单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-23 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Acute Myocardial Infarction
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.908815
PMID:35844519
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性心肌梗死患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次揭示了在斑块破裂和非破裂情况下，不同免疫细胞亚群在急性心肌梗死中的具体作用 | 样本量较小，仅包括10名患者 | 探讨急性心肌梗死患者中斑块破裂与非破裂情况下循环免疫细胞的差异 | 急性心肌梗死患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名急性心肌梗死患者 |
| 522 | 2024-08-23 |
RNA-Seq of Single Fish Cells - Seeking Out the Leukocytes Mediating Immunity in Teleost Fishes
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.798712
PMID:35140719
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统研究中的应用，特别是揭示白细胞亚群及其相互作用对整体免疫反应的贡献 | 单细胞RNA测序技术揭示了白细胞群体的意外可塑性和异质性，改变了免疫学的几个长期范式 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在硬骨鱼类免疫系统中的应用，揭示白细胞亚群的个体贡献及其相互作用 | 硬骨鱼类的白细胞及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个鱼细胞 |
| 523 | 2024-08-22 |
Integrated hepatic single-cell RNA sequencing and untargeted metabolomics reveals the immune and metabolic modulation of Qing-Fei-Pai-Du decoction in mice with coronavirus-induced pneumonia
2022-Mar, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2021.153922
PMID:35032732
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研究论文 | 本研究通过整合肝单细胞RNA测序和非靶向代谢组学，探讨了清肺排毒汤对冠状病毒诱导的小鼠肺炎的免疫和代谢调节机制。 | 首次将肝单细胞RNA测序和非靶向代谢组学整合应用于中药配方中，揭示了清肺排毒汤对免疫功能和肝脏损伤的改善作用。 | NA | 研究清肺排毒汤在治疗冠状病毒诱导的小鼠肺炎中的作用机制。 | 清肺排毒汤对冠状病毒诱导的小鼠肺炎的免疫和代谢调节机制。 | 数字病理学 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学 | NA | RNA序列, 代谢数据 | BALB/c小鼠模型 |
| 524 | 2024-08-22 |
A matter of space and time: Emerging roles of disease-associated proteins in neural development
2022-01-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.10.035
PMID:34847355
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研究论文 | 本文探讨了神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的新兴角色 | 新证据表明，这些蛋白质在未成熟细胞中具有新颖的、不同的作用，特别是在神经系统在产前发育中的组装过程中 | NA | 探讨神经发育障碍中与疾病相关的蛋白质在神经发育中的作用 | 神经发育障碍中的突触蛋白和离子通道 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-08-22 |
Challenges and Opportunities for the Translation of Single-Cell RNA Sequencing Technologies to Dermatology
2022-Jan-04, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life12010067
PMID:35054460
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在皮肤生物学领域的最新进展，特别关注皮肤病理学及其向临床的转化 | 本文总结了单细胞分析的优势和局限性，有助于将这些新技术的新见解转化为临床应用 | 目前这些新技术的临床转化尚不足 | 总结单细胞RNA测序技术在皮肤生物学中的应用现状，并探讨其向临床转化的挑战与机遇 | 人类皮肤细胞类型及其在稳态和多种皮肤病中的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 大量 |
| 526 | 2024-08-22 |
A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15
2022-01-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210420
PMID:34846534
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研究论文 | 本文研究了肌肉再生过程中，一种表达生长因子的巨噬细胞亚群通过GDF-15调控再生性炎症的机制 | 首次揭示了GDF-15在肌肉再生中的作用及其调控机制，并识别出一种新的巨噬细胞亚群——生长因子表达巨噬细胞（GFEMs） | NA | 探讨肌肉再生过程中巨噬细胞亚群的特化及其在再生性炎症中的作用 | 肌肉再生过程中的巨噬细胞及其表达的GDF-15 | NA | NA | 基因表达动力学聚类分析，免疫单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 受伤肌肉中分离的Ly6Chigh和Ly6Clow巨噬细胞 |
| 527 | 2024-08-21 |
Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell levels
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab878
PMID:34591957
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research paper | 本文介绍了一个名为Gene Expression Nebulas（GEN）的综合数据门户，该门户整合了多个物种在批量和单细胞层面的转录组数据 | GEN通过使用标准化的数据处理流程和结构化的管理模型，收集了高质量的批量和单细胞RNA测序数据集 | NA | 旨在提供一个全面的转录组数据集，以更好地理解从组织到细胞的遗传调控结构和功能机制 | 多个物种的转录组数据 | NA | NA | RNA sequencing | NA | transcriptomic profiles | 50,500个样本和15,540,169个细胞，涵盖30个物种 |
| 528 | 2024-08-19 |
Diminished function of cytotoxic T- and NK- cells in severe alcohol-associated hepatitis
2022-Dec, Metabolism and target organ damage
DOI:10.20517/mtod.2022.13
PMID:39148503
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研究论文 | 本研究探讨了严重酒精相关肝炎（sAH）患者中细胞毒性T细胞和NK细胞的功能减退及其机制 | 首次使用单细胞RNA测序和多面板细胞内流式细胞术分析sAH患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs），揭示了NK细胞和CD8 T细胞中关键受体的下调 | 样本量较小，仅为4例sAH患者和7-8例健康对照者 | 理解代谢性肝病患者免疫反应的机制，特别是sAH患者中细胞毒性细胞的功能减退 | 严重酒精相关肝炎患者的细胞毒性NK细胞和CD8 T细胞 | 免疫学 | 酒精相关肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多面板细胞内流式细胞术 | NA | RNA | 4例sAH患者和7-8例健康对照者 |
| 529 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing to characterize the response of pancreatic cancer to anti-PD-1 immunotherapy
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101262
PMID:34768100
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研究论文 | 本研究通过建立四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型，利用单细胞RNA测序技术分析了αPD-1抗体治疗对胰腺癌的响应，揭示了肿瘤微环境中免疫细胞的差异及其与免疫治疗响应的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制，特别是肿瘤相关巨噬细胞与效应CD8 T细胞的失衡对治疗响应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在临床样本中验证这些发现 | 探究胰腺癌对αPD-1免疫治疗的响应机制 | 胰腺癌及其对αPD-1免疫治疗的响应 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种不同胰腺癌细胞系的原位胰腺癌小鼠模型 |
| 530 | 2024-08-18 |
Omnibus and robust deconvolution scheme for bulk RNA sequencing data integrating multiple single-cell reference sets and prior biological knowledge
2022-09-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac563
PMID:35980155
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Integrated and Robust Deconvolution (InteRD)的算法，用于从目标批量RNA测序数据中推断细胞类型比例 | InteRD算法通过创新的惩罚回归和新的评估标准，能够有效整合来自多个单细胞RNA测序数据集的去卷积结果，并考虑额外的生物信息作为先验，从而校准基于参考的去卷积估计 | NA | 开发一种新的去卷积方法，以提高从批量RNA测序数据中推断细胞类型比例的准确性和鲁棒性 | 批量RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 惩罚回归 | RNA测序数据 | NA |
| 531 | 2024-08-17 |
Quantification of extracellular proteins, protein complexes and mRNAs in single cells by proximity sequencing
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01684-z
PMID:36456784
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研究论文 | 本文介绍了近端测序（Prox-seq）技术，该技术能够在数千个单细胞中同时测量蛋白质、蛋白质复合物和mRNA | Prox-seq结合了近端连接 assay 和单细胞测序，能够从所有目标蛋白质的成对组合中测量蛋白质及其复合物，提供了平方级扩展的多重分析能力 | NA | 验证Prox-seq技术并分析其在不同细胞类型中的应用，探索蛋白质相互作用 | T细胞、B细胞、人外周血单个核细胞、人巨噬细胞 | 生物技术 | NA | 近端测序（Prox-seq） | NA | 蛋白质、蛋白质复合物、mRNA | 数千个单细胞 |
| 532 | 2024-08-17 |
Unsupervised discovery of tissue architecture in multiplexed imaging
2022-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01657-2
PMID:36316562
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研究论文 | 本文开发了一种名为UTAG的方法，用于在无监督的情况下识别和量化多重成像中的微解剖组织结构 | UTAG方法能够结合细胞表型信息和细胞物理接近度，准确识别健康和疾病组织中的器官特异性微解剖域 | NA | 解决多重成像和空间转录组学中对组织高阶模式理解不足的问题 | 多重成像中的微解剖组织结构 | 数字病理学 | NA | 多重成像 | NA | 图像 | 多种健康和疾病状态的图像 |
| 533 | 2024-08-17 |
Targeting Glutamine Metabolism to Enhance Immunoprevention of EGFR-Driven Lung Cancer
2022-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105885
PMID:35861366
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研究论文 | 本文报道了一种口服活性谷氨酰胺拮抗剂前药JHU083，其在EGFR驱动的肺癌小鼠模型中显示出强大的抗癌效果，并与EGFR肽疫苗EVax联合使用时显著抑制肺癌发展 | JHU083通过抑制谷氨酰胺代谢，增加CD8 T细胞和CD4 Th1细胞的浸润，减少免疫抑制细胞，从而增强EVax的免疫预防效果 | NA | 研究谷氨酰胺代谢在EGFR驱动的肺癌免疫预防中的作用 | EGFR驱动的肺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 534 | 2024-08-17 |
Single-cell analysis identifies the interaction of altered renal tubules with basophils orchestrating kidney fibrosis
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01200-7
PMID:35552540
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了肾脏纤维化过程中的免疫过程，特别是肾小管细胞与嗜碱性粒细胞的相互作用。 | 首次揭示了嗜碱性粒细胞在肾脏纤维化中的作用，并提出了针对这些细胞的治疗策略。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证结果。 | 阐明肾脏纤维化过程中的免疫机制，并探索潜在的治疗方法。 | 肾小管细胞、嗜碱性粒细胞及其在肾脏纤维化中的作用。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类肾脏样本 |
| 535 | 2024-08-12 |
MuSiC2: cell-type deconvolution for multi-condition bulk RNA-seq data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac430
PMID:36208175
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研究论文 | 本文提出了一种名为MuSiC2的迭代估计程序，用于在多临床条件下对bulk RNA-seq数据进行细胞类型反卷积分析 | MuSiC2是MuSiC的扩展，能够在单细胞参考与bulk样本临床条件不同时，提高细胞类型比例估计的准确性 | 现有的细胞类型反卷积方法通常需要与bulk RNA-seq数据临床条件相匹配的单细胞RNA-seq数据作为参考，这在疾病样本中获取较为困难 | 旨在解决在不同临床条件下，使用单细胞RNA-seq参考数据进行bulk RNA-seq数据反卷积时可能导致的细胞类型比例估计偏差问题 | 研究对象包括来自人类胰腺胰岛和视网膜的两个bulk RNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | MuSiC2 | RNA-seq数据 | 涉及两个bulk RNA-seq数据集，一个来自人类胰腺胰岛，另一个来自人类视网膜 |
| 536 | 2024-08-11 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
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研究论文 | 本文介绍了一个使用BASiCS Bioconductor包的计算工作流程，用于稳健地量化单细胞RNA测序数据中的表达变异性 | BASiCS工作流程整合了数据标准化、技术噪声量化和下游分析的框架，能够在单一细胞群体中识别高度变异和低度变异的基因，并使用概率决策规则识别细胞群体间表达变异性的变化 | NA | 量化单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 537 | 2024-08-09 |
Concurrent delivery of immune checkpoint blockade modulates T cell dynamics to enhance neoantigen vaccine-generated antitumor immunity
2022-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00352-7
PMID:35393580
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研究论文 | 本文研究了新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤特异性T细胞反应的影响 | 通过单细胞测序揭示了联合治疗诱导的特定CD8 T细胞群体的特征，这些细胞具有活跃的趋化因子信号、较低的共抑制受体表达和较高的细胞毒性 | NA | 探讨新抗原疫苗与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤控制的有效性及其机制 | 新抗原疫苗生成的T细胞与免疫检查点阻断的协同作用 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 超过100,000个T细胞 |
| 538 | 2024-08-09 |
Blocking LAIR1 signaling in immune cells inhibits tumor development
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.996026
PMID:36211388
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研究论文 | 本文研究了通过阻断免疫细胞中的LAIR1信号来抑制肿瘤发展的效果 | 开发了特异性的拮抗性抗LAIR1单克隆抗体，并研究了其在癌症治疗中的免疫激活作用 | NA | 探索新的癌症免疫学分子靶点和治疗策略 | 免疫细胞中的LAIR1信号阻断对肿瘤发展的影响 | 癌症免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了同源人类LAIR1转基因小鼠模型 |
| 539 | 2024-08-07 |
Transcriptional and Immune Landscape of Cardiac Sarcoidosis
2022-09-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320449
PMID:36111531
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了心脏肉瘤病中的细胞和转录组景观，并识别了其与其它炎症性心脏疾病的差异 | 本研究首次通过空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了心脏肉瘤病中免疫细胞的多样性和独特的分子特征 | NA | 阐明心脏肉瘤病中的细胞和转录组景观，并区分其与其它炎症性心脏疾病的差异 | 心脏肉瘤病中的免疫细胞类型及其转录组景观 | 数字病理学 | 心脏肉瘤病 | 空间转录组学（GeoMx数字空间分析仪）和单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类心脏肉瘤病样本 |
| 540 | 2024-08-07 |
Brain cancer stem cells: resilience through adaptive plasticity and hierarchical heterogeneity
2022-09, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00486-x
PMID:35710946
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综述 | 本文综述了脑癌干细胞如何通过适应性可塑性和层次异质性在脑肿瘤生态系统中维持其动态特性，并探讨了单细胞测序等技术进步如何帮助我们更好地理解这些机制以用于治疗目的 | 利用单细胞测序等技术深入探讨脑癌干细胞的生物机制，并探索这些机制如何被用于治疗 | NA | 探讨脑癌干细胞的生物机制及其在治疗中的应用潜力 | 脑癌干细胞及其在脑肿瘤中的作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |