单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3761 - 3780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3761 | 2024-08-08 |
Surgical resection of glioblastomas induces pleiotrophin-mediated self-renewal of glioblastoma stem cells in recurrent tumors
2022-07-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab302
PMID:34964899
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研究论文 | 本文研究了手术切除胶质母细胞瘤后，肿瘤复发细胞中多能蛋白（PTN）介导的自我更新现象 | 首次揭示了手术切除胶质母细胞瘤后，PTN在肿瘤复发细胞中的作用及其对治疗抵抗和肿瘤复发的促进作用 | 研究主要基于动物模型和患者样本，未来需进一步在更大规模的人体研究中验证 | 探讨手术切除胶质母细胞瘤对肿瘤复发细胞表型的影响及其机制 | 胶质母细胞瘤及其复发肿瘤细胞 | NA | 脑肿瘤 | 18F-FET PET/CT成像，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23名匹配原发/复发肿瘤患者，190名胶质母细胞瘤患者 |
| 3762 | 2024-08-08 |
CellDepot: A Unified Repository for scRNA-seq Data and Visual Exploration
2022-06-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2021.167425
PMID:34971674
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研究论文 | CellDepot是一个集成网络应用，用于探索和比较来自多种研究的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集 | CellDepot通过用户友好的界面和先进的可视化及分析功能，提供了一个高效的数据管理系统，支持多属性查询和快速数据筛选 | NA | 促进大规模单细胞数据共享，便于元分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 超过270个数据集，来自8个物种和多种组织 |
| 3763 | 2024-08-08 |
Molecular insights into the early stage of glomerular injury in IgA nephropathy using single-cell RNA sequencing
2022-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2021.12.011
PMID:34968552
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了IgA肾病早期肾小球损伤的分子机制 | 揭示了内皮细胞在IgA肾病早期发病机制中的关键作用，并发现了多种肾小球内旁分泌途径和肾小球-肾小管细胞间相互作用途径 | NA | 深入理解IgA肾病早期肾小球损伤的分子机制 | IgA肾病早期阶段的肾小球相关细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用ddY小鼠模型进行研究 |
| 3764 | 2024-08-08 |
Regulation of axial elongation by Cdx
2022-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.12.011
PMID:34958748
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研究论文 | 本文研究了Cdx家族转录因子在轴向延长中的作用，特别是Cdx2在维持神经中胚层前体细胞（NMP）微环境和指定NMP后代中的作用 | 通过RNA测序和基因本体分析，识别了349个Cdx依赖基因，并揭示了多个与轴向延长相关的潜在直接Cdx目标基因 | NA | 深入理解Cdx家族在轴向延长中的作用 | 神经中胚层前体细胞（NMP）及其在胚胎发育中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 349个Cdx依赖基因 |
| 3765 | 2024-08-08 |
Examining the Development of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension at the Single-Cell Level
2022-03, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）患者的肺动脉内膜切除组织中的单个细胞类型及其相互作用。 | 首次在单细胞水平上揭示了CTEPH的发展轨迹及其细胞间的紧密通信关系。 | 研究样本仅来自5名患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子机制。 | CTEPH患者的肺动脉内膜切除组织中的单个细胞类型。 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名CTEPH患者 |
| 3766 | 2024-08-08 |
Differential Survival and Therapy Benefit of Patients with Breast Cancer Are Characterized by Distinct Epithelial and Immune Cell Microenvironments
2022-Mar-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1442
PMID:34965952
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研究论文 | 本文研究了乳腺癌患者中不同微环境细胞对生存和治疗效果的影响 | 首次在乳腺癌患者中识别出非免疫细胞类型（如成纤维细胞、肌上皮细胞等）对生存和治疗效果的相关性 | NA | 探讨微环境细胞在乳腺癌患者生存和治疗效果中的作用 | 乳腺癌患者的微环境细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA序列数据 | 超过3,500个乳腺癌患者的原发性肿瘤样本 |
| 3767 | 2024-08-08 |
Per- and polyfluoroalkyl substances target and alter human prostate stem-progenitor cells
2022-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2021.114902
PMID:34968493
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研究论文 | 研究探讨了全氟和多氟烷基物质（PFAS）对人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs）的影响及其潜在机制 | 首次发现人类前列腺SPCs是PFAS的直接作用目标，并揭示了PFAS暴露导致的转录组和代谢组重编程，这可能增加前列腺癌的风险 | NA | 探究PFAS长期暴露与前列腺癌风险增加之间的潜在机制 | 人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了10 nM的PFOA或PFOS处理的人类前列腺干细胞-祖细胞（SPCs） |
| 3768 | 2024-08-08 |
Single cell transcriptomics in human osteoarthritis synovium and in silico deconvoluted bulk RNA sequencing
2022-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.12.007
PMID:34971754
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研究论文 | 本研究旨在揭示骨关节炎（OA）滑膜组织中不同细胞类型的异质性，并通过新颖的方法确定是否可以通过基因反卷积技术将批量RNA测序数据转化为模拟的单细胞RNA测序数据 | 本研究首次通过基因反卷积技术将批量RNA测序数据转化为模拟的单细胞RNA测序数据，并创建了针对关节炎的特异性签名矩阵，提高了预测性能 | NA | 揭示骨关节炎滑膜组织中细胞类型的异质性，并探索批量RNA测序数据反卷积的可行性 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习工具CIBERSORTx | RNA测序数据 | 102,077个滑膜细胞，来自17名接受全膝关节置换术的患者 |
| 3769 | 2024-08-08 |
Fatal COVID-19 and Non-COVID-19 Acute Respiratory Distress Syndrome Is Associated with Incomplete Alveolar Type 1 Epithelial Cell Differentiation from the Transitional State without Fibrosis
2022-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2021.11.014
PMID:34973949
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研究论文 | 本文研究了急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中肺泡上皮细胞（AEC）的再生过程，特别是从过渡状态到肺泡上皮细胞1型（AEC1）的分化，以及这一过程与肺纤维化的关系。 | 首次揭示了在人类ARDS中，过渡细胞可以分化为AEC1而不伴随纤维化的现象，并探讨了这一过程与肺纤维化的潜在关联。 | 研究主要基于免疫染色和单细胞RNA测序，未涉及更深入的分子机制研究。 | 探讨ARDS中肺泡上皮细胞的再生机制及其与肺纤维化的关系。 | ARDS患者的肺组织，特别是肺泡上皮细胞的分化和过渡状态。 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 免疫染色，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3770 | 2024-08-08 |
Optical Cell Tagging for Spatially Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2022-02-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202113929
PMID:34970821
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研究论文 | 本文开发了一种名为OpTAG的新型化学平台，用于在空间解析的方式下将功能标签附着在细胞表面，从而实现空间解析的单细胞RNA测序（scRNA-seq）。 | OpTAG-seq方法的创新之处在于它能够提供细胞在多细胞样本中的位置信息，从而实现空间解析的scRNA-seq。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法来克服单细胞RNA测序数据中缺乏细胞位置信息的问题。 | 研究对象是迁移性癌细胞中的空间定义转录程序。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 3771 | 2024-08-08 |
Immunotherapy of cancer in single-cell RNA sequencing era: A precision medicine perspective
2022-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112558
PMID:34953396
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在癌症免疫治疗中的应用 | 结合单细胞RNA测序技术，能够以单细胞分辨率评估肿瘤在免疫治疗药物作用下的机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗中的肿瘤异质性和微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录活性数据 | NA |
| 3772 | 2024-08-08 |
An integrated brain-specific network identifies genes associated with neuropathologic and clinical traits of Alzheimer's disease
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab522
PMID:34953465
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研究论文 | 本研究开发了一种基于阿尔茨海默病大脑基因网络的方法，用于预测与阿尔茨海默病相关的基因，并通过独立遗传、转录组、蛋白质组数据以及神经病理学和临床数据进行系统验证 | 构建的网络在预测阿尔茨海默病相关基因方面优于现有网络，并揭示了细胞类型特异性的早期病理关联 | NA | 旨在识别与阿尔茨海默病相关的风险基因 | 阿尔茨海默病的遗传风险基因 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 基因网络 | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、神经病理学数据、临床数据 | 使用了来自Mount Sinai脑库研究、宗教秩序研究、记忆和衰老项目以及巴尔的摩衰老纵向研究的数据 |
| 3773 | 2024-08-08 |
Understanding of mouse and human bladder at single-cell resolution: integrated analysis of trajectory and cell-cell interactive networks based on multiple scRNA-seq datasets
2022-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13170
PMID:34951074
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，详细解析了小鼠和人类膀胱在单细胞水平上的轨迹和细胞间相互作用网络 | 创建了迄今为止最大的整合膀胱数据集，并发现了多种基因的伪时间模式以及细胞间信号传导的特定模式 | NA | 详细解析小鼠和人类膀胱在单细胞水平上的生物学特性 | 小鼠和人类膀胱的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共收集了超过50,000个细胞，包括16,688个小鼠膀胱细胞和22,080个人类膀胱细胞 |
| 3774 | 2024-08-08 |
Lineage recording in human cerebral organoids
2022-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01344-8
PMID:34969984
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研究论文 | 本文介绍了iTracer技术，一种结合报告条形码和可诱导的CRISPR-Cas9疤痕的谱系记录器，用于研究人脑类器官发育中的克隆性和谱系动态 | iTracer技术能够直接测量谱系关系，并兼容单细胞和空间转录组学 | NA | 探索脑类器官发育过程中的克隆性和谱系动态 | 人脑类器官 | 干细胞研究 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3775 | 2024-08-08 |
Deciphering functional tumor states at single-cell resolution
2022-12-17, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021109221
PMID:34918370
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综述 | 本文综述了通过单细胞测序方法识别肿瘤状态的不同研究，以及促进和维持这些功能状态及其转换的机制 | 讨论了肿瘤可塑性和转换状态的理解如何用于开发改善癌症治疗的新策略 | NA | 深入理解肿瘤功能异质性和揭示肿瘤脆弱性 | 肿瘤细胞的不同状态及其基因调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因调控网络 | NA |
| 3776 | 2024-08-08 |
Microglia activation, classification and microglia-mediated neuroinflammatory modulators in subarachnoid hemorrhage
2022-Jul, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.330589
PMID:34916410
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综述 | 本文综述了蛛网膜下腔出血中微胶质细胞激活、分类及其介导的神经炎症调节因子的研究进展 | 介绍了单细胞转录组学在微胶质细胞研究中的最新进展，并总结了基于转录组的微胶质细胞分类及其对微胶质细胞激活和神经炎症的启示 | NA | 旨在理解蛛网膜下腔出血后的疾病过程，特别是微胶质细胞激活的调节因子和促炎/抗炎细胞因子及趋化因子 | 微胶质细胞及其介导的神经炎症在蛛网膜下腔出血中的作用 | NA | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 3777 | 2024-08-08 |
Parallel Single-Cell Multiomics Analysis of Neonatal Skin Reveals the Transitional Fibroblast States that Restrict Differentiation into Distinct Fates
2022-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.11.032
PMID:34922949
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研究论文 | 本文通过并行多组学分析新生小鼠皮肤中的单细胞转座酶可及染色质测序和单细胞RNA测序，揭示了纤维母细胞群可以根据转录组特征分为乳头状和网状谱系，并探讨了染色质可及性与基因表达之间的关系。 | 本文首次通过单细胞转座酶可及染色质测序分析了新生纤维母细胞谱系标记，发现尽管纤维母细胞群具有谱系特异性的转录组特征，但所有纤维母细胞群中均存在可及染色质，这表明染色质可及性并不总是转化为基因表达。 | NA | 研究新生纤维母细胞的异质性及其在皮肤再生中的作用，特别是分子机制调控细胞状态和命运。 | 新生小鼠皮肤中的纤维母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 新生小鼠皮肤样本 |
| 3778 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03883-1
PMID:34931260
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了一例罕见的人喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 首次系统研究了喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制，并通过单细胞测序技术揭示了肿瘤异质性和肿瘤微环境组成 | 仅基于一例病例进行研究，可能存在样本量不足的问题 | 探索喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 | 一例74岁男性患者的喉软骨肉瘤及其周围软骨组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 5455个单细胞 |
| 3779 | 2024-08-08 |
Early Tumor-Immune Microenvironmental Remodeling and Response to First-Line Fluoropyrimidine and Platinum Chemotherapy in Advanced Gastric Cancer
2022-04-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0888
PMID:34933901
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研究论文 | 本文通过结合全外显子测序、批量RNA和单细胞转录组学，研究了HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者在接受一线氟嘧啶和铂类化疗前后肿瘤免疫微环境的变化，并定义了与化疗反应相关的特征。 | 首次详细描述了化疗对肿瘤免疫微环境的具体影响，包括自然杀伤细胞的招募、肿瘤相关巨噬细胞的减少等，并提出了未来治疗策略的候选方法。 | 研究未观察到早期治疗采样中的显著基因组变化，且样本量未明确提及。 | 探讨标准化疗对肿瘤免疫微环境的影响，并识别与化疗反应相关的特征。 | HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者。 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 3780 | 2024-08-08 |
Allosteric inhibition of SHP2 uncovers aberrant TLR7 trafficking in aggravating psoriasis
2022-03-07, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202114455
PMID:34936223
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研究论文 | 研究揭示了SHP2在银屑病中的作用及其通过调节TLR7转运影响炎症的机制 | 首次发现SHP2通过调节TLR7的转运在银屑病中起关键作用，并验证了SHP2抑制剂SHP099的治疗潜力 | NA | 探究SHP2在银屑病中的作用及其分子机制 | SHP2在银屑病患者和模拟银屑病小鼠模型中的表达及作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括银屑病患者和模拟银屑病的小鼠模型 |