单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
641	2024-08-05	A human STAT3 gain-of-function variant confers T cell dysregulation without predominant Treg dysfunction in mice 2022-11-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.162695 PMID:36136607	研究论文	本研究探讨了一种人类STAT3增效变体在小鼠中引起T细胞失调的机制	首次使用载入小鼠模型研究STAT3 GOF综合症的病理机制，并发现Tregs并非疾病的主要驱动因素	研究主要基于小鼠模型，临床应用和治疗策略尚未确定	明确STAT3 GOF综合症的病理机制及其对T细胞调节的影响	开发了携带人类STAT3变体的小鼠模型并进行相关的单细胞RNA测序分析	数字病理学	自体免疫性疾病	单细胞RNA测序	knock-in小鼠模型	细胞数据	使用STAT3 GOF患者的T细胞进行单细胞RNA测序，具体样本数量未说明
642	2024-08-05	PTEN directs developmental and metabolic signaling for innate-like T cell fate and tissue homeostasis 2022-11, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-022-01011-w PMID:36302969	研究论文	本文研究了PTEN在先天样T细胞生成和组织稳态中的作用	揭示了PTEN调控先天样T细胞发育与代谢信号传导的新机制	该研究未明确探讨PTEN在其他类型T细胞的作用	阐明PTEN在T细胞发育及组织稳态中的功能	研究了PTEN缺失对界面样IL-17产生T细胞的影响	NA	人类癌症	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	PTEN缺失小鼠和PTEN杂合缺失小鼠的样本
643	2024-08-05	Cell-type identity of the avian utricle 2022-09-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111432 PMID:36170825	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序鉴定了鸡内耳前庭器官中的不同感官毛细胞亚型特征基因	首次识别了鸡前庭器官的多种感官毛细胞亚型及其对应的标记基因	研究主要集中于鸡的前庭器官，结果可能不适用于其他物种	研究鸟类前庭器官中感官毛细胞的类型及其再生能力	鸡的前庭器官中感官毛细胞和支持细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
644	2024-08-05	Single-cell transcriptome mapping identifies a local, innate B cell population driving chronic rejection after lung transplantation 2022-09-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.156648 PMID:36134664	研究论文	本研究分析了肺移植后慢性排斥反应中细胞种群变化及其基因表达模式	首次识别了驱动肺移植后慢性排斥反应的局部固有B细胞群体及其在BOS中的作用	研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况	理解B细胞在慢性排斥反应中的作用及其异质性	肺移植小鼠模型及人类BOS病例	数字病理学	肺癌	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	使用了2个不同的人类BOS队列和小鼠模型
645	2024-08-05	Genome-wide DNA hypermethylation opposes healing in patients with chronic wounds by impairing epithelial-mesenchymal transition 2022-09-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI157279 PMID:35819852	研究论文	本研究探讨了慢性创伤患者中全基因组DNA高甲基化如何通过影响上皮间充质转化阻碍创伤愈合	该研究首次通过全基因组甲基组分析揭示了慢性创伤边缘组织中高甲基化与上皮间充质转化之间的关系	研究主要集中于小鼠实验，可能存在物种间差异	研究创伤微环境中的表观遗传机制及其在慢性创伤愈合中的作用	慢性创伤患者的创伤边缘组织和小鼠模型	数字病理学	NA	RNA-Seq，亚硫酸盐测序	NA	基因组数据	慢性创伤患者创伤边缘组织4,689个差异甲基化区域
646	2024-08-05	Interleukin-17 governs hypoxic adaptation of injured epithelium 2022-07-08, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.abg9302 PMID:35709248	研究论文	本文研究了IL-17A如何调控受损上皮的缺氧适应	揭示了IL-17A通过激活HIF1α来驱动受损上皮的缺氧适应，并且说明了其在上皮愈合过程中的重要性	未说明样本大小和具体实验条件	探讨IL-17A在受损上皮的缺氧适应中的作用	受损的上皮细胞及其周围的免疫细胞	数字病理学	NA	单细胞转录组分析	NA	NA	NA
647	2024-08-05	A comparative transcriptomic analysis of glucagon-like peptide-1 receptor- and glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor-expressing cells in the hypothalamus 2022-07-01, Appetite IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.appet.2022.106022 PMID:35430298	研究论文	本文通过单细胞RNA测序比较了下丘脑中表达GIPR和GLP-1R的细胞类型和表达谱	首次提供了对下丘脑中GLP-1R和GIPR细胞的详细比较，揭示了其在能量平衡和进食行为中的作用机制	本文未探讨GLP-1R和GIPR共同激动下的具体机制	旨在深入理解下丘脑中表达胰高血糖素样肽-1和葡萄糖依赖性胰岛素促分泌肽受体的细胞种群	下丘脑中表达GIPR和GLP-1R的细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	转基因小鼠	转录组数据	共分离和测序了14,091个Glp1rEYFP+和GiprEYFP+细胞
648	2024-08-05	Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine 2022-07, Experimental hematology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002 PMID:35429619	研究论文	该文章系统性地识别了在急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者接受地西他滨治疗后诱导的全球基因组和转录组改变。	本研究揭示了地西他滨诱导的全球可逆性低甲基化及其对干扰素诱导的通路的影响，为理解其在体内的作用提供了新的视角。	临床反应与表观遗传或转录特征之间没有关联，样本大小和患者间的变异限制了捕捉较小效应所需的统计能力。	研究地西他滨对急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者的反应及其分子机制。	急性髓性白血病和骨髓增生异常综合症患者的主要骨髓样本。	数字病理学	急性髓性白血病	全基因组亚硫酸盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序	NA	基因组数据	在患者治疗过程中收集的主要骨髓样本
649	2024-08-05	Genetic loss of function of Ptbp1 does not induce glia-to-neuron conversion in retina 2022-06-14, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.110849 PMID:35705053	研究论文	这篇文章探讨了Ptbp1的遗传功能缺失是否会导致视网膜胶质细胞转化为神经元	揭示了Ptbp1的缺失不能有效诱导视网膜Mϋller胶质细胞转化为功能性神经元	仅在特定的基因突变体中研究了Ptbp1的功能，可能无法推广到其他细胞类型	研究Ptbp1在视网膜胶质细胞转化为神经元中的角色	成年视网膜Mϋller胶质细胞	数字病理学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	成年视网膜Mϋller胶质细胞的突变体
650	2024-08-05	Mapping the developing human immune system across organs 2022-06-03, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.abo0510 PMID:35549310	研究论文	该文章映射了人类免疫系统在多个器官中的发育过程	本研究通过整合单细胞RNA测序、抗原受体测序和空间转录组学，重建了发育中的人类免疫系统，揭示了免疫细胞功能的晚期获得以及单核细胞和T细胞的成熟	限制在于对发育中的免疫系统的分布网络进行的描述仍然有限	研究人类胎儿免疫系统的发育及其在不同组织中的分布	九种胎儿组织	数字病理学	NA	单细胞RNA测序、抗原受体测序、空间转录组学	NA	NA	九种胎儿组织
651	2024-08-05	Drug-Induced Hypersensitivity Syndrome (DIHS)/Drug Reaction With Eosinophilia and Systemic Symptoms (DRESS): Clinical Features and Pathogenesis 2022-05, The journal of allergy and clinical immunology. In practice DOI:10.1016/j.jaip.2022.02.004 PMID:35176506	研究论文	本研究讨论了药物诱导超敏反应综合征（DIHS）/药物反应伴嗜酸性粒细胞增多和全身症状（DRESS）的临床特征和发病机制	研究揭示了DIHS/DRESS与特定HLA等位基因的强关联，为预防和早期诊断提供了新思路	未涉及更广泛的药物反应机制和长期随访影响	探讨DIHS/DRESS的临床特征及其发病机制	讨论DIHS/DRESS与药物及HLA等位基因的关系	NA	NA	单细胞测序	NA	NA	NA
652	2024-08-05	Endothelial Phospholipase Cγ2 Improves Outcomes of Diabetic Ischemic Limb Rescue Following VEGF Therapy 2022-05-01, Diabetes IF:6.2Q1 DOI:10.2337/db21-0830 PMID:35192691	研究论文	本文研究了内皮磷脂酶Cγ2在糖尿病缺血肢体救助中的作用，并探讨了其与VEGF疗法的关系	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病皮肤中PLCγ2的下调及其对VEGF疗法的影响	华尔街文献中未提及样本的长期效果及临床适用性	旨在改善VEGF疗法对于糖尿病缺血肢体的疗效	研究对象为糖尿病小鼠模型的内皮细胞	数字病理学	糖尿病缺血	单细胞RNA测序	NA	细胞	共分析36,487个细胞样本
653	2024-08-05	Single-cell transcriptional profiling of murine conjunctival immune cells reveals distinct populations expressing homeostatic and regulatory genes 2022-04, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1038/s41385-022-00507-w PMID:35361907	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠结膜免疫细胞的不同群体	识别了新的中性粒细胞和MHCII巨噬细胞群体，发现结膜中有不同的免疫细胞群体及其基因的表达特征	NA	研究小鼠结膜区域的免疫细胞群体及其基因表达特征	结膜免疫细胞群体	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	NA
654	2024-08-05	Isolation and Profiling of Human Primary Mesenteric Arterial Endothelial Cells at the Transcriptome Level 2022-03-14, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/63307 PMID:35343966	研究论文	本文展示了一种从供体肠系膜动脉分离人类原代内皮细胞的方法，以捕捉其原生状态	开发了隔离和初步分析内皮细胞转录组的新技术	研究依赖于供体的可用性，且可能受到细胞分离过程中外部变量的影响	揭示内皮细胞在发展、健康和疾病中的角色	人类原代内皮细胞，特定于肠系膜动脉	数字病理学	NA	RNA测序	NA	RNA数据	NA
655	2024-08-05	BATF promotes group 2 innate lymphoid cell-mediated lung tissue protection during acute respiratory virus infection 2022-Jan-14, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abc9934 PMID:35030033	研究论文	本文研究了BATF在急性呼吸病毒感染中促进第2类固有淋巴细胞介导的肺组织保护的作用	识别了转录上独特的ILC2亚群，并揭示BATF在控制ILC2细胞的增殖、功能及其可塑性中的重要机制	ILC2在肺部的异质性及其在组织修复中的具体贡献机制仍不清楚	研究BATF在急性呼吸病毒感染中对ILC2的影响及其在组织修复中的作用	激活的第2类固有淋巴细胞（ILC2s）	数字病理学	肺部疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA
656	2024-08-05	High-content CRISPR screening 2022, Nature reviews. Methods primers DOI:10.1038/s43586-022-00098-7 PMID:37214176	研究论文	该文章介绍了高内容CRISPR筛选技术及其应用于生物发现的潜力	文章强调了高内容方法如何提供前所未有的细节，以直接获得生物学见解	NA	探索CRISPR筛选的基本和高级概念及其在生物医学研究和药物开发中的应用	各种基因功能的非偏见探讨，包括癌症研究、免疫学和微生物学等领域	数字生物学	癌症	CRISPR	NA	RNA测序, 空间成像	NA
657	2024-08-05	Nociceptor neurons affect cancer immunosurveillance 2022-Nov, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-022-05374-w PMID:36323780	研究论文	本研究探讨了疼痛感知神经元对癌症免疫监视的影响	首次揭示了黑色素瘤细胞与痛觉神经元之间的相互作用及其对细胞免疫反应的影响	未能全面探索不同类型肿瘤对疼痛神经元的影响	研究痛觉神经元在肿瘤免疫监视中的作用	主要研究黑色素瘤细胞和肿瘤浸润的细胞	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	小鼠模型	生物样本	研究中使用了多种小鼠和黑色素瘤患者的活检样本
658	2024-08-05	Fibroblast Heterogeneity in Healthy and Wounded Skin 2022-Jun-06, Cold Spring Harbor perspectives in biology IF:6.9Q1 DOI:10.1101/cshperspect.a041238 PMID:35667795	研究论文	本文讨论了健康和受伤皮肤中的成纤维细胞异质性。	利用单细胞测序技术，揭示了小鼠和人类皮肤中成纤维细胞的不同亚群体，并比较了其转录组特征。	未提及具体的局限性	研究成纤维细胞异质性对生理愈合及其在病理状态下的影响。	小鼠和人类的成纤维细胞。	数字病理	NA	单细胞测序	NA	细胞	使用了多种细胞群体，具体样本数量未提及
659	2024-08-05	Precision analysis of mutant U2AF1 activity reveals deployment of stress granules in myeloid malignancies 2022-03-17, Molecular cell IF:14.5Q1 DOI:10.1016/j.molcel.2022.02.025 PMID:35303483	研究论文	该文章研究了U2AF1突变在骨髓恶性肿瘤中的作用及其对应激颗粒的影响。	文章揭示了U2AF1突变带来的新3'剪接位点接触，以及这些突变如何通过影响应激颗粒成分促进癌症发展。	研究主要集中在特定突变，可能无法全面反映所有U2AF1突变的影响。	研究U2AF1突变对剪接和癌症的影响，特别是在骨髓恶性肿瘤中的作用。	研究对象包括U2AF1突变的细胞系和患者来源的骨髓增生异常综合症/急性髓性白血病细胞。	数字病理学	骨髓恶性肿瘤	交联免疫沉淀	NA	RNA-seq	涉及U2AF1突变细胞系和患者来源的细胞
660	2024-08-05	Delineating the transcriptional landscape and clonal diversity of virus-specific CD4+ T cells during chronic viral infection 2022-10-18, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.80079 PMID:36255051	研究论文	本文研究了慢性病毒感染过程中病毒特异性CD4 T细胞的转录景观和克隆多样性	识别了在感染高峰期形成的Th1、Tfh和记忆样T细胞亚群中多个转录明显不同的状态，包括一个新的具有细胞杀伤特征的Slamf7亚群	尚未充分研究细胞内因子如TCR使用对CD4 T细胞命运承诺的影响	探究慢性病毒感染中CD4 T细胞的转录特征及其克隆多样性	病毒特异性CD4 T细胞，孤立于慢性淋巴细胞脉络膜脑膜炎病毒感染的小鼠	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）	NA	NA	NA