单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3941 - 3960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3941 | 2024-08-08 |
Global 3'-untranslated region landscape mediated by alternative polyadenylation during meiotic maturation of pig oocytes
2022-Jan, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14026
PMID:34647356
|
研究论文 | 本研究分析了猪卵母细胞在减数分裂成熟过程中的3'-非翻译区（3'-UTR）的动态变化，利用先前的单细胞RNA测序数据，通过两种软件DaPars和APAtrap识别了显著差异的3'-UTR mRNA，并进行了基因富集分析。 | 首次系统地描述了猪卵母细胞减数分裂成熟过程中3'-UTR的全局景观变化，并探讨了其与卵母细胞成熟过程的关系。 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，可能需要更多类型的数据来全面验证结果。 | 探讨猪卵母细胞减数分裂成熟过程中3'-UTR的动态变化及其对生物过程的影响。 | 猪卵母细胞的3'-UTR及其在减数分裂成熟过程中的变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及猪卵母细胞的germinal vesicle和metaphase II阶段的数据 |
| 3942 | 2024-08-08 |
Small Airway Susceptibility to Chemical and Particle Injury
2022, Respiration; international review of thoracic diseases
DOI:10.1159/000519344
PMID:34649249
|
综述 | 本文综述了人类小气道对化学和颗粒损伤的易感性及其在气道疾病发展中的作用 | 介绍了单细胞测序技术在人类气道中的最新进展，提供了前所未有的细胞表型细节，可能影响气道对化学和颗粒损伤的反应 | 目前缺乏足够的人类数据来支持与动物研究相似的结论 | 探讨小气道对特定化学和颗粒暴露的易感性原因，以及这对识别有害物质、其特性和相关暴露情景的重要性 | 人类小气道及其对化学和颗粒损伤的易感性 | NA | 慢性阻塞性肺病，哮喘 | 单细胞测序 | NA | 细胞表型数据 | NA |
| 3943 | 2024-08-08 |
Plant Single Cell Transcriptome Hub (PsctH): an integrated online tool to explore the plant single-cell transcriptome landscape
2022-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13725
PMID:34651402
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3944 | 2024-08-08 |
WGBS combined with RNA-seq analysis revealed that Dnmt1 affects the methylation modification and gene expression changes during mouse oocyte vitrification
2022-Jan-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞全基因组亚硫酸氢盐测序（scWGBS）和单细胞RNA测序（scRNA-seq），探讨了小鼠卵母细胞玻璃化过程中的分子特性变化 | 首次揭示了Dnmt1在小鼠卵母细胞玻璃化过程中对甲基化修饰和基因表达变化的影响 | 研究仅限于小鼠卵母细胞，未来研究应扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 探究卵母细胞冷冻保存及后续升温过程中分子层面的变化，以改进卵母细胞冷冻保存技术 | 小鼠成熟中期II（MII）卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组亚硫酸氢盐测序（scWGBS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 新鲜卵母细胞与玻璃化卵母细胞的比较 |
| 3945 | 2024-08-08 |
Sex-Stratified Single-Cell RNA-Seq Analysis Identifies Sex-Specific and Cell Type-Specific Transcriptional Responses in Alzheimer's Disease Across Two Brain Regions
2022-Jan, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-021-02591-8
PMID:34669146
|
研究论文 | 本研究通过性别分层的单细胞RNA测序分析，识别了阿尔茨海默病在两个大脑区域中的性别特异性和细胞类型特异性转录反应 | 首次在单细胞水平上全面检查了阿尔茨海默病中的性别差异，特别是在前额叶皮质的胶质细胞中 | NA | 探究阿尔茨海默病中性别特异性的病理生理机制，为新疗法的开发提供信息 | 阿尔茨海默病患者的两个大脑区域（前额叶皮质和内嗅皮质）的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 近74,000个细胞 |
| 3946 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in ZFP36L2 cause female infertility characterised by recurrent preimplantation embryo arrest
2022-Sep, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2021-107933
PMID:34611029
|
研究论文 | 本文通过全外显子测序和功能验证，发现双等位变异在ZFP36L2基因中与反复的植入前胚胎发育停滞相关 | 首次发现ZFP36L2基因的双等位变异与反复的植入前胚胎发育停滞有关，为这类不孕症提供了新的遗传诊断靶点 | NA | 探究反复植入前胚胎发育停滞的遗传原因 | 100名经历反复植入前胚胎发育停滞的不孕女性 | NA | 不孕症 | 全外显子测序, Sanger测序, 生物信息学分析, 体外功能分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列 | 100名不孕女性 |
| 3947 | 2024-08-08 |
Satb1 expression in retinal ganglion cells of marmosets, macaques, and humans
2022-04, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25258
PMID:34622958
|
研究论文 | 本研究利用针对转录因子Satb1的抗体，研究了狨猴、猕猴和人类视网膜中Satb1的表达情况 | 发现旧世界（人类和猕猴）和新世界（狨猴）灵长类动物视网膜神经节细胞中转录因子的表达并不保守，并将分子标记与特定细胞类型联系起来 | NA | 研究不同物种视网膜神经节细胞中Satb1的表达情况 | 狨猴、猕猴和人类的视网膜神经节细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 狨猴、猕猴和人类各一种 |
| 3948 | 2024-08-08 |
Integrating genetic and epigenetic factors in chronic myeloid leukemia risk assessment: toward gene expression-based biomarkers
2022-02-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2021.279317
PMID:34615339
|
综述 | 本文综述了基因表达（GE）分析在慢性髓性白血病（CML）中的应用，探讨其作为个性化治疗风险评估工具的潜力 | 提出了一个四阶段方法来开发基于GE的CML生物标志物，并探讨了遗传和表观遗传因素在耐药性和急性转化中的作用 | 不同细胞类型、技术使用和基因组数据解释的复杂性对将GE数据转化为具有临床实用性的生物标志物提出了挑战 | 评估GE分析在CML中的临床信息价值，并探索其作为个性化CML治疗风险评估工具的潜力 | 慢性髓性白血病（CML）患者 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种来源的患者材料 |
| 3949 | 2024-08-08 |
Clustering spatial transcriptomics data
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab704
PMID:34623423
|
研究论文 | 本文开发了一种名为FICT的新方法，该方法结合了基因表达和邻域信息来分配细胞类型，以充分利用空间转录组数据并提高识别新型亚型的能力 | FICT方法的创新之处在于它同时考虑了基因表达和细胞邻域信息，从而提高了细胞类型和亚型的识别准确性 | NA | 开发一种新的方法来更有效地分析空间转录组数据，并提高细胞类型和亚型的识别能力 | 空间转录组数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | 概率函数 | 空间转录组数据 | 模拟数据和多个真实空间转录组数据 |
| 3950 | 2024-08-08 |
Alignment of single-cell trajectories by tuMap enables high-resolution quantitative comparison of cancer samples
2022-01-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.09.003
PMID:34624253
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为tuMap的算法，该算法利用高维单细胞数据对具有内在发育结构的癌症样本进行对齐，以实现与健康发育的比较 | tuMap算法能够生成tuMap伪时间轴，允许对癌症样本进行系统性和有意义的比较，并揭示与临床相关的关联 | NA | 开发一种算法以实现高分辨率的癌症样本定量比较 | 急性淋巴细胞白血病和骨髓性白血病的单细胞数据 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 3951 | 2024-08-08 |
scMRA: a robust deep learning method to annotate scRNA-seq data with multiple reference datasets
2022-01-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab700
PMID:34623390
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scMRA的深度学习方法，用于使用多个参考数据集注释单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | scMRA通过构建知识图谱和使用图形卷积网络作为判别器，能够有效地从多个参考数据集中转移知识到未标记的目标域，并能去除批次效应 | NA | 开发一种有效且高效的细胞类型识别方法，以整合积累的scRNA-seq数据，实现细胞类型和状态的共同本体 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图形卷积网络 | scRNA-seq数据 | 多个数据集 |
| 3952 | 2024-08-08 |
CeDR Atlas: a knowledgebase of cellular drug response
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab897
PMID:34634794
|
研究论文 | 本文介绍了CeDR Atlas，一个报告细胞药物反应计算推断的知识库，涵盖多种组织中的数百种细胞类型 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和Connectivity Map资源（CMap）的高通量药物诱导基因表达分析，实现了细胞分辨率的药物反应精细映射 | NA | 研究不同细胞类型对药物反应的差异，以改善组合治疗、药物抗性和副作用的设计 | 人类、小鼠和细胞系的单细胞数据对象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过582个单细胞数据对象，包括约140种表型和1250种组织-细胞组合类型 |
| 3953 | 2024-08-08 |
SMILE: mutual information learning for integration of single-cell omics data
2022-01-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab706
PMID:34623402
|
研究论文 | 本文介绍了一种无监督深度学习算法SMILE，通过最大化互信息来学习单细胞数据的判别表示，用于整合多源单细胞转录组数据 | SMILE算法能够成功整合多源单细胞转录组数据，消除批次效应，并将来自不同组织的相似细胞类型投影到共享空间中 | NA | 开发一种新的算法来整合不同来源、类型和特征的单细胞组学数据 | 单细胞组学数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习算法 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 3954 | 2024-08-08 |
Joint-Tissue Integrative Analysis Identified Hundreds of Schizophrenia Risk Genes
2022-Jan, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-021-02572-x
PMID:34628600
|
研究论文 | 本研究利用多组织基因表达数据和全基因组关联研究数据，通过转录组范围的关联研究（TWAS）和孟德尔随机化分析，识别了与精神分裂症遗传风险相关的144个基因 | 本研究首次发现这些基因在产前和产后脑组织中的表达趋势截然相反，并在中孕期胎儿脑部的单细胞RNA测序数据中揭示了这些基因在谷氨酸能兴奋性神经元和循环前体细胞中的富集 | 需要进一步使用先进的算法在大量脑组织和单细胞中以及不同发育阶段进行研究，以表征精神分裂症发病机制的转录组特征 | 识别与精神分裂症遗传风险相关的基因，并探讨其在疾病发病机制中的作用 | 精神分裂症风险基因及其在脑发育中的表达模式 | 基因组学 | 精神分裂症 | 全基因组关联研究（GWAS），转录组范围的关联研究（TWAS），孟德尔随机化（MR）分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3955 | 2024-08-08 |
Lineage tracing and single-cell analysis reveal proliferative Prom1+ tumour-propagating cells and their dynamic cellular transition during liver cancer progression
2022-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324321
PMID:34588223
|
研究论文 | 本研究通过体内谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了Prom1+肝细胞癌细胞的异质性和动态变化 | 结合体内谱系追踪和单细胞RNA测序技术，首次揭示了Prom1+肝细胞癌细胞的异质性和动态变化，以及其在肝细胞癌进展中的机制作用 | NA | 研究肝细胞癌中Prom1+细胞的异质性和特性 | 肝细胞癌中的Prom1+细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Prom1C-L/+; Rosa26tdTomato/+和Prom1C-L/+; Rosa26DTA/+小鼠模型进行研究 |
| 3956 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of prostaglandin E2-induced human decidual cell in vitro differentiation: a minimal ancestral deciduogenic signal†
2022-01-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab183
PMID:34591094
|
研究论文 | 研究探讨了前列腺素E2（PGE2）在体外诱导人类基蜕膜细胞分化中的作用 | 首次通过单细胞转录组学分析PGE2介导的蜕膜化过程，并提出PGE2作为体外蜕膜化的替代方法 | NA | 验证PGE2和孕激素能否激活蜕膜细胞的核心基因调控网络 | 人类子宫内膜成纤维细胞的蜕膜化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 3957 | 2024-08-08 |
Regeneration Roadmap: database resources for regenerative biology
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab870
PMID:34591960
|
research paper | 本文构建了一个名为Regeneration Roadmap的数据库，用于系统地收集和标准化再生生物学研究中产生的大量数据 | 首次开发了一个开放且全面的数据库，收集并标准化了再生研究中的大量数据，如高通量测序数据 | NA | 促进再生研究，为延迟衰老提供潜在策略 | 再生相关的基因、批量和单细胞转录组学、表观基因组学和药物基因组学数据 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 基因、转录组学、表观基因组学和药物基因组学数据 | 2.38 million data entries across 11 species and 36 tissues |
| 3958 | 2024-08-08 |
Crafting a blueprint for single-cell RNA sequencing
2022-01, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2021.08.016
PMID:34580023
|
研究论文 | 本文讨论了基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）技术在实验设计中的关键考虑因素和实用建议 | 提供了针对scRNA-Seq实验设计的实用技巧，以确保最佳结果 | 未明确提及 | 最大化scRNA-Seq技术的潜力 | 单细胞RNA测序技术的关键考虑因素 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA序列 | 未明确提及 |
| 3959 | 2024-08-08 |
The transcriptomic revolution and radiation biology
2022, International journal of radiation biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1080/09553002.2021.1987562
PMID:34586968
|
review | 本文简要回顾了功能基因组学的起源和演变，重点介绍了实验技术、数据分析和可视化方法，并强调了功能基因组学在辐射生物学中的应用 | 文章探讨了非编码RNA、基因组的替代阅读和单细胞转录组学等创新领域，这些领域可能有助于塑造未来辐射生物学和肿瘤学的研究 | NA | 回顾功能基因组学的发展，并探讨其在辐射生物学和肿瘤学中的应用 | 功能基因组学技术及其在辐射生物学中的应用 | NA | NA | 功能基因组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3960 | 2024-08-08 |
IL13 Acts Directly on Gastric Epithelial Cells to Promote Metaplasia Development During Chronic Gastritis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.09.012
PMID:34587523
|
研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素13（IL13）在慢性胃炎中促进胃上皮细胞化生的机制 | 首次鉴定了六种独特的IL13产生免疫细胞亚群，并揭示了IL13直接作用于胃上皮细胞诱导化生表型的机制 | NA | 旨在识别产生IL13的免疫细胞，确定胃上皮细胞对IL13的反应，并确立IL13在化生发展中的作用 | 慢性胃炎中的免疫细胞和细胞因子如何调节化生细胞变化的机制 | NA | 胃癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用TxA23、TxA23×Il4ra-/-和TxA23×Il13-Yfp小鼠模型，以及人胃类器官进行实验 |