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当前共找到 4053 篇文献，本页显示第 3901 - 3920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3901 | 2024-08-08 |
DISCO: a database of Deeply Integrated human Single-Cell Omics data
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1020
PMID:34791375
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研究论文 | 本文介绍了一个名为DISCO的数据库，该数据库整合了大量的人类单细胞组学数据，并提供了多种工具用于数据集成和分析 | DISCO数据库首次提供了公开可用的整合细胞图谱，具有标准化元数据和多种在线工具，如FastIntegration和CELLiD，用于大规模单细胞数据集成和细胞类型识别 | NA | 开发一个多功能平台，用于探索已发表的单细胞数据并高效地与用户自己的数据进行集成分析 | 人类单细胞组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 超过1800万个细胞，来自4593个样本，涵盖107种组织/细胞系/类器官，158种疾病，以及20种平台 | NA | NA | NA | NA |
| 3902 | 2024-08-08 |
The misuse of distributional assumptions in functional class scoring gene-set and pathway analysis
2022-01-04, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkab365
PMID:34791175
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研究论文 | 本文研究了基因集分析（GSA）中功能类评分（FCS）方法对多元正态分布假设的误用问题 | 首次系统分析了多元正态分布假设在基因集分析中的适用性，并评估了非正态分布对FCS方法统计效能的影响 | 研究主要集中在FCS方法上，未涵盖所有GSA方法 | 探讨多元基因表达数据是否符合多元正态分布，并评估非正态分布对FCS方法统计效能的影响 | 24个RNA数据集，包括癌症患者和正常个体的微阵列实验、RNA测序和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 微阵列实验, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 24个RNA数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3903 | 2024-08-08 |
High-Throughput Multimodal Single-Cell Targeted DNA and Surface Protein Analysis Using the Mission Bio Tapestri Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_12
PMID:34766272
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研究论文 | 本文介绍了使用Mission Bio Tapestri平台进行高通量多模态单细胞靶向DNA和表面蛋白分析的方法 | 该技术结合了单细胞测序和分析，能够解析个体样本中的高分辨率基因组多样性，并增加了对表面蛋白标记表达的分析能力 | NA | 旨在通过基因组信息提供预测能力，进一步指导治疗策略 | 癌症生物学中的基因型-表型展示多样性及疾病进程结果 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据和表面蛋白标记表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3904 | 2024-08-08 |
Generation of Centered Log-Ratio Normalized Antibody-Derived Tag Counts from Large Single-Cell Sequencing Datasets
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_14
PMID:34766274
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研究论文 | 本文介绍了从大规模单细胞测序数据集中生成中心对数比归一化的抗体衍生标签计数的详细步骤 | 本文提供了使用云计算从大型CITE-seq数据集生成中心对数比归一化CITE-seq数据的详细步骤 | NA | 探讨单细胞分析中新技术的应用，特别是CITE-seq和REAP-seq方法 | 单细胞蛋白表达分析 | 生物信息学 | NA | CITE-seq | NA | 数据集 | 大规模单细胞测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3905 | 2024-08-08 |
Combined Measurement of RNA and Protein Expression on a Single-Cell Level
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_16
PMID:34766276
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研究论文 | 本文描述了一种结合单细胞RNA测序和蛋白质表达分析的新技术，使用BD Rhapsody单细胞分析系统进行3' mRNA全转录组分析（WTA），并结合AbO和样本标签文库制备 | 开发了一种新的单细胞多组学方法，结合转录和表面蛋白表达分析，使用大量与寡核苷酸偶联的抗体（AbOs）进行表面标记检测，克服了传统流式细胞术中使用有限表面标记的限制 | 目前免疫细胞分离基于RNA表达谱预测的表面标记表达，常受转录和蛋白质表达模式之间低相关性的限制 | 克服转录和蛋白质表达模式之间的低相关性，提高免疫细胞功能和异质性分析的准确性 | 单细胞RNA和蛋白质表达 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（sc-RNAseq） | NA | RNA和蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3906 | 2024-08-08 |
Live Cell Genomics: Cell-Specific Transcriptome Capture in Live Single Cells from Complex Tissues
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1752-6_40
PMID:34766318
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研究论文 | 本文介绍了一种名为体内转录组分析（TIVA）的单细胞分析程序，用于从活体组织中准确获取特定细胞的转录组 | 首次使用细胞穿透肽（CPPs）结合光激活技术，实现了从活体单细胞中非侵入性地准确分离单细胞mRNA | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞转录组，以更好地理解细胞异质性及其在正常功能和疾病发展中的作用 | 单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 细胞穿透肽（CPPs） | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3907 | 2024-08-08 |
Exposure to Tobacco Smoking Induces a subset of Activated Tumor-resident Tregs in Non-Small Cell Lung Cancer
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101261
PMID:34768099
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研究论文 | 研究烟草烟雾暴露对非小细胞肺癌中肿瘤内调节性T细胞亚群的影响 | 定义了一种与吸烟相关的肿瘤特异性调节性T细胞亚群ADAM12 CTLA4 Tregs，并发现其在吸烟史患者中的比例显著增加 | NA | 探讨烟草烟雾如何影响肺癌的肿瘤免疫环境 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤内T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个研究中的非小细胞肺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3908 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals hidden information in trypanosomatids
2022-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2021.10.006
PMID:34774423
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术揭示了双宿主寄生虫在从媒介到宿主过渡期间的发展阶段特异性基因表达模式 | 使用单细胞转录组学技术揭示了寄生虫发展阶段的隐藏信息 | NA | 研究双宿主寄生虫在环境极端条件下的适应性和生存机制 | 双宿主寄生虫的发展阶段特异性基因表达 | 转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3909 | 2024-08-08 |
Loss of H2R Signaling Disrupts Neutrophil Homeostasis and Promotes Inflammation-Associated Colonic Tumorigenesis in Mice
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.11.003
PMID:34781022
|
研究论文 | 本研究探讨了H2R信号在先天免疫细胞中的下游效应，特别是中性粒细胞在炎症相关结肠肿瘤发生中的作用。 | 首次揭示了H2R信号缺失如何影响中性粒细胞的稳态及其在炎症相关结肠肿瘤发生中的作用。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果。 | 精确阐明H2R激活在先天免疫细胞中的下游效应。 | 小鼠中性粒细胞和肠道上皮细胞。 | 免疫学 | 结肠肿瘤 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | RNA | 野生型和H2R缺陷小鼠的中性粒细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 3910 | 2024-08-08 |
scCDG: A Method Based on DAE and GCN for scRNA-Seq Data Analysis
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3126641
PMID:34752401
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于去噪自编码器和图卷积网络的单细胞RNA测序数据分析方法scCDG | 提出了一种新的方法scCDG，结合去噪自编码器和图卷积网络，有效处理单细胞RNA测序数据中的大量噪声 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的细胞类型识别和聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | DAE, GCN | RNA测序数据 | 七个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3911 | 2024-08-08 |
CXCL13 is expressed in a subpopulation of neuroendocrine cells in the murine trachea and lung
2022-Oct, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-021-03552-2
PMID:34762185
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研究论文 | 本文研究了小鼠气管和肺中神经内分泌细胞亚群中CXCL13的表达情况 | 首次鉴定了在小鼠气管上皮中的孤立神经内分泌细胞中CXCL13的高表达，并指出了这些细胞在支气管相关淋巴组织形成和B细胞稳态中的潜在免疫调节作用 | NA | 评估CXCL13在神经内分泌细胞中的表达，并探讨其在免疫调节中的作用 | 小鼠气管和肺中的神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | RT-PCR, 免疫组化, 免疫电子显微镜, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA序列数据 | 小鼠气管上皮细胞中的神经内分泌细胞（约70% CXCL13）和肺内支气管上皮细胞中的神经内分泌细胞（<10% CXCL13） | NA | NA | NA | NA |
| 3912 | 2024-08-08 |
Aging weakens Th17 cell pathogenicity and ameliorates experimental autoimmune uveitis in mice
2022-06, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-021-00882-3
PMID:34748200
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了老年和年轻小鼠的颈部引流淋巴结（CDLNs）在实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）中的免疫细胞图谱，发现老年小鼠的EAU症状较轻，且Th17细胞的致病性减弱。 | 首次详细描述了衰老对淋巴结及其相关自身免疫疾病的影响，并揭示了衰老通过下调Th17细胞的IL-23R表达和GM-CSF分泌来减轻EAU症状的机制。 | NA | 探讨衰老对免疫系统及实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响。 | 老年和年轻小鼠的颈部引流淋巴结（CDLNs）及其在实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）中的免疫细胞变化。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 细胞 | 老年和年轻小鼠的颈部引流淋巴结（CDLNs）样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3913 | 2024-08-08 |
Hif-1a suppresses ROS-induced proliferation of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.10.009
PMID:34762860
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研究论文 | 研究报告了心脏成纤维细胞（CFs）和间充质前体细胞在心肌梗死后表现出更高的缺氧状态，表达更多的缺氧诱导因子1α（HIF-1α），并具有增强的糖酵解代谢。 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）展示了CF特异性删除Hif-1a后的影响，并发现线粒体靶向抗氧化剂MitoTEMPO能挽救Hif-1a突变体的表型。 | NA | 探讨HIF-1α在心肌梗死后心脏成纤维细胞中的作用及其对线粒体活性氧（ROS）的调控机制。 | 心脏成纤维细胞（CFs）和间充质前体细胞。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及心肌梗死后的心脏成纤维细胞和间充质前体细胞，具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 3914 | 2024-08-08 |
SPICA: Swiss portal for immune cell analysis
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1055
PMID:34747477
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research paper | SPICA是一个专注于探索和分析免疫细胞单细胞RNA-seq数据的网络资源 | SPICA与其他单细胞数据库不同，它托管了经过精心策划的、特定细胞类型的参考图谱，这些图谱以高分辨率描述免疫细胞状态，并分析了在这些图谱背景下发表的单细胞数据 | NA | 开发一个用于免疫细胞单细胞转录组数据探索和分析的网络资源 | 免疫细胞的单细胞RNA-seq数据 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3915 | 2024-08-08 |
scEnhancer: a single-cell enhancer resource with annotation across hundreds of tissue/cell types in three species
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1032
PMID:34761274
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scEnhancer的单细胞增强子资源数据库，涵盖了三种物种中数百种组织/细胞类型的14527776个增强子和63658600个增强子-基因相互作用 | 利用单细胞测序技术scATAC-seq在单细胞水平上注释增强子和启动子，并通过无监督学习方法和顺式调控网络算法识别增强子-基因连接 | NA | 旨在为单细胞水平上增强子对目标基因的调控功能分析提供一个全面的资源 | 单细胞增强子及其与基因的相互作用 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 无监督学习方法 | 单细胞数据 | 1196906个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3916 | 2024-08-08 |
Dysregulated Immunometabolism Is Associated with the Generation of Myeloid-Derived Suppressor Cells in Staphylococcus aureus Chronic Infection
2022, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000519306
PMID:34763332
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和功能代谢分析，深入探讨了慢性金黄色葡萄球菌感染中髓源抑制细胞（MDSCs）的生成和维持机制 | 首次揭示了MDSCs不仅在骨髓中产生，还在金黄色葡萄球菌感染的小鼠的骨髓外部位产生，并发现MDSCs的高糖酵解活性和高葡萄糖消耗率对其终末分化至关重要 | NA | 探讨慢性金黄色葡萄球菌感染中MDSCs的生成和维持机制 | 髓源抑制细胞（MDSCs）及其在慢性金黄色葡萄球菌感染中的代谢特征 | NA | 慢性感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 金黄色葡萄球菌感染的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3917 | 2024-08-08 |
Translational pediatrics: clinical perspective for Phelan-McDermid syndrome and autism research
2022-08, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-021-01806-x
PMID:34702975
|
研究论文 | 本文探讨了Phelan-McDermid综合征（PMS）及其与自闭症谱系障碍（ASD）的关系，利用诱导多能干细胞（iPS）技术开发脑类器官和微胶质细胞，并通过单细胞RNA测序探索神经发育障碍的病理生理学 | 利用iPS细胞技术开发脑类器官和微胶质细胞，以及通过单细胞RNA测序揭示人类特异性基因在皮质发育中的独特表达 | NA | 旨在通过患者来源的疾病模型识别SHANK3在人类大脑发育中的未知功能，并为PMS和其他疾病提供治疗见解 | Phelan-McDermid综合征患者及其脑类器官和微胶质细胞 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3918 | 2024-08-08 |
Nuclear Factor I in neurons, glia and during the formation of Müller glia-derived progenitor cells in avian, porcine and primate retinas
2022-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25270
PMID:34729776
|
研究论文 | 研究探讨了核因子I（NFI）在不同发育阶段和损伤后的鸡视网膜中的表达模式，以及在猪和猴视网膜中的表达情况 | 首次详细描述了NFI在鸡、猪和猴视网膜中的表达模式，并提出NFI可能抑制鸡视网膜中Müller胶质细胞衍生前体细胞（MGPCs）的神经发生潜力 | 研究主要集中在NFI的表达模式上，未深入探讨NFI如何具体抑制MGPCs的神经发生潜力 | 研究NFI在不同物种视网膜中的表达模式及其对MGPCs神经发生潜力的影响 | 鸡、猪和猴的视网膜中的NFI表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫标记 | NA | RNA | 包括鸡、猪和猴的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3919 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells from the Elderly People
2022-May-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc21042
PMID:34711696
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术将6,514个老年人的骨髓间充质干细胞分为三个集群，并分析了各集群的基因表达谱和功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了骨髓间充质干细胞的异质性及其不同的细胞亚群 | NA | 探究骨髓间充质干细胞的细胞亚群及其功能 | 老年人的骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,514个骨髓间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3920 | 2024-08-08 |
Data-driven comparison of multiple high-dimensional single-cell expression profiles
2022-Apr, Journal of human genetics
IF:2.6Q2
DOI:10.1038/s10038-021-00989-9
PMID:34719682
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研究论文 | 本文提出了一种完全数据驱动的计算生物学方法，用于比较多个高维单细胞表达数据集，如流式细胞术和scRNA-seq数据，以阐明疾病机制。 | 该方法克服了传统基于细胞子集比较的挑战，并促进了机器学习和基因集分析等进一步分析。 | NA | 旨在通过比较多个单细胞表达数据集来阐明疾病机制。 | 研究对象为多个高维单细胞表达数据集，如流式细胞术和scRNA-seq数据。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |