单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
A dietary change to a high-fat diet initiates a rapid adaptation of the intestine
2022-11-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111641
PMID:36384107
|
研究论文 | 本研究通过生理指标和单细胞转录组学揭示了高脂饮食对肠道上皮细胞的快速适应性反应 | 首次系统揭示了肠道上皮细胞在饮食改变后1天内的快速转录组适应机制 | 研究仅关注短期反应，长期影响仍需进一步探索 | 探究饮食改变对肠道上皮细胞的即时响应机制 | 小鼠肠道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞转录组学，计算轨迹分析 | NA | 转录组数据，生理指标数据 | 高脂饮食处理的小鼠肠道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
ClampFISH 2.0 enables rapid, scalable amplified RNA detection in situ
2022-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01653-6
PMID:36280724
|
研究论文 | 介绍了一种名为clampFISH 2.0的新型原位RNA检测方法，能够快速、可扩展地检测和扩增RNA信号 | 采用反向挂锁设计，可同时高效检测多种RNA物种并指数级扩增信号，相比前代方法显著减少时间和成本 | NA | 开发高效的多重RNA原位检测和信号扩增技术 | RNA分子在单细胞和组织切片中的检测 | 空间转录组学 | NA | clampFISH 2.0, 原位RNA标记 | NA | RNA检测信号 | 超过100万个细胞 | NA | 空间转录组学, 多重信号扩增, 顺序检测 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome highlights a multilayer regulatory network on an invasive trajectory within colorectal cancer progression
2022-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04020-2
PMID:35523976
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌中从癌症干细胞到侵袭性细胞的多层调控网络 | 首次构建了结直肠癌中'干细胞-侵袭路径'的分支轨迹，并建立了多层调控网络来阐明肿瘤细胞获得侵袭特性的关键机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索结直肠癌中癌症干细胞向侵袭性细胞转化的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，生物信息学分析 | 聚类分析，伪时间分析，基因集变异分析，基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
|
研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病但谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛中α细胞功能异常的特征 | 首次发现在胰岛自身免疫早期阶段，当β细胞数量仍正常时α细胞功能已出现异常 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 研究单自身抗体阳性个体胰岛细胞功能异常的早期特征 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛组织 | 糖尿病研究 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序，组织学分析，分子表型分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学数据，功能测定数据 | 非糖尿病GADA+供体和1型糖尿病供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
NeuCA web server: a neural network-based cell annotation tool with web-app and GUI
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac108
PMID:35176143
|
研究论文 | 开发了一个基于神经网络的单细胞RNA测序细胞注释工具，提供网页应用和图形用户界面 | 首个采用神经网络架构的网页应用工具，提供超过20个常用组织类型的预训练分类器 | NA | 开发自动细胞类型注释工具，促进单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示罕见人类喉软骨肉瘤的细胞组成和肿瘤微环境特征 | 首次系统研究喉软骨肉瘤的单细胞转录组景观，发现SLAMF9基因在肿瘤非免疫细胞中的特异性表达 | 仅分析单一样本，样本量有限 | 解析喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 74岁男性原发性喉软骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 喉软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 1例患者，5455个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Mechanotherapy Reprograms Aged Muscle Stromal Cells to Remodel the Extracellular Matrix during Recovery from Disuse
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqac015
PMID:35434632
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现机械疗法能够重编程衰老肌肉基质细胞，促进废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 首次揭示机械疗法通过调节衰老肌肉中基质细胞的基因表达模式，使其更接近年轻肌肉状态，从而促进细胞外基质重塑 | 研究主要基于大鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究机械疗法是否能够促进衰老肌肉在废用性萎缩恢复期间的细胞外基质重塑 | 成年和老年大鼠的腓肠肌单核细胞 | 单细胞转录组学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序，同位素示踪，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像数据 | 成年和老年大鼠腓肠肌单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
IFN-γ transforms the transcriptomic landscape and triggers myeloid cell hyperresponsiveness to cause lethal lung injury
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1011132
PMID:36203588
|
研究论文 | 本研究揭示了流感诱导的IFN-γ通过触发髓系细胞过度反应导致MRSA共感染时致命性肺损伤的机制 | 首次证明IFN-γ受体信号驱动髓系细胞（特别是CD11c单核吞噬细胞）转录组重编程和过度反应，导致炎症因子风暴和肺组织损伤 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究急性呼吸窘迫综合征（ARDS）发病机制中IFN-γ信号通路的作用 | 小鼠模型中的免疫细胞，特别是髓系细胞和单核吞噬细胞 | 免疫学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
|
病例报告 | 通过一例重症COVID-19康复期血浆输注后完全缓解的病例，分析疾病消退的关键生物学动态 | 首次通过纵向蛋白质组学和单细胞转录组学联合分析，揭示康复期血浆输注后免疫稳态重建的生物学过程 | 单病例报告，结果需要更大规模研究验证 | 探索COVID-19疾病消退过程中的关键生物学相关因素 | 重症COVID-19患者 | 单细胞分析 | COVID-19 | 无偏蛋白质组学分析，单细胞转录组学 | NA | 蛋白质组数据，单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组分析 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Human B Cells Mediate Innate Anti-Cancer Cytotoxicity Through Concurrent Engagement of Multiple TNF Superfamily Ligands
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.837842
PMID:35392082
|
研究论文 | 研究发现人类循环B细胞通过同时表达多种TNF超家族配体介导先天性抗癌细胞毒性 | 首次揭示B细胞作为适应性免疫介质也具有先天性抗癌细胞毒性功能，通过同时表达四种跨膜TNFSF配体协同作用 | 研究样本主要来自头颈鳞状细胞癌患者，需要验证在其他癌症类型中的普适性 | 探索B细胞在先天性抗癌免疫中的作用机制 | 人类外周血B细胞及多种白血病和实体瘤细胞 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 健康个体和头颈鳞状细胞癌患者的外周血B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Locus-specific expression of transposable elements in single cells with CELLO-seq
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01093-1
PMID:34782740
|
研究论文 | 开发了结合长读长单细胞RNA测序与计算分析的CELLO-seq方法，用于在单细胞水平测量转座子元件在特定位点的表达 | 首次实现了在单细胞分辨率下对转座子元件进行位点特异性表达分析，解决了短读长测序技术无法准确定位高重复序列的难题 | 对于小鼠中极少数非常年轻的转座子元件仍无法高置信度地映射回参考基因组 | 开发能够准确测量转座子元件位点特异性表达的单细胞测序技术 | 二细胞期小鼠卵裂球和人类诱导多能干细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 二细胞期小鼠卵裂球和人类诱导多能干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CELLO-seq（单细胞长读长RNA测序） |
| 72 | 2025-10-06 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
|
研究论文 | 介绍使用BASiCS Bioconductor包分析单细胞RNA测序数据中基因表达变异性的分步计算工作流程 | 提供集成框架同时进行数据标准化、技术噪音量化和下游分析，并在分析步骤间传播统计不确定性 | 依赖于公开可用数据集，需要用户具备一定的生物信息学分析能力 | 开发稳健量化单细胞基因表达变异性的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 公开可用数据集（未指定具体样本数量） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
SH3GLB1-related autophagy mediates mitochondrial metabolism to acquire resistance against temozolomide in glioblastoma
2022-Jul-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-022-02429-8
PMID:35831908
|
研究论文 | 本研究揭示了SH3GLB1通过调控自噬介导线粒体代谢从而促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的机制 | 首次发现SH3GLB1通过自噬调控线粒体代谢功能介导胶质母细胞瘤对TMZ的耐药性 | 机制研究主要基于体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞系、动物模型和临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA干扰、基因扩增、单细胞转录组分析、细胞分子检测 | NA | RNA转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床肿瘤样本和细胞系，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals three sequential phases of gene expression during zebrafish sensory hair cell regeneration
2022-03-28, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.03.001
PMID:35316618
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示斑马鱼感觉毛细胞再生过程中基因表达的三个连续阶段 | 首次以高时空分辨率揭示斑马鱼感觉毛细胞再生的三个连续转录激活模块 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 理解感觉毛细胞再生的分子机制和转录动态 | 斑马鱼感觉毛细胞 | 单细胞生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
The promising role of new molecular biomarkers in prostate cancer: from coding and non-coding genes to artificial intelligence approaches
2022-09, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-022-00537-2
PMID:35422101
|
综述 | 本文系统综述了前列腺癌新型分子标志物（包括编码和非编码基因）及人工智能方法的最新研究进展 | 整合了转录组学、基因组学和人工智能方法在前列腺癌生物标志物发现中的协同应用 | NA | 概述通过转录组学、基因组学和人工智能发现新型分子标志物的最新进展，以改善前列腺癌患者的临床管理 | 前列腺癌相关分子标志物和人工智能分析方法 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 全基因组测序, RNA测序, 外显子组测序, 空间转录组学 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 全基因组测序, 外显子组测序, RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Mitochondrial dysfunction induces ALK5-SMAD2-mediated hypovascularization and arteriovenous malformations in mouse retinas
2022-12-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-35262-w
PMID:36496409
|
研究论文 | 本研究揭示了线粒体功能障碍通过ALK5-SMAD2信号通路导致小鼠视网膜血管发育异常和动静脉畸形的机制 | 首次发现线粒体功能障碍通过诱导SMAD2线粒体定位和MAPKs介导的磷酸化增强ALK5-SMAD2信号通路，导致视网膜血管异常 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类疾病中验证 | 探究线粒体功能障碍导致视网膜血管发育异常的分子机制 | 内皮细胞特异性缺失Tfam、Cox10或Trx2基因的小鼠视网膜 | 分子生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像 | 三种不同基因敲除小鼠品系的视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
mTORC1 links pathology in experimental models of Still's disease and macrophage activation syndrome
2022-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34480-6
PMID:36443301
|
研究论文 | 本研究揭示了mTORC1在斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征病理机制中的核心作用 | 首次证明mTORC1的异常激活是连接斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征的关键分子机制 | 主要基于小鼠模型研究，人类样本验证相对有限 | 探究mTORC1在斯蒂尔病和巨噬细胞活化综合征发病机制中的作用 | 小鼠模型和斯蒂尔病患者样本 | 分子病理学 | 斯蒂尔病, 巨噬细胞活化综合征 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas基因编辑, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 小鼠模型和人类患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Reprogramming Müller glia to regenerate ganglion-like cells in adult mouse retina with developmental transcription factors
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq7219
PMID:36417510
|
研究论文 | 本研究通过过表达发育转录因子将成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞重编程为神经节样细胞 | 首次证明通过靶向过表达发育性视网膜神经节细胞转录因子可在成年哺乳动物视网膜中实现特定类型神经元再生 | 研究仅限于小鼠模型，再生细胞的长期功能和整合能力仍需进一步验证 | 探索特定转录因子组合引导Müller胶质细胞向特定视网膜神经元类型再生的能力 | 成年小鼠视网膜Müller胶质细胞 | 神经再生 | 青光眼 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，电生理学 | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据，电生理数据 | 工程化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Oral cavity infection by the SARS-CoV-2: emphasizing the essence of masking and peptide therapeutics
2022, The Egyptian journal of medical human genetics
DOI:10.1186/s43042-022-00213-z
PMID:37521842
|
研究论文 | 本研究基于TMPRSS2与PAI-1的结合界面设计治疗性肽以抑制SARS-CoV-2感染，并强调佩戴口罩的预防作用 | 首次利用TMPRSS2与PAI-1的结合界面信息设计特异性抑制TMPRSS2的治疗性肽 | NA | 开发抑制SARS-CoV-2感染的治疗方法并强调预防措施 | 口腔黏膜上皮细胞及SARS-CoV-2病毒入侵机制 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Intratumor heterogeneity and T cell exhaustion in primary CNS lymphoma
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01110-1
PMID:36153593
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析原发性中枢神经系统淋巴瘤的肿瘤异质性和T细胞耗竭特征 | 首次结合单细胞RNA测序、B细胞受体测序和空间转录组学技术系统揭示PCNSL的瘤内异质性及T细胞耗竭空间分布特征 | 样本量有限且仅来自活检组织、血液和脑脊液，可能无法完全代表肿瘤整体特征 | 深入表征原发性中枢神经系统淋巴瘤的肿瘤异质性和免疫微环境特征 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤患者活检组织、血液和脑脊液样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,B细胞受体测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,B细胞受体序列数据 | 未明确具体样本数量（包含活检组织、血液和脑脊液样本） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |