单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4050 篇文献，本页显示第 3681 - 3700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3681 | 2024-08-08 |
Molecular Landscape of the Coagulome of Oral Squamous Cell Carcinoma
2022-Jan-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14020460
PMID:35053621
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研究论文 | 研究口腔鳞状细胞癌（OSCC）的凝血组及其与肿瘤微环境（TME）的关联 | 发现OSCC中F3和PLAU的mRNA表达水平最高，并观察到单细胞水平上的凝血和纤维蛋白溶解亚群共存现象 | 需要进一步研究凝血过程对肿瘤适应性免疫反应的潜在负面调节作用 | 探讨OSCC的凝血组及其与肿瘤微环境的联系 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）的凝血组 | NA | 口腔鳞状细胞癌 | bulk tumor DNA/RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | DNA/RNA | 使用The Cancer Genome Atlas的数据和OSCC细胞培养数据 |
| 3682 | 2024-08-08 |
Utilizing Shared Big Data to Identify Liver Cancer Dedifferentiation Markers
2022-Jan-14, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI210862
PMID:35062095
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据，重新分析大数据以识别肝癌干细胞的去分化标志物 | 首次在大数据重新分析中识别出肝癌干细胞的去分化因子Msh Homeobox 2，并发现其在肝癌干细胞中显著上调 | NA | 通过重新分析大数据，探索和识别肝癌干细胞的去分化标志物 | 肝癌干细胞和健康肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 3683 | 2024-08-08 |
Restoring FAS Expression via Lipid-Encapsulated FAS DNA Nanoparticle Delivery Is Sufficient to Suppress Colon Tumor Growth In Vivo
2022-Jan-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14020361
PMID:35053524
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研究论文 | 本研究通过脂质包裹的FAS DNA纳米粒子递送恢复FAS表达，以抑制体内结肠肿瘤生长 | 设计并合成了密码子使用优化的鼠和人FAS cDNA，并将其封装到阳离子脂质中形成纳米粒子，用于体内外抑制结肠肿瘤生长 | NA | 探讨恢复FAS表达是否足以抑制结直肠癌的发展 | 结直肠癌患者的结肠肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及鼠和人的结肠肿瘤细胞 |
| 3684 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolism during SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2022-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.01.10.475725
PMID:35043114
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法，比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫反应和代谢差异 | 首次系统比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染的单细胞转录组数据，揭示了两种病毒感染的共同和独特免疫反应及代谢特征 | NA | 理解SARS-CoV-2和HIV-1感染的相似性和差异性，为疾病进展和疫苗及疗法开发提供依据 | SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 94,442个PBMCs样本，来自7名COVID-19患者和9名HIV-1患者 |
| 3685 | 2024-08-08 |
Expression of Lineage Transcription Factors Identifies Differences in Transition States of Induced Human Oligodendrocyte Differentiation
2022-01-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11020241
PMID:35053357
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研究论文 | 本文通过定量图像分析和单细胞转录组学方法，比较了不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 研究发现，与单独使用SOX10相比，SOX10与OLIG2和NKX6.2的组合能增加iOLs的数量并促进更复杂的形态和更高的髓鞘标记基因表达水平 | NA | 研究不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 人源诱导少突胶质细胞的分化过程 | 细胞生物学 | NA | 定量图像分析、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 3686 | 2024-08-08 |
Towards Tabula Gallus
2022-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020613
PMID:35054796
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研究论文 | Tabula Gallus项目旨在创建鸡体和鸡胚中每种细胞类型的地图 | 该项目将生成单细胞转录组数据的综合目录，并提供研究该物种生物学的工具，类似于其他正在进行的细胞图谱项目 | NA | 研究鸡和其他鸟类的基本科学，并最终增进对人类健康和疾病的理解 | 鸡体和鸡胚中的每种细胞类型 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3687 | 2024-08-08 |
Combination of ultrasound-based mechanical disruption of tumor with immune checkpoint blockade modifies tumor microenvironment and augments systemic antitumor immunity
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003717
PMID:35039461
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研究论文 | 本文研究了超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤微环境和系统性抗肿瘤免疫的影响。 | 验证了新型高强度聚焦超声（M-HIFU）在增强抗肿瘤免疫中的作用，并探讨了与免疫检查点抑制剂（anti-PD-L1）联合使用的潜力。 | 研究主要在鼠类模型中进行，需要进一步的人体临床试验验证其效果。 | 探索通过超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗来增强系统性抗肿瘤免疫和抑制肿瘤生长的机制。 | 鼠类乳腺癌模型，包括三阴性（E0771）和人ErbB-2（HER2）表达（MM3MG-HER2）肿瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高强度聚焦超声（HIFU） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用C57BL/6或BALB/c小鼠进行实验 |
| 3688 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Computational Analysis Tools: Application in Cancer Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1896-7_23
PMID:35044670
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在癌症研究中的应用，介绍了最新的scRNA-seq技术和平台，以及相关的计算分析工具 | scRNA-seq技术为研究人员提供了发现新生物学现象和理解组织复杂性的独特机会 | NA | 介绍scRNA-seq技术及其在癌症研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术和计算分析工具 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 3689 | 2024-08-08 |
GRNUlar: A Deep Learning Framework for Recovering Single-Cell Gene Regulatory Networks
2022-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0437
PMID:35050715
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研究论文 | 提出了一种名为GRNUlar的深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中恢复基因调控网络 | 开发了一个多任务学习框架来捕捉转录因子与它们调控的基因之间的复杂依赖关系，并设计了一种展开算法技术来捕捉真实世界中基因调控网络的稀疏性 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中监督学习基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA测序数据 | NA |
| 3690 | 2024-08-08 |
A spatial and cellular distribution of rabies virus infection in the mouse brain revealed by fMOST and single-cell RNA sequencing
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.700
PMID:35051311
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研究论文 | 本研究利用荧光微光学断层成像（fMOST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，揭示了狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 首次通过fMOST和scRNA-seq技术全面绘制了典型神经亲和性病毒在小鼠大脑中的空间和细胞感染图谱 | NA | 探索狂犬病毒在小鼠大脑中的感染分布及其发病机制 | 狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 数字病理学 | 狂犬病 | 荧光微光学断层成像（fMOST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像，RNA序列 | 小鼠样本 |
| 3691 | 2024-08-08 |
Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.002
PMID:35032503
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研究论文 | 本研究通过使用利多卡因的硬膜外注射治疗银屑病患者，发现利多卡因能显著降低患者的临床评分，并在咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型中显示出治疗效果。 | 首次揭示了利多卡因通过阻断病理性CGRP信号传导介导的感觉神经-树突状细胞通信来改善银屑病。 | 本研究为初步研究，样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证。 | 探索利多卡因对银屑病的治疗效果及其作用机制。 | 银屑病患者及咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型。 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本量未明确提及，大鼠模型使用咪喹莫特诱导的银屑病大鼠。 |
| 3692 | 2024-08-08 |
FSCAM: CAM-Based Feature Selection for Clustering scRNA-seq
2022-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00495-8
PMID:35028910
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研究论文 | 本文提出了一种基于凸分析混合方法的单细胞特征选择方法FSCAM，用于改进单细胞RNA测序数据的聚类准确性 | FSCAM方法考虑了基因间的'多对多'关系，与传统的'一对一'方法相比，增加了相关性、冗余性和完整性的组合选择 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的基因特征选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PAM聚类算法 | 转录组数据 | 使用真实数据集进行验证 |
| 3693 | 2024-08-08 |
Combined effects of arsenic and 2,2-dichloroacetamide on different cell populations of zebrafish liver
2022-May-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2022.152961
PMID:35031379
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研究论文 | 研究了砷和2,2-二氯乙酰胺对斑马鱼肝脏不同细胞群体的联合效应 | 首次揭示了砷和2,2-二氯乙酰胺在斑马鱼肝脏中的细胞特异性联合反应 | NA | 探讨砷和2,2-二氯乙酰胺对斑马鱼肝脏不同细胞群体的联合效应 | 斑马鱼肝脏中的不同细胞群体 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共获得13,563个细胞，包括肝细胞、肝管细胞、内皮细胞和巨噬细胞 |
| 3694 | 2024-08-08 |
Cell2location maps fine-grained cell types in spatial transcriptomics
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01139-4
PMID:35027729
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cell2location的贝叶斯模型，用于在空间转录组数据中解析细粒度的细胞类型并创建全面的细胞图谱 | cell2location模型能够处理技术变异源，并通过跨位置借用统计强度，实现单细胞和空间转录组学数据的高灵敏度和高分辨率整合，优于现有工具 | NA | 开发一种能够全面映射细胞类型在空间转录组数据中的新模型 | 细胞类型在不同组织中的空间分布 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 转录组数据 | 在三种不同组织（小鼠大脑、人类淋巴结和人类肠道）中进行了评估 |
| 3695 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of tumour evolution in multiple myeloma - opportunities for precision medicine
2022-04, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00593-y
PMID:35017721
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在多发性骨髓瘤（MM）中的应用，探讨了其在揭示MM克隆进化模式和个体细胞突变及表型特征方面的潜力 | 利用单细胞测序技术深入解析MM及其前体阶段的遗传异质性，为精准医疗提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在多发性骨髓瘤中的应用及其对临床诊断和治疗策略的潜在影响 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的遗传异质性和克隆进化模式 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3696 | 2024-08-08 |
A robust and scalable graph neural network for accurate single-cell classification
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab570
PMID:35018408
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研究论文 | 本文开发了一种基于图神经网络（GNN）的稳健且可扩展的方法GraphCS，用于准确进行单细胞分类 | 通过预计算扩散信息，使用近似广义PageRank算法，实现了亚线性复杂度，提高了处理大规模数据的速度和可扩展性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中细胞类型识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络（GNN） | 数据 | 100万细胞 |
| 3697 | 2024-08-08 |
A comprehensive comparison of supervised and unsupervised methods for cell type identification in single-cell RNA-seq
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab567
PMID:35021202
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研究论文 | 本研究对比了监督学习和无监督学习方法在单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的表现 | 研究不仅解释了不同实验设置下细胞类型识别方法的行为，还提供了根据科学目标和数据特性选择方法的一般指导 | 监督方法的优越性可能会被研究中调查的一些不良数据特性所削弱，导致参考数据集不具信息性和偏倚 | 评估监督和无监督方法在单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的表现 | 8种监督方法和10种无监督方法在14个公共单细胞RNA测序数据集上的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个不同组织、测序协议和物种的公共单细胞RNA测序数据集 |
| 3698 | 2024-08-08 |
Host T Cell Dedifferentiation Effects Drive HIV-1 Latency Stability
2022-03-09, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01974-21
PMID:35019721
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研究论文 | 本文研究了HIV-1潜伏感染的T细胞中的转录组异质性，并揭示了这些细胞表现出一种去分化表型，类似于造血干细胞，这种表型对HIV-1潜伏稳定性有影响。 | 本文首次揭示了HIV-1潜伏感染的T细胞去分化表型，并提供了数据挖掘和软件集成方法来识别药物靶点，以重新分化病毒宿主细胞，从而破坏HIV-1潜伏感染。 | 本文的局限性在于对控制机制的理解仍然有限，需要进一步研究以完全理解这些机制。 | 研究HIV-1潜伏感染的生物分子机制，以开发治愈性治疗干预措施。 | HIV-1潜伏感染的T细胞及其去分化表型。 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自患者的HIV-1潜伏感染的T细胞 |
| 3699 | 2024-08-08 |
A chemoresistance lncRNA signature for recurrence risk stratification of colon cancer patients with chemotherapy
2022-Mar-08, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.12.015
PMID:35036055
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研究论文 | 本研究通过分析公共数据库中的长非编码RNA表达谱，识别出55种化疗特异性的长非编码RNA，并构建了一个名为CRLSig的化疗抵抗lncRNA特征，用于区分结肠癌化疗患者的无复发生存率。 | 首次构建了一个化疗抵抗lncRNA特征（CRLSig），能够有效区分结肠癌化疗患者的复发风险。 | NA | 开发一种新的分子标志物，用于评估结肠癌患者化疗后的复发风险。 | 结肠癌患者的化疗效果及复发风险。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序 | NA | RNA表达谱 | 多个队列的结肠癌患者，具体数量未详述 |
| 3700 | 2024-08-08 |
Origin, molecular specification, and stemness of astrocytes
2022-03, Developmental neurobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1002/dneu.22863
PMID:35006642
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞的起源、分子特化及其干细胞特性 | 利用单细胞测序技术深入理解星形胶质细胞谱系的模式和分子特化 | 星形胶质细胞的发育分期和命运特化及分化的分子机制仍未完全明确 | 探讨星形胶质细胞的早期发育、异质性及其在不同条件下的功能适应性 | 星形胶质细胞及其在神经系统中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |