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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3781 | 2024-08-08 |
MACA: marker-based automatic cell-type annotation for single-cell expression data
2022-03-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab840
PMID:34935911
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MACA的新工具,用于自动注释单细胞转录组数据中的细胞类型 | MACA通过测试四种细胞类型评分方法和两个公共细胞标记数据库,在六个单细胞研究中表现出色,提高了注释的准确性和速度 | NA | 开发一种新的工具,用于提高单细胞转录组数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约29万个细胞 |
3782 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis defines mesenchymal stromal cells in the mouse incisor dental pulp
2022-03, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2021.119228
PMID:34915194
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠切牙牙髓中的间充质基质细胞的转录组特征 | 首次揭示了牙髓中不同细胞簇的转录组特征和细胞异质性 | NA | 深入理解牙髓中的细胞类型及其转录组特征 | 小鼠切牙牙髓中的间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 5至6天龄的小鼠切牙牙髓细胞 |
3783 | 2024-08-08 |
PTGES3 is a Putative Prognostic Marker in Breast Cancer
2022-03, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2021.08.033
PMID:34920330
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研究论文 | 本研究分析了COX/前列腺素通路酶在乳腺癌中的表达模式,特别是PTGES3的表达与乳腺癌预后的关联 | 首次详细描述了PTGES3在乳腺癌中的表达模式及其作为预后标志物的潜力 | NA | 探讨COX/前列腺素通路酶在乳腺癌中的表达及其作为预后标志物的可能性 | 乳腺癌组织中COX/前列腺素通路酶的表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | Cox回归Kaplan-Meier生存分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了Cancer Genome Atlas数据和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium数据库中的样本 |
3784 | 2024-08-08 |
Transcriptional differences between JAK2-V617F and wild-type bone marrow cells in patients with myeloproliferative neoplasms
2022-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2021.12.364
PMID:34921959
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研究论文 | 研究JAK2-V617F突变在骨髓细胞中的转录差异及其对骨髓增生性肿瘤患者的影响 | 首次联合单细胞RNA测序和JAK2基因分型,揭示了JAK2-V617F突变在骨髓细胞中的转录效应 | NA | 探究JAK2-V617F突变对骨髓细胞转录组的影响 | 骨髓细胞中的JAK2-V617F突变 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名新诊断的原发性血小板增多症或真性红细胞增多症患者 |
3785 | 2024-08-08 |
MEK inhibition suppresses metastatic progression of KRAS-mutated gastric cancer
2022-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15244
PMID:34931404
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研究论文 | 本文通过开发基于胃癌的器官样模型,研究了MEK抑制剂trametinib在抑制KRAS突变胃癌转移进展中的作用 | 首次揭示了MEK抑制剂trametinib通过抑制肿瘤和微环境的MAPK信号传导,有效抑制KRAS突变胃癌的转移进展 | NA | 阐明致癌基因诱导的胃癌进展机制,并探索MEK抑制剂在抑制胃癌转移中的应用 | 胃癌细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学分析 | 器官样模型 | 基因表达数据 | 使用GAN小鼠来源的肿瘤细胞进行实验 |
3786 | 2024-08-08 |
Lipid-loaded tumor-associated macrophages sustain tumor growth and invasiveness in prostate cancer
2022-02-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210564
PMID:34919143
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的转录组图谱,发现了一类与脂质代谢失调相关的TAMs亚群,该亚群与前列腺癌进展和较短的无病生存期正相关 | 首次揭示了脂质积累的TAMs在前列腺癌进展中的作用机制,并提出了通过阻断Marco来减少脂质积累的治疗策略 | 研究主要基于模型动物和体外实验,需要在临床试验中进一步验证 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌进展中的作用机制及潜在治疗策略 | 前列腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其与脂质代谢的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类前列腺癌样本 |
3787 | 2024-08-08 |
Human embryonic genome activation initiates at the one-cell stage
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.11.012
PMID:34936886
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术,深入分析了人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎的基因表达,揭示了胚胎基因激活(EGA)在人类一细胞阶段的早期启动 | 本研究首次揭示了人类胚胎基因激活在一细胞阶段的早期启动,比之前认为的时间更早,并发现了数百个剪接转录本的低幅度上调 | NA | 探讨人类胚胎基因激活的确切时间和基因表达特征 | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎的基因表达 | NA | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎 |
3788 | 2024-08-08 |
Kidney-Targeted Renalase Agonist Prevents Cisplatin-Induced Chronic Kidney Disease by Inhibiting Regulated Necrosis and Inflammation
2022-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021040439
PMID:34921111
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研究论文 | 本研究通过特定递送肾调节素激动剂肽RP81至肾近端小管,探讨其对顺铂诱导的慢性肾脏病的预防作用 | 采用纳米粒子递送系统,实现了肾特异性递送肾调节素激动剂肽,有效减少了顺铂诱导的慢性肾脏病 | NA | 探讨肾特异性递送肾调节素激动剂肽对顺铂诱导的慢性肾脏病的预防作用 | 小鼠模型及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序分析,Western blotting | NA | RNA | 小鼠模型及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 |
3789 | 2024-08-08 |
Novel insights into adipose tissue heterogeneity
2022-02, Reviews in endocrine & metabolic disorders
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s11154-021-09703-8
PMID:34935088
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综述 | 本文综述了脂肪组织的细胞组成及其通过单细胞RNA测序展现的异质性 | 探讨了脂肪组织中脂肪细胞和间质血管部分(SVF)细胞的深刻多样性及其对整体功能的影响 | 当前数据有限,对脂肪组织异质性和可塑性的生物学相关性理解尚不全面 | 旨在建立脂肪组织细胞异质性的图谱,以增进对其功能的理解 | 脂肪组织的细胞组成及其异质性 | NA | 代谢性疾病 | 单细胞/核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
3790 | 2024-08-08 |
Reversing T-cell Exhaustion in Cancer: Lessons Learned from PD-1/PD-L1 Immune Checkpoint Blockade
2022-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0515
PMID:34937730
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研究论文 | 本文讨论了通过PD-1/PD-L1免疫检查点阻断疗法逆转肿瘤中CD8 T细胞耗竭的机制及其对癌症免疫治疗发展的影响 | 通过单细胞RNA测序和表观遗传学分析揭示了肿瘤微环境中CD8 T细胞的异质性及其在免疫检查点阻断后的不同反应能力 | NA | 重新评估免疫检查点阻断疗法的作用机制和作用位点 | CD8 T细胞在肿瘤微环境中的状态及其对免疫治疗的反应 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序,表观遗传学分析 | NA | RNA | NA |
3791 | 2024-08-08 |
Cell type specificity of glucocorticoid signaling in the adult mouse hippocampus
2022-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13072
PMID:34939259
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研究论文 | 本文利用公开的单细胞RNA测序数据,研究了成年小鼠海马体中糖皮质激素信号的细胞类型特异性 | 首次在细胞类型水平上分析了糖皮质激素受体和盐皮质激素受体的信号传导特异性 | NA | 探讨糖皮质激素在成年小鼠海马体中的细胞类型特异性信号传导 | 成年小鼠海马体中的糖皮质激素受体和盐皮质激素受体 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
3792 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing to Unveil the Mystery of Embryonic Development
2022-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202101151
PMID:34939365
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research paper | 本文综述了单细胞测序技术在胚胎发育研究中的应用及其技术原理 | 单细胞测序技术为理解胚胎发育的分子路线图提供了有力工具 | 单细胞测序是高度跨学科的,需要在特定生物学背景下对其多样性及其优缺点有全面的理解 | 探讨单细胞测序技术在胚胎发育研究中的应用 | 胚胎发育过程中的细胞命运决定 | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
3793 | 2024-08-08 |
Stiffness is associated with hepatic stellate cell heterogeneity during liver fibrosis
2022-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00254.2021
PMID:34941452
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研究论文 | 本文研究了肝纤维化过程中肝脏硬度的分布及其对肝星状细胞(HSC)异质性的影响,并探讨了硬度如何通过特定的粘附分子途径放大纤维化反应。 | 首次揭示了硬度在整体器官、小叶和细胞水平上的异质性,并通过特定的粘附分子途径驱动纤维化反应的放大循环。 | NA | 理解肝纤维化中硬度的分布及其对肝星状细胞异质性的影响,并识别硬度放大纤维化反应的机制。 | 肝纤维化中的肝脏硬度分布、肝星状细胞异质性及纤维化反应的放大机制。 | 数字病理学 | 肝病 | 磁共振弹性成像、原子力显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 使用四氯化碳(CCl)诱导的肝纤维化小鼠模型与健康对照组进行比较,以及从健康和CCl处理的小鼠中提取的初级肝星状细胞进行单细胞RNA测序。 |
3794 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Discrete Steps in Regulatory T Cell Development in the Human Thymus
2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100506
PMID:34937744
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学和流式细胞术,揭示了人类胸腺中调节性T细胞发育的三个主要阶段 | 首次详细描述了人类胸腺中调节性T细胞发育的三个主要阶段,并提出了每个阶段的特征基因和表面标记 | 文中提到循环成熟的效应调节性T细胞的发育起源尚不明确,这可能会在使用胸腺组织作为稳定细胞来源进行细胞疗法时引起注意 | 阐明人类胸腺中调节性T细胞的发育过程,为细胞疗法提供更成熟的细胞来源 | 人类胸腺中的调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
3795 | 2024-08-08 |
A census of the lung: CellCards from LungMAP
2022-01-10, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.11.007
PMID:34936882
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和遗传谱系追踪等技术的新数据,创建了一个全面的肺细胞普查,包括细胞类型的身份、功能、标记、发育谱系、异质性、再生潜力、疾病关联和关键实验工具。 | 首次利用最新的单细胞RNA测序技术,对肺细胞进行全面普查,提供了详细的细胞类型信息和功能属性。 | NA | 旨在通过创建一个全面的肺细胞普查,促进呼吸健康的研究和支持。 | 人类肺部的细胞类型及其功能和属性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
3796 | 2024-08-08 |
Ubiquitin-conjugating enzyme V variant 1 enables cellular responses toward fibroblast growth factor signaling in endothelium
2022-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100808RRR
PMID:34921695
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研究论文 | 本文探讨了泛素结合酶V变体1(UBE2V1)在调节内皮细胞中成纤维细胞生长因子信号传导的作用 | 首次详细研究了UBE2V1在血管生成中的作用,特别是在成纤维细胞生长因子2诱导的血管生成中的关键作用 | 主要集中在体外和体内实验,可能需要更多临床数据支持 | 阐明UBE2V1在调节内皮细胞行为和血管生成中的作用 | 内皮细胞(ECs)和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 多种细胞类型,特别是内皮细胞 |
3797 | 2024-08-08 |
Cytokine and Nitric Oxide-Dependent Gene Regulation in Islet Endocrine and Nonendocrine Cells
2022, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab063
PMID:34927076
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研究论文 | 本文探讨了细胞因子及一氧化氮在胰岛内分泌和非内分泌细胞中的基因调控作用 | 提出细胞因子信号在生理上有保护β细胞免受多种环境压力的作用,并通过单细胞RNA测序验证了这一假设 | NA | 研究细胞因子和一氧化氮在胰岛内分泌细胞中的保护作用及其机制 | 小鼠胰岛细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰岛细胞在18小时细胞因子暴露后的单细胞RNA测序数据 |
3798 | 2024-08-08 |
LRRK2 correlates with macrophage infiltration in pan-cancer
2022-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.11.037
PMID:34929286
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研究论文 | 本文探讨了LRRK2在泛癌水平上的致癌作用,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证了其与生存事件的相关性 | 首次在泛癌水平上研究LRRK2对肿瘤微环境中巨噬细胞招募的影响,并提供了基于干扰LRRK2表达和活性的治疗策略 | NA | 研究LRRK2在泛癌中的作用及其对患者生存概率的影响 | LRRK2在不同癌症类型中的作用及其对巨噬细胞功能的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3799 | 2024-08-08 |
Interleukin-23 receptor expressing γδ T cells locally promote early atherosclerotic lesion formation and plaque necrosis in mice
2022-11-10, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab359
PMID:34897380
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研究论文 | 研究探讨了白细胞介素-23受体(IL-23R)在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化早期病变形成和斑块坏死中的作用。 | 首次详细研究了IL-23R在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化中的具体作用。 | 研究主要在老鼠模型中进行,其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 研究IL-23R在γδ T细胞中的表达及其在动脉粥样硬化中的作用,探索其作为治疗靶点的可能性。 | 主要研究对象为表达IL-23R的γδ T细胞和动脉粥样硬化病变。 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 使用了Ldlr-/-Il23rgfp/+和Ldlr-/-Tcrδ-/-两种基因改造的小鼠模型 |
3800 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing predicts motility networks in purified human gastric interstitial cells of Cajal
2022-07, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.14303
PMID:34913225
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人类胃间质Cajal细胞的运动网络 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究了人类胃间质Cajal细胞的分子网络,为胃肠动力障碍的治疗提供了新的分子见解和假设 | NA | 探索控制人类胃间质Cajal细胞生物学的分子网络,为胃肠动力障碍的靶向治疗提供新的框架 | 人类胃间质Cajal细胞 | 数字病理学 | 胃肠动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用KIT+ CD45- CD11B- 初级人类胃间质Cajal细胞进行了一系列表征实验 |