单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-30 |
Single-cell transcriptomics reveals age-resistant maintenance of cell identities, stem cell compartments and differentiation trajectories in long-lived naked mole-rats skin
2022-05-04, Aging
DOI:10.18632/aging.204054
PMID:35507806
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了裸鼹鼠皮肤在长寿过程中细胞身份、干细胞区室和分化轨迹的年龄抵抗性维持 | 研究发现裸鼹鼠皮肤在衰老过程中保持了细胞类型和皮肤区室的稳定性，干细胞数量恒定，且表皮基因表达未随年龄变化 | NA | 探讨裸鼹鼠皮肤在长寿过程中的细胞和遗传特征 | 裸鼹鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年裸鼹鼠 |
| 422 | 2024-08-30 |
Microfluidic cell sorter sample preparation for genomic assays
2022-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0092358
PMID:35698630
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研究论文 | 本文探讨了微流控细胞分选技术在基因组测序样本准备中的应用 | 介绍了NanoCellect Biomedical开发的WOLF Cell Sorter和WOLF G2微流控细胞分选器，这些设备使用温和的分选技术，兼容多种RNA测序平台 | 传统的液滴式分选器存在操作复杂、可访问性差以及可能对细胞造成压力的问题 | 研究如何通过微流控分选技术提高单细胞转录组学的样本质量 | 单细胞RNA测序样本的准备和细胞分选技术 | NA | NA | 微流控技术，RNA测序 | NA | 细胞 | 未具体说明 |
| 423 | 2024-08-30 |
Spatial transcriptomic analysis reveals inflammatory foci defined by senescent cells in the white matter, hippocampi and cortical grey matter in the aged mouse brain
2022-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-022-00521-7
PMID:35098444
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研究论文 | 本文通过空间转录组学方法分析了老年小鼠大脑中细胞衰老的空间分布及其与神经炎症的关系 | 首次使用空间转录组学技术，结合组织学信息，精确地定位了老年小鼠大脑中包含衰老细胞的微域，并分析了这些区域的基因表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性和可靠性 | 探讨衰老细胞在大脑中的空间分布及其与年龄相关认知衰退的关系 | 老年C57BL/6小鼠的大脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | 3个月和28个月大的C57BL/6小鼠各若干只 |
| 424 | 2024-08-30 |
Vemurafenib acts as a molecular on-off switch governing systemic inflammation in Langerhans cell histiocytosis
2022-02-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005442
PMID:34619771
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研究论文 | 本文报道了一名Langerhans细胞组织细胞增生症（LCH）患者在接受vemurafenib和挽救性化疗联合治疗后，实现了持续的临床和分子缓解的全面分析 | 研究发现vemurafenib能快速、高效但可逆地抑制系统性炎症的临床表现，并且炎症细胞因子的血清水平与vemurafenib的使用完全一致 | NA | 探讨vemurafenib在LCH治疗中的作用及其对系统性炎症的影响 | LCH患者及其细胞类型 | NA | Langerhans细胞组织细胞增生症 | 单细胞转录组分析 | NA | 血液和骨髓细胞 | 一名LCH患者 |
| 425 | 2024-08-30 |
Glycan Profiling by Sequencing to Uncover Multicellular Communication: Launching Glycobiology in Single Cells and Microbiomes
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.919168
PMID:35712658
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGR-seq的新技术，用于在单细胞水平上同时分析糖类和RNA，并将其应用于异质细胞群和微生物群的表面糖类分析 | 首次开发了一种能够在单细胞水平上分析糖组的技术，通过使用DNA条形码凝集素将糖信息转化为基因信息，从而实现糖类和RNA的同时分析 | NA | 探索糖类在细胞间和细胞与微生物间通信中的功能，扩展糖生物学到单细胞和微生物群水平 | 单细胞和微生物群中的糖类 | 生物技术 | NA | scGR-seq | NA | 糖类和RNA | 异质细胞群和微生物群中的单个细胞 |
| 426 | 2024-08-30 |
Myocardial-Treg Crosstalk: How to Tame a Wolf
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.914033
PMID:35693830
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综述 | 本文综述了心肌梗死（MI）后心肌调节T细胞（Tregs）在组织修复和局部炎症控制中的核心作用 | 讨论了心肌微环境如何通过塑造肌球蛋白特异性T细胞向调节表型发展，从而控制潜在的自体攻击性局部免疫反应 | NA | 探讨心肌梗死后免疫系统如何通过Tregs协调组织修复和控制炎症反应 | 心肌调节T细胞（Tregs）及其在心肌梗死修复中的作用 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学和T细胞受体分析 | NA | 图像 | 使用转基因小鼠模型进行研究 |
| 427 | 2024-08-08 |
Identifying In Vitro Cultured Human Hepatocytes Markers with Machine Learning Methods Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.916309
PMID:35706505
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和机器学习方法，识别体外培养的人肝细胞在不同分化时期的标志物 | 本研究通过先进的计算分析方法，解决了肝细胞分化过程中的异质性问题，并挖掘了不同分化时期的生物标志物 | NA | 阐明肝细胞发育的过程和机制，为细胞移植相关的肝病治疗策略提供潜在目标 | 体外培养的人肝细胞及其分化过程中的标志物 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林、k-最近邻、决策树 | 转录组数据 | 一批压缩和有效的分类特征 |
| 428 | 2024-08-29 |
Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell-cell interactions underlying the bone repair process
2022-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2022.05.001
PMID:35619947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了骨骼前体细胞在骨修复过程中的异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞分辨率下描述了多潜能骨骼前体细胞及其分化方向，并识别了Ccl9信号通路作为骨再生的潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 深入理解骨骼前体细胞在骨修复过程中的行为及其分子机制 | 骨骼前体细胞及其在骨修复中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用Sox9-CreERT2;R26R tdTomato小鼠模型进行线粒体追踪和单细胞RNA测序分析 |
| 429 | 2024-08-29 |
The power of single-cell transcriptomics in cardiovascular disease
2022-Jul, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-022-00109-6
PMID:39196239
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-08-29 |
Intrahepatic inflammatory IgA+PD-L1high monocytes in hepatocellular carcinoma development and immunotherapy
2022-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003618
PMID:35577505
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研究论文 | 本研究探讨了炎症诱导的肝内炎症性IgA+单核细胞在肝细胞癌（HCC）发展中的作用 | 发现血清IgA水平与慢性肝病和HCC中的肝内及肿瘤内炎症性IgA+PD-L1高表达单核细胞浸润相关，为潜在的治疗靶点提供了依据 | NA | 阐明炎症诱导的肝内炎症性IgA+单核细胞在肝细胞癌发展中的作用 | 肝细胞癌患者及其肝内炎症性IgA+单核细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 免疫组织化学、多色流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 组织样本、血液样本 | 包括61例脂肪性肝炎患者和271例HCC患者 |
| 431 | 2024-08-29 |
Single-Cell RNA-seq Reveals a Developmental Hierarchy Super-Imposed Over Subclonal Evolution in the Cellular Ecosystem of Prostate Cancer
2022-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105530
PMID:35322584
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研究论文 | 研究者通过单细胞RNA测序技术分析了14名未经治疗的前列腺癌患者的细胞，构建了一个详细的前列腺癌细胞图谱，并揭示了肿瘤亚克隆进化与转录异质性之间的关系 | 首次将发育层次结构映射到肿瘤亚克隆进化上，并识别了四种转录亚型，这些亚型在干细胞样和分化状态中呈层次结构 | 研究仅限于14名未经治疗的前列腺癌患者，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探讨前列腺癌中亚克隆进化与转录异质性之间的关系及其对患者预后的影响 | 前列腺癌患者的肿瘤细胞及其亚克隆和转录异质性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14名未经治疗的前列腺癌患者 |
| 432 | 2024-08-29 |
CCPE: cell cycle pseudotime estimation for single cell RNA-seq data
2022-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1236
PMID:34931240
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研究论文 | 本文开发了一种名为CCPE的新型细胞周期伪时间估计方法，用于从单细胞RNA测序数据中表征细胞周期时间和识别细胞周期阶段 | CCPE使用一种判别性螺旋来表征细胞周期的循环过程，并估计每个细胞沿细胞周期的伪时间 | NA | 开发一种有效的方法来预测细胞周期伪时间并识别细胞周期阶段 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种模拟和真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 433 | 2024-08-29 |
Transcriptomic signatures associated with autoimmune thyroiditis in papillary thyroid carcinoma and cancer immunotherapy-induced thyroid dysfunction
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.019
PMID:35664236
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）与桥本甲状腺炎（HT）共存现象及其转录组基础，以及免疫治疗相关甲状腺功能障碍的分子标志物 | 首次揭示了PTC患者中HT与复发之间的负相关性，并发现了HT患者中PD-1相关基因的高表达与CD8 T细胞激活的潜在关联 | 研究主要基于回顾性数据分析，未来需通过前瞻性研究进一步验证 | 探索PTC与HT共存的转录组基础及免疫治疗相关甲状腺功能障碍的分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者及接受免疫治疗的患者的甲状腺功能障碍 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 转录组分析，单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据，单细胞数据 | 468名PTC患者，22,155名PTC患者（元分析），17,438个细胞（单细胞转录组分析），39,123名患者（甲状腺不良事件分析） |
| 434 | 2024-08-29 |
Comparative Toxicotranscriptomics of Single Cell RNA-Seq and Conventional RNA-Seq in TCDD-Exposed Testicular Tissue
2022, Frontiers in toxicology
IF:3.6Q2
DOI:10.3389/ftox.2022.821116
PMID:35615540
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研究论文 | 本报告比较了两种转录组学方法（常规RNA-seq和单细胞RNA测序）在暴露于TCDD的成年斑马鱼睾丸组织中的结果和局限性 | 单细胞RNA测序能够揭示异质组织中特定细胞类型的转录组动态 | 单细胞RNA测序中的细胞解离效应和转录组覆盖度降低可能影响毒理学研究 | 探讨单细胞RNA测序与常规RNA-seq在转录组学和毒理学上的差异 | 暴露于TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 控制组和TCDD暴露组的配对样本 |
| 435 | 2024-08-29 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
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研究论文 | 研究揭示了顺铂化疗引起的外周神经病变中，顺铂如何影响酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元的特定亚群和K+通道 | 发现了顺铂通过靶向外向K电流（可能通过K2P18.1通道）影响神经元功能，并暗示维生素E可能具有神经保护作用 | NA | 探讨顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析和电生理分析 | NA | 转录组数据和电生理数据 | 小鼠的酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 |
| 436 | 2024-08-28 |
Pandemic influenza A (H1N1) virus causes abortive infection of primary human T cells
2022-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2022.2056523
PMID:35317717
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研究论文 | 研究探讨了甲型流感病毒H1N1对人类T细胞的感染及其对免疫反应的影响 | 通过单细胞转录组分析揭示了不同CD4 T和CD8 T细胞亚群对病毒感染的异质性及生物学反应 | NA | 探究甲型流感病毒H1N1对人类T细胞的感染机制及其对免疫系统的影响 | 人类T细胞及其亚群 | 免疫学 | 流感 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多种CD4 T和CD8 T细胞亚群 |
| 437 | 2024-08-28 |
Modeling zero inflation is not necessary for spatial transcriptomics
2022-05-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02684-0
PMID:35585605
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研究论文 | 本文对20个来自11种不同技术的空间转录组数据集进行了综合分析，以表征表达计数数据的分布特性并理解零值的统计本质 | 研究表明，在空间转录组学中，大量的零值并非由于零膨胀，支持使用不含零膨胀成分的计数模型 | NA | 探究空间转录组学数据中零值的来源及其统计特性 | 20个空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 泊松模型和负二项模型 | 基因表达数据 | 20个数据集，来自11种不同技术 |
| 438 | 2024-08-28 |
Human liver single nucleus and single cell RNA sequencing identify a hepatocellular carcinoma-associated cell-type affecting survival
2022-05-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01055-5
PMID:35581624
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研究论文 | 本文通过整合肝脏单核（snRNA-seq）、单细胞（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，识别出与肝细胞癌（HCC）相关的细胞类型，该细胞类型影响患者的生存率 | 本文首次通过整合多组学数据，发现了一种与HCC相关的增殖细胞类型（Prol），并揭示了其与TP53和RB1体细胞突变的关联 | NA | 旨在识别影响肝细胞癌患者生存率的特定细胞类型 | 肝细胞癌（HCC）及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 健康肝脏队列（9个非HCC样本）、HCC队列（1个非HCC，14个HCC肿瘤，14个邻近非肿瘤样本）、另一个HCC队列（3个HCC肿瘤，3个邻近非肿瘤样本）、TCGA多中心队列（361个HCC肿瘤，49个邻近非肿瘤组织）、LCI队列（221个HCC，209个邻近非肿瘤肝脏微阵列样本） |
| 439 | 2024-08-28 |
Single-cell profiling of human dura and meningioma reveals cellular meningeal landscape and insights into meningioma immune response
2022-05-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01051-9
PMID:35534852
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术首次对非肿瘤相关的人类硬脑膜和原发性脑膜瘤样本进行了表征 | 揭示了人类硬脑膜中复杂的免疫微环境，并展示了与脑膜瘤不同的转录特征，同时描述了非免疫细胞（如内皮细胞和成纤维细胞）的功能多样性和异质性 | 研究主要基于单细胞RNA测序技术，可能无法全面反映所有细胞类型的功能和相互作用 | 探究人类硬脑膜和脑膜瘤的免疫和非免疫细胞景观，并提供新的见解 | 非肿瘤相关的人类硬脑膜和原发性脑膜瘤样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7个非肿瘤相关的人类硬脑膜样本和6个原发性脑膜瘤肿瘤样本（4个匹配和2个非匹配） |
| 440 | 2024-08-28 |
Benchmarking of a Bayesian single cell RNAseq differential gene expression test for dose-response study designs
2022-05-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac019
PMID:35061903
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研究论文 | 本文提出了一种多重校正的贝叶斯测试方法，用于剂量反应设计的单细胞RNA测序差异基因表达分析，并与其他八种方法进行了比较 | 本文提出的贝叶斯测试方法在广泛的准确性指标上优于所有其他测试方法，特别是在控制假阳性错误率方面 | NA | 评估和比较不同差异基因表达分析方法在剂量反应单细胞RNA测序实验中的性能 | 单细胞RNA测序数据在药物和毒理学反应中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯测试方法 | RNA测序数据 | NA |