单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4052 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-30 |
Intrinsic entropy model for feature selection of scRNA-seq data
2022-06-08, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac008
PMID:35102420
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研究论文 | 本文提出了一种基于内在熵模型的特征选择方法，用于提高scRNA-seq数据聚类分析的准确性 | 通过推导熵分解公式，提出了一种新的特征选择方法——内在熵（IE）模型，用于识别信息丰富的基因 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的特征基因选择 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 内在熵（IE）模型 | scRNA-seq数据 | 模拟数据集和真实单细胞数据集 |
| 502 | 2024-08-30 |
Alveolar Basal Cells Differentiate towards Secretory Epithelial- and Aberrant Basaloid-like Cells In Vitro
2022-06-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11111820
PMID:35681516
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析体外培养的肺泡基底细胞在不同培养条件下的转录组特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了肺泡基底细胞在不同培养条件下的转录组变化 | NA | 探究特发性肺纤维化中肺泡基底细胞的分化过程及其转录组特征 | 肺泡基底细胞及其在不同培养条件下的转录组 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自外周纤维化肺组织的肺泡基底细胞 |
| 503 | 2024-08-30 |
Bronchial epithelium epithelial-mesenchymal plasticity forms aberrant basaloid-like cells in vitro
2022-06-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00254.2021
PMID:35438006
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研究论文 | 本研究探讨了上皮-间质转化（EMT）在支气管上皮细胞中形成异常基底样细胞的作用，并通过批量和单细胞RNA测序分析了EMT诱导的转录变化。 | 本研究首次揭示了支气管上皮细胞在体外通过EMT形成异常基底样细胞的转录变化，并提供了单细胞RNA-Seq数据的交互式浏览器。 | 研究未发现EMT诱导后细胞向成纤维细胞/肌成纤维细胞转化的证据，且仅显示部分EMT基因特征。 | 阐明EMT在支气管上皮细胞中形成异常基底样细胞的作用。 | 人支气管上皮细胞在不同培养条件下的转录变化。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序 | NA | RNA | 8,247个蛋白质编码基因和1,621个长非编码RNA基因在不同培养条件下的差异表达，以及6,020个蛋白质编码基因和907个长非编码RNA基因在EMT诱导后的转录重编程。 |
| 504 | 2024-08-30 |
Astrocytes and oligodendrocytes undergo subtype-specific transcriptional changes in Alzheimer's disease
2022-06-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.03.008
PMID:35381189
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研究论文 | 本研究使用单核RNA测序技术（snRNA-seq）分析了阿尔茨海默病（AD）患者和非症状对照组大脑中星形胶质细胞和少突胶质细胞的转录组变化 | 本研究首次利用snRNA-seq技术详细描述了AD患者中星形胶质细胞和少突胶质细胞的亚型特异性转录组变化，并结合空间转录组学资源，揭示了健康和炎症大脑中星形胶质细胞亚型的定位 | 研究主要集中在星形胶质细胞和少突胶质细胞的转录组分析，未涉及其他类型细胞的贡献 | 深入理解阿尔茨海默病中胶质细胞的转录组异质性 | 阿尔茨海默病患者的星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | APOE Ɛ2/3人类AD患者和年龄及基因型匹配的非症状（NS）大脑样本 |
| 505 | 2024-08-30 |
Male-Specific Activation of Lysine Demethylases 5B and 5C Mediates Alcohol-Induced Liver Injury and Hepatocyte Dedifferentiation
2022-06, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1895
PMID:35084807
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研究论文 | 本研究探讨了酒精相关肝病（ALD）中性别特异性的生物学途径，特别是在雄性小鼠中酒精诱导的肝细胞去分化和肿瘤发展。 | 发现了酒精在雄性小鼠中通过激活KDM5B和KDM5C去甲基酶促进肝细胞去分化和肿瘤发展的新机制。 | 研究主要集中在雄性小鼠，对雌性小鼠的影响未深入探讨。 | 定义酒精暴露下肝脏的性别特异性途径。 | 雄性和雌性小鼠的肝脏细胞。 | NA | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq） | NA | RNA序列数据 | 雄性和雌性小鼠的肝脏细胞 |
| 506 | 2024-08-30 |
Mapping the cardiac vascular niche in heart failure
2022-05-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30682-0
PMID:35641541
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研究论文 | 本文通过结合遗传命运追踪与共聚焦成像以及单细胞RNA测序技术，研究了心脏血管和周围血管微环境在稳态和心力衰竭期间的细胞类型特异性转录组变化。 | 本文揭示了纤维母细胞、内皮细胞、周细胞和血管平滑肌细胞亚型在心力衰竭期间的特异性转录组变化，并识别了调控纤维母细胞活化的转录因子TEAD1。 | NA | 研究心脏血管和周围血管微环境在心力衰竭期间的细胞异质性和对损伤的反应。 | 心脏血管和周围血管微环境的细胞类型特异性转录组变化。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 507 | 2024-08-30 |
Identifying tumor cells at the single-cell level using machine learning
2022-05-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02683-1
PMID:35637521
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研究论文 | 本文提出了一种名为ikarus的机器学习管道，用于在单细胞水平上区分肿瘤细胞和正常细胞 | ikarus能够在多个实验环境中实现高灵敏度和特异性 | NA | 旨在解决单细胞或空间测序实验中肿瘤细胞的识别问题 | 肿瘤细胞和正常细胞的区分 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习管道 | 单细胞数据集 | 多个单细胞数据集 |
| 508 | 2024-08-30 |
Modern venomics-Current insights, novel methods, and future perspectives in biological and applied animal venom research
2022-05-18, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giac048
PMID:35640874
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综述 | 本文综述了现代毒液学领域的最新进展和新策略，探讨了技术革新和多组学方法如何显著提升对有毒动物毒液的研究 | 文章介绍了CRISPR和敲降技术在研究基因组及其修饰中的应用，以及质谱成像与空间转录组学、原位杂交技术和现代计算机断层扫描技术在毒液系统空间分布和功能研究中的应用 | NA | 探讨毒液成分的进化、功能及其在不同发育阶段的生物学意义，以及毒液在农业化学、制药、治疗和诊断等领域的应用 | 有毒动物的毒液及其成分 | 生物学 | NA | CRISPR, 质谱成像, 空间转录组学, 原位杂交技术, 计算机断层扫描 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质 | NA |
| 509 | 2024-08-30 |
Distinct phenotypic states and spatial distribution of CD8+ T cell clonotypes in human brain metastases
2022-05-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100620
PMID:35584630
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研究论文 | 本文分析了人脑转移瘤中CD8+ T细胞克隆型的不同表型状态和空间分布 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了增殖和耗竭的CD8 T细胞之间存在显著的克隆重叠，但与其他肿瘤浸润CD8 T细胞和循环中的CD8 T细胞克隆重叠最小 | NA | 研究脑转移瘤中CD8 T细胞的表型状态和空间分布，以探索针对脑转移瘤的免疫治疗新靶点 | 人脑转移瘤中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 510 | 2024-08-30 |
Single-cell transcriptomics reveals age-resistant maintenance of cell identities, stem cell compartments and differentiation trajectories in long-lived naked mole-rats skin
2022-05-04, Aging
DOI:10.18632/aging.204054
PMID:35507806
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了裸鼹鼠皮肤在长寿过程中细胞身份、干细胞区室和分化轨迹的年龄抵抗性维持 | 研究发现裸鼹鼠皮肤在衰老过程中保持了细胞类型和皮肤区室的稳定性，干细胞数量恒定，且表皮基因表达未随年龄变化 | NA | 探讨裸鼹鼠皮肤在长寿过程中的细胞和遗传特征 | 裸鼹鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年裸鼹鼠 |
| 511 | 2024-08-30 |
Microfluidic cell sorter sample preparation for genomic assays
2022-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0092358
PMID:35698630
|
研究论文 | 本文探讨了微流控细胞分选技术在基因组测序样本准备中的应用 | 介绍了NanoCellect Biomedical开发的WOLF Cell Sorter和WOLF G2微流控细胞分选器，这些设备使用温和的分选技术，兼容多种RNA测序平台 | 传统的液滴式分选器存在操作复杂、可访问性差以及可能对细胞造成压力的问题 | 研究如何通过微流控分选技术提高单细胞转录组学的样本质量 | 单细胞RNA测序样本的准备和细胞分选技术 | NA | NA | 微流控技术，RNA测序 | NA | 细胞 | 未具体说明 |
| 512 | 2024-08-30 |
Spatial transcriptomic analysis reveals inflammatory foci defined by senescent cells in the white matter, hippocampi and cortical grey matter in the aged mouse brain
2022-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-022-00521-7
PMID:35098444
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研究论文 | 本文通过空间转录组学方法分析了老年小鼠大脑中细胞衰老的空间分布及其与神经炎症的关系 | 首次使用空间转录组学技术，结合组织学信息，精确地定位了老年小鼠大脑中包含衰老细胞的微域，并分析了这些区域的基因表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性和可靠性 | 探讨衰老细胞在大脑中的空间分布及其与年龄相关认知衰退的关系 | 老年C57BL/6小鼠的大脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 3个月和28个月大的C57BL/6小鼠各若干只 |
| 513 | 2024-08-30 |
Vemurafenib acts as a molecular on-off switch governing systemic inflammation in Langerhans cell histiocytosis
2022-02-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005442
PMID:34619771
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研究论文 | 本文报道了一名Langerhans细胞组织细胞增生症（LCH）患者在接受vemurafenib和挽救性化疗联合治疗后，实现了持续的临床和分子缓解的全面分析 | 研究发现vemurafenib能快速、高效但可逆地抑制系统性炎症的临床表现，并且炎症细胞因子的血清水平与vemurafenib的使用完全一致 | NA | 探讨vemurafenib在LCH治疗中的作用及其对系统性炎症的影响 | LCH患者及其细胞类型 | NA | Langerhans细胞组织细胞增生症 | 单细胞转录组分析 | NA | 血液和骨髓细胞 | 一名LCH患者 |
| 514 | 2024-08-30 |
Glycan Profiling by Sequencing to Uncover Multicellular Communication: Launching Glycobiology in Single Cells and Microbiomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.919168
PMID:35712658
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGR-seq的新技术，用于在单细胞水平上同时分析糖类和RNA，并将其应用于异质细胞群和微生物群的表面糖类分析 | 首次开发了一种能够在单细胞水平上分析糖组的技术，通过使用DNA条形码凝集素将糖信息转化为基因信息，从而实现糖类和RNA的同时分析 | NA | 探索糖类在细胞间和细胞与微生物间通信中的功能，扩展糖生物学到单细胞和微生物群水平 | 单细胞和微生物群中的糖类 | 生物技术 | NA | scGR-seq | NA | 糖类和RNA | 异质细胞群和微生物群中的单个细胞 |
| 515 | 2024-08-30 |
Myocardial-Treg Crosstalk: How to Tame a Wolf
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914033
PMID:35693830
|
综述 | 本文综述了心肌梗死（MI）后心肌调节T细胞（Tregs）在组织修复和局部炎症控制中的核心作用 | 讨论了心肌微环境如何通过塑造肌球蛋白特异性T细胞向调节表型发展，从而控制潜在的自体攻击性局部免疫反应 | NA | 探讨心肌梗死后免疫系统如何通过Tregs协调组织修复和控制炎症反应 | 心肌调节T细胞（Tregs）及其在心肌梗死修复中的作用 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学和T细胞受体分析 | NA | 图像 | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 516 | 2024-08-08 |
Identifying In Vitro Cultured Human Hepatocytes Markers with Machine Learning Methods Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.916309
PMID:35706505
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和机器学习方法，识别体外培养的人肝细胞在不同分化时期的标志物 | 本研究通过先进的计算分析方法，解决了肝细胞分化过程中的异质性问题，并挖掘了不同分化时期的生物标志物 | NA | 阐明肝细胞发育的过程和机制，为细胞移植相关的肝病治疗策略提供潜在目标 | 体外培养的人肝细胞及其分化过程中的标志物 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林、k-最近邻、决策树 | 转录组数据 | 一批压缩和有效的分类特征 |
| 517 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell-cell interactions underlying the bone repair process
2022-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2022.05.001
PMID:35619947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了骨骼前体细胞在骨修复过程中的异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞分辨率下描述了多潜能骨骼前体细胞及其分化方向，并识别了Ccl9信号通路作为骨再生的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 深入理解骨骼前体细胞在骨修复过程中的行为及其分子机制 | 骨骼前体细胞及其在骨修复中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用Sox9-CreERT2;R26R tdTomato小鼠模型进行线粒体追踪和单细胞RNA测序分析 |
| 518 | 2024-08-29 |
The power of single-cell transcriptomics in cardiovascular disease
2022-Jul, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00109-6
PMID:39196239
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-08-29 |
Intrahepatic inflammatory IgA+PD-L1high monocytes in hepatocellular carcinoma development and immunotherapy
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003618
PMID:35577505
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研究论文 | 本研究探讨了炎症诱导的肝内炎症性IgA+单核细胞在肝细胞癌（HCC）发展中的作用 | 发现血清IgA水平与慢性肝病和HCC中的肝内及肿瘤内炎症性IgA+PD-L1高表达单核细胞浸润相关，为潜在的治疗靶点提供了依据 | NA | 阐明炎症诱导的肝内炎症性IgA+单核细胞在肝细胞癌发展中的作用 | 肝细胞癌患者及其肝内炎症性IgA+单核细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫组织化学、多色流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 组织样本、血液样本 | 包括61例脂肪性肝炎患者和271例HCC患者 |
| 520 | 2024-08-29 |
Single-Cell RNA-seq Reveals a Developmental Hierarchy Super-Imposed Over Subclonal Evolution in the Cellular Ecosystem of Prostate Cancer
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105530
PMID:35322584
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研究论文 | 研究者通过单细胞RNA测序技术分析了14名未经治疗的前列腺癌患者的细胞，构建了一个详细的前列腺癌细胞图谱，并揭示了肿瘤亚克隆进化与转录异质性之间的关系 | 首次将发育层次结构映射到肿瘤亚克隆进化上，并识别了四种转录亚型，这些亚型在干细胞样和分化状态中呈层次结构 | 研究仅限于14名未经治疗的前列腺癌患者，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探讨前列腺癌中亚克隆进化与转录异质性之间的关系及其对患者预后的影响 | 前列腺癌患者的肿瘤细胞及其亚克隆和转录异质性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14名未经治疗的前列腺癌患者 |