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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-07 |
Mammalian Digit Tip Regeneration: Moving from Phenomenon to Molecular Mechanism
2022-01-04, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a040857
PMID:34312249
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综述 | 本文综述了哺乳动物指尖再生的当前知识状态,讨论了胚芽的来源和形成以及单细胞RNA测序带来的分子标记和细胞组成的最新见解 | 探讨了指尖再生的分子机制,并讨论了已知的分子途径在肢体发育中如何为指尖再生研究提供信息 | NA | 深入理解哺乳动物指尖再生的分子机制 | 指尖再生的胚芽结构及其分子标记和细胞组成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2024-08-07 |
Sensei: how many samples to tell a change in cell type abundance?
2022-Jan-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04526-5
PMID:34983369
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research paper | 本文开发了一种名为Sensei的新方法,用于确定在单细胞研究中检测细胞类型丰度变化所需的样本数量和细胞数量 | Sensei扩展了t检验并使用beta-二项分布模型来模拟细胞丰度,为确定样本大小提供了数学准确性和实用指南 | NA | 解决在受控研究中确定检测细胞类型丰度变化所需样本大小的统计挑战 | 细胞类型丰度变化 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing, mass cytometry | beta-binomial distribution | single-cell data | 超过20种细胞类型和30种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 923 | 2024-08-07 |
Dexamethasone modulates immature neutrophils and interferon programming in severe COVID-19
2022-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01576-3
PMID:34782790
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和血浆蛋白质组学技术,探讨了地塞米松在严重COVID-19中对未成熟中性粒细胞和干扰素编程的调节作用 | 发现COVID-19相关ARDS中存在由干扰素和前列腺素信号调节的特定中性粒细胞状态,地塞米松能改变这些中性粒细胞状态并重塑细胞间相互作用 | 研究主要集中在男性患者,可能影响结果的普遍性 | 揭示地塞米松在严重COVID-19中的作用机制,为开发针对性的免疫疗法提供依据 | 严重COVID-19患者中的中性粒细胞及其对地塞米松的反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,血浆蛋白质组学 | NA | RNA序列,蛋白质 | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 924 | 2024-08-07 |
Long non-coding RNAs (lncRNAs) NEAT1 and MALAT1 are differentially expressed in severe COVID-19 patients: An integrated single-cell analysis
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0261242
PMID:35007307
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了长非编码RNA NEAT1和MALAT1在重症COVID-19患者中的差异表达情况 | 首次综合分析了来自重症和轻症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据,揭示了NEAT1和MALAT1在不同病情中的差异表达 | 研究仅限于特定的细胞类型和基因,可能需要更广泛的细胞和基因分析以全面理解其在COVID-19中的作用 | 揭示重症与轻症COVID-19患者之间的关键炎症差异因子 | 长非编码RNA NEAT1和MALAT1在COVID-19患者中的表达情况 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自重症和轻症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗细胞和外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 925 | 2024-08-07 |
Optimization of Long-Term Human iPSC-Derived Spinal Motor Neuron Culture Using a Dendritic Polyglycerol Amine-Based Substrate
2022 Jan-Dec, ASN neuro
IF:3.9Q2
DOI:10.1177/17590914211073381
PMID:35023784
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研究论文 | 本文介绍了一种基于树枝状聚甘油胺(dPGA)基质的方法,用于延长人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的脊髓运动神经元(MNs)的长期培养 | 使用dPGA涂层培养皿,使得MNs更适合长期研究细胞活力、分子身份和自发网络电生理活动 | 目前hiPSC衍生的MN应用常受限于我们监测MN形态、存活和其他功能特性的能力 | 改善hiPSC衍生的MN的长期培养条件,以促进人类MN生物学和疾病的研究 | 人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的脊髓运动神经元(MNs) | NA | 脊髓性肌萎缩症,肌萎缩侧索硬化症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 926 | 2024-08-07 |
An atlas of dynamic peripheral blood mononuclear cell landscapes in human perioperative anaesthesia/surgery
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.663
PMID:35061932
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研究论文 | 本研究探讨了围手术期麻醉对患者免疫细胞动态变化的影响,通过单细胞测序技术分析了外周血单个核细胞(PBMCs)的响应。 | 首次报道了围手术期麻醉/手术对循环免疫细胞时间表型的影响,并提供了单细胞层面的解决方案。 | NA | 研究围手术期麻醉对患者免疫系统的具体影响,特别是免疫细胞的动态变化。 | 外周血单个核细胞(PBMCs)及其在围手术期对麻醉的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | PBMCs样本在麻醉和手术前1天、麻醉后0小时、24小时和48小时采集。 | NA | NA | NA | NA |
| 927 | 2024-08-07 |
Evaluation of deep convolutional neural networks for in situ hybridization gene expression image representation
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0262717
PMID:35073334
|
研究论文 | 本文评估了深度卷积神经网络在原位杂交基因表达图像表示中的应用 | 提出了一种对比学习任务——基因重识别,以计算原位杂交图像的表示,并在模型中实现了显著的改进 | NA | 更好地捕捉人类大脑皮层中基因表达的复杂模式 | 原位杂交图像中的基因表达强度和模式 | 计算机视觉 | 精神分裂症 | 深度卷积神经网络 | CNN | 图像 | 约1000个基因的数据集,来自42个个体;第二个数据集包含78个基因,来自53个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 928 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling identifies mechanisms of inflammatory heterogeneity in chronic rhinosinusitis
2022-10, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01312-0
PMID:36138182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞,识别了与慢性鼻窦炎亚型发病机制相关的特定细胞亚群和分子 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了慢性鼻窦炎亚型的异质性免疫微环境和发病机制,并发现了潜在的治疗靶点 | 研究主要集中在小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体临床试验验证 | 深入理解慢性鼻窦炎的异质性免疫微环境和发病机制,并探索潜在的治疗方法 | 健康个体和慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜细胞 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 健康个体和三种慢性鼻窦炎亚型患者的鼻黏膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 929 | 2024-08-07 |
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120718
PMID:35714704
|
研究论文 | 本研究探讨了早期生活压力通过矿物皮质激素受体依赖性增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量,加剧成年雌性小鼠肥胖的现象。 | 本研究首次揭示了早期生活压力通过矿物皮质激素受体影响脂肪细胞功能,加剧肥胖的具体机制。 | 研究主要集中在雌性小鼠上,未来研究可以扩展到雄性小鼠或其他动物模型,以验证结果的普遍性。 | 旨在理解母体分离和早期断奶对脂肪组织基本稳态功能的具体影响,并探究这种影响是否通过矿物皮质激素受体介导。 | 研究对象包括雌性小鼠的卵巢白色脂肪组织,以及分离的前脂肪细胞和成熟脂肪细胞。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据,脂质组学数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 930 | 2024-08-07 |
Progesterone Receptor Membrane Component-1 May Promote Survival of Human Brain Microvascular Endothelial Cells in Alzheimer's Disease
2022 Jan-Dec, American journal of Alzheimer's disease and other dementias
DOI:10.1177/15333175221109749
PMID:35730360
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研究论文 | 本研究探讨了孕酮受体膜成分-1(PGRMC1)在阿尔茨海默病(AD)中对脑血管内皮细胞功能的调节作用 | 首次揭示了PGRMC1在AD中对脑血管内皮细胞功能的影响,为AD治疗提供了新的治疗靶点 | NA | 探索PGRMC1在调节血管内皮功能中的作用,为AD提供新的治疗选项 | 人脑微血管内皮细胞(HBMVECs) | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 使用了人脑微血管内皮细胞(HBMVECs)进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 931 | 2024-08-07 |
Combined protein and transcript single-cell RNA sequencing in human peripheral blood mononuclear cells
2022-09-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-022-01382-4
PMID:36045343
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研究论文 | 本文开发了一种结合蛋白质和转录组单细胞RNA测序(scRNA-seq)的方法,用于分析人外周血单个核细胞(PBMCs)。 | 该研究首次实现了在PBMCs中同时进行蛋白质和转录组的单细胞RNA测序,这种方法比传统的流式细胞术、质谱细胞术或仅转录组的scRNA-seq具有更高的分辨率。 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法,以提高临床研究中PBMCs分析的分辨率和应用范围。 | 人外周血单个核细胞(PBMCs) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Seurat UMAPs 和 Louvain 聚类 | 细胞 | 31名参与者,共测序41,611个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 932 | 2024-08-07 |
Human distal lung maps and lineage hierarchies reveal a bipotent progenitor
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04541-3
PMID:35355018
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞分析技术,揭示了人类远端气道的细胞类型和分子特征,包括首次描述的LGR5成纤维细胞和TRB特异性AT0细胞及TRB分泌细胞 | 首次全面描绘了人类远端气道的细胞图谱,并发现了一种双潜能的AT0细胞状态,这种细胞在肺再生和疾病中起关键作用 | 研究主要基于非人类灵长类模型和人类器官培养,可能与实际人体肺部情况存在差异 | 旨在理解人类远端气道的细胞组成和分子身份,以及这些信息在健康和疾病中的应用 | 人类远端气道,包括终末和呼吸性细支气管(TRBs)的细胞类型和分子特征 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | 细胞数据 | 包括非人类灵长类模型、人类器官培养和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 933 | 2024-08-07 |
Antimicrobial production by perifollicular dermal preadipocytes is essential to the pathophysiology of acne
2022-02-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abh1478
PMID:35171653
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨了皮肤成纤维细胞向脂肪细胞分化在痤疮发病机制中的作用 | 首次揭示了成纤维细胞向脂肪细胞分化过程中产生的抗菌肽cathelicidin在非感染性皮肤病痤疮中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和痤疮患者样本,可能存在种属差异 | 探究成纤维细胞向脂肪细胞分化在痤疮发病机制中的作用 | 人痤疮病灶和受挑战的小鼠皮肤 | NA | 痤疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人痤疮病灶和小鼠皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 934 | 2024-08-07 |
Transcriptome Comparison of Brain and Kidney Endothelial Cells in Homeostasis
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/5239255
PMID:35132377
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了脑和肾内皮细胞的基因表达谱和生物学特征 | 首次揭示了脑和肾内皮细胞在稳态下的相似性和差异,并识别出七个内皮细胞亚群,其中两个与中风和/或抑郁相关的通路基因上调 | NA | 旨在深入理解肾病与神经炎症(如中风和抑郁)之间的关系 | 脑和肾内皮细胞 | 数字病理学 | 中风,抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个脑和肾内皮细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 935 | 2024-08-07 |
Immune dysfunction signatures predict outcomes and define checkpoint blockade-unresponsive microenvironments in acute myeloid leukemia
2022-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159579
PMID:36099049
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研究论文 | 本研究探讨了急性髓系白血病(AML)如何促进衰老样CD8+ T细胞的生成及其预后相关性 | 定义了新的免疫效应功能障碍(IED)签名,这些签名与不良风险分子病变、干细胞性和不良预后相关,并且是比2017-ELN风险或白血病干细胞(LSC17)评分更强大的总体生存预测因子 | NA | 研究AML如何促进衰老样CD8+ T细胞的生成及其预后相关性 | 急性髓系白血病(AML)患者的免疫功能障碍和预后 | 免疫学 | 急性髓系白血病 | NanoString, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 1,896名接受化疗和/或免疫检查点阻断(ICB)治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 936 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies G-protein coupled receptor 87 as a basal cell marker expressed in distal honeycomb cysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02373-2021
PMID:35604813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 937 | 2024-08-07 |
Protocol to obtain high-quality single-cell RNA-sequencing data from mouse liver cells using centrifugation
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101824
PMID:36386875
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研究论文 | 本文介绍了一种使用离心法从鼠肝细胞中获取高质量单细胞RNA测序数据的方法 | 提出了一种新的离心法来获取可存活的肝细胞和非实质性肝细胞,以避免使用荧光激活细胞分选(FACS)导致的细胞死亡问题 | NA | 开发一种新的方法来获取高质量的肝细胞单细胞RNA测序数据 | 鼠肝细胞,特别是肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2024-08-07 |
DeepVelo: Single-cell transcriptomic deep velocity field learning with neural ordinary differential equations
2022-Dec-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq3745
PMID:36449617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络的常微分方程模型DeepVelo,用于模拟单细胞转录组动力学 | DeepVelo能够通过描述单细胞内连续时间的基因表达变化,来模拟复杂的转录组动力学 | NA | 研究单细胞转录组动力学,并探索细胞状态的不稳定性及发育驱动基因 | 单细胞基因表达数据和RNA速度 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 使用来自不同测序平台的公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 939 | 2024-08-07 |
Improving Transcriptome Fidelity Following Synovial Tissue Disaggregation
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.919748
PMID:36035425
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研究论文 | 本文通过改进关节组织分散技术,提高了解散关节组织细胞转录组的保真度,特别是对于单细胞RNA测序(scRNAseq)的应用 | 本文引入了RNA聚合酶抑制剂和冷酶消化方法,有效减少了组织处理过程中相关转录本的诱导,从而提高了转录组的保真度 | NA | 提高解散关节组织细胞转录组的保真度 | 骨关节炎(OA)和类风湿关节炎(RA)的关节组织 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 骨关节炎和类风湿关节炎的关节组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 940 | 2024-08-07 |
A high interferon gamma signature of CD8+ T cells predicts response to neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1056144
PMID:36685525
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研究论文 | 研究探讨了胃癌中肿瘤微环境(TME)与新辅助免疫治疗加化疗之间的相互作用,并分析了CD8+ T细胞中高基线干扰素γ(IFN-γ)信号对治疗反应的预测作用。 | 首次阐明了胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境特征之间的相互作用,并强调了CD8+ T细胞的信号在预测治疗反应中的重要性。 | 研究样本量较小,仅涉及十个胃癌样本,可能影响结果的普遍性。 | 探究胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境的相互作用及其对治疗效果的影响。 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8+ T细胞的干扰素γ信号。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十个胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |