单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-27 |
Single-cell genomics revolutionizes plant development studies across scales
2022-03-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200179
PMID:35285482
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在植物发育研究中的应用及其技术发展 | 介绍了单细胞和单核分离技术在植物物种中的广泛应用，以及这些技术如何促进了植物器官中单细胞基因组学的研究 | NA | 强调单细胞基因组学在揭示植物器官内不同细胞类型发育轨迹中的贡献，并展示单细胞水平上组织和器官比较分析的努力 | 植物的组织、器官和整个生物体的发育 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 522 | 2024-08-27 |
Precision medicine in rheumatoid arthritis
2022-03, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2022.101742
PMID:35248489
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎（RA）的病理新见解，并讨论了将这些发现转化为临床实践中的可操作变化的关键步骤 | 应用单细胞转录组学和空间转录组学等细胞分析技术，揭示了RA关节组织中新的致病细胞类型和患者间细胞组成的显著异质性 | NA | 旨在强调RA病理学的新见解，并讨论将这些发现转化为临床实践中的可操作变化的关键步骤 | 类风湿性关节炎的病理机制及临床应用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 523 | 2024-08-27 |
Computational exploration of cellular communication in skin from emerging single-cell and spatial transcriptomic data
2022-02-28, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210863
PMID:35191953
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学和空间转录组学数据推断细胞间通信的计算工具，并强调了这些工具在探索皮肤发育、稳态、疾病和衰老中的细胞通信方面的生物学见解 | 利用空间转录组学数据结合细胞间通信分析，为理解组织结构和功能提供了新的方向 | 单细胞转录组学数据 inherently 丢失了细胞的空间信息 | 探索细胞间通信在组织发育和稳态中的作用 | 皮肤中的细胞间通信机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 524 | 2024-08-27 |
Single-cell eQTL analysis of activated T cell subsets reveals activation and cell type-dependent effects of disease-risk variants
2022-02-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abm2508
PMID:35213211
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研究论文 | 本文通过激活来自89名健康供体的CD4 T细胞并进行单细胞RNA测序，研究了遗传变异在细胞类型特异性和激活依赖性效应中的作用。 | 首次在单细胞水平上探讨了遗传变异对激活T细胞亚群的影响，并发现了新的疾病风险变异基因关联。 | 研究样本仅限于健康供体，可能限制了对疾病相关遗传变异效应的全面理解。 | 探索遗传变异在生物学相关背景下对细胞的影响。 | CD4 T细胞及其亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 89名健康供体的CD4 T细胞，超过100万个细胞 |
| 525 | 2024-08-27 |
Single-Cell RNA Sequencing of Urinary Cells Reveals Distinct Cellular Diversity in COVID-19-Associated AKI
2022-01-27, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0005522021
PMID:35368565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞，揭示了其细胞多样性和基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术非侵入性地研究COVID-19相关急性肾损伤的细胞变化，并提供了尿液膀胱细胞直接被SARS-CoV-2感染的初步证据 | 样本量较小，且仅包括住院患者 | 探究COVID-19相关急性肾损伤在尿液细胞中的表现和机制 | COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了30,076个细胞，来自8名COVID-19患者和4名非COVID-19急性肾损伤患者 |
| 526 | 2024-08-27 |
Loss of Function of the Neural Cell Adhesion Molecule NrCAM Regulates Differentiation, Proliferation and Neurogenesis in Early Postnatal Hypothalamic Tanycytes
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.832961
PMID:35464310
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研究论文 | 本文研究了神经细胞粘附分子NrCAM在早期新生小鼠下丘脑tanycytes中的功能丧失对分化、增殖和神经发生的影响 | 首次提供了NrCAM在成年小鼠tanycytes中调控作用的证据，并使用单细胞RNA测序技术揭示了tanycyte特异性基因表达的变化 | NrCAM缺陷小鼠中观察到的tanycyte减少和标记物丢失仅与轻微的代谢表型相关，可能需要进一步研究以揭示更深层次的影响 | 探讨NrCAM在tanycytes中的功能及其对细胞稳态的调控作用 | 下丘脑tanycytes及NrCAM的功能 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学分析、杂交分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠及E16胚胎小鼠 |
| 527 | 2024-08-27 |
Next-Generation and Single-Cell Sequencing Approaches to Study Atherosclerosis and Vascular Inflammation Pathophysiology: A Systematic Review
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.849675
PMID:35419441
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综述 | 本文综述了利用单细胞和下一代测序技术研究动脉粥样硬化和血管炎症病理生理学的现有数据 | 单细胞和下一代测序方法提供了比以往方法更高分辨率的阐明动脉粥样硬化的新手段 | 研究主要集中在平滑肌细胞、巨噬细胞和干细胞/祖细胞对疾病的贡献上，而对其他细胞类型如淋巴细胞和内皮细胞的贡献关注较少 | 旨在全面评估利用单细胞和下一代测序技术发表的数据，以识别动脉粥样硬化和血管炎症的关键细胞和分子贡献 | 动脉粥样硬化和血管炎症的病理生理学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序和下一代测序 | NA | 基因组数据 | 34项研究符合叙事综合分析，其中16篇文章仅使用单细胞测序，10篇使用下一代测序，8篇使用这两种方法的组合 |
| 528 | 2024-08-27 |
Analysis of Half a Billion Datapoints Across Ten Machine-Learning Algorithms Identifies Key Elements Associated With Insulin Transcription in Human Pancreatic Islet Cells
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.853863
PMID:35399953
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研究论文 | 本研究通过分析超过4.9亿个数据点，比较了10种不同的机器学习工作流程，以识别与人类胰腺单细胞转录组中胰岛素转录相关基因 | 本研究首次在大规模数据集上比较了多种机器学习算法，特别是随机森林算法显示出高预测能力和敏感性 | NA | 比较不同机器学习工作流程在大数据分析中的表现，并识别与胰岛素转录相关的关键元素 | 人类胰腺单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 机器学习 | 随机森林 | 转录组数据 | 训练数据集包含11,652个样本，验证数据集包含2,913个样本 |
| 529 | 2024-08-26 |
Identification and validation of a seven-gene prognostic marker in colon cancer based on single-cell transcriptome analysis
2022-04, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12041
PMID:35352485
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在结肠癌中识别并验证了一个包含七个基因的预后标志物。 | 通过单细胞RNA测序技术，本研究首次识别并验证了一个包含七个基因的预后标志物，为结肠癌的预后预测提供了新的潜在标志物。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别并验证结肠癌的预后标志物。 | 结肠癌患者的单细胞RNA测序数据、体细胞变异数据和临床报告。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析和最小绝对收缩与选择算子方法 | 转录组数据 | 结肠癌患者的数据，包括治疗前后的样本 |
| 530 | 2024-08-26 |
Prime-seq, efficient and powerful bulk RNA sequencing
2022-03-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02660-8
PMID:35361256
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研究论文 | 本文优化并验证了一种早期条形码批量RNA测序方法——prime-seq，展示了其与标准批量RNA测序方法TruSeq性能相当，但成本效率高出四倍 | prime-seq方法通过早期条形码技术，实现了成本效率的显著提升，且库成本降低了近50倍 | NA | 优化和验证一种成本效率高的早期条形码批量RNA测序方法 | prime-seq方法的性能和成本效率 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 531 | 2024-08-26 |
Decoding the multicellular ecosystem of vena caval tumor thrombus in clear cell renal cell carcinoma by single-cell RNA sequencing
2022-03-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02651-9
PMID:35361264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了8名透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的19个手术组织样本，揭示了肿瘤血栓形成的多细胞生态系统及其机制。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肿瘤血栓中的细胞类型和它们之间的相互作用，特别是肿瘤血栓中CD8+ T细胞和巨噬细胞的特征。 | 研究样本量较小，仅包括8名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入了解肿瘤血栓形成的机制，为设计有效的辅助治疗提供依据。 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤血栓组织。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 19个手术组织样本来自8名患者 |
| 532 | 2024-08-26 |
Hand2 delineates mesothelium progenitors and is reactivated in mesothelioma
2022-03-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29311-7
PMID:35354817
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研究论文 | 本文通过斑马鱼模型追踪了间皮细胞在侧板中胚层（LPM）中的起源，并发现hand2基因在间皮前体细胞中的表达特征，同时探讨了hand2在人和小鼠间皮瘤中的重新激活现象。 | 首次揭示了hand2基因在间皮前体细胞中的表达特征，并证实了其在人和小鼠间皮瘤中的重新激活，为理解间皮病理提供了新的视角。 | 研究主要基于斑马鱼模型，对人类和小鼠的验证尚需进一步的临床数据支持。 | 探究间皮细胞的起源及其在间皮瘤中的作用机制。 | 间皮细胞的前体细胞及其在间皮瘤中的表达特征。 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎和人类及小鼠的间皮瘤组织 |
| 533 | 2024-08-26 |
The landscape of receptor-mediated precision cancer combination therapy via a single-cell perspective
2022-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29154-2
PMID:35338126
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研究论文 | 本研究利用组合优化技术，通过单细胞转录组学数据分析，探索了癌症精准联合治疗的最佳组合策略 | 首次通过单细胞转录组学数据，利用组合优化技术，确定了针对癌症精准治疗的个性化组合策略 | 研究中使用的组合优化技术可能需要进一步验证其在临床应用中的有效性 | 旨在通过计算方法确定癌症精准治疗所需的靶点和数量 | 研究对象为1269个编码细胞表面受体的基因，这些基因可能是CAR-T、偶联抗体或涂层纳米粒子疗法的靶点 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | 组合优化 | 转录组数据 | 大规模单细胞转录组学数据集 |
| 534 | 2024-08-26 |
Dynamic single-cell RNA sequencing reveals BCG vaccination curtails SARS-CoV-2 induced disease severity and lung inflammation
2022-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.03.15.484018
PMID:35313583
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨BCG疫苗对COVID-19的影响，发现BCG疫苗能减轻SARS-CoV-2引起的疾病严重性和肺部炎症 | 首次通过单细胞RNA测序揭示BCG疫苗如何通过调节免疫细胞和基因表达来减轻COVID-19的严重性 | 研究仅在叙利亚金仓鼠模型中进行，可能需要进一步的人体试验验证 | 探讨BCG疫苗对COVID-19的影响及其免疫机制 | BCG疫苗对COVID-19的免疫保护作用及其对肺部炎症的影响 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 叙利亚金仓鼠模型 |
| 535 | 2024-08-26 |
The Power of Single-Cell RNA Sequencing in eQTL Discovery
2022-03-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13030502
PMID:35328055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在表达数量性状位点（eQTL）发现中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够在单细胞水平上评估基因表达的时空变化，揭示了使用传统批量RNA测序方法可能忽略的不同细胞类型、发育阶段和刺激下的eQTL | 文章指出单细胞eQTL研究在实验和分析方面仍需考虑未来的发展 | 探讨单细胞eQTL研究在大型群体遗传学中的应用，以更接近理解疾病的分子机制 | 单细胞RNA测序技术在eQTL发现中的方法学原理、优势、局限性及未来实验和分析考虑 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 536 | 2024-08-26 |
A Phase II Study of Pembrolizumab in Combination with Capecitabine and Oxaliplatin with Molecular Profiling in Patients with Advanced Biliary Tract Carcinoma
2022-03-11, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyab073
PMID:35274717
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研究论文 | 本研究评估了帕博利珠单抗与卡培他滨和奥沙利铂联合治疗晚期胆道癌的反应率和临床疗效 | 本研究强调了针对个体化胆道癌肿瘤精确表征的设计框架 | NA | 评估帕博利珠单抗与卡培他滨和奥沙利铂联合治疗晚期胆道癌的反应率和临床疗效 | 晚期胆道癌患者 | NA | 胆道癌 | 免疫组织化学（IHC） | NA | 肿瘤活检样本 | 11名患者 |
| 537 | 2024-08-26 |
Deciphering tissue structure and function using spatial transcriptomics
2022-03-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03175-5
PMID:35273328
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综述 | 本文综述了空间转录组学（ST）数据分析中的关键问题和当前应用的方法，并探讨了未来的发展方向 | NA | NA | 探讨空间转录组学数据分析中的问题和未来发展 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 538 | 2024-08-26 |
Single-cell RNA-seq reveals clonal diversity and prognostic genes of relapsed multiple myeloma
2022-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.757
PMID:35297204
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了复发性多发性骨髓瘤的克隆多样性和预后基因 | 首次通过单细胞RNA测序和可变多样性结合区域靶向测序技术，分析了多发性骨髓瘤细胞的克隆类型，并识别了与疾病进展和复发相关的潜在生物标志物 | 研究样本仅包括18名患者，可能不足以全面代表所有多发性骨髓瘤患者的情况 | 旨在通过单细胞技术解析多发性骨髓瘤的疾病异质性，并识别新的生物标志物以改善患者分层和治疗结果预测 | 新诊断的多发性骨髓瘤和难治性/复发性多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和可变多样性结合区域靶向测序（scVDJ-seq） | CCA算法 | 基因表达数据 | 18名患者，其中12名新诊断的多发性骨髓瘤患者和6名难治性/复发性多发性骨髓瘤患者 |
| 539 | 2024-08-26 |
Molecular divergence of mammalian astrocyte progenitor cells at early gliogenesis
2022-03-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199985
PMID:35253855
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哺乳动物大脑发育早期星形胶质细胞前体细胞（APCs）的分子分化 | 首次揭示了哺乳动物大脑发育早期APCs的分子分化，并发现了两个分子上不同的APC亚群，分别标记为Sparc和Sparcl1 | NA | 探究哺乳动物大脑发育过程中星形胶质细胞前体细胞的分子分化 | 胚胎小鼠前脑的前体细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 540 | 2024-08-26 |
Tumor Heterogeneity and Molecular Characteristics of Glioblastoma Revealed by Single-Cell RNA-Seq Data Analysis
2022-02-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13030428
PMID:35327982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了胶质母细胞瘤的肿瘤异质性和分子特征 | 本研究通过单细胞转录组数据分析，揭示了胶质母细胞瘤的异质性，并识别了94个在肿瘤和周边细胞中差异表达的基因，构建了组织特异性的共表达网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 本研究仅分析了四个原发性IDH-WT胶质母细胞瘤患者的3389个细胞，样本量较小 | 理解胶质母细胞瘤的异质性和疾病预后机制 | 胶质母细胞瘤的肿瘤异质性和分子特征 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3389个细胞，来自四个原发性IDH-WT胶质母细胞瘤患者 |