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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3621 | 2024-08-08 |
Clonally expanded B cells in multiple sclerosis bind EBV EBNA1 and GlialCAM
2022-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04432-7
PMID:35073561
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研究论文 | 本文研究了多发性硬化症(MS)患者脑脊液中的B淋巴细胞与EB病毒EBNA1和GlialCAM的结合,揭示了EBNA1与GlialCAM之间的高亲和力分子模拟机制。 | 首次展示了EBNA1与GlialCAM之间的高亲和力分子模拟,并提供了结构和功能证据,支持其在多发性硬化症中的病理作用。 | NA | 探讨EB病毒与多发性硬化症之间的关联机制,并可能指导新疗法的开发。 | 多发性硬化症患者的B淋巴细胞、EB病毒EBNA1和GlialCAM。 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序、蛋白质微阵列、晶体结构分析 | NA | 蛋白质 | NA |
3622 | 2024-08-08 |
Oncogenesis induced by combined Phf6 and Idh2 mutations through increased oncometabolites and impaired DNA repair
2022-03, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-022-02193-1
PMID:35091680
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研究论文 | 本研究通过分析携带不同突变(Phf6、Idh2 R172K或两者结合)的小鼠的造血表型,探讨了IDH1/2和PHF6突变在急性白血病发病机制中的协同作用。 | 首次探讨了IDH1/2和PHF6突变在急性白血病中的协同作用,并发现这些突变通过增加2-羟基戊二酸的产生和损害DNA修复机制来促进白血病的发展。 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨IDH1/2和PHF6突变在急性白血病发病机制中的协同作用。 | 携带Phf6、Idh2 R172K或两者结合突变的小鼠。 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 携带不同突变的小鼠样本 |
3623 | 2024-08-08 |
Evidence for Multiple Subpopulations of Herpesvirus-Latently Infected Cells
2022-02-22, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03473-21
PMID:35089062
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)潜伏感染的初级渗出性淋巴瘤(PEL)细胞中的多个亚群 | 首次在单细胞水平上探讨了KSHV潜伏感染的PEL细胞的异质性,并揭示了新的干预靶点 | NA | 研究KSHV潜伏感染细胞的异质性及其与宿主细胞转录的关系 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)潜伏感染的初级渗出性淋巴瘤(PEL)细胞 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个细胞 |
3624 | 2024-08-08 |
Heterogeneous pdgfrb+ cells regulate coronary vessel development and revascularization during heart regeneration
2022-02-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199752
PMID:35088848
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研究论文 | 研究揭示了pdgfrb+细胞在斑马鱼心脏再生过程中对冠状血管发育和再血管化的调控作用 | 首次发现pdgfrb+细胞在心脏再生中的动态表达及其对冠状血管发育和再血管化的重要性 | 研究主要集中在斑马鱼模型,可能需要进一步在其他物种中验证pdgfrb+细胞的功能 | 探讨pdgfrb+细胞在心脏再生中的作用及其对冠状血管发育的影响 | 斑马鱼心脏中的pdgfrb+细胞及其在心脏再生中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼心脏中的pdgfrb+细胞和壁细胞 |
3625 | 2024-08-08 |
Single-Cell Genomics-Based Molecular Algorithm for Early Cancer Detection
2022-02-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04968
PMID:35077134
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研究论文 | 本文报道了一种基于单细胞基因组拷贝数变异特征的分子算法scCancerDx,用于确认体液中可疑细胞的恶性程度,从而实现早期癌症的确诊 | 提出了一种名为scCancerDx的分子算法,用于基于单细胞拷贝数变异特征确认细胞恶性程度,并验证了HK2作为识别不同体液中播散性肿瘤细胞的有效代谢功能相关标记 | 液体活检无法建立明确的癌症诊断,且单细胞测序的技术噪声和癌症细胞间的基因组变异增加了技术挑战 | 开发一种新的分子算法,用于早期癌症检测和确诊 | 体液中的可疑细胞和不同类型的癌症细胞 | 基因组学 | 膀胱癌 | 单细胞基因组学 | 分子算法 | 基因组数据 | 使用正常细胞和癌细胞系进行训练,并在临床样本中分离的单个肿瘤细胞上进行验证 |
3626 | 2024-08-08 |
Reconstruction of dynamic regulatory networks reveals signaling-induced topology changes associated with germ layer specification
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.018
PMID:35090587
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Epoch的工具,利用单细胞转录组学数据准确推断动态基因调控网络,并应用于小鼠胚胎干细胞的分化研究 | Epoch工具能够精确推断动态基因调控网络,揭示信号通路调控下的拓扑结构变化 | NA | 阐明转录因子与目标基因之间的调控关系,理解细胞如何控制其身份和行为 | 小鼠胚胎干细胞的分化过程及其与信号通路的相互作用 | 基因调控网络 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
3627 | 2024-08-08 |
Multi-omic analysis reveals divergent molecular events in scarring and regenerative wound healing
2022-02-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.12.011
PMID:35077667
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了皮肤伤口愈合过程中瘢痕形成和再生修复的不同分子事件 | 首次综合转录组、蛋白质组和组织水平的数据,揭示了伤口愈合的纤维化和再生分子轨迹,并确定了Trps1作为伤口再生的关键调控基因 | NA | 开发促进再生疗法,深入理解从损伤到纤维化或再生的分子进展 | 皮肤伤口细胞在瘢痕形成和再生修复中的分子事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、timsTOF蛋白质组学、细胞外基质超微结构分析 | NA | 转录组、蛋白质组、组织 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
3628 | 2024-08-08 |
LINEAGE: Label-free identification of endogenous informative single-cell mitochondrial RNA mutation for lineage analysis
2022-02-01, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2119767119
PMID:35086932
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LINEAGE的计算算法,用于从无标签的单细胞线粒体RNA测序数据中识别内源性信息突变,以进行谱系分析 | LINEAGE算法通过特征子空间分离和低交叉熵子空间识别的标记选择策略,实现了无标签单细胞RNA测序数据的谱系推断 | NA | 开发一种用户友好的计算算法,用于从无标签的单细胞RNA测序数据中识别内源性谱系标记 | 单细胞线粒体RNA突变 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
3629 | 2024-08-08 |
Subtyping of sarcomas based on pathway enrichment scores in bulk and single cell transcriptomes
2022-01-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03248-3
PMID:35093080
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研究论文 | 本文通过分析14条涉及免疫、间质、DNA损伤修复和致癌信号通路的富集分数,对肉瘤进行了基于批量和单细胞转录组的分层聚类分析 | 本文首次通过整合不同类型的通路对肉瘤进行分类,并构建了一个线性风险评分模型(ICMScore),用于预测肉瘤和其他癌症的不良预后 | NA | 探索肉瘤的分子亚型及其生物学和临床意义 | 肉瘤的分子亚型及其与免疫、间质、DNA损伤修复和致癌信号通路的关系 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 线性风险评分模型(ICMScore) | 转录组数据 | 涉及三个批量肿瘤转录组数据集和一个单细胞RNA测序数据集 |
3630 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a novel cell state and switching genes during hepatic stellate cell activation in vitro
2022-01-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03263-4
PMID:35093101
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了体外肝星状细胞激活过程中的一种新型细胞状态及关键切换基因 | 发现了一种新型细胞状态及关键切换基因,这些基因可能在肝星状细胞向肌成纤维细胞转化中起关键作用,并可作为慢性肝病患者纤维化进展的预测标志物 | NA | 揭示肝星状细胞激活过程中的细胞状态变化及关键基因表达 | 肝星状细胞及其在肝纤维化中的转化过程 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3631 | 2024-08-08 |
Gene expression predicts dormant metastatic breast cancer cell phenotype
2022-01-29, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-022-01503-5
PMID:35093137
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研究论文 | 本文开发了一种高效系统,用于从骨等转移器官中分离和研究罕见的休眠乳腺癌细胞,并使用单细胞RNA测序技术分析其基因表达特征 | 首次识别出一组在休眠乳腺癌细胞中高度表达的基因,这些基因与人类乳腺癌患者的无病生存期相关 | 研究主要集中在小鼠模型和人类数据集的比较,未详细探讨这些基因在人体内的具体作用机制 | 揭示控制肿瘤细胞休眠的机制,预测患者复发风险 | 休眠的乳腺癌转移细胞及其基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括来自骨和肺的休眠及增殖性PyMT-Bo1乳腺癌细胞 |
3632 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to track novel perspectives in HSC heterogeneity
2022-01-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-022-02718-1
PMID:35093185
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在研究造血干细胞异质性及其起源和谱系承诺中的应用 | 单细胞RNA测序技术为研究正常和病理状态下造血干细胞的异质性提供了新的机会 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在追踪造血干细胞起源和谱系承诺中的贡献 | 造血干细胞及其异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
3633 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing and its applications in bladder cancer
2022-01-28, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2021.23
PMID:35086606
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用及其对诊断和治疗的潜在影响 | 单细胞测序技术能够识别肿瘤内的细胞亚群,解析肿瘤微环境,并表征细胞基因组突变,从而深入理解肿瘤生物学 | NA | 探讨单细胞测序技术在膀胱癌研究和临床实践中的应用 | 膀胱癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
3634 | 2024-08-08 |
Characterizing cellular heterogeneity in fibrotic hypersensitivity pneumonitis by single-cell transcriptional analysis
2022-Jan-28, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-022-00831-x
PMID:35091537
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析方法,揭示了纤维化过敏性肺炎(FHP)中的细胞异质性 | 通过整合scRNA-seq、scTCR-seq和bulk RNA-seq分析,识别了FHP中的十种主要细胞类型和19种独特亚型,并揭示了这些细胞亚群在FHP发病机制中的关键作用 | NA | 全面解析FHP的细胞异质性,为开发针对FHP的通用基因治疗方案铺平道路 | 纤维化过敏性肺炎(FHP)中的细胞异质性 | 数字病理学 | 肺疾病 | scRNA-seq, scTCR-seq, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及FHP患者的多种细胞类型和亚型 |
3635 | 2024-08-08 |
Microskeletal stiffness promotes aortic aneurysm by sustaining pathological vascular smooth muscle cell mechanosensation via Piezo1
2022-01-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27874-5
PMID:35082286
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研究论文 | 本文探讨了血管平滑肌细胞在腹主动脉瘤形成中的机械感应机制,特别是通过Piezo1通道的作用 | 首次揭示了Piezo1通道在腹主动脉瘤形成中的关键作用,并展示了通过抑制Piezo1来预防腹主动脉瘤的可能性 | NA | 研究腹主动脉瘤的病理机制及潜在的治疗策略 | 血管平滑肌细胞的机械感应行为及Piezo1通道的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 超声镊子基微机械系统和单细胞RNA测序技术 | 理论模型 | 单细胞RNA序列数据 | NA |
3636 | 2024-08-08 |
A novel prognostic model based on single-cell RNA sequencing data for hepatocellular carcinoma
2022-Jan-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-022-02469-2
PMID:35078458
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据构建了一个新的肝细胞癌预后模型 | 开发了一个基于肿瘤免疫微环境异质性的3基因签名,用于预测生存结果和免疫治疗反应 | NA | 旨在全面理解肝细胞癌的肿瘤免疫微环境,并构建一个预后模型 | 肝细胞癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因共表达网络分析(WGCNA) | 基因表达数据 | 基于GSE149614数据集定义了25个细胞集群 |
3637 | 2024-08-08 |
Tracing PRX1+ cells during molar formation and periodontal ligament reconstruction
2022-01-25, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-021-00155-z
PMID:35078971
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研究论文 | 本研究评估了PRX1细胞在小鼠磨牙发育和牙周韧带形成过程中的细胞命运,并使用单细胞RNA测序分析了PRX1细胞在牙周韧带细胞中的分布。 | 首次探讨了PRX1细胞在牙齿发育和再生中的潜在功能,并发现PRX1细胞在牙周韧带重建中作为周细胞参与血管生成。 | NA | 研究PRX1细胞在牙齿和骨骼发育中的作用及其在牙周韧带重建中的功能。 | PRX1细胞在小鼠磨牙发育和牙周韧带形成中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠磨牙和牙周韧带细胞 |
3638 | 2024-08-08 |
Single-cell ATAC-seq of fetal human retina and stem-cell-derived retinal organoids shows changing chromatin landscapes during cell fate acquisition
2022-01-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110294
PMID:35081356
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq),研究了人类胎儿视网膜发育及视网膜类器官中的染色质景观变化 | 首次将scATAC-seq与scRNA-seq结合,以高分辨率视角研究人类视网膜发育 | 视网膜类器官在Notch信号传导和无长突细胞基因调控方面与正常发育存在差异 | 探讨细胞命运获得过程中染色质景观的变化,并评估视网膜类器官在再生医学中的应用潜力 | 人类胎儿视网膜及干细胞衍生的视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
3639 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of de novo β-cell regeneration reveals the contribution of hybrid β/δ-cells to diabetes recovery in zebrafish
2022-01-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199853
PMID:35088828
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,在斑马鱼中绘制了糖尿病诱导和恢复期间的新生β细胞再生的图谱,并揭示了β/δ杂交细胞在糖尿病恢复中的作用 | 首次在斑马鱼中发现并描述了两种不同类型的生长激素释放抑制素产生的δ细胞(δ1和δ2细胞),并鉴定了一小群同时具有β细胞和δ1细胞激素及命运决定因子的葡萄糖反应性胰岛细胞 | NA | 探索再生能力强的物种通过恢复受损组织功能来逆转严重疾病进展的细胞动力学机制 | 斑马鱼中的β细胞再生过程 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
3640 | 2024-08-08 |
[Application of single-cell transcriptome sequencing in mechanistic toxicology]
2022-Jan-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在机制毒理学研究中的发展、原理、方法、应用及局限性 | 单细胞RNA测序技术能够识别组织微环境中化学暴露下的异质细胞反应,有助于发现敏感反应细胞和关键分子事件 | 文章讨论了单细胞转录组测序技术在机制毒理学研究中的局限性 | 探索毒性机制和作用模式的新视角 | 单细胞转录组测序技术在毒理学研究中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |