单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 4001 - 4020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4001 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals innate lymphoid cell lineage infidelity in atopic dermatitis
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.07.025
PMID:34363841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了特应性皮炎中先天淋巴细胞谱系的不忠实性 | 首次通过单细胞RNA测序展示了特应性皮炎病变皮肤中先天淋巴细胞谱系的不忠实性 | NA | 更好地理解皮肤先天淋巴细胞（ILCs）在生理和病理条件下的表型和分子特征 | 皮肤先天淋巴细胞（ILCs） | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 来自特应性皮炎患者和健康个体的皮肤穿刺活检、减薄片和血液样本 |
| 4002 | 2024-08-08 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
|
研究论文 | 通过单细胞时空转录组学技术，研究了小鼠胎肝中造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP）的扩展单元 | 发现了新的HSC/MPP '口袋状'单元（HSC PLUS），并验证了巨噬细胞和生长因子在HSC/MPP扩展中的支持作用 | NA | 探索胎肝中HSC/MPP扩展的细胞和分子机制，为基于干细胞的血液恶性肿瘤治疗提供新见解 | 小鼠胎肝中的造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP） | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胎肝样本 |
| 4003 | 2024-08-08 |
Advances and Challenges in Kidney Organoids
2022, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
综述 | 本文综述了肾脏类器官的最新进展、应用及面临的挑战 | 介绍了单细胞RNA测序、3D生物打印和微流控技术在肾脏类器官研究中的应用 | 目前缺乏针对肾脏类器官方法学的全面综述 | 总结肾脏类器官的分化方法、应用及挑战 | 肾脏类器官的生成及其在体外细胞培养系统中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序、3D生物打印、微流控技术 | NA | NA | NA |
| 4004 | 2024-08-08 |
NMFLRR: Clustering scRNA-Seq Data by Integrating Nonnegative Matrix Factorization With Low Rank Representation
2022-03, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3099127
PMID:34310328
|
研究论文 | 本文提出了一种新的计算框架NMFLRR，通过整合低秩表示（LRR）和非负矩阵分解（NMF）来识别细胞类型，并使用九个真实的scRNA-seq数据集测试了其性能 | NMFLRR框架通过引入局部约束图正则化项来捕获数据的局部几何信息，并使用交替方向乘子法（ADMM）算法同时获得数据的相似矩阵和低维特征 | NA | 开发一种新的计算方法，以准确识别单细胞类型 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF），低秩表示（LRR） | 基因表达数据 | 九个真实的scRNA-seq数据集 |
| 4005 | 2024-08-08 |
Generation of functional human thymic cells from induced pluripotent stem cells
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.07.021
PMID:34331993
|
研究论文 | 本文研究了从诱导多能干细胞（iPSCs）生成功能性人类胸腺细胞的方法 | 开发了一种直接分化协议，能够从多个iPSC系生成患者来源的胸腺上皮祖细胞，并在移植到无胸腺裸鼠后进一步分化为功能性胸腺上皮细胞 | NA | 系统评估信号通路，开发一种精炼的直接分化协议，生成患者来源的胸腺上皮祖细胞 | 诱导多能干细胞（iPSCs）生成的胸腺上皮祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 流式细胞术，定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个iPSC系生成的胸腺上皮祖细胞 |
| 4006 | 2024-08-08 |
rPanglaoDB: an R package to download and merge labeled single-cell RNA-seq data from the PanglaoDB database
2022-01-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab549
PMID:34320637
|
研究论文 | 介绍了一个名为rPanglaoDB的R包，用于从PanglaoDB数据库下载和合并标记的单细胞RNA测序数据 | 首次提供了纤维细胞的无偏转录组图谱报告，并通过比较纤维细胞与同一组织样本中收集的成纤维细胞的转录组图谱，确认了它们与组织损伤和感染愈合过程的关联 | NA | 通过整合多个公共单细胞实验数据，增加目标细胞类型的样本量，实现稳健的细胞类型转录组特征描述 | 纤维细胞，一种罕见的单核细胞衍生细胞类型 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 157个纤维细胞 |
| 4007 | 2024-08-08 |
Molecular Fingerprinting by Single Cell Clone Analysis in Adverse Drug Reaction (ADR) Assessment
2022, Current drug safety
IF:1.1Q4
|
研究论文 | 本文通过单细胞克隆分析技术，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），对药物不良反应（ADR）进行分子指纹识别，以区分不同克隆细胞在个体器官中的差异敏感性 | 利用scRNA-seq技术对ADR进行分子指纹识别，识别特定克隆中直接表达的基因（DEG），为靶向治疗策略提供机会 | 成本效益、ADR的频率/严重程度和人群差异等因素仍需考虑 | 开发一种新的框架，用于使用scRNA-seq技术对ADR进行潜在评估，并探讨其对药物警戒和药物开发的潜在监管影响 | 药物不良反应（ADR）的分子指纹识别 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及可活检/采样的组织（如皮肤、肝脏、肾脏、血液、干细胞） |
| 4008 | 2024-08-08 |
Role of laminin and collagen chains in human spermatogenesis - Insights from studies in rodents and scRNA-Seq transcriptome profiling
2022-01, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2021.07.011
PMID:34325997
|
综述 | 本文综述了在啮齿动物和单细胞RNA测序转录组分析中，层粘连蛋白和胶原蛋白链在人类精子发生中的作用 | 通过分析公开的单细胞RNA测序转录组数据集，揭示了不同类型的人类睾丸中胶原蛋白链和层粘连蛋白链的差异表达，提出了人类睾丸中可能存在的局部调节网络 | NA | 探讨层粘连蛋白和胶原蛋白链在人类精子发生中的作用及其在不同类型睾丸疾病中的潜在影响 | 人类睾丸中的层粘连蛋白和胶原蛋白链 | NA | 男性不育症 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 4009 | 2024-08-08 |
scRAE: Deterministic Regularized Autoencoders With Flexible Priors for Clustering Single-Cell Gene Expression Data
2022 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3098394
PMID:34288873
|
研究论文 | 本文提出了一种改进的正则化自编码器框架（scRAE），用于单细胞RNA测序数据的有效聚类 | scRAE包含一个确定性的自编码器和一个灵活的可学习先验生成网络，共同训练，以在潜在空间中更好地权衡偏差和方差 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中的统计和计算挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 正则化自编码器（RAE） | 自编码器（AE） | 基因表达数据 | 多个真实世界的单细胞基因表达数据集 |
| 4010 | 2024-08-08 |
i2dash: Creation of Flexible, Interactive, and Web-based Dashboards for Visualization of Omics Data
2022-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.01.007
PMID:34280547
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为i2dash的R包，用于程序化创建自定义的网络化、交互式仪表盘，以可视化组学数据 | i2dash支持跨预定义图形布局的交互式和响应式可视化，并能与任何基于R的分析管道兼容，促进了数据可视化与数据分析任务的分离 | NA | 开发一种工具，用于简化组学数据处理管道与动态生成交互式仪表盘的结合 | 组学数据的可视化和交互式探索 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组学数据 | NA |
| 4011 | 2024-08-08 |
Exploring the role of autophagy during early human embryonic development through single-cell transcriptome and methylome analyses
2022-05, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-1948-1
PMID:34302606
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和甲基组分析，系统探讨了自噬在早期人类胚胎发育中的作用 | 首次全面揭示了自噬在早期人类胚胎发育中的特征 | NA | 探索自噬在早期人类胚胎发育中的调控作用 | 早期人类胚胎细胞中的自噬相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组和甲基组分析 | NA | 转录组和甲基组数据 | 365个细胞的转录组数据和265个细胞的甲基组数据 |
| 4012 | 2024-08-08 |
Exploring the choroidal vascular labyrinth and its molecular and structural roles in health and disease
2022-03, Progress in retinal and eye research
IF:18.6Q1
DOI:10.1016/j.preteyeres.2021.100994
PMID:34280556
|
综述 | 本文综述了脉络膜在生理和病理生理机制中的作用，特别是脉络膜内皮细胞（CECs）的角色 | 讨论了CECs的表型特性、亚群以及从尸检眼中提取的原代CEC培养物中测量转录组学的价值 | 对于这些脉络膜视网膜疾病的临床特征和分子途径的理解仍然相对有限 | 深入了解脉络膜的特定临床和分子特性，以揭示广泛的脉络膜视网膜疾病的发病机制 | 脉络膜及其在健康和疾病中的分子和结构作用 | NA | 脉络膜视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学数据 | 从尸检眼中提取的原代CEC培养物 |
| 4013 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of relapse-initiating cells in MLL-rearranged infant ALL by single-cell transcriptomics
2022-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01341-y
PMID:34304246
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了MLL重排婴儿急性淋巴细胞白血病（MLL-r iALL）中对糖皮质激素药物泼尼松的反应，以识别和表征复发启动细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术量化了对治疗敏感和抵抗的癌细胞群体，以更好地预测个体患者的未来复发情况 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和表征MLL-r iALL中的复发启动细胞，以改善风险分层和理解白血病治疗抵抗亚群 | MLL重排婴儿急性淋巴细胞白血病中的复发启动细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 诊断性骨髓和外周血样本 |
| 4014 | 2024-08-08 |
Immune cell profiling in atherosclerosis: role in research and precision medicine
2022-01, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-021-00589-2
PMID:34267377
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在动脉粥样硬化免疫细胞图谱构建及精准免疫治疗发现中的应用 | 探讨了单细胞技术如单细胞质谱细胞仪、单细胞RNA测序和细胞转录组及表位索引测序在动脉粥样硬化斑块细胞和分子组成图谱中的应用，并强调了这些数据在发现新型精准免疫治疗中的作用 | 需要进一步在相关实验模型中严格验证来自人类研究的单细胞数据 | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究及精准医学中的作用 | 动脉粥样硬化中的免疫细胞及其在精准医疗中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 4015 | 2024-08-08 |
Similarity and Dissimilarity Regularized Nonnegative Matrix Factorization for Single-Cell RNA-seq Analysis
2022-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00457-0
PMID:34231183
|
研究论文 | 本文提出了一种新的聚类方法——相似性与相异性正则化的非负矩阵分解（SDCNMF），用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | SDCNMF方法同时施加相似性和相异性约束于低维表示，既能保持相似细胞在低维空间中更接近，也能将不相似的细胞彼此推开 | NA | 探索单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 4016 | 2024-08-08 |
An active learning approach for clustering single-cell RNA-seq data
2022-03, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-021-00639-w
PMID:34244616
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的主动学习框架 | 该框架采用主动学习算法，能够主动向生物学家查询标签，并仅对部分细胞进行手动标记，从而提高聚类的生物学解释性 | NA | 解决现有单细胞RNA测序数据聚类方法中生物学解释性差的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主动学习模型 | 数据 | 四个真实单细胞RNA测序数据集，每个数据集少于1000个标记细胞 |
| 4017 | 2024-08-08 |
Extrafollicular PD-1highCXCR5-CD4+ T cells participate in local immunoglobulin production in nasal polyps
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.06.023
PMID:34224786
|
研究论文 | 本文研究了鼻息肉中非滤泡外的PD-1高表达CXCR5阴性CD4+ T细胞在局部免疫球蛋白产生中的作用 | 发现PD-1高表达CXCR5阴性CD4+ T细胞在鼻息肉中具有独特的表型，与B细胞帮助和组织定居相关，且不同于鼻息肉中的其他CD4+ T细胞亚群 | NA | 旨在识别鼻息肉中独立于异位淋巴组织（eLTs）的局部免疫球蛋白产生相关的T细胞亚群 | 鼻息肉中的CD4+ T细胞亚群及其在局部免疫球蛋白产生中的作用 | 免疫学 | 鼻息肉 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 鼻息肉组织样本 |
| 4018 | 2024-08-08 |
A novel patient stratification strategy to enhance the therapeutic efficacy of dasatinib in glioblastoma
2022-01-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab158
PMID:34232320
|
研究论文 | 本文研究了一种新的患者分层策略，以提高达沙替尼在胶质母细胞瘤治疗中的疗效 | 提出了一种基于基因表达分型的患者分层策略，以优化达沙替尼在胶质母细胞瘤治疗中的应用 | NA | 探讨不同亚型胶质母细胞瘤对达沙替尼的反应差异，并提出临床试验中的患者富集策略 | 胶质母细胞瘤及其亚型对达沙替尼的敏感性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 来自原发性患者肿瘤的胶质母细胞瘤干细胞样细胞（GSCs） |
| 4019 | 2024-08-08 |
Adipocyte Heterogeneity Underlying Adipose Tissue Functions
2022-01-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqab138
PMID:34223880
|
研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序和单核测序技术研究脂肪细胞异质性的策略，以更好地理解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其与代谢疾病的关系 | 采用了单细胞RNA测序和单核测序技术来揭示脂肪细胞亚型的复杂性，这些技术之前因脂肪细胞的大小、浮力和脆弱性而难以应用 | NA | 深入了解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其在代谢疾病中的作用 | 脂肪细胞亚型及其在不同脂肪库中的功能 | NA | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 4020 | 2024-08-08 |
Induction of Interferon-γ and Tissue Inflammation by Overexpression of Eosinophil Cationic Protein in T Cells and Exosomes
2022-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41920
PMID:34224653
|
研究论文 | 本研究探讨了T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮（SLE）发病机制中的作用，特别是嗜酸性阳离子蛋白（ECP）的过度表达。 | 首次揭示了ECP在T细胞和T细胞衍生的外泌体中过度表达可能导致SLE相关的肾炎、肝炎和关节炎。 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 研究T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照的T细胞衍生的外泌体蛋白。 | NA | 系统性红斑狼疮 | MACSPlex外泌体分析和蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | T细胞特异性ECP转基因小鼠（每组5只），老年T细胞特异性ECP转基因小鼠（每组3只），接受转移外泌体的小鼠（每组3只） |