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当前共找到 4054 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-09-23 |
Matrix Inversion and Subset Selection (MISS): A pipeline for mapping of diverse cell types across the murine brain
2022-04-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2111786119
PMID:35363567
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Matrix Inversion and Subset Selection (MISS)的开源计算管道，用于推断小鼠大脑中多种神经细胞类型的定量验证分布 | MISS通过基因子集选择这一预处理步骤，显著提高了细胞类型图谱的准确性，并展示了其可推广性 | NA | 填补当前实验方法未能全面绘制小鼠大脑中神经和非神经细胞类型分布图谱的知识空白 | 小鼠大脑中的神经细胞类型分布 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 (RNAseq) 和原位杂交 | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-09-23 |
Quantifying chromosomal instability from intratumoral karyotype diversity using agent-based modeling and Bayesian inference
2022-04-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69799
PMID:35380536
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研究论文 | 本文开发了一种框架，通过考虑核型选择，使用模拟和模型选择来量化染色体不稳定性（CIN） | 本文提出了一种新的方法，通过模拟和贝叶斯推断来量化CIN，并考虑了核型选择的影响 | 本文的实验验证仅限于化疗药物紫杉醇，且样本量较小 | 开发一种量化人类肿瘤中CIN的方法，并将其发展为预测性生物标志物 | 染色体不稳定性（CIN）及其在癌症中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯推断 | 核型数据 | 实验验证中使用了化疗药物紫杉醇处理的细胞，临床样本的具体数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-09-23 |
Metabolism drives macrophage heterogeneity in the tumor microenvironment
2022-04-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110609
PMID:35385733
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤微环境中的代谢驱动异质性 | 首次揭示了TAMs在转录、发育、代谢和功能层面的高度异质性，并发现嘌呤代谢是促进肿瘤和终末分化TAMs的特征 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，可能需要更多临床数据验证 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的代谢与表型关系 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及其代谢模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠肝脏转移瘤和人类TAMs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-09-23 |
Cell type and gene expression deconvolution with BayesPrism enables Bayesian integrative analysis across bulk and single-cell RNA sequencing in oncology
2022-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00356-3
PMID:35469013
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研究论文 | 开发了一种贝叶斯方法BayesPrism，用于从批量RNA测序数据中推断单细胞组成和基因表达，并在多种肿瘤类型中进行综合分析 | 引入了一种新的贝叶斯方法BayesPrism，能够准确推断大规模批量RNA测序数据中的细胞组成和表达 | NA | 解决从批量RNA测序数据中推断单细胞组成和基因表达的问题，并在肿瘤学中进行综合分析 | 主要胶质母细胞瘤、头颈鳞状细胞癌和皮肤黑色素瘤 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA测序 | 贝叶斯方法 | RNA测序数据 | 多种肿瘤类型的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-09-23 |
Antigen identification and high-throughput interaction mapping by reprogramming viral entry
2022-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01436-z
PMID:35396484
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研究论文 | 本文介绍了一种通过重新编程病毒进入机制来识别抗原并进行高通量相互作用映射的技术 | 本文提出了一种新的方法，结合病毒假型化和分子工程技术，通过在慢病毒表面展示抗原并在病毒基因组中编码其身份，实现了抗原和受体的配对 | NA | 解码免疫识别，以理解广泛的疾病并开发有效的疫苗和免疫疗法 | 抗原和免疫受体的相互作用 | NA | NA | 病毒假型化、分子工程 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-09-23 |
Obesity alters pathology and treatment response in inflammatory disease
2022-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04536-0
PMID:35355021
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研究论文 | 研究肥胖对特应性皮炎病理和治疗反应的影响 | 首次揭示肥胖通过改变T细胞分化和PPARγ活性，影响特应性皮炎的免疫反应和生物治疗效果 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨肥胖如何影响免疫疾病病理和治疗反应 | 肥胖和正常体重小鼠的特应性皮炎模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序和全基因组结合分析 | NA | 基因表达数据 | 两组小鼠模型，每组若干只 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-09-23 |
B lymphocyte-derived acetylcholine limits steady-state and emergency hematopoiesis
2022-04, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01165-7
PMID:35352063
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研究论文 | 本文探讨了B淋巴细胞衍生的乙酰胆碱如何调节骨髓中的造血功能 | 首次揭示了B淋巴细胞是乙酰胆碱的重要来源，并阐明了其在调节造血中的作用 | 仅限于小鼠和心血管疾病患者的研究，缺乏更广泛的人类样本 | 研究副交感神经信号如何调节造血功能 | B淋巴细胞衍生的乙酰胆碱及其在骨髓造血中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和心血管疾病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-09-23 |
Analyzing Spatial Transcriptomics Data Using Giotto
2022-Apr, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.405
PMID:35384407
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研究论文 | 本文介绍了Giotto工具箱在空间转录组数据分析和可视化中的应用 | 开发了Giotto作为全面、通用且用户友好的工具箱，用于空间转录组数据分析 | NA | 帮助用户熟悉Giotto环境并有效应用于新数据集的分析 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | 隐藏马尔可夫随机场模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-09-23 |
Inflammatory blockade prevents injury to the developing pulmonary gas exchange surface in preterm primates
2022-03-30, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl8574
PMID:35353543
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研究论文 | 研究探讨了炎症阻断对早产灵长类动物发育中的肺气体交换表面的保护作用 | 首次使用单细胞RNA测序分析定义了多细胞肺泡信号微环境，并展示了炎症阻断对肺损伤的保护作用 | 研究仅限于灵长类动物模型，尚未在人类中验证 | 探讨炎症对早产儿肺发育的影响及炎症阻断的治疗潜力 | 早产灵长类动物的肺发育和炎症反应 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 早产灵长类动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-09-20 |
Single-cell transcriptome reveals insights into the development and function of the zebrafish ovary
2022-05-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.76014
PMID:35588359
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序技术研究了斑马鱼卵巢的发育和功能 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼卵巢中不同细胞亚群的转录组特征，并发现了新的细胞亚群 | 基因敲除实验仅限于少数基因，未来需要进一步扩展以全面理解卵巢发育和功能的调控机制 | 揭示斑马鱼卵巢发育和功能的分子机制 | 斑马鱼卵巢中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10,658个生殖细胞和14,431个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-09-20 |
Noninvasive Low-Frequency Pulsed Focused Ultrasound Therapy for Rheumatoid Arthritis in Mice
2022, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0013
PMID:39290964
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研究论文 | 研究低频脉冲聚焦超声（LFPFU）对小鼠类风湿性关节炎的治疗效果及其对免疫细胞的影响 | 首次揭示了低频脉冲聚焦超声对类风湿性关节炎小鼠模型的治疗效果，并详细分析了其对免疫细胞亚群的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨低频脉冲聚焦超声治疗类风湿性关节炎的机制及其对免疫细胞的影响 | 类风湿性关节炎小鼠模型及其免疫细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 低频脉冲聚焦超声 | NA | 细胞 | DBA/1J小鼠模型中的类风湿性关节炎小鼠及其免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-09-19 |
Microenvironmental Landscape of Human Melanoma Brain Metastases in Response to Immune Checkpoint Inhibition
2022-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0870
PMID:35706413
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研究论文 | 研究了黑色素瘤脑转移瘤（MBM）在免疫检查点抑制剂（ICI）作用下的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次对MBM的TME进行了单细胞RNA测序和T细胞受体克隆型分析，揭示了TME中髓系细胞的异质性和中性粒细胞的不同状态，以及这些特征与ICI反应的关系 | 样本量较小，仅收集了32个新鲜MBM样本 | 探讨MBM在ICI作用下的TME特征及其与ICI反应的关系 | 黑色素瘤脑转移瘤（MBM）的肿瘤微环境（TME）和T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 32个新鲜MBM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-09-19 |
Biological Sequence Classification: A Review on Data and General Methods
2022, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0011
PMID:39285948
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综述 | 本文综述了基于机器学习的生物序列分类方法及其在DNA、RNA、蛋白质和肽的功能和修饰分类中的应用 | 本文旨在建立一个长期支持网站，提供详细的分类方法信息和相关数据集的下载链接 | 本文未深入探讨所有已开发的生物序列分类模型及其具体方法的细节 | 综述生物序列分类的研究现状，并探讨未来的挑战和前景 | 生物序列数据及其在DNA、RNA、蛋白质和肽的功能和修饰分类中的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-09-17 |
Identification of visual cortex cell types and species differences using single-cell RNA sequencing
2022-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34590-1
PMID:36371428
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了133,454个猕猴视觉皮层细胞，识别了多种细胞类型及其在不同物种间的基因表达差异 | 本文首次建立了大规模的猕猴视觉皮层单细胞RNA测序数据集，并发现了两种新的细胞类型，以及不同物种间在突触可塑性和神经调节相关基因表达上的差异 | 本文仅分析了猕猴、人类和小鼠的视觉皮层细胞，未涉及其他物种 | 研究灵长类视觉皮层的细胞类型及其在不同物种间的差异 | 猕猴、人类和小鼠的视觉皮层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 133,454个猕猴视觉皮层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-09-17 |
Single-cell multi-omics of human clonal hematopoiesis reveals that DNMT3A R882 mutations perturb early progenitor states through selective hypomethylation
2022-10, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01179-9
PMID:36138229
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研究论文 | 本文利用单细胞多组学技术研究了DNMT3A R882突变在人类克隆造血中的影响 | 首次通过单细胞多组学技术捕获了DNMT3A R882突变个体的基因型、转录组和甲基化组，揭示了突变通过选择性低甲基化影响早期祖细胞状态的机制 | 研究仅限于DNMT3A R882突变个体，且样本量较小 | 探讨DNMT3A R882突变在克隆造血中的下游效应 | DNMT3A R882突变个体的造血祖细胞 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞多组学测序 | NA | 基因型、转录组、甲基化组 | 少量DNMT3A R882突变个体 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-09-17 |
Self-supervised learning of cell type specificity from immunohistochemical images
2022-06-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac263
PMID:35758799
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研究论文 | 本文开发了一种从无标签的免疫组化图像中预测蛋白质标记物细胞类型特异性的方法 | 利用自监督学习目标训练卷积神经网络生成图像嵌入，并通过非线性降维观察模型根据细胞类型和解剖区域对图像进行聚类，无需人工标注图像 | NA | 改进蛋白质标记物的细胞类型特异性识别 | 免疫组化图像中的细胞类型特异性 | 计算机视觉 | NA | 免疫组化 | 卷积神经网络 | 图像 | 数千个抗体在人体组织中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-09-17 |
Salivary gland organoid culture maintains distinct glandular properties of murine and human major salivary glands
2022-06-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30934-z
PMID:35672412
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研究论文 | 本文介绍了在小鼠和人唾液腺类器官培养中维持特定腺体特性的方法 | 首次建立了长期的小鼠和人类唾液腺类器官培养，并展示了这些类器官在神经递质刺激下保持腺体功能的能力 | 未提及具体限制 | 开发一种实验平台，用于探索组织再生和抗癌治疗时代的精准医学 | 小鼠和人类唾液腺类器官 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 小鼠和人类唾液腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-09-15 |
TIST: Transcriptome and Histopathological Image Integrative Analysis for Spatial Transcriptomics
2022-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.11.012
PMID:36549467
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研究论文 | 提出了一种名为TIST的新方法，通过整合转录组数据和组织病理学图像来分析空间转录组数据，以识别空间聚类并增强基因表达模式 | TIST方法通过马尔可夫随机场（MRF）提取组织病理学特征，并将这些特征与转录组数据和位置信息整合，形成TIST-net网络，从而增强空间基因表达模式 | NA | 开发一种新的空间转录组数据分析方法，以减少技术噪声并提高分辨率 | 空间转录组数据和匹配的组织病理学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 马尔可夫随机场（MRF） | 图像和转录组数据 | 32个真实样本 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-09-15 |
Application of Deep Learning on Single-cell RNA Sequencing Data Analysis: A Review
2022-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.11.011
PMID:36528240
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综述 | 本文综述了深度学习在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 深度学习能够从噪声大、异质性强和高维度的单细胞RNA测序数据中提取信息丰富且紧凑的特征，从而改进下游分析 | 当前深度学习方法在单细胞RNA测序数据分析中面临挑战，需要进一步改进算法 | 综述近期开发的深度学习技术在单细胞RNA测序数据分析中的应用，并探讨其相对于传统分析工具的优势 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-09-14 |
Single-Cell Transcriptomic Census of Endothelial Changes Induced by Matrix Stiffness and the Association with Atherosclerosis
2022-Nov-17, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202203069
PMID:36816792
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研究论文 | 研究了基质硬度对内皮细胞向间充质细胞转化的影响及其与动脉粥样硬化的关联 | 首次在单细胞分辨率下研究了基质硬度对内皮细胞向间充质细胞转化的调控作用，并揭示了新的间充质-内皮反向转化轨迹 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内复杂的相互作用 | 探讨基质硬度对内皮细胞可塑性和动脉粥样硬化进展的影响 | 人冠状动脉内皮细胞及其在不同基质硬度下的转录特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人冠状动脉内皮细胞在生理和病理基质硬度下的培养样本 | NA | NA | NA | NA |