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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-08-17 |
Widespread choroid plexus contamination in sampling and profiling of brain tissue
2022-03, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01416-3
PMID:34983929
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研究论文 | 该研究揭示了脑组织采样和 profiling 过程中脉络丛污染的普遍性问题，并评估了其对转录组数据分析的影响 | 首次系统地评估了脑组织转录组研究中脉络丛污染的普遍性及其对差异表达分析的影响，并提出通过检测脉络丛标志基因来识别和减轻污染的建议 | 无法确定 Ttr 等基因的差异表达完全由污染导致，因为可能涉及真实生物学效应；且污染检测仅基于单个标志基因 | 评估脑组织转录组研究中脉络丛污染的程度及其对数据分析的潜在影响 | 来自 Allen Brain Atlas 和 GTEx 数据库的人类脑组织样本以及 GEO 中的多项研究 | 基因组学, 转录组学 | NA | RNA-seq, 原位杂交 | NA | 转录组数据, 基因表达数据 | 包括 Allen Brain Atlas 和 GTEx 数据库中的多个脑区样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-08-17 |
Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis
2022-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01018-x
PMID:35288709
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研究论文 | 整合多个单细胞RNA测序数据集，系统重建小鼠胚胎发生过程中的细胞轨迹，并构建有向无环图TOME，以提名转录因子调控因子和跨脊椎动物进化的细胞类型同源物 | 通过整合多个scRNA-seq数据集并补充新测序的约15万个细胞核，以体节间隔的精细时间分辨率覆盖E8.5阶段，实现了从E3.5到E13.5共19个阶段的全面细胞状态连接，自动化构建了哺乳动物胚胎发生的细胞轨迹图TOME，并系统性提名候选转录因子和细胞类型同源物 | 未在摘要中明确提及局限性 | 全面描绘哺乳动物体内发育的主要细胞轨迹，并提名每个细胞类型特化的候选转录因子和跨物种的细胞类型同源物 | 小鼠胚胎发育过程中的细胞，覆盖从E3.5到E13.5的19个连续阶段 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 有向无环图（TOME） | 单细胞转录组数据 | 约15万个细胞核，来自约E8.5胚胎，以一体节间隔分期；整合多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-08-17 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞转录组数据，揭示了小鼠器官发生过程中的细胞类型和分化模式 | 采用基于图像的单细胞转录组方法seqFISH，结合空间上下文和多路转录测量，实现了未能直接测序基因的空间表达推断，并发现了单细胞RNA测序无法揭示的细胞分化轴，如食管和气管祖细胞的早期背腹分离 | 摘要未提及局限性 | 通过空间和单细胞转录组数据整合，研究小鼠器官发生中的细胞命运决定 | 小鼠胚胎（8-12体节阶段）的组织切片 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 不适用 | seqFISH、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠胚胎组织切片，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | seqFISH检测387个目标基因的mRNA，并结合两个单细胞转录组图谱 |
| 44 | 2026-08-17 |
An immunodominant NP105-113-B*07:02 cytotoxic T cell response controls viral replication and is associated with less severe COVID-19 disease
2022-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-01084-z
PMID:34853448
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研究论文 | 研究NP105-113-B*07:02特异性CD8 T细胞反应与COVID-19轻症关联，并揭示其抗病毒效应和持久性 | 首次将功能性亲和力、抗病毒效力和T细胞受体使用、转录组特征及疾病严重程度相关联，发现该T细胞反应与轻症相关，且对多个变异株保持抗病毒效力 | 未提及具体局限性 | 探究NP-B*07:02特异性CD8 T细胞反应在COVID-19疾病进展中的保护作用及其机制 | SARS-CoV-2感染者的NP-B*07:02特异性T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 急性期77例，恢复期52例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-08-12 |
Single cell transcriptome sequencing of inspiratory neurons of the preBötzinger complex in neonatal mice
2022-07-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-022-01569-y
PMID:35907922
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研究论文 | 本研究对新生小鼠preBötzinger复合体中吸气神经元的单细胞转录组进行了测序，提供了相关的原始数据和注释文件 | 首次对preBötC中吸气神经元进行单细胞转录组测序，结合电生理和遗传背景对神经元进行分类 | 仅基于转录组数据，未涉及功能验证或蛋白质表达分析 | 揭示preBötC吸气神经元的转录组特征，以理解呼吸节律生成的分子机制 | 新生小鼠preBötC中的吸气神经元 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不适用 | 基因表达数据（FASTQ、注释文件） | 未提供具体样本量 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 46 | 2026-08-07 |
Generation of human islet cell type-specific identity genesets
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29588-8
PMID:35440614
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研究论文 | 通过单细胞转录组元分析，构建了人类胰岛α、β、γ和δ细胞类型特异性身份基因集，用于准确评估胰岛细胞身份。 | 基于全面的单细胞转录组元分析，构建了比以往更稳健和准确的胰岛细胞类型特异性基因集，能有效追踪细胞身份变化并揭示其遗传机制。 | 未明确提及局限性。 | 开发可靠工具，以评估和追踪胰岛细胞身份，支持细胞替代疗法（如糖尿病治疗）研究。 | 人类胰岛α、β、γ和δ细胞，以及胚胎胰腺发育和实验性细胞重编程或分化过程中的细胞。 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-08-07 |
Obesity alters pathology and treatment response in inflammatory disease
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04536-0
PMID:35355021
|
研究论文 | 本研究通过特应性皮炎模型发现，肥胖将典型的2型T辅助细胞主导的疾病转变为更严重的T17炎症，并影响生物制剂疗效，而PPARγ激动剂可改善治疗反应 | 首次揭示肥胖通过抑制PPARγ活性改变T细胞分化方向，将T2型炎症转为T17型，并导致生物制剂治疗失效，提出PPARγ激动剂作为精准医学策略 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证；未探讨肥胖对除特应性皮炎外其他炎症性疾病的影响 | 阐明肥胖如何改变炎症性疾病的病理机制及对免疫治疗反应的影响，并探索潜在干预靶点 | 瘦素和肥胖小鼠的特应性皮炎模型，以及T细胞中PPARγ的基因敲除小鼠 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序、全基因组结合分析、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据、结合位点数据 | 涉及瘦和肥胖小鼠模型，具体数量未在摘要中给出 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 48 | 2026-08-06 |
A multidimensional coding architecture of the vagal interoceptive system
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04515-5
PMID:35296859
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研究论文 | 本研究通过大规模单细胞分析和空间转录组学揭示迷走神经感觉神经元采用多维编码架构，分别处理内脏器官、组织层和刺激模态三类信息，以支持身体-大脑的精确信号交流 | 首次阐明哺乳动物迷走神经感觉系统在多个维度上独立编码内脏信号特征，并采用组合化方式形成众多平行通路，这一多维编码架构为理解迷走神经信号处理机制提供了新的视角 | 研究基于小鼠模型，是否适用于人类及其他哺乳动物尚待验证，且未深入探讨这些编码维度在疾病状态下的变化 | 解析迷走神经感觉神经元如何编码内脏器官、组织层和刺激模态三类关键特征，以理解身体-大脑间信号传递的编码策略 | 迷走神经感觉神经元（VSNs）及其在多个内脏器官的投射 | 神经科学，单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、钙成像引导的空间转录组学、多重投影条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组图像、钙成像数据 | 来自小鼠七个主要内脏器官的VSNs | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'、10x Visium空间转录组学（用于钙成像引导的空间转录组学） |
| 49 | 2026-08-04 |
ScRNA-seq expression of IFI27 and APOC2 identifies four alveolar macrophage superclusters in healthy BALF
2022-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201458
PMID:35820705
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研究论文 | 对健康及未发炎囊性纤维化患者的支气管肺泡灌洗液进行单细胞RNA测序，鉴定出四种肺泡巨噬细胞超簇及多种免疫细胞亚型 | 首次基于IFI27和APOC2基因表达定义四种肺泡巨噬细胞超簇，并发现趋化因子亚簇的独特组合表达及AM家族比例的保守性 | 研究样本量有限，且未完全阐明AM亚簇的功能机制 | 理解肺泡巨噬细胞、间质巨噬细胞和募集单核细胞的异质性及其在气道疾病中的作用 | 健康和未发炎囊性纤维化受试者的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化、COVID-19 | 单细胞RNA测序、TotalSeq | NA | 单细胞转录组数据 | 113,213个支气管肺泡灌洗细胞，来自4名健康及3名未发炎囊性纤维化受试者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 50 | 2026-08-04 |
Single-cell RNA sequencing and binary hierarchical clustering define lung interstitial macrophage heterogeneity in response to hypoxia
2022-07-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00104.2022
PMID:35608266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和二元层次聚类分析了肺间质巨噬细胞在低氧条件下的异质性，并探讨其与低氧性肺动脉高压的关联 | 首次将单细胞RNA测序与二元层次聚类相结合来解析肺间质巨噬细胞在体内的异质性，并发现了常氧下存在的推定常驻训练免疫巨噬细胞及与肺动脉高压相关的罕见致病性群体 | 未提及具体局限性 | 确定肺间质巨噬细胞的多样性及其与低氧诱导的肺动脉高压的关联 | 肺间质巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 低氧性肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、二元层次聚类 | ClusterMap、Seurat、monocle | 单细胞转录组数据 | 374个（常氧）、2526个（1天低氧）、1211个（7天低氧）肺间质巨噬细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序 |
| 51 | 2026-08-04 |
Epigenetic and Transcriptomic Programming of HSC Quiescence Signaling in Large for Gestational Age Neonates
2022-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23137323
PMID:35806330
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞表观基因组学、单细胞转录组学和体外分析，探究大于胎龄新生儿造血干细胞静息信号的表观遗传和转录组编程 | 采用多模态单细胞（表观）基因组学方法，首次将DNA甲基化变化与HSPC功能改变相关联，并揭示表观遗传编程影响HSC静息能力 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究大于胎龄新生儿HSPC中DNA甲基化改变的功能影响，特别是HSC静息信号的改变 | 大于胎龄新生儿的造血干细胞和祖细胞（HSPC），尤其是造血干细胞（HSC） | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学 | 大于胎龄（过度胎儿生长） | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学、体外分析 | NA | 单细胞表观基因组数据、单细胞转录组数据 | NA（摘要未明确样本数量） | NA | 单细胞表观基因组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-08-03 |
Subsets of Tissue CD4 T Cells Display Different Susceptibilities to HIV Infection and Death: Analysis by CyTOF and Single Cell RNA-seq
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.883420
PMID:35784348
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了人扁桃体组织中不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和细胞死亡的敏感性差异 | 首次通过整合质谱流式细胞术和单细胞RNA-seq技术，揭示了HIV优先杀伤的CD4 T细胞亚群与优先感染的亚群在表型和基因表达上的差异，并强调了无效感染和焦亡在CD4 T细胞耗竭中的重要作用 | 研究仅基于人扁桃体组织样本，可能无法完全代表其他组织或外周血中的CD4 T细胞亚群反应 | 明确不同CD4 T细胞亚群对HIV感染和死亡的敏感性，并探索其潜在机制 | 人扁桃体组织中的CD4 T淋巴细胞及其不同亚群 | 免疫学、单细胞组学 | HIV感染 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式细胞术数据 | 人扁桃体组织样本（具体数量未提供） | Fluidigm、10x Genomics | 质谱流式细胞术、单细胞RNA-seq | CyTOF、10x Chromium | 质谱流式细胞术（CyTOF）和10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 53 | 2026-08-02 |
Occult polyclonality of preclinical pancreatic cancer models drives in vitro evolution
2022-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31376-3
PMID:35752636
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研究论文 | 本研究应用单细胞测序技术揭示临床前胰腺癌模型中潜在的克隆异质性，并探讨其对实验可重复性的影响 | 首次通过单细胞测序技术系统揭示假定单克隆的胰腺癌细胞系和患者来源类器官中存在基因组和转录组多克隆性，并揭露实验室间培养差异及2D到3D转换引起的转录组变化 | 研究结果对已建立的临床前模型在不同实验室间实验数据的严谨性和可重复性影响存在不确定性，且未明确干预措施 | 探讨临床前胰腺癌模型中潜在的克隆异质性及其对实验有效性和可重复性的影响 | 胰腺癌细胞系和患者来源类器官 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 全外显子测序、单细胞拷贝数变异测序、单细胞核染色质开放性测序、荧光原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 多种胰腺癌细胞系和患者来源类器官，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞拷贝数变异测序、单细胞核染色质开放性测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-07-10 |
A single-cell transcriptome of mesenchymal stromal cells to fabricate bioactive hydroxyapatite materials for bone regeneration
2022-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.009
PMID:34820571
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研究论文 | 利用单细胞转录组技术绘制间充质干细胞在不同成骨微环境中的转录图谱，揭示羟基磷灰石支架和成骨培养基的成骨机制 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三维羟基磷灰石支架和成骨培养基对间充质干细胞的成骨调控机制，发现两种条件通过不同信号通路（如ZBTB16、WNT）驱动成骨，并揭示间充质干细胞亚群（LRRC75A、PCDH10）的功能异质性 | 未明确提及具体限制，但可能包括样本量有限或仅基于体外模型，未在体内验证 | 通过单细胞转录组解析间充质干细胞在生物活性羟基磷灰石材料中的成骨微环境，为骨再生材料优化提供数据库参考 | 间充质干细胞（MSCs）及其亚群（如LRRC75A、PCDH10） | 数字病理学 | 骨再生相关疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-06-02 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
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研究论文 | 提供使用BASiCS Bioconductor包对单细胞RNA测序数据进行表达变异分析的逐步计算流程 | 集成框架同时处理数据标准化、技术噪声量化和下游分析，并通过概率决策规则识别细胞群间表达变异的变化，避免技术噪声和整体丰度差异的混淆效应 | 需要用户熟悉R语言和Bioconductor生态，且依赖Docker镜像确保可重复性，可能对非计算背景用户存在门槛 | 开发并指导用户使用BASiCS方法稳健量化单细胞RNA测序数据中的表达变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率模型 | 基因表达数据 | 使用公开数据集作为示例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2026-06-01 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 优化分散胰岛细胞的冻存方法，并通过单细胞转录组分析验证其功能完整性 | 提出了一种优化的梯度冷冻方法，能够维持冻存后分散胰岛细胞的膜完整性、分子和功能表型，为糖尿病研究和细胞治疗提供了可靠细胞来源 | 未提及冻存过程中可能存在的细胞亚群偏好性损伤或长期稳定性数据 | 优化分散胰岛细胞的冻存技术，获得可用于单细胞转录组研究的活性细胞 | 分散的人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类胰岛细胞样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-05-31 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
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研究论文 | 以猪、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞为对象，发现扰动血流激活JAG1-NOTCH4信号通路驱动动脉粥样硬化，并揭示内皮细胞异质性的调控机制 | 首次揭示Notch通路（JAG1-NOTCH4）在扰动血流感知中的功能，并阐明其通过调控内皮细胞异质性增强动脉粥样硬化易感性的机制 | 未明确说明，但从标题和摘要推断可能包括：研究主要集中在动物模型和体外培养细胞，人类动脉粥样硬化的直接证据有限 | 探究扰动血流如何通过Notch通路驱动动脉粥样硬化 | 猪动脉、小鼠动脉、培养的人冠状动脉内皮细胞 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、光片成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 猪动脉、小鼠动脉及培养的人冠状动脉内皮细胞（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-05-28 |
Mechanical tension mobilizes Lgr6+ epidermal stem cells to drive skin growth
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl8698
PMID:35476447
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研究论文 | 使用受控组织扩张系统结合机器学习辅助三维重建和单细胞RNA测序，揭示机械张力通过Hippo通路激活Lgr6+表皮干细胞驱动小鼠皮肤生长的细胞与分子机制 | 首次在哺乳动物中系统揭示机械张力通过优先激活Lgr6+表皮干细胞驱动皮肤生长的机制，并利用机器学习三维重建和单细胞RNA测序技术构建器官大小动态变化的平台 | 主要基于小鼠模型，在人体中的适用性需要进一步验证；部分机制如Hippo通路的具体作用细节尚待阐明 | 阐明成年哺乳动物皮肤显著尺寸变化的细胞与分子基础 | 小鼠皮肤组织及Lgr6+表皮干细胞 | 机器学习， 数字病理学 | NA | RNA-seq | CNN | 图像， 文本 | 小鼠皮肤样本，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 59 | 2026-05-28 |
The landscape of human tissue and cell type specific expression and co-regulation of senescence genes
2022-01-09, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00507-7
PMID:35000600
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研究论文 | 对人类组织及细胞类型中衰老基因的表达与共调控网络进行了系统分析 | 首次通过整合网络分析揭示健康人类组织中衰老基因的共表达模块和细胞类型特异性 | 主要依赖公开数据库，未进行实验验证；对衰老细胞在组织中的实际分布缺乏直接证据 | 阐明人类组织中衰老基因的共表达模式及其细胞类型特异性 | 健康人类组织中的衰老基因及其在不同细胞类型中的表达特征 | 机器学习和生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 50个人体组织的GTEx队列数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2026-05-28 |
Caspases and therapeutic potential of caspase inhibitors in moderate-severe SARS-CoV-2 infection and long COVID
2022-01, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14907
PMID:33993490
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研究论文 | 研究半胱天冬酶在中度至重症SARS-CoV-2感染及长新冠中的表达及其抑制剂的治疗潜力 | 首次在单细胞水平揭示COVID-19患者免疫细胞中半胱天冬酶的独特表达模式，并发现泛半胱天冬酶抑制剂可减轻长新冠患者CD4+ T细胞中caspase-1活性 | 初步结果需进一步临床相关性验证，样本量有限可能影响结论普适性 | 探索半胱天冬酶在COVID-19疾病谱中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | COVID-19急性期和恢复期患者血液细胞，以及伴有合并症的非COVID-19对照组 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | COVID-19患者及非COVID-19对照者血液样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于免疫细胞转录组分析 |