单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 4041 - 4050 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4041 | 2024-08-09 |
Disrupted spermatogenesis in a metabolic syndrome model: the role of vitamin A metabolism in the gut-testis axis
2022-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-323347
PMID:33504491
|
研究论文 | 本研究探讨了饮食诱导的肠道微生物失调对睾丸轴的影响，特别是在代谢综合征模型中对精子发生的影响 | 通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，揭示了维生素A代谢在肠道-睾丸轴中的作用，以及肠道微生物与精子发生之间的直接联系 | NA | 旨在揭示肠道-睾丸轴在精子发生障碍中的作用机制 | 代谢综合征模型中的睾丸样本、宿主代谢组和肠道微生物群 | NA | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序、代谢组学分析、16S rDNA测序 | NA | RNA、代谢物、微生物序列 | NA |
| 4042 | 2024-08-09 |
Single-cell ATAC-Seq reveals cell type-specific transcriptional regulation and unique chromatin accessibility in human spermatogenesis
2022-02-03, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab006
PMID:33438010
|
研究论文 | 本文通过单细胞ATAC-Seq技术分析了来自3名正常男性的5376个睾丸细胞，揭示了人类精子发生过程中细胞类型特异性的转录调控和独特的染色质可及性 | 首次在单细胞水平上揭示了人类精子发生过程中不同阶段的染色质可及性和转录因子结合位点的特异性模式 | NA | 深入理解人类精子发生过程中的转录调控机制 | 人类睾丸细胞中的染色质可及性和转录因子结合位点 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-Seq | NA | 基因组数据 | 5376个睾丸细胞 |
| 4043 | 2024-08-09 |
Placental growth factor promotes tumour desmoplasia and treatment resistance in intrahepatic cholangiocarcinoma
2022-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-322493
PMID:33431577
|
研究论文 | 本研究探讨了胎盘生长因子（PlGF）在肝内胆管癌（ICC）进展中的作用，特别是在肿瘤间质化和治疗抵抗方面。 | 首次揭示了PlGF在ICC中的表达与疾病进展的相关性，并证明了PlGF阻断可以改善ICC的治疗效果。 | 研究主要基于小鼠模型和体外3-D共培养系统，可能需要进一步的人体临床试验来验证结果。 | 确定PlGF在肝内胆管癌进展中的作用及其对治疗效果的影响。 | 肝内胆管癌患者样本、ICC细胞、癌相关成纤维细胞（CAFs）和小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括ICC患者样本和小鼠模型 |
| 4044 | 2024-08-09 |
Dysfunction of VIPR2 leads to myopia in humans and mice
2022-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2020-107220
PMID:33318135
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研究论文 | 研究VIP-VIPR2信号通路在调控近视发展中的作用 | 首次揭示了VIP-VIPR2信号通路在近视发展中的作用，并验证了VIPR2基因敲除小鼠的近视表型 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类中验证 | 探究VIP-VIPR2信号通路在近视发展中的作用 | VIP-VIPR2信号通路及其在近视发展中的影响 | NA | 近视 | 单细胞转录组测序，批量RNA测序，药理学操作，基因敲除研究 | NA | RNA | 中国汉族人群中的高近视关联分析，VIPR2基因敲除小鼠 |
| 4045 | 2024-08-09 |
Neuraminidase inhibitors rewire neutrophil function in vivo in murine sepsis and ex vivo in COVID-19
2022-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.11.12.379115
PMID:33200130
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研究论文 | 研究报告了抗病毒神经氨酸酶抑制剂在体内外调节中性粒细胞功能的作用，特别是在小鼠脓毒症和COVID-19患者中的应用 | 首次揭示了神经氨酸酶抑制剂通过限制宿主神经氨酸酶活性、表面唾液酸释放、ROS产生和中性粒细胞释放的NETs，来控制感染和提高宿主生存率 | NA | 探讨神经氨酸酶抑制剂在严重感染中调节中性粒细胞功能的作用 | 小鼠脓毒症模型和COVID-19患者的血液细胞 | NA | 脓毒症, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 公开数据集中的呼吸道样本 |
| 4046 | 2024-08-09 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
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综述 | 本文综述了kappa阿片受体（KOR）及其内源性激动剂dynorphins在调节痒感和疼痛中的作用 | 介绍了KOR及其受体影响细胞和神经回路的最新发现，并重新分析了单细胞测序数据，展示了这些分子的表达谱 | 仅考虑了KOR与来自prodynorphin基因的肽和其他亲和力较低的阿片肽的相互作用 | 探讨kappa阿片系统在特定解剖位置中的作用及其在神经系统中的相互联系 | kappa阿片受体及其内源性激动剂dynorphins在痒感和疼痛调节中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 4047 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering by Low-Rank Subspace Ensemble Framework
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3029187
PMID:33026977
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研究论文 | 本文提出了一种低秩子空间集成聚类框架（LRSEC）用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | LRSEC框架通过低秩子空间捕获数据的全局结构，相比单一聚类模型具有更好的聚类性能 | NA | 分析scRNA-seq数据，揭示细胞的异质性和多样性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 低秩模型 | 基因表达数据 | 七个小数据集和一个大数据集 |
| 4048 | 2024-08-09 |
scLRTD : A Novel Low Rank Tensor Decomposition Method for Imputing Missing Values in Single-Cell Multi-Omics Sequencing Data
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3025804
PMID:32960767
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLRTD的新方法，利用低秩张量分解基于核范数来填补单细胞多组学测序数据中的缺失值 | scLRTD方法不同于一般的单类型单细胞数据填补方法，能够处理不同阶段、组织或条件的单细胞RNA测序数据 | NA | 开发有效的方法来填补单细胞数据分析中的缺失值 | 单细胞多组学测序数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 低秩张量分解 | 测序数据 | 四组模拟数据和两组来自小鼠胚胎干细胞和肝细胞癌的真实单细胞RNA测序数据 |
| 4049 | 2024-08-09 |
CIPHER-SC: Disease-Gene Association Inference Using Graph Convolution on a Context-Aware Network With Single-Cell Data
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3017547
PMID:32809944
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积的疾病-基因关联推断方法CIPHER-SC，该方法利用单细胞转录组数据构建了一个上下文感知网络，实现了端到端的训练架构 | 引入了单细胞转录组数据，构建了上下文感知网络，实现了无偏差的数据整合和端到端的训练架构 | NA | 推断疾病-基因关联，揭示疾病发病机制，并为治疗提供帮助 | 疾病-基因关联 | 机器学习 | NA | 图卷积 | 图卷积网络 | 单细胞转录组数据 | 涉及三个不同的测试集进行五折交叉验证 |
| 4050 | 2024-08-09 |
SelfE: Gene Selection via Self-Expression for Single-Cell Data
2022 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.2997326
PMID:32750851
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研究论文 | 本文提出了一种名为SelfE的新型l-minimization算法，用于单细胞数据中的基因选择，通过自表达保留数据中的子空间结构 | 提出了一种新的l-minimization算法SelfE，用于单细胞表达数据分析中的特征选择 | 未提及 | 开发新的特征选择技术，提高单细胞表达数据分析的透明度和效果 | 单细胞RNA测序数据中的基因选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | l-minimization算法 | 表达矩阵 | 未提及 |