单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-02-14	[Re-understanding the physiological and pathophysiological roles of neutrophils] 2022-Feb-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi DOI:10.3760/cma.j.cn501120-20211122-00391 PMID:35220698	综述	本文综述了近年来关于中性粒细胞的生物学行为及其在各种疾病中的作用的研究进展	重新审视了中性粒细胞的生理和病理生理作用，特别是其异质性及与其他免疫细胞相互作用的机制	NA	重新理解中性粒细胞在生理和病理生理中的作用	中性粒细胞	免疫学	NA	单细胞测序技术、空间转录组测序技术、多组学联合测序技术	NA	NA	NA
42	2025-02-11	Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models 2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04589-4 PMID:36346530	综述	本文综述了人类滋养层细胞和干细胞（hTSCs）模型的转录组数据，评估了这些模型的实用性和适用性	整合了单细胞RNA测序数据集，以识别这些模型如何重现早期滋养层发育	NA	评估人类滋养层细胞和干细胞模型的转录组数据，以确定其在实际应用中的价值	人类滋养层细胞和干细胞模型	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
43	2025-02-11	CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis 2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04606-6 PMID:36315271	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析和遗传谱系追踪小鼠模型，研究了CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用	揭示了CD34+细胞在血管生成和器官纤维化中的双重作用，特别是表达Pi16的CD34+细胞可能转化为肌成纤维细胞并参与器官纤维化	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和作用，特别是其在血管生成和器官纤维化中的角色	CD34+细胞	单细胞RNA测序	心血管疾病	单细胞RNA测序，遗传谱系追踪	遗传谱系追踪小鼠模型	单细胞RNA测序数据	NA
44	2025-02-11	Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy 2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04608-4 PMID:36316529	综述	本文综述了单细胞测序在癌症免疫治疗中的进展和应用	单细胞测序提供了单细胞水平的多维度细胞特征，揭示了肿瘤微环境的复杂性、肿瘤异质性的普遍性、细胞组成和细胞间相互作用、细胞谱系追踪以及肿瘤耐药机制	单细胞技术的临床转化尚未深入，特别是在免疫治疗中的应用	提高免疫治疗疗效，推动精准医学发展	癌症患者	数字病理	癌症	单细胞测序	NA	基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组和多组学数据	NA
45	2025-02-09	SK3 in POMC neurons plays a sexually dimorphic role in energy and glucose homeostasis 2022-Oct-09, Cell & bioscience DOI:10.1186/s13578-022-00907-2 PMID:36210455	研究论文	本研究探讨了POMC神经元中SK3在能量和葡萄糖稳态中的性别二态性作用	揭示了SK3在POMC神经元中的性别二态性作用，特别是在能量和葡萄糖稳态方面，独立于体重控制	研究未完全阐明POMC神经元功能性别差异的机制	研究POMC神经元中SK3在能量和葡萄糖稳态中的性别二态性作用	小鼠的POMC神经元	神经科学	代谢疾病	单细胞RNA-Seq, Cre-loxP策略	NA	基因表达数据	雄性及雌性小鼠
46	2025-02-05	Single-cell analysis identifies the interaction of altered renal tubules with basophils orchestrating kidney fibrosis 2022-06, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-022-01200-7 PMID:35552540	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了小鼠肾脏纤维化模型，揭示了肾小管细胞与嗜碱性粒细胞在肾脏纤维化中的相互作用	首次通过单细胞测序技术识别出具有促纤维化-炎症表型的肾小管细胞亚群，并发现这些细胞通过分泌CXCL1招募CXCR2嗜碱性粒细胞，进而促进肾脏纤维化	研究主要基于小鼠模型，虽然有人类肾脏单细胞数据的验证，但仍需进一步在人类患者中进行大规模验证	研究肾脏纤维化中的免疫过程，特别是肾小管细胞与嗜碱性粒细胞的相互作用	小鼠肾脏纤维化模型及人类肾脏纤维化患者	单细胞测序	肾脏纤维化	单细胞测序	NA	单细胞数据、基因表达数据、免疫染色数据	小鼠模型及人类肾脏纤维化患者的单细胞数据
47	2025-02-02	Systematic Comparison of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Models Identifies a Conserved Highly Plastic Basal Cell State 2022-Oct-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1742 PMID:35952360	研究论文	本文通过单细胞基因组学方法，研究了胰腺导管腺癌（PDAC）在不同生长条件下的细胞异质性，发现了一种高度可塑性的基底细胞状态	揭示了PDAC中基底细胞状态的高度可塑性及其在促进肿瘤内异质性中的作用	研究主要依赖于体外和体内模型，可能无法完全反映人类PDAC的复杂性	理解PDAC中细胞多样性的机制	胰腺导管腺癌（PDAC）细胞	癌症研究	胰腺癌	单细胞基因组学	NA	单细胞转录组数据	多种体外和体内模型
48	2025-01-30	Decoding liver fibrogenesis with single-cell technologies 2022-Dec, Life medicine DOI:10.1093/lifemedi/lnac040 PMID:39872749	review	本文综述了单细胞RNA测序技术如何改变我们对肝纤维化调控机制的理解	利用单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化过程中疾病相关细胞亚群、分子事件和细胞间相互作用	需要进一步努力以全面理解这些变化对肝纤维化的功能贡献，并将新知识转化为有效的治疗方法	探讨单细胞RNA测序技术在肝纤维化研究中的应用	肝细胞、肝窦内皮细胞、肌成纤维细胞和巨噬细胞	生物信息学	肝病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
49	2025-01-29	Single-cell atlas of multilineage cardiac organoids derived from human induced pluripotent stem cells 2022-Oct, Life medicine DOI:10.1093/lifemedi/lnac002 PMID:39871934	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
50	2025-01-26	Correlation between circulating innate lymphoid cell precursors and thymic function 2022-Feb-18, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2022.103732 PMID:35118353	研究论文	本文探讨了胸腺在固有淋巴细胞（ILC）前体细胞分化中的作用及其在不同外周组织中的补充作用	研究发现胸腺在不同外周组织中补充ILC池的作用，并揭示了年龄对ILC前体细胞丰度的影响	研究未明确胸腺在组织ILC池稳态中的具体贡献机制	研究胸腺在固有淋巴细胞前体细胞分化中的作用及其与年龄相关的免疫功能差异	固有淋巴细胞前体细胞及胸腺功能	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	野生型和无胸腺裸鼠的血液样本
51	2025-01-25	Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease 2022-08, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708 PMID:35428651	研究论文	本文研究了一例以关节炎、反复发热和皮疹为特征的晚发性自身炎症性疾病的遗传基础	发现了一种低比例体细胞NLRC4突变导致晚发性自身炎症性疾病，并揭示了其致病机制及潜在治疗策略	研究仅基于一例患者，样本量较小	探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础及致病机制	一例晚发性自身炎症性疾病患者	基因组学	自身炎症性疾病	全外显子/基因组测序、数字液滴PCR、单细胞RNA测序、细胞内细胞因子染色、定量PCR、免疫组化、Western blotting	NA	基因组数据、单细胞转录组数据	一例患者
52	2025-01-25	Differential responses to immune checkpoint inhibitor dictated by pre-existing differential immune profiles in squamous cell carcinomas caused by same initial oncogenic drivers 2022-Apr-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-022-02337-x PMID:35366939	研究论文	本研究通过建立两种具有TP53缺失和PIK3CA过度激活的鳞状细胞癌（SCC）模型，探讨了不同肿瘤对免疫检查点抑制剂（ICI）反应的差异	揭示了肿瘤内在差异如何影响ICI反应，并提出了结合肿瘤特异性或肿瘤相关巨噬细胞（TAM）特异性靶点的联合免疫疗法	研究主要基于小鼠模型，结果在人类HNSCC中的适用性尚需进一步验证	探讨鳞状细胞癌对免疫检查点抑制剂反应的差异机制	两种具有TP53缺失和PIK3CA过度激活的鳞状细胞癌模型（TAb2和TCh3）	肿瘤免疫学	头颈部鳞状细胞癌	流式细胞术、单细胞RNA测序	小鼠SCC模型	RNA测序数据、流式细胞术数据	两种SCC肿瘤模型（TAb2和TCh3）
53	2025-01-25	Sox13 is a novel flow-sensitive transcription factor that prevents inflammation by repressing chemokine expression in endothelial cells 2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2022.979745 PMID:36247423	研究论文	本文研究了SOX13作为一种新型的流动敏感转录因子，在稳定血流条件下通过抑制内皮细胞中趋化因子的表达来预防炎症	首次发现SOX13作为一种新型的流动敏感转录因子，其在稳定血流条件下通过抑制趋化因子的表达来预防内皮炎症	研究主要基于小鼠模型和培养的人主动脉内皮细胞，尚未在人体内进行验证	探索SOX13在血流调节内皮炎症中的作用	小鼠动脉和培养的人主动脉内皮细胞（HAECs）	生物医学	动脉粥样硬化	单细胞RNA测序（scRNAseq）、染色质可及性测序（scATACseq）、RNA测序（RNAseq）、qPCR、ELISA	小鼠部分颈动脉结扎模型	基因表达数据、染色质可及性数据	小鼠动脉和培养的人主动脉内皮细胞（HAECs）
54	2025-01-16	Acly Deficiency Enhances Myelopoiesis through Acetyl Coenzyme A and Metabolic-Epigenetic Cross-Talk 2022-12-01, ImmunoHorizons DOI:10.4049/immunohorizons.2200086 PMID:36547387	研究论文	本研究探讨了ATP柠檬酸裂解酶（Acly）在造血过程中通过调节乙酰辅酶A和代谢-表观遗传交叉对话来增强髓系生成的作用	揭示了Acly通过调节乙酰辅酶A水平和表观遗传修饰来限制髓系分化的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究Acly在造血过程中的作用及其对髓系分化的影响	小鼠的造血干细胞和祖细胞	代谢与表观遗传学	NA	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序	NA	基因表达数据、染色质可及性数据	小鼠的造血干细胞和祖细胞
55	2025-01-16	Archetype tasks link intratumoral heterogeneity to plasticity and cancer hallmarks in small cell lung cancer 2022-09-21, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2022.07.006 PMID:35981544	研究论文	本文通过原型任务分析，将小细胞肺癌（SCLC）肿瘤内的异质性与可塑性及癌症标志联系起来	应用原型分析模型，通过多任务进化理论重新构建SCLC表型异质性，揭示了细胞状态转换与治疗适应性和生存率的关系	研究主要基于细胞系和肿瘤转录组数据，可能无法完全反映体内复杂情况	探索小细胞肺癌肿瘤内异质性与细胞可塑性及癌症标志的关系	小细胞肺癌（SCLC）肿瘤细胞	数字病理学	肺癌	转录组分析	原型分析模型	转录组数据	细胞系和肿瘤样本
56	2025-01-16	Urine Proteomics and Renal Single-Cell Transcriptomics Implicate Interleukin-16 in Lupus Nephritis 2022-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.42023 PMID:34783463	研究论文	本研究通过分析狼疮性肾炎（LN）患者的纵向尿液蛋白质组学数据，探索了新的生物标志物和治疗策略	首次通过尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学联合分析，揭示了IL-16在狼疮性肾炎中的重要作用，并提出了其作为潜在治疗靶点和生物标志物的可能性	样本量较小（30名患者），且未进行长期随访以验证治疗效果的持续性	开发新的狼疮性肾炎治疗策略和生物标志物	狼疮性肾炎患者	数字病理学	狼疮性肾炎	尿液蛋白质组学、单细胞转录组学、RNA测序	NA	蛋白质组数据、转录组数据	30名狼疮性肾炎患者
57	2025-01-16	A Comprehensive Immune Cell Atlas of Cystic Kidney Disease Reveals the Involvement of Adaptive Immune Cells in Injury-Mediated Cyst Progression in Mice 2022-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2021030278 PMID:35110364	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，构建了小鼠囊性肾病的免疫细胞图谱，揭示了适应性免疫细胞在损伤介导的囊肿进展中的作用	首次在囊性肾病中构建了全面的免疫细胞单细胞图谱，并发现适应性免疫细胞在损伤加速的囊肿进展中的关键作用	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探究囊性肾病中免疫细胞的作用，特别是适应性免疫细胞在损伤加速的囊肿进展中的机制	小鼠模型中的囊性肾病	生物信息学	肾病	单细胞RNA测序（RNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	79,355个细胞，来自对照组小鼠和诱导型Ift88突变小鼠
58	2024-12-17	Granzyme K+ CD8 T cells form a core population in inflamed human tissue 2022-06-15, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abo0686 PMID:35704599	研究论文	研究发现在炎症组织中，表达颗粒酶K（GzmK）的CD8 T细胞构成了一个核心群体，并在类风湿性关节炎（RA）等疾病中发挥重要作用	首次发现CD8 T细胞在类风湿性关节炎等疾病中具有显著的炎症驱动作用，并且这些细胞在多种组织和疾病中广泛存在	研究主要集中在类风湿性关节炎和少数其他疾病，未来需要进一步验证这些发现在更广泛疾病中的适用性	探讨CD8 T细胞在炎症组织中的作用及其在不同疾病中的分布	类风湿性关节炎、肠道、肾脏和COVID-19患者的CD8 T细胞	免疫学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	单细胞RNA数据、流式细胞数据	涉及类风湿性关节炎、肠道、肾脏和COVID-19患者的多种组织样本
59	2024-12-17	Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain 2022-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-022-01022-8 PMID:35260865	研究论文	本文探讨了单细胞测序实验中酶解组织对基因表达的影响，并提出了一种新的方法来减少这种影响	提出了一个严格验证的协议，保留了体内转录组特征和细胞类型多样性，并揭示了人类死后脑组织中单核RNA测序数据中的类似特征	仅在鼠脑和人脑组织中进行了验证，尚未在其他物种或组织类型中进行测试	解决单细胞测序中酶解组织引起的基因表达变化问题	鼠脑和人脑组织	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	鼠脑和人脑组织样本
60	2024-12-17	Dynamic Molecular Profiles of Bone Marrow-Derived Osteoblasts at the Single-Cell Level 2022, Folia biologica IF:1.1Q4 DOI:10.14712/fb2022068030097 PMID:36689316	研究论文	研究探讨了单细胞水平上骨髓来源成骨细胞的异质性及其发育轨迹	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了骨髓来源成骨细胞的异质性及其发育轨迹，并识别了不同亚群的特征基因和信号通路	研究仅限于小鼠骨髓细胞，未涉及人类样本	揭示成骨细胞的异质性及其发育机制，为骨骼系统疾病的研究提供新思路	骨髓来源的成骨细胞及其在单细胞水平上的分子特征	数字病理学	骨骼系统疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠骨髓细胞的单细胞测序数据