单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和小RNA测序发现体外分化的小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNAs | 首次证明体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞尚未建立功能性piRNA通路 | 研究仅关注第6天的mPGCLCs，未覆盖更长的分化时间点 | 探究小鼠原始生殖细胞样细胞中piRNA通路的发育状态 | 小鼠原始生殖细胞样细胞(mPGCLCs) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 多个第6天mPGCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 小RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
|
研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了阿尔茨海默病小鼠模型中斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病不同阶段的转录组重塑 | 首次结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA-seq技术，无预设地识别斑块相关和斑块远离小胶质细胞在疾病关键阶段的基因失调网络 | 研究基于小鼠模型，人类验证仅使用死后脑组织样本 | 揭示斑块相关和斑块远离小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同贡献 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 激光捕获显微切割，RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 阿尔茨海默病小鼠模型在疾病早期、中期和晚期阶段的小胶质细胞样本 | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Graph deep learning for the characterization of tumour microenvironments from spatial protein profiles in tissue specimens
2022-12, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-022-00951-w
PMID:36357512
|
研究论文 | 利用图神经网络分析组织样本中的空间蛋白质谱以表征肿瘤微环境 | 提出基于空间蛋白质谱的局部子图建模方法，能捕捉与临床结果相关的独特细胞相互作用 | 方法验证仅限于头颈癌和结直肠癌样本，需进一步扩展验证 | 开发基于图深度学习的肿瘤微环境表征方法以预测患者预后 | 人类头颈癌和结直肠癌组织样本 | 计算机视觉 | 头颈癌,结直肠癌 | 多重免疫荧光成像 | 图神经网络(GNN) | 空间蛋白质谱图像 | NA | NA | 多重免疫荧光成像 | NA | 40重免疫荧光成像 |
| 24 | 2025-10-06 |
JAG1-NOTCH4 mechanosensing drives atherosclerosis
2022-09-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo7958
PMID:36044575
|
研究论文 | 本研究揭示了JAG1-NOTCH4信号通路通过感知紊乱血流促进动脉粥样硬化的机制 | 首次发现JAG1-NOTCH4通路在感知紊乱血流中的作用及其通过调节内皮细胞异质性促进动脉粥样硬化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，需要进一步验证在人类疾病中的直接相关性 | 探究紊乱血流通过JAG1-NOTCH4信号通路促进动脉粥样硬化的分子机制 | 猪和鼠的动脉组织、培养的人类冠状动脉内皮细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,光片成像 | NA | 基因表达数据,成像数据 | 多种动物模型和细胞培养体系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Amyloid-beta and tau pathologies act synergistically to induce novel disease stage-specific microglia subtypes
2022-12-17, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-022-00589-x
PMID:36536457
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了淀粉样蛋白-β和tau病理在阿尔茨海默病进展中协同诱导新型疾病阶段特异性小胶质细胞亚型 | 首次发现Aβ和tau病理协同作用在疾病不同阶段诱导特异性小胶质细胞亚型EADAM和LADAM，并鉴定Siglec基因作为AD进展的生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 探究阿尔茨海默病中Aβ和tau病理如何协同调控小胶质细胞亚型 | AD模型小鼠的小胶质细胞及人类颞上回和内嗅皮层组织 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, snRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | AD模型小鼠及不同Braak分期的人类脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and cell-specific proteomics reveals molecular signatures of sleep
2022-08-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03800-3
PMID:35986171
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和细胞特异性蛋白质组学揭示睡眠的分子特征 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞类型特异性蛋白质组学技术系统研究睡眠分子机制 | 仅研究了三个脑区，未覆盖全脑所有区域；样本量未明确说明 | 探索睡眠调控的分子机制 | 脑干、皮层和下丘脑中的不同细胞类型（星形胶质细胞和神经元） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Cisplatin Neurotoxicity Targets Specific Subpopulations and K+ Channels in Tyrosine-Hydroxylase Positive Dorsal Root Ganglia Neurons
2022, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2022.853035
PMID:35586548
|
研究论文 | 本研究揭示顺铂通过靶向酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元中的特定亚群和K+通道导致神经毒性 | 首次在单细胞水平揭示顺铂神经毒性的特异性细胞靶点，发现K2P18.1钾通道在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本验证；维生素E的保护作用有限 | 探究顺铂化疗引起的外周神经病变的细胞机制 | 小鼠酪氨酸羟化酶阳性背根神经节神经元 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 单细胞转录组测序,电生理分析 | NA | 转录组数据,电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac048
PMID:35896368
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示白血病抑制因子诱导的脂肪来源细胞向心脏细胞转变的动态过程 | 首次在单细胞分辨率下解析ADC向心脏细胞转变的异质性和细胞动力学，发现Nrf2信号通路的瞬时变化是心肌生成起始的关键 | 研究主要关注LIF诱导的转变过程，其他因子可能的影响尚未探索 | 探究脂肪来源细胞向心脏细胞转变的机制和细胞异质性 | 脂肪来源细胞(ADCs)及其向心脏细胞的转变过程 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 39,432个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
New insights into tuft cell formation: Implications for structure-function relationships
2022-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2022.102082
PMID:35468541
|
综述 | 总结簇细胞形成与功能的最新研究进展，重点关注不同疾病状态和器官系统中的发育机制 | 利用单细胞转录组学和计算生物学方法揭示簇细胞形成与成熟的遗传和环境调控机制 | NA | 探讨簇细胞的发育过程及其在不同器官系统中的功能作用 | 簇细胞（哨兵化学感应细胞） | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Sox13 is a novel flow-sensitive transcription factor that prevents inflammation by repressing chemokine expression in endothelial cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.979745
PMID:36247423
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现SOX13是一种新型流动敏感转录因子，能够抑制内皮细胞中炎症趋化因子的表达 | 首次鉴定SOX13为流动敏感转录因子，并揭示其在稳定血流条件下抑制内皮细胞炎症反应的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养的人主动脉内皮细胞，需要在更复杂的体内环境中进一步验证 | 探索血流动力学调节内皮细胞炎症反应的分子机制，寻找新的动脉粥样硬化治疗靶点 | 小鼠颈动脉模型和培养的人主动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, RNA干扰, RNA测序, qPCR, ELISA | 小鼠部分颈动脉结扎模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
ZetaSuite: computational analysis of two-dimensional high-throughput data from multi-target screens and single-cell transcriptomics
2022-07-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02729-4
PMID:35879727
|
研究论文 | 开发用于分析二维高通量数据的Zeta统计量和ZetaSuite软件包 | 提出新的Zeta统计量，专门用于分析二维高通量数据，并开发配套软件工具 | NA | 解决功能基因组学中二维高通量数据分析的挑战 | 二维RNAi筛选数据、癌症依赖性筛选数据、单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNAi筛选、单细胞转录组学 | 统计模型 | 高通量功能数据、单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Universal prediction of cell-cycle position using transfer learning
2022-01-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02581-y
PMID:35101061
|
研究论文 | 开发了一种名为tricycle的R/Bioconductor软件包，通过迁移学习实现细胞周期位置的通用预测 | 利用细胞周期生物学特性、周期性函数主成分分析的数学特性和迁移学习，克服了数据集依赖嵌入的学习限制 | NA | 从单细胞RNA-seq数据高分辨率推断细胞周期位置 | 细胞周期 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习，主成分分析 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Omnibus and robust deconvolution scheme for bulk RNA sequencing data integrating multiple single-cell reference sets and prior biological knowledge
2022-09-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac563
PMID:35980155
|
研究论文 | 提出一种整合多个单细胞参考集和先验生物知识的稳健反卷积算法InteRD，用于从批量RNA测序数据推断细胞类型比例 | 开发了带惩罚回归和新评估标准的反卷积算法，能有效整合多个单细胞数据集并利用先验生物信息进行校准 | 算法性能仍依赖于外部数据源的质量和先验信息的准确性 | 开发更准确和稳健的细胞类型反卷积方法 | 批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 惩罚回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 开发了一个增强的单细胞RNA测序分析工作流程，用于研究冠状动脉疾病的细胞相互作用和潜在药物靶点 | 整合了自动化细胞标记、伪时序排序、配体-受体评估和药物-基因相互作用分析的用户友好型工作流程，并开发了交互式网络应用PlaqView | 基于已发表的单细胞数据集进行二次分析，需要进一步实验验证 | 开发单细胞RNA测序分析工作流程以研究动脉粥样硬化斑块微环境和发现潜在治疗方法 | 人类冠状动脉单细胞数据集中的细胞类型，特别是平滑肌细胞来源的成纤维样细胞 | 单细胞分析 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析，配体-受体相互作用分析 | 单细胞RNA测序数据 | 基于Wirka等人先前发表的人类冠状动脉单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Ensembles of endothelial and mural cells promote angiogenesis in prenatal human brain
2022-09-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.09.004
PMID:36179668
|
研究论文 | 本研究揭示了产前人类大脑中内皮细胞和周细胞协同促进血管生成的新机制 | 首次在人类产前大脑中发现内皮细胞和周细胞亚型组成的功能性集合体，并揭示其通过胶原蛋白、层粘连蛋白和中动蛋白等信号机制促进血管成熟 | 研究主要聚焦于妊娠中期的发育阶段，缺乏对其他发育时期的比较分析 | 探索产前人类大脑血管细胞成熟阶段的分子机制和细胞相互作用 | 产前人类大脑血管系统中的内皮细胞和周细胞 | 单细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选, 单细胞转录组学, 组织学分析, 超微结构分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 妊娠中期人类大脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
CXCL12 defines lung endothelial heterogeneity and promotes distal vascular growth
2022-11-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200909
PMID:36239312
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肺内皮细胞异质性，发现CXCL12信号对远端血管发育的关键作用 | 首次利用Cxcl12转基因小鼠报告系统结合单细胞测序技术解析肺动脉内皮细胞的功能异质性 | 研究局限于小鼠胚胎发育模型，尚未在人类样本中验证 | 探索肺血管系统在胚胎发育过程中的形态发生和生长机制 | 小鼠肺内皮细胞，特别是Cxcl12-DsRed+动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 儿科肺疾病 | 单细胞RNA测序，转基因报告系统，基因本体分析，组织学分析 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 转基因小鼠肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
The role of specialized cell cycles during erythroid lineage development: insights from single-cell RNA sequencing
2022-Aug, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-022-03406-9
PMID:35759181
|
综述 | 本文综述了红细胞谱系发育过程中特殊细胞周期的作用，重点关注CFU-e向红细胞终末分化的转变机制 | 揭示了CFU-e/ETD转变是一个快速的S期依赖性转录开关，并发现细胞周期速度和S期缩短在细胞命运决定中的新发育作用 | NA | 探讨红细胞谱系发育过程中细胞周期调控的机制 | 红细胞祖细胞(CFU-e)和红细胞终末分化(ETD)过程 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Comparison of oocyte vitrification using a semi-automated or a manual closed system in human siblings: survival and transcriptomic analyses
2022-Dec-05, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-022-01064-3
PMID:36464714
|
研究论文 | 比较半自动与手动封闭系统对人类姐妹卵母细胞玻璃化冷冻的效果，包括存活率和转录组分析 | 首次使用单细胞RNA-seq技术评估卵母细胞玻璃化冷冻的转录组后果，并比较新型半自动化系统与传统手动方法的差异 | 研究样本量有限，且不同研究间未观察到一致的转录组特征 | 评估半自动化卵母细胞玻璃化冷冻系统的效率及其对卵母细胞转录组的影响 | 人类姐妹卵母细胞 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA-seq, 玻璃化冷冻技术 | NA | 基因表达数据, 形态测量数据 | 人类姐妹卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Uncoupling immune trajectories of response and adverse events from anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2022-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.03.039
PMID:35430299
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了肝细胞癌患者接受抗PD-1免疫治疗的应答和不良反应的免疫轨迹机制 | 首次在肝细胞癌中识别出与抗PD-1治疗应答和不良反应相关的CXCR3+CD8+效应记忆T细胞和CD11c+抗原呈递细胞，并提出了抗PD-1与抗TNFR2联合治疗新策略 | 样本量相对有限（新加坡队列32例，韩国队列29例），需要在更大规模研究中验证 | 解析肝细胞癌患者接受抗PD-1免疫治疗的应答和免疫相关不良反应的免疫机制 | 肝细胞癌患者和小鼠肝细胞癌模型 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术验证, 批量RNA测序 | 小鼠肝细胞癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 批量RNA测序数据 | 新加坡队列32例患者60份外周血样本，韩国队列29例患者，20份治疗前后肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
T cell characteristics associated with toxicity to immune checkpoint blockade in patients with melanoma
2022-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01623-z
PMID:35027754
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析黑色素瘤患者外周血样本，发现与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 首次发现循环中活化的CD4记忆T细胞丰度和TCR多样性这两个治疗前因素与严重免疫相关不良事件的发生相关 | 样本量相对有限（共3个队列，n=27、26和18），需要更大规模研究验证 | 探索与免疫检查点抑制剂毒性相关的T细胞特征 | 接受抗PD-1单药或抗PD-1联合抗CTLA-4治疗的黑色素瘤患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 飞行时间质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序 | NA | 单细胞测序数据，质谱流式数据，RNA测序数据 | 93份治疗前和早期治疗血液样本，3个患者队列（n=27、26和18） | NA | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序，bulk RNA测序，bulk TCR测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |