基于缺氧依赖的空间异质性，并探讨了其作为临床结果和免疫治疗反应预测生物标志物的潜力。 | NA | 探讨缺氧依赖的空间转录组学与claudin-低乳腺癌患者免疫治疗预后和疗效的相关性。 | 人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | 1904例乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 949 | 2024-08-07 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
|
研究论文 | 本文开发了一种名为SECANT的生物学指导半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括使用表面蛋白数据中识别的可靠细胞类型标签作为细胞聚类的指导，为每个细胞群提供一般注释，利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞提高性能，以及准确预测scRNA-seq数据的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 生物信息学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 多个组织的公共和内部数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 950 | 2024-08-07 |
Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts
2022-Apr-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092197
PMID:35565326
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了胰腺导管细胞癌（PDAC）从原发部位向淋巴结转移过程中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的变化 | 提出了“进化侵袭水平（ELI）”框架，描述了基质侵袭性的进化，并发现了在PDAC进展的不同阶段，成纤维细胞亚群的显著变化 | NA | 探究胰腺导管细胞癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的角色和变化 | 胰腺导管细胞癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用Peng等人发表的单细胞RNA测序数据和The Cancer Genome Atlas中的大量RNAseq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 951 | 2024-08-07 |
Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network of Immune Environment Underlying Cervical Premalignant Lesion, Cervical Cancer and Metastatic Lymph Nodes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.897366
PMID:35812401
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了宫颈癌不同阶段的免疫细胞和间质细胞的组成、谱系和功能状态 | 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了宫颈癌进展过程中免疫细胞的转录组图谱 | NA | 深入理解肿瘤微环境（TME）的复杂性，为宫颈癌提供新的治疗策略 | 正常宫颈组织、上皮内瘤变、原发性肿瘤和转移性淋巴结组织中的免疫细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共获得59913个单细胞，分为9个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 952 | 2024-08-07 |
LRcell: detecting the source of differential expression at the sub-cell-type level from bulk RNA-seq data
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac063
PMID:35272348
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为LRcell的计算方法，用于从批量RNA-seq数据中识别导致差异表达的具体（亚）细胞类型 | LRcell方法通过预嵌入的标记基因和模拟研究，有效识别了与精神疾病相关的已知细胞类型 | LRcell主要依赖于批量RNA-seq数据，未涉及单细胞RNA测序技术 | 旨在解决批量RNA-seq分析中未解决的问题，即识别差异表达发生的具体（亚）细胞类型 | 批量RNA-seq数据中的（亚）细胞类型 | 生物信息学 | 精神疾病 | RNA-seq | 计算方法 | RNA-seq数据 | 使用了三个不同的真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 953 | 2024-08-07 |
Establishment of the large-scale longitudinal multi-omics dataset in COVID-19 patients: data profile and biospecimen
2022-Sep, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:35996834
|
研究论文 | 本文建立了COVID-19患者的大规模纵向多组学数据集，并提供了数据概况和生物样本信息 | 本研究收集了300名COVID-19患者和120名健康对照的全面生物样本和纵向多组学数据，包括全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序等 | NA | 旨在帮助管理当前和未来的病毒介导的流行病，并促进对COVID-19感染中涉及的生物相互作用的理解 | COVID-19患者的生物样本和多组学数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 全基因组测序、单细胞RNA测序结合T细胞受体和B细胞受体测序、批量TCR/BCR测序、细胞因子 profiling | NA | 生物样本和多组学数据 | 300名COVID-19患者和120名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 954 | 2024-08-07 |
Single Cell Transcriptomes of In Vitro Bradyzoite Infected Cells Reveals Toxoplasma gondii Stage Dependent Host Cell Alterations
2022, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2022.848693
PMID:35372115
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了体外感染布氏锥虫的宿主细胞转录组变化 | 揭示了布氏锥虫感染阶段依赖的宿主细胞转录组变化，并发现了宿主细胞中c-Myc和NF-κB信号通路及能量代谢途径的上调 | 未提及 | 旨在理解宿主细胞与布氏锥虫在转录组层面的相互作用 | 体外感染布氏锥虫的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 955 | 2024-08-07 |
Spatially resolved transcriptomics of high-grade serous ovarian carcinoma
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103923
PMID:35252817
|
研究论文 | 本研究首次全面采用空间转录组学方法分析高级别浆液性卵巢癌，通过分析治疗前肿瘤组织样本，揭示了化疗反应者之间的肿瘤组成差异 | 首次采用空间转录组学方法全面分析高级别浆液性卵巢癌，揭示了细胞集群组织和定位对化疗反应的影响 | 研究样本量较小，仅包括少数经过详细注释的高级别浆液性卵巢癌患者 | 深入分析高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织，探讨细胞集群的空间交互作用对化疗反应的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者，特别是化疗反应不同的患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小样本量，具体数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 956 | 2024-08-07 |
Emerging concepts on Leydig cell development in fetal and adult testis
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.1086276
PMID:36686449
|
综述 | 本文综述了睾丸间质细胞（Leydig细胞）在胎儿和成人阶段的发育过程及其细胞起源和功能意义 | 利用细胞/器官培养、全基因组分析、遗传操作小鼠模型、谱系追踪和单细胞RNA测序等技术，揭示了Leydig细胞的不同细胞起源及其转录组和类固醇生成输出的差异 | NA | 总结当前对胎儿和成人睾丸中Leydig细胞发育的理解，强调其在啮齿动物和灵长类动物中的共同或不同的细胞（祖细胞/干细胞）起源及其功能意义 | Leydig细胞在胎儿和成人睾丸中的发育及其细胞起源和功能 | NA | NA | 细胞/器官培养、全基因组分析、遗传操作小鼠模型、谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 957 | 2024-08-07 |
Profibrotic properties of C1q+ interstitial macrophages in silica-induced pulmonary fibrosis in mice
2022-04-09, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2022.02.037
PMID:35180470
|
研究论文 | 研究探讨了C1q+间质巨噬细胞在硅尘诱导的小鼠肺纤维化中的促纤维化特性 | 首次揭示了间质巨噬细胞在肺纤维化中的具体作用，并提出了针对这些细胞的潜在治疗策略 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨间质巨噬细胞在肺纤维化中的作用及其潜在的治疗策略 | 硅尘诱导的小鼠肺纤维化模型中的间质巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 958 | 2024-08-07 |
CEBPβ regulation of endogenous IGF-1 in adult sensory neurons can be mobilized to overcome diabetes-induced deficits in bioenergetics and axonal outgrowth
2022-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04201-9
PMID:35298717
|
研究论文 | 本研究探讨了CEBPβ调控内源性IGF-1在成年感觉神经元中的作用，以及如何通过上调IGF-1来克服糖尿病引起的生物能量和轴突生长的缺陷 | 首次详细描述了CEBPβ在糖尿病模型中对内源性IGF-1表达的调控作用，并证明了CEBPβ过表达可以促进神经突生长和线粒体呼吸 | 研究主要基于体外细胞培养系统和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 研究内源性IGF-1在感觉神经元中的表达及其在糖尿病神经病变中的作用 | 感觉神经元、卫星胶质细胞（SGCs）和背根神经节（DRG） | 神经科学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、原位杂交 | NA | RNA | 包括STZ诱导的1型糖尿病大鼠、Zucker糖尿病肥胖（ZDF）大鼠、高脂/高糖饮食的小鼠和db/db 2型糖尿病小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 959 | 2024-08-07 |
In vivo development and single-cell transcriptome profiling of human brain organoids
2022-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13201
PMID:35141969
|
研究论文 | 本文通过将小型未成熟的人脑类器官注射到成年SCID小鼠的纹状体中，创新性地在体内开发了人脑类器官，并对其进行了单细胞转录组分析 | 本文创新性地在体内开发了人脑类器官，并发现这些类器官具有更多的支持细胞，如周细胞样细胞和脉络丛细胞，以及较低的细胞应激和凋亡水平 | 文中提到，由于移植手术引起的损伤等技术问题仍然限制了人脑类器官的应用 | 提供一种新方法来生成人脑类器官，以应用于疾病模型和治疗 | 人脑类器官及其在神经系统疾病中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 6131个GFP标记的人类细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 960 | 2024-08-07 |
Cellular architecture of human brain metastases
2022-02-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.043
PMID:35063085
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、质谱流式细胞术以及结合小鼠模型和计算机模拟方法，对15个人类脑转移瘤中的超过10万个恶性与非恶性细胞进行了综合分析 | 揭示了脑转移瘤微环境的组成，分子层面定义了血瘤界面，并发现了富含浸润性T细胞和巨噬细胞的基质免疫抑制状态 | NA | 旨在深入理解人类脑转移瘤的生物学基础及其与肿瘤细胞内在特性和宿主环境的关系 | 人类脑转移瘤中的恶性与非恶性细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学，质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 超过10万个细胞来自15个人类脑转移瘤 | NA | NA | NA | NA |