单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Features of Heterogeneity in the Murine Retinal Pigment Epithelium
2022-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810419
PMID:36142331
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜色素上皮细胞的分子异质性特征 | 首次通过单细胞RNA测序识别出视网膜色素上皮细胞的六种不同细胞群体，并探讨其发育过程中的代谢网络变化 | 只在两只年轻成年小鼠中进行了研究，样本量有限，可能无法完全代表其他小鼠或不同生理状态下的情况 | 研究视网膜色素上皮细胞的异质性及其在眼部发育和功能中的作用 | 主要研究小鼠视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2667和2846个视网膜色素上皮细胞 |
| 622 | 2024-08-05 |
Precision analysis of mutant U2AF1 activity reveals deployment of stress granules in myeloid malignancies
2022-03-17, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2022.02.025
PMID:35303483
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研究论文 | 该文章研究了U2AF1突变在骨髓恶性肿瘤中的作用及其对应激颗粒的影响。 | 文章揭示了U2AF1突变带来的新3'剪接位点接触，以及这些突变如何通过影响应激颗粒成分促进癌症发展。 | 研究主要集中在特定突变，可能无法全面反映所有U2AF1突变的影响。 | 研究U2AF1突变对剪接和癌症的影响，特别是在骨髓恶性肿瘤中的作用。 | 研究对象包括U2AF1突变的细胞系和患者来源的骨髓增生异常综合症/急性髓性白血病细胞。 | 数字病理学 | 骨髓恶性肿瘤 | 交联免疫沉淀 | NA | RNA-seq | 涉及U2AF1突变细胞系和患者来源的细胞 |
| 623 | 2024-08-05 |
Delineating the transcriptional landscape and clonal diversity of virus-specific CD4+ T cells during chronic viral infection
2022-10-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80079
PMID:36255051
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研究论文 | 本文研究了慢性病毒感染过程中病毒特异性CD4 T细胞的转录景观和克隆多样性 | 识别了在感染高峰期形成的Th1、Tfh和记忆样T细胞亚群中多个转录明显不同的状态，包括一个新的具有细胞杀伤特征的Slamf7亚群 | 尚未充分研究细胞内因子如TCR使用对CD4 T细胞命运承诺的影响 | 探究慢性病毒感染中CD4 T细胞的转录特征及其克隆多样性 | 病毒特异性CD4 T细胞，孤立于慢性淋巴细胞脉络膜脑膜炎病毒感染的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | NA | NA |
| 624 | 2024-08-05 |
Metabolic transitions define spermatogonial stem cell maturation
2022-08-25, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deac157
PMID:35856882
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研究论文 | 本研究表明人类青春前的生精细胞经历了从氧化磷酸化到厌氧代谢的显著代谢转变。 | 首次揭示了青春期前人类生精干细胞的代谢特征及其向成人代谢转变的机制。 | 人类青春前组织样本稀缺，每个年龄组样本数量有限，功能状态仅通过基因富集分析给出指示。 | 探讨生精细胞在青春前发展期间是否经历代谢改变。 | 研究对象包括人类青春前的生精细胞、鼠类和猪的生精细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 总共分析了来自3只幼鼠和2只成年鼠的生精细胞，以及不同年龄的人类生精细胞 |
| 625 | 2024-08-05 |
Comprehensive Characterization of the Multiple Myeloma Immune Microenvironment Using Integrated scRNA-seq, CyTOF, and CITE-seq Analysis
2022-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0022
PMID:36969740
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研究论文 | 本文对多发性骨髓瘤的免疫微环境进行了全面表征 | 结合使用了单细胞RNA测序、质谱细胞术和CITE-seq分析，揭示了不同检测方法之间的一致性和差异性 | 缺乏对更多样本的分析，且结果需要在更大规模的项目中进一步验证 | 理解多发性骨髓瘤骨髓样本中免疫细胞的特征 | 来自18名患者的多发性骨髓瘤骨髓样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, CyTOF, CITE-seq | NA | RNA | 18名患者的骨髓样本 |
| 626 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analyses show that long non-coding RNAs are conspicuously expressed in Schistosoma mansoni gamete and tegument progenitor cell populations
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.924877
PMID:36204320
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研究论文 | 该研究分析了Schistosoma mansoni的单细胞RNA测序数据，发现长非编码RNA在生殖细胞和外表细胞群体中显著表达 | 首次揭示了Schistosoma mansoni中长非编码RNA的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要依赖公开的数据，可能存在数据质量和完整性的问题 | 探索Schistosoma mansoni中长非编码RNA的表达模式及其潜在的治疗靶点 | Schistosoma mansoni的成人细胞类型及其长非编码RNA表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 8023个长非编码RNA |
| 627 | 2024-08-05 |
Zebrafish neuromesodermal progenitors undergo a critical state transition in vivo
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105216
PMID:36274939
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研究论文 | 本文评估了斑马鱼神经中胚层祖细胞在脊肠和旁轴中胚层分化前的转变状态模型 | 本研究通过构建复合基因表达图谱，展示了细胞群体异质性在关键时间点的变化，为转变状态模型提供了支持 | 研究仅集中于斑马鱼，可能无法直接推广到其他物种 | 探讨神经中胚层祖细胞的基因表达变化与分化之间的关系 | 斑马鱼神经中胚层祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了一个18ss的单细胞RNA测序数据集 |
| 628 | 2024-08-05 |
What are housekeeping genes?
2022-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010295
PMID:35830477
|
研究论文 | 本文探讨了家务基因的定义及其生物学和进化特征 | 提出了一个定量和实验支持的家务基因定义，并比较了不同物种间的基因稳定性和必要性 | 目前的实验支持有限，需更多研究验证基因的稳定表达与必要性之间的关系 | 旨在优化家务基因的定义并探讨其在不同生物体中的功能 | 分析人类和其他10种动物物种的家务基因数据集 | NA | NA | 基因组规模功能基因组筛选、批量及单细胞测序技术 | NA | 基因数据 | 来自多个数据集的人类基因及10种动物的基因列表 |
| 629 | 2024-08-05 |
Transcriptional and functional analyses of neoantigen-specific CD4 T cells during a profound response to anti-PD-L1 in metastatic Merkel cell carcinoma
2022-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005328
PMID:36252564
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研究论文 | 本研究探讨了在转移性梅克尔细胞癌中对抗PD-L1的显著反应期间，特异性针对新抗原的CD4 T细胞的转录和功能分析 | 这是首次报告梅克尔细胞癌中针对新抗原的特异性T细胞反应的研究 | 研究仅关注一名病毒阴性梅克尔细胞癌患者，样本量较小 | 本研究的目的在于分析特异性针对新抗原的CD4 T细胞的功能和转录特征 | 研究对象为一位中年女性梅克尔细胞癌患者及其血液中的T细胞 | 数字病理学 | 梅克尔细胞癌 | 全外显子测序（WES）、ELISpot、流式细胞术和单细胞RNA序列分析 | NA | 血液样本 | 1名患者 |
| 630 | 2024-08-05 |
Multiplex immunofluorescence-guided laser capture microdissection for spatial transcriptomics of metastatic melanoma tissues
2022-12-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101698
PMID:36149794
|
研究论文 | 本文描述了一种优化和简化的多重免疫荧光引导的激光捕获显微切割流程 | 这一流程能够基于细胞表型和组织定位收集个体细胞以进行转录组分析 | 该方法主要描述于黑色素瘤组织的应用，尽管也适用于其他类型的组织 | 研究该流程在转录组分析中的应用 | 研究对象包括CD3+ T细胞、CD14+单核细胞/巨噬细胞和黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代RNA测序 | NA | 转录组 | 非解离的转移性黑色素瘤组织中的细胞 |
| 631 | 2024-08-05 |
Imputation of Human Primary Osteoblast Single Cell RNA-Seq Data Identified Three Novel Osteoblastic Subtypes
2022-10-31, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2710295
PMID:36336853
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研究论文 | 该文章主要探讨了人类原代成骨细胞的单细胞RNA测序数据，识别出了三种新的成骨细胞亚型 | 文章创新点在于通过impute方法发现了三种新的成骨细胞亚型，包括成骨细胞祖细胞和两种未确定的成骨细胞 | 研究可能受到样本类型和数量的限制，导致结果的普遍性尚待验证 | 研究的目的是深入了解人类成骨细胞的异质性及其潜在生物功能 | 研究对象为新鲜分离的人类成骨细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 新鲜分离的人类成骨细胞样本数据集 |
| 632 | 2024-08-05 |
SARS-CoV-2 infection of human pluripotent stem cell-derived liver organoids reveals potential mechanisms of liver pathology
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105146
PMID:36128218
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研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2感染对人类诱导多能干细胞衍生肝脏类器官的影响以及潜在的肝脏病理机制 | 利用单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2感染肝脏细胞及未感染旁观细胞的转录组变化 | NA | 研究SARS-CoV-2感染对肝脏的影响及其潜在机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 肝脏类器官 | 转录组数据 | NA |
| 633 | 2024-08-05 |
Multi-apical polarity of alveolar stem cells and their dynamics during lung development and regeneration
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105114
PMID:36185377
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研究论文 | 本研究探讨了肺泡干细胞的多顶端极性及其在肺发育和再生中的动态变化 | 首次揭示了肺泡类型2上皮细胞（AT2s）可以具有多个顶端极性结构 | 未深入探讨多顶端极性的具体机制与影响因素 | 了解AT2s在肺发育与再生过程中的动态变化和功能 | 主要研究肺泡类型2上皮细胞（AT2s） | 数字病理学 | NA | 厚组织成像和电子显微镜 | NA | 细胞转录组数据 | NA |
| 634 | 2024-08-05 |
FXYD3 facilitates Na+ and liquid absorption across human airway epithelia by increasing the transport capacity of the Na/K ATPase
2022-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00047.2022
PMID:35993520
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研究论文 | 本研究探讨了FXYD3在增加人类气道上皮Na+和液体吸收中的作用 | 首次确定了FXYD3作为Na/K ATPase的γ亚基在气道上皮细胞中的定位和功能 | 研究仅限于单细胞RNA测序和体外实验，未在体内验证FXYD3的作用 | 探讨FXYD3在气道上皮细胞中对Na+和液体吸收的影响 | 人类气道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫组化 | NA | 细胞数据 | NA |
| 635 | 2024-08-05 |
Hippo signaling cofactor, WWTR1, at the crossroads of human trophoblast progenitor self-renewal and differentiation
2022-09-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204069119
PMID:36037374
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研究论文 | 本文探讨了Hippo信号共因子WWTR1在人类滋养层前体自我更新和分化过程中的关键作用 | 揭示了WWTR1作为人类滋养层命运选择的主调控因子，并明确了其在自我更新和分化中的双重作用 | 对WWTR1在不同妊娠阶段的完全作用及其调控机制仍需进一步研究 | 揭示人类滋养层前体的自我更新与分化之间的分子机制 | 人类滋养层干细胞、初级滋养细胞和人类胎盘样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 多个胎盘样本，包括病理妊娠的胎盘 |
| 636 | 2024-08-05 |
Neuropeptides and small-molecule amine transmitters: cooperative signaling in the nervous system
2022-Aug-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04451-7
PMID:35997826
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综述 | 本文回顾了神经肽和小分子胺类传递物质在神经系统中的协同信号传递 | 提出了神经肽如何与小分子胺类传递物质共同作用于神经传递的具体机制 | 对神经肽和小分子胺类传递物质的部分机制仍未完全阐明 | 探讨神经肽与小分子胺类传递物质在神经传递中的作用 | 关于神经肽及其受体的数据，以及它们在神经元释放后的作用 | 神经生物学 | NA | 药理学和遗传学功能丧失与获得实验 | NA | 数据 | NA |
| 637 | 2024-08-05 |
Asynchronous excitatory neuron development in an isogenic cortical spheroid model of Down syndrome
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.932384
PMID:36161168
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研究论文 | 本研究利用同源的诱导多能干细胞（iPSC）系生成了模型唐氏综合症（DS）对大脑发育影响的皮层球体 | 本研究揭示了三体21染色体对兴奋性神经元发育的特定影响，并识别潜在驱动三体和常态兴奋性神经元发育非同步性的候选基因 | 尚未确定分子过程如何详细影响唐氏综合症中的智力障碍 | 研究唐氏综合症中神经发育变化的机制基础 | 利用同源的诱导多能干细胞系生成的皮层球体 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 皮层球体模型 | 转录组数据 | 使用了一对同源的诱导多能干细胞系（trisomic 和 euploid） |
| 638 | 2024-08-05 |
Defining mast cell differentiation and heterogeneity through single-cell transcriptomics analysis
2022-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.08.011
PMID:36205448
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research paper | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了肥大细胞的分化及其异质性 | 揭示了肥大细胞的多样性超出了传统使用的蛋白酶差异，并强调了微环境信号对肥大细胞发展的影响 | 未提及具体的样本数据或实验限制 | 探讨肥大细胞前体的分化特征及健康与疾病中的肥大细胞异质性 | 肥大细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 639 | 2024-08-05 |
Transcriptional profiling of mouse projection neurons with VECTORseq
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101625
PMID:36035788
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研究论文 | 本文介绍了一种新技术VECTORseq，用于小鼠投射神经元的转录组特征分析 | 开发了VECTORseq技术，可以同时在单个实验中标记多个神经元群体 | 未提及具体的研究限制 | 提高投射神经元转录组特征分析的通量 | 小鼠脑中的不同投射神经元 | 数字病理学 | NA | 病毒条形码传递 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 640 | 2024-08-05 |
Transcriptional responses to injury of regenerative lung alveolar epithelium
2022-Aug-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104843
PMID:35996586
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研究论文 | 这篇文章探讨了转录因子在肺泡上皮细胞再生和增殖中的作用 | 首次揭示了ATF3和THRA转录因子在肺泡上皮细胞增殖中的关键作用 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生物学过程 | 了解肺泡上皮再生过程中AT2细胞增殖的机制 | 小鼠模型中的AT2细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用Ki67基因敲入小鼠模型进行分析 |