单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-07 |
Adversarial domain translation networks for integrating large-scale atlas-level single-cell datasets
2022-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00251-y
PMID:38177826
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Portal的统一框架，利用对抗域翻译网络来学习大规模图谱级别单细胞RNA-seq数据集的协调表示 | Portal框架在集成过程中能更好地保留生物变异，且在低内存消耗下快速集成数百万个细胞 | NA | 开发一种能够有效集成和协调大规模单细胞RNA-seq数据集的方法 | 大规模图谱级别的单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗域翻译网络 | 单细胞RNA-seq数据 | 数百万个细胞 |
| 922 | 2024-08-07 |
sciCNV: high-throughput paired profiling of transcriptomes and DNA copy number variations at single-cell resolution
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab413
PMID:34655292
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研究论文 | 本文介绍了一种高吞吐量的单细胞RNA测序分析流程，能够为单个细胞提供配对的CNV和转录组图谱，从而探索CNV对细胞程序的影响 | 提出了sciCNV工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断单细胞CNV，提高了CNV检测的灵敏度和特异性 | NA | 研究CNV对细胞功能的影响，并开发新的工具用于单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据和CNV | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 923 | 2024-08-07 |
Human B-cell subset identification and changes in inflammatory diseases
2022-12-31, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxac104
PMID:36617261
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综述 | 本文综述了人类血液中B细胞亚群的识别及其在炎症疾病中的变化 | 利用高维表型工具如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了先前被认为是均质的B细胞群体的异质性 | 关于B细胞亚群的识别和命名仍存在不确定性和研究间的差异 | 探讨人类血液中常见的B细胞亚群及其在炎症和自身免疫疾病中的频率和功能变化 | 人类血液中的B细胞亚群及其在炎症疾病中的变化 | NA | 炎症疾病 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 924 | 2024-08-07 |
Singling out motor neurons in the age of single-cell transcriptomics
2022-09, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.03.016
PMID:35487823
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research paper | 本文讨论了利用单细胞转录组学技术揭示成年动物运动神经元内在异质性的新兴技术及其对疾病和脊髓损伤的潜在影响 | 利用高吞吐量的单细胞转录组学技术，快速分离和分析运动神经元核，揭示了骨骼和自主神经系统的显著转录多样性 | NA | 定义成年运动系统中运动神经元的异质性，并探讨其对疾病和脊髓损伤的影响 | 运动神经元的异质性及其在健康和退化状态下的特性 | digital pathology | neuromuscular disease | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | NA |
| 925 | 2024-08-07 |
Expression Profile of Inflammation Response Genes and Potential Regulatory Mechanisms in Dilated Cardiomyopathy
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/1051652
PMID:36035223
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研究论文 | 本研究分析了扩张型心肌病（DCM）中的炎症反应基因表达谱及其潜在调控机制 | 首次详细描述了DCM中炎症反应基因的表达情况及其调控机制，包括转录因子和非编码RNA的调控网络 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨DCM中炎症反应基因的表达及其调控机制 | DCM患者和健康对照组的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27,665个细胞样本，包括4个DCM样本和2个健康对照样本；166个DCM患者和166个健康对照的批量测序数据 |
| 926 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis of the Pathogenesis of Tendon Injury
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/7887782
PMID:36148412
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据挖掘，分析了肌腱组织中的细胞组成及其在肌腱修复中的作用 | 首次揭示了肌腱组织中M1巨噬细胞和T细胞的异质性，及其在肌腱损伤和修复中的不同生理过程 | NA | 探索肌腱组织的细胞组成及与肌腱修复相关的细胞群体和信号通路 | 肌腱组织的细胞组成及肌腱修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含七种细胞亚群的肌腱组织样本 |
| 927 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Low-Level Tragus Stimulation Improves Sepsis-Induced Myocardial Dysfunction by Promoting M2 Macrophage Polarization
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3327583
PMID:36285297
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了低水平耳屏刺激通过促进M2巨噬细胞极化改善脓毒症引起的心肌功能障碍 | 首次探讨了低水平耳屏刺激对脓毒症心肌功能障碍的影响及其机制，通过单细胞mRNA测序揭示了心脏细胞景观图 | NA | 探讨低水平耳屏刺激对脓毒症引起的心肌功能障碍的影响及其机制 | 脓毒症引起的心肌功能障碍及低水平耳屏刺激的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | NA |
| 928 | 2024-08-07 |
Functionalized Lineage Tracing for the Study and Manipulation of Heterogeneous Cell Populations
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1811-0_8
PMID:35094325
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研究论文 | 本文介绍了COLBERT方法，通过使用独特的单引导RNA（sgRNA）条形码作为功能标签来识别和召回特定的细胞谱系 | COLBERT方法利用sgRNA条形码稳定整合并主动转录，使得所有细胞后代都包含亲本条形码并产生功能性sgRNA，从而实现对异质细胞群中特定谱系的追踪和分离 | NA | 研究并操控异质细胞群 | 异质细胞群中的独特细胞谱系 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 929 | 2024-08-07 |
Titration of 124 antibodies using CITE-Seq on human PBMCs
2022-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24371-7
PMID:36460735
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研究论文 | 研究使用CITE-Seq技术在人外周血单个核细胞（PBMCs）上滴定124种抗体的最佳浓度 | 首次系统地评估了188种CITE-Seq抗体在PBMCs上的检测能力，并找到了最佳的染色浓度 | 研究仅限于人外周血单个核细胞，未涉及其他细胞类型 | 确定哪些CITE-Seq抗体能在PBMCs上检测到其抗原，并找到最佳的染色浓度 | 188种CITE-Seq抗体及其在PBMCs上的检测能力 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 930 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes and T cell receptors of vaccine-expanded apolipoprotein B-specific T cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1076808
PMID:36684560
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接种ApoB肽P6疫苗的小鼠中ApoB特异性T细胞的转录组和T细胞受体 | 首次深入表征了疫苗扩增的ApoB特异性T细胞，并揭示了T细胞受体与ApoB肽P6:MHC-II相互作用的特异性 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究疫苗接种对ApoB表位的诱导反应 | ApoB特异性T细胞的单细胞转录组和T细胞受体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠接种ApoB肽P6疫苗后的T细胞 |
| 931 | 2024-08-07 |
The effects of H22 tumor on the quality of oocytes and the development of early embryos from host mice: A single-cell RNA sequencing approach
2022-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本研究探讨了H22肿瘤对宿主小鼠卵母细胞质量和早期胚胎发育的影响，通过单细胞RNA测序方法进行分析 | 首次揭示了H22肿瘤通过改变与生殖相关基因的表达模式，影响卵母细胞质量和早期胚胎发育 | NA | 研究癌症与女性生殖之间的关联 | H22肿瘤携带小鼠的卵母细胞和合子发育潜力 | NA | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 202个差异表达基因中，45个与卵母细胞质量密切相关 |
| 932 | 2024-08-07 |
scPreGAN, a deep generative model for predicting the response of single-cell expression to perturbation
2022-06-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac357
PMID:35639705
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研究论文 | 本文提出了一种名为scPreGAN的深度生成模型，用于预测单细胞表达对外部扰动的响应 | scPreGAN结合了自编码器和生成对抗网络，能够提取未扰动数据和扰动数据的共同信息，并预测扰动数据，实验表明其预测性能优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测单细胞表达对外部扰动响应的深度生成模型 | 单细胞表达数据及其对外部扰动的响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 单细胞表达数据 | 三个真实数据集 |
| 933 | 2024-08-07 |
RNA-seq characterization of histamine-releasing mast cells as potential therapeutic target of osteoarthritis
2022-Nov, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2022.109117
PMID:36109004
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析和药物阻断组胺活性，探讨肥大细胞在骨关节炎中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，结合流式细胞术和免疫组化分析，对骨关节炎中的肥大细胞进行详细表征 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人体中进一步验证 | 进一步阐明肥大细胞在骨关节炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 骨关节炎的滑膜组织和滑液中的肥大细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | RNA | 包括40名骨关节炎患者和使用组胺H1受体拮抗剂西替利嗪治疗的小鼠模型 |
| 934 | 2024-08-07 |
Mapping the biogenesis of forward programmed megakaryocytes from induced pluripotent stem cells
2022-02-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj8618
PMID:35171685
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研究论文 | 本文开发了一种从多能干细胞生产血小板前体细胞巨核细胞的系统，并通过单细胞RNA测序技术映射了体外分化过程中的每个状态与其在体内的等效状态 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了五个表面标记，这些标记可重复纯化巨核细胞前体细胞，并优化了培养条件以增加巨核细胞前体细胞的生产 | 目前尚不清楚体外巨核细胞前体细胞状态是否与体内状态一致 | 研究旨在映射体外和体内巨核细胞前体细胞状态的平行关系，并优化体外衍生输血产品的生产 | 研究对象为从诱导多能干细胞衍生的巨核细胞及其前体细胞 | NA | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 935 | 2024-08-07 |
Cerebrospinal fluid immune dysregulation during healthy brain aging and cognitive impairment
2022-12-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.019
PMID:36516855
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序研究了45名认知正常的54至82岁受试者的脑脊液（CSF）免疫变化，并对比了14名认知受损受试者的CSF免疫情况。 | 首次揭示了随着年龄增长和认知障碍，脑脊液中免疫系统的变化，特别是单核细胞中脂质运输基因的上调和下调，以及CXCL16-CXCR6信号通路在认知受损中的作用。 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定年龄段和认知状态的受试者。 | 探究脑脊液免疫系统在健康脑老化和认知障碍中的变化。 | 脑脊液中的免疫系统及其在不同认知状态下的变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 45名认知正常的受试者和14名认知受损的受试者 |
| 936 | 2024-08-07 |
223Ra Induces Transient Functional Bone Marrow Toxicity
2022-10, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.121.263310
PMID:35177425
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研究论文 | 本研究探讨了223Ra治疗对骨髓生物学的影响，通过结合流式细胞术、单细胞RNA测序、三维多光子显微镜和骨髓移植分析 | 本研究首次全面解释了223Ra对骨髓细胞的可逆效应，并排除了长期骨髓毒性 | NA | 研究223Ra治疗对骨髓功能的影响及其安全性 | 骨髓生物学和骨髓细胞 | NA | 前列腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、三维多光子显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 937 | 2024-08-07 |
Inference on spatial heterogeneity in tumor microenvironment using spatial transcriptomics data
2022-Sep, Computational and systems oncology
DOI:10.1002/cso2.1043
PMID:36035873
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研究论文 | 本文提出了一种基于网络图的空间统计模型框架，用于分析空间转录组数据，以揭示肿瘤微环境中的模块性和空间异质性 | 首次提出使用网络图的空间统计模型来量化肿瘤微环境中的空间异质性 | 研究仅限于胰腺导管腺癌样本，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究肿瘤微环境中的空间异质性及其对肿瘤生长和癌症特征的影响 | 肿瘤微环境中的细胞类型和通路特征的空间分布 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 网络图 | 分子数据 | 胰腺导管腺癌样本 |
| 938 | 2024-08-07 |
IDEAS: individual level differential expression analysis for single-cell RNA-seq data
2022-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02605-1
PMID:35073995
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研究论文 | 本文提出了一种名为IDEAS的统计方法，用于分析单细胞RNA测序数据中个体间基因表达的差异 | IDEAS方法通过总结每个基因在每个个体中的表达分布，并评估这些个体特定分布在两组个体之间是否存在差异，从而实现个体水平的差异表达分析 | NA | 旨在发现两组个体间差异表达的基因 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 自闭症, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个个体 |
| 939 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing in Yeast Using the 10× Genomics Chromium Device
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2257-5_1
PMID:35524108
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研究论文 | 本文描述了一种使用10× Genomics平台对酵母Saccharomyces cerevisiae进行单细胞RNA测序的简易实施方案 | 引入了Zymolyase酶来消化细胞壁，以便在液滴形成初期有效裂解酵母细胞，同时不影响液滴乳化和后续样本处理 | NA | 研究微生物中单个细胞的生理学特性 | 酵母Saccharomyces cerevisiae | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 940 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA analysis reveals the potential risk of organ-specific cell types vulnerable to SARS-CoV-2 infections
2022-Jan, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2021.105092
PMID:34864302
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据，通过生物信息学分析揭示了SARS-CoV-2感染特定器官细胞类型的潜在风险 | 研究首次揭示了M1型巨噬细胞与重症COVID-19患者的高度关联，并识别了可能的治疗靶点，如核糖体相关通路 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 理解SARS-CoV-2入侵人体细胞的机制及COVID-19特定器官易感细胞类型 | SARS-CoV-2感染的特定器官细胞类型及COVID-19的发病机制 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过160万例确诊病例，包括330万例死亡 |