单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-07 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨了CD161表达及其调控在HPV16相关肿瘤中对效应CD4+ T细胞的影响，发现CD4+CD161+效应记忆T细胞与改善生存率相关。 | 首次揭示了CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的作用及其调控机制，并发现CD161与SOX4共同参与TCR信号的放大。 | 研究主要集中在HPV16+的OPSCC患者，可能需要进一步研究以验证在其他类型癌症中的普遍性。 | 研究CD161表达在HPV16相关肿瘤中对CD4+ T细胞的影响及其临床意义。 | HPV16+的OPSCC患者中的CD4+CD161+ T细胞。 | 免疫学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括治疗性疫苗接种患者和肿瘤浸润淋巴细胞的样本 |
| 882 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.005
PMID:35158099
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析，揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 | 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观，并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 | NA | 旨在通过单细胞分析，定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化，以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 | 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 883 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境，揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用，扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 884 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查，揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的独特发育状态 | 发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体（ELP）状态主导，并具有混合髓系-淋巴系特征 | 研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断，但未详细说明其他潜在限制 | 探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态 | KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 885 | 2024-08-07 |
Notch-dependent cooperativity between myeloid lineages promotes Langerhans cell histiocytosis pathology
2022-12-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add3330
PMID:36525505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和蛋白质分析技术，探讨了朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）的病理机制，揭示了LCH细胞的异质性及其与正常单核吞噬细胞的区别 | 发现了LCH的两个主要谱系，即DC2和DC3/单核细胞样表型，并验证了它们在多个病理组织位点的存在；揭示了Notch依赖的DC2和DC3/单核细胞谱系之间的协同作用 | 未详细说明Notch依赖的协同作用的具体机制 | 探讨LCH的病理机制及其细胞来源 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）及其细胞谱系 | NA | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序，蛋白质分析，高含量成像 | NA | RNA-seq数据，蛋白质数据 | 多个病理组织位点的样本 |
| 886 | 2024-08-07 |
Mapping single-cell transcriptomes in the intra-tumoral and associated territories of kidney cancer
2022-12-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.001
PMID:36423636
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研究论文 | 研究通过分析超过270,000个单细胞转录组和100个微切割的全外显子，探索肾癌肿瘤内部及周围区域的细胞相互作用和微环境特征 | 首次通过单细胞RNA测序数据进行从头突变调用，推断基质细胞的克隆性并追踪髓系细胞的发育 | NA | 理解肿瘤行为与癌细胞及其多细胞相互作用的关系 | 肾癌患者的肿瘤核心、肿瘤-正常组织界面、周围正常组织及外周血的组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 270,000个单细胞转录组和100个微切割的全外显子，来自12名患者 |
| 887 | 2024-08-07 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序和RT-qPCR分析，发现体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）中piRNA途径因子未完全表达，且未检测到piRNAs。 | 首次揭示了体外分化的mPGCLCs中piRNA途径因子表达的缺失，以及piRNAs的检测缺失。 | 研究仅限于第6天的mPGCLCs，未涉及更晚期的细胞状态。 | 探讨体外分化的mPGCLCs中piRNA途径的表达情况。 | 小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）及其piRNA途径。 | NA | NA | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，小RNA测序 | NA | RNA | 多个第6天的mPGCLC细胞系 |
| 888 | 2024-08-07 |
Targeting cancer glycosylation repolarizes tumor-associated macrophages allowing effective immune checkpoint blockade
2022-11-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj1270
PMID:36322632
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研究论文 | 本文研究了肿瘤糖基化对肿瘤相关巨噬细胞的影响，并探讨了通过靶向去除Siglec配体来增强免疫检查点阻断疗法的效果。 | 首次展示了肿瘤唾液酸化与特定免疫状态和生存率降低的相关性，并证明了使用抗体-唾液酸酶偶联物靶向去除肿瘤微环境中的Siglec配体可以增强抗肿瘤免疫并阻止肿瘤进展。 | NA | 探讨肿瘤糖基化对肿瘤相关巨噬细胞的影响，并寻找增强免疫检查点阻断疗法效果的新方法。 | 肿瘤糖基化、肿瘤相关巨噬细胞、免疫检查点阻断疗法。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠模型 |
| 889 | 2024-08-07 |
Anti-CTLA-4 antibodies drive myeloid activation and reprogram the tumor microenvironment through FcγR engagement and type I interferon signaling
2022-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00447-1
PMID:36302895
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CTLA-4抗体通过FcγR结合和I型干扰素信号传导重编程肿瘤微环境的影响 | 发现FcγR结合和I型干扰素信号传导在抗CTLA-4治疗中的重要作用，支持开发具有这些特性的优化免疫治疗剂 | NA | 探讨抗CTLA-4抗体的作用机制及其对肿瘤微环境的影响 | 抗CTLA-4抗体、FcγR结合、I型干扰素信号传导、肿瘤微环境 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 890 | 2024-08-07 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
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research paper | 本文研究了Xenopus tropicalis附肢再生过程中的代谢重编程，特别是戊糖磷酸途径（PPP）的作用。 | 首次详细描述了再生组织中葡萄糖流向PPP的增加，以及PPP在促进细胞增殖和再生中的关键作用。 | NA | 探究再生过程中支持快速生长的代谢途径。 | Xenopus tropicalis的附肢再生过程。 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 代谢物、RNA | NA |
| 891 | 2024-08-07 |
Biological Misinterpretation of Transcriptional Signatures in Tumor Samples Can Unknowingly Undermine Mechanistic Understanding and Faithful Alignment with Preclinical Data
2022-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1102
PMID:35792866
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤样本中转录组特征的生物学误解可能无意中削弱对疾病机制的理解，并影响与临床前数据的准确对应 | 开发了ConfoundR资源，允许用户测试基因/特征在多种癌症数据集中受基质影响的程度 | 研究主要集中在结直肠癌，可能需要进一步研究其他癌症类型 | 评估广泛使用的基因表达特征（GES）在肿瘤组织中受基质成分影响的程度 | 结直肠癌样本及其基因表达特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 激光捕获显微切割、流式细胞术、单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多区域活检临床样本 |
| 892 | 2024-08-07 |
'Youthful' phenotype of c-Kit+ cardiac fibroblasts
2022-Jul-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04449-1
PMID:35841449
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研究论文 | 本文研究了c-Kit阳性心脏成纤维细胞的'年轻'表型，探讨了c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其与DDR2标记的关系。 | 首次评估了c-Kit在DDR2阳性心脏成纤维细胞中的生物学特性，并揭示了其与'年轻'细胞表型的关联。 | NA | 探讨c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其对心肌生物学、病理损伤反应和生理衰老的影响。 | c-Kit阳性心脏成纤维细胞及其与DDR2标记的关系。 | NA | NA | 流式细胞术、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及约8%的总心脏间质细胞 |
| 893 | 2024-08-07 |
Processing single-cell RNA-seq datasets using SingCellaR
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101266
PMID:35391938
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研究论文 | 本文提供了一个全面的分析协议，使用SingCellaR工具在R语言环境中处理多个单细胞RNA测序数据集 | 介绍了使用SingCellaR工具进行单细胞转录组分析的新方法 | NA | 开发和验证一个用于处理和分析单细胞RNA测序数据集的计算平台 | 人类造血干细胞和祖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集 |
| 894 | 2024-08-07 |
In vivo labeling reveals continuous trafficking of TCF-1+ T cells between tumor and lymphoid tissue
2022-06-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210749
PMID:35472220
|
研究论文 | 本文通过光转换技术研究肿瘤免疫细胞的动态迁移，揭示了TCF-1+ T细胞在肿瘤和淋巴组织之间的持续循环 | 首次使用光转换技术结合单细胞转录组学和流式细胞术，揭示了CD8 T细胞在肿瘤内的快速耗竭过程及其在肿瘤和淋巴组织间的动态循环 | NA | 提高免疫检查点疗法的疗效，深入理解免疫细胞在肿瘤中的招募和维持机制 | TCF-1+ T细胞在肿瘤和淋巴组织间的迁移及其动态变化 | 免疫学 | NA | 光转换技术，单细胞转录组学，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 895 | 2024-08-07 |
Hyperpolarised 13C-MRI identifies the emergence of a glycolytic cell population within intermediate-risk human prostate cancer
2022-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28069-2
PMID:35075123
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研究论文 | 本文利用超极化13C磁共振成像（HP C-MRI）技术，通过检测前列腺癌中[1-C]乳酸的产生，区分临床显著性前列腺癌与惰性病变 | 本文首次通过HP C-MRI技术，结合免疫组化和空间转录组学，揭示了前列腺癌中上皮细胞和基质细胞的代谢差异 | NA | 区分临床显著性前列腺癌与惰性病变 | 低/中度风险人群中的前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 超极化磁共振成像（HP C-MRI） | NA | 图像 | 独立TCGA队列中的肿瘤样本 |
| 896 | 2024-08-07 |
Age-Dependent Changes in the Plasma and Brain Pharmacokinetics of Amyloid-β Peptides and Insulin
2022, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-215128
PMID:34924382
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研究论文 | 研究年龄对小鼠血浆和脑中Aβ肽和胰岛素药代动力学的影响 | 首次探讨了年龄对Aβ同工型和胰岛素在血浆药代动力学和脑内流入的差异性影响，以及这种影响如何潜在增加阿尔茨海默病风险 | NA | 识别年龄相关的小鼠血浆分布和血脑屏障（BBB）中Aβ肽和胰岛素的转运变化 | 野生型（WT）和阿尔茨海默病转基因（APP/PS1）小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 不同年龄的野生型（WT）和APP/PS1转基因小鼠 |
| 897 | 2024-08-07 |
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167754
PMID:35868363
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研究论文 | 本文探讨了通过整合多种不同方法来识别生物学上重要的标记基因 | 本文提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术，以更稳健地识别标记细胞的基因 | 目前尚未有单一的最佳方法出现，且验证这些分析结果的成本较高 | 利用单细胞RNA测序更好地理解生物学特性 | 识别可靠标记不同细胞类型的基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 898 | 2024-08-07 |
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015724
PMID:35862735
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研究论文 | 本文通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重建和单细胞RNA测序等方法，研究了成年小鼠骨髓中的红细胞岛（EBI）成分细胞，发现EBI中的CD11b+细胞是与骨髓EBI巨噬细胞特异性相关的嗜中性粒细胞前体，表明红细胞（髓细胞）岛是终末粒细胞生成和红细胞生成的场所。 | 首次揭示了红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的双重作用，并展示了巨噬细胞在优化红细胞或嗜中性粒细胞生产中的适应性。 | NA | 研究红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的作用及其在不同生理病理状态下的调节机制。 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞及其在粒细胞生成和红细胞生成中的作用。 | NA | NA | 多光谱成像流式细胞术、体外岛重建、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞 |
| 899 | 2024-08-07 |
Don't you forget about me(gakaryocytes)
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009302
PMID:34582554
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综述 | 本文综述了巨核细胞（MKs）在骨髓中的复杂分化过程及其在血小板生成和骨髓稳态中的多重功能 | 文章提出了巨核细胞不仅作为血小板前体，还可能通过细胞膜出芽和在远端器官如肺或肝脏中产生血小板，并参与骨髓稳态的维持 | NA | 探讨巨核细胞在体外和体内形成血小板前体的机制，并批判性地讨论巨核细胞作为免疫调节细胞的假设 | 巨核细胞及其在血小板生成和骨髓稳态中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自成人和胎儿骨髓及肺的巨核细胞 |
| 900 | 2024-08-07 |
The Peripheral Immune Landscape in a Patient with Myocarditis after the Administration of BNT162b2 mRNA Vaccine
2022-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0031
PMID:35904026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析，首次描述了接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 首次使用单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析来描述接种BNT162b2 mRNA疫苗后心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 研究样本仅为单一患者，可能影响结果的普遍性 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后心肌炎的发病机制 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者 |