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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-09-01 |
Joint dimension reduction and clustering analysis of single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics data
2022-07-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac219
PMID:35349708
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研究论文 | 本文开发了一种名为DR-SC的计算方法，能够在统一框架内同时进行降维和（空间）聚类分析 | DR-SC方法通过联合分析，产生准确的空间聚类结果并有效提取生物学上有意义的低维特征 | NA | 开发一种新的计算方法，以同时进行单细胞RNA-seq和空间转录组数据的空间聚类和降维分析 | 单细胞RNA-seq和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场模型 | 转录组数据 | 适用于大规模样本 | NA | NA | NA | NA |
| 642 | 2024-09-01 |
PU.1 and MYC transcriptional network defines synergistic drug responses to KIT and LSD1 inhibition in acute myeloid leukemia
2022-07, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01594-1
PMID:35590033
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研究论文 | 本文研究了急性髓系白血病（AML）中KIT和LSD1抑制剂联合治疗的协同效应 | 首次报道了KIT和LSD1联合抑制在KIT突变AML细胞系和患者样本中产生协同细胞死亡的效果 | 需要临床试验来评估KIT和LSD1抑制在患者中的实际疗效 | 探讨KIT和LSD1联合抑制在急性髓系白血病治疗中的协同作用 | KIT突变的急性髓系白血病细胞系和患者样本 | NA | 急性髓系白血病 | scRNA-seq, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | 细胞 | KIT突变的AML细胞系和患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 643 | 2024-09-01 |
Lymph node fibroblastic reticular cells preserve a tolerogenic niche in allograft transplantation through laminin α4
2022-07-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156994
PMID:35775481
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研究论文 | 研究探讨了淋巴结（LN）成纤维网状细胞（FRCs）通过产生层粘连蛋白α4（Lama4）在同种异体移植中维持耐受性微环境的作用 | 首次揭示了FRC-Lama4在维持淋巴结耐受性微环境中的关键作用，并提出其作为免疫工程治疗的新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，未来需要进一步在人类中验证其效果 | 探究FRC-Lama4在同种异体移植中维持耐受性微环境的作用 | 淋巴结成纤维网状细胞（FRCs）和层粘连蛋白α4（Lama4） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 使用FRC-Lama4条件性敲除Pdgfrb-Cre-/- × Lama4fl/fl小鼠进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 644 | 2024-09-01 |
How genetic risk contributes to autoimmune liver disease
2022-07, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-022-00950-8
PMID:35650446
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研究论文 | 本文通过全基因组关联研究（GWAS）和全基因组元分析（GWMA）探讨了自身免疫性肝病（AILDs）的遗传风险，并分析了遗传风险变异对肝脏细胞及其免疫微环境的影响 | 本文利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验和基因组范围内的比较分析，为理解遗传风险变异在肝脏驻留免疫细胞和肝脏细胞亚群中的作用提供了新的视角 | 基于当前全基因组数据的多元遗传风险评分（PRSs）在预测个体疾病风险方面的潜力有限 | 探讨遗传风险如何影响自身免疫性肝病的发病机制 | 自身免疫性肝炎（AIH）、原发性胆汁性胆管炎（PBC）和原发性硬化性胆管炎（PSC） | 遗传学 | 自身免疫性疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、全基因组元分析（GWMA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 约100个易感位点 | NA | NA | NA | NA |
| 645 | 2024-09-01 |
Microglia Phenotypes in Aging and Neurodegenerative Diseases
2022-06-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11132091
PMID:35805174
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综述 | 本文综述了在健康、衰老和神经退行性疾病中微胶质细胞表型和炎症反应的当前研究 | 强调了微胶质细胞在急性和慢性疾病中的异质性表型反应，并探讨了潜在的治疗靶点 | NA | 全面概述微胶质细胞在不同病理状态下的表型和炎症反应 | 微胶质细胞在健康、衰老和神经退行性疾病中的表型和炎症反应 | NA | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 646 | 2024-09-01 |
Bookend: precise transcript reconstruction with end-guided assembly
2022-06-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02700-3
PMID:35768836
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研究论文 | 开发了Bookend软件包，用于结合不同RNA-seq技术数据的转录本组装，特别关注RNA的5'和3'端识别与利用 | Bookend通过利用端标记读取数据，显著提高了单细胞中转录本组装的精确度，并展示了跨短读、长读和端捕获RNA-seq数据集的混合组装能力 | NA | 旨在提高转录本组装的精确度，并探索不同RNA-seq技术数据的整合应用 | RNA-seq数据中的转录本组装，特别是RNA的5'和3'端识别 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 序列数据 | 涉及拟南芥和单个小鼠胚胎干细胞的RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 647 | 2024-09-01 |
TAS-Seq is a robust and sensitive amplification method for bead-based scRNA-seq
2022-06-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03536-0
PMID:35760847
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于终止子、末端转移酶和纳米孔/珠基平台的单细胞RNA测序方法TAS-Seq，该方法在鼠和人类肺样本中显示出比10X Chromium v2和Smart-seq2更高的基因检测灵敏度和更稳健的细胞间相互作用及生长因子/白细胞介素表达检测 | TAS-Seq方法对末端转移酶反应的变化具有高度耐受性，提高了单细胞RNA测序数据的准确性和细胞组成的分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以提高细胞组成的准确性和细胞间相互作用的检测 | 鼠和人类肺样本的单细胞RNA测序 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠和人类肺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 648 | 2024-09-01 |
The immune cell atlas of human neuroblastoma
2022-06-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100657
PMID:35688160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学技术，分析了19个人类神经母细胞瘤样本的免疫细胞组成，并与正常胎儿肾上腺数据进行比较 | 本研究揭示了神经母细胞瘤中27种免疫细胞亚型，并发现与成人癌症和先前研究不同，神经母细胞瘤中炎症性单核细胞状态增加，而T细胞的细胞毒性和耗竭评分以及Treg活性没有差异 | NA | 旨在理解人类神经母细胞瘤的完整免疫细胞组成，为开发免疫治疗提供依据 | 人类神经母细胞瘤的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19个人类神经母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 649 | 2024-09-01 |
Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived treatment of severe pulmonary arterial hypertension
2022-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00083-z
PMID:39195868
|
研究论文 | 本文报道了人脐带间充质干细胞（HUCMSC）衍生的治疗方法在肺动脉高压（PAH）中的应用 | 首次使用HUCMSC的条件培养基（CM）进行连续血管内输注治疗PAH，并展示了其显著的临床和血流动力学改善效果 | 需要进一步的前瞻性临床研究来确认和探索HUCMSC衍生治疗对PAH的益处 | 探索HUCMSC衍生治疗在PAH中的应用及其潜在机制 | HUCMSC的条件培养基（CM）及其在PAH治疗中的效果 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及三个人脐带间充质干细胞（HUCMSC）和两个人脐带静脉内皮细胞（HUVEC）的控制样本 | NA | NA | NA | NA |
| 650 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing in silent corticotroph tumors confirms impaired POMC processing and provides new insights into their invasive behavior
2022-May-12, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1530/EJE-21-1183
PMID:35521707
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了静默性和活性皮质垂体瘤的细胞组成和转录组，揭示了POMC加工缺陷及其侵袭行为的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术深入研究了静默性皮质垂体瘤中POMC加工缺陷和侵袭行为的分子机制 | NA | 探究静默性皮质垂体瘤中POMC加工缺陷和侵袭行为的分子机制 | 静默性和活性皮质垂体瘤的细胞组成和转录组 | 数字病理学 | 垂体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 651 | 2024-09-01 |
Spatial mapping of protein composition and tissue organization: a primer for multiplexed antibody-based imaging
2022-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01316-y
PMID:34811556
|
perspective | 本文探讨了多重抗体成像技术在组织蛋白质组成和结构组织空间映射中的应用 | 介绍了多重蛋白成像方法的最新进展，这些方法能够提供复杂组织的空间和功能详细图谱 | 目前的方法主要依赖于单细胞测序，缺乏理解细胞间通信和相关结构组织所需的空间背景 | 旨在为多重抗体成像技术提供必要的资源和关键考虑，以促进其广泛应用和数据标准化 | 组织和器官中的细胞类型及其在生理功能中的协同作用 | NA | NA | 多重蛋白成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 652 | 2024-09-01 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Changes of Tumor Immune Microenvironment in Oral Squamous Cell Carcinoma After Chemotherapy
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.914120
PMID:35784460
|
research paper | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤免疫微环境的变化 | 本研究首次在单细胞转录组水平揭示了化疗后口腔鳞状细胞癌中肿瘤微环境的特征 | NA | 研究化疗对口腔鳞状细胞癌中肿瘤细胞和肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌化疗后的肿瘤微环境 | digital pathology | 口腔癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 653 | 2024-09-01 |
Applications and Achievements of Single-Cell Sequencing in Gastrointestinal Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.905571
PMID:35785171
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用及其最新进展 | 单细胞测序技术提供了比大规模测序技术更准确的数据，能够解析细胞和分子层面的单细胞分辨率特征 | NA | 探讨单细胞测序技术在胃肠癌研究中的应用 | 胃肠癌的来源、异质性、微环境信息以及诊断和治疗方法 | 数字病理学 | 胃肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 654 | 2024-09-01 |
Progress and Prospect of Immunotherapy for Triple-Negative Breast Cancer
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.919072
PMID:35795050
|
综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）免疫治疗的进展和前景 | 介绍了基于免疫分子疗法、溶瘤病毒疗法和过继免疫细胞转移疗法等多种新型免疫治疗方法 | 目前免疫治疗在乳腺癌患者中的总体反应不强，且存在一系列挑战和机遇 | 探讨三阴性乳腺癌免疫治疗的新发现、临床试验结果及未来发展方向 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其免疫治疗策略 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | 免疫检查点抑制剂（ICIs）、单细胞测序、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2024-08-31 |
Connecting past and present: single-cell lineage tracing
2022-11, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-022-00913-7
PMID:35441356
|
review | 本文综述了单细胞谱系追踪技术的发展，主要特点，应用以及技术考虑和局限性 | 利用克隆分析和单细胞RNA测序技术，单细胞谱系追踪提供了新的机会来探究细胞状态和谱系历史 | 尽管上述策略已在动物发育和干细胞研究中得到证明，但实施这些方法仍需谨慎和努力 | 描绘细胞的历史、状态和命运是现代生物学的基本目标 | 单细胞的谱系追踪 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 656 | 2024-08-31 |
Single-cell transcriptomics reveals conserved cell identities and fibrogenic phenotypes in zebrafish and human liver
2022-07, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1930
PMID:35315595
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，比较了斑马鱼和人类肝脏中的细胞类型和纤维化表型，揭示了两者之间的高度保守性。 | 首次建立了成年斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱，并发现了斑马鱼肝星状细胞的新型保守标记物colec11。 | NA | 旨在通过单细胞转录组测序技术，评估成年斑马鱼肝脏作为研究肝纤维化模型的有效性。 | 成年斑马鱼和人类肝脏的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 657 | 2024-08-31 |
An introduction to spatial transcriptomics for biomedical research
2022-06-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01075-1
PMID:35761361
|
review | 本文介绍了空间转录组学的方法，包括记录杂交mRNA分子位置、细胞位置成像以及使用空间阵列mRNA探针等，并讨论了组织保存对平台选择的影响以及生物信息学方法在分析空间转录组数据中的应用 | 介绍了多种商业可用的空间转录组学平台，并讨论了它们在发现筛选和假设检验中的适用性 | NA | 旨在为希望在其生物医学研究中使用空间转录组学的研究人员提供入门级指导 | 空间转录组学方法及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因转录数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 658 | 2024-08-31 |
scDART: integrating unmatched scRNA-seq and scATAC-seq data and learning cross-modality relationship simultaneously
2022-06-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02706-x
PMID:35761403
|
研究论文 | 提出了一种名为scDART的深度学习框架，用于整合不匹配的scRNA-seq和scATAC-seq数据，并同时学习跨模态关系 | scDART框架能够保留连续细胞群体中的细胞轨迹，并可应用于整合数据上的轨迹推断 | NA | 整合不同批次的scRNA-seq和scATAC-seq数据，并学习跨模态关系 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习框架 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 659 | 2024-08-31 |
Pseudomonas aeruginosa: pathogenesis, virulence factors, antibiotic resistance, interaction with host, technology advances and emerging therapeutics
2022-06-25, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01056-1
PMID:35752612
|
综述 | 本文综述了铜绿假单胞菌的致病性、毒力因子、抗生素抗性、与宿主的相互作用以及技术进步和新兴疗法 | 介绍了生物信息学、代谢组学、单细胞RNA测序、纳米颗粒、药物筛选和噬菌体疗法等技术在铜绿假单胞菌研究中的应用 | 仍需探索铜绿假单胞菌与宿主免疫反应之间的相互作用，包括已知或未注释的细菌毒力因子的耐药机制以及哺乳动物细胞信号传导途径 | 全面回顾铜绿假单胞菌的生物物理特性、行为、毒力因子、侵入调节因子以及宿主防御模式，指出未来研究的新方向，并为设计新型或替代疗法提供依据 | 铜绿假单胞菌的致病性、毒力因子、抗生素抗性、与宿主的相互作用以及新兴疗法 | NA | 囊性纤维化、烧伤伤口、免疫缺陷、慢性阻塞性肺疾病、癌症、严重感染（如COVID-19） | 生物信息学、代谢组学、单细胞RNA测序、纳米颗粒、药物筛选、噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2024-08-31 |
Forest Fire Clustering for single-cell sequencing combines iterative label propagation with parallelized Monte Carlo simulations
2022-06-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31107-8
PMID:35725981
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research paper | 本文介绍了一种名为森林火灾聚类的高效且可解释的单细胞测序数据细胞类型发现方法 | 森林火灾聚类方法计算每个细胞的非参数后验概率，评估标签置信度并计算“标签熵”，突出沿发育轨迹的转变，并能在在线学习环境中进行稳健的归纳推理 | NA | 开发一种新的单细胞测序数据聚类方法，用于细胞类型发现 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 森林火灾聚类 | 单细胞数据 | 数百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |