单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies G-protein coupled receptor 87 as a basal cell marker expressed in distal honeycomb cysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02373-2021
PMID:35604813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 742 | 2024-08-07 |
Deciphering Mesenchymal Drivers of Human Dupuytren's Disease at Single-Cell Level
2022-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.05.030
PMID:34274346
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了35,250个人类单细胞的转录组，以识别驱动Dupuytren病的关键细胞和分子途径 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出Dupuytren病特异性的病原性PDPN/FAP间充质细胞群，并揭示了调控该病特异性肌成纤维细胞表型的关键分子途径 | NA | 旨在识别驱动Dupuytren病的关键细胞和分子途径，以开发新的有效治疗方法 | Dupuytren病、非病理性筋膜和健康真皮的单细胞 | 数字病理学 | Dupuytren病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 35,250个人类单细胞 |
| 743 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics and cell-specific proteomics reveals molecular signatures of sleep
2022-08-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03800-3
PMID:35986171
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和细胞类型特异性蛋白质组学研究了睡眠的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞类型特异性蛋白质组学技术，探讨了不同脑区细胞类型对睡眠需求的转录响应 | NA | 揭示睡眠的分子机制 | 大脑中的不同细胞类型及其对睡眠需求的响应 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞类型特异性蛋白质组学 | NA | 转录组，蛋白质组 | 涉及三个重要脑区（脑干、皮层和下丘脑）的不同细胞类型 |
| 744 | 2024-08-07 |
Protocol to obtain high-quality single-cell RNA-sequencing data from mouse liver cells using centrifugation
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101824
PMID:36386875
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用离心法从鼠肝细胞中获取高质量单细胞RNA测序数据的方法 | 提出了一种新的离心法来获取可存活的肝细胞和非实质性肝细胞，以避免使用荧光激活细胞分选（FACS）导致的细胞死亡问题 | NA | 开发一种新的方法来获取高质量的肝细胞单细胞RNA测序数据 | 鼠肝细胞，特别是肝细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 745 | 2024-08-07 |
DeepVelo: Single-cell transcriptomic deep velocity field learning with neural ordinary differential equations
2022-Dec-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq3745
PMID:36449617
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络的常微分方程模型DeepVelo，用于模拟单细胞转录组动力学 | DeepVelo能够通过描述单细胞内连续时间的基因表达变化，来模拟复杂的转录组动力学 | NA | 研究单细胞转录组动力学，并探索细胞状态的不稳定性及发育驱动基因 | 单细胞基因表达数据和RNA速度 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 神经网络 | 基因表达数据 | 使用来自不同测序平台的公共数据集 |
| 746 | 2024-08-07 |
Improving Transcriptome Fidelity Following Synovial Tissue Disaggregation
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.919748
PMID:36035425
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研究论文 | 本文通过改进关节组织分散技术，提高了解散关节组织细胞转录组的保真度，特别是对于单细胞RNA测序（scRNAseq）的应用 | 本文引入了RNA聚合酶抑制剂和冷酶消化方法，有效减少了组织处理过程中相关转录本的诱导，从而提高了转录组的保真度 | NA | 提高解散关节组织细胞转录组的保真度 | 骨关节炎（OA）和类风湿关节炎（RA）的关节组织 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 骨关节炎和类风湿关节炎的关节组织样本 |
| 747 | 2024-08-07 |
A high interferon gamma signature of CD8+ T cells predicts response to neoadjuvant immunotherapy plus chemotherapy in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1056144
PMID:36685525
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研究论文 | 研究探讨了胃癌中肿瘤微环境（TME）与新辅助免疫治疗加化疗之间的相互作用，并分析了CD8+ T细胞中高基线干扰素γ（IFN-γ）信号对治疗反应的预测作用。 | 首次阐明了胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境特征之间的相互作用，并强调了CD8+ T细胞的信号在预测治疗反应中的重要性。 | 研究样本量较小，仅涉及十个胃癌样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究胃癌中新辅助免疫治疗加化疗与肿瘤微环境的相互作用及其对治疗效果的影响。 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8+ T细胞的干扰素γ信号。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十个胃癌样本 |
| 748 | 2024-08-07 |
Single-cell computational machine learning approaches to immune-mediated inflammatory disease: New tools uncover novel fibroblast and macrophage interactions driving pathogenesis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1076700
PMID:36685542
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术结合计算生物学方法，探索纤维母细胞与骨髓细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用及其临床意义 | 介绍了新的计算生物学技术，如维度降低、聚类和轨迹推断，以及这些技术在揭示纤维母细胞亚群与巨噬细胞之间新型相互作用中的应用 | 需要更强大的模型来进一步分析纤维母细胞的异质性及其与骨髓细胞的相互作用 | 总结计算技术在分类纤维母细胞异质性及其与骨髓细胞在特定生物学和临床环境中的相互作用方面的关键进展 | 纤维母细胞的异质性及其与巨噬细胞在免疫介导炎症疾病中的相互作用 | 机器学习 | 免疫介导炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 749 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals striking heterogeneity and functional organization of dendritic and monocytic cells in the bovine mesenteric lymph node
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1099357
PMID:36685557
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了牛肠系膜淋巴结中树突状细胞和单核细胞的异质性和功能组织 | 揭示了树突状细胞和单核细胞的十个集群和七个集群，具有明显的转录组特征，并定义了淋巴结定居子集及其前体，以及高度激活的迁移树突状细胞子集 | NA | 研究树突状细胞和单核细胞在次级淋巴组织中启动和塑造适应性免疫反应的复杂系统 | 牛肠系膜淋巴结中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 三头成年牛的肠系膜淋巴结 |
| 750 | 2024-08-07 |
Disordered T cell-B cell interactions in autoantibody-positive inflammatory arthritis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1068399
PMID:36685593
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研究论文 | 研究探讨了在幼年寡关节炎（oligo JIA）中，Tph细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 | 通过单细胞转录组学技术，进一步定义了Tph细胞的基因特征，并发现ANA阳性患者的Tph细胞上调了与B细胞帮助相关的基因 | NA | 确定在幼年寡关节炎中，T细胞与B细胞的异常相互作用是否与自身抗体阳性相关 | Tph细胞在幼年寡关节炎患者中的分布及其与B细胞的相互作用 | NA | 幼年寡关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 751 | 2024-08-07 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
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research paper | 本文通过结合单细胞RNA和ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像，呈现了一个人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱。 | 本文识别了所有肺部细胞区室中先前未被表征的细胞状态，包括与人类小细胞肺癌相关的新型神经内分泌细胞亚型。 | NA | 揭示人类胎儿肺发育过程中的细胞分化梯度和关键调控因子。 | 人类胎儿肺部的上皮细胞、间质细胞、内皮细胞和红细胞/白细胞区室。 | digital pathology | lung cancer | 单细胞RNA测序、ATAC测序、高通量空间转录组学 | NA | 细胞图谱数据 | 从5-22周的胎儿肺部样本 |
| 752 | 2024-08-07 |
Protein aggregation and calcium dysregulation are hallmarks of familial Parkinson's disease in midbrain dopaminergic neurons
2022-Nov-24, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-022-00423-7
PMID:36424392
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研究论文 | 本文利用人类诱导多能干细胞（hiPSCs）研究了SNCA基因突变引起的帕金森病（PD）中分子事件的时间序列，揭示了早期和可能的致病事件。 | 首次展示了SNCA突变细胞在分化早期形成的β片层丰富的寡聚体聚集物，并揭示了这些聚集物与细胞内钙信号失调的关系，表明蛋白质错误折叠生成神经元内寡聚体是疾病早期的关键事件。 | 研究仅限于使用人类诱导多能干细胞模型，可能与真实的疾病发展过程存在差异。 | 研究SNCA基因突变导致的帕金森病中分子事件的时间序列，以发现早期和可能的致病事件。 | SNCA基因突变引起的帕金森病中的分子事件。 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序和蛋白质组学 | NA | 细胞 | 小分子为基础的协议生成的高度富集的中脑多巴胺能（mDA）神经元 |
| 753 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the identity and regulators of human mast cell progenitors
2022-08-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022006969
PMID:35500226
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析揭示了人类肥大细胞前体细胞的身份及其调控因子 | 首次展示了FcεRI在肥大细胞前体阶段表达的时间关联，并揭示了外部刺激对肥大细胞前体FcεRI表达的调控作用 | NA | 探讨肥大细胞前体细胞的特征及其在疾病中的作用 | 人类肥大细胞前体细胞及其在过敏性哮喘和系统性肥大细胞增多症中的作用 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 成人外周血中的CD34+造血前体细胞 |
| 754 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing distinguishes dendritic cell subsets in the rat, allowing advanced characterization of the effects of FMS-like tyrosine kinase 3 ligand
2022-Jul, Scandinavian journal of immunology
IF:4.1Q2
DOI:10.1111/sji.13159
PMID:35285040
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合多色光谱流式细胞术，对大鼠模型中的组织驻留树突状细胞进行鉴定和表征，并研究了FMS样酪氨酸激酶3配体（FLT3L）对其的影响。 | 首次将单细胞RNA测序与多色光谱流式细胞术结合，用于鉴定和表征大鼠模型中的组织驻留树突状细胞，并详细研究了FLT3L对其数量和表型的影响。 | 研究主要集中在肝脏、脾脏和肠系膜淋巴结中的树突状细胞，未涉及其他组织或器官。 | 探讨FLT3L对大鼠组织驻留树突状细胞数量和表型的影响。 | 大鼠模型中的组织驻留树突状细胞及其亚型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了Lewis大鼠进行体内实验。 |
| 755 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and clonality of kidney-infiltrating T cells in murine lupus nephritis
2022-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156048
PMID:35271505
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序分析了小鼠狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的异质性和克隆性 | 发现CD8+和CD4+肾脏浸润T细胞在狼疮性肾炎中的不同分化状态，揭示了肾脏微环境对T细胞的抑制作用 | NA | 探讨狼疮性肾炎中肾脏浸润T细胞的功能状态及其与疾病进展的关系 | 小鼠狼疮性肾炎模型中的肾脏浸润T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 756 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity and convergence of the tumor microenvironment in colorectal cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1003419
PMID:36685571
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序数据分析，揭示了结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 | 本研究首次通过追踪分化轨迹，揭示了脂质代谢重塑和免疫功能抑制的关系，并构建了具有良好预后价值的免疫风险模型和临床风险模型 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境的异质性和收敛性 | 结直肠癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从肿瘤、癌旁组织和外周血中鉴定出8种主要细胞类型和25个亚群 |
| 757 | 2024-08-07 |
The relevance between hypoxia-dependent spatial transcriptomics and the prognosis and efficacy of immunotherapy in claudin-low breast cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1042835
PMID:36685583
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学（ST）与免疫荧光技术，探讨了人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤中与缺氧相关的空间异质性及其对免疫治疗预后和疗效的影响。 | 首次揭示了claudin-低乳腺癌中基于缺氧依赖的空间异质性，并探讨了其作为临床结果和免疫治疗反应预测生物标志物的潜力。 | NA | 探讨缺氧依赖的空间转录组学与claudin-低乳腺癌患者免疫治疗预后和疗效的相关性。 | 人claudin-低乳腺癌MDA-MB-231移植瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | 1904例乳腺癌样本 |
| 758 | 2024-08-07 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
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研究论文 | 本文开发了一种名为SECANT的生物学指导半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括使用表面蛋白数据中识别的可靠细胞类型标签作为细胞聚类的指导，为每个细胞群提供一般注释，利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞提高性能，以及准确预测scRNA-seq数据的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 单细胞多组学数据，特别是CITE-seq数据 | 生物信息学 | NA | CITE-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 多个组织的公共和内部数据集 |
| 759 | 2024-08-07 |
Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts
2022-Apr-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092197
PMID:35565326
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了胰腺导管细胞癌（PDAC）从原发部位向淋巴结转移过程中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的变化 | 提出了“进化侵袭水平（ELI）”框架，描述了基质侵袭性的进化，并发现了在PDAC进展的不同阶段，成纤维细胞亚群的显著变化 | NA | 探究胰腺导管细胞癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的角色和变化 | 胰腺导管细胞癌及其相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用Peng等人发表的单细胞RNA测序数据和The Cancer Genome Atlas中的大量RNAseq数据 |
| 760 | 2024-08-07 |
Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network of Immune Environment Underlying Cervical Premalignant Lesion, Cervical Cancer and Metastatic Lymph Nodes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.897366
PMID:35812401
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了宫颈癌不同阶段的免疫细胞和间质细胞的组成、谱系和功能状态 | 首次使用单细胞RNA测序技术描绘了宫颈癌进展过程中免疫细胞的转录组图谱 | NA | 深入理解肿瘤微环境（TME）的复杂性，为宫颈癌提供新的治疗策略 | 正常宫颈组织、上皮内瘤变、原发性肿瘤和转移性淋巴结组织中的免疫细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共获得59913个单细胞，分为9个细胞集群 |