单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2024-08-07 |
Differential assembly diversifies GABAA receptor structures and signalling
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04517-3
PMID:35355020
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研究论文 | 本文使用低温电子显微镜研究了由α4、β3和δ亚基组装的外突触GABAA受体的结构，以及包含γ2亚基的对应物，发现两种具有不同化学计量和排列的受体亚型，这些亚型与先前观察到的突触α1-包含受体不同 | 本文首次提供了结构和功能证据，表明选定的GABAR排列可以作为同时响应GABA和组胺两种神经递质的巧合检测器 | NA | 探讨GABAA受体的组装原理及其对GABA能信号传导的影响 | GABAA受体的结构和功能 | 神经科学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 结构数据 | NA |
| 802 | 2024-08-07 |
Using topic modeling to detect cellular crosstalk in scRNA-seq
2022-04, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009975
PMID:35395014
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研究论文 | 本文介绍了一种基于隐狄利克雷分配（LDA）的新方法，用于检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用相关基因变化 | 该方法不依赖于现有的生物学知识数据库，而是通过分析物理相互作用的细胞数据来检测基因表达变化 | 文章未明确提及该方法的局限性 | 开发一种新的方法来检测scRNA-seq数据中的细胞间相互作用 | 研究细胞间相互作用对基因表达的影响 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | LDA | 基因表达数据 | 涉及两个物理相互作用细胞的数据集和一个标准液滴法生成的数据集 |
| 803 | 2024-08-07 |
NGF-p75 signaling coordinates skeletal cell migration during bone repair
2022-03-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5716
PMID:35302859
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研究论文 | 本文研究了神经生长因子（NGF）通过p75信号通路在颅骨损伤后调节骨再生中的作用 | 首次揭示了NGF通过p75信号通路在骨修复过程中协调骨骼细胞迁移的机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨骨损伤后神经信号与骨再生之间的关系 | 神经生长因子（NGF）及其p75受体在骨修复中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 804 | 2024-08-07 |
Clonal lineage tracing reveals shared origin of conventional and plasmacytoid dendritic cells
2022-03-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.01.016
PMID:35180378
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研究论文 | 本研究使用诱导性谱系追踪结合克隆DNA条形码和单细胞转录组及表型分析（CITE-seq），在未经处理的成年小鼠中研究树突状细胞（DCs）的发育过程 | 揭示了常规DCs（cDCs）和浆细胞样DCs（pDCs）的共同起源，并提出了DC发育的新模式 | NA | 阐明树突状细胞的发育起源 | 树突状细胞（包括常规DCs和浆细胞样DCs）的发育过程 | NA | NA | CITE-seq | NA | 单细胞转录组 | 成年小鼠 |
| 805 | 2024-08-07 |
Cell type-specific mechanism of Setd1a heterozygosity in schizophrenia pathogenesis
2022-03-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm1077
PMID:35245111
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研究论文 | 本研究通过生成Setd1a半合子不足的小鼠模型，探讨了这一与精神分裂症相关的表观遗传因子如何在高度相关的脑区影响基因表达 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Setd1a半合子不足在不同细胞类型中的高度可变的转录适应性，并发现这些变化与神经元形态发生和突触功能相关的基因失调有关 | NA | 理解Setd1a半合子不足在精神分裂症发病机制中的细胞特异性机制 | Setd1a半合子不足的小鼠模型及其在精神分裂症相关脑区的基因表达变化 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 806 | 2024-08-07 |
Widespread choroid plexus contamination in sampling and profiling of brain tissue
2022-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01416-3
PMID:34983929
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研究论文 | 本研究探讨了脑组织样本中脉络丛污染的问题，并提出了相应的解决方案 | 首次系统性地识别和分析了脑组织样本中的脉络丛污染，并提出了预防措施 | 无法完全确定某些差异表达的基因或蛋白质是否仅由脉络丛污染引起 | 揭示脑组织样本中脉络丛污染的问题及其对数据分析的影响 | 脑组织样本中的脉络丛污染 | 数字病理学 | NA | RNA测序, 基因表达谱分析, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 转录组数据 | 多个研究中的脑组织样本 |
| 807 | 2024-08-07 |
Systems-based approaches to study immunometabolism
2022-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-021-00783-9
PMID:35121805
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综述 | 本文综述了利用系统生物学方法研究免疫细胞代谢的现状和挑战 | 介绍了数学建模方法用于系统性分析免疫细胞代谢变化 | 讨论了代谢建模技术的应用和不足 | 定义免疫代谢的系统性质，总结细胞和系统层面的研究方法 | 免疫细胞的代谢 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学模型 | 细胞数据 | NA |
| 808 | 2024-08-07 |
Identification of kidney injury released circulating osteopontin as causal agent of respiratory failure
2022-02-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abm5900
PMID:35213222
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和配体-受体分析，识别了急性肾损伤（AKI）引起的急性肺损伤（ALI）中，肾脏释放的循环骨桥蛋白（OPN）作为关键介质的作用 | 首次揭示了肾脏释放的OPN在AKI-ALI中的因果作用，并证明了OPN抑制剂在预防AKI-ALI中的有效性 | 研究主要在动物模型中进行，需要在人类中进一步验证 | 识别并验证介导组织损伤间相互作用的分子 | 急性肾损伤和急性肺损伤 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型和人类患者样本 |
| 809 | 2024-08-07 |
4D imaging analysis of the aging mouse neural stem cell niche reveals a dramatic loss of progenitor cell dynamism regulated by the RHO-ROCK pathway
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.007
PMID:35030320
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research paper | 研究通过4D成像分析老龄小鼠神经干细胞微环境，揭示了由RHO-ROCK通路调控的前体细胞动态活性的显著丧失 | 首次使用活体时间流逝成像结合计算机图像分析，探讨了年轻和老龄小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为，并发现RHO-ROCK信号通路在调控这些细胞运动和相互作用中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠V-SVZ中神经干细胞及其前体细胞的动态行为及其与年龄相关的变化 | 神经干细胞（NSCs）和过渡放大前体（TAP）细胞的动态行为 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 图像 | 年轻和老龄的转基因小鼠V-SVZ全装片 |
| 810 | 2024-08-07 |
CellMeSH: probabilistic cell-type identification using indexed literature
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab834
PMID:34893819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMeSH的新自动化方法，用于基于先前文献识别细胞类型 | CellMeSH结合了基因-细胞类型关联数据库与概率方法进行数据库查询，相比手动构建的数据库更全面且易于更新 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化单细胞RNA测序实验中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 概率方法 | 文本 | 多个小鼠和人类数据集 |
| 811 | 2024-08-07 |
Coding and long non-coding gene expression changes in the CNS traumatic injuries
2022-Feb-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04092-2
PMID:35129669
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤（TBI）和脊髓损伤（SCI）中编码和长非编码基因表达变化的研究进展 | 强调了长非编码RNA（lncRNAs）在CNS损伤中的重要作用及其作为诊断、治疗和预后潜在靶点的可能性 | NA | 探讨TBI和SCI中基因表达变化及其分子机制 | 创伤性脑损伤和脊髓损伤中的基因表达变化 | NA | 神经系统损伤 | RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 812 | 2024-08-07 |
Temporal analyses of postnatal liver development and maturation by single-cell transcriptomics
2022-02-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.01.004
PMID:35134346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了小鼠出生后1、3、7、21和56天的肝脏发育和成熟过程 | 首次揭示了发育中肝脏内肝细胞的高度异质性以及从中心到门静脉肝细胞的代谢功能分区的逐步构建过程 | NA | 深入理解肝脏在出生后的发育和成熟过程 | 小鼠出生后不同时间点的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 52,834个单细胞 |
| 813 | 2024-08-07 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和单细胞蛋白质组学结合机制研究，评估了严重COVID-19中病理性T细胞功能及其诱导信号 | 发现了在严重COVID-19中高度激活的CD16 T细胞，其具有增强的细胞毒性功能，并通过免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性脱颗粒和细胞毒性作用，这在其他疾病中未见 | NA | 研究严重COVID-19中T细胞是否参与疾病病理过程 | 严重COVID-19患者的T细胞功能及诱导信号 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞数据 | COVID-19患者的CD16 T细胞 |
| 814 | 2024-08-07 |
Biologic correlates of beneficial convalescent plasma therapy in a COVID-19 patient reveal disease resolution mechanisms
2022-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.02.03.22269612
PMID:35132422
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研究论文 | 本研究报告了一例由于恢复期血浆输注导致严重COVID-19完全缓解的病例，并通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了与疾病从严重到无病状态过渡相关的关键生物学过程。 | 本研究首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了恢复期血浆治疗COVID-19患者后，疾病缓解的生物学机制。 | 本研究仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性，需要更多病例验证研究结果。 | 探究恢复期血浆治疗COVID-19的生物学机制及其在疾病缓解中的作用。 | 严重COVID-19患者及其恢复期血浆治疗后的生物学变化。 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 单一病例 |
| 815 | 2024-08-07 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
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研究论文 | 本文通过多模态高维度策略分析了口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境（TIME），揭示了与长期生存相关的免疫微聚集物的形成机制。 | 首次揭示了肿瘤特异性T细胞通过产生趋化因子支持免疫微聚集物的形成，从而形成正反馈循环，维持DC-T细胞微聚集物的形成。 | NA | 研究肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境与长期生存之间的关系。 | 口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中的肿瘤特异性T细胞及其免疫微环境。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | NanoString、Hyperion成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 组织样本 | 包括免疫响应阳性（IR+）和免疫响应阴性（IR-）的口腔鳞状细胞癌组织样本 |
| 816 | 2024-08-07 |
Enhancing CDK4/6 inhibitor therapy for medulloblastoma using nanoparticle delivery and scRNA-seq-guided combination with sapanisertib
2022-Jan-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5838
PMID:35080986
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研究论文 | 研究通过纳米颗粒递送和单细胞RNA测序指导的组合疗法，增强CDK4/6抑制剂对髓母细胞瘤的治疗效果 | 使用纳米颗粒封装减少药物毒性，改善中枢神经系统药代动力学，并通过单细胞RNA测序分析识别新的联合治疗策略 | 尽管延长了生存期，但复发问题仍未完全解决 | 探索提高CDK4/6抑制剂治疗髓母细胞瘤效果的新方法 | 髓母细胞瘤及其治疗 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用基因工程小鼠模型进行实验 |
| 817 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics defines keratinocyte differentiation in avian scutate scales
2022-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04082-1
PMID:34997067
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，探讨了鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 首次通过单细胞转录组学技术揭示了鸟类鳞状鳞片中两种不同类型的分化角质形成细胞，并发现了与人类皮肤相似的角质形成细胞分化基因 | NA | 研究鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 鸟类鳞状鳞片中的角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | mRNA | 来自1日龄小鸡腿部的皮肤细胞 |
| 818 | 2024-08-07 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文描述了使用10x Genomics平台同时分析人造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组和细胞表面蛋白表达的工作流程 | 结合传统的单细胞转录组分析和使用寡核苷酸偶联抗体的细胞表面蛋白表达同时分析，增加了免疫表型分析到mRNA数据中 | NA | 详细表征单细胞异质性，并有助于识别用于前瞻性分离转录定义的新细胞亚群的标记 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据和蛋白表达数据 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 |
| 819 | 2024-08-07 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨了CD161表达及其调控在HPV16相关肿瘤中对效应CD4+ T细胞的影响，发现CD4+CD161+效应记忆T细胞与改善生存率相关。 | 首次揭示了CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的作用及其调控机制，并发现CD161与SOX4共同参与TCR信号的放大。 | 研究主要集中在HPV16+的OPSCC患者，可能需要进一步研究以验证在其他类型癌症中的普遍性。 | 研究CD161表达在HPV16相关肿瘤中对CD4+ T细胞的影响及其临床意义。 | HPV16+的OPSCC患者中的CD4+CD161+ T细胞。 | 免疫学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括治疗性疫苗接种患者和肿瘤浸润淋巴细胞的样本 |
| 820 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.005
PMID:35158099
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析，揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 | 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观，并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 | NA | 旨在通过单细胞分析，定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化，以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 | 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |