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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-08-24 |
Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01111-0
PMID:36153630
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠西尼罗病毒恢复期前脑中的免疫细胞，揭示CXCL16/CXCR6信号通路在维持组织驻留T细胞和驱动突触消除中的作用 | 首次鉴定CXCL16/CXCR6趋化因子信号通路作为小胶质细胞和CD8+ T细胞之间的相互作用连接，调控病毒恢复后中枢神经系统中组织驻留记忆T细胞的维持和突触消除 | 研究仅在小鼠模型中开展，临床转化需进一步验证；未完全阐明CXCL16/CXCR6调控T细胞功能的分子机制 | 探究中枢神经系统免疫细胞间的相互作用，特别是T细胞与小胶质细胞之间的信号通路，以理解病毒感染后认知功能障碍的机制 | 小鼠西尼罗病毒恢复期的前脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 西尼罗病毒感染的神经系统后遗症 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、差异基因分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠前脑免疫细胞（未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-08-23 |
Mesenchymal cell replacement corrects thymic hypoplasia in murine models of 22q11.2 deletion syndrome
2022-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI160101
PMID:36136514
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探索22q11.2缺失综合征中胸腺发育不全的分子机制，发现间充质细胞异常是主因，并可通过正常间充质细胞替代或抑制胶原交联来纠正。 | 首次揭示间充质细胞而非上皮或造血细胞是22q11.2DS胸腺发育不全的关键，并通过单细胞RNA测序明确差异主要存在于间充质亚群，且提出通过替代间充质或抑制胶原交联的治疗策略。 | 研究基于小鼠模型，其与人类22q11.2DS的差异可能限制直接转化；未深入探讨间充质细胞异常的上下游分子机制；未进行长期功能验证。 | 阐明22q11.2缺失综合征导致胸腺发育不全的分子机制，并探索潜在的治疗干预方法。 | 小鼠胚胎胸腺组织，包括间充质、上皮和造血细胞，以及Tbx1neo2/neo2小鼠模型。 | 发育生物学、分子生物学 | 22q11.2缺失综合征、胸腺发育不全、唐氏综合征样免疫缺陷 | 单细胞RNA测序、器官培养、集落形成实验、胶原染色 | 小鼠基因敲除模型（Tbx1neo2/neo2） | 单细胞转录组数据、组织学图像、生长测量数据 | 小鼠胚胎胸腺，具体数量未在标题和摘要中说明。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 23 | 2026-08-23 |
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167754
PMID:35868363
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研究论文 | 本研究通过整合多种差异表达分析方法，构建集成策略来识别具有生物学意义的标记基因，以提高单细胞RNA测序数据中细胞类型标记基因的可靠性。 | 提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术，该技术能够稳健地识别标记基因，并通过反义mRNA原位杂交和免疫荧光验证其限制性表达，且易于扩展至更多方法。 | 验证结果成本高，且集成方法的效果依赖于所选方法的多样性，可能仍有改进空间。 | 开发一种集成方法，以更可靠地识别单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因。 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-08-23 |
Single-cell mapping of regenerative and fibrotic healing responses after musculoskeletal injury
2022-10-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.08.011
PMID:36150381
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序比较了肌肉骨骼损伤后再生、纤维化和异位骨化三种愈合反应，揭示了共同及特异性的分子通路 | 首次在单细胞水平上比较再生（P3截指）与纤维化（P2截指）及创伤性异位骨化模型，发现纤维化组织在转录水平上与异位骨化更相似，而非再生组织 | 摘要未提及具体局限性，可能包括样本量有限、模型仅涉及小鼠等 | 探究肌肉骨骼损伤后再生与纤维化愈合反应的分子机制，以指导未来的伤口再生策略 | 小鼠第三指节（P3）和第二指节（P2）截指模型及创伤性异位骨化组织 | 单细胞测序 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本量，涉及P3、P2截指模型及异位骨化组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-08-23 |
Adipocyte mesenchymal transition contributes to mammary tumor progression
2022-09-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111362
PMID:36103820
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研究论文 | 本研究探讨脂肪细胞间质转化在乳腺肿瘤进展中的作用，发现肿瘤浸润脂肪组织中的脂肪细胞去分化成成纤维细胞样前体细胞并促进肿瘤生长 | 首次揭示肿瘤细胞与脂肪细胞的代谢相互作用诱导脂肪细胞间质转化，并证明去分化脂肪细胞转化为多种细胞类型，且干预这一过程可影响肿瘤进展 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究肥胖与癌症关联的机制，特别是脂肪细胞在肿瘤微环境中通过间质转化促进肿瘤进展的机制 | 乳腺肿瘤中的脂肪细胞及其去分化过程 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-08-23 |
Cell type-specific inference of differential expression in spatial transcriptomics
2022-09, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01575-3
PMID:36050488
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研究论文 | 提出一种名为C-SIDE的统计方法，用于在空间转录组数据中识别细胞类型特异性的差异表达基因，并考虑其他细胞类型的空间定位。 | C-SIDE通过加性混合模型明确考虑其他细胞类型的存在，能够准确估计细胞类型特异性表达，并支持多种组织情境和多样本统计分析。 | 文章未在摘要中提及具体的局限性。 | 开发一种统计方法，以解决空间转录组中因细胞类型组成变化和像素混合导致的差异表达检测难题。 | 空间转录组数据中的基因表达，涉及不同细胞类型和组织背景。 | 生物信息学、空间转录组学 | 阿尔茨海默病、肿瘤 | 空间转录组测序技术（Slide-seq、MERFISH、Visium） | 统计模型（对数线性混合模型） | 空间转录组数据（基因表达矩阵） | 未在摘要中指明具体样本量。 | 10x Genomics（用于Visium） | 空间转录组学 | 10x Visium（用于Visium数据） | 未在摘要中提供平台配置细节。 |
| 27 | 2026-08-23 |
Distinct functional properties of murine perinatal and adult adipose progenitor subpopulations
2022-08, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-022-00613-w
PMID:35982290
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示小鼠围产期附睾白色脂肪组织中的祖细胞亚群，并发现围产期与成年期纤维炎症祖细胞的功能差异及其对代谢健康的长期影响 | 首次描绘围产期附睾白色脂肪原基的细胞景观，并发现围产期短暂过表达Pparg可导致持久的前体细胞重编程和成年期肥胖保护 | 摘要未提及研究的局限性 | 研究围产期与成年期脂肪祖细胞亚群的功能差异及其对白色脂肪组织功能和可塑性的影响 | 小鼠围产期和成年期的附睾白色脂肪组织祖细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 肥胖 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雄性小鼠，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-08-22 |
Drepmel-A Multi-Omics Melanoma Drug Repurposing Resource for Prioritizing Drug Combinations and Understanding Tumor Microenvironment
2022-09-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11182894
PMID:36139469
|
研究论文 | 开发了一个名为DRepMel的多组学黑色素瘤药物重定位资源，用于优先排序药物组合并理解肿瘤微环境 | 提出了一个基于多组学药物重定位计算方法的Shiny应用，能够从七万三千种组合中预测合理的联合治疗方案，并利用单细胞RNA-seq数据识别对肿瘤微环境的潜在治疗影响 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 为黑色素瘤患者提供合理的联合治疗预测，并理解治疗对肿瘤微环境的影响 | 黑色素瘤患者 | 机器学习和计算生物学 | 黑色素瘤 | 全外显子测序、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 两个独立患者队列的批量样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-08-22 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Molecular Features of Heterogeneity in the Murine Retinal Pigment Epithelium
2022-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810419
PMID:36142331
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜色素上皮细胞异质性的分子特征 | 首次在小鼠视网膜色素上皮中识别出六个不同的细胞亚群，并发现一个具有干细胞/祖细胞特征的细胞群，为理解RPE发育和代谢网络提供新视角 | 仅使用两只年轻成年雄性小鼠，样本量有限，可能无法完全代表RPE细胞的全部异质性 | 评估小鼠视网膜色素上皮细胞的异质性，并建立转录组基线，以用于未来研究 | 两只年轻成年雄性C57BL/6J小鼠的视网膜色素上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2只小鼠，共5513个RPE细胞（2667和2846个） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-08-22 |
Targeting Glutamine Metabolism to Enhance Immunoprevention of EGFR-Driven Lung Cancer
2022-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105885
PMID:35861366
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研究论文 | 该研究探讨了靶向谷氨酰胺代谢的JHU083药物与EGFR肽疫苗联合使用对EGFR驱动的小鼠肺癌发生具有显著抑制效果，并增强抗肿瘤免疫反应。 | 首次报道JHU083作为一种口服谷氨酰胺拮抗剂前药，在肿瘤微环境中优先激活，与EGFR肽疫苗联合使用时能显著抑制EGFR驱动的肺癌发生，并发现Th1细胞在谷氨酰胺抑制下上调氧化代谢并呈现激活和记忆样表型。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证其效果和安全性。 | 评估JHU083对EGFR驱动肺癌的预防和治疗效果，并探索其与EGFR肽疫苗联合使用的免疫机制。 | EGFR驱动的小鼠肺肿瘤模型及肿瘤微环境中的免疫细胞。 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 小鼠模型，具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置 |
| 31 | 2026-08-21 |
Protocol for the isolation of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes from human tumors and their characterization by single-cell immune profiling and multiome
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101649
PMID:36065294
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研究论文 | 本文提出了一种从人类肿瘤中分离CD8+肿瘤浸润淋巴细胞并进行单细胞免疫谱和多重组学表征的实验方案 | 建立了结合单细胞RNA测序、VDJ谱分析和染色质结构分析的综合方案，为CD8 TILs的表征提供了详细指导 | 未明确说明局限性 | 建立用于表征人类肿瘤中CD8 TILs异质性和免疫生物学的实验方案 | 人类肿瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、VDJ测序、染色质可及性分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞VDJ测序、单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'、10x Chromium单细胞VDJ、10x Chromium单细胞ATAC |
| 32 | 2026-08-21 |
Heterogeneity and transcriptome changes of human CD8+ T cells across nine decades of life
2022-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32869-x
PMID:36050300
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究人类CD8+ T细胞在九十年生命跨度的异质性和转录组变化，并开发预测细胞年龄的机器学习模型 | 首次结合横断面和纵向样本，全面描述CD8+ T细胞在九十年间的异质性变化，并揭示年龄相关基因表达变化的三种模式，开发出基于转录组特征预测细胞年龄的机器学习模型，并在HIV感染和CAR T细胞扩增两个独立情境中验证 | 摘要未提及明显局限性 | 阐明人类CD8+ T细胞在衰老过程中异质性和转录组变化及其机制，并建立预测模型 | 人类CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 单细胞转录组数据 | 横断面和纵向样本，具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 33 | 2026-08-21 |
Sex Differences in Coronary Artery Disease and Diabetes Revealed by scRNA-Seq and CITE-Seq of Human CD4+ T Cells
2022-Aug-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23179875
PMID:36077273
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和CITE-Seq分析人类CD4+ T细胞，揭示了冠状动脉疾病和糖尿病中存在的性别差异及共同基因表达特征 | 首次将scRNA-Seq与CITE-Seq结合应用于冠状动脉疾病与糖尿病中CD4+ T细胞的研究，并系统评估性别和糖尿病状态对细胞比例及基因表达的影响 | 样本量相对较小，且研究为横断面设计，未能建立因果关系；仅聚焦于CD4+ T细胞，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究冠状动脉疾病与性别及糖尿病之间的关联，通过CD4+ T细胞的单细胞转录组和表面蛋白表达谱分析来理解其免疫机制 | 接受心导管检查的61名男性和女性的外周血单核细胞（PBMCs）中的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病、糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、CITE-Seq | NA | 转录组和表面蛋白表达数据 | 41,782个单CD4+ T细胞，来自61名受试者（16名女性，45名男性） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、CITE-Seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'文库制备，并结合49种表面标记物的CITE-Seq |
| 34 | 2026-08-21 |
B7H3-dependent myeloid-derived suppressor cell recruitment and activation in pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.901349
PMID:36045668
|
研究论文 | 本研究探讨了B7H3依赖性髓源性抑制细胞在肺纤维化中的募集与激活作用 | 首次揭示B7H3通过促进MDSC的扩增和募集，进而激活肌成纤维细胞分化，加重肺纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本量有限，需进一步验证 | 探究MDSCs在特发性肺纤维化中的作用及其依赖B7H3的调控机制 | 特发性肺纤维化患者外周血样本及小鼠肺纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特发性肺纤维化患者外周血样本和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 35 | 2026-08-20 |
'Youthful' phenotype of c-Kit+ cardiac fibroblasts
2022-Jul-16, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04449-1
PMID:35841449
|
研究论文 | 本研究揭示了c-Kit+心脏成纤维细胞具有年轻化表型，并探讨了其在衰老和病理损伤过程中的作用 | 首次评估了c-Kit在DDR2心脏成纤维细胞群体中的生物学意义，发现c-Kit表达与年轻化表型相关 | 未提及明确的局限性 | 探究c-Kit在心脏成纤维细胞中的生物学作用及其与衰老和损伤的关系 | 心脏成纤维细胞（c-Kit+和c-Kit-）及心脏间质细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞形态和功能数据 | 小鼠心脏组织样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 36 | 2026-08-20 |
Coding and long non-coding gene expression changes in the CNS traumatic injuries
2022-Feb-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04092-2
PMID:35129669
|
综述 | 本文综述了创伤性脑损伤和脊髓损伤中编码基因及长链非编码RNA表达变化的研究进展，并探讨其分子机制及作为诊断、治疗和预后靶点的潜力 | 强调了长链非编码RNA在CNS创伤中的组织及细胞类型特异性表达模式，并系统总结了其通过增益或功能缺失调控蛋白编码基因或miRNA参与炎症、胶质激活等过程的新见解 | 由于是综述，未进行原始实验验证，可能缺乏对具体分子机制的深入定量分析 | 总结SCI和TBI的转录组学研究进展，阐明lncRNA在CNS损伤中的调控作用及转化潜力 | 创伤性脑损伤和脊髓损伤中的编码基因及长链非编码RNA | 基因组学 | 中枢神经系统创伤（创伤性脑损伤和脊髓损伤） | bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-08-18 |
A stromal Integrated Stress Response activates perivascular cancer-associated fibroblasts to drive angiogenesis and tumour progression
2022-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00918-8
PMID:35654839
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠中的ATF4，发现基质细胞中整合应激反应通过激活血管周围癌症相关成纤维细胞，促进血管生成和肿瘤进展 | 首次揭示基质ATF4作为关键驱动因子，调控癌症相关成纤维细胞功能、恶性进展和转移，并阐明其通过调控胶原合成和氨基酸代谢的机制 | 摘要未提及具体局限性 | 探究宿主基质细胞中ATF4在肿瘤血管生成和进展中的作用及机制 | 小鼠模型中的黑色素瘤和胰腺肿瘤，以及人黑色素瘤和胰腺肿瘤样本 | 癌症生物学 | 黑色素瘤, 胰腺癌 | 条件性基因敲除, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-08-18 |
STtools: A Comprehensive Software Pipeline for Ultra-high Resolution Spatial Transcriptomics Data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac061
PMID:36284674
|
研究论文 | 开发了STtools软件管道，用于处理超高通量空间转录组数据，支持多种分辨率并自动进行下游分析。 | 提供可扩展的框架，能处理亚微米分辨率的超高通量空间转录组数据，且不降低分辨率。 | 未提及具体局限性。 | 满足对具有计算可扩展性且不损失分辨率的亚微米分辨率空间转录组数据分析工具的新需求。 | 空间转录组数据集，包括Seq-Scope、Slide-seq和VISIUM等平台产生的数据。 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据及原始FASTQ文件 | NA | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope, Slide-seq, VISIUM | NA |
| 39 | 2026-08-17 |
Origin and function of activated fibroblast states during zebrafish heart regeneration
2022-08, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01129-5
PMID:35864193
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学和时空分析，解析了斑马鱼心脏再生过程中激活成纤维细胞状态的多样性及其功能 | 首次通过高通量谱系追踪确定了激活成纤维细胞来源于心外膜和心内膜两个独立来源，并发现Wnt信号调控心内膜成纤维细胞反应 | 摘要中未提及研究的局限性 | 揭示斑马鱼心脏再生过程中激活成纤维细胞状态的起源和功能，为调节脊椎动物心脏再生能力提供潜在途径 | 斑马鱼心脏再生过程中的激活成纤维细胞状态 | 单细胞转录组学 | 心脏损伤 | 单细胞转录组学、高通量谱系追踪、时空分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-08-17 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了KMT2A重排婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病独特的早期淋巴细胞前体发育状态 | 首次利用单细胞转录组学结合发育骨髓参考图谱，识别出KMT2A重排婴儿B-ALL特有的早期淋巴细胞前体状态，并发现其具有杂交髓系-淋巴系特征及非生理性抗原组合 | 样本量可能有限，且仅基于转录组数据推断发育状态，未涉及表观遗传或蛋白水平验证 | 探究KMT2A重排婴儿B-ALL的细胞发育起源和状态，以理解其侵袭性并寻找潜在治疗靶点 | KMT2A重排婴儿B-ALL患者样本及NUTM1重排婴儿ALL作为对照，包括一名复发为AML的儿童的白血病样本 | 单细胞转录组学、血液肿瘤学 | 婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量mRNA分析、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、流式细胞术数据 | KMT2A重排婴儿B-ALL样本（具体数量未提供）及NUTM1重排对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' (推测，基于常见平台配置) |