单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3841 - 3860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3841 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing for Everybody
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1944-5_15
PMID:34870822
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研究论文 | 本文描述了Smart-seq2协议，用于单细胞全长mRNA测序，适用于多种细胞类型，且成本相对较低 | 介绍了Smart-seq2协议，该协议易于优化并适用于标准分子生物学实验室 | NA | 帮助新手研究人员选择最佳的单细胞测序协议 | 单细胞全长mRNA测序协议 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA序列 | 多种细胞类型 |
| 3842 | 2024-08-08 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本文开发了一种增强的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析工作流程，用于揭示冠状动脉疾病中的细胞间对话和候选药物靶点 | 本文设计了一个用户友好的、可重复的工作流程，并开发了一个交互式网络应用程序PlaqView，以促进对心血管单细胞数据集的进一步探索和分析 | NA | 开发和应用scRNA-seq分析工作流程，以研究动脉粥样硬化斑块微环境并发现潜在的治疗方法 | 冠状动脉疾病中的细胞间对话和候选药物靶点 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 使用了Wirka等人之前发表的人类冠状单细胞数据集 |
| 3843 | 2024-08-08 |
Serglycin Is Involved in Adipose Tissue Inflammation in Obesity
2022-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100231
PMID:34872979
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研究论文 | 本研究探讨了serglycin在饮食诱导的肥胖相关脂肪组织炎症中的作用 | 首次揭示了serglycin在调节肥胖诱导的脂肪炎症中的作用 | NA | 研究serglycin表达对饮食诱导的脂肪组织炎症的影响 | serglycin在肥胖条件下对脂肪组织炎症的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用C57BL/6J遗传背景的小鼠进行8周高脂高蔗糖饮食实验 |
| 3844 | 2024-08-08 |
Identification of Vulnerable Interneuron Subtypes in 15q13.3 Microdeletion Syndrome Using Single-Cell Transcriptomics
2022-04-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2021.09.012
PMID:34838304
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据，识别了15q13.3微缺失综合征中易受影响的中间神经元亚型 | 提出并验证了一种预测CNV基因对大脑发育影响的新策略，并通过分析单细胞转录组数据和在小鼠模型中验证，揭示了Klf13基因在特定发育阶段的表达模式及其对神经元发育的影响 | NA | 研究15q13.3微缺失综合征对大脑发育的影响机制 | 15q13.3微缺失综合征中的中间神经元亚型 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包含皮质中间神经元的单细胞转录组数据，以及Df(h15q13.3)/+和Klf13+/-胚胎的小鼠模型 |
| 3845 | 2024-08-08 |
Super-resolved spatial transcriptomics by deep data fusion
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01075-3
PMID:34845373
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研究论文 | 本文介绍了一种结合空间基因表达数据和组织切片的组织学图像数据来推断更高分辨率表达图谱的方法 | 利用深度生成模型，该方法能够表征微米尺度解剖特征的转录组，并能仅从组织学图像预测空间基因表达 | NA | 提高空间转录组学的空间分辨率 | 空间基因表达数据和组织切片的组织学图像数据 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 图像数据 | NA |
| 3846 | 2024-08-08 |
Redefining intestinal immunity with single-cell transcriptomics
2022-04, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-021-00470-y
PMID:34848830
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研究论文 | 本文讨论了单细胞转录组学在重塑我们对肠道免疫系统理解方面的作用 | 利用单细胞转录组学技术，深入解析了肠道免疫系统的复杂性，包括早期肠道发育、与邻近微生物群的相互作用、肠道免疫细胞的多样性、肠道内的区域化以及与非免疫细胞的相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在肠道免疫系统研究中的应用 | 肠道免疫系统及其与微生物群和非免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 3847 | 2024-08-08 |
Generation and characterization of stable pig pregastrulation epiblast stem cell lines
2022-04, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00592-9
PMID:34848870
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研究论文 | 本文介绍了从猪胚胎E10前原肠胚外胚层（pgEpiSCs）成功建立和维持稳定的多能干细胞系的培养方法 | 首次成功建立了稳定的猪前原肠胚外胚层干细胞系，并通过化学抑制WNT相关信号通路及FGF/ERK、JAK/STAT3和Activin/Nodal途径维持其多能性特征 | NA | 开发用于建立和维持猪多能干细胞系的新型体外培养介质，并探索其在生物学研究和再生医学中的应用潜力 | 猪胚胎E10前原肠胚外胚层细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析、Hi-C分析 | NA | 细胞 | 超过240次传代的多能干细胞系 |
| 3848 | 2024-08-08 |
Shoot and root single cell sequencing reveals tissue- and daytime-specific transcriptome profiles
2022-02-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab537
PMID:34850215
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了拟南芥根和地上组织的转录组，揭示了组织特异性和昼夜特异性的转录组特征 | 首次提供了拟南芥根和地上组织细胞类型的从头参考图谱，并探讨了非注释和双顺反子转录本的存在 | NA | 研究拟南芥根和地上组织在特定时间点的基因表达空间控制 | 拟南芥的根和地上组织 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 近70,000个拟南芥细胞 |
| 3849 | 2024-08-08 |
An autoimmune stem-like CD8 T cell population drives type 1 diabetes
2022-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04248-x
PMID:34847567
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研究论文 | 本文研究了非肥胖糖尿病小鼠中β细胞特异性CD8 T细胞在1型糖尿病发展过程中的命运，并识别出胰腺引流淋巴结中的干细胞样自身免疫前体细胞群 | 本文首次识别出干细胞样自身免疫前体细胞群，并揭示了其自我更新及分化为自身免疫介质的机制 | 本文主要在非肥胖糖尿病小鼠模型中进行研究，其结果在人类中的适用性有待进一步验证 | 研究自身免疫T细胞群的产生、维持及其分子调控机制 | β细胞特异性CD8 T细胞及干细胞样自身免疫前体细胞群 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 非肥胖糖尿病小鼠 |
| 3850 | 2024-08-08 |
GNN-based embedding for clustering scRNA-seq data
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab787
PMID:34850828
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图神经网络（GNN）的嵌入方法graph-sc，用于聚类单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | graph-sc方法利用图自编码器网络为scRNA-seq细胞数据创建嵌入，相比其他竞争技术在各种数据集上表现更优，且具有更高的计算效率和稳定性 | 尽管在多个数据集上表现良好，但并没有一种方法能在所有分析的数据集上始终表现最佳 | 开发一种新的聚类方法，用于预测细胞类别分配和推断细胞身份 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 图神经网络（GNN） | 图自编码器网络 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及模拟和真实scRNA-seq数据集 |
| 3851 | 2024-08-08 |
Enhancing biological signals and detection rates in single-cell RNA-seq experiments with cDNA library equalization
2022-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1071
PMID:34850101
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研究论文 | 本文研究了在单细胞RNA测序实验中，通过等量化cDNA文库浓度来提高基因检测率和增强生物信号的方法 | 提出了在单细胞实验中不一致执行的cDNA文库浓度等量化步骤，以改善基因检测率、增强生物信号并减少技术伪影 | NA | 评估等量化步骤对不同单细胞RNA测序协议的影响 | 单细胞RNA测序数据中的基因检测率和生物信号 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 实验中使用了不同等量化步骤的体外实验样本，具体数量未详细说明 |
| 3852 | 2024-08-08 |
High-Throughput Functional Screening of Antigen-Specific T Cells Based on Droplet Microfluidics at a Single-Cell Level
2022-01-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c03678
PMID:34852202
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研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控平台的高通量功能性筛选肿瘤抗原特异性T细胞的方法 | 开发了一种新的液滴微流控平台，用于高通量功能性筛选和分离肿瘤抗原特异性T细胞 | NA | 旨在提高基于T细胞的癌症免疫疗法的效率 | 肿瘤抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 荧光信号 | 单个细胞水平 |
| 3853 | 2024-08-08 |
Deep learning-based advances and applications for single-cell RNA-sequencing data analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab473
PMID:34849562
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研究论文 | 本文总结了基于深度学习的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法及其应用，并探讨了深度学习技术在scRNA-seq数据分析中的未来展望和挑战 | 深度学习技术能够克服scRNA-seq数据在上游和下游分析中的独特挑战 | NA | 旨在支持深度学习工具在生物医学领域的应用，并帮助生物学家和生物信息学家探索这一快速发展的领域 | 单细胞RNA测序数据分析 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度学习 | scRNA-seq数据 | NA |
| 3854 | 2024-08-08 |
SC-MEB: spatial clustering with hidden Markov random field using empirical Bayes
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab466
PMID:34849574
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SC-MEB的经验贝叶斯方法，用于空间聚类分析，利用隐马尔可夫随机场进行空间转录组数据分析 | SC-MEB不仅计算效率高且可扩展到大规模样本，还能选择平滑参数和聚类数量，优于现有的方法如BayesSpace | NA | 通过空间转录组数据识别细胞集群，以扩展对细胞类型和状态如何受微环境调控的理解 | 人类背外侧前额叶皮质组织和老鼠下丘脑前区的空间转录组数据，以及结直肠癌和COVID-19患者的结肠数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场 | 转录组数据 | 大规模样本 |
| 3855 | 2024-08-08 |
Expression Atlas update: gene and protein expression in multiple species
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1030
PMID:34850121
|
研究论文 | 本文介绍了EMBL-EBI表达图谱数据库的更新，该数据库整合了来自超过4500个表达研究的数据，涵盖超过65种不同物种，旨在帮助研究人员了解基因或蛋白质在不同组织、条件下的表达情况 | 表达图谱数据库通过专家审核和标准化分析流程，提供了易于可视化的数据，并区分了批量表达图谱和单细胞表达图谱 | NA | 旨在提供一个全面的基因和蛋白质表达数据库，帮助研究人员探索基因或蛋白质在不同条件下的表达模式 | 基因和蛋白质在不同物种、组织和条件下的表达情况 | NA | NA | RNA测序，蛋白质组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 超过4500个表达研究，涉及超过65种不同物种 |
| 3856 | 2024-08-08 |
Gene family evolution underlies cell-type diversification in the hypothalamus of teleosts
2022-01, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-021-01580-3
PMID:34824389
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了斑马鱼和墨西哥四须鲃的视丘细胞类型多样性，发现大多数细胞类型在两种鱼类中共享，并探讨了基因家族进化和旁系同源基因表达变化对细胞多样性的影响。 | 首次揭示了斑马鱼和墨西哥四须鲃视丘细胞类型多样性的共享性，并探讨了基因家族进化和旁系同源基因表达变化对细胞多样性的贡献。 | 研究仅限于斑马鱼和墨西哥四须鲃两种鱼类，可能无法完全代表所有硬骨鱼类的细胞类型多样性。 | 探究硬骨鱼类视丘细胞类型多样性及其进化机制。 | 斑马鱼和墨西哥四须鲃的视丘细胞。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约130,000个视丘细胞 |
| 3857 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Multicellular Ecosystem of Nucleus Pulposus during Degeneration Progression
2022-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202103631
PMID:34825784
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了人类椎间盘软骨核（NP）在退变过程中的多细胞生态系统 | 发现了六种新型人类NP细胞（NPCs）群体，并探索了它们在不同退变阶段的潜在功能差异，以及NP中免疫细胞的新类型 | NA | 揭示椎间盘软骨核（NP）退变过程中的分子复杂性和细胞异质性 | 人类椎间盘软骨核（NP）细胞及其在退变过程中的变化 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个NP组织样本 |
| 3858 | 2024-08-08 |
Functional heterogeneity of immune defenses in molluscan oysters Crassostrea hongkongensis revealed by high-throughput single-cell transcriptome
2022-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2021.11.027
PMID:34843943
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术揭示了香港牡蛎Crassostrea hongkongensis免疫细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细描绘了香港牡蛎免疫细胞的多样性和功能异质性 | NA | 探究香港牡蛎免疫细胞的功能异质性及其在免疫防御中的作用 | 香港牡蛎Crassostrea hongkongensis的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 十三种亚群的免疫细胞 |
| 3859 | 2024-08-08 |
BNT162b2 vaccine induces divergent B cell responses to SARS-CoV-2 S1 and S2
2022-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-01088-9
PMID:34848871
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研究论文 | 研究BNT162b2疫苗接种后对SARS-CoV-2 S1和S2蛋白的B细胞反应 | 首次整合B细胞受体分析和单细胞转录组学，研究疫苗接种前后的B细胞反应 | NA | 探讨BNT162b2疫苗接种后对SARS-CoV-2刺突蛋白抗体的生成及其对新变种的保护程度 | BNT162b2疫苗接种后的B细胞反应 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | B细胞受体数据 | NA |
| 3860 | 2024-08-08 |
Endothelial TRPV4-eNOS coupling as a vital therapy target for treatment of hypertension
2022-05, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.15755
PMID:34822720
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研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中TRPV4与eNOS的相互作用及其在高血压治疗中的潜在作用 | 首次整合单细胞RNA测序、单细胞功能研究和药物筛选于大动脉中，并设计了小分子药物JNc-463以改善高血压中的TRPV4-eNOS相互作用 | NA | 探索TRPV4与eNOS在大动脉中的相互作用及其在高血压中的作用 | 内皮细胞中的TRPV4与eNOS相互作用 | NA | 高血压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用TRPV4EC-/-小鼠模型和JNc-463小分子药物进行研究 |