单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-07 |
Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer
2022-Sep-30, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0036
PMID:35983702
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析癌症细胞衰老相关基因表达异质性中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了癌症细胞中衰老相关基因表达的多样性及其在肿瘤恶性转化中的作用 | NA | 探讨衰老细胞在肿瘤恶性转化中的作用及衰老相关基因在肿瘤微环境中的功能 | 癌症细胞及肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 902 | 2024-08-07 |
IL-13-programmed airway tuft cells produce PGE2, which promotes CFTR-dependent mucociliary function
2022-07-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159832
PMID:35608904
|
研究论文 | 本文研究了IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响，发现IL-13能扩展和编程气道簇细胞向前列腺素E2代谢，进而促进囊性纤维化跨膜传导调节因子依赖的纤毛功能。 | 首次揭示了气道簇细胞在过敏性气道中调节上皮纤毛功能的作用。 | NA | 探讨IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响及其对纤毛功能的作用。 | 气道簇细胞及其在2型炎症中的作用。 | NA | 呼吸道疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用大量和单细胞RNA测序分析气道上皮和鼠模型。 |
| 903 | 2024-08-07 |
Trophoblast Cell Subtypes and Dysfunction in the Placenta of Individuals with Preeclampsia Revealed by Single‑Cell RNA Sequencing
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0211
PMID:35289305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型及其功能异常的转录组变化 | 首次在单细胞水平上比较了健康对照组和先兆子痫组胎盘中滋养层细胞的转录组差异，并分析了相关的转录因子调控网络 | 研究主要集中在转录组水平，未涉及蛋白质水平或其他层面的功能验证 | 探究先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型的特异性转录组变化及其功能 | 胎盘组织中的滋养层细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,006个细胞，包括11种细胞类型 |
| 904 | 2024-08-07 |
Gene Expression Profiling of the Habenula in Rats Exposed to Chronic Restraint Stress
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.2257
PMID:35534192
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研究论文 | 本研究通过基因组范围的基因表达分析，研究了暴露于慢性束缚应激下的大鼠缰核的转录组变化 | 本研究首次识别了379个受慢性应激影响的差异表达基因（DEGs），并分析了这些基因在神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、昼夜节律同步和突触信号传导中的富集情况 | NA | 探讨慢性应激对大鼠缰核基因表达的影响及其在抑郁症发病机制中的作用 | 大鼠缰核的基因表达 | 神经科学 | 抑郁症 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 14天慢性束缚应激暴露的大鼠缰核样本 |
| 905 | 2024-08-07 |
RAGE Inhibitors as Alternatives to Dexamethasone for Managing Cerebral Edema Following Brain Tumor Surgery
2022-03, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1007/s13311-022-01207-w
PMID:35226341
|
研究论文 | 研究了RAGE抑制剂在减少脑肿瘤手术后脑水肿中的作用，并比较了其与地塞米松的效果 | 发现RAGE抑制剂在减少神经炎症和血脑屏障破坏方面与地塞米松同样有效，且不会影响抗PD-1免疫疗法的效果 | 研究主要在动物模型和有限的临床样本中进行，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索脑肿瘤手术后脑水肿管理的新方法 | RAGE受体及其配体在神经外科损伤后的炎症反应中的作用 | NA | 脑肿瘤 | Nanostring, 流式细胞术, qPCR, 免疫印迹, 单细胞RNA测序, ELISA | NA | 组织, 体液 | 小鼠模型和人类肿瘤组织及体液样本 |
| 906 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Infection Induces Ferroptosis of Sinoatrial Node Pacemaker Cells
2022-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320518
PMID:35255712
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响，特别是通过仓鼠模型和人类胚胎干细胞（hESC）衍生的类似窦房结（SAN）起搏细胞进行研究。 | 本文首次展示了SARS-CoV-2可以直接感染心脏的主要起搏细胞，并诱导铁死亡，这是一种可能导致COVID-19患者心律失常的机制。 | 由于难以分离和培养人类SAN细胞，研究主要依赖于仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 探索SARS-CoV-2感染对心脏起搏细胞的影响，并寻找保护这些细胞免受感染的药物。 | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 定量实时聚合酶链反应、免疫染色、单细胞RNA测序和高含量化学筛选。 | NA | RNA | 仓鼠模型和hESC衍生的SAN-like起搏细胞。 |
| 907 | 2024-08-07 |
Long read single cell RNA sequencing reveals the isoform diversity of Plasmodium vivax transcripts
2022-12, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010991
PMID:36525464
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研究论文 | 本研究利用Pacific Biosciences化学方法对单细胞寄生虫进行scRNA-seq库测序，以表征全长Plasmodium vivax转录本 | 首次使用长读长测序技术在单细胞水平上表征Plasmodium vivax的转录本多样性 | NA | 旨在揭示Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | Plasmodium vivax转录本的异构体多样性 | 测序技术 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），Pacific Biosciences（PacBio）化学 | NA | 转录组数据 | 多个单细胞寄生虫样本 |
| 908 | 2024-08-07 |
Engineering a niche supporting hematopoietic stem cell development using integrated single-cell transcriptomics
2022-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28781-z
PMID:35332125
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了从胚胎动脉血管中的造血内皮细胞向造血干细胞过渡的转录组特征，并识别了支持造血干细胞成熟和自我更新的信号分子。 | 本文通过伪时间排序揭示了造血内皮细胞向造血干细胞过渡过程中的基因表达动态，并识别了特定表达于发育中的造血干细胞的表面受体及其相应的配体。 | NA | 研究造血干细胞发育所需的信号交互作用，并推进造血干细胞在治疗应用中的工程化目标。 | 造血干细胞（HSCs）及其发育过程中的信号分子。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 胚胎动脉血管区域（AGM）来源的细胞 |
| 909 | 2024-08-07 |
SCIFER: approach for analysis of LINE-1 mRNA expression in single cells at a single locus resolution
2022-Aug-26, Mobile DNA
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13100-022-00276-0
PMID:36028901
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研究论文 | 介绍了一种名为SCIFER的方法，用于在单细胞RNA测序数据集中以单个位点分辨率量化移动元素的表达 | SCIFER通过唯一地比对单细胞RNA测序读取到基因组并提取单细胞的比对，提高了L1位点识别的准确性 | NA | 研究L1 mRNA在单细胞中的表达模式，特别是在单个位点分辨率下 | L1 mRNA在单细胞中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了来自人类和小鼠的睾丸的单细胞RNA测序数据集 |
| 910 | 2024-08-07 |
ESR1 mutant breast cancers show elevated basal cytokeratins and immune activation
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29498-9
PMID:35440136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 911 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis of human pancreatic islets reveals novel cellular states in type 1 diabetes
2022-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00531-x
PMID:35228745
|
研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析，研究了人类胰腺胰岛在1型糖尿病中的细胞状态 | 开发了一种先进的综合分析策略，用于评估胰腺胰岛并识别典型细胞类型 | NA | 揭示1型糖尿病中胰腺胰岛的新细胞状态 | 人类胰腺胰岛中的多种细胞类型 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组学、飞行时间流式细胞术、原位成像质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 24名1型糖尿病、自身抗体阳性和非糖尿病器官捐赠者的胰腺胰岛 |
| 912 | 2024-08-07 |
Tipping the balance between erythroid cell differentiation and induction of anemia in response to the inflammatory pathology associated with chronic trypanosome infections
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1051647
PMID:36420267
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研究论文 | 本研究通过筛选10个不同毒力的野外分离株，建立了一个模拟慢性动物锥虫病的实验疾病模型，并深入分析了脾脏巨噬细胞在调节脾脏髓外造血中的作用。 | 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞（TRMs）在调节脾脏髓外造血中的双重作用，并展示了在慢性感染过程中，巨噬细胞激活状态的复杂性。 | NA | 研究慢性锥虫感染引起的炎症病理与红细胞分化及贫血诱导之间的平衡。 | 慢性锥虫感染的实验模型及脾脏巨噬细胞在其中的作用。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个不同毒力的野外分离株 |
| 913 | 2024-08-07 |
The purinergic P2Y14 receptor links hepatocyte death to hepatic stellate cell activation and fibrogenesis in the liver
2022-04-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe5795
PMID:35385339
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研究论文 | 本文探讨了嘌呤能受体P2Y14在肝细胞死亡与肝星状细胞激活及纤维化中的作用 | 首次揭示了P2Y14受体及其配体在肝细胞死亡与肝纤维化之间的直接联系 | NA | 研究肝纤维化的机制及潜在的治疗靶点 | 肝细胞、肝星状细胞及P2Y14受体 | NA | 肝病 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 多个小鼠模型及人类样本 |
| 914 | 2024-08-07 |
Development and Optimization of a Prognostic Model Associated with Stemness Genes in Hepatocellular Carcinoma
2022, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2022/9168441
PMID:36246969
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研究论文 | 本研究旨在开发一种基于干细胞相关基因的预测模型，用于评估肝细胞癌（HCC）患者的预后，以优化治疗方案 | 本研究通过单细胞测序数据筛选与干细胞相关的差异表达基因，并利用LASSO回归分析构建了一个包含18个干细胞相关基因的预测模型，该模型能有效预测HCC患者的总体生存率 | NA | 开发和优化与干细胞基因相关的肝细胞癌预后模型 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后评估 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用了TCGA和GSE14520两个队列的数据 |
| 915 | 2024-08-07 |
Multi-context genetic modeling of transcriptional regulation resolves novel disease loci
2022-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33212-0
PMID:36171194
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CONTENT的新方法，该方法利用多上下文表达研究中的个体内部相关性，通过跨上下文的错误发现校正提高功率，并生成上下文特定和上下文共享的表达成分。 | CONTENT方法通过利用跨上下文的相关结构，提高了遗传预测基因的数量，并在转录组关联研究中增加了位点-表型关联的发现数量。 | NA | 提高转录组关联研究（TWAS）的解释和发现与复杂性状相关基因的能力。 | 多组织和单细胞RNA-seq数据集。 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多组织和单细胞数据集，具体样本数量未详细说明。 |
| 916 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomic reconstruction of the mouse olfactory glomerular map suggests principles of odor processing
2022-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01030-8
PMID:35314823
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术，生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的地图 | 本研究首次生成了小鼠嗅球中大多数glomeruli位置的详细地图，并提出了可能的组织原则，有助于大脑进行气味解码 | 研究仅限于小鼠嗅球中的glomeruli位置，未涉及其他物种或更广泛的嗅觉系统功能 | 探究小鼠嗅球中glomeruli位置与气味辨别之间的关系 | 小鼠嗅球中的glomeruli位置及其在气味处理中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 917 | 2024-08-07 |
Cell type-specific inference of differential expression in spatial transcriptomics
2022-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01575-3
PMID:36050488
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为C-SIDE的统计方法，用于在空间转录组学中识别细胞类型特异性的差异表达基因 | C-SIDE方法考虑了其他细胞类型的定位，并能应用于多种情境，如病理、解剖区域、细胞间相互作用和细胞微环境 | NA | 开发一种新的统计方法，用于在空间转录组学中准确识别细胞类型特异性的差异表达基因 | 空间转录组学中的差异表达基因 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 使用了Slide-seq、MERFISH和Visium数据集进行模拟和验证实验 |
| 918 | 2024-08-07 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-Sep, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
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研究论文 | 介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在处理大量细胞和突变数据时，运行时间呈线性增长，且在模拟和真实肿瘤测序数据中显示出比现有方法更快的速度和相当的或更好的准确性 | NA | 开发一种快速且准确的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的肿瘤内异质性 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | 计算方法 | 基因型矩阵 | NA |
| 919 | 2024-08-07 |
Graphing cell relations in spatial transcriptomics
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00269-2
PMID:38177581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 920 | 2024-08-07 |
Cell clustering for spatial transcriptomics data with graph neural networks
2022-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00266-5
PMID:38177586
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积网络的无监督细胞聚类方法，用于空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型发现 | 利用空间转录组学和图神经网络，有效整合了基因表达信息和空间信息，提高了细胞聚类和细胞亚型发现的准确性 | NA | 改进基于空间转录组数据的细胞聚类和细胞亚型发现 | 空间转录组数据中的细胞聚类和细胞亚型 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图卷积网络 | 空间转录组数据 | 五个体外和体内的空间数据集 |