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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3641 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomic Analysis Reveals the Cellular Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2022-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.01.005
PMID:35123072
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析骨髓和脐带华通胶来源的61,296个间充质干细胞,揭示了五个不同的亚群及其发育轨迹 | 首次揭示了间充质干细胞的五个不同亚群及其从干细胞样活跃增殖细胞到多能祖细胞的分化路径,并发现了具有自我更新和免疫调节潜力的亚群 | NA | 揭示间充质干细胞的细胞异质性及其功能 | 间充质干细胞的亚群及其功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 61,296个间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3642 | 2024-08-08 |
Inter-tissue convergence of gene expression during ageing suggests age-related loss of tissue and cellular identity
2022-01-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68048
PMID:35098922
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研究论文 | 研究分析了小鼠大脑皮层、肺、肝和肌肉在发育和衰老过程中的基因表达变化,发现衰老过程中基因表达出现逆转现象,导致不同组织间的基因表达趋向一致 | 首次提出并验证了衰老过程中不同组织基因表达趋向一致的现象,即DiCo(divergence followed by convergence) | NA | 探讨衰老过程中基因表达的变化及其对组织和细胞身份的影响 | 小鼠的大脑皮层、肺、肝和肌肉组织 | 基因表达 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 3643 | 2024-08-08 |
A Rapid Adaptable Method for Isolation of Endothelial Cells from Human Adipose Tissue
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_18
PMID:35099741
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research paper | 本文介绍了一种从人类脂肪组织中快速分离内皮细胞的可靠且灵活的方法 | 该方法可以用于各种分析,包括单细胞RNA测序、体外培养和下游应用 | NA | 研究旨在开发一种有效的方法来分离和研究脂肪组织中的内皮细胞 | 人类脂肪组织中的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3644 | 2024-08-08 |
Isolation of Cardiac Endothelial Cells for Transcriptomic Analysis of the Zebrafish and Mouse Heart
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_23
PMID:35099746
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研究论文 | 本文描述了一种使用酶解和机械解离以及荧光激活细胞分选(FACS)从斑马鱼和老鼠心脏中分离高质量心脏内皮细胞的协议 | 该方法能够获得高活性和纯度的心脏内皮细胞,适用于下游转录分析应用 | NA | 研究心脏内皮细胞的转录组分析 | 斑马鱼和老鼠的心脏内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及幼体和成体斑马鱼心脏以及健康和缺血成年老鼠心脏的内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3645 | 2024-08-08 |
CD73+ Epithelial Progenitor Cells That Contribute to Homeostasis and Renewal Are Depleted in Eosinophilic Esophagitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.018
PMID:35108658
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研究论文 | 研究探讨了CD73+CD104+细胞在嗜酸性食管炎(EoE)中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | 首次研究了CD73+CD104+细胞在EoE中的生物学意义,并探讨了其在EoE上皮更新和稳态中的作用 | NA | 探讨CD73+CD104+细胞在EoE中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | CD73+CD104+细胞在EoE中的数量和功能 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 流式细胞术,免疫组织化学,定量逆转录聚合酶链反应,单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 细胞 | EoE和非EoE患者的食管活检样本,患者来源和永生化细胞系来源的食管类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 3646 | 2024-08-08 |
CD4+ T cells in classical Hodgkin lymphoma express exhaustion associated transcription factors TOX and TOX2: Characterizing CD4+ T cells in Hodgkin lymphoma
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2033433
PMID:35111387
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和T细胞受体可变基因片段使用分析,比较了经典霍奇金淋巴瘤(cHL)中CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞的特征 | 发现CD4+CD26- T细胞虽经历抗原暴露但未克隆扩增,表达与耗竭相关的转录因子TOX和TOX2,以及免疫检查点和趋化因子 | NA | 研究经典霍奇金淋巴瘤中CD4+ T细胞的特征及其与肿瘤细胞生存的关系 | 经典霍奇金淋巴瘤中的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 来自cHL淋巴结细胞悬液的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3647 | 2024-08-08 |
Notch-Regulated c-Kit-Positive Liver Sinusoidal Endothelial Cells Contribute to Liver Zonation and Regeneration
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.019
PMID:35114417
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研究论文 | 本研究探讨了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生过程中的作用及其机制 | 首次鉴定并研究了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的具体作用及其通过Wnt2依赖性方式调节肝细胞再生的机制 | NA | 研究c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的作用及其机制 | c-kit阳性肝窦内皮细胞及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 定量逆转录聚合酶链反应, 免疫荧光染色, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用部分肝切除小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 3648 | 2024-08-08 |
Functional New Transcription Factors (TFs) Associated with Cervical Cancer
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8381559
PMID:35126951
|
研究论文 | 本研究旨在发现与宫颈癌发生相关的新转录因子(TFs) | 揭示了EMX2作为宫颈癌中的肿瘤抑制因子,并发现PDZRN3可能是EMX2在宫颈癌中的潜在靶点 | NA | 发现与宫颈癌发生相关的新转录因子 | 宫颈癌中的转录因子及其潜在靶点 | NA | 宫颈癌 | RNA-seq, 微阵列, 实时PCR | NA | 基因表达数据 | 10个宫颈癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3649 | 2024-08-08 |
Allosteric inhibition reveals SHP2-mediated tumor immunosuppression in colon cancer by single-cell transcriptomics
2022-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2021.08.006
PMID:35127377
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术探讨了SHP2在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次揭示了SHP2通过调节STING-TBK1-IRF3介导的I型干扰素信号通路在肿瘤微环境中发挥免疫抑制作用 | 研究仅基于小鼠MC38异种移植模型,可能与人类结直肠癌存在差异 | 探讨SHP2在结直肠癌中的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌中的SHP2及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠MC38异种移植模型中的肿瘤微环境细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3650 | 2024-08-08 |
Haploinsufficiency of PSMD12 Causes Proteasome Dysfunction and Subclinical Autoinflammation
2022-06, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42070
PMID:35080150
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研究论文 | 本研究探讨了由PSMD12半合子不足引起的新型蛋白酶体相关自身炎症综合征(PRAAS)的致病机制 | 首次发现PSMD12半合子不足导致的炎症标志物及神经发育障碍,扩展了PRAAS的基因型和表型谱 | NA | 研究PSMD12半合子不足引起的新型PRAAS的致病机制 | 家族成员的皮肤疹、先天性葡萄膜炎和发育迟缓 | NA | 自身炎症性疾病 | 全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2个家族成员 | NA | NA | NA | NA |
| 3651 | 2024-08-08 |
Systems-level analysis of transcriptome reorganization during liver regeneration
2022-05-11, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d1mo00382h
PMID:35072185
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研究论文 | 本研究通过网络推断和数学建模方法分析了肝脏再生过程中大量RNA测序时间序列数据,揭示了代谢、RNA剪接和细胞周期在肝脏再生中的整体协调作用 | 本研究通过构建动态调控网络和数学模型,揭示了HNF4A作为关键转录激活因子在肝脏再生中的作用,以及其在调控肝脏再生启动和终止中的双稳态失活机制 | NA | 理解肝脏在损伤或切除后平衡肝脏功能和增殖需求的调控机制 | 肝脏再生过程中的转录组重组织 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 数学模型 | RNA测序数据 | 两组三分之二部分肝切除(PHx)后的肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3652 | 2024-08-08 |
In Vitro Matured Human Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Form Grafts With Enhanced Structure and Function in Injured Hearts
2022-05-03, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究通过在聚二甲基硅氧烷(PDMS)衬里的滚瓶中培养,实现了人多能干细胞衍生的心肌细胞(hPSC-CMs)的大规模成熟制造,并证明了这些细胞移植后在受损心脏中形成具有增强结构和功能的移植物 | 首次提供了证据表明,移植更成熟的心肌细胞在体内产生更好的结果 | 文章未明确提及现有研究的局限性 | 探索人多能干细胞衍生的心肌细胞在心脏再生中的应用潜力,并通过改进培养方法提高其成熟度和移植效果 | 人多能干细胞衍生的心肌细胞(hPSC-CMs)及其在心脏再生中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 免疫细胞化学、超微结构分析、荧光钙成像、批量和单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 使用了一个转基因的人多能干细胞系,生成了超过1×10^8个成熟hPSC-CMs | NA | NA | NA | NA |
| 3653 | 2024-08-08 |
Liver stromal cells restrict macrophage maturation and stromal IL-6 limits the differentiation of cirrhosis-linked macrophages
2022-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.12.036
PMID:35074474
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研究论文 | 本研究探讨了人肝星状细胞如何影响髓系细胞的特性,并利用星状-髓系共培养系统研究了这些相互作用在肝硬化背景下的应用。 | 发现肝星状细胞通过减少CD14+细胞亚群的频率和影响巨噬细胞的分化,限制了巨噬细胞的成熟,并揭示了IL-6在肝星状细胞限制CD9+巨噬细胞分化中的作用。 | NA | 研究人肝星状细胞如何影响髓系细胞的特性,并理解星状-髓系共培养系统在肝硬化研究中的应用。 | 人肝星状细胞和髓系细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 非肝硬化组织样本7例,肝硬化组织样本5例 | NA | NA | NA | NA |
| 3654 | 2024-08-08 |
Prostate luminal progenitor cells: from mouse to human, from health to disease
2022-04, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-021-00561-2
PMID:35079142
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综述 | 本文综述了前列腺腔内祖细胞的研究进展,从鼠类到人类,从健康到疾病 | 近年来,单细胞转录组学的兴起使得对鼠类和人类前列腺腔内祖细胞的全面分析成为可能 | NA | 探讨前列腺腔内祖细胞在前列腺病理生理中的作用及其对雄激素剥夺疗法的抵抗性 | 前列腺腔内祖细胞 | NA | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3655 | 2024-08-08 |
Clonally expanded B cells in multiple sclerosis bind EBV EBNA1 and GlialCAM
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04432-7
PMID:35073561
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研究论文 | 本文研究了多发性硬化症(MS)患者脑脊液中的B淋巴细胞与EB病毒EBNA1和GlialCAM的结合,揭示了EBNA1与GlialCAM之间的高亲和力分子模拟机制。 | 首次展示了EBNA1与GlialCAM之间的高亲和力分子模拟,并提供了结构和功能证据,支持其在多发性硬化症中的病理作用。 | NA | 探讨EB病毒与多发性硬化症之间的关联机制,并可能指导新疗法的开发。 | 多发性硬化症患者的B淋巴细胞、EB病毒EBNA1和GlialCAM。 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序、蛋白质微阵列、晶体结构分析 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3656 | 2024-08-08 |
Oncogenesis induced by combined Phf6 and Idh2 mutations through increased oncometabolites and impaired DNA repair
2022-03, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02193-1
PMID:35091680
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研究论文 | 本研究通过分析携带不同突变(Phf6、Idh2 R172K或两者结合)的小鼠的造血表型,探讨了IDH1/2和PHF6突变在急性白血病发病机制中的协同作用。 | 首次探讨了IDH1/2和PHF6突变在急性白血病中的协同作用,并发现这些突变通过增加2-羟基戊二酸的产生和损害DNA修复机制来促进白血病的发展。 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨IDH1/2和PHF6突变在急性白血病发病机制中的协同作用。 | 携带Phf6、Idh2 R172K或两者结合突变的小鼠。 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 携带不同突变的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3657 | 2024-08-08 |
Evidence for Multiple Subpopulations of Herpesvirus-Latently Infected Cells
2022-02-22, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03473-21
PMID:35089062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)潜伏感染的初级渗出性淋巴瘤(PEL)细胞中的多个亚群 | 首次在单细胞水平上探讨了KSHV潜伏感染的PEL细胞的异质性,并揭示了新的干预靶点 | NA | 研究KSHV潜伏感染细胞的异质性及其与宿主细胞转录的关系 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)潜伏感染的初级渗出性淋巴瘤(PEL)细胞 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3658 | 2024-08-08 |
Heterogeneous pdgfrb+ cells regulate coronary vessel development and revascularization during heart regeneration
2022-02-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199752
PMID:35088848
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研究论文 | 研究揭示了pdgfrb+细胞在斑马鱼心脏再生过程中对冠状血管发育和再血管化的调控作用 | 首次发现pdgfrb+细胞在心脏再生中的动态表达及其对冠状血管发育和再血管化的重要性 | 研究主要集中在斑马鱼模型,可能需要进一步在其他物种中验证pdgfrb+细胞的功能 | 探讨pdgfrb+细胞在心脏再生中的作用及其对冠状血管发育的影响 | 斑马鱼心脏中的pdgfrb+细胞及其在心脏再生中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼心脏中的pdgfrb+细胞和壁细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3659 | 2024-08-08 |
Single-Cell Genomics-Based Molecular Algorithm for Early Cancer Detection
2022-02-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04968
PMID:35077134
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研究论文 | 本文报道了一种基于单细胞基因组拷贝数变异特征的分子算法scCancerDx,用于确认体液中可疑细胞的恶性程度,从而实现早期癌症的确诊 | 提出了一种名为scCancerDx的分子算法,用于基于单细胞拷贝数变异特征确认细胞恶性程度,并验证了HK2作为识别不同体液中播散性肿瘤细胞的有效代谢功能相关标记 | 液体活检无法建立明确的癌症诊断,且单细胞测序的技术噪声和癌症细胞间的基因组变异增加了技术挑战 | 开发一种新的分子算法,用于早期癌症检测和确诊 | 体液中的可疑细胞和不同类型的癌症细胞 | 基因组学 | 膀胱癌 | 单细胞基因组学 | 分子算法 | 基因组数据 | 使用正常细胞和癌细胞系进行训练,并在临床样本中分离的单个肿瘤细胞上进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 3660 | 2024-08-08 |
Reconstruction of dynamic regulatory networks reveals signaling-induced topology changes associated with germ layer specification
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.018
PMID:35090587
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Epoch的工具,利用单细胞转录组学数据准确推断动态基因调控网络,并应用于小鼠胚胎干细胞的分化研究 | Epoch工具能够精确推断动态基因调控网络,揭示信号通路调控下的拓扑结构变化 | NA | 阐明转录因子与目标基因之间的调控关系,理解细胞如何控制其身份和行为 | 小鼠胚胎干细胞的分化过程及其与信号通路的相互作用 | 基因调控网络 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |