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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-27 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析、转录因子调控网络分析、高分辨率共聚焦显微镜及胰岛素分泌测量,揭示了人类胰岛β细胞在衰老过程中发生的分子和功能变化 | 首次通过跨人类生命周期的综合分析,揭示了衰老导致β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活和胰岛素分泌功能减退的分子机制 | 研究基于非糖尿病供体样本,可能无法完全代表糖尿病患者的β细胞衰老特征 | 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和特性的影响机制 | 人类非糖尿病供体的胰岛β细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、高分辨率共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-05-26 |
Mitochondrial variant enrichment from high-throughput single-cell RNA sequencing resolves clonal populations
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01210-8
PMID:35210612
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研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序富集线粒体变异,解析克隆群体 | 结合常见3'单细胞RNA测序方案与线粒体转录组富集技术,将覆盖率提高50倍以上,实现高置信度突变检测 | NA | 建立可扩展且高灵敏度的线粒体DNA变异检测方法,以解析复杂组织中细胞克隆关系 | 原代人细胞(克隆造血中的免疫细胞) | 机器学习 | 克隆造血 | 单细胞RNA测序, 线粒体转录组富集 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 常见3'单细胞RNA测序方案 |
| 63 | 2026-05-26 |
Novel bi-allelic variants in KASH5 are associated with meiotic arrest and non-obstructive azoospermia
2022-06-30, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaac021
PMID:35674372
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研究论文 | 本研究在非梗阻性无精子症患者中鉴定出KASH5基因的新型双等位变异,证实其与减数分裂阻滞和男性不育相关 | 首次在人类细胞中评估KASH5蛋白表达,并揭示LINC复合物在人类和小鼠中的保守调控机制 | 功能验证主要依赖小鼠模型,人类样本数量有限,具体分子机制尚需进一步研究 | 探究KASH5基因变异与非梗阻性无精子症和减数分裂阻滞的关联 | 非梗阻性无精子症患者及其不孕姐妹 | 机器学习 | 男性不育症 | 全外显子组测序、CNV芯片、单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列数据、单细胞转录组数据 | 1例先证者及其姐妹,以及Kash5基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-05-23 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dynamic control of metabolic zonation and liver regeneration by endothelial cell Wnt2 and Wnt9b
2022-10-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100754
PMID:36220068
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研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示内皮细胞Wnt2和Wnt9b对肝脏代谢分区和再生的动态调控 | 首次明确证明内皮细胞来源的Wnt2和Wnt9b在肝脏分区与再生中的关键作用,并发现分区过程具有动态性,同时开发四价抗体激活剂为急性肝衰竭提供再生治疗新策略 | NA | 阐明调控肝脏分区和再生的Wnt信号具体来源及其机制 | 肝脏内皮细胞、肝细胞、小鼠模型及对乙酰氨基酚中毒急性肝衰竭模型 | 单细胞组学 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 65 | 2026-05-17 |
CoSpar identifies early cell fate biases from single-cell transcriptomic and lineage information
2022-07, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01209-1
PMID:35190690
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研究论文 | CoSpar是一种利用单细胞转录组和谱系信息识别早期细胞命运偏向的鲁棒计算方法 | 通过相干稀疏优化(CoSpar)方法,在谱系数据严重降采样和分散的情况下仍能稳健推断细胞动态,并发现了先前未检测到的早期命运偏向预测因子 | 未提及具体限制 | 开发稳健计算方法从整合单细胞转录组与谱系跟踪的数据中推断细胞动态 | 造血、重编程和定向分化过程中的细胞动态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | 稀疏优化模型 | 单细胞转录组数据、谱系数据 | 造血、重编程和定向分化数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-05-17 |
Longitudinal Analysis of Biologic Correlates of COVID-19 Resolution: Case Report
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.915367
PMID:35783607
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研究报告 | 通过纵向分析一名重症COVID-19患者的血浆蛋白质组和外周血单细胞转录组,揭示了从重症到康复过程中的关键生物学变化 | 首次结合无偏倚血浆蛋白质组学和单细胞转录组学纵向追踪COVID-19患者从重症到完全康复的生物学动态,特别是发现了一类具有高度干扰素应答和降低TNF-α信号的单核细胞亚群在康复后消失 | 仅基于单一个案报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 | 阐明COVID-19患者从重症到完全康复过程中的关键生物学动态 | 一名接受恢复期血浆输注的重症COVID-19患者 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 蛋白质组学和转录组学数据 | 1例重症COVID-19患者 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于外周血单细胞转录组分析 |
| 67 | 2026-05-16 |
Single cell RNA-seq analysis reveals temporally-regulated and quiescence-regulated gene expression in Drosophila larval neuroblasts
2022-08-24, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-022-00163-7
PMID:36002894
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析果蝇幼虫神经母细胞的基因表达,揭示时间调控和静止调控的特征 | 首次在多个发育时间点对果蝇幼虫中枢神经系统进行单细胞转录组分析,发现新的祖细胞亚型标记物,并鉴定出静止神经母细胞对胰岛素信号通路的转录预备状态 | 未提及具体局限性 | 探究果蝇幼虫神经系统发育中神经多样性的生成机制 | 果蝇幼虫中枢神经系统中的神经母细胞和中间祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育时间点的果蝇幼虫样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-05-16 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
|
研究论文 | 系统鉴定了地西他滨在体内诱导的全局基因组和转录组改变,包括全基因组亚硫酸氢盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序分析 | 首次系统描述了地西他滨在体内治疗过程中诱导的全局性、可逆性低甲基化及其相关转录组变化,并发现红系相关通路在治疗中受抑制而在复发时逆转 | 样本量有限且患者间变异大,限制了检测较小临床效应的统计效力 | 阐明地西他滨治疗骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者时引起的体内分子变化机制 | 接受地西他滨治疗的骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者的原代骨髓样本 | 机器学习和生物信息学 | 骨髓增生异常综合征, 急性髓系白血病 | 全基因组亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多名患者的原代骨髓样本 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序, 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-05-15 |
Molecular and anatomical characterization of parabrachial neurons and their axonal projections
2022-11-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81868
PMID:36317965
|
研究论文 | 对臂旁核神经元及其轴突投射进行分子和解剖学特征描述 | 通过单细胞RNA测序鉴定出臂旁核及其邻近区域的21个神经元亚群,并利用多重原位杂交和21种Cre驱动小鼠品系提供了详细的分子身份、空间位置和投射模式 | 未明确讨论研究局限性 | 揭示臂旁核神经元亚群的分子特征、空间分布和轴突投射模式 | 臂旁核及其邻近区域的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,多重原位杂交 | NA | 基因表达数据,图像 | 21种Cre驱动小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-12 |
Selectively Imaging Cranial Sensory Ganglion Neurons Using AAV-PHP.S
2022 May-Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0373-21.2022
PMID:35610024
|
研究论文 | 使用AAV-PHP.S选择性成像颅脑感觉神经节神经元 | 首次利用AAV-PHP.S载体实现对小鼠颅神经V、VII、IX、X感觉神经节神经元的高效转导和荧光标记,并结合功能成像揭示此前未记录的膝状神经节耳廓神经元的感官特性 | 研究主要基于小鼠模型,且转导效率约为66%,可能未覆盖全部神经元亚型 | 开发并验证AAV-PHP.S作为工具用于外周感觉神经元的解剖和功能映射 | 小鼠颅神经V、VII、IX、X感觉神经节的感觉神经元(包括躯体性和内脏性假单极神经元)以及卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | AAV介导的基因传递、荧光成像、光片显微镜、钙成像 | NA | 图像 | 小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | NA | AAV-PHP.S | AAV-PHP.S携带GFP或mScarlet荧光蛋白以及Cre依赖性报告基因 |
| 71 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA-seq of primary bone marrow neutrophils from female and male adult mice
2022-07-23, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01544-7
PMID:35871169
|
研究论文 | 使用单细胞RNA-seq技术对成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞进行转录组分析 | 首次对雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞进行单细胞分辨率转录组分析,克服了中性粒细胞RNA含量低的技术挑战 | 仅分析了小鼠模型,尚未涉及人类样本或更复杂的生理病理条件 | 研究哺乳动物免疫系统的性别二态性,特别是中性粒细胞在单细胞水平的转录组差异 | 成年雌性和雄性小鼠骨髓中的原发性中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 约2500个雌性和雄性小鼠骨髓中性粒细胞(具体数量需参考原文) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 72 | 2026-05-06 |
Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data
2022-10, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01167-z
PMID:36050550
|
研究论文 | 介绍单细胞疾病相关性评分(scDRS),一种将单细胞RNA测序与多基因疾病风险关联的方法 | 在单细胞水平上独立于注释的细胞类型,通过多基因富集识别疾病相关细胞亚群 | 未提及明确局限性 | 建立单细胞基因表达与多基因疾病风险之间的关联,发现新的疾病相关细胞亚群 | 单细胞基因表达谱 | 机器学习和生物信息学 | 多种疾病/性状,包括炎性肠病、精神分裂症和甘油三酯水平相关疾病 | scRNA-seq | scDRS(单细胞疾病相关性评分) | 基因表达数据 | 74种疾病/性状,130万个单细胞基因表达谱,涵盖31个组织/器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-05-02 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 利用结直肠癌类器官模型通过单细胞RNA测序揭示奥沙利铂耐药机制 | 建立了来自奥沙利铂耐药和初治患者的患者源性类器官模型,并通过单细胞RNA测序解析耐药细胞群体及相关信号通路和驱动基因 | 未提及具体局限性 | 研究结直肠癌对奥沙利铂化疗耐药的分子机制 | 来自奥沙利铂耐药和初治结直肠癌患者的患者源性类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两株患者源性类器官(来自耐药和初治患者各一株) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-05-02 |
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00664-x
PMID:35290607
|
综述 | 总结了胰腺导管化生的分子机制及其作为早期胰腺癌检测和干预生物标志物的潜力 | 通过整合基因工程小鼠模型、细胞谱系追踪和单细胞测序等最新技术,揭示了PDM形成和演化的新型细胞和分子机制,并探讨其作为早期胰腺癌生物标志物的临床应用前景 | 基于综述性分析,可能缺乏原始实验数据支持,且PDM标志物向临床转化的有效性需进一步验证 | 阐释胰腺导管化生的细胞和分子机制,并探讨其作为早期胰腺癌筛查和干预生物标志物的潜在价值 | 胰腺导管化生细胞及其基因调控网络 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,细胞谱系追踪 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 可能使用10x Chromium平台进行单细胞转录组分析 |
| 75 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2026-04-30 |
Expansion, persistence, and efficacy of donor memory-like NK cells infused for posttransplant relapse
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154334
PMID:35349491
|
研究论文 | 该研究通过I期临床试验,评估了供者来源的记忆样自然杀伤细胞在单倍体相合造血干细胞移植后复发患者中的扩增、持久性和疗效 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式技术在纵向时间点对输入体内的记忆样NK细胞亚群进行高分辨率特征分析,揭示了其在免疫相容环境中的快速扩增和长期持续能力 | 初始仅纳入6例患者,样本量较小,且未详细阐述记忆样NK细胞与T细胞和肿瘤靶标的相互作用机制 | 评估供者来源的细胞因子诱导的记忆样NK细胞治疗异基因造血干细胞移植后髓系肿瘤复发的安全性和有效性 | 接受单倍体相合造血干细胞移植后复发的髓系肿瘤患者 | 数字病理学 | 髓系肿瘤 | 单细胞RNA测序,质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据,免疫表型数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals evolution of immune landscape during glioblastoma progression
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01215-0
PMID:35624211
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演变 | 首次在小鼠模型中通过单细胞转录组学系统描绘了GBM进展全过程中免疫细胞组成的大规模纵向变化,并发现与临床样本的低级别胶质瘤和GBM中相似的微胶质细胞和巨噬细胞关系 | 未明确提及局限性 | 研究胶质母细胞瘤进展过程中免疫微环境的动态演变及标准治疗的影响 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者活检样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者低级别胶质瘤和GBM活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-04-30 |
Human CD206+ macrophages associate with diabetes and adipose tissue lymphoid clusters
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146563
PMID:34990410
|
研究论文 | 本研究分析了人类脂肪组织中三种巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用,发现CD206+CD11c-巨噬细胞与糖尿病相关,并在血管化淋巴样簇中聚集 | 首次在人类脂肪组织中定义CD206+巨噬细胞亚型与2型糖尿病的关联,并揭示其独特的基因表达谱和空间分布特征 | 样本量有限且仅来自肥胖参与者,未纳入正常体重或非糖尿病对照组 | 探究人类脂肪组织巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用及其基因表达特征 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的内脏脂肪组织和皮下脂肪组织 | 机器学习和数据分析 | 糖尿病、肥胖 | 单细胞转录组学、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 79 | 2026-04-28 |
Unsupervised cell functional annotation for single-cell RNA-seq
2022-Sep-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276609.122
PMID:35764397
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研究论文 | 开发了一种无监督的细胞功能注释方法UNIFAN,用于单细胞RNA测序数据 | UNIFAN是一种同时进行聚类和注释的神经网络方法,利用已知基因集来确定聚类,显著优于传统聚类方法 | 可能依赖已知基因集的完整性和准确性,未提及在未知细胞类型或复杂组织中的性能 | 改进单细胞RNA测序数据中细胞类型分配的准确性和可解释性 | 人类和小鼠的scRNA-seq数据集,来自多个不同器官 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 人类和小鼠scRNA-seq数据集,具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomics reveals conserved cell identities and fibrogenic phenotypes in zebrafish and human liver
2022-07, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1930
PMID:35315595
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示斑马鱼与人类肝脏中保守的细胞身份和纤维化表型 | 首次建立成年斑马鱼肝脏的单细胞RNA测序图谱,发现colec11作为斑马鱼肝星状细胞的新保守标记物,并通过比较分析验证斑马鱼作为肝纤维化研究模型的实用性 | 未明确提及局限性 | 表征成年斑马鱼肝脏的单细胞转录组以确定其作为研究肝纤维化模型的效用 | 成年斑马鱼肝脏和人类肝脏中的单细胞,尤其是肝星状细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 斑马鱼肝脏样本和人类肝脏样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |