单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3861 - 3880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3861 | 2024-08-08 |
Deciphering the Dynamic Molecular Program of Radiation-Induced Endothelial Senescence
2022-03-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2021.11.019
PMID:34808254
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法，解析了辐射诱导的内皮细胞衰老相关的动态转录程序。 | 首次揭示了辐射诱导内皮细胞早衰过程中白细胞介素-1信号通路的关键作用，以及内皮细胞向间充质细胞转化的过程。 | 研究主要集中在体外实验，辐射对内皮细胞衰老的影响还需体内实验进一步验证。 | 探究辐射诱导内皮细胞衰老的动态分子机制及其对正常组织损伤的影响。 | 辐射诱导的内皮细胞衰老及其相关分子程序。 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的内皮细胞样本 |
| 3862 | 2024-08-08 |
Induced cell-autonomous neutropenia systemically perturbs hematopoiesis in Cebpa enhancer-null mice
2022-03-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021005851
PMID:34814180
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研究论文 | 研究Cebpa增强子缺失小鼠模型中，细胞自主性中性粒细胞减少如何系统性地干扰造血过程 | 首次揭示了Cebpa增强子缺失导致的细胞自主性中性粒细胞减少对造血干细胞的静止状态和造血过程的系统性影响 | NA | 探讨Cebpa增强子缺失对造血干细胞数量和造血过程的影响及其机制 | Cebpa增强子缺失小鼠的骨髓和造血干细胞 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 涉及Cebpa增强子缺失小鼠和野生型小鼠的骨髓移植实验 |
| 3863 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome of mesenchymal stromal cells to fabricate bioactive hydroxyapatite materials for bone regeneration
2022-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2021.08.009
PMID:34820571
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了间充质基质细胞在三维羟基磷灰石支架和成骨培养基中的转录景观，以探索骨再生材料的生物活性 | 本文揭示了羟基磷灰石支架中类似于软骨内骨化的成骨过程，并阐明了成骨培养基介导的成骨机制，为改善成骨生物材料提供了新见解 | NA | 研究骨修复材料的成骨微环境，以加速骨再生 | 间充质基质细胞在羟基磷灰石支架和成骨培养基中的转录景观 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3864 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Human Dental Pulp Stem Cell and Human Periodontal Ligament Stem Cell
2022-Feb, Journal of endodontics
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.joen.2021.11.005
PMID:34801591
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞的特征及异质性 | 本研究首次在单细胞水平上探讨了人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞的转录组特征及其差异 | 研究样本仅来自两个无龋齿的前磨牙，样本量较小 | 探讨人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞在单细胞水平的转录组特征及其差异 | 人牙髓干细胞和人牙周韧带干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2个无龋齿的前磨牙 |
| 3865 | 2024-08-08 |
Bringing precision oncology to cellular resolution with single-cell genomics
2022-02, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-021-10129-4
PMID:34807338
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综述 | 本文概述了单细胞癌症测序领域的发展，并提供了一个路线图，将这些技术从研究工具转变为向临床肿瘤学家提供高分辨率、治疗导向细节的诊断仪器。 | 单细胞测序技术的发展为理解癌症的病因、发病机制和治疗反应性提供了新的见解，并开始为肿瘤内临床相关的亚群提供生物标志物和药物靶点。 | 目前这些技术主要集中在基础肿瘤生物学研究，尚未广泛应用于临床诊断。 | 将单细胞测序技术从研究工具发展为临床诊断仪器，提供高分辨率的治疗导向细节。 | 单细胞测序技术在癌症研究中的应用及其向临床诊断的转化。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3866 | 2024-08-08 |
circRNAome profiling reveals circFgfr2 regulates myogenesis and muscle regeneration via a feedback loop
2022-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12859
PMID:34811940
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研究论文 | 本研究通过环状RNA组分析揭示了circFgfr2通过反馈环路调控肌生成和肌肉再生的机制。 | 首次揭示了circFgfr2在肌生成和肌肉再生中的作用及其通过miR-133/Map3k20/JNK/Klf4反馈环路的调控机制。 | NA | 探究环状RNA在肌生成和骨骼肌发育中的动态表达、功能和机制。 | 环状RNA circFgfr2及其在肌生成和肌肉再生中的作用。 | RNA研究 | NA | RNA测序（RNA-seq）、微阵列、RT-qPCR、western blotting、双荧光素酶活性测定、RNA免疫沉淀、RNA荧光原位杂交、染色质免疫沉淀 | NA | RNA | 52,918个高可信度环状RNA，其中2916个在人、小鼠和猪中保守 |
| 3867 | 2024-08-08 |
HMGB1/Foxp1 regulates hypoxia-induced inflammatory response in macrophages
2022-Feb, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11728
PMID:34816539
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研究论文 | 本研究探讨了高迁移率族蛋白B1（HMGB1）及其靶基因叉头框蛋白P1（Foxp1）在心肌梗死（MI）模型中巨噬细胞的炎症反应中的作用 | 首次研究了Foxp1在心肌梗死中巨噬细胞的作用，并验证了HMGB1通过下调Foxp1加剧巨噬细胞的炎症反应 | NA | 研究HMGB1和Foxp1在心肌梗死中巨噬细胞炎症反应中的作用 | 心肌梗死模型中巨噬细胞的HMGB1和Foxp1基因 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的GSE136088数据集 |
| 3868 | 2024-08-08 |
Emerging Single-cell Approaches to Understand HIV in the Central Nervous System
2022-02, Current HIV/AIDS reports
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11904-021-00586-7
PMID:34822063
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综述 | 本综述重点介绍了与HIV在中枢神经系统（CNS）转化研究相关的新兴单细胞测序方法，总结了CNS中HIV的有限单细胞研究，并讨论了未来HIV转化CNS研究的机会 | 利用单细胞技术的新方法在基因组、蛋白质组、转录组和表观基因组研究中提高了分辨率和深度。单细胞分析可以揭示HIV感染者CNS的扰动，并有助于揭示CNS中隐藏的HIV库的分子身份 | NA | 探讨HIV在中枢神经系统中的研究进展和未来研究方向 | HIV在中枢神经系统中的单细胞研究 | NA | HIV | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 3869 | 2024-08-08 |
Pathogenic Mechanisms Underlying Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-01-24, Annual review of pathology
|
综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）的发病机制，涉及细胞类型和信号通路的复杂相互作用 | 近期单细胞RNA测序研究揭示了一种具有异常基底细胞特征的新型AEC，可能干扰正常的上皮修复并促进促纤维化表型 | NA | 探讨IPF的发病机制，利用新型生物信息学工具发现疾病通路、细胞特异性机制和细胞间相互作用 | 特发性肺纤维化的发病机制 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 3870 | 2024-08-08 |
Peanut oral immunotherapy differentially suppresses clonally distinct subsets of T helper cells
2022-01-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI150634
PMID:34813505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和配对的T细胞受体α/β测序，评估了12名花生过敏患者在口服免疫治疗（OIT）过程中CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞的转录组 | 本研究首次揭示了OIT过程中不同临床反应与花生反应性CD4+ T细胞的预先存在特征以及Th2细胞亚群的抑制之间的关系 | 本研究仅涉及12名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨口服免疫治疗（OIT）对花生过敏患者临床结果的免疫学基础 | 花生过敏患者的CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，T细胞受体α/β测序 | NA | 转录组数据 | 12名花生过敏患者 |
| 3871 | 2024-08-08 |
Comparative Proteome Signatures of Trace Samples by Multiplexed Data-Independent Acquisition
2022-01, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100177
PMID:34793982
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研究论文 | 本文结合DIA和Tandem-Mass-Tag（TMT）-multiplexing两种分析策略，开发了一种新的、独立于鉴定的蛋白质组数据分析流程，用于从超低输入样本中生成高度可重复的、定量的蛋白质组特征 | 本文开发了一种新的、独立于鉴定的蛋白质组数据分析流程，允许在数百个样本中定量比较DIA-TMT蛋白质组特征，无需考虑其生物学来源，以识别细胞类型和单个蛋白质敲除 | NA | 旨在通过结合DIA和TMT-multiplexing技术，提高单细胞蛋白质组分析的可重复性和定量性 | 超低输入样本的蛋白质组特征 | 蛋白质组学 | NA | DIA和Tandem-Mass-Tag（TMT）-multiplexing | NA | 蛋白质组数据 | 数百个样本 |
| 3872 | 2024-08-08 |
Macrophage-Targeted Therapy Unlocks Antitumoral Cross-talk between IFNγ-Secreting Lymphocytes and IL12-Producing Dendritic Cells
2022-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0326
PMID:34795032
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研究论文 | 本研究评估了使用BLZ945（一种小分子CSF1R抑制剂）治疗的小鼠肺肿瘤免疫微环境，通过单细胞RNA测序和机制验证方法，揭示了CSF1R靶向治疗如何重塑CSF1R细胞景观并激活抗肿瘤细胞间的交叉对话。 | 首次展示了CSF1R靶向治疗不仅通过细胞耗竭，而是通过重塑CSF1R细胞景观来激活抗肿瘤细胞间的交叉对话，包括IFNγ产生的自然杀伤细胞和T细胞以及IL12产生的树突状细胞。 | 研究主要在动物模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨CSF1R抑制剂在肺肿瘤免疫治疗中的作用机制。 | 小鼠肺肿瘤中的免疫细胞，特别是CSF1R细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 免疫学 | 肺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 3873 | 2024-08-08 |
Early lung carcinogenesis and tumor microenvironment observed by single-cell transcriptome analysis
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101277
PMID:34800916
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究了从不吸烟患者的肺磨玻璃结节（GGN）和正常肺组织中观察到的早期肺癌发生和肿瘤微环境 | 首次揭示了肺癌细胞中与小泡处理和表面活性物质稳态相关的基因集富集，以及肿瘤微环境中免疫细胞的特定变化 | 研究样本仅来自6名从不吸烟的患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期肺癌发生过程中癌细胞特异性标志物和肿瘤微环境的变化 | 从不吸烟患者的肺磨玻璃结节和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11个肺磨玻璃结节和正常肺组织样本，来自6名从不吸烟患者 |
| 3874 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of Bisphenol A exposure reveals the key roles of the testicular microenvironment in male reproduction
2022-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112449
PMID:34808557
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了双酚A暴露对睾丸微环境的影响及其在男性生殖中的关键作用 | 首次系统分析了青春期人类睾丸中细胞类型组成的显著变化，并构建了青少年睾丸中生殖细胞与体细胞之间的细胞间通信网络 | NA | 揭示双酚A在支持细胞和男性生殖中的生殖毒性和分子机制 | 人类睾丸中的生殖细胞和体细胞 | NA | 非阻塞性无精症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3875 | 2024-08-08 |
Establishment of Trophoblast-Like Tissue Model from Human Pluripotent Stem Cells in Three-Dimensional Culture System
2022-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202100031
PMID:34813178
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研究论文 | 本文报道了从人多能干细胞（hPSCs）在三维（3D）培养系统中生成滋养层样组织模型的方法 | 该研究首次成功在体外建立了从hPSCs到3D滋养层样组织模型，这一模型能够展示微绒毛结构并分泌人胎盘特异性激素 | NA | 旨在深入理解人类早期胎盘发育的机制，并探索其在发育生物学和妊娠障碍研究中的应用潜力 | 人多能干细胞（hPSCs）及其在三维培养系统中的滋养层样组织模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D培养系统 | 细胞 | NA |
| 3876 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals How the Aryl Hydrocarbon Receptor Shapes Cellular Differentiation Potency in the Mouse Colon
2022-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-21-0378
PMID:34815312
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和高级分析策略，探讨了芳香烃受体（Ahr）在调节小鼠结肠隐窝稳态中的作用 | 本研究首次揭示了Ahr缺失对隐窝相关上皮细胞类型和亚型的促进作用，以及对单细胞熵和RNA速度长度的影响 | NA | 探讨Ahr在调节结肠隐窝稳态中的作用 | 小鼠结肠隐窝中的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 野生型和肠道特异性Ahr敲除小鼠的结肠隐窝 |
| 3877 | 2024-08-08 |
Stem cell aging in the skeletal muscle: The importance of communication
2022-01, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2021.101528
PMID:34818593
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综述 | 本文综述了骨骼肌中卫星细胞功能衰退的分子过程及其在衰老中的作用 | 强调了单细胞测序技术在研究骨骼肌衰老中的新兴应用，特别是在卫星细胞群体异质性和与微环境中其他细胞类型的分子相互作用方面 | 文中提到的许多外在因素仍未明确 | 探讨卫星细胞在衰老过程中的功能衰退机制及其与环境的相互作用 | 骨骼肌中的卫星细胞及其在衰老中的功能衰退 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 3878 | 2024-08-08 |
Effectively Clustering Single Cell RNA Sequencing Data by Sparse Representation
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3128576
PMID:34788219
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法SPARC，通过稀疏表示系数来测量细胞间的关系，并开发了一种异常值检测方法以辅助参数选择 | SPARC方法引入了一种新的相似性度量，利用每个细胞相对于其他细胞的稀疏表示系数来衡量细胞间的关系，并开发了异常值检测方法以帮助参数选择 | NA | 研究如何更有效地对单细胞RNA测序数据进行聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二个真实数据集 |
| 3879 | 2024-08-08 |
Urine Proteomics and Renal Single-Cell Transcriptomics Implicate Interleukin-16 in Lupus Nephritis
2022-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42023
PMID:34783463
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研究论文 | 本研究通过分析狼疮性肾炎（LN）患者的纵向尿液蛋白质组学特征和肾脏单细胞转录组学，探讨了白细胞介素-16（IL-16）在LN中的作用。 | 本研究首次通过尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学分析，揭示了IL-16在LN发病机制中的作用，并将其确定为潜在的治疗靶点和生物标志物。 | 研究样本量较小，仅包括30名LN患者，可能影响结果的普遍性。 | 开发新的治疗策略，并通过分析尿液蛋白质组学特征探索新的生物标志物。 | 狼疮性肾炎患者及其尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学。 | 生物标志物 | 狼疮性肾炎 | 尿液蛋白质组学，单细胞转录组学 | NA | 蛋白质，RNA | 30名狼疮性肾炎患者 |
| 3880 | 2024-08-08 |
The effects of TNF-α/TNFR2 in regulatory T cells on the microenvironment and progression of gastric cancer
2022-04-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33873
PMID:34766338
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研究论文 | 研究探讨了TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | 揭示了TNFR2 Tregs在肿瘤微环境中高浸润水平，并处于激活和效应状态，为胃癌治疗提供了新的理论基础 | NA | 探索TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 多色免疫荧光、单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |