单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-05 |
Cellular reprogramming with ATOH1, GFI1, and POU4F3 implicate epigenetic changes and cell-cell signaling as obstacles to hair cell regeneration in mature mammals
2022-11-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79712
PMID:36445327
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研究论文 | 该研究探讨了使用ATOH1、GFI1和POU4F3进行耳蜗再编程，以克服在成熟哺乳动物中毛细胞再生的障碍 | 揭示了老年动物毛细胞再编程的表观遗传障碍和细胞间信号传导的影响 | 只在特定的转录因子组合下进行了研究，未充分评估其他可能的因素 | 研究耳蜗中毛细胞特异性转录因子对听力恢复的影响 | 使用Cre诱导小鼠模型来比较不同转录因子的毛细胞再编程效果 | 数字病理学 | 听力损失 | scRNA-seq和ATAC-seq | NA | 细胞 | 新生小鼠与1周龄小鼠的比较 |
| 622 | 2024-08-05 |
Anti-diabetic drug canagliflozin hinders skeletal muscle regeneration in mice
2022-Oct, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-022-00878-7
PMID:35217814
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研究论文 | 这篇文章探讨了抗糖尿病药物canagliflozin对小鼠骨骼肌再生的影响 | 首次揭示了canagliflozin在骨骼肌再生中的负面作用以及LARS2在肌肉干细胞中的关键角色 | 主要研究了小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 研究canagliflozin对小鼠缺血性下肢肌肉再生的影响 | 小鼠和C2C12肌母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 肌肉组织和细胞数据 | 小鼠模型和细胞实验的具体样本量未提及 |
| 623 | 2024-08-05 |
Spatial profiling of chromatin accessibility in mouse and human tissues
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05094-1
PMID:35978191
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研究论文 | 本文描述了一种通过空间-ATAC-seq方法对组织切片进行空间分辨的染色质可及性分析 | 创新之处在于结合了原位Tn5转座化学和微流体确定性条形码，能够在细胞水平和基因组规模上捕捉组织的空间表观遗传信息 | NA | 研究目的在于改善对细胞身份、状态及命运决策的理解，尤其是与表观遗传基础相关的部分 | 研究对象包括小鼠和人类的脑组织以及扁桃体组织 | 空间生物学 | NA | 下一代测序 | NA | 组织切片 | 使用了小鼠胚胎和扁桃体组织样本 |
| 624 | 2024-08-05 |
Hermansky-Pudlak syndrome type 1 causes impaired anti-microbial immunity and inflammation due to dysregulated immunometabolism
2022-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-022-00572-1
PMID:36302964
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研究论文 | 本研究探讨了Hermansky-Pudlak综合症1型中免疫代谢失调对抗微生物免疫和炎症的影响 | 揭示了HPS1缺乏如何通过Rab32介导的mTOR信号通路改变代谢程序，并影响抗微生物反应 | 该研究的细胞机制和临床显著性仍需进一步验证 | 理解Hermansky-Pudlak综合症1型中炎症的细胞基础 | 研究HPS-1患者的外周血细胞和血清 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 大规模细胞测定、蛋白组学和转录组学分析 | NA | 血液样本、组织样本 | HPS-1患者的外周血细胞和血清样本 |
| 625 | 2024-08-05 |
High-resolution transcriptomics informs glial pathology in human temporal lobe epilepsy
2022-10-23, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-022-01453-1
PMID:36274170
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研究论文 | 本研究验证了一种从人类大脑皮层中同时分离神经元、星形胶质细胞和少突胶质前体细胞的方法，并研究了与颞叶癫痫相关的转录组特征 | 首次揭示了颞叶癫痫中特异性混合胶质亚群的存在，并表明其表达反应性星形胶质细胞和少突胶质细胞的特征 | 样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 研究癫痫中的神经元和胶质细胞之间的复杂相互作用及其转录组特征 | 从癫痫手术样本中分离的神经元和胶质细胞群体 | 数字病理学 | 癫痫 | RNA-seq，单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 包含四个额外的人类TLE样本和对照样本 |
| 626 | 2024-08-05 |
Degradation-resistant implanted biomaterials establish an immunosuppressive microenvironment that induces T cell exhaustion by recruiting myeloid cells
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.10.007
PMID:38933993
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研究论文 | 研究表明，耐降解的钛基植入材料通过招募髓系细胞建立免疫抑制微环境，从而诱导T细胞耗竭 | 首次揭示了钛基植入物如何通过招募髓系细胞形成免疫抑制微环境 | 对植入物周围免疫环境的影响机制尚需进一步探索 | 探索植入生物材料对局部免疫环境的影响 | 耐降解的钛基植入材料及其对周围免疫环境的影响 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 627 | 2024-08-05 |
Multi-tissue scRNA-seq reveals immune cell landscape of turbot (Scophthalmus maximus)
2022-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2021.12.015
PMID:38933994
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研究论文 | 本文开发了一个鲽鱼的动态细菌感染模型，并创建了鱼类免疫细胞景观。 | 首次系统性解析了鲽鱼中的免疫细胞亚群及其在细菌感染中的双重功能 | 主要集中于鲽鱼，结果可能不适用于其他鱼类 | 阐明骨鱼类免疫细胞的细致分布和功能 | 鲽鱼（Scophthalmus maximus） | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 表达谱数据 | NA |
| 628 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of human midbrain reveals glial activation and a Parkinson-specific neuronal state
2022-04-29, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awab446
PMID:34919646
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研究论文 | 该研究揭示了人类中脑的胶质细胞激活和特定于帕金森病的神经元状态 | 首次通过单核RNA测序揭示了特定于帕金森病的神经元细胞集群及其在运动障碍中的作用 | 研究仍需更多探讨以确认免疫信号和免疫调节治疗在帕金森病中的作用 | 表征所有中脑细胞类型在帕金森病病理中的贡献 | 来自六例特发性帕金森病患者及五例年龄/性别匹配对照的中脑单核样本 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41,000多单核转录组，来自六例特发性帕金森病患者和五例匹配对照 |
| 629 | 2024-08-05 |
Reconstructing codependent cellular cross-talk in lung adenocarcinoma using REMI
2022-Mar-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi4757
PMID:35302849
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研究论文 | 本研究提出REMI，一个图形算法，通过考虑配体-受体依赖性来重建肺腺癌中的细胞交互作用 | 提出了一种新型算法REMI，能够处理高维小样本数据集并考虑配体-受体交互之间的依赖性 | 当前方法依赖于小样本数据，可能在推广性和准确性上存在限制 | 研究细胞交互作用在肺腺癌中的重建，以识别与临床相关的交互 | 关注人类肺腺癌（LUAD）的配体-受体交互作用及其在肿瘤-基质-免疫亚群中的前景特征 | 计算机视觉 | 肺癌 | RNA测序 | 图算法 | 转录组数据 | 使用了来自流式分选的RNA测序数据集和单细胞转录组数据 |
| 630 | 2024-08-05 |
The spatial transcriptomic landscape of the healing mouse intestine following damage
2022-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-28497-0
PMID:35149721
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学定义了小鼠肠道在稳态和愈合过程中的转录组景观 | 揭示了结肠在稳态条件下的分子区域化特征，及其在粘膜愈合过程中的显著变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全代表人类的相应机制 | 探讨小鼠肠道在愈合过程中转录组的空间组织 | 小鼠结肠的转录组及其在愈合过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本 |
| 631 | 2024-08-05 |
A transcriptomics-guided drug target discovery strategy identifies receptor ligands for lung regeneration
2022-03-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj9949
PMID:35319981
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研究论文 | 本研究提出了一种转录组指导的药物靶标发现策略，识别了用于肺部再生的受体配体 | 开发了一种新方法来识别针对慢性阻塞性肺病(COPD)的再生药物靶标，强调了EP和IP前列腺素受体配体的疗效 | 研究可能未充分考虑其他可能影响慢性病修复机制的因素 | 探索治疗慢性疾病中的组织修复缺陷的新药物靶点 | 烟草相关的慢性阻塞性肺病患者及其小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 结合慢性阻塞性肺病的临床样本和吸烟小鼠模型 |
| 632 | 2024-08-05 |
Cell-by-Cell: Unlocking Lung Cancer Pathogenesis
2022-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14143424
PMID:35884485
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review | 本综述文章总结了单细胞分析在非小细胞肺癌研究中的应用，尤其是肺腺癌亚型。 | 利用单细胞测序技术，文章揭示了肿瘤起源细胞和肿瘤免疫动态的新知识，重写了谱系可塑性和肿瘤内部异质性的机制细节。 | 该综述主要集中于肺腺癌亚型，可能未涵盖其他类型的肺癌及其相应的病理机制。 | 旨在总结肺腺癌发病机制及其肿瘤微环境的互动。 | 研究对象为不同阶段的肺腺癌肿瘤组织及相关动物模型。 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括不同阶段的肺腺癌样本及相关动物模型 |
| 633 | 2024-08-05 |
secDrug: a pipeline to discover novel drug combinations to kill drug-resistant multiple myeloma cells using a greedy set cover algorithm and single-cell multi-omics
2022-03-09, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-022-00636-2
PMID:35264575
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研究论文 | 本文介绍了一种计算管道，用于发现对抗耐药性多发性骨髓瘤细胞的新药组合 | 提出了一种结合药理基因组数据的优化算法来预测新药组合，并开发了可普遍应用的R软件包 | 实验主要在体外进行，临床应用效果尚未验证 | 研究针对耐药性多发性骨髓瘤的新药组合的发现 | 主要研究耐药性多发性骨髓瘤细胞及其药物组合 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，CyTOF单细胞蛋白组学，CRISPR基因编辑 | 贪婪集合覆盖算法 | 基因组数据，转录组数据，细胞系数据 | 使用了多个代表耐药性的人的多发性骨髓瘤细胞系 |
| 634 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals activation of core transcription factors in PRC2-deficient malignant peripheral nerve sheath tumor
2022-09-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111363
PMID:36130486
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研究论文 | 本研究揭示了在PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤中核心转录因子的激活机制 | 通过单细胞测序与工程细胞结合，本研究首次揭示了PRC2缺失导致的肿瘤细胞转录程序改变与干细胞特征的关系 | 本研究未涉及PRC2缺失在其他类型肿瘤中的影响 | 阐明PRC2缺失的肿瘤发生机制 | 针对PRC2缺失的恶性周围神经鞘瘤细胞进行研究 | 数字病理学 | 恶性周围神经鞘瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | NA |
| 635 | 2024-08-05 |
Systematic pan-cancer analysis identifies APOC1 as an immunological biomarker which regulates macrophage polarization and promotes tumor metastasis
2022-09, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2022.106376
PMID:35914680
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研究论文 | 本文通过系统的全癌症分析发现APOC1是一个免疫生物标志物，调节巨噬细胞极化并促进肿瘤转移 | 阐明了APOC1在肿瘤免疫中的作用及其在肾细胞癌中异常表达的机制 | 研究主要集中于肾细胞癌，缺乏对其他癌种中APOC1作用的深入探讨 | 探讨APOC1在肿瘤免疫中的角色及其对巨噬细胞极化的影响 | APOC1在不同癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织和血清样本 | 涉及多种癌症的系统分析和肾细胞癌患者的样本 |
| 636 | 2024-08-05 |
A CD4+ T cell reference map delineates subtype-specific adaptation during acute and chronic viral infections
2022-07-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76339
PMID:35829695
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研究论文 | 本研究构建了CD4 T细胞的参考图，以描述急性和慢性病毒感染期间亚型特异性的适应性变化 | 首次提供了针对病毒的CD4 T细胞转录状态适应性的深入理解，并建立了新的计算资源用于CD4 T细胞分析 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类病毒感染的情况 | 阐明CD4 T细胞在急性和慢性病毒感染中的转录状态适应 | 小鼠模型中的CD4 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 多个个体的病毒特异性CD4 T细胞 |
| 637 | 2024-08-05 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序探讨了局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞中的炎症特征 | 首次利用尿液单细胞RNA测序识别出与局灶性节段性肾小管硬化症相关的单核细胞亚群和足细胞表达特征 | 研究仅基于12名FSGS患者的尿液样本，样本量可能不足以绘制全貌 | 探究局灶性节段性肾小管硬化症患者尿液细胞的疾病相关分子特征 | 分析来自12名局灶性节段性肾小管硬化症患者的尿液样本 | 数字病理 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液细胞 | 收集了来自12名FSGS患者的17个尿液样本，捕获为23个尿液细胞样本 |
| 638 | 2024-08-05 |
AhR Activation Leads to Attenuation of Murine Autoimmune Hepatitis: Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Unique Immune Cell Phenotypes and Gene Expression Changes in the Liver
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.899609
PMID:35720411
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研究论文 | 本研究探讨了芳香烃受体（AhR）激活如何通过单细胞RNA测序分析减少小鼠自身免疫性肝炎中的免疫细胞炎症。 | 本文创新性地揭示了AhR激活导致小鼠自身免疫性肝炎中免疫细胞表型和基因表达的变化。 | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全反映人类的复杂免疫反应。 | 探讨AhR激活在小鼠自身免疫性肝炎中的作用机制。 | 小鼠模型及其肝脏中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 639 | 2024-08-05 |
The tumour microenvironment shapes innate lymphoid cells in patients with hepatocellular carcinoma
2022-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325288
PMID:34340996
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研究论文 | 这篇文章研究了肝细胞癌患者的肿瘤微环境如何影响固有淋巴细胞（ILCs）。 | 文章揭示了肿瘤微环境中的细胞因子如何影响ILCs的组成和功能，并与患者的生存预后相关。 | 该研究主要基于肝细胞癌患者的样本，可能无法普遍适用于其他类型的肿瘤。 | 探讨肝细胞癌中局部细胞因子环境如何影响ILCs的变化。 | 研究的对象为来自48名肝细胞癌患者的ILCs，特别是肿瘤组织和非肿瘤组织中的ILCs。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | 48名肝细胞癌患者 |
| 640 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Unveils the Role of the Tumor Immune Microenvironment and Notch Signaling in Dormant Minimal Residual Disease
2022-Mar-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-1230
PMID:34965936
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研究论文 | 该研究揭示了肿瘤免疫微环境和Notch信号通路在休眠微小残留疾病中的角色 | 首次利用新的免疫竞争转基因模型研究休眠微小残留疾病，并发现Jagged-1/Notch信号通路在肿瘤发生中的多重调控作用 | 尚未完全阐明肿瘤休眠的复杂生态系统及其影响因素 | 探讨休眠的分子通路和微环境的作用，提供新的策略延长癌症休眠 | 休眠微小残留疾病及其相关的肿瘤细胞和免疫细胞微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 转基因模型 | RNA序列数据 | NA |