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当前共找到 4054 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-19 |
Proteomic and Single-Cell Transcriptomic Dissection of Human Plasmacytoid Dendritic Cell Response to Influenza Virus
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.814627
PMID:35401570
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学和单细胞转录组学技术，全面解析了人类浆细胞样树突状细胞对流感病毒的反应 | 首次报告了pDC在生理刺激下的全面无偏分泌组分析，并结合单细胞RNA-seq揭示了pDC的异质性和激活后的功能特化 | 研究仅针对流感H1N1病毒，未涵盖其他病毒或刺激条件，且样本来源和数量可能有限 | 研究人类浆细胞样树突状细胞在基线和流感病毒刺激下的分子特征和功能异质性 | 人类浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 流感 | LC-MS/MS, 单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-04-18 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SECANT的生物学引导的半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括：1) 利用表面蛋白数据中识别出的可靠细胞类型标签指导细胞聚类；2) 为每个细胞簇提供可靠的细胞类型通用注释；3) 利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞来提高性能；4) 能够准确预测scRNA-seq数据中的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据分析方法 | 单细胞多组学数据（特别是CITE-seq数据） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 半监督模型 | 单细胞多组学数据 | 公共和内部数据集（来自多个组织） | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-04-18 |
RAGE Inhibitors as Alternatives to Dexamethasone for Managing Cerebral Edema Following Brain Tumor Surgery
2022-03, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1007/s13311-022-01207-w
PMID:35226341
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研究论文 | 本文研究了RAGE抑制剂作为地塞米松替代方案，用于管理脑肿瘤手术后脑水肿的效果 | 首次证实RAGE抑制剂在减轻神经炎症方面与地塞米松效果相当，且不影响抗PD-1免疫疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化需进一步验证 | 探索替代地塞米松的新方法，以最小化神经外科手术引起的脑水肿 | 小鼠和人类脑肿瘤组织及手术腔液 | 神经科学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, ELISA, Nanostring, 流式细胞术, qPCR, 免疫印迹 | RAGE基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞数据 | 野生型和RAGE敲除小鼠脑组织, 人类肿瘤组织和手术腔液 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-04-17 |
Molecular Computational Anatomy: Unifying the Particle to Tissue Continuum via Measure Representations of the Brain
2022, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/2022/9868673
PMID:37206893
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研究论文 | 本文提出了一种基于几何测度表示的分子计算解剖学理论，用于统一大脑映射中空间转录组学和细胞尺度组织学与组织尺度的计算解剖学 | 引入几何varifold测度和统计力学方法，首次将分子尺度的确定性粒子描述与组织尺度的统计集合统一起来，实现从分子到组织尺度的无缝过渡 | 未明确说明实验验证或具体应用案例，理论框架的实践可行性有待进一步探索 | 统一大脑映射中的分子尺度（如空间转录组学）和组织尺度（如计算解剖学）表示，以理解大脑的结构和功能特性 | 大脑的分子、细胞和组织尺度结构，包括蛋白质、转录组功能身份、电生理学、分子组织学等 | 计算解剖学 | NA | 空间转录组学、数字病理学、分子组织学、电生理学 | 几何varifold测度、统计力学模型 | 分子数据、图像数据、功能状态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 25 | 2026-04-17 |
STtools: A Comprehensive Software Pipeline for Ultra-high Resolution Spatial Transcriptomics Data
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac061
PMID:36284674
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研究论文 | 本文介绍了STtools，一个用于处理超高清空间转录组数据的综合软件管道 | STtools能处理新兴技术生成的亚微米分辨率数据，计算可扩展性强，且不牺牲分辨率，相比现有方法提供数倍更高的分析分辨率 | NA | 开发一个能处理多种分辨率空间转录组数据的软件工具，以解决现有工具无法有效处理超高清数据的问题 | 空间转录组数据集，包括Seq-Scope、Slide-seq和VISIUM生成的数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Seq-Scope, Slide-seq, VISIUM | Seq-Scope（<1μm分辨率）, Slide-seq（10μm分辨率）, VISIUM（100μm分辨率） |
| 26 | 2026-04-14 |
Kidney-Targeted Renalase Agonist Prevents Cisplatin-Induced Chronic Kidney Disease by Inhibiting Regulated Necrosis and Inflammation
2022-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021040439
PMID:34921111
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研究论文 | 本研究探讨了通过肾脏靶向递送肾胺酶激动剂RP81-MNP，在顺铂诱导的慢性肾病小鼠模型中预防肾损伤的机制和效果 | 首次使用中尺度纳米颗粒封装肾胺酶激动剂肽RP81进行肾脏靶向递送，通过单细胞RNA测序分析揭示了其在保护肾小管上皮细胞和抑制炎症反应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仅涉及血浆肾胺酶水平趋势，未直接验证RP81-MNP在人体中的疗效 | 研究肾胺酶激动剂在预防顺铂诱导的慢性肾病中的作用机制和治疗潜力 | 顺铂诱导的慢性肾病小鼠模型以及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | 小鼠模型及头颈部鳞状细胞癌患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-04-11 |
Developmental regulation of epithelial cell cuboidal-to-squamous transition in Drosophila follicle cells
2022-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.09.001
PMID:36100084
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研究论文 | 本研究揭示了果蝇卵泡细胞从立方体到鳞状形态转变的发育调控机制 | 发现蜕皮激素和JAK/STAT信号通路协同抑制转录因子Broad，从而调控上皮细胞形态重塑，并首次结合单细胞RNA测序数据揭示基因表达变化 | 研究局限于果蝇模型系统，在哺乳动物中的保守性尚未验证 | 探究上皮细胞形态转变的分子调控机制 | 果蝇卵泡上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-10 |
TWO-SIGMA-G: a new competitive gene set testing framework for scRNA-seq data accounting for inter-gene and cell-cell correlation
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac084
PMID:35325048
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研究论文 | 本文提出了一种名为TWO-SIGMA-G的竞争性基因集测试框架，专门用于单细胞RNA测序数据，以解决基因间相关性和细胞间相关性的问题 | TWO-SIGMA-G采用了一种新颖的方法来调整基因集水平的基因间相关性，从而控制假阳性率，相比其他方法在存在基因间相关性时提高了统计功效 | NA | 开发一种用于单细胞RNA测序数据的竞争性基因集测试方法，以更准确地识别差异表达基因集 | 单细胞RNA测序数据，包括来自异种移植小鼠的HIV相关干扰素通路和人类阿尔茨海默病进展相关通路 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 混合效应回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-04-09 |
Cerebrospinal fluid immune dysregulation during healthy brain aging and cognitive impairment
2022-12-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.019
PMID:36516855
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康衰老和认知障碍期间脑脊液免疫系统的变化 | 首次在单细胞水平上揭示了脑脊液免疫系统随年龄和认知障碍的动态变化，并发现了CXCL16-CXCR6信号通路在T细胞进入大脑中的潜在作用 | 样本量相对较小（共59例），且为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究健康大脑衰老和认知障碍期间脑脊液免疫系统的变化 | 人类脑脊液样本 | 单细胞组学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 59例受试者（45例认知正常，14例认知障碍） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-04-09 |
Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts
2022-Apr-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092197
PMID:35565326
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研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌（PDAC）从原发灶到淋巴结转移过程中的单细胞RNA测序数据，揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在转移过程中的动态变化及其对基质侵袭性的调控作用 | 提出了“进化侵袭性水平（ELI）”框架来解释基质侵袭性的演变，并发现PDAC转移初期伴随促抵抗基因的下调和促侵袭性成纤维细胞亚群的出现 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据，实验验证部分可能有限；样本阶段覆盖可能不够全面 | 探究胰腺导管腺癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的动态变化及其在调控基质侵袭性和促进转移中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）组织样本、癌症相关成纤维细胞（CAFs）、星状细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据（RNA-seq） | 基于Peng等人已发表单细胞RNA测序数据及TCGA批量RNAseq队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-08 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
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研究论文 | 本文通过多模态方法研究了非洲爪蟾附肢再生过程中的代谢重编程，发现再生组织通过增强戊糖磷酸途径（PPP）通量来支持细胞增殖和再生 | 揭示了再生过程中葡萄糖代谢从糖酵解转向戊糖磷酸途径（PPP）的关键代谢重编程机制，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）证实了高增殖细胞中PPP酶转录上调 | 研究主要基于非洲爪蟾模型，结果在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证，且未深入探讨PPP调控的具体分子机制 | 探究再生过程中支持快速组织生长的代谢途径 | 非洲爪蟾（Xenopus tropicalis）的附肢再生组织 | 代谢组学与再生生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）代谢物分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 代谢物数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-07 |
Transcriptional profiling reveals roles of intercellular Fgf9 signaling in astrocyte maturation and synaptic refinement during brainstem development
2022-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2022.102176
PMID:35753346
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了脑干发育过程中神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号在星形胶质细胞成熟和突触精细化中的关键作用 | 首次在单细胞水平上解析了脑干MNTB区域各主要细胞类型的转录谱，并发现了神经元-星形胶质细胞间Fgf9信号网络对星形胶质细胞成熟、神经元周围网络结构和突触精细化的调控机制 | 研究主要聚焦于脑干MNTB区域，结果可能不适用于其他脑区；单细胞RNA测序技术虽然能揭示细胞异质性，但可能无法完全捕捉低丰度基因表达或瞬态信号事件 | 探究脑干发育过程中细胞间信号传导对神经组织成熟和突触精细化的调控机制 | 小鼠脑干内侧斜方体核（MNTB）的主要细胞类型，包括神经元、星形胶质细胞和血管相关细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-04 |
Bone marrow-confined IL-6 signaling mediates the progression of myelodysplastic syndromes to acute myeloid leukemia
2022-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI152673
PMID:35900794
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓微环境中IL-6信号通路在骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化中的关键作用 | 建立了模拟年龄相关MDS向AML进展的小鼠模型，并首次证明骨髓微环境特异性IL-6信号是白血病转化的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证相对有限，且未详细探讨IL-6信号下游的具体分子机制 | 探究骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化的分子机制，特别是衰老微环境的作用 | mDia1/miR-146a双敲除小鼠模型、高风险MDS患者的CD34阳性细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和MDS患者细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-03 |
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049349
PMID:36254682
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，比较了脂多糖（LPS）等免疫刺激对人类诱导多能干细胞来源的小胶质细胞转录组的影响，并发现LPS+IFN-γ刺激能使其转录组特征更接近阿尔茨海默病（AD）小鼠模型中的小胶质细胞 | 首次系统比较了不同免疫刺激（包括LPS、IFN-γ和ATPγS）对人类iPSC来源小胶质细胞转录组的时序影响，并发现LPS+IFN-γ组合能特异性地诱导其转录组变化与AD小鼠模型中的小胶质细胞特征相似 | 研究主要基于体外培养的iPSC来源小胶质细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂微环境；且仅分析了24小时和48小时两个时间点，缺乏更长期的动态观察 | 探究不同免疫刺激对人类iPSC来源小胶质细胞转录组的影响，并评估其与阿尔茨海默病病理的相关性 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）来源的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个处理组（PGE2、LPS+IFN-γ、ATPγS单独或组合处理）在两个时间点（24小时和48小时）的转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-04-03 |
Spatial transcriptomics of dorsal root ganglia identifies molecular signatures of human nociceptors
2022-02-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj8186
PMID:35171654
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，对八名器官捐献者的背根神经节（DRG）单神经元进行分子特征分析，鉴定了人类伤害性感受器的分子特征 | 首次对人类背根神经节伤害性感受器进行全面的空间转录组学表征，系统鉴定了12种人类感觉神经元亚型，并与小鼠及非人灵长类动物进行了直接比较，揭示了物种差异和潜在的药物靶点 | 样本量有限（仅8名器官捐献者），且为死后组织，可能无法完全反映活体状态下的基因表达情况 | 鉴定人类伤害性感受器的转录组特征，识别物种差异并寻找潜在药物靶点，以开发更好的急慢性疼痛治疗方法 | 人类背根神经节（DRG）中的感觉神经元，特别是伤害性感受器 | 空间转录组学 | 疼痛障碍（急慢性疼痛） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 8名人类器官捐献者的背根神经节组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-03-31 |
Multiplexed single-cell RNA-sequencing of mouse thymic and splenic samples
2022-Mar-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101041
PMID:36475567
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研究论文 | 本文介绍了一种使用抗体标记的哈希寡核苷酸（Ab-HTO）和10x Genomics技术进行小鼠胸腺和脾脏样本的多重单细胞RNA测序方法 | 利用Ab-HTO标记样本，结合10x Genomics平台实现多重单细胞RNA测序，以降低成本、避免批次效应，并促进细胞双联体去除与数据整合 | 未明确说明样本数量或实验重复次数，可能限制结果的统计稳健性 | 研究小鼠胸腺细胞和脾脏T淋巴细胞的发育过程 | 小鼠胸腺和脾脏样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics技术用于单细胞基因表达分析 |
| 37 | 2026-03-30 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在运行时间上具有线性与二次方的优势，且在合理条件下能高概率计算肿瘤的真实进展历史 | NA | 开发一种快速且准确的算法来推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的基因型矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-03-25 |
A time-resolved, multi-symbol molecular recorder via sequential genome editing
2022-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04922-8
PMID:35794474
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA Typewriter的体内分子记录系统，通过顺序基因组编辑实现时间分辨、多符号的分子记录 | DNA Typewriter系统克服了现有DNA记忆设备在并发记录符号数量和事件顺序捕获方面的限制，利用CRISPR-Cas9靶点阵列和短插入编辑实现顺序记录 | 作为概念验证研究，系统在体内应用和长期稳定性方面可能仍需进一步优化 | 开发一种能够记录事件顺序和多种符号的体内DNA分子记录系统 | DNA分子记录系统及其在细胞谱系追踪中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组编辑数据、单细胞RNA测序数据 | 3,257个细胞的单克隆谱系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-03-18 |
Manifold Interpolating Optimal-Transport Flows for Trajectory Inference
2022-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:37397786
|
研究论文 | 提出了一种名为MIOFlow的方法，用于从稀疏时间点采集的静态快照样本中学习随机、连续的群体动态 | 结合动态模型、流形学习和最优传输，通过训练神经常微分方程在静态群体快照之间进行插值，并利用流形地面距离的最优传输进行惩罚 | 未在摘要中明确说明 | 从静态快照样本推断连续群体动态轨迹 | 模拟数据（含分叉与合并）和scRNA-seq数据（胚状体分化和急性髓系白血病治疗） | 机器学习 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq | 神经常微分方程（Neural ODE）、自编码器（GAE） | 单细胞RNA测序数据、模拟数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-03-15 |
NeuCA web server: a neural network-based cell annotation tool with web-app and GUI
2022-04-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac108
PMID:35176143
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研究论文 | 介绍NeuCA网络服务器，一个基于神经网络的单细胞RNA测序细胞注释工具，提供网络应用和图形用户界面 | 首个实现神经网络基础设施的网络应用工具，提供超过20个预训练分类器，用于常见组织类型 | NA | 开发自动分配细胞标签的工具，以促进单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |