单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2024-08-07 |
Archetype tasks link intratumoral heterogeneity to plasticity and cancer hallmarks in small cell lung cancer
2022-09-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2022.07.006
PMID:35981544
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研究论文 | 本文通过原型分析模型，利用多任务进化理论重新构建小细胞肺癌（SCLC）表型异质性，探讨肿瘤内异质性与可塑性和癌症特征之间的关系 | 应用原型分析模型和多任务进化理论来理解SCLC的表型异质性和可塑性 | NA | 探讨小细胞肺癌肿瘤内异质性与可塑性和癌症特征之间的关系 | 小细胞肺癌（SCLC）的肿瘤内异质性和细胞状态 | 数字病理学 | 肺癌 | 原型分析 | NA | 转录组数据 | 细胞系和肿瘤样本 |
| 822 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境，揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用，扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 823 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查，揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的独特发育状态 | 发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体（ELP）状态主导，并具有混合髓系-淋巴系特征 | 研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断，但未详细说明其他潜在限制 | 探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态 | KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 824 | 2024-08-07 |
Notch-dependent cooperativity between myeloid lineages promotes Langerhans cell histiocytosis pathology
2022-12-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add3330
PMID:36525505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和蛋白质分析技术，探讨了朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）的病理机制，揭示了LCH细胞的异质性及其与正常单核吞噬细胞的区别 | 发现了LCH的两个主要谱系，即DC2和DC3/单核细胞样表型，并验证了它们在多个病理组织位点的存在；揭示了Notch依赖的DC2和DC3/单核细胞谱系之间的协同作用 | 未详细说明Notch依赖的协同作用的具体机制 | 探讨LCH的病理机制及其细胞来源 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）及其细胞谱系 | NA | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序，蛋白质分析，高含量成像 | NA | RNA-seq数据，蛋白质数据 | 多个病理组织位点的样本 |
| 825 | 2024-08-07 |
Delivery of costimulatory blockade to lymph nodes promotes transplant acceptance in mice
2022-12-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159672
PMID:36519543
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研究论文 | 研究纤维网状细胞（FRCs）在心脏移植小鼠模型中如何促进抗CD40L诱导的耐受性，并探讨淋巴结（LN）靶向纳米递送抗CD40L的效果。 | 首次证明FRCs在促进共刺激阻断中的关键作用，并展示了淋巴结靶向纳米递送抗CD40L的有效性。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证。 | 探讨FRCs在心脏移植中的作用及淋巴结靶向纳米递送抗CD40L的效果。 | 纤维网状细胞（FRCs）、淋巴结（LN）、心脏移植小鼠模型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序、纳米颗粒（NPs）递送技术。 | NA | RNA测序数据 | 小鼠心脏移植模型 |
| 826 | 2024-08-07 |
Mapping single-cell transcriptomes in the intra-tumoral and associated territories of kidney cancer
2022-12-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2022.11.001
PMID:36423636
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研究论文 | 研究通过分析超过270,000个单细胞转录组和100个微切割的全外显子，探索肾癌肿瘤内部及周围区域的细胞相互作用和微环境特征 | 首次通过单细胞RNA测序数据进行从头突变调用，推断基质细胞的克隆性并追踪髓系细胞的发育 | NA | 理解肿瘤行为与癌细胞及其多细胞相互作用的关系 | 肾癌患者的肿瘤核心、肿瘤-正常组织界面、周围正常组织及外周血的组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 270,000个单细胞转录组和100个微切割的全外显子，来自12名患者 |
| 827 | 2024-08-07 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序和RT-qPCR分析，发现体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）中piRNA途径因子未完全表达，且未检测到piRNAs。 | 首次揭示了体外分化的mPGCLCs中piRNA途径因子表达的缺失，以及piRNAs的检测缺失。 | 研究仅限于第6天的mPGCLCs，未涉及更晚期的细胞状态。 | 探讨体外分化的mPGCLCs中piRNA途径的表达情况。 | 小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）及其piRNA途径。 | NA | NA | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，小RNA测序 | NA | RNA | 多个第6天的mPGCLC细胞系 |
| 828 | 2024-08-07 |
Targeting cancer glycosylation repolarizes tumor-associated macrophages allowing effective immune checkpoint blockade
2022-11-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj1270
PMID:36322632
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研究论文 | 本文研究了肿瘤糖基化对肿瘤相关巨噬细胞的影响，并探讨了通过靶向去除Siglec配体来增强免疫检查点阻断疗法的效果。 | 首次展示了肿瘤唾液酸化与特定免疫状态和生存率降低的相关性，并证明了使用抗体-唾液酸酶偶联物靶向去除肿瘤微环境中的Siglec配体可以增强抗肿瘤免疫并阻止肿瘤进展。 | NA | 探讨肿瘤糖基化对肿瘤相关巨噬细胞的影响，并寻找增强免疫检查点阻断疗法效果的新方法。 | 肿瘤糖基化、肿瘤相关巨噬细胞、免疫检查点阻断疗法。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠模型 |
| 829 | 2024-08-07 |
Anti-CTLA-4 antibodies drive myeloid activation and reprogram the tumor microenvironment through FcγR engagement and type I interferon signaling
2022-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00447-1
PMID:36302895
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CTLA-4抗体通过FcγR结合和I型干扰素信号传导重编程肿瘤微环境的影响 | 发现FcγR结合和I型干扰素信号传导在抗CTLA-4治疗中的重要作用，支持开发具有这些特性的优化免疫治疗剂 | NA | 探讨抗CTLA-4抗体的作用机制及其对肿瘤微环境的影响 | 抗CTLA-4抗体、FcγR结合、I型干扰素信号传导、肿瘤微环境 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 830 | 2024-08-07 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
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research paper | 本文研究了Xenopus tropicalis附肢再生过程中的代谢重编程，特别是戊糖磷酸途径（PPP）的作用。 | 首次详细描述了再生组织中葡萄糖流向PPP的增加，以及PPP在促进细胞增殖和再生中的关键作用。 | NA | 探究再生过程中支持快速生长的代谢途径。 | Xenopus tropicalis的附肢再生过程。 | NA | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 代谢物、RNA | NA |
| 831 | 2024-08-07 |
Biological Misinterpretation of Transcriptional Signatures in Tumor Samples Can Unknowingly Undermine Mechanistic Understanding and Faithful Alignment with Preclinical Data
2022-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1102
PMID:35792866
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤样本中转录组特征的生物学误解可能无意中削弱对疾病机制的理解，并影响与临床前数据的准确对应 | 开发了ConfoundR资源，允许用户测试基因/特征在多种癌症数据集中受基质影响的程度 | 研究主要集中在结直肠癌，可能需要进一步研究其他癌症类型 | 评估广泛使用的基因表达特征（GES）在肿瘤组织中受基质成分影响的程度 | 结直肠癌样本及其基因表达特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 激光捕获显微切割、流式细胞术、单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多区域活检临床样本 |
| 832 | 2024-08-07 |
'Youthful' phenotype of c-Kit+ cardiac fibroblasts
2022-Jul-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04449-1
PMID:35841449
|
研究论文 | 本文研究了c-Kit阳性心脏成纤维细胞的'年轻'表型，探讨了c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其与DDR2标记的关系。 | 首次评估了c-Kit在DDR2阳性心脏成纤维细胞中的生物学特性，并揭示了其与'年轻'细胞表型的关联。 | NA | 探讨c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学意义及其对心肌生物学、病理损伤反应和生理衰老的影响。 | c-Kit阳性心脏成纤维细胞及其与DDR2标记的关系。 | NA | NA | 流式细胞术、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及约8%的总心脏间质细胞 |
| 833 | 2024-08-07 |
Processing single-cell RNA-seq datasets using SingCellaR
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101266
PMID:35391938
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研究论文 | 本文提供了一个全面的分析协议，使用SingCellaR工具在R语言环境中处理多个单细胞RNA测序数据集 | 介绍了使用SingCellaR工具进行单细胞转录组分析的新方法 | NA | 开发和验证一个用于处理和分析单细胞RNA测序数据集的计算平台 | 人类造血干细胞和祖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个数据集 |
| 834 | 2024-08-07 |
In vivo labeling reveals continuous trafficking of TCF-1+ T cells between tumor and lymphoid tissue
2022-06-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210749
PMID:35472220
|
研究论文 | 本文通过光转换技术研究肿瘤免疫细胞的动态迁移，揭示了TCF-1+ T细胞在肿瘤和淋巴组织之间的持续循环 | 首次使用光转换技术结合单细胞转录组学和流式细胞术，揭示了CD8 T细胞在肿瘤内的快速耗竭过程及其在肿瘤和淋巴组织间的动态循环 | NA | 提高免疫检查点疗法的疗效，深入理解免疫细胞在肿瘤中的招募和维持机制 | TCF-1+ T细胞在肿瘤和淋巴组织间的迁移及其动态变化 | 免疫学 | NA | 光转换技术，单细胞转录组学，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 835 | 2024-08-07 |
Locus-specific expression of transposable elements in single cells with CELLO-seq
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01093-1
PMID:34782740
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研究论文 | 研究使用CELLO-seq技术在单细胞水平上测量转座元件在特定位点的表达 | CELLO-seq技术结合长读长单细胞RNA测序和计算分析，能够测量转座元件在特定位点的表达 | 研究指出只有少数非常年轻的元素在老鼠中无法高置信度地映射回参考序列 | 探索转座元件在单细胞中的位点特异性表达及其与潜在调控因子的关系 | 转座元件在两细胞期小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞中的表达 | 基因组学 | NA | CELLO-seq | NA | RNA序列 | 两细胞期小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞 |
| 836 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Conserved Metaplasia Program in Pancreatic Injury
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.027
PMID:34695382
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了胰腺损伤后腺泡向导管化生（ADM）的保守程序 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺损伤后ADM的转录变化，并发现了与疾病进展相关的标记物 | 研究主要集中在小鼠模型和慢性胰腺炎患者的样本上，可能不完全代表所有胰腺疾病的情况 | 定义ADM产生的细胞群、相关的转录变化以及疾病进展的标记物 | 胰腺损伤后的腺泡细胞及其化生过程 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 超过13,000个EYFP+细胞，15例慢性胰腺炎患者的手术样本 |
| 837 | 2024-08-07 |
Hyperpolarised 13C-MRI identifies the emergence of a glycolytic cell population within intermediate-risk human prostate cancer
2022-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28069-2
PMID:35075123
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研究论文 | 本文利用超极化13C磁共振成像（HP C-MRI）技术，通过检测前列腺癌中[1-C]乳酸的产生，区分临床显著性前列腺癌与惰性病变 | 本文首次通过HP C-MRI技术，结合免疫组化和空间转录组学，揭示了前列腺癌中上皮细胞和基质细胞的代谢差异 | NA | 区分临床显著性前列腺癌与惰性病变 | 低/中度风险人群中的前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 超极化磁共振成像（HP C-MRI） | NA | 图像 | 独立TCGA队列中的肿瘤样本 |
| 838 | 2024-08-07 |
Age-Dependent Changes in the Plasma and Brain Pharmacokinetics of Amyloid-β Peptides and Insulin
2022, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-215128
PMID:34924382
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研究论文 | 研究年龄对小鼠血浆和脑中Aβ肽和胰岛素药代动力学的影响 | 首次探讨了年龄对Aβ同工型和胰岛素在血浆药代动力学和脑内流入的差异性影响，以及这种影响如何潜在增加阿尔茨海默病风险 | NA | 识别年龄相关的小鼠血浆分布和血脑屏障（BBB）中Aβ肽和胰岛素的转运变化 | 野生型（WT）和阿尔茨海默病转基因（APP/PS1）小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 不同年龄的野生型（WT）和APP/PS1转基因小鼠 |
| 839 | 2024-08-07 |
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167754
PMID:35868363
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研究论文 | 本文探讨了通过整合多种不同方法来识别生物学上重要的标记基因 | 本文提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术，以更稳健地识别标记细胞的基因 | 目前尚未有单一的最佳方法出现，且验证这些分析结果的成本较高 | 利用单细胞RNA测序更好地理解生物学特性 | 识别可靠标记不同细胞类型的基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 840 | 2024-08-07 |
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015724
PMID:35862735
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研究论文 | 本文通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重建和单细胞RNA测序等方法，研究了成年小鼠骨髓中的红细胞岛（EBI）成分细胞，发现EBI中的CD11b+细胞是与骨髓EBI巨噬细胞特异性相关的嗜中性粒细胞前体，表明红细胞（髓细胞）岛是终末粒细胞生成和红细胞生成的场所。 | 首次揭示了红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的双重作用，并展示了巨噬细胞在优化红细胞或嗜中性粒细胞生产中的适应性。 | NA | 研究红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的作用及其在不同生理病理状态下的调节机制。 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞及其在粒细胞生成和红细胞生成中的作用。 | NA | NA | 多光谱成像流式细胞术、体外岛重建、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞 |