单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-05 |
Single cell full-length transcriptome of human subcutaneous adipose tissue reveals unique and heterogeneous cell populations
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104772
PMID:35992069
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研究论文 | 这篇文章揭示了人类皮下脂肪组织的独特且异质的细胞群体 | 采用全长单细胞RNA测序技术，首次全面分析了白色脂肪组织的转录组组成 | 与脂肪组织相比，脂肪细胞的单细胞RNA测序无法匹配其异质性 | 识别影响代谢的白色脂肪组织细胞组成的潜在变化 | 人类的皮下白色脂肪组织及其相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用整块组织、分离的脂肪细胞和基质血管分数的单细胞样本进行分析 |
| 642 | 2024-08-05 |
ELF5 is a potential respiratory epithelial cell-specific risk gene for severe COVID-19
2022-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31999-6
PMID:35970849
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研究论文 | 本文优先考虑了与COVID-19结局相关的候选蛋白介导因子，ELF5被认为是严重COVID-19的潜在风险基因 | 该研究首次将ELF5作为与严重COVID-19相关的特定呼吸上皮细胞风险基因进行强调 | 研究可能未能识别所有潜在的遗传因素，且尚未对所有候选基因进行全面的功能验证 | 探讨主机遗传因素如何影响COVID-19感染的预后 | 研究对象包括ELF5及其他相关蛋白介导因子与COVID-19结局的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫组化 | NA | NA | 大型人类遗传研究 |
| 643 | 2024-08-05 |
Sample-multiplexing approaches for single-cell sequencing
2022-Aug-05, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04482-0
PMID:35927335
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研究论文 | 本文介绍了单细胞测序的样本多重化方法 | 提出了一系列创新的样本多重化方法，克服了当前单细胞测序的高成本和效率低下的问题 | 未详细讨论每种多重化方法的具体应用和潜在局限性 | 探索如何在转录组学、表观基因组学、基因组学和多组学中提升单细胞测序的效率 | 主要研究单细胞测序中样本多重化的方法和技术 | 数字病理学 | NA | 转录组学、表观基因组学、基因组学、多组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 644 | 2024-08-05 |
BAP1 Loss Promotes Suppressive Tumor Immune Microenvironment via Upregulation of PROS1 in Class 2 Uveal Melanomas
2022-Jul-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14153678
PMID:35954340
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研究论文 | 本文研究了BAP1缺失如何通过上调PROS1促进二类葡萄膜黑色素瘤的免疫抑制微环境 | 提出了BAP1缺失与肿瘤免疫微环境抑制之间的机制联系，揭示了PROS1-MERTK通路作为潜在免疫治疗靶点 | 尚未明确其他可能的调控因子，且结果的通用性需进一步验证 | 探讨BAP1缺失与二类葡萄膜黑色素瘤免疫抑制之间的潜在机制 | 二类葡萄膜黑色素瘤样本、基因工程UM细胞系及葡萄膜黑色素细胞 | 数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | RNA测序 (RNA-seq) 和ChIP-seq | NA | 基因组数据 | 包括UM样本和基因工程细胞系的多个样本 |
| 645 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing of zebrafish hair cells reveals novel genes potentially involved in hearing loss
2022-Jun-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04410-2
PMID:35753015
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研究论文 | 本研究分析了斑马鱼毛细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了与听力损失相关的潜在新基因 | 首次在斑马鱼中系统分析不同类型毛细胞的分子特征，发现与听力损失相关的新基因 | 对毛细胞的分子特征的系统分析仍然不足，可能未涵盖所有相关基因 | 研究斑马鱼毛细胞的基因特征及其与听力损失的关系 | 斑马鱼的不同类型毛细胞，包括毛细胞亚型 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用来自Tg(Brn3c:mGFP)幼鱼的GFP+细胞进行分析 |
| 646 | 2024-08-05 |
Impaired primordial follicle assembly in offspring ovaries from zearalenone-exposed mothers involves reduced mitochondrial activity and altered epigenetics in oocytes
2022-Apr-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04288-0
PMID:35469021
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研究论文 | 本研究探讨了ZEA暴露对新生小鼠卵巢中原始卵泡形成的影响以及其在卵母细胞中的表观遗传学改变 | 揭示了ZEA引起的线粒体活性降低和卵母细胞中表观遗传学改变是导致原始卵泡组装受损的机制 | 未涉及长期ZEA暴露对后代长期生育能力的影响 | 研究ZEA对小鼠卵巢原始卵泡形成和卵母细胞基因表达的影响 | 母鼠及其新生小鼠的卵巢及卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠卵巢样本数量未具体说明 |
| 647 | 2024-08-05 |
Gene regulatory network from cranial neural crest cells to osteoblast differentiation and calvarial bone development
2022-Feb-27, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04208-2
PMID:35220463
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综述 | 本文总结了颅神经嵴细胞在骨形成中的基因调控网络及其对颅骨发育的贡献 | 揭示了鼠和人类中颅神经嵴衍生的成骨潜能的潜在基因调控网络的差异 | 虽然讨论了基因调控网络的影响，但是具体的实验数据和样本大小未详述 | 研究颅神经嵴细胞的分化及其在颅骨发育中的作用 | 颅神经嵴细胞及其衍生的成骨细胞和软骨细胞 | 数字病理学 | 临床出生缺陷和疾病 | 单细胞测序 | 基因鼠模型 | NA | NA |
| 648 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Defines Expression of Kabuki Syndrome-Associated KMT2D Targets and Interacting Partners
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/4969441
PMID:35992033
|
研究论文 | 本文研究了Kabuki综合征相关的KMT2D靶基因及其相互作用伙伴的表达 | 首次使用单细胞RNA数据分析KMT2D和KDM6A在小鼠牙髓中的表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探究KMT2D和KDM6A在间充质干细胞分化过程中的作用 | 小鼠牙髓中的KMT2D和KDM6A基因表达 | 数字病理学 | Kabuki综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠牙髓样本 |
| 649 | 2024-08-05 |
SHH and Notch regulate SOX9+ progenitors to govern arcuate POMC neurogenesis
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.855288
PMID:36033614
|
研究论文 | 本文研究了SHH和Notch信号通路如何调控SOX9+前体细胞以影响POMC神经发生 | 本研究首次揭示了SHH和Notch在调控SOX9+前体细胞及其分化中的作用 | 研究主要基于胚胎小鸡模型，可能在其他物种中存在差异 | 探讨下丘脑神经发生过程中转录因子的动态表达及其调控机制 | 主要研究对象为下丘脑弓状核中的POMC表达神经元及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫组化和多重杂交技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胚胎小鸡样本 |
| 650 | 2024-08-05 |
LDL delivery of microbial small RNAs drives atherosclerosis through macrophage TLR8
2022-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01030-7
PMID:36474072
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研究论文 | 本研究表明微生物小RNA（msRNA）通过低密度脂蛋白（LDL）驱动促炎性巨噬细胞极化和细胞因子分泌。 | 确定了LDL-msRNA作为动脉粥样硬化相关炎症的诱因，揭示了LDL在胆固醇运输之外的其他功能。 | NA | 研究微生物小RNA在动脉粥样硬化中通过巨噬细胞TLR8的作用机制。 | 聚焦于巨噬细胞表型及其在动脉粥样硬化病理中的作用。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | 小鼠模型中的不同动脉粥样硬化模型 |
| 651 | 2024-08-05 |
Modular derivation of diverse, regionally discrete human posterior CNS neurons enables discovery of transcriptomic patterns
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn7430
PMID:36179024
|
研究论文 | 本文建立了一种模块化的单层分化范式，用于衍生具有区域特异性的多样化人类后中枢神经系统神经元 | 创新性地使用调节D/V信号来导向不同类型的后中枢神经系统神经元，并利用单细胞RNA测序和计算管道发现区域特异性的转录标记 | 研究可能在hPSCs的来源以及特定神经元类型的功能验证方面存在局限 | 旨在通过衍生人类后中枢神经系统神经元来加深对人类神经发育和疾病的理解 | 研究对象为由人类多能干细胞衍生的后中枢神经系统神经元前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 652 | 2024-08-05 |
Dissociation and inDrops microfluidic encapsulation of human gut tissues for single-cell atlasing studies
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101570
PMID:35880121
|
研究论文 | 本文详细介绍了人肠组织解离和在inDrops微流体平台上的单细胞RNA测序的步骤 | 创新点在于使用冷激活蛋白酶进行人肠组织解离，并在inDrops平台上进行单细胞封装 | 此方法的适用性尚需进一步验证，尤其是在不同类型的肠组织中 | 研究人肠组织的单细胞RNA测序，以帮助了解细胞的多样性和功能 | 人肠组织中的单个上皮细胞 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了多种病变和炎症状态的组织样本 |
| 653 | 2024-08-05 |
Dysfunctional ERG signaling drives pulmonary vascular aging and persistent fibrosis
2022-07-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31890-4
PMID:35879310
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研究论文 | 本文探讨了老年小鼠肺内皮细胞在肺纤维化恢复或进展过程中的表观遗传和转录分析 | 识别了转录因子ETS相关基因(ERG)作为肺毛细血管稳态和修复的潜在调节因子，并揭示了其在衰老中的功能失调 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能无法完全转化到人类 | 探究血管在肺部修复和纤维化中的作用及其衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠，具体样本数量未提及 |
| 654 | 2024-08-05 |
A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours
2022-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31408-y
PMID:35853870
|
研究论文 | 本研究揭示了人类脑肿瘤中细胞类型与神经发育各个阶段的相似性 | 该研究首次建立了小鼠大脑发展过程的单细胞转录组图谱，并与人类脑肿瘤中的单细胞数据进行对比，发现肿瘤细胞表现出与胚胎放射神经前体细胞的表达特征重叠 | 本研究主要基于小鼠模型与人类细胞数据的比较，可能无法完全反映人类脑肿瘤的所有特征 | 本研究旨在阐明人类脑胶质瘤的起源及其细胞类型特征 | 研究对象为鼠类大脑发育过程中的细胞及人类胚胎和儿童胶质肿瘤的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞转录组数据 | 超过100,000个细胞，以及超过100个成人和儿童脑肿瘤样本 |
| 655 | 2024-08-05 |
Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal
2022-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31591-y
PMID:35851580
|
研究论文 | 本研究展示了orexin神经元通过间接抑制促进睡眠的神经元来维持觉醒 | 发现了一个新的前馈电路，通过这个电路，orexin和共同释放的谷氨酸作用于并抑制促睡眠的神经元 | 未明确提及 | 探讨orexin神经元在维持觉醒中的作用机制 | orexin神经元及其在觉醒和睡眠之间的调节作用 | 神经科学 | 睡眠障碍 | 体内光遗传学、体外光遗传学电路映射和单细胞转录组学 | NA | 光学数据、转录组数据 | 涉及了多个动物样本，但具体样本数量未提及 |
| 656 | 2024-08-05 |
Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104660
PMID:35845169
|
研究论文 | 该文章探讨了3型天生淋巴细胞在膀胱防御中的17型免疫中的独特贡献 | 发现组3天生淋巴细胞(ILC3s)在膀胱感染后释放IL17，并探讨了ILC3和髓系细胞之间的相互作用 | 对人类膀胱的具体机制分析还不完全 | 旨在深入理解膀胱免疫，特别是17型免疫的调控机制 | 研究对象为小鼠和人类的膀胱样本 | NA | 膀胱感染 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 研究涉及小鼠和人类样本 |
| 657 | 2024-08-05 |
Immune landscape of a genetically engineered murine model of glioma compared with human glioma
2022-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148990
PMID:35653194
|
研究论文 | 本研究比较了基因工程小鼠模型与人类胶质瘤的免疫微环境 | 本研究利用Qk/Trp53/Pten三重敲除小鼠模型，探讨了胶质瘤的免疫微环境与人类胶质瘤的比较 | 该研究主要集中在小鼠模型中，可能不能完全代表人类疾病的复杂性 | 阐明胶质瘤的肿瘤生理病理及对治疗药物的前临床评估 | 研究对象包括QPP小鼠和患者来源的胶质瘤肿瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | QPP三重敲除模型 | 免疫谱分析 | 包括QPP小鼠以及人类胶质瘤样本 |
| 658 | 2024-08-05 |
Localization of T cell clonotypes using the Visium spatial transcriptomics platform
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101391
PMID:35707680
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研究论文 | 本文介绍了一种使用Visium空间转录组平台定位T细胞克隆的新协议 | 该方法允许在组织切片中同时定位基因表达和T细胞克隆类型 | NA | 研究人类T细胞库的空间组织 | T细胞受体克隆和其在肿瘤微环境中的定位 | 数字病理 | NA | 空间转录组 | NA | NA | NA |
| 659 | 2024-08-05 |
Endothelial plasticity drives aberrant vascularization and impedes cardiac repair after myocardial infarction
2022-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00047-3
PMID:35571674
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研究论文 | 本文探讨了心肌梗死后内皮细胞的可塑性如何驱动异常血管化并妨碍心脏修复 | 提出针对获得性内皮细胞变化的靶向治疗，以正常化血管并促进心脏修复 | 目前仅在小鼠模型中进行了验证，临床适用性尚需进一步研究 | 研究心肌梗死后血管异常的机制及相关治疗策略 | 主要关注与心肌梗死相关的内皮细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 660 | 2024-08-05 |
The landscape of human tissue and cell type specific expression and co-regulation of senescence genes
2022-01-09, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00507-7
PMID:35000600
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研究论文 | 这项研究揭示了人类组织和细胞类型特异的衰老基因的共调控特征 | 系统地分析了健康人类组织中衰老基因的表达模式及其细胞类型特异性 | 对健康人类组织中的衰老细胞的普遍性理解仍然有限 | 研究衰老基因在不同类细胞中的共表达特征及其特异性 | 非疾病人类组织中的衰老基因及其相关网络 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 网络分析 | 转录组数据 | 50种人类组织 |