单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-05 |
A transcriptomics-guided drug target discovery strategy identifies receptor ligands for lung regeneration
2022-03-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj9949
PMID:35319981
|
研究论文 | 本研究提出了一种转录组指导的药物靶标发现策略，识别了用于肺部再生的受体配体 | 开发了一种新方法来识别针对慢性阻塞性肺病(COPD)的再生药物靶标，强调了EP和IP前列腺素受体配体的疗效 | 研究可能未充分考虑其他可能影响慢性病修复机制的因素 | 探索治疗慢性疾病中的组织修复缺陷的新药物靶点 | 烟草相关的慢性阻塞性肺病患者及其小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 结合慢性阻塞性肺病的临床样本和吸烟小鼠模型 |
| 622 | 2024-08-05 |
Cell-by-Cell: Unlocking Lung Cancer Pathogenesis
2022-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14143424
PMID:35884485
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review | 本综述文章总结了单细胞分析在非小细胞肺癌研究中的应用，尤其是肺腺癌亚型。 | 利用单细胞测序技术，文章揭示了肿瘤起源细胞和肿瘤免疫动态的新知识，重写了谱系可塑性和肿瘤内部异质性的机制细节。 | 该综述主要集中于肺腺癌亚型，可能未涵盖其他类型的肺癌及其相应的病理机制。 | 旨在总结肺腺癌发病机制及其肿瘤微环境的互动。 | 研究对象为不同阶段的肺腺癌肿瘤组织及相关动物模型。 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括不同阶段的肺腺癌样本及相关动物模型 |
| 623 | 2024-08-05 |
secDrug: a pipeline to discover novel drug combinations to kill drug-resistant multiple myeloma cells using a greedy set cover algorithm and single-cell multi-omics
2022-03-09, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-022-00636-2
PMID:35264575
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研究论文 | 本文介绍了一种计算管道，用于发现对抗耐药性多发性骨髓瘤细胞的新药组合 | 提出了一种结合药理基因组数据的优化算法来预测新药组合，并开发了可普遍应用的R软件包 | 实验主要在体外进行，临床应用效果尚未验证 | 研究针对耐药性多发性骨髓瘤的新药组合的发现 | 主要研究耐药性多发性骨髓瘤细胞及其药物组合 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，CyTOF单细胞蛋白组学，CRISPR基因编辑 | 贪婪集合覆盖算法 | 基因组数据，转录组数据，细胞系数据 | 使用了多个代表耐药性的人的多发性骨髓瘤细胞系 |
| 624 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
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研究论文 | 本研究揭示了在PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 通过单细胞测序与工程细胞结合，本研究首次揭示了PRC2缺失导致的肿瘤细胞转录程序改变与干细胞特征的关系 | 本研究未涉及PRC2缺失在其他类型肿瘤中的影响 | 阐明PRC2缺失的肿瘤发生机制 | 针对PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤细胞进行研究 | 数字病理学 | 恶性周围神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 625 | 2024-08-05 |
Systematic pan-cancer analysis identifies APOC1 as an immunological biomarker which regulates macrophage polarization and promotes tumor metastasis
2022-09, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106376
PMID:35914680
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研究论文 | 本文通过系统的全癌症分析发现APOC1是一个免疫生物标志物，调节巨噬细胞极化并促进肿瘤转移 | 阐明了APOC1在肿瘤免疫中的作用及其在肾细胞癌中异常表达的机制 | 研究主要集中于肾细胞癌，缺乏对其他癌种中APOC1作用的深入探讨 | 探讨APOC1在肿瘤免疫中的角色及其对巨噬细胞极化的影响 | APOC1在不同癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织和血清样本 | 涉及多种癌症的系统分析和肾细胞癌患者的样本 |
| 626 | 2024-08-05 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
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研究论文 | 本研究构建了CD4 T细胞的参考图，以描述急性和慢性病毒感染期间亚型特异性的适应性变化 | 首次提供了针对病毒的CD4 T细胞转录状态适应性的深入理解，并建立了新的计算资源用于CD4 T细胞分析 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类病毒感染的情况 | 阐明CD4 T细胞在急性和慢性病毒感染中的转录状态适应 | 小鼠模型中的CD4 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 多个个体的病毒特异性CD4 T细胞 |
| 627 | 2024-08-05 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序探讨了局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞中的炎症特征 | 首次利用尿液单细胞RNA测序识别出与局灶性节段性肾小管硬化症相关的单核细胞亚群和足细胞表达特征 | 研究仅基于12名FSGS患者的尿液样本，样本量可能不足以绘制全貌 | 探究局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞的疾病相关分子特征 | 分析来自12名局灶性节段性肾小管硬化症患者的尿液样本 | 数字病理 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液细胞 | 收集了来自12名FSGS患者的17个尿液样本，捕获为23个尿液细胞样本 |
| 628 | 2024-08-05 |
AhR Activation Leads to Attenuation of Murine Autoimmune Hepatitis: Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Unique Immune Cell Phenotypes and Gene Expression Changes in the Liver
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.899609
PMID:35720411
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研究论文 | 本研究探讨了芳香烃受体（AhR）激活如何通过单细胞RNA测序分析减少小鼠自身免疫性肝炎中的免疫细胞炎症。 | 本文创新性地揭示了AhR激活导致小鼠自身免疫性肝炎中免疫细胞表型和基因表达的变化。 | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全反映人类的复杂免疫反应。 | 探讨AhR激活在小鼠自身免疫性肝炎中的作用机制。 | 小鼠模型及其肝脏中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 629 | 2024-08-05 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
|
研究论文 | 这篇文章研究了肝细胞癌患者的肿瘤微环境如何影响固有淋巴细胞（ILCs）。 | 文章揭示了肿瘤微环境中的细胞因子如何影响ILCs的组成和功能，并与患者的生存预后相关。 | 该研究主要基于肝细胞癌患者的样本，可能无法普遍适用于其他类型的肿瘤。 | 探讨肝细胞癌中局部细胞因子环境如何影响ILCs的变化。 | 研究的对象为来自48名肝细胞癌患者的ILCs，特别是肿瘤组织和非肿瘤组织中的ILCs。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 48名肝细胞癌患者 |
| 630 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Unveils the Role of the Tumor Immune Microenvironment and Notch Signaling in Dormant Minimal Residual Disease
2022-Mar-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-1230
PMID:34965936
|
研究论文 | 该研究揭示了肿瘤免疫微环境和Notch信号通路在休眠微小残留疾病中的角色 | 首次利用新的免疫竞争转基因模型研究休眠微小残留疾病，并发现Jagged-1/Notch信号通路在肿瘤发生中的多重调控作用 | 尚未完全阐明肿瘤休眠的复杂生态系统及其影响因素 | 探讨休眠的分子通路和微环境的作用，提供新的策略延长癌症休眠 | 休眠微小残留疾病及其相关的肿瘤细胞和免疫细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因模型 | RNA序列数据 | NA |
| 631 | 2024-08-05 |
Deconstructing cold-induced brown adipocyte neogenesis in mice
2022-07-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80167
PMID:35848799
|
研究论文 | 研究表明寒冷暴露会诱导小鼠经典肩胛间褐色脂肪组织中的新生现象 | 发现瘦素细胞不仅受β1-肾上腺素受体的调控，还受到成熟褐色脂肪细胞的信号的间接触发 | 目前尚不清楚招募免疫细胞的具体表型 | 探究寒冷诱导的褐色脂肪细胞新生机制 | 小鼠的褐色脂肪细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 生物组织 | 小鼠，具体样本数量未提及 |
| 632 | 2024-08-05 |
Hypoxic, glycolytic metabolism is a vulnerability of B-acute lymphoblastic leukemia-initiating cells
2022-04-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110752
PMID:35476984
|
研究论文 | 这篇文章探讨了高风险B-急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中白血病起始细胞（LICs）的特性及其代谢弱点 | 发现抑制缺氧和糖酵解对MLL-r B-ALL LICs有害，提供了治疗靶向的新思路 | 对高风险B-ALL中LICs的特性理解仍不完全 | 研究高风险B-急性淋巴细胞白血病中的白血病起始细胞及其代谢特性 | MLL重排的B-ALL中的白血病起始细胞 | 数字病理学 | 骨髓瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 633 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a paracrine interaction that may drive oncogenic notch signaling in human adenoid cystic carcinoma
2022-11-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111743
PMID:36450256
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析人类腮腺腺样囊性癌中的肿瘤细胞间相互作用 | 首次揭示了腺样囊性癌中肿瘤细胞表达的异质性及其在Notch信号通路中的潜在作用 | 研究仍缺乏对人类肿瘤中MYB和Notch信号的完整体内描述 | 探索腺样囊性癌的病理生理学及其细胞信号传递机制 | 腺样囊性癌的原发肿瘤及其匹配的局部复发样本 | 数字病理学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含有腺样囊性癌的多个样本及三个已发表患者组 |
| 634 | 2024-08-05 |
PRDM16 Is a Compact Myocardium-Enriched Transcription Factor Required to Maintain Compact Myocardial Cardiomyocyte Identity in Left Ventricle
2022-02-22, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究表明PRDM16是维持左心室紧凑型心肌细胞身份所需的转录因子。 | 建立了心肌特异性Prdm16基因敲除小鼠模型，该模型能够完全再现患者的左心室非紧凑型心肌病表型，揭示了PRDM16的作用机制。 | 目前尚不清楚PRDM16缺失如何导致左心室非紧凑型心肌病的具体分子机制。 | 探讨PRDM16在左心室非紧凑型心肌病中的作用和机制。 | 使用心肌细胞特异性Prdm16基因敲除小鼠及相关技术进行分析。 | 数字病理学 | 心脏病 | RNA测序，染色质免疫沉淀深度测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 生成并分析了心肌细胞特异性Prdm16基因敲除小鼠模型 |
| 635 | 2024-08-05 |
Cell types and molecular architecture of the Octopus bimaculoides visual system
2022-12-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.10.015
PMID:36318923
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研究论文 | 该论文呈现了章鱼视觉系统的单细胞分子图谱 | 首次系统性描绘了章鱼视网膜的细胞类型及其分子特征 | 研究可能在未覆盖的细胞类型和功能连接性方面存在局限 | 探索章鱼视觉系统的细胞类型和分子架构 | 章鱼的视觉神经元及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA原位杂交 | NA | 细胞 | NA |
| 636 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing: promises and challenges for human genetics
2022-Dec, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2022-2156
PMID:38836091
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综述 | 这篇文章描述了单细胞测序在人的遗传学中的现状及其应用 | 该技术承诺在宏观规模上功能性地注释人类基因组中的每个区域及其所有可能的变异 | 文章未具体提及单细胞测序的局限性 | 研究单细胞测序在人的遗传学中的作用和应用 | 讨论该技术如何应用于表征和监测疾病，开发人类细胞图谱，以及注释基因组 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 637 | 2024-08-05 |
The Vasculature in Pulmonary Fibrosis
2022-Dec, Current tissue microenvironment reports
DOI:10.1007/s43152-022-00040-9
PMID:36712832
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review | 本文回顾了特发性肺纤维化（IPF）中血管的变化及其对纤维化病理生理的影响 | 此文通过单细胞RNA测序的进展，更好地表征了肺内皮细胞类型，并识别了IPF患者的血管变化 | 需要更多的研究来进一步定义这些血管变化的功能角色 | 研究血管在特发性肺纤维化中的作用及其变化 | 特发性肺纤维化患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 涉及特发性肺纤维化患者的肺组织 |
| 638 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics demonstrates the role of CD4 T cells in effector CD8 T cell differentiation during chronic viral infection
2022-11-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111736
PMID:36450262
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨了CD4 T细胞在慢性病毒感染中对效应CD8 T细胞分化的作用 | 揭示了在CD4细胞耗竭情况下，免疫调节CD4 T细胞相较于产生IL-21的Tfh细胞的数量占优，从而影响CD8 T细胞的应答 | 未详细探讨其他细胞类型在T细胞相互作用中可能的作用 | 研究CD4 T细胞异质性及其在慢性病毒感染中的功能 | CD4和CD8 T细胞及其在慢性病毒感染中的相互作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 639 | 2024-08-05 |
TrkA+ Neurons Induce Pathologic Regeneration After Soft Tissue Trauma
2022-11-18, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szac073
PMID:36222619
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研究论文 | 本研究探讨了TrkA+神经元在软组织创伤后诱导病理再生的作用 | 首次发现NGF响应的TrkA表达神经在软组织创伤后的侵袭与异位骨形成相关 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性尚待验证 | 研究TraK信号调控对创伤后异位骨形成的影响 | 使用小鼠模型研究异位骨形成及相关神经元活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 影像，组织学 | 小鼠模型，具体样本量未定 |
| 640 | 2024-08-05 |
GATA4 Regulates Developing Endocardium Through Interaction With ETS1
2022-11-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.318102
PMID:36263775
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研究论文 | 本文研究GATA4转录因子在心脏发育中的作用及其与ETS1的相互作用 | 探索了GATA4如何在心肌细胞和心内膜细胞中选择性占据染色质的机制，并揭示了ETS1在GATA4调控内皮发育中的协同作用 | 研究主要集中在小鼠模型中，结果的转化性可能受限于物种差异 | 阐明GATA4如何通过与ETS1等非先导转录因子的相互作用来调控心内膜的发育 | 小鼠胚胎心脏中的心肌细胞和心内膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光素酶报告实验 | 细胞系 | 基因组数据和转录组数据 | 使用了小鼠胚胎心脏细胞和稳定转染的NIH3T3细胞系 |