单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-07 |
4D imaging analysis of the aging mouse neural stem cell niche reveals a dramatic loss of progenitor cell dynamism regulated by the RHO-ROCK pathway
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.007
PMID:35030320
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research paper | 研究通过4D成像分析老龄小鼠神经干细胞微环境，揭示了由RHO-ROCK通路调控的前体细胞动态活性的显著丧失 | 首次使用活体时间流逝成像结合计算机图像分析，探讨了年轻和老龄小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为，并发现RHO-ROCK信号通路在调控这些细胞运动和相互作用中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为及其与年龄相关的变化 | 神经干细胞（NSCs）和过渡放大前体（TAP）细胞的动态行为 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 图像 | 年轻和老龄的转基因小鼠V-SVZ全装片 |
| 882 | 2024-08-07 |
CellMeSH: probabilistic cell-type identification using indexed literature
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab834
PMID:34893819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMeSH的新自动化方法，用于基于先前文献识别细胞类型 | CellMeSH结合了基因-细胞类型关联数据库与概率方法进行数据库查询，相比手动构建的数据库更全面且易于更新 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化单细胞RNA测序实验中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 概率方法 | 文本 | 多个小鼠和人类数据集 |
| 883 | 2024-08-07 |
Coding and long non-coding gene expression changes in the CNS traumatic injuries
2022-Feb-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04092-2
PMID:35129669
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤（TBI）和脊髓损伤（SCI）中编码和长非编码基因表达变化的研究进展 | 强调了长非编码RNA（lncRNAs）在CNS损伤中的重要作用及其作为诊断、治疗和预后潜在靶点的可能性 | NA | 探讨TBI和SCI中基因表达变化及其分子机制 | 创伤性脑损伤和脊髓损伤中的基因表达变化 | NA | 神经系统损伤 | RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 884 | 2024-08-07 |
Temporal analyses of postnatal liver development and maturation by single-cell transcriptomics
2022-02-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.01.004
PMID:35134346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了小鼠出生后1、3、7、21和56天的肝脏发育和成熟过程 | 首次揭示了发育中肝脏内肝细胞的高度异质性以及从中心到门静脉肝细胞的代谢功能分区的逐步构建过程 | NA | 深入理解肝脏在出生后的发育和成熟过程 | 小鼠出生后不同时间点的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 52,834个单细胞 |
| 885 | 2024-08-07 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和单细胞蛋白质组学结合机制研究，评估了严重COVID-19中病理性T细胞功能及其诱导信号 | 发现了在严重COVID-19中高度激活的CD16 T细胞，其具有增强的细胞毒性功能，并通过免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性脱颗粒和细胞毒性作用，这在其他疾病中未见 | NA | 研究严重COVID-19中T细胞是否参与疾病病理过程 | 严重COVID-19患者的T细胞功能及诱导信号 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞数据 | COVID-19患者的CD16 T细胞 |
| 886 | 2024-08-07 |
Biologic correlates of beneficial convalescent plasma therapy in a COVID-19 patient reveal disease resolution mechanisms
2022-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.02.03.22269612
PMID:35132422
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研究论文 | 本研究报告了一例由于恢复期血浆输注导致严重COVID-19完全缓解的病例，并通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了与疾病从严重到无病状态过渡相关的关键生物学过程。 | 本研究首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了恢复期血浆治疗COVID-19患者后，疾病缓解的生物学机制。 | 本研究仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性，需要更多病例验证研究结果。 | 探究恢复期血浆治疗COVID-19的生物学机制及其在疾病缓解中的作用。 | 严重COVID-19患者及其恢复期血浆治疗后的生物学变化。 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 单一病例 |
| 887 | 2024-08-07 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
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研究论文 | 本文通过多模态高维度策略分析了口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境（TIME），揭示了与长期生存相关的免疫微聚集物的形成机制。 | 首次揭示了肿瘤特异性T细胞通过产生趋化因子支持免疫微聚集物的形成，从而形成正反馈循环，维持DC-T细胞微聚集物的形成。 | NA | 研究肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境与长期生存之间的关系。 | 口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中的肿瘤特异性T细胞及其免疫微环境。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | NanoString、Hyperion成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 组织样本 | 包括免疫响应阳性（IR+）和免疫响应阴性（IR-）的口腔鳞状细胞癌组织样本 |
| 888 | 2024-08-07 |
Enhancing CDK4/6 inhibitor therapy for medulloblastoma using nanoparticle delivery and scRNA-seq-guided combination with sapanisertib
2022-Jan-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5838
PMID:35080986
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研究论文 | 研究通过纳米颗粒递送和单细胞RNA测序指导的组合疗法，增强CDK4/6抑制剂对髓母细胞瘤的治疗效果 | 使用纳米颗粒封装减少药物毒性，改善中枢神经系统药代动力学，并通过单细胞RNA测序分析识别新的联合治疗策略 | 尽管延长了生存期，但复发问题仍未完全解决 | 探索提高CDK4/6抑制剂治疗髓母细胞瘤效果的新方法 | 髓母细胞瘤及其治疗 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用基因工程小鼠模型进行实验 |
| 889 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics defines keratinocyte differentiation in avian scutate scales
2022-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04082-1
PMID:34997067
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，探讨了鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 首次通过单细胞转录组学技术揭示了鸟类鳞状鳞片中两种不同类型的分化角质形成细胞，并发现了与人类皮肤相似的角质形成细胞分化基因 | NA | 研究鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 鸟类鳞状鳞片中的角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | mRNA | 来自1日龄小鸡腿部的皮肤细胞 |
| 890 | 2024-08-07 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文描述了使用10x Genomics平台同时分析人造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组和细胞表面蛋白表达的工作流程 | 结合传统的单细胞转录组分析和使用寡核苷酸偶联抗体的细胞表面蛋白表达同时分析，增加了免疫表型分析到mRNA数据中 | NA | 详细表征单细胞异质性，并有助于识别用于前瞻性分离转录定义的新细胞亚群的标记 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据和蛋白表达数据 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 |
| 891 | 2024-08-07 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨了CD161表达及其调控在HPV16相关肿瘤中对效应CD4+ T细胞的影响，发现CD4+CD161+效应记忆T细胞与改善生存率相关。 | 首次揭示了CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的作用及其调控机制，并发现CD161与SOX4共同参与TCR信号的放大。 | 研究主要集中在HPV16+的OPSCC患者，可能需要进一步研究以验证在其他类型癌症中的普遍性。 | 研究CD161表达在HPV16相关肿瘤中对CD4+ T细胞的影响及其临床意义。 | HPV16+的OPSCC患者中的CD4+CD161+ T细胞。 | 免疫学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括治疗性疫苗接种患者和肿瘤浸润淋巴细胞的样本 |
| 892 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.005
PMID:35158099
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析，揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 | 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观，并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 | NA | 旨在通过单细胞分析，定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化，以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 | 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 893 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境，揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用，扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 894 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查，揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的独特发育状态 | 发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体（ELP）状态主导，并具有混合髓系-淋巴系特征 | 研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断，但未详细说明其他潜在限制 | 探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态 | KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 895 | 2024-08-07 |
Notch-dependent cooperativity between myeloid lineages promotes Langerhans cell histiocytosis pathology
2022-12-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add3330
PMID:36525505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和蛋白质分析技术，探讨了朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）的病理机制，揭示了LCH细胞的异质性及其与正常单核吞噬细胞的区别 | 发现了LCH的两个主要谱系，即DC2和DC3/单核细胞样表型，并验证了它们在多个病理组织位点的存在；揭示了Notch依赖的DC2和DC3/单核细胞谱系之间的协同作用 | 未详细说明Notch依赖的协同作用的具体机制 | 探讨LCH的病理机制及其细胞来源 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）及其细胞谱系 | NA | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序，蛋白质分析，高含量成像 | NA | RNA-seq数据，蛋白质数据 | 多个病理组织位点的样本 |
| 896 | 2024-08-07 |
Mapping single-cell transcriptomes in the intra-tumoral and associated territories of kidney cancer
2022-12-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.001
PMID:36423636
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研究论文 | 研究通过分析超过270,000个单细胞转录组和100个微切割的全外显子，探索肾癌肿瘤内部及周围区域的细胞相互作用和微环境特征 | 首次通过单细胞RNA测序数据进行从头突变调用，推断基质细胞的克隆性并追踪髓系细胞的发育 | NA | 理解肿瘤行为与癌细胞及其多细胞相互作用的关系 | 肾癌患者的肿瘤核心、肿瘤-正常组织界面、周围正常组织及外周血的组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 270,000个单细胞转录组和100个微切割的全外显子，来自12名患者 |
| 897 | 2024-08-07 |
Targeting cancer glycosylation repolarizes tumor-associated macrophages allowing effective immune checkpoint blockade
2022-11-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj1270
PMID:36322632
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研究论文 | 本文研究了肿瘤糖基化对肿瘤相关巨噬细胞的影响，并探讨了通过靶向去除Siglec配体来增强免疫检查点阻断疗法的效果。 | 首次展示了肿瘤唾液酸化与特定免疫状态和生存率降低的相关性，并证明了使用抗体-唾液酸酶偶联物靶向去除肿瘤微环境中的Siglec配体可以增强抗肿瘤免疫并阻止肿瘤进展。 | NA | 探讨肿瘤糖基化对肿瘤相关巨噬细胞的影响，并寻找增强免疫检查点阻断疗法效果的新方法。 | 肿瘤糖基化、肿瘤相关巨噬细胞、免疫检查点阻断疗法。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠模型 |
| 898 | 2024-08-07 |
Anti-CTLA-4 antibodies drive myeloid activation and reprogram the tumor microenvironment through FcγR engagement and type I interferon signaling
2022-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00447-1
PMID:36302895
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CTLA-4抗体通过FcγR结合和I型干扰素信号传导重编程肿瘤微环境的影响 | 发现FcγR结合和I型干扰素信号传导在抗CTLA-4治疗中的重要作用，支持开发具有这些特性的优化免疫治疗剂 | NA | 探讨抗CTLA-4抗体的作用机制及其对肿瘤微环境的影响 | 抗CTLA-4抗体、FcγR结合、I型干扰素信号传导、肿瘤微环境 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 899 | 2024-08-07 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
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research paper | 本文研究了Xenopus tropicalis附肢再生过程中的代谢重编程，特别是戊糖磷酸途径（PPP）的作用。 | 首次详细描述了再生组织中葡萄糖流向PPP的增加，以及PPP在促进细胞增殖和再生中的关键作用。 | NA | 探究再生过程中支持快速生长的代谢途径。 | Xenopus tropicalis的附肢再生过程。 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 代谢物、RNA | NA |
| 900 | 2024-08-07 |
Biological Misinterpretation of Transcriptional Signatures in Tumor Samples Can Unknowingly Undermine Mechanistic Understanding and Faithful Alignment with Preclinical Data
2022-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1102
PMID:35792866
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤样本中转录组特征的生物学误解可能无意中削弱对疾病机制的理解，并影响与临床前数据的准确对应 | 开发了ConfoundR资源，允许用户测试基因/特征在多种癌症数据集中受基质影响的程度 | 研究主要集中在结直肠癌，可能需要进一步研究其他癌症类型 | 评估广泛使用的基因表达特征（GES）在肿瘤组织中受基质成分影响的程度 | 结直肠癌样本及其基因表达特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 激光捕获显微切割、流式细胞术、单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多区域活检临床样本 |