单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3901 - 3920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3901 | 2024-08-08 |
Hif-1a suppresses ROS-induced proliferation of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.10.009
PMID:34762860
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研究论文 | 研究报告了心脏成纤维细胞（CFs）和间充质前体细胞在心肌梗死后表现出更高的缺氧状态，表达更多的缺氧诱导因子1α（HIF-1α），并具有增强的糖酵解代谢。 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）展示了CF特异性删除Hif-1a后的影响，并发现线粒体靶向抗氧化剂MitoTEMPO能挽救Hif-1a突变体的表型。 | NA | 探讨HIF-1α在心肌梗死后心脏成纤维细胞中的作用及其对线粒体活性氧（ROS）的调控机制。 | 心脏成纤维细胞（CFs）和间充质前体细胞。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及心肌梗死后的心脏成纤维细胞和间充质前体细胞，具体样本数量未详细说明。 |
| 3902 | 2024-08-08 |
SPICA: Swiss portal for immune cell analysis
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1055
PMID:34747477
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research paper | SPICA是一个专注于探索和分析免疫细胞单细胞RNA-seq数据的网络资源 | SPICA与其他单细胞数据库不同，它托管了经过精心策划的、特定细胞类型的参考图谱，这些图谱以高分辨率描述免疫细胞状态，并分析了在这些图谱背景下发表的单细胞数据 | NA | 开发一个用于免疫细胞单细胞转录组数据探索和分析的网络资源 | 免疫细胞的单细胞RNA-seq数据 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | NA |
| 3903 | 2024-08-08 |
scEnhancer: a single-cell enhancer resource with annotation across hundreds of tissue/cell types in three species
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1032
PMID:34761274
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scEnhancer的单细胞增强子资源数据库，涵盖了三种物种中数百种组织/细胞类型的14527776个增强子和63658600个增强子-基因相互作用 | 利用单细胞测序技术scATAC-seq在单细胞水平上注释增强子和启动子，并通过无监督学习方法和顺式调控网络算法识别增强子-基因连接 | NA | 旨在为单细胞水平上增强子对目标基因的调控功能分析提供一个全面的资源 | 单细胞增强子及其与基因的相互作用 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 无监督学习方法 | 单细胞数据 | 1196906个单细胞 |
| 3904 | 2024-08-08 |
Dysregulated Immunometabolism Is Associated with the Generation of Myeloid-Derived Suppressor Cells in Staphylococcus aureus Chronic Infection
2022, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000519306
PMID:34763332
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和功能代谢分析，深入探讨了慢性金黄色葡萄球菌感染中髓源抑制细胞（MDSCs）的生成和维持机制 | 首次揭示了MDSCs不仅在骨髓中产生，还在金黄色葡萄球菌感染的小鼠的骨髓外部位产生，并发现MDSCs的高糖酵解活性和高葡萄糖消耗率对其终末分化至关重要 | NA | 探讨慢性金黄色葡萄球菌感染中MDSCs的生成和维持机制 | 髓源抑制细胞（MDSCs）及其在慢性金黄色葡萄球菌感染中的代谢特征 | NA | 慢性感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 金黄色葡萄球菌感染的小鼠 |
| 3905 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Molecular Markers for CNS Glial Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2022-Nov, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-021-01159-3
PMID:34704168
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综述 | 本文综述了通过单细胞转录组学技术揭示的中枢神经系统（CNS）胶质细胞的异质性和分子标志物 | 利用单细胞测序技术（scRNA-seq）从转录组层面扩展了对胶质细胞异质性的理解 | NA | 总结CNS中主要胶质细胞的标志基因，并揭示其在不同物种、CNS区域、发育阶段和病理状态下的异质性 | 中枢神经系统中的胶质细胞，包括星形胶质细胞、少突胶质细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 3906 | 2024-08-08 |
Translational pediatrics: clinical perspective for Phelan-McDermid syndrome and autism research
2022-08, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-021-01806-x
PMID:34702975
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研究论文 | 本文探讨了Phelan-McDermid综合征（PMS）及其与自闭症谱系障碍（ASD）的关系，利用诱导多能干细胞（iPS）技术开发脑类器官和微胶质细胞，并通过单细胞RNA测序探索神经发育障碍的病理生理学 | 利用iPS细胞技术开发脑类器官和微胶质细胞，以及通过单细胞RNA测序揭示人类特异性基因在皮质发育中的独特表达 | NA | 旨在通过患者来源的疾病模型识别SHANK3在人类大脑发育中的未知功能，并为PMS和其他疾病提供治疗见解 | Phelan-McDermid综合征患者及其脑类器官和微胶质细胞 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官 | 细胞 | NA |
| 3907 | 2024-08-08 |
Nuclear Factor I in neurons, glia and during the formation of Müller glia-derived progenitor cells in avian, porcine and primate retinas
2022-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25270
PMID:34729776
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研究论文 | 研究探讨了核因子I（NFI）在不同发育阶段和损伤后的鸡视网膜中的表达模式，以及在猪和猴视网膜中的表达情况 | 首次详细描述了NFI在鸡、猪和猴视网膜中的表达模式，并提出NFI可能抑制鸡视网膜中Müller胶质细胞衍生前体细胞（MGPCs）的神经发生潜力 | 研究主要集中在NFI的表达模式上，未深入探讨NFI如何具体抑制MGPCs的神经发生潜力 | 研究NFI在不同物种视网膜中的表达模式及其对MGPCs神经发生潜力的影响 | 鸡、猪和猴的视网膜中的NFI表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫标记 | NA | RNA | 包括鸡、猪和猴的视网膜样本 |
| 3908 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells from the Elderly People
2022-May-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc21042
PMID:34711696
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术将6,514个老年人的骨髓间充质干细胞分为三个集群，并分析了各集群的基因表达谱和功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了骨髓间充质干细胞的异质性及其不同的细胞亚群 | NA | 探究骨髓间充质干细胞的细胞亚群及其功能 | 老年人的骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,514个骨髓间充质干细胞 |
| 3909 | 2024-08-08 |
Data-driven comparison of multiple high-dimensional single-cell expression profiles
2022-Apr, Journal of human genetics
IF:2.6Q2
DOI:10.1038/s10038-021-00989-9
PMID:34719682
|
研究论文 | 本文提出了一种完全数据驱动的计算生物学方法，用于比较多个高维单细胞表达数据集，如流式细胞术和scRNA-seq数据，以阐明疾病机制。 | 该方法克服了传统基于细胞子集比较的挑战，并促进了机器学习和基因集分析等进一步分析。 | NA | 旨在通过比较多个单细胞表达数据集来阐明疾病机制。 | 研究对象为多个高维单细胞表达数据集，如流式细胞术和scRNA-seq数据。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 表达数据 | NA |
| 3910 | 2024-08-08 |
NKG2A is a late immune checkpoint on CD8 T cells and marks repeated stimulation and cell division
2022-02-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33859
PMID:34716584
|
研究论文 | 研究探讨了NKG2A作为CD8 T细胞上的晚期免疫检查点，及其与细胞分裂和重复刺激的关系 | 揭示了NKG2A作为晚期抑制受体的表达动力学，及其与TIM-3和CD39的共同表达模式 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组数据，未涵盖所有可能的体内环境 | 阐明NKG2A在CD8 T细胞中的表达模式及其在肿瘤免疫治疗中的潜在作用 | NKG2A在CD8 T细胞上的表达及其与细胞分裂和重复刺激的关系 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及人类肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的单细胞转录组数据 |
| 3911 | 2024-08-08 |
Paligenosis: Cellular Remodeling During Tissue Repair
2022-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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研究论文 | 本文讨论了在组织修复过程中，新兴技术如何挑战了组织更新是由驻留干细胞单向分化的概念，并强调了细胞可塑性在组织更新中的核心作用。 | 提出了细胞可塑性作为组织更新的中心机制，并介绍了进化上保守的程序——paligenosis，成熟细胞通过这一程序重新进入细胞周期并再生受损组织。 | 文章指出，细胞可塑性虽然有益，但也带来了风险，如长期存活的细胞在周期性增殖和再分化过程中可能积累并传播获得性突变，增加癌症风险。 | 探讨细胞在组织修复过程中的重塑机制，并提出新的细胞增殖模式分类框架。 | 多细胞生物在稳态和修复过程中的细胞更新机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3912 | 2024-08-08 |
Mapping the genomic diaspora of gastric cancer
2022-02, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-021-00412-7
PMID:34702982
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综述 | 本文综述了胃癌基因组学的最新进展，包括非编码变异、表观遗传异常和转录组改变，并探讨了这些改变如何与环境影响、遗传因素和肿瘤微环境相互作用 | 介绍了单细胞测序和液体活检等技术在胃癌治疗抵抗机制和临床前靶点识别中的应用 | 需要设计特定的胃癌队列，将多模态基因组数据与治疗挑战和患者结果的纵向数据相结合 | 提高对胃癌发展生物学机制的理解，并推动胃癌精准肿瘤学和预防的临床举措 | 胃癌的基因组学特征及其与环境、遗传因素和肿瘤微环境的相互作用 | NA | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3913 | 2024-08-08 |
Profiling the specificity of clonally expanded plasma cells during chronic viral infection by single-cell analysis
2022-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202149331
PMID:34727578
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和抗体谱测序研究了慢性病毒感染后小鼠骨髓浆细胞的克隆扩增特异性 | 首次通过单细胞测序技术全面描述了浆细胞的基因型、表型和抗体谱特征，并揭示了慢性病毒感染诱导的浆细胞克隆扩增和交叉反应性抗体的产生 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨慢性病毒感染期间浆细胞的克隆扩增特异性及其对抗体反应的影响 | 小鼠骨髓浆细胞及其在慢性淋巴细胞性脉络膜脑膜炎病毒感染后的抗体谱 | NA | NA | 单细胞转录组测序，抗体谱测序 | NA | 基因表达数据，抗体序列数据 | 数千个浆细胞 |
| 3914 | 2024-08-08 |
Systems biological assessment of altered cytokine responses to bacteria and fungi reveals impaired immune functionality in schizophrenia
2022-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01362-0
PMID:34728799
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法评估了精神分裂症患者对细菌和真菌的细胞因子反应变化，揭示了其免疫功能障碍的分子和细胞基础。 | 首次系统比较了精神分裂症患者与对照组的外周血单个核细胞对不同病原体的细胞因子反应，并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞亚群中的广泛抑制和受损的趋化因子/细胞因子受体相互作用网络。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未涉及更广泛的临床症状或治疗效果的评估。 | 旨在深入理解精神分裂症中的免疫变化和分子通路。 | 精神分裂症患者和对照组的外周血单个核细胞对细菌、真菌及纯化微生物配体的细胞因子反应。 | 免疫学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 3915 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of T lymphocytes in deficiency of adenosine deaminase 2
2022-02, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5A0621-314R
PMID:34730257
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞TCR测序技术，分析了10名腺苷脱氨酶2缺乏症（DADA2）患者的T淋巴细胞特征 | 首次详细描述了DADA2患者中T淋巴细胞的活化和细胞间相互作用，揭示了先前未被充分表征的细胞特征 | 研究样本量较小，仅包括10名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究腺苷脱氨酶2缺乏症中T淋巴细胞的特征及其在疾病中的作用 | 腺苷脱氨酶2缺乏症患者的T淋巴细胞 | 数字病理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 10名DADA2患者 |
| 3916 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and complexity of the prostate epithelium: New findings from single-cell RNA sequencing studies
2022-01-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2021.10.035
PMID:34728312
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了前列腺上皮的异质性和复杂性 | 发现了前列腺管近端区域的新型腔上皮细胞群及其与远端腔上皮细胞的区别 | 研究主要集中在小鼠前列腺，对人类前列腺的比较研究较少 | 揭示前列腺上皮的细胞异质性及其在疾病和癌症中的相关性 | 前列腺上皮细胞的异质性及其在不同环境下的可塑性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类前列腺样本，具体数量未详述 |
| 3917 | 2024-08-08 |
Are dropout imputation methods for scRNA-seq effective for scATAC-seq data?
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab442
PMID:34718405
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研究论文 | 本文评估了几种先进的scRNA-seq插补方法在scATAC-seq数据中推断缺失峰的有效性 | 首次系统评估了scRNA-seq插补方法在scATAC-seq数据中的应用 | 不同方法在不同数据集上的表现差异较大，使用时应谨慎 | 评估scRNA-seq插补方法在scATAC-seq数据中的有效性 | scATAC-seq数据中的缺失峰 | 单细胞测序 | NA | ATAC-seq | NA | scATAC-seq数据 | 未具体说明 |
| 3918 | 2024-08-08 |
PCMDB: a curated and comprehensive resource of plant cell markers
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab949
PMID:34718712
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研究论文 | 本文介绍了一个名为PCMDB的植物细胞标记数据库，该数据库通过手动筛选超过13万篇研究出版物，收集了22种组织中263种细胞类型的81,117个细胞标记基因。 | PCMDB是首个为植物研究社区设计的全面且经过精心策划的细胞标记数据库，支持多种分析工具和可视化方法。 | NA | 开发一个全面的植物细胞标记数据库，以支持细胞类型注释和单细胞研究。 | 植物细胞标记基因和细胞类型。 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 81,117个细胞标记基因，涉及263种细胞类型和22种组织，涵盖6种植物物种。 |
| 3919 | 2024-08-08 |
A Single-Cell RNA-Seq-Based Approach for Genome-Wide Identification of Cell Essential Genes
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1720-5_18
PMID:34709625
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序的高通量方法，用于鉴定足细胞必需基因 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，通过分析所有单个细胞中表达的基因，识别特定细胞类型的必需基因 | 该方法目前仅在鼠足细胞中进行了验证，尚未在其他细胞类型中广泛应用 | 旨在开发一种高效的方法来识别特定细胞类型的必需基因 | 鼠足细胞的必需基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 鼠足细胞的单细胞样本 |
| 3920 | 2024-08-08 |
Astrocyte Reactivity in Alzheimer's Disease: Therapeutic Opportunities to Promote Repair
2022, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其在疾病发展中的潜在治疗机会 | 单细胞转录组学揭示了阿尔茨海默病脑中的星形胶质细胞与正常健康星形胶质细胞的差异，并探讨了针对星形胶质细胞的干预措施在治疗阿尔茨海默病中的潜在价值 | NA | 探讨星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及通过调控星形胶质细胞功能作为未来治疗途径的可能性 | 星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的角色及其治疗潜力 | 神经退行性疾病 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |