单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-13 |
A mouse model of the LEAP study reveals a role for CTLA-4 in preventing peanut allergy induced by environmental peanut exposure
2022-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.02.024
PMID:35288169
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研究论文 | 本研究通过建立模拟LEAP临床试验的小鼠模型，揭示了食用花生制品通过CTLA-4通路预防环境暴露诱发花生过敏的免疫机制 | 首次建立模拟人类LEAP研究的小鼠模型，发现CTLA-4在调节T滤泡辅助细胞反应和预防花生过敏中的关键作用 | 研究使用成年BALB/c小鼠，与人类婴幼儿免疫系统存在差异；仅使用单一商业花生酱产品 | 探究早期食用花生制品预防花生过敏的免疫学机制 | BALB/c小鼠 | 免疫学 | 花生过敏 | 单细胞RNA测序，分子免疫学方法 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，免疫反应数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-11-13 |
Dihydroartemisinin beneficially regulates splenic immune cell heterogeneity through the SOD3-JNK-AP-1 axis
2022-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2061-7
PMID:35226255
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了双氢青蒿素通过SOD3-JNK-AP-1轴调节脾脏免疫细胞异质性的机制 | 首次发现双氢青蒿素通过SOD3-JNK-AP-1信号轴调节脾脏免疫细胞亚群的重组，并证明SOD3敲除小鼠对该调节作用具有抵抗性 | NA | 阐明双氢青蒿素的免疫调节机制 | 小鼠脾脏免疫细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,细胞学方法,生物化学方法 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-11-13 |
Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.002
PMID:35032503
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研究论文 | 本研究揭示利多卡因通过阻断CGRP信号通路介导的感觉神经元-树突状细胞通讯治疗银屑病的机制 | 首次证明硬膜外利多卡因注射可通过抑制异常感觉神经生长和CGRP介导的树突状细胞IL-23产生治疗银屑病 | 仅为初步研究，样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 探究神经系统在银屑病发病机制中的作用及神经干预的治疗潜力 | 银屑病患者和咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，细胞共培养 | 动物模型 | 基因表达数据，临床评分数据 | 银屑病患者和动物模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-11-13 |
Transcriptomes of MPO-Deficient Patients with Generalized Pustular Psoriasis Reveals Expansion of CD4+ Cytotoxic T Cells and an Involvement of the Complement System
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.12.021
PMID:34973310
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析MPO缺陷型泛发性脓疱型银屑病患者的转录组特征 | 首次系统分析MPO基因型对中性粒细胞和PBMC亚群及其差异基因表达的影响 | 研究仅针对稳定期患者样本，未验证发现是否适用于急性表皮情况 | 探究MPO缺陷在泛发性脓疱型银屑病发病机制中的作用 | MPO缺陷型泛发性脓疱型银屑病患者的外周血单个核细胞和中性粒细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | MPO缺陷型泛发性脓疱型银屑病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-11-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals that BMPR2 mutation regulates right ventricular function via ID genes
2022-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00327-2021
PMID:34857612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMPR2突变通过ID基因调控右心室功能的机制 | 首次证明BMPR2信号通过ID基因和USP9X调控心脏分化，并阐明其在先天性心脏病相关肺动脉高压中的作用机制 | 研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异 | 阐明BMPR2信号通过下游效应子ID基因在心脏发育中促进先天性心脏病患者肺动脉高压进展的机制 | 先天性心脏病相关肺动脉高压患者、基因敲除小鼠、人胚胎干细胞和诱导多能干细胞 | 单细胞测序 | 先天性心脏病和肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、基因敲除、共聚焦显微镜、超声检查 | 基因敲除动物模型、干细胞分化模型 | 单细胞RNA测序数据、影像数据、生理指标数据 | 25只基因敲除小鼠（其中12只发病）、患者来源iPSCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-11-13 |
Profiling of lung SARS-CoV-2 and influenza virus infection dissects virus-specific host responses and gene signatures
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01881-2021
PMID:34675048
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研究论文 | 通过空间转录组学分析比较SARS-CoV-2和流感病毒感染的肺部宿主反应差异 | 首次使用空间转录组学技术揭示SARS-CoV-2在肺部非均匀分布特征及其与干扰素反应的关联 | 样本量有限，主要基于尸检组织样本 | 解析SARS-CoV-2和流感病毒特异性宿主反应及基因特征 | COVID-19患者、H1N1流感患者和未感染对照者的肺部组织 | 空间转录组学 | COVID-19, 流感 | 靶向转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | COVID-19患者、流感患者和未感染对照的肺部组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMX平台 | NanoString GeoMX数字空间分析平台用于FFPE组织 |
| 47 | 2025-10-19 |
Integrated multi-omics analyses identify key anti-viral host factors and pathways controlling SARS-CoV-2 infection
2022-Aug-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-1910932/v1
PMID:36032971
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研究论文 | 通过整合多组学分析鉴定控制SARS-CoV-2感染的关键抗病毒宿主因子和通路 | 发现被先前研究遗漏的多个抗病毒宿主因子（如V-ATPases、ESCRT和N-糖基化通路组分），首次鉴定cohesin复合物作为新型抗病毒通路，并发现与重症COVID-19相关的转录因子KLF5 | 未明确说明研究样本规模和技术验证的局限性 | 系统鉴定控制SARS-CoV-2感染的宿主抗病毒因子和通路 | 宿主细胞因子、病毒-宿主相互作用网络 | 基因组学 | COVID-19 | CRISPR筛选、多组学整合分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、蛋白质/RNA相互作用组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-09 |
A Comprehensive Immune Cell Atlas of Cystic Kidney Disease Reveals the Involvement of Adaptive Immune Cells in Injury-Mediated Cyst Progression in Mice
2022-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021030278
PMID:35110364
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研究论文 | 通过构建小鼠囊性肾病单细胞图谱，揭示适应性免疫细胞在损伤介导的囊肿进展中的关键作用 | 首次系统绘制囊性肾病免疫细胞图谱，发现适应性免疫细胞在损伤加速型囊肿进展中的特异性作用机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；样本数量相对有限 | 探究免疫细胞在囊性肾病进展中的作用机制 | 成年诱导性条件性Ift88基因敲除小鼠（纤毛突变小鼠） | 单细胞生物学 | 囊性肾病 | 单细胞RNA测序 | NicheNet | 单细胞转录组数据 | 79,355个细胞，来自对照组和纤毛突变小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-05 |
A mineralizing pool of Gli1-expressing progenitors builds the tendon enthesis and demonstrates therapeutic potential
2022-12-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.11.007
PMID:36459968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肌腱附着点发育过程中的细胞类型和转录调控机制，并验证了Gli1表达祖细胞的治疗潜力 | 首次在单细胞分辨率下定义了小鼠肌腱附着点的发育转录组，识别了六种驻留细胞类型及其转录调控网络，并证实Gli1谱系细胞具有克隆性和多能性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索肌腱附着点的发育机制并开发促进其再生的治疗方法 | 小鼠肌腱附着点发育过程中的细胞类型和Gli1谱系细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱附着点损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠产后发育阶段的肌腱附着点组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA- and CAGE-seq Reveals Tooth-Enriched Genes
2022-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211049785
PMID:34806461
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和CAGE测序技术识别牙齿特异性表达基因 | 首次结合scRNA-seq和CAGE-seq技术鉴定牙齿发育关键基因，开发新型生物信息学分析方法 | 仅使用出生后第1天小鼠磨牙数据，未验证其他发育阶段 | 鉴定牙齿发育过程中的重要功能基因 | 小鼠牙齿胚和磨牙细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, CAGE测序 | NA | 基因表达数据 | 12,212个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, CAGE-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-10-05 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 本研究优化了分散人胰岛细胞的冷冻保存方法，并验证了冻存后细胞的功能特性 | 开发了迭代分级冷冻方法，首次系统评估了冻存后胰岛细胞的分子和功能表型完整性 | 研究仅针对分散的胰岛细胞，未评估完整胰岛组织的冷冻保存效果 | 优化胰岛细胞冷冻保存技术，为糖尿病研究和治疗提供细胞来源 | 分散的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，膜片钳电生理学 | NA | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-05 |
Guidelines for bioinformatics of single-cell sequencing data analysis in Alzheimer's disease: review, recommendation, implementation and application
2022-03-02, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00517-z
PMID:35236372
|
综述 | 本文系统综述了单细胞测序数据分析的生物信息学方法及其在阿尔茨海默病研究中的应用 | 提供了14个主要分析方向的推荐工作流程并在大型单核RNA测序数据集上实施验证 | 未明确说明所用数据集的样本量限制和模型验证的局限性 | 为阿尔茨海默病单细胞测序数据分析提供生物信息学指南 | 阿尔茨海默病患者和小鼠模型的单细胞测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-05 |
Diagnostic Evidence GAuge of Single cells (DEGAS): a flexible deep transfer learning framework for prioritizing cells in relation to disease
2022-02-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01012-2
PMID:35105355
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研究论文 | 提出一种名为DEGAS的深度迁移学习框架，可将疾病信息从患者层面迁移到细胞层面 | 引入'印象'概念作为可迁移信息，将个体细胞与疾病属性关联 | 仅使用模拟数据和有限的实际数据集进行验证 | 开发能够将疾病信息从患者迁移到细胞的深度学习框架 | 单细胞和患者批量组织转录组数据 | 机器学习 | 多形性胶质母细胞瘤,阿尔茨海默病,多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 深度迁移学习 | 转录组数据 | 十个不同的单细胞和患者批量组织转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-05 |
Nonlesional lupus skin contributes to inflammatory education of myeloid cells and primes for cutaneous inflammation
2022-04-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abn2263
PMID:35476593
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示狼疮非皮损皮肤在炎症启动中的作用 | 首次全面表征狼疮皮损和非皮损皮肤的分子特征，发现非皮损皮肤是富含I型干扰素的预炎症环境 | 样本量有限，需要进一步功能验证 | 探究皮肤性红斑狼疮的免疫发病机制 | 狼疮患者的正常外观皮肤、皮损皮肤和循环免疫细胞 | 数字病理学 | 红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 狼疮患者的皮肤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-05 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
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研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了阿尔茨海默病小鼠模型中斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病不同阶段的转录组重塑 | 首次结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA-seq技术，无预设地识别斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病关键阶段的基因失调网络 | 研究基于小鼠模型，人类验证仅使用死后脑组织样本 | 揭示斑块相关和斑块远离小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同贡献 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 激光捕获显微切割，RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 阿尔茨海默病小鼠模型在疾病早期、中期和晚期阶段的小胶质细胞样本 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Graph deep learning for the characterization of tumour microenvironments from spatial protein profiles in tissue specimens
2022-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00951-w
PMID:36357512
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研究论文 | 利用图神经网络分析组织样本中的空间蛋白质谱以表征肿瘤微环境 | 提出基于空间蛋白质谱的局部子图建模方法，能捕捉与临床结果相关的独特细胞相互作用 | 方法验证仅限于头颈癌和结直肠癌样本，需进一步扩展验证 | 开发基于图深度学习的肿瘤微环境表征方法以预测患者预后 | 人类头颈癌和结直肠癌组织样本 | 计算机视觉 | 头颈癌,结直肠癌 | 多重免疫荧光成像 | 图神经网络(GNN) | 空间蛋白质谱图像 | NA | NA | 多重免疫荧光成像 | NA | 40重免疫荧光成像 |
| 57 | 2025-10-06 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
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研究论文 | 本研究揭示了JAG1-NOTCH4信号通路通过感知紊乱血流促进动脉粥样硬化的机制 | 首次发现JAG1-NOTCH4通路在感知紊乱血流中的作用及其通过调节内皮细胞异质性促进动脉粥样硬化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步验证在人类疾病中的直接相关性 | 探究紊乱血流通过JAG1-NOTCH4信号通路促进动脉粥样硬化的分子机制 | 猪和鼠的动脉组织、培养的人类冠状动脉内皮细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,光片成像 | NA | 基因表达数据,成像数据 | 多种动物模型和细胞培养体系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00589-x
PMID:36536457
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了淀粉样蛋白-β和tau病理在阿尔茨海默病进展中协同诱导新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型 | 首次发现Aβ和tau病理协同作用在疾病不同阶段诱导特异性小胶质细胞亚型EADAM和LADAM，并鉴定Siglec基因作为AD进展的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 探究阿尔茨海默病中Aβ和tau病理如何协同调控小胶质细胞亚型 | AD模型小鼠的小胶质细胞及人类颞上回和内嗅皮层组织 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, snRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | AD模型小鼠及不同Braak分期的人类脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and cell-specific proteomics reveals molecular signatures of sleep
2022-08-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03800-3
PMID:35986171
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和细胞特异性蛋白质组学揭示睡眠的分子特征 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞类型特异性蛋白质组学技术系统研究睡眠分子机制 | 仅研究了三个脑区，未覆盖全脑所有区域；样本量未明确说明 | 探索睡眠调控的分子机制 | 脑干、皮层和下丘脑中的不同细胞类型（星形胶质细胞和神经元） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
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研究论文 | 本研究揭示顺铂通过靶向酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元中的特定亚群和K+通道导致神经毒性 | 首次在单细胞水平揭示顺铂神经毒性的特异性细胞靶点，发现K2P18.1钾通道在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本验证；维生素E的保护作用有限 | 探究顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 小鼠酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 单细胞转录组测序,电生理分析 | NA | 转录组数据,电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |