单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-02 |
Transcription and splicing regulation by NLRC5 shape the interferon response in human pancreatic β cells
2022-09-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5732
PMID:36103539
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子NLRC5在人类胰腺β细胞中调控干扰素反应、HLA I类分子表达及可变剪接的核心作用 | 首次发现NLRC5不仅调控HLA I类分子和抗原呈递相关基因的表达，还介导IFNα对可变剪接的影响，从而参与β细胞新抗原生成 | 研究主要基于体外诱导的多能干细胞来源的胰岛样细胞和EndoC-βH1细胞系，未在完整人体组织中进行验证 | 阐明IFNα在1型糖尿病早期通过NLRC5调控β细胞免疫原性反应的分子机制 | 人类诱导多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系以及人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | RNA测序、单细胞RNA测序、靶向基因/蛋白检测 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，涉及多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1细胞系和人类胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-03-02 |
CST6 suppresses osteolytic bone disease in multiple myeloma by blocking osteoclast differentiation
2022-09-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI159527
PMID:35881476
|
研究论文 | 本研究揭示了CST6通过抑制破骨细胞分化和功能，在多发性骨髓瘤中抑制溶骨性骨病的作用机制 | 首次发现CST6表达升高与多发性骨髓瘤患者无溶骨性病变显著相关，并阐明其通过阻断cathepsin K活性和NF-κB/p100、TRAF3的切割来抑制破骨细胞分化的分子机制 | 研究主要基于相关性分析和体外/体内模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性骨病缺失的分子基础 | 多发性骨髓瘤患者骨髓CD138+细胞及破骨细胞分化过程 | NA | 多发性骨髓瘤 | PET-CT、基因表达谱分析、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据、单细胞转录组数据 | 512名新诊断的多发性骨髓瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-03-02 |
Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal
2022-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31591-y
PMID:35851580
|
研究论文 | 本文通过体内光遗传学、体外光遗传学电路映射和单细胞转录组学，揭示了食欲素神经元通过抑制腹外侧视前核的促睡眠神经元来促进觉醒的间接机制 | 发现食欲素神经元通过间接抑制促睡眠神经元来维持觉醒，这为理解觉醒维持提供了新的电路框架 | NA | 研究食欲素神经元如何通过神经回路机制促进和维持觉醒状态 | 食欲素神经元和腹外侧视前核的促睡眠神经元 | 神经科学 | NA | 体内光遗传学、体外光遗传学电路映射、单细胞转录组学 | NA | 神经活动数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-03-02 |
Cellular and immunometabolic mechanisms of inflammation in depression: Preliminary findings from single cell RNA sequencing and a tribute to Bruce McEwen
2022-Jul, Neurobiology of stress
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ynstr.2022.100462
PMID:35655933
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了重度抑郁症患者中炎症与快感缺失症状相关的免疫细胞亚群和转录组特征 | 首次在单细胞水平上揭示了重度抑郁症患者中单核细胞和CD4 T细胞的免疫代谢重编程与炎症及行为症状的关联 | 样本量较小（仅6名患者），且为初步发现，需要更大规模研究验证 | 探究重度抑郁症中炎症的细胞和免疫代谢机制及其与行为症状的关系 | 重度抑郁症门诊患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名未用药的重度抑郁症门诊患者（3名高CRP，3名低CRP） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-03-02 |
Altered patterning of trisomy 21 interneuron progenitors
2022-06-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.001
PMID:35623352
|
研究论文 | 本研究通过分析唐氏综合征（21三体）患者的大脑皮层及利用诱导多能干细胞模型，揭示了21三体导致中间神经元前体细胞模式改变及数量减少的机制 | 首次结合成人脑组织立体学分析与21三体诱导多能干细胞模型，发现COUP-TFII+前体细胞减少与WNT信号通路异常在唐氏综合征皮层中间神经元发育缺陷中的关键作用 | 研究主要基于体外干细胞模型，体内验证尚不充分；WNT信号激活仅部分恢复表型，提示存在其他调控机制 | 探究唐氏综合征大脑神经元减少及智力障碍的发育机制 | 唐氏综合征患者大脑皮层组织、21三体人类诱导多能干细胞及其同基因对照 | 发育神经生物学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序、立体学分析、干细胞分化 | 人类诱导多能干细胞分化模型 | 基因表达数据、细胞计数数据 | 未明确样本数量，使用成人DS皮层组织及多株iPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-03-02 |
CellRank for directed single-cell fate mapping
2022-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01346-6
PMID:35027767
|
研究论文 | 本文介绍了CellRank，一种用于单细胞命运映射的计算方法，适用于方向未知的多样化场景，如再生、重编程和疾病 | 结合轨迹推断的鲁棒性和RNA速度的方向信息，考虑细胞命运决策的渐进性和随机性，以及速度向量的不确定性 | NA | 开发一种能够处理方向未知生物过程的单细胞命运映射工具 | 单细胞RNA测序数据，应用于胰腺发育、细胞重编程和肺损伤后再生等场景 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-02-25 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation
2022-Dec-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000032558
PMID:36595859
|
研究论文 | 本研究基于铁死亡相关长链非编码RNA构建了一个膀胱癌预后风险预测模型，并通过单细胞转录组测序进行验证 | 首次从铁死亡相关lncRNAs的角度构建膀胱癌预后模型，并结合单细胞测序验证其在肿瘤微环境中的特异性表达 | 样本量较小（仅4例单细胞测序样本），且依赖于公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 构建膀胱癌预后风险模型以指导临床预后评估并识别潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者样本（包括TCGA数据库中的批量RNA-seq数据和4例患者单细胞测序数据） | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的膀胱癌样本（具体数量未明确）和4例患者单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-02-25 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01006-2
PMID:34489600
|
研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组数据，阐明了小鼠器官发生过程 | 应用基于图像的单细胞转录组学方法seqFISH，结合空间背景和多路转录测量，揭示了scRNA-seq数据中未显现的细胞分化轴 | 仅检测了387个目标基因的mRNA，可能未覆盖全部相关基因表达 | 研究复杂组织和发育中的细胞命运决定 | 小鼠胚胎组织切片（8-12体节阶段） | 数字病理学 | NA | seqFISH, scRNA-seq | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-02-17 |
Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues
2022-Nov, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243
PMID:36712323
|
研究论文 | 本研究通过分析GTEx项目的RNA-seq数据，探讨了人类组织中基因表达变异性的性别差异及其与生物学功能和疾病的关系 | 首次系统性地研究了性别在基因表达变异性方面的差异，并关联到细胞类型特异性表达、性别偏倚疾病（如Graves病）以及进化约束 | 研究主要基于GTEx项目的RNA-seq数据，可能受样本来源和技术平台的限制，且单细胞RNA-seq分析仅针对乳腺上皮细胞 | 探究性别在个体间基因表达变异性上的差异及其生物学意义 | 人类43种组织的RNA-seq数据及乳腺上皮细胞的单细胞RNA-seq数据 | 自然语言处理 | Graves病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自GTEx项目的43种组织数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-02-17 |
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087010
PMID:36713384
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了CD14+单核细胞的不同亚群在活动性结核病血液免疫特征中的独特作用 | 首次证明中间型和经典单核细胞各自贡献于活动性结核病的血液免疫特征，并识别了新的亚群和相关基因特征 | 样本量有限，仅包括活动性结核病患者和健康对照，未涵盖潜伏感染或其他疾病状态 | 探究单核细胞在活动性结核病血液免疫特征中的作用 | 活动性结核病患者在诊断和治疗中期的配对血液样本以及健康对照 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 活动性结核病患者和健康对照的配对血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-02-17 |
MAP4K3/GLK inhibits Treg differentiation by direct phosphorylating IKKβ and inducing IKKβ-mediated FoxO1 nuclear export and Foxp3 downregulation
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.72148
PMID:35966593
|
研究论文 | 本文探讨了GLK（MAP4K3）通过直接磷酸化IKKβ并诱导FoxO1核输出，从而抑制Treg分化的分子机制 | 揭示了GLK在PKCθ非依赖方式下直接磷酸化IKKβ Ser733位点的新机制，并建立了GLK-IKKβ-FoxO1信号轴调控Foxp3转录的完整通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限 | 阐明GLK/IKKβ信号轴在调节性T细胞（Treg）分化和功能中的作用机制 | T细胞特异性GLK转基因小鼠和IKKβ条件性敲除小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 染色质免疫沉淀、报告基因检测、激酶检测、蛋白质互作检测、质谱分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据、磷酸化数据 | 转基因小鼠和条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-02-13 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和RT-qPCR技术，发现体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNA表达，与体内E13.5或更晚的性原细胞不同 | 首次揭示体外分化的mPGCLCs在特定时间点未激活piRNA通路，挑战了先前关于其作为研究胎儿piRNA通路模型的假设 | 研究仅针对第6天的mPGCLCs，未涵盖更长时间点的分化过程，且未深入探讨piRNA缺失的具体分子机制 | 评估体外分化的小鼠原始生殖细胞样细胞是否具备功能性piRNA通路，以验证其作为研究模型的适用性 | 小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）及其分化过程中的piRNA通路 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个第6天mPGCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 小RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-02-09 |
Identification and Isolation of Burst-Forming Unit and Colony-Forming Unit Erythroid Progenitors from Mouse Tissue by Flow Cytometry
2022-11-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64373
PMID:36408979
|
研究论文 | 本文开发了一种基于流式细胞术的新方法，用于从小鼠骨髓或脾脏中直接、完整地鉴定和分离纯的BFU-e和CFU-e红系祖细胞 | 首次结合单细胞RNA-seq数据分析与细胞命运测定，开发了一种能够直接、完整地分离纯BFU-e和CFU-e祖细胞的流式细胞术方法，并同时鉴定其他祖细胞亚群 | 该方法目前仅在小鼠组织（骨髓和脾脏）中得到验证，尚未在人类或其他物种中应用 | 解决无法直接从新鲜分离的成年小鼠骨髓中前瞻性、完整地分离纯BFU-e和CFU-e祖细胞的技术缺口 | 小鼠骨髓和脾脏中的早期红系祖细胞（BFU-e和CFU-e）及其他造血祖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq (scRNAseq), 流式细胞术, 细胞命运测定 | NA | 单细胞基因表达数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-02-03 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探索了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的遗传调控机制及其与免疫疾病风险变异的关联 | 首次在单细胞水平上系统性地绘制了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的动态遗传调控图谱，并揭示了免疫疾病风险变异如何调控激活过程中的基因表达变化 | 研究仅针对健康个体，未直接验证疾病状态下的调控机制；样本量相对有限（119人），可能影响罕见变异的检测 | 探究遗传变异如何调控CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化，以解释免疫疾病的遗传易感性机制 | CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-12-20 |
Data-driven modeling predicts gene regulatory network dynamics during the differentiation of multipotential hematopoietic progenitors
2022-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009779
PMID:35030198
|
研究论文 | 本文通过数据驱动建模预测了多潜能造血祖细胞分化过程中的基因调控网络动态 | 利用瞬时基因表达模式推断基因调控网络的遗传结构和动态，揭示了PU.1上调的调控机制超出Gata1-PU.1双稳态开关 | 模型基于诱导细胞系数据，可能无法完全反映体内复杂环境 | 研究造血过程中细胞分化的基因调控网络动态 | 多潜能造血祖细胞分化为红细胞和中性粒细胞的过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因电路模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-12-09 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA与ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像技术，构建了一个人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱 | 结合单细胞方法与空间分析，首次全面描绘了人类肺发育中上皮、间充质、内皮及红细胞/白细胞等细胞区室，并识别了包括发育特异性分泌祖细胞和与人类小细胞肺癌相关的神经内分泌细胞亚型在内的新细胞状态 | NA | 构建人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱，以揭示细胞分化梯度和关键调控因子 | 人类胎儿肺组织（孕后5-22周） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 高通量空间转录组学, 单细胞成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 成像数据 | 涵盖孕后5-22周的人类胎儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-29 |
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0362
PMID:35977003
|
研究论文 | 本研究通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析免疫检查点抑制剂引发的皮炎和结肠炎患者组织 | 首次揭示免疫检查点阻断相关不良反应主要由组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子主导，而非传统认为的Th17通路 | 样本量有限，仅分析了皮炎和结肠炎两种不良反应类型 | 阐明免疫检查点抑制剂相关不良反应的免疫学机制 | 免疫检查点抑制剂治疗引发皮炎和结肠炎的患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤炎症和结肠炎 | 多参数免疫荧光、空间转录组学、RNA原位杂交 | NA | 组织图像、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-27 |
Liver Colonization by Colorectal Cancer Metastases Requires YAP-Controlled Plasticity at the Micrometastatic Stage
2022-05-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0933
PMID:35570706
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移过程中YAP控制的细胞可塑性在微转移阶段的关键作用 | 发现微转移灶缺乏癌症干细胞，而明显转移灶通过多细胞阶段的细胞可塑性重新产生癌症干细胞 | NA | 研究结直肠癌肝转移的分子机制和细胞动态变化 | 结直肠癌患者肝标本、小鼠肝脏转移模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 活体显微镜、单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-22 |
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of triple-negative breast cancer patients after surgery
2022-Nov, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1016/j.ijsu.2022.106936
PMID:36341760
|
研究论文 | 通过分析12种细胞死亡模式建立细胞死亡指数模型，用于预测三阴性乳腺癌患者术后预后和药物敏感性 | 首次综合12种程序性细胞死亡模式建立预测模型，并识别出两种具有不同生物学过程的三阴性乳腺癌分子亚型 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 预测三阴性乳腺癌患者术后预后和化疗敏感性 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法，转录组分析 | 无监督聚类模型，nomogram模型 | 转录组数据，基因组数据，临床信息 | 来自TCGA-BRCA、METABRIC、GSE58812、GSE21653、GSE176078、GSE75688和KM-plotter等多个队列的数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-11-13 |
Excessive IL-10 and IL-18 trigger hemophagocytic lymphohistiocytosis-like hyperinflammation and enhanced myelopoiesis
2022-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.06.017
PMID:35792218
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-10和IL-18在触发噬血细胞性淋巴组织细胞增生症样超炎症反应中的协同作用 | 首次揭示IL-10和IL-18共同升高足以驱动HLH样超炎症综合征，并证明IL-10阻断具有保护作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化需进一步验证 | 研究IL-10和IL-18在超炎症反应中的协同作用机制 | 87例继发性HLH患者、转基因小鼠模型、培养的巨噬细胞 | 免疫学 | 噬血细胞性淋巴组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序、细胞培养、转基因模型 | 转基因小鼠模型 | RNA测序数据、细胞表型数据 | 87例HLH患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |